# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fh14721.fasta.huge -Q ../query/KIAA1509.ptfa ./tmplib.25089 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1509, 1365 aa vs ./tmplib.25089 library 1986140 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.8104+/-0.0117; mu= -29.4527+/- 0.783 mean_var=707.5737+/-172.050, 0's: 0 Z-trim: 19 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.048216 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1212 ( 802 res) fh00638s1 ( 802) 1519 121.7 5.1e-28 KIAA1512 ( 2010 res) fg04660y1 (2010) 330 39.4 0.0078 KIAA1275 ( 1140 res) hk10413 (1140) 321 38.5 0.008 >>KIAA1212 ( 802 res) fh00638s1 (802 aa) initn: 1380 init1: 1289 opt: 1519 Z-score: 594.9 bits: 121.7 E(): 5.1e-28 Smith-Waterman score: 1529; 37.637% identity (67.113% similar) in 821 aa overlap (394-1197:5-797) 370 380 390 400 410 420 KIAA15 PAGKTAASHQGKEAWGPGHKEATMELLRVKDRAIELERNNAALQAEKQLLKEQLQHLETQ : .:.:::::.:::::: :: ::..:::: KIAA12 HASADAWVEVERNNATLQAEKQALKTQLKQLETQ 10 20 30 430 440 450 460 470 480 KIAA15 NVTFSSQILTLQKQSAFLQEHNTTLQTQTAKLQVENSTLSSQSAALTAQYTLLQNHHTAK : ....:::.::.:.. :::.:::::::.::::::::::.:::..: : . : .... 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KIAA12 YATLPRASSV---ISTAEGTTRRTSIHDFLTKDSRLPISVDSPPAAADSNTTAASNVDKV 730 740 750 760 770 780 1190 1200 1210 1220 1230 1240 KIAA15 PPSSHSLARERTPLVGKAGSSCQGPGPRSRPLDTRRFSLAPPKEERLAPLHQSATAPAIA : .: .: : KIAA12 QESRNSKSRSREQQSS 790 800 >>KIAA1512 ( 2010 res) fg04660y1 (2010 aa) initn: 157 init1: 99 opt: 330 Z-score: 142.8 bits: 39.4 E(): 0.0078 Smith-Waterman score: 371; 24.451% identity (55.632% similar) in 728 aa overlap (45-723:1218-1925) 20 30 40 50 60 70 KIAA15 LRCGSWILPPSHHNPLSVFPQLLPFSRVPLELRRLVETMRFTSTKLAQMERENQQLEREK ::..: : .. .. : ... .. : : KIAA15 QARAEELEEELEAERAARARVEKQRAEAARELEELSERLEEAGGASAGQREGCRKREAEL 1190 1200 1210 1220 1230 1240 80 90 100 110 120 130 KIAA15 EELRKNVDLLKALGKKSERLELSYQSVSAENLRLQQSLESSSHKTQTLESELGELEAERQ .::.... :: ... : ... . .: ....: .. : ::.: .::. : . 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KIAA15 EAEEGVEAANAKCSSLEKAKLRLQTESEDVTLELERATSAAAALDKKQRHLERALEERRR 1480 1490 1500 1510 1520 1530 370 380 390 400 410 KIAA15 KTAASHQGKEAWGPGHKEATMELLRVK---DRAIE----LERNNAALQAEKQLLKEQ--L . .. :: . ::.:.. ..:.: :.:.: :: : . : .: : KIAA15 QEEEMQRELEAAQRESRGLGTELFRLRHGHEEALEALETLKRENKNLQEEISDLTDQVSL 1540 1550 1560 1570 1580 1590 420 430 