# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fj07893.fasta.huge -Q ../query/KIAA1488.ptfa ./tmplib.24314 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1488, 852 aa vs ./tmplib.24314 library 1986653 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.1368+/-0.00475; mu= 19.8820+/- 0.324 mean_var=83.2799+/-19.592, 0's: 0 Z-trim: 5 B-trim: 5 in 1/39 Lambda= 0.140541 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0890 ( 1210 res) hk08057 (1210) 985 210.5 8.8e-55 KIAA0577 ( 1043 res) hj00291 (1043) 644 141.3 5.2e-34 KIAA0224 ( 1256 res) ha04657 (1256) 615 135.5 3.4e-32 KIAA0134 ( 587 res) ha04001 ( 587) 586 129.2 1.3e-30 KIAA1517 ( 998 res) fh11426(revised) ( 998) 455 103.0 1.8e-22 >>KIAA0890 ( 1210 res) hk08057 (1210 aa) initn: 1469 init1: 593 opt: 985 Z-score: 1075.4 bits: 210.5 E(): 8.8e-55 Smith-Waterman score: 1679; 36.295% identity (67.459% similar) in 799 aa overlap (24-807:429-1171) 10 20 30 40 50 KIAA14 IRNRSYIDRDSEYLLQENEPDGTLDQKLLEDLQKKKNDLRYIEMQHFREKLPS :.:.::: : .... . . .:: KIAA08 ILPLGKDSGPLSDPITGKPYVPLLEAEEVRLSQSLLE-LWRRRGPV-----WQEAPQLPV 400 410 420 430 440 450 60 70 80 90 100 110 KIAA14 YGMQKELVNLIDNHQVTVISGETGCGKTTQVTQFILDNYIERGKGSACRIVCTQPRRISA . ..: :..: :.::::.:::::::.. :..:. :. .:.:. : .. :::::::: KIAA08 DPHRDTILNAIEQHPVVVISGDTGCGKTTRIPQLLLERYVTEGRGARCNVIITQPRRISA 460 470 480 490 500 510 120 130 140 150 160 170 KIAA14 ISVAERVAAERAESCGSGNSTGYQIRLQSRLPRKQGSILYCTTGIILQWLQSDPYLSSVS .:::.::. : . : ..:.:.::.:. : . :..:.::.::.:. :::.: : .:: KIAA08 VSVAQRVSHELGPSLRR--NVGFQVRLESKPPSRGGALLFCTVGILLRKLQSNPSLEGVS 520 530 540 550 560 570 180 190 200 210 220 230 KIAA14 HIVLDEIHERNLQSDVLMTVVKDLLNFRSDLKVILMSATLNAEKFSEYFGNCPMIHIPGF :...::.:::....: :. ..: : . :...::::: . :.::.:::.::.:..::: KIAA08 HVIVDEVHERDVNTDFLLILLKGLQRLNPALRLVLMSATGDNERFSRYFGGCPVIKVPGF 580 590 600 610 620 630 240 250 260 270 280 290 KIAA14 TFPVVEYLLEDVIEKIRYVPEQKEHRSQFKRGFMQGHVNRQEKEEKEAIYKERWPDYVRE .:: :. :::.. :. :. ... : ..:.:.. :. KIAA08 MYPVKEHYLEDILAKLG------------KHQYLHRH-RHHESEDECAL----------- 640 650 660 300 310 320 330 340 350 KIAA14 LRRRYSASTVDVIEMMEDDKVDLNLIVALIRYIVLEEEDGAILVFLPGWDNISTLHDLLM ::.:.. :. .: . : :.:: :::::..:. ... :. KIAA08 ---------------------DLDLVTDLVLHIDARGEPGGILCFLPGWQEIKGVQQRLQ 670 