# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fh20178s1.fasta.huge -Q ../query/KIAA1561.ptfa ./tmplib.25089 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1561, 1416 aa vs ./tmplib.25089 library 1986089 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.1683+/-0.00989; mu= -15.0176+/- 0.665 mean_var=582.3502+/-143.156, 0's: 0 Z-trim: 46 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.053147 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1334 ( 989 res) fh15842 ( 989) 1105 101.2 9.6e-22 KIAA1981 ( 862 res) fk03148(revised) ( 862) 824 79.6 2.7e-15 KIAA1074 ( 1715 res) hj06637 (1715) 473 53.1 5.2e-07 KIAA0004 ( 1307 res) ha00065 (1307) 430 49.6 4.3e-06 KIAA0373 ( 1540 res) hh00281 (1540) 429 49.6 5e-06 KIAA1565 ( 1313 res) bf00184 (1313) 391 46.6 3.4e-05 KIAA1000 ( 1956 res) hk09604y2 (1956) 383 46.3 6.7e-05 KIAA0949 ( 1559 res) af07325 (1559) 346 43.3 0.00042 KIAA1275 ( 1140 res) hk10413 (1140) 342 42.8 0.00043 KIAA0912 ( 1300 res) hk03560(revised) (1300) 341 42.8 0.00049 KIAA2015 ( 996 res) fk09763 ( 996) 335 42.2 0.00057 KIAA1223 ( 1089 res) pg00513 (1089) 317 40.9 0.0016 KIAA1749 ( 1047 res) pj02119y1 (1047) 314 40.6 0.0018 KIAA0619 ( 1428 res) hg04117 (1428) 316 40.9 0.002 KIAA1728 ( 1644 res) pg00239 (1644) 308 40.4 0.0032 KIAA0378 ( 970 res) hh00502s1 ( 970) 300 39.5 0.0036 KIAA1081 ( 1003 res) bg00262 (1003) 291 38.8 0.006 >>KIAA1334 ( 989 res) fh15842 (989 aa) initn: 1460 init1: 829 opt: 1105 Z-score: 482.2 bits: 101.2 E(): 9.6e-22 Smith-Waterman score: 1238; 27.188% identity (60.615% similar) in 1074 aa overlap (1-1047:10-988) 10 20 30 40 50 KIAA15 MKSLKSRLRRQDVPGPASSGAAAASAHAADWNKYDDRLMKAAERGDVEKVT :::::...:..:. .::: ::::..:.: ::.:::. 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KIAA13 LGYNALHYSKLSENAGIQSLL------------------------LSKISQDADLKTPTK 230 240 250 260 300 310 320 330 340 350 KIAA15 EHQNIQDLEIENEDLKERLRKIQQEQRILLDKVNGLQLQLNEEVMVADDLESEREKLKSL .:. : .: .: .... .. ::. :. : : .. KIAA13 PKQHDQVSKISSER-----SGTPKKRKAPPPPISPTQLS---------DVSSPRSITSTP 270 280 290 300 360 370 380 390 400 KIAA15 LAAKEK------QHEESLRTIEALKNRFKYFES--DHLGSGSHFSNRKEDMLLKQGQMYM :..::. . . .:. :.:.. . : : . : ..... ::. : . KIAA13 LSGKESVFFAEPPFKAEISSIRENKDRLSDSTTGADSLLDISSEADQQD--LLSLLQAKV 310 320 330 340 350 360 410 420 430 440 450 460 KIAA15 ADSQCTSPGIPAHMQSRSMLRPLELSLPSQTSYSENEILKKELEAMRTFCESAKQDRLKL :. . . ..:..: . : .: .. .: . : : :.. : . KIAA13 ASLTLHNKELQDKLQAKSP-KEAEADLSFDSYHSTQTDLGPSLGKP---GETSPPDSKSS 370 380 390 400 410 420 470 480 490 500 510 520 KIAA15 QNELAHKVAECKALALECERVKEDSDEQIKQLEDALKDVQKRMYESEGKVKQMQTHFLAL . : :.... . :.: .:.::.. :.:.:::. ::.. ::.:... . KIAA13 PSVLIHSLGKSTT----------DNDVRIQQLQEILQDLQKRLESSEAERKQLQVELQSR 430 440 450 460 470 530 540 550 560 570 KIAA15 KEHLTSEAASGNHRLTEELKDQLKDLKVKYEGASAEVGKLRNQIKQNEMIVEEFKR---- . .:. . . . .:...::. . ::: : :: ....:.: . . : . KIAA13 RAELVCLNNTEISENSSDLSQKLKETQSKYEEAMKEVLSVQKQMKLGLVSPESMDNYSHF 480 490 500 510 520 530 580 590 600 610 620 630 KIAA15 DEGKLIEEN-KRLQKELSMCEMEREKKGRKVTEMEGQAKELSAKLALSIPAEKFENMKSS : .. ::. . :...:. : :.. .:: :.: . : ... :.:..:.:::: KIAA13 HELRVTEEEINVLKQDLQNALEESERNKEKVRELEEKLVEREKGTVIKPPVEEYEEMKSS 540 550 560 570 580 590 640 650 660 670 680 690 KIAA15 LSNEVNEKAKKLVEMEREHEKSLSEIRQLKRELENVKAKLAQHVKPEEHEQVKSRLEQKS . ... :. . . ...... :: .:: ...:....:... .: :..: ... KIAA13 YCSVIENMNKEKAFLFEKYQEAQEEIMKLK---DTLKSQMTQEAS-DEAEDMKEAMNRMI 600 610 620 630 640 700 710 720 730 740 750 KIAA15 GELGKKITELTLKNQTLQKEIEKVYLDNKLLKEQAHNLTIEMKNHYVPLKVSEDMKKSHD ::.:...::. . : :.: : : :.. .: : :. : :. KIAA13 DELNKQVSELSQLYKEAQAELED-YRKRKSLED----VTAE----YI-------HKAEHE 650 660 670 680 690 760 770 780 790 800 810 KIAA15 AIIDDLNRKLLDVTQKYTEKKLEMEKLLLENDSLSKDVSRLETVFVPPEKHEKEIIALKS ... : . . . .: : .. :.: : .:.. :. . : .: . : .:.. KIAA13 KLMQLTNVSRAKAEDALSEMKSQYSKVLNELTQLKQLVDAQKENSVSITEHLQVITTLRT 700 710 720 730 740 750 820 830 840 850 860 870 KIAA15 NIVELKKQLSELKKKCGEDQEKIHALTSENTNLKKMMSNQYVPVKTHEEVKMTLNDTLAK :.....:.::.. . . .. : .. . : :.. .:: ...:... .:.. .. KIAA13 AAKEMEEKISNLKEHLASKEVEVAKLEKQLLEEKAAMTDAMVPRSSYEKLQSSLESEVSV 760 770 780 790 800 810 880 890 900 910 920 930 KIAA15 TNRELLDVKKKFEDINQEFVKIKDKNEILKRNLENTQNQIKAEYISLAEHEAKMSSLSQS .: . :. : ...: :.:... .::. :: :. .:.. . : :... .. KIAA13 LASKLKESVKEKEKVHSEVVQIRSEVSQVKREKENIQTLLKSKEQEVNELLQKFQQAQEE 820 830 840 850 860 870 940 950 960 970 980 990 KIAA15 ---MRKVQDSNAEILANYRKGQEEIVTLHAEIKAQKKELDTIQECIKVKYAPIVSFEECE :.. ..:.... . : .: . :. :. :.... ...:. : .. . KIAA13 LAEMKRYSESSSKLEEDKDK---KINEMSKEVTKLKEALNSLS---QLSYSTSSSKRQSQ 880 890 900 910 920 1000 1010 1020 1030 1040 KIAA15 R--KFKATEKELKDQLSE---QTQK----YSVSEEEVKKNKQEND--KLKKEIFTLQKDL . .. :.:..::.: : :. : . . ......: :. :.:.:. :. KIAA13 QLEALQQQVKQLQNQLAECKKQHQEVISVYRMHLLYAVQGQMDEDVQKVLKQILTMCKNQ 930 940 950 960 970 980 1050 1060 1070 1080 1090 1100 KIAA15 RDKTVLIEKSHEMERALSRKTDELNKQLKDLSQKYTEVKNVKEKLVEENAKQTSEILAVQ .: KIAA13 SQKK >>KIAA1981 ( 862 res) fk03148(revised) (862 aa) initn: 831 init1: 718 opt: 824 Z-score: 366.4 bits: 79.6 E(): 2.7e-15 Smith-Waterman score: 831; 30.115% identity (61.702% similar) in 611 aa overlap (22-619:27-597) 10 20 30 40 50 KIAA15 MKSLKSRLRRQDVPGPASSGAAAASAHAADWNKYDDRLMKAAERGDVEKVTSILA :::: . ::.: :.::..:.: .:. .:....: KIAA19 GRRLLLEPRAPPAPRAPDAMKQLCLCAAASFASQDWGKSDERLLQAVENNDAPRVAALIA 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 KIAA15 KKGVNPGKLDVEGRSVFHVVTSKGNLECLNAILIHGVDITTSDTAGRNALHLAAKYGHAL .::. : ::: ::.:.::... .: ::.... :: .. ..: :: ::::::::::: KIAA19 RKGLVPTKLDPEGKSAFHLAAMRGAASCLEVMIAHGSNVMSTDGAGYNALHLAAKYGHPQ 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 KIAA15 CLQKLLQYNCPTEHADLQGRTALHDAAMADCPSSIQLLCDHGASVNAKDVDGRTPLVLAT ::..::: .: .. .: .: :::: :: . : : ..::. : .: .: .: :::..:. KIAA19 CLKQLLQASCVVDVVDSSGWTALHHAAAGGCLSCSEVLCSFKAHLNPQDRSGATPLIIAA 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 KIAA15 QMSRPTICQLLIDRGADVNSRDKQNRTALMLGCEYGCRDAVEVLIKNGADISLLDALGHD :: . .:.::...:: .:..: :.::::::.:: . ..::::...::. .. ::::.: KIAA19 QMCHTDLCRLLLQQGAAANDQDLQGRTALMLACEGASPETVEVLLQGGAQPGITDALGQD 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 KIAA15 SSYY-ARIGDNLDILTLLKTASENTNKGRELWK--KGPSLQQRNLTHMQDEVNVKSHQRE ...: : ::.: :: ::. :.. . : . .: . .: ... . :... KIAA19 AAHYGALAGDKL-ILHLLQEAAQRPSPPSALTEDDSGEASSQNSMSSHGKQGAPKKRKAP 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 KIAA15 HQNIQDLEIENEDLKERLRKIQQEQRILLDKVNGLQL---QLNEEVMVADDL---ESERE . ...: :.. ...::. ::.:. ::. : ..: :..: : . . KIAA19 PPPASIPMPDDRDAYEEIVRLRQERGRLLQKIRGLEQHKEQRQQESPEASSLHILERQVQ 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 KIAA15 KLKSLLAAKEKQHEESLRTIEALKNRFKYFESDHLGSGSHFSN-RKEDMLLKQ--GQMYM .:..::. .....: : .:.:..:.. .:... ... .. . :. : . : . KIAA19 ELQQLLVERQEEKESLGREVESLQSRLSLLENERENTSYDVTTLQDEEGELPDLPGAEVL 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 KIAA15 ADSQCTSPGIPAHMQSRSMLRPLELSLPSQTSYSENEILKKELEAMRTFCESAKQDRLKL . : ::. :. : :. .. : .:. : .... ...: ..:. .. KIAA19 LSRQ-LSPSAQEHLAS------LQEQVAVLTR--QNQELMEKVQILENF----EKDETQM 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 KIAA15 QNELAHKVAECKALALECERVKEDSDEQIKQLEDALKDVQKRMYESEGKVKQMQTHFLAL . : .:: ::: . .. . :. .: .::. ..:..:. . KIAA19 EVE---ALAEVIPLALY-DSLRAEFDQLRRQHAEALQ-----------ALRQQETREVPR 470 480 490 500 510 530 540 550 560 570 580 KIAA15 KEHLTSEAASGNHRLTEELKDQLKDLKVKYEGASAEVGKLRNQIKQNEMIVEEFKRDEGK .: :: :. ... . ... .:. : ..... : : :: :: KIAA19 EEG----AACGESEVAGATATKNGPTHMELNGSVAP----ETKVNGAETIDEEAAGDE-- 520 530 540 550 560 590 600 610 620 630 640 KIAA15 LIEENKRLQKELSMCEME-REKKGRKVTEMEGQAKELSAKLALSIPAEKFENMKSSLSNE : . .. : . . : : :::: . . :. KIAA19 -TMEARTMEAEATGAKATGAEATGAKVTETKPTGAEVREMETTEEEANMETKPTGAQATD 570 580 590 600 610 620 650 660 670 680 690 700 KIAA15 VNEKAKKLVEMEREHEKSLSEIRQLKRELENVKAKLAQHVKPEEHEQVKSRLEQKSGELG KIAA19 TETTGVEAMGVEATKTKAEEAEMQAYGVGAGQAEPPVTGTTNMEATGSRATGMEATGVSA 630 640 650 