440 450 460 470 KIAA15 QHLETQNVTFSSQILTLQKQ--SAFLQEHNTTLQ---TQTAKLQVENSTLSSQSAALTAQ . :.. ... : .:. .: :.: . .:. :.: ..:.: : .... :. KIAA15 SGKSIQELEKTKKALEGEKSEIQAALEEAEGALELEETKTLRIQLELSQVKAEVDRKLAE 1600 1610 1620 1630 1640 1650 480 490 500 510 KIAA15 Y-----TLLQNHHTAKETENESLQRQQE------QLTAAYEALLQDHE-HLGTLHE-RQS .: .::. : :. . ::. . . .: .:. :.: : .:: : ::. 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KIAA15 GERSRRLA---EQELLEATERLNLLHSQNTGLLNQKKKLEADLAQLSGEVEEAAQERREA 1780 1790 1800 1810 1820 640 650 660 670 680 KIAA15 QARFDELKEQHQTMDISLTKLDNHCELLSRLKGNLEEENHHLLSQIQLLSQ--------Q . . . . : : : .. : :.: .::. ..: .... : : KIAA15 EEKAKKAITDAAMMAEELKKEQDTSAHLERMKKTLEQTVRELQARLEEAEQAALRGGKKQ 1830 1840 1850 1860 1870 1880 690 700 710 720 730 740 KIAA15 NQMLLEQNMENKEQYHEEQKQYIDKLNALRRHKEKLEEKIMDQYKFYDPPPKKKNHWIGA : : . : . . :::.. . :...:.:.....: KIAA15 VQKLEAKVRELEAELDAEQKKHAEALKGVRKHERRVKELAYQAEEDRKNLARMQDLVDKL 1890 1900 1910 1920 1930 1940 750 760 770 780 790 800 KIAA15 KALVKLIKPKKEGSRERLKSTVDSPPWQLESSDPASPAASQPLRSQAENPDTPALGSNCA KIAA15 QSKVKSYKRQFEEAEQQANTNLAKYRKAQHELDDAEERADMAETQANKLRARTRDALGPK 1950 1960 1970 1980 1990 2000 >>KIAA1275 ( 1140 res) hk10413 (1140 aa) initn: 159 init1: 60 opt: 321 Z-score: 142.6 bits: 38.5 E(): 0.008 Smith-Waterman score: 400; 21.622% identity (53.793% similar) in 1147 aa overlap (112-1160:28-1118) 90 100 110 120 130 KIAA15 DLLKALGKKSERLELSYQSVSAENLRLQQSLESSSHKTQTLESELGELEAER--QALRRD :.. . : ..::.. : : :. ..:.:: KIAA12 AQYAIYIVSRLILLHFLLQAREDVIHMLKTEKTKPEVLEAHYGSAEPEKVLRVLHRD 10 20 30 40 50 140 150 160 170 180 190 KIAA15 LEALRLANAQLEGAEKDRKALEQEVAQLEKDKKLLEKEAKRLWQQVELKDAV-------L :. ::. . : . . :. ...:.. .. .. .:. .:. : . : KIAA12 --AI-LAQEKSIGED----VYEKPISELDRLEEKQKETYRRMLEQLLLAEKCHRRTVYEL 60 70 80 90 100 110 200 210 220 230 240 250 KIAA15 DDSTAKLSAVEKESRALDKELARCRDAAGKLKELEKDNRDLTKQVTVHARTLTTLREDLV .. : . ..: . . : . :. :: : :: . ... .:. :. ::..:: KIAA12 ENEKHKHTDYMNKSDDFTNLLEQERERLKKLLEQEKAYQ--ARKEKENAKRLNKLRDELV 120 130 140 150 160 260 270 280 290 300 310 KIAA15 LEKLKSQQLSSELDKLSQELEKVGLNRELLLQEDDSGSDTKYKILEGRNESALKTTLAMK :::: : .:. ....:..::. . . .: :. : .: ::. . . 