# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hh04104mrp1.fasta.nr -Q ../query/KIAA1529.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1529, 1680 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7814586 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9934+/-0.000199; mu= 12.2949+/- 0.011 mean_var=121.5968+/-22.858, 0's: 29 Z-trim: 86 B-trim: 84 in 1/65 Lambda= 0.116309 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|55741661|ref|NP_065944.1| hypothetical protein (1646) 10766 1819.2 0 gi|51476370|emb|CAH18175.1| hypothetical protein [ (1708) 5719 972.4 0 gi|114625751|ref|XP_520133.2| PREDICTED: hypotheti (1703) 5588 950.4 0 gi|194381090|dbj|BAG64113.1| unnamed protein produ ( 905) 5553 944.2 0 gi|123123574|emb|CAM22128.1| novel protein [Mus mu (1488) 4836 824.1 0 gi|149045826|gb|EDL98826.1| rCG54779 [Rattus norve ( 626) 2312 400.2 2.7e-108 gi|148670438|gb|EDL02385.1| mCG14146 [Mus musculus (1388) 2038 354.6 3.2e-94 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gi|12836354|dbj|BAB23619.1| unnamed protein produc ( 621) 658 122.7 9.4e-25 gi|118118382|ref|XP_001235991.1| PREDICTED: hypoth ( 247) 632 117.9 1e-23 gi|115665299|ref|XP_798947.2| PREDICTED: hypotheti ( 556) 634 118.6 1.4e-23 gi|148744079|gb|AAI42271.1| MGC157266 protein [Bos ( 618) 631 118.2 2.2e-23 gi|67678213|gb|AAH97368.1| Hypothetical LOC298077 ( 621) 623 116.8 5.5e-23 gi|126334124|ref|XP_001372459.1| PREDICTED: hypoth ( 641) 585 110.5 4.7e-21 gi|149415625|ref|XP_001520426.1| PREDICTED: hypoth ( 385) 570 107.7 1.9e-20 gi|55631939|ref|XP_520132.1| PREDICTED: similar to ( 118) 495 94.6 5.1e-17 gi|169641866|gb|AAI60523.1| LOC100145324 protein [ ( 646) 465 90.3 5.4e-15 gi|221126145|ref|XP_002154373.1| PREDICTED: hypoth ( 400) 450 87.6 2.2e-14 gi|126631988|gb|AAI34163.1| Zgc:162946 protein [Da ( 609) 435 85.3 1.7e-13 gi|190587480|gb|EDV27522.1| hypothetical protein T ( 333) 428 83.8 2.5e-13 gi|47220002|emb|CAG11535.1| unnamed protein produc ( 85) 418 81.6 3.1e-13 gi|189538475|ref|XP_001333657.2| PREDICTED: simila ( 586) 409 80.9 3.4e-12 gi|115774841|ref|XP_784469.2| PREDICTED: hypotheti ( 368) 396 78.5 1.1e-11 gi|124427679|emb|CAK92455.1| unnamed protein produ (2175) 360 73.2 2.5e-09 gi|124418019|emb|CAK83011.1| unnamed protein produ (1481) 351 71.6 5.6e-09 gi|190587481|gb|EDV27523.1| hypothetical protein T (1147) 346 70.6 8.3e-09 gi|123123575|emb|CAM22129.1| novel protein [Mus mu ( 375) 338 68.8 9.7e-09 gi|158276288|gb|EDP02061.1| flagellar associated p (1544) 321 66.6 1.9e-07 gi|115918897|ref|XP_001201709.1| PREDICTED: hypoth ( 283) 307 63.5 2.9e-07 gi|115969912|ref|XP_001178857.1| PREDICTED: hypoth ( 357) 307 63.6 3.4e-07 gi|89287594|gb|EAR85583.1| hypothetical protein TT (1955) 311 65.0 7.1e-07 gi|156209703|gb|EDO30951.1| predicted protein [Nem ( 82) 290 60.1 8.9e-07 gi|109509437|ref|XP_001077753.1| PREDICTED: hypoth ( 532) 301 62.7 9.1e-07 gi|156224853|gb|EDO45675.1| predicted protein [Nem ( 626) 296 62.0 1.8e-06 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:::::::::.:...:: ::::::.:::.:::.::..:::.:.:::::::::::::::::: gi|123 FSEGGNFSPEEVETLCHRLEKEATRIEFVESLIMIHMEKMETEYLDQANDVINKFESKFH 870 880 890 900 910 920 1120 1130 1140 1150 1160 1170 KIAA15 NLSVDLIFIEKIQRLLTNLQVKIKCQVAKSNSQTNGLNFSLQQLQNKIKTCQESRGEKTT ::: ::::.::::::.:::::.:::: ::::::..::: ::.:::.::.:::. ::.: gi|123 NLSSDLIFVEKIQRLMTNLQVNIKCQEAKSNSQAEGLNSSLEQLQQKIQTCQDHRGDKDI 930 940 950 960 970 980 1180 1190 1200 1210 1220 1230 KIAA15 VTTEELLSFVQTWKEKLSQRIQYLNCSLDRVSMTELVFTNTILKDQEEDSDILTSSEALE :::..::.::..:::::::::.::::::: ::.:. :::.::: : : .::. : :::: gi|123 VTTDDLLAFVRSWKEKLSQRIKYLNCSLDMVSITQEVFTDTILADTEVESDMHMSMEALE 990 1000 1010 1020 1030 1040 1240 1250 1260 1270 1280 1290 KIAA15 EEAKLDVVTPESFTQLSRVGKPLIEDPAVDVIRKLLQLPNTKWPTHHCDKDPSQTGFKRH :..:. .::::::.: .:.:.:.::::::::.:..::. ..: : :::: :::..:: gi|123 EDVKVGLVTPESFAQPTRMGRPMIEDPAVDVVRRILQISQAK-STCPCDKDRSQTALKR- 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1300 1310 1320 1330 1340 1350 KIAA15 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gi|148 SDE----------------------------------------IPYEEMEFFTTTSGNTY 720 730 1010 1020 1030 1040 1050 1060 KIAA15 FVFVPLEEEHCRKSHSTFSAMFINDTSSAKFIEQVTIPSRLILEIKKQLFSEGGNFSPKE :.:. .:.:. .:. ..:. . :.::::.::..:::..:: ::::::::::.: gi|148 FAFLSVEDEQQIHSRPHSHHNLLNSFCT-KYIEQVSIPQKLILKVKKGLFSEGGNFSPEE 740 750 760 770 780 1070 1080 1090 1100 1110 1120 KIAA15 INSLCSRLEKEAARIELVESVIMLNMEKLENEYLDQANDVINKFESKFHNLSVDLIFIEK ...:: ::::::.:::.:::.::..:::.:.::::::::::::::::::::: ::::.:: gi|148 VETLCHRLEKEATRIEFVESLIMIHMEKMETEYLDQANDVINKFESKFHNLSSDLIFVEK 790 800 810 820 830 840 1130 1140 1150 1160 1170 1180 KIAA15 IQRLLTNLQVKIKCQVAKSNSQTNGLNFSLQQLQNKIKTCQESRGEKTTVTTEELLSFVQ ::::.:::::.:::: ::::::..::: ::.:::.::.:::. ::.: :::..::.::. gi|148 IQRLMTNLQVNIKCQEAKSNSQAEGLNSSLEQLQQKIQTCQDHRGDKDIVTTDDLLAFVR 850 860 870 880 890 900 1190 1200 1210 1220 1230 1240 KIAA15 TWKEKLSQRIQYLNCSLDRVSMTELVFTNTILKDQEEDSDILTSSEALEEEAKLDVVTPE .:::::::::.::::::: ::.:. :::.::: : : .::. : :::::..:. .:::: gi|148 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protein [Homo (260 aa) initn: 918 init1: 918 opt: 1688 Z-score: 1539.4 bits: 295.2 E(): 4.8e-77 Smith-Waterman score: 1688; 99.617% identity (99.617% similar) in 261 aa overlap (1420-1680:1-260) 1390 1400 1410 1420 1430 1440 KIAA15 DTFDQCAENISKKILEYQSQANKYHNSCLIELRIQIRRFEELLPQVCWLVMENFKEHHWK :::::::::::::::::::::::::::::: gi|509 ELRIQIRRFEELLPQVCWLVMENFKEHHWK 10 20 30 1450 1460 1470 1480 1490 1500 KIAA15 KFFTSVKEIRGQFEEQQKRLEKRKDKNAQKLHLNLGHPVHFQEMESLHLSEEERQEELDS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|509 KFFTSVKEIRGQFEEQQKRLEKRKDKNAQKLHLNLGHPVHFQEMESLHLSEEERQEELDS 40 50 60 70 80 90 1510 1520 1530 1540 1550 1560 KIAA15 MIRMNKEKLEECTRRNGQVFITNLATFTEKFLLQLDEVVTIDDVQVARMEPPKQKLSMLI ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::: gi|509 MIRMNKEKLEECTRRNGQVFITNLATFTEKFLLQLDEVVTIDDVQVA-MEPPKQKLSMLI 100 110 120 130 140 1570 1580 1590 1600 1610 1620 KIAA15 RRKLAGLSLKEESEKPLIERGSRKWPGIKPTEVTIQNKILLQPTSSISTTKTTLGHLAAV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|509 RRKLAGLSLKEESEKPLIERGSRKWPGIKPTEVTIQNKILLQPTSSISTTKTTLGHLAAV 150 160 170 180 190 200 1630 1640 1650 1660 1670 1680 KIAA15 EARDAVYLKYLASFEEELKRIQDDCTSQIKEAQRWKDSWKQSLHTIQGLYV ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|509 EARDAVYLKYLASFEEELKRIQDDCTSQIKEAQRWKDSWKQSLHTIQGLYV 210 220 230 240 250 260 >>gi|26343903|dbj|BAC35608.1| unnamed protein product [M (310 aa) initn: 1509 init1: 1509 opt: 1509 Z-score: 1376.1 bits: 265.2 E(): 6e-68 Smith-Waterman score: 1509; 71.613% identity (90.000% similar) in 310 aa overlap (427-736:1-310) 400 410 420 430 440 450 KIAA15 LFLKVENDTNLEDYTIQALLELWDKVAGRLLLRKQEIKELDEALHSLEFSRTDKLKSVLK . .::::::::: : .:: ::.:::: ::: gi|263 MQQKQEIKELDEELLALEVSRADKLKEVLK 10 20 30 460 470 480 490 500 510 KIAA15 KYAEVIEKTSYLMRPEVYRLINEEAMVMNYALLGNRKALAQLFVNLMESTLQQELDSRHR .:. .::::::...:.:::::..:::.:: ::::::.:.:::.::: :::::::::.::: gi|263 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