680 690 700 360 370 380 390 400 410 KIAA14 SQVMFKSDKFLIIPLHSLMPTVNQTQVFKRTPPGVRKIVIATNIAETSITIDDVVYVIDG . .. .:.::.:.:: .: ..: .:.. : ::::::.:::::::::::.:.:.:.:. KIAA08 EALGMHESKYLILPVHSNIPMMDQKAIFQQPPVGVRKIVLATNIAETSITINDIVHVVDS 710 720 730 740 750 760 420 430 440 450 460 470 KIAA14 GKIKETHFDTQNNISTMSAEWVSKANAKQRKGRAGRVQPGHCYHLYNGLRASLLDDYQLP : :: ..: ....: . . :::.::. ::.::::: : : :::. : . .:.: KIAA08 GLHKEERYDLKTKVSCLETVWVSRANVIQRRGRAGRCQSGFAYHLFPRSRLEKMVPFQVP 770 780 790 800 810 820 480 490 500 510 520 530 KIAA14 EILRTPLEELCLQIKI-LRLGGIAYFLSRLMDPPSNEAVLLSIRHLMELNALDKQEELTP ::::::::.: :: :: . . :::. .: :. .:: .. :.:...::..: :: KIAA08 EILRTPLENLVLQAKIHMPEKTAVEFLSKAVDSPNIKAVDEAVILLQEIGVLDQREYLTT 830 840 850 860 870 880 540 550 560 570 580 590 KIAA14 LGVHLARLPVEPHIGKMILFGALFCCLDPVLTIAASLSFKDPFVIPLGKEKIADARRKEL :: .::.. ..:...: :...:.: :: :.:.... :. .::: : .. .: . : KIAA08 LGQRLAHISTDPRLAKAIVLAAIFRCLHPLLVVVSCLT-RDPFSSSLQNRAEVDKVKALL 890 900 910 920 930 940 600 610 620 630 640 650 KIAA14 AKDTRSDHLTVVNAFEGWEEARRRGFRYEKD-YCWEYFLSSNTLQMLHNMKGQFAEHLLG ..:. ::::. : : ::::. : : .. : : .: . .:...:.. ::.:.. KIAA08 SHDSGSDHLAFVRAVAGWEEVLRWQDRSSRENYLEENLLYAPSLRFIHGLIKQFSENIYE 950 960 970 980 990 1000 660 670 680 690 700 KIAA14 AGFVSSRNPKD-----PESNINSDNEKIIKAVICAGLYPKVAKIRLN----LGKKRKMVK : .:. .:.: . : :..:...:.:. :::::.. ..: . :: . KIAA08 AFLVG--KPSDCTLASAQCNEYSEEEELVKGVLMAGLYPNLIQVRQGKVTRQGKFKPNSV 1010 1020 1030 1040 1050 1060 710 720 730 740 750 760 KIAA14 VYTKTDGLVAVHPKSVNVEQTDFHYNWLIYHLKMRTS-SIYLYDCTEVSPYC-LLFFGGD .: .: . .: ...: : : .. :: : . .... :... : ..: : ::. :: KIAA08 TYRTKSGNILLHKSTINREATRLRSRWLTYFMAVKSNGSVFVRDSSQVHPLAVLLLTDGD 1070 1080 1090 1100 1110 1120 770 780 790 800 810 KIAA14 ISIQKDNDQETIAVDE--WIVFQSPARIAHLVKELRKELDILLQEKIESPHPVDWNDTKS . :. :. . ::.... . ... .: ..:.::::. : .......: KIAA08 VHIRDDGRRATISLSDSDLLRLEGDSRTVRLLKELRRALGRMVERSLRSELAALPPSVQE 1130 1140 1150 1160 1170 1180 820 830 840 850 KIAA14 RDCAVLSAIIDLIKTQEKATPRNFPPRFQDGYYS KIAA08 EHGQLLALLAELLRGPCGSFDVRKTADD 1190 1200 1210 >>KIAA0577 ( 1043 res) hj00291 (1043 aa) initn: 1016 init1: 290 opt: 644 Z-score: 702.4 bits: 141.3 E(): 5.2e-34 Smith-Waterman score: 1071; 32.406% identity (60.501% similar) in 719 aa overlap (44-755:394-1011) 20 30 