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KIAA12 TESQCRELRKKLQEEEHHSKELRLEVEKLQKRMSELEKLEEAFSKSKSECTQLHLNLEKE 330 340 350 360 370 380 480 490 500 510 520 KIAA15 HHTAKETENE---------SLQRQQEQLTAAYEALLQDHEHLGTL-----HERQSAEYEA .. .:. :: :. .. .: : .: .: .: .. ::.. .: KIAA12 KNLTKDLLNELEVVKSRVKELECSESRLEKAELSLKDDLTKLKSFTVMLVDERKNM-MEK 390 400 410 420 430 440 530 540 550 560 570 KIAA15 LIRQHSCLKTLHRNLELEH-------KELGERHGDMLKRKAELEEREKVLTTEREAL--- . ... . :..:...:. ..: :. .:: :.:.::. :: ::. : KIAA12 IKQEERKVDGLNKNFKVEQGKVMDVTEKLIEESKKLLKLKSEMEEKVYNLTRERDELIGK 450 460 470 480 490 500 580 590 600 610 620 630 KIAA15 --QQEQRTNALAMGENQRLRGELDRVNFLHHQL-KGEYEELHAHTKELKTSLNNAQLELN ..:.... :. . . :. .:: .. ..... .:. .. : ..... ::.. KIAA12 LKSEEEKSSELSCSVDL-LKKRLDGIEEVEREITRGRSRKGSELTCPEDNKIKELTLEIE 510 520 530 540 550 560 640 650 660 670 KIAA15 RWQARFDELK-------EQHQTMDISLTKLDNHCELLSRLKGNLEEENHHL-----LSQI : . :...:. . .. .: :. .. . . :. .::: .:.. . . KIAA12 RLKKRLQQLEVVEGDLMKTEDEYDQLEQKFRTEQDKANFLSQQLEEIKHQIAKNKAIEKG 570 580 590 600 610 620 680 690 700 710 720 730 KIAA15 QLLSQQNQMLLEQNMENKEQY--HEEQKQYIDKLNALRRHKEKLEEKIMD----QYKFYD ...::. .. . .:. .. . : . .:.. : ....: . .: : .:.. 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KIAA12 TSEEFFSSTTVIP----TLGNQKPRITIIPSPNVMPQKQKSGDTTLGPERAMSPVTITTF 860 870 880 890 900 910 960 970 980 990 1000 1010 KIAA15 PREASTP--GRNALGRHEYPLPRNGPLPQEGAQKRGTAPPYVGVRPCSASPSSEMVTLEE :: .:: ::.:.. . : ..:. : . . ..:: ..: : : . :. KIAA12 SRE-KTPESGRGAFA--DRP---TSPI-QIMTVSTSAAPAEIAVSPESQEMPMGRTILKV 920 930 940 950 960 1020 1030 1040 1050 1060 KIAA15 FLEESNRSSPTHDTPSCRDDLLSDYFRKASDPPAIGGQ--PGPPAKKEGAKMPTNFVAPT :... .:.. : . . .. . .:.: .: .. ::.. :. : :. KIAA12 TPEKQTVPTPVRKYNSNANIITTE---DNKIHIHLGSQFKRSPGTSGEGVS-PVITVRPV 970 980 990 1000 1010 1020 1070 1080 1090 1100 1110 1120 KIAA15 -VKMAAPTSEGRPLK-PGQYVKPNFRLTEAEAPPSVAP---RQAQPPQSLSLGRPRQAPV : .: : :. : .... ... . ...: .:. ::.: :. .. KIAA12 NVTAEKEVSTGTVLRSPRNHLSSRPGASKVTSTITITPVTTSSARGTQSVS-GQDGSSQR 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1130 1140 1150 1160 1170 1180 KIAA15 PPASHAPASRSASLSRAFSLA-SADLLRASGPEACKQESPQKLGAPEALGGRETGSHTLQ : .. : :.. . .. : .: : :.: : KIAA12 PTPTRIPMSKGMKAGKPVVAAPGAGNLTKFEPRAETQSMKIELKKSAASSTTSLGGGKG 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1190 1200 1210 1220 1230 1240 KIAA15 SPAPPSSHSLARERTPLVGKAGSSCQGPGPRSRPLDTRRFSLAPPKEERLAPLHQSATAP 1365 residues in 1 query sequences 1986140 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:06:06 2008 done: Thu Dec 18 15:06:07 2008 Total Scan time: 0.820 Total Display time: 0.200 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]