660 670 680 >>KIAA1074 ( 1715 res) hj06637 (1715 aa) initn: 362 init1: 238 opt: 473 Z-score: 217.8 bits: 53.1 E(): 5.2e-07 Smith-Waterman score: 634; 22.033% identity (53.914% similar) in 1584 aa overlap (6-1398:23-1567) 10 20 30 40 KIAA15 MKSLKSRLRRQDVPGPASSGAAAASAHAADWNKYD-DRLMKAA .: ::... : . : .: : . : .. ::: KIAA10 SPVAWAMKKIFSKKGESPLGSFARRRRSSAGGGGEPGEGAYSQPGYHVRDRDLGKIHKAA 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 KIAA15 ERGDVEKVTSILA--KKGVNPGKLDVEGRSVFHVVTSKGNLECLNAILIHGVDITTSDTA :.: :: .:: :.:.: : .:...:.. ..:. : .. .. . .... :. KIAA10 SAGNVAKVQQILLLRKNGLNDR--DKMNRTALHLACANGHPEVVTLLVDRKCQLNVCDNE 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 KIAA15 GRNALHLAAKYGHALCLQKLLQYNCPTEHADLQGRTALHDAAMADCPSSIQLLCDHGASV .:.:: :.. . : ::... . ::..: :::: :.. . : : . :.. KIAA10 NRTALMKAVQCQEEKCATILLEHGADPNLADVHGNTALHYAVYNEDISVATKLLLYDANI 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 KIAA15 NAKDVDGRTPLVLATQMSRPTICQLLIDRGADVNSRDKQNRTALMLGCEYGCRDAVE--V .::. : :::.::.. .. . ..:: . :.::. :: . . ... :: . . KIAA10 EAKNKDDLTPLLLAVSGKKQQMVEFLIKKKANVNAVDKLESSHQLIS-EYKEERIPKHSS 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 KIAA15 LIKNGADISLLDAL-------GHDSSYYARIGDNLDI---------LTLLKTASENTNKG .:..: : :.: : :.:. . ..:.. :. : :::... :. KIAA10 QNSNSVDESSEDSLSRLSGKPGVDDSWPTSDDEDLNFDTKNVPKPSLAKLMTASQQSRKN 240 250 260 270 280 290 270 280 290 300 KIAA15 RELWKKGPSLQQRNL-----THMQDEVNVKSHQREHQNIQDLE---IENEDLKER----- : .:.: . :::: :.: ..: . .. :: . KIAA10 LEATYGTVRTGNRTLFEDRDSDSQDEVVVESLPTTSIKVQCFSHPTYQSPDLLPKPSHKS 300 310 320 330 340 350 310 320 330 340 350 KIAA15 -----LRKIQQEQRILLDKVNGLQL-------QLNEEVMV-ADDL-ESEREKLKSLLAAK : : . . . : ::... : :.. .. .:.. ...: . : :. KIAA10 LANPGLMKEEPTKPGIAKKENGIDIIESAPLEQTNNDNLTYVDEVHKNNRSDMMSALGLG 360 370 380 390 400 410 360 370 380 390 400 KIAA15 EKQHEESLRTIEALKNRFKYFESDHL-----GSGSHFSNRK-EDMLLKQGQMY------M ... :: :.... : : : :. ....:.. ::.. . : : KIAA10 QEEDIESPWDSESISENFPQKYVDPLAGAADGKEKNIGNEQAEDVFYIPSCMSGSRNFKM 420 430 440 450 460 470 410 420 430 440 450 460 KIAA15 ADSQCT-SPGIP-AHMQSRSMLRPLELSLPSQTSYSENEILKKELEAMRTFCESAKQD-R : . : . :.: :::.: :. .. . : .. :.... . .:..: . KIAA10 AKLEDTRNVGMPVAHMESPERYLHLKPTIEMKDSVPNKAGGMKDVQTSK----AAEHDLE 480 490 500 510 520 530 470 480 490 500 510 KIAA15 LKLQNELAHKVAECKALALECERVKEDSDEQ--IKQLEDALKDVQKRMYESEG---KVKQ . ..: .. .: . .: :: :. ..:. ...:. : . ...: : :. KIAA10 VASEEEQEREGSENNQPQVEEERKKHRNNEMEVSANIHDGATDDAEDDDDDDGLIQKRKS 540 550 560 570 580 590 520 530 540 550 560 KIAA15 MQTHFLALKEHLTSEAASGNHRLTEELKDQLKDLKVKYEGASAEV-GK---LRNQIKQ-- .: . .. ..: ::: .:.:. :. ... :.... : :: : . . : KIAA10 GETDHQQFPRKENKEYASGPALQMKEVKSTEKEKRTSKESVNSPVFGKASLLTGGLLQVD 600 610 620 630 640 650 570 580 590 600 KIAA15 NEMIVEEFKRDEG----KLIEENKRLQKEL-SM----------------CEMEREKKGRK .. . :. .::: : .:........ :: ::. . . KIAA10 DDSSLSEIDEDEGRPTKKTSNEKNKVKNQIQSMDDVDDLTQSSETASEDCELPHSSYKNF 660 670 680 690 700 710 610 620 630 640 650 660 KIAA15 VTEMEGQAKELSAKLAL------SIPAEKFENMKSSLSNEVNEKAKKLVEMEREHEKSLS . .: . : . ...: .. :.. ..:.. . .. : ::. . .. :: KIAA10 MLLIEQLGMECKDSVSLLKIQDAALSCERLLELKKNHCELLTVKIKKMEDKVNVLQRELS 720 730 740 750 760 770 670 680 690 700 KIAA15 EIRQLKRELENVKAKLAQHV--------KPEE--------HEQVKSRLEQKSGELGKKIT : ...: .::. :.. ... . :: .:... .:..: . :.. KIAA10 ETKEIKSQLEHQKVEWERELCSLRFSLNQEEEKRRNADTLYEKIREQLRRKEEQYRKEVE 780 790 800 810 820 830 710 720 730 740 KIAA15 ---ELTLKNQTLQKEIEKVYLD-NKLLKEQA---HNLTIE----------MKNHYVPLKV .: :. :::. :.. : . :....:. ..:. : . :: : KIAA10 VKQQLELSLQTLEMELRTVKSNLNQVVQERNDAQRQLSREQNARMLQDGILTNHLSKQKE 840 850 860 870 880 890 750 760 770 780 790 800 KIAA15 SEDMKKSHDAIIDDLNRKLLDVTQKYTEKKLEMEKLLLENDSLS-----KDVSRLETVFV : .:. .. . ... :...: . . :. : :: :... :. . .: . . KIAA10 IEMAQKKMNSENSHSHEEEKDLSHKNSMLQEEIAMLRLEIDTIKNQNQEKEKKCFEDLKI 900 910 920 930 940 950 810 820 830 840 850 860 KIAA15 PPEKHEKEIIALKSNIVELKKQLSELKKKCGEDQEKIHALTSENTNLKKMMSNQYVPVKT ::.: ..:.: : . .:. . . . . :.:. : :. . :.. KIAA10 VKEKNEDLQKTIKQNEETLTQTISQYNGRLSVLTAENAMLNSKLENEKQSKERLEAEVES 960 970 980 990 1000 1010 870 880 890 900 910 KIAA15 -HEEVKMTLNDTLAK--TNRELL-------DVKKKFED-INQEFVKIKDKNEILKRNLEN : .. ...: . ..::: : ....: .: . ..::.::::...: . KIAA10 YHSRLAAAIHDRDQSETSKRELELAFQRARDECSRLQDKMNFDVSNLKDNNEILSQQLFK 1020 1030 1040 1050 1060 1070 920 930 940 950 KIAA15 TQNQIKAEYI-------SLAEH----EAKMSSLSQS---MRKVQDS--NAEILANYRKGQ :...... : .: :. : ...:::. :...... : .. .: :. KIAA10 TESKLNSLEIEFHHTRDALREKTLGLERVQKDLSQTQCQMKEMEQKYQNEQVKVNKYIGK 1080 1090 1100 1110 1120 1130 960 970 980 990 1000 KIAA15 EEIVT-----LHAEIKAQKKELDTIQECIKVKYAPIVS----FEECERKFKATEKELKDQ .: : :..: ...:: .. : ... :. .:..: :.: .. 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KIAA10 FKNLLKM----TRKKLNEYENGEFSFHGD---LKTSQFEMDIQINKLKHKIDDLTAELET 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1250 1260 1270 1280 1290 KIAA15 LNEKLANLNRKYEEVCEEVLHAK----KKEISAKDEKELLHFSIEQEI---KDQKERCDK . : .:. : . . ::.: : : : :..:.: :::. ... :: KIAA10 AGSKCLHLDTKNQILQEELLSMKTVQKKCEKLQKNKKKL-----EQEVINLRSHIERNMV 1430 1440 1450 1460 1470 1300 1310 1320 1330 1340 1350 KIAA15 SLTTITELQRRIQESAKQIEAKDNKITELLNDVERLKQALNGLSQLT---YTSGNPTKRQ : . . ...:.: :.: .:.: :..:. . :: .. :: . . .: .. . 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