40 50 60 70 KIAA14 LLQENEPDGTLDQKLLEDLQKKKNDLRYIEMQHFREKLPSYGMQKELVNLIDNHQVTVIS .: :..:: . ...::. : :::: .: KIAA05 TIEFVRATQLQGDEEPSAPPTSTQAQQKESIQAVRRSLPVFPFREELLAAIANHQVLIIE 370 380 390 400 410 420 80 90 100 110 120 130 KIAA14 GETGCGKTTQVTQFILDN-YIERGKGSACRIVCTQPRRISAISVAERVAAERAESCGSGN :::: :::::. :..... : ..: .:.::::::..:.::: ::: : . :: KIAA05 GETGSGKTTQIPQYLFEEGYTNKGM----KIACTQPRRVAAMSVAARVA--REMGVKLGN 430 440 450 460 470 140 150 160 170 180 190 KIAA14 STGYQIRLQSRLPRKQGSIL-YCTTGIILQWLQSDPYLSSVSHIVLDEIHERNLQSDVLM .::.::... .. ..: : : :..:. . :.: :.: : ...:: :::.:..:.:. KIAA05 EVGYSIRFEDCTSER--TVLRYMTDGMLLREFLSEPDLASYSVVMVDEAHERTLHTDILF 480 490 500 510 520 530 200 210 220 230 240 250 KIAA14 TVVKDLLNFRSDLKVILMSATLNAEKFSEYFGNCPMIHIPGFTFPVVEYLLEDVIEKIRY ..::. :: .:::.. :::... .:: .: . :...::: ::: :.. KIAA05 GLIKDVARFRPELKVLVASATMDTARFSTFFDDAPVFRIPGRRFPV------DIF--YTK 540 550 560 570 580 260 270 280 290 300 310 KIAA14 VPEQKEHRSQFKRGFMQGHVNRQEKEEKEAIYKERWPDYVRELRRRYSASTVDVIEMMED .:: ::.. : .:.:... KIAA05 APEA---------------------------------DYLE-------ACVVSVLQIH-- 590 600 320 330 340 350 360 KIAA14 DKVDLNLIVALIRYIVLEEEDGAILVFLPGWDNISTLHDLLMSQVMFKSDK---FLIIPL . . : ::::: : ..: . ..:... ..: .:..:. KIAA05 ----------------VTQPPGDILVFLTGQEEIEAACEMLQDRCRRLGSKIRELLVLPI 610 620 630 640 370 380 390 400 410 420 KIAA14 HSLMPTVNQTQVFKRTPPGVRKIVIATNIAETSITIDDVVYVIDGGKIKETHFDTQNNIS .. .:. :...:. ::::.::.:.::::::::.::. ..::.: : :. .. .... KIAA05 YANLPSDMQARIFQPTPPGARKVVVATNIAETSLTIEGIIYVLDPGFCKQKSYNPRTGME 650 660 670 680 690 700 430 440 450 460 470 480 KIAA14 TMSAEWVSKANAKQRKGRAGRVQPGHCYHLYNGL-RASLLDDYQLPEILRTPLEELCLQI .... :::.:.:: :::::: :.:..::.. :.. .::: :: : .. : . KIAA05 SLTVTPCSKASANQRAGRAGRVAAGKCFRLYTAWAYQHELEETTVPEIQRTSLGNVVLLL 710 720 730 740 750 760 490 500 510 520 530 540 KIAA14 KILRLGGIAYFLSRLMDPPSNEAVLLSIRHLMELNALDKQEELTPLGVHLARLPVEPHIG : : . . .: ..::: :..::....:. :.::.. ::: : ..:.:::.: .. KIAA05 KSLGIHDLMHF--DFLDPPPYETLLLALEQLYALGALNHLGELTTSGRKMAELPVDPMLS 770 780 790 800 810 820 550 560 570 580 590 600 KIAA14 KMILFGALFCCLDPVLTIAASLSFKDP-FVIPLGKEKIADARRKELAKDTRSDHLTVVNA :::: . . : . .::.:: :: .. : : : :: : .. .:::...:. KIAA05 KMILASEKYSCSEEILTVAAMLSVNNSIFYRPKDKVVHADNARVNFFLPG-GDHLVLLNV 830 840 850 860 870 880 