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FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

 KIAA1566, 1313 aa
 vs ./tmplib.25089 library

1986192 residues in  2037 sequences
  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7125+/-0.0068; mu= 12.7147+/- 0.465
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 Lambda= 0.086244

FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
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The best scores are:                                      opt bits E(2037)
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>>KIAA1760  ( 2219 res)   af00030                         (2219 aa)
 initn: 1132 init1: 326 opt: 537  Z-score: 367.8  bits: 81.1 E(): 2.3e-15
Smith-Waterman score: 794;  25.463% identity (52.500% similar) in 1080 aa overlap (89-1121:965-1951)

       60        70        80        90       100         110      
KIAA15 TPIKKTREKKPAGCLEERRDSQCKSMGNVFPQPQNTTLPLAPAQQT--GAECEETEVDQH
                                     :::     :. : :           .    
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KIAA15 VRQQLLQRK-PQQHCSSVTGDNLSEAGAASVIHSDTSSQ-PSVAYSSNQTMGSQMVSNI-
       :: . :: . :.:   ..:  .    :  .    :...: :.:      ...  .   . 
KIAA17 VRPEPLQPHLPEQAAPAATPGSQILLGHPAPYAVDVAAQVPTVPVPPAAVLSPPLPEVLL
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KIAA15 PQAEVNVPGQIYSSQQLVGHYQQVSGLQKHSKLTQPQILPLVQGQSTVLPVHVLGPTVVS
       : :   .: :. ::   :.   :    :  . :  :   ::  : . . :     :::  
KIAA17 PAAPELLP-QFPSSLATVSASVQSVPTQTAT-LLPPANPPLPGGPGIASPC----PTV--
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KIAA15 QPQVSPLTVQKVPQIKPVSQPVGAEQQAALLKPDLVRSLNQDVATTKENVSSPDNPSGNG
       :  : :.  ... : :: . : . :. ..           .::.. ::  .: ..  :.:
KIAA17 QLTVEPVQEEQASQDKPPGLPQSCESYGG-----------SDVTSGKELSDSCEGAFGGG
       1110      1120      1130                 1140      1150     

               300         310       320       330       340       
KIAA15 KQD----RIKQRRASCPRP--EKGTKFQLTVLQVSTSGDNMVECQLETHNNKMVTFKFDV
       . .    : ..::..  :   :.... .::.:.: ..::.::::::::::.::::::::.
KIAA17 RLEGRAARKHHRRSTRARSRQERASRPRLTILNVCNTGDKMVECQLETHNHKMVTFKFDL
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KIAA15 DGDAPEDIADYMVEDNFVLESEKEKFVEELRAIVGQAQEILHVHFATERATGVDSITVDS
       :::::..:: :::: .:.:..:.: :.:... .. .:...:     ..:..   .     
KIAA17 DGDAPDEIATYMVEHDFILQAERETFIEQMKDVMDKAEDMLSEDTDADRGSDPGTSPPHL
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KIAA15 NSSQTGSSEQVQINSTSTQTSNESAPQSSPVGRWRFCINQTIRNRETQSPPSLQH-SMSA
       ..   :..:. . ..... . .... ...   :: : :  . ..   ..: :     .:.
KIAA17 STCGLGTGEESRQSQANAPVYQQNVLHTGK--RW-FIICPVAEHPAPEAPESSPPLPLSS
        1280      1290      1300         1310      1320      1330  

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KIAA15 VPGRHPLPSPKNTSNKEISRDTLLTIENNPCHRALFTSKSEHKDVVDGKISECASVETKQ
       .:       :. ....   .: : . :. :   :     :.     .   .  : .  ..
KIAA17 LP-------PEASQDSAPYKDQLSSKEQ-PSFLASQQLLSQAGPS-NPPGAPPAPLAPSS
                  1340      1350       1360       1370      1380   

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KIAA15 PAILYQVEDNRQIMAPVTNS---SSYSTTSVRAVPAECEGLTKQASIFIPVYPCHQTASQ
       : .    .:.    ::.:..    . .:.:  . :.  .:::..     :.   :..   
KIAA17 PPVTALPQDG---AAPATSTMPEPASGTASQAGGPGTPQGLTSELETSQPLAETHEAPLA
          1390         1400      1410      1420      1430      1440

