# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hh12031s1.fasta.nr -Q ../query/KIAA1500.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1500, 2240 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7826174 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3544+/-0.000184; mu= 15.5482+/- 0.010 mean_var=77.5143+/-15.242, 0's: 32 Z-trim: 42 B-trim: 125 in 1/64 Lambda= 0.145674 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 43, opt: 31, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|119626226|gb|EAX05821.1| Fraser syndrome 1 [Hom (4012) 14833 3128.7 0 gi|108773804|ref|NP_079350.4| Fraser syndrome 1 [H (4011) 14812 3124.3 0 gi|51315966|sp|Q86XX4.1|FRAS1_HUMAN RecName: Full= (4007) 14753 3111.9 0 gi|114594080|ref|XP_517202.2| PREDICTED: Fraser sy (4012) 14750 3111.2 0 gi|149701441|ref|XP_001492196.1| PREDICTED: simila (4011) 13962 2945.6 0 gi|74002007|ref|XP_535623.2| PREDICTED: similar to (3994) 13881 2928.6 0 gi|51315947|sp|Q80T14.1|FRAS1_MOUSE RecName: Full= (4010) 13470 2842.2 0 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(3335) 6672 1413.5 0 gi|210108537|gb|EEA56433.1| hypothetical protein B (3832) 6498 1377.0 0 gi|198429747|ref|XP_002124273.1| PREDICTED: simila (2508) 5664 1201.5 0 gi|194668085|ref|XP_001788302.1| PREDICTED: simila (3965) 5511 1169.5 0 gi|28278035|gb|AAH44881.1| Fras1 protein [Mus musc ( 783) 4967 1054.7 0 gi|50949880|emb|CAH10488.1| hypothetical protein [ ( 734) 4872 1034.7 0 gi|210086684|gb|EEA35091.1| hypothetical protein B (3884) 3424 730.9 6.4e-207 gi|26343577|dbj|BAC35445.1| unnamed protein produc ( 406) 2496 535.2 5.6e-149 gi|115927327|ref|XP_001199199.1| PREDICTED: simila (1723) 2356 506.2 1.3e-139 gi|118084941|ref|XP_417087.2| PREDICTED: similar t (3168) 2347 504.5 7.5e-139 gi|212549692|ref|NP_001131129.1| Fras1 related ext (3113) 2346 504.3 8.5e-139 gi|126327645|ref|XP_001377800.1| PREDICTED: simila (3224) 2330 500.9 9e-138 gi|126331504|ref|XP_001377186.1| PREDICTED: simila (3312) 2326 500.1 1.6e-137 gi|220678181|emb|CAX12661.1| novel protein similar (3074) 2319 498.6 4.3e-137 gi|212549690|ref|NP_001131131.1| Fras-related extr (3127) 2319 498.6 4.4e-137 gi|194221841|ref|XP_001915729.1| PREDICTED: simila (3171) 2303 495.3 4.5e-136 gi|109466659|ref|XP_001057556.1| PREDICTED: simila (3224) 2296 493.8 1.3e-135 gi|109464881|ref|XP_227142.4| PREDICTED: similar t (3224) 2296 493.8 1.3e-135 gi|90704838|dbj|BAE92301.1| Fras1 related extracel (3160) 2287 491.9 4.7e-135 gi|73620905|sp|Q6NVD0.2|FREM2_MOUSE RecName: Full= (3160) 2286 491.7 5.4e-135 gi|73993318|ref|XP_543127.2| PREDICTED: similar to (3169) 2265 487.3 1.2e-133 gi|114649453|ref|XP_522664.2| PREDICTED: FRAS1 rel (3169) 2258 485.8 3.2e-133 gi|119629013|gb|EAX08608.1| FRAS1 related extracel (3249) 2255 485.2 5e-133 gi|73620903|sp|Q5SZK8.2|FREM2_HUMAN RecName: Full= (3169) 2252 484.5 7.6e-133 gi|109120515|ref|XP_001086486.1| PREDICTED: FRAS1 (3170) 2249 483.9 1.2e-132 gi|73620904|sp|Q9GV77.1|FREM2_LYTVA RecName: Full= (3103) 2240 482.0 4.3e-132 gi|212549688|ref|NP_001131133.1| Fras1 related ext (3116) 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