# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fg02934mrp1.fasta.nr -Q ../query/KIAA1510.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1510, 1140 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7805306 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0037+/-0.000198; mu= 11.4807+/- 0.011 mean_var=115.0193+/-22.268, 0's: 33 Z-trim: 142 B-trim: 67 in 1/66 Lambda= 0.119588 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|66347353|emb|CAI95066.1| collagen, type XX, alp (1297) 7734 1346.3 0 gi|66347352|emb|CAI95065.1| collagen, type XX, alp (1284) 7584 1320.4 0 gi|45946128|gb|AAH43183.1| Collagen, type XX, alph (1284) 7568 1317.6 0 gi|114683021|ref|XP_001148451.1| PREDICTED: hypoth (1284) 7455 1298.1 0 gi|161784304|sp|Q9P218.3|COKA1_HUMAN RecName: Full (1329) 6623 1154.6 0 gi|194672306|ref|XP_597723.4| PREDICTED: similar t (1566) 5863 1023.5 0 gi|123231311|emb|CAM23231.1| collagen, type XX, al (1280) 5702 995.7 0 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