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KIAA15 ADALM-----SHPG-ESTQTSGNS-----LTTLAFDQKPQTLSVQQPAMDAEFISQEGET
       .. :.       :. :...:   :     :   : . .:.. .. :::.        . .
KIAA17 VQPLVVGLAPCTPAPEAASTRDASAPREPLPPPAPEPSPHS-GTPQPALGQPAPLLPAAV
             1450      1460      1470      1480       1490         

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KIAA15 TVNTEASSPKTVIPTQTPGLEPTTL-QPTTVLESDGERPP-KLEFADNRIKTLDEKLRNL
        . . :.:    .:  .: : ::.  :: ..:::::: :: .. :.:. ::.::::::.:
KIAA17 GAVSLATSQ---LP--SPPLGPTVPPQPPSALESDGEGPPPRVGFVDSTIKSLDEKLRTL
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KIAA15 LYQEH----SISSIYPESQKDTQSIDSPFSSSAEDTLSC-------PVTEVIAISHCGIK
       :::::    : :.  :    : .    :. ..   .  :       :: .  . ..  . 
KIAA17 LYQEHVPTSSASAGTPVEVGDRDFTLEPLRGDQPRSEVCGGDLALPPVPKEAVSGRVQLP
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KIAA15 DSPVQSPNFQQTGSKLL------SNVAASQPANISVFKRDLNVITSVSSELCLHEMSSDA
       .  :.. ..  : . ..      : .: :.: ..  . ::   ..: :     : .    
KIAA17 QPLVEKSELAPTRGAVMEQGTSSSMTAESSPRSMLGYDRDGRQVASDS-----HVVP---
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KIAA15 SLPGDPEAY--PAAVSSGGAIHLQTGVETEEMRSAIAPDPIPLTRESTADTRALNRCKAM
       :.: :  :.  :: :        . : :. :  .   :. .  .  ...  ..:.  .:.
KIAA17 SVPQDVPAFVRPARVEPTD----RDGGEAGESSAEPPPSDMGTVGGQASHPQTLG-ARAL
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KIAA15 SGSFQRGRFQVITIPQQQSAKMTSFGIEHISVFSETNHSSEEAFIKTAKSQLVEIEPATQ
       ..  .: . : .. : .  ..   :..  .:. .: . .: ...  .:  . : .. : .
KIAA17 GSPRKRPEQQDVSSPAKTVGR---FSV--VSTQDEWTLASPHSLRYSAPPD-VYLDEAPS
            1730      1740           1750      1760       1770     

             920       930       940       950       960       970 
KIAA15 NPKTSFSYEKLQALQETCKENKGVPKQGDNFLSFSAACETDVSSVTPEKEFEETSATGSS
       .: .... .. :. . . . . : : ..:.        .    .  : ..     ..:: 
KIAA17 SPDVKLAVRRAQTAS-SIEVGVGEPVSSDS-------GDEGPRARPPVQKQASLPVSGSV
        1780      1790       1800             1810      1820       

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KIAA15 MQSGSELLLKEREILTAGKQPSSDSEFSASLAGSGKSVAKTGPESNQCLPHHEEQAYAQT
          ..... :   .:   ..::         :::       :::.    : .  .     
KIAA17 ---AGDFVKKATAFL---QRPSR--------AGS------LGPET----PSRVGMKVPTI
         1830         1840                    1850          1860   

            1040      1050      1060      1070      1080      1090 
KIAA15 QSSLFYSPSSPMSSDDESEIEDEDLKVELQRLREKHIQEVVNLQTQQNKELQELYERLRS
       . . :.: :: .:::..::.:: :.: ::: :::::..:. .::.::..:.. ::.::  
KIAA17 SVTSFHSQSSYISSDNDSELEDADIKKELQSLREKHLKEISELQSQQKQEIEALYRRLG-
          1870      1880      1890      1900      1910      1920   

            1100      1110      1120      1130      1140      1150 
KIAA15 IKDSKTQSTEIPLPPASPRRPRSFKSKLRSRPQSLTHVDNGIVATDPLCVESNAASCQQS
        :    .   .   : . :: .. ::::..                              
KIAA17 -KPLPPNVGFFHTAPPTGRRRKTSKSKLKAGKLLNPLVRQLKVVASSTGHLADSSRGPPA
            1930      1940      1950      1960      1970      1980 