610 620 630 640 650 660 KIAA14 FEGWEEARRRGFRYEKDYCWEYFLSSNTLQMLHNMKGQFAEHLLGAGFVSSRNPKDPESN . : :. : : ...:.: :.. ... .... :. : :: :. :. KIAA05 YTQWAES---G--YSSQWCYENFVQFRSMRRARDVREQL-EGLLERVEVGL-------SS 890 900 910 920 930 670 680 690 700 710 720 KIAA14 INSDNEKIIKAVICAGLYPKVAKIRLNLGKKRKMVKVYTKTDGLVAVHPKSVNVEQTDFH ..: .. :: : :: . ..: ::. . : . : . : .::.: :: . KIAA05 CQGDYIRVRKA-ITAGYFYHTA--RLTRSGYRTV-----KQQQTVFIHPNSSLFEQ---Q 940 950 960 970 980 730 740 750 760 770 780 KIAA14 YNWLIYHLKMRTSSIYLYDCTEVSPYCLLFFGGDISIQKDNDQETIAVDEWIVFQSPARI ::.:: . :.. .. . :. :: KIAA05 PRWLLYHELVLTTKEFMRQVLEIESSWLLEVAPHYYKAKELEDPHAKKMPKKIGKTREEL 990 1000 1010 1020 1030 1040 >>KIAA0224 ( 1256 res) ha04657 (1256 aa) initn: 885 init1: 286 opt: 615 Z-score: 669.8 bits: 135.5 E(): 3.4e-32 Smith-Waterman score: 1031; 29.880% identity (59.894% similar) in 753 aa overlap (16-749:512-1165) 10 20 30 KIAA14 IRNRSYIDRDSEYLLQENEPD------GTLD----QKLLEDLQKK .:.::: : .: ::. . ...: KIAA02 KHREQKERKKAQHKHWELAGTKLGDIMGVKKEEEPDKAVTEDGKVDYRTEQKFADHMKRK 490 500 510 520 530 540 40 50 60 70 80 90 KIAA14 KN-DLRYIEMQHF---REKLPSYGMQKELVNLIDNHQVTVISGETGCGKTTQVTQFIL-D .. . .. . . . :. :: ...:.::...: ....... :::: :::::.::.. : KIAA02 SEASSEFAKKKSILEQRQYLPIFAVQQELLTIIRDNSIVIVVGETGSGKTTQLTQYLHED 550 560 570 580 590 600 100 110 120 130 140 150 KIAA14 NYIERGKGSACRIVCTQPRRISAISVAERVAAERAESCGSGNSTGYQIRLQSRLPRKQGS .: . : : ::::::..:.:::.::. : . . : . .:: ::... .. KIAA02 GYTDYGM-----IGCTQPRRVAAMSVAKRVSEEMGGNLG--EEVGYAIRFED-CTSENTL 610 620 630 640 650 160 170 180 190 200 210 KIAA14 ILYCTTGIILQWLQSDPYLSSVSHIVLDEIHERNLQSDVLMTVVKDLLNFRSDLKVILMS : : : ::.:. . :. : :..:: :::.:..:::. ...... :::::.:. : KIAA02 IKYMTDGILLRESLREADLDHYSAIIMDEAHERSLNTDVLFGLLREVVARRSDLKLIVTS 660 670 680 690 700 710 220 230 240 250 260 270 KIAA14 ATLNAEKFSEYFGNCPMIHIPGFTFPVVEYLLEDVIEKIRYVPEQKEHRSQFKRGFMQGH ::..::::. .::: :..:::: :::: :.. . .:.. KIAA02 ATMDAEKFAAFFGNVPIFHIPGRTFPV------DIL--FSKTPQE--------------- 720 730 740 750 280 290 300 310 320 330 KIAA14 VNRQEKEEKEAIYKERWPDYVRELRRRYSASTVDVIEMMEDDKVDLNLIVALIRYIVLEE ::: . : .: : : KIAA02 ------------------DYV-------------------EAAVKQSLQVHL------SG 760 340 350 360 370 380 KIAA14 EDGAILVFLPGWDNISTLHDLLMSQV--MFKSDKFLIIPLHSLMPTVNQTQVFKRTPPGV : ::.:