>>KIAA0344  ( 2066 res)   hg01568                         (2066 aa)
 initn: 937 init1: 318 opt: 433  Z-score: 298.2  bits: 68.1 E(): 1.7e-11
Smith-Waterman score: 1037;  26.852% identity (49.674% similar) in 1687 aa overlap (1-1311:437-2060)

                                             10        20        30
KIAA15                               RDEDPKKLKGKHKDNEAIEFSFNLETDTPE
                                     : :: ::::::.::::::::::.:: :.::
KIAA03 NHAFFQEETGVRVELAEEDDGEKIAIKLWLRIEDIKKLKGKYKDNEAIEFSFDLERDVPE
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               40        50        60                    70        
KIAA15 EVAYEMVKSGFFHESDSKAVAKSIRDRVTPIKKTRE------------KKPAGCLEERRD
       .:: :::.::.  :.: :..::.:.:::. ::. ::            :.  . :... .
KIAA03 DVAQEMVESGYVCEGDHKTMAKAIKDRVSLIKRKREQRQLVREEQEKKKQEESSLKQQVE
        470       480       490       500       510       520      

       80        90        100           110       120       130   
KIAA15 SQCKSMGNVFPQPQNTT-LPLAPAQQ----TGAECEETEVDQHVRQQLLQRKPQQHCSSV
       ..  :. ..   :. .: .: : . .    : .: :: :.:::  :::  ..:.    ::
KIAA03 QSSASQTGIKQLPSASTGIPTASTTSASVSTQVEPEEPEADQH--QQLQYQQPSI---SV
        530       540       550       560         570          580 

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KIAA15 TGDNLSEAGAASVIHSDT--SSQPSVAYSSNQTMGSQMVSNIPQAEVNVPGQIYSSQQLV
        .:.  ..: .: . ...  ::: .:.:.: :   .. ....:    ..:. . ...:  
KIAA03 LSDGTVDSGQGSSVFTESRVSSQQTVSYGS-QHEQAHSTGTVPG---HIPSTVQAQSQPH
             590       600       610        620          630       

                    200            210        220       230        
KIAA15 GHYQ-------QVSGLQKHSKLT-----QPQILPLVQG-QSTVLPVHVLGPTV-------
       : :        : .:  . :.::     ::   :  :: :.:. : ...  ..       
KIAA03 GVYPPSSVAQGQSQGQPSSSSLTGVSSSQPIQHPQQQGIQQTAPPQQTVQYSLSQTSTSS
       640       650       660       670       680       690       

                       240             250       260       270     
KIAA15 -------VSQPQ---VSPL------TVQKVPQIKPVSQPVGAEQQAALLKPDLVRSLNQ-
              :::::   : :       ..: : :. : ..::.. :  :     :. :... 
KIAA03 EATTAQPVSQPQAPQVLPQVSAGKQSTQGVSQVAP-AEPVAVAQPQATQPTTLASSVDSA
       700       710       720       730        740       750      

            280       290        300            310       320      
KIAA15 --DVATTKENVSSPDNPSGNGKQD-RIKQR--RASC---PRPEKGTKFQLTVLQVSTSGD
         :::.   . .. . ::..:... :  .:  : :     : :: .. .: .:.::..::
KIAA03 HSDVASGMSD-GNENVPSSSGRHEGRTTKRHYRKSVRSRSRHEKTSRPKLRILNVSNKGD
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KIAA15 NMVECQLETHNNKMVTFKFDVDGDAPEDIADYMVEDNFVLESEKEKFVEELRAIVGQAQE
        .::::::::: ::::::::.::: ::.::  ::...:.:  :.:.::...: :. .:.:
KIAA03 RVVECQLETHNRKMVTFKFDLDGDNPEEIATIMVNNDFILAIERESFVDQVREIIEKADE
         820       830       840       850       860       870     

          390       400       410                       420        
KIAA15 ILH--VHFATERATGVDSITVDSNSSQTGSS----------------EQVQINSTSTQTS
       .:   :    :   :..:.   .. . .::.                .:. : ..:    
KIAA03 MLSEDVSVEPEGDQGLESLQGKDDYGFSGSQKLEGEFKQPIPASSMPQQIGIPTSSLTQV
         880       890       900       910       920       930     

      430          440               450        460       470      
KIAA15 NESAPQS---SPVGRWRF--------CINQTIRNRETQSPP-SLQHSMSAVPGRH-----
        .:: .    ::: . :.         :..:.    .:::  .:.:: :..  ..     
KIAA03 VHSAGRRFIVSPVPESRLRESKVFPSEITDTVAASTAQSPGMNLSHSASSLSLQQAFSEL
         940       950       960       970       980       990     

                     480           490       500           510     
KIAA15 --------PLPSPKNTSNK----EISRDTLLTIENNPCHRA----LFTSKSEHKDVVDGK
               :  .: : :.      .    : .: . :   :    . ...:  .:.  . 
KIAA03 RRAQMTEGPNTAPPNFSHTGPTFPVVPPFLSSIAGVPTTAAATAPVPATSSPPNDISTSV
        1000      1010      1020      1030      1040      1050     

         520                                            530        
KIAA15 ISECASVETKQ-------------------------------------PAILYQVEDNRQ
       :.  ..: :..                                     ::..     . .
KIAA03 IQSEVTVPTEEGIAGVATSTGVVTSGGLPIPPVSESPVLSSVVSSITIPAVVSISTTSPS
        1060      1070      1080      1090      1100      1110     

      540              550       560       570       580           
KIAA15 IMAP-------VTNSSSYSTTSVRAVPAECEGLTKQASIFIPVYPCHQTA---------S
       ...:       :.... : ...: :. :   : :   .   :.   .:.:         .
KIAA03 LQVPTSTSEIVVSSTALYPSVTVSATSASAGGSTATPGPKPPAVVSQQAAGSTTVGATLT
        1120      1130      1140      1150      1160      1170     

            590                                  600       610     
KIAA15 QADALMSHPGESTQ---------------------------TSGNSLTTLAFDQKPQTLS
       ....  : :. ..:                           :: .: : :::. .  . :
KIAA03 SVSTTTSFPSTASQLSIQLSSSTSTPTLAETVVVSAHSLDKTSHSSTTGLAFSLSAPSSS
        1180      1190      1200      1210      1220      1230     

         620       630                   640            650        
KIAA15 VQQPAMDAEFISQEG------------ETTVNTEASSPKTV-----IPTQTPGLEPT---
        .  :  . .::: :             : .  .:..: ..     .:.  : ..:.   
KIAA03 SSPGAGVSSYISQPGGLHPLVIPSVIASTPILPQAAGPTSTPLLPQVPSIPPLVQPVANV
        1240      1250      1260      1270      1280      1290     

                 660                 670       680       690       
KIAA15 -----TL---QPTTVL----------ESDGERPPKLEFADNRIKTLDEKLRNLLYQEHSI
            ::   ::  .:          : :..  ::    :. ::::.::::.: ..::: 
KIAA03 PAVQQTLIHSQPQPALLPNQPHTHCPEVDSDTQPKAPGIDD-IKTLEEKLRSL-FSEHSS
        1300      1310      1320      1330       1340       1350   

            700          710       720             730       740   
KIAA15 S-----SIYPESQ---KDTQSIDSPFSSSAEDTL------SCPVTEVIAISHCGIKDSPV
       :     :.  :..   ..: .   : .. : . :      .:     . ..  ..  .::
KIAA03 SGAQHASVSLETSLVIESTVTPGIPTTAVAPSKLLTSTTSTCLPPTNLPLGTVALPVTPV
          1360      1370      1380      1390      1400      1410   

           750       760       770         780       790       800 
KIAA15 QSPNFQQTGSKLLSNVAASQPANISVFKRDLNV--ITSVSSELCLHEMSSDASLPGDPEA
        .:.  :... . ..... .:..    :  :.   .  :..::    . :. .::  :  
KIAA03 VTPG--QVSTPVSTTTSGVKPGTAPS-KPPLTKAPVLPVGTELPAGTLPSE-QLP--PFP
            1420      1430       1440      1450      1460          

             810            820             830       840          
KIAA15 YPAAVSSGGAI-----HLQTGVETEEMR--SAIAP----DPIPLTRESTADTRALNRCK-
        :. ..:   .     .:.  .  : .   ::..:     :  .: :. .. . ... : 
KIAA03 GPSLTQSQQPLEDLDAQLRRTLSPEMITVTSAVGPVSMAAPTAIT-EAGTQPQKVSQVKE
      1470      1480      1490      1500      1510       1520      

         850          860         870       880       890       900
KIAA15 ----AMS---GSFQRGRFQVITIPQ--QQSAKMTSFGIEHISVFSETNHSSEEAFIKTAK
           : :   : :. ::::: .  .  :. .:  :   . .   : :..::  .  .. .
KIAA03 GPVLATSSGAGVFKMGRFQVSVAADGAQKEGKNKSEDAKSVHFESSTSESSVLSS-SSPE
       1530      1540      1550      1560      1570      1580      

               910       920       930          940       950      
KIAA15 SQLVEIEP-ATQNPKTSFSYEKLQALQETCKENK---GVPKQGDNFLSFSAACETDVSSV
       : ::. :: .   :  : .  . .: . : .: :   : : .   :   ..: ..   ::
KIAA03 STLVKPEPNGITIPGISSDVPE-SAHKTTASEAKSDTGQPTKVGRFQVTTTANKVGRFSV
        1590      1600       1610      1620      1630      1640    

         960       970                 980       990         1000  
KIAA15 TP-EKEFEETSATGSS-----MQSGSELL-----LKEREILTAGKQ---PSSDSEFSASL
       .  : .. .:.  :       :.  . .:      ::.  :.  ..   :::: : .: :
KIAA03 SKTEDKITDTKKEGPVASPPFMDLEQAVLPAVIPKKEKPELSEPSHLNGPSSDPE-AAFL
         1650      1660      1670      1680      1690       1700   

                1010      1020      1030      1040      1050       
KIAA15 A-----GSGKSVAKTGPESNQCLPHHEEQAYAQTQSSLFYSPSSPMSSDDESEIEDEDLK
       .     ::: :  .    :.. ::    :  .:. :. :   :: ::::.::.:::::::
KIAA03 SRDVDDGSG-SPHSPHQLSSKSLP---SQNLSQSLSNSFN--SSYMSSDNESDIEDEDLK
          1710       1720         1730        1740      1750       

      1060      1070      1080      1090      1100           1110  
KIAA15 VELQRLREKHIQEVVNLQTQQNKELQELYERLRSIKDSKTQSTEIPLPPASP-----RRP
       .::.:::.::..:. .::..:..:.. :: .: ..  .      . .:::.:     :::
KIAA03 LELRRLRDKHLKEIQDLQSRQKHEIESLYTKLGKVPPA------VIIPPAAPLSGRRRRP
      1760      1770      1780      1790            1800      1810 

           1120                                                    
KIAA15 RSFKSKLRSR-------------------------PQSLTH-------------------
        . :..  ::                         ::.  :                   
KIAA03 TKSKGSKSSRSSSLGNKSPQLSGNLSGQSAASVLHPQQTLHPPGNIPESGQNQLLQPLKP
            1820      1830      1840      1850      1860      1870 

        1130                           1140       1150         1160
KIAA15 ---VDN---------------------GIVATDPLCVESNAASCQ-QSPA---SKKGMFT
           ::                     :  .:. . .  :. . : : ::   :.:: ::
KIAA03 SPSSDNLYSAFTSDGAISVPSLSAPGQGTSSTNTVGATVNSQAAQAQPPAMTSSRKGTFT
            1880      1890      1900      1910      1920      1930 

             1170      1180      1190      1200       1210         
KIAA15 DDLHKLVDDWTKEAVGNSLIKPSLNQLKQSQHKLETENWNKVSE-NTPSTMGYTSTWISS
       ::::::::.:...:.       .:.  . :. ... :. . . . ..:. .      :: 
KIAA03 DDLHKLVDNWARDAM-------NLSGRRGSKGHMNYEGPGMARKFSAPGQLC-----ISM
            1940             1950      1960      1970              

    1220      1230      1240         1250      1260      1270      
KIAA15 LSQIRGAVPTSLPQGLSLPSFPG---PLSSYGMPHVCQYNAVAGAGYPVQWVGISGTTQQ
        :.. :..: :  .. ::  :     : ..::.:         .. . .:: : .: . :
KIAA03 TSNLGGSAPISAASATSLGHFTKSMCPPQQYGFP---------ATPFGAQWSGTGGPAPQ
    1980      1990      2000      2010               2020      2030

       1280      1290        1300      1310       
KIAA15 SVVIPAQSGGPFQP-GM-NMQAFPTSSVQNPATIPPGPK    
        .       : ::: :  ..: :  :..:.  . :::      
KIAA03 PL-------GQFQPVGTASLQNFNISNLQKSISNPPGSNLRTT
                    2040      2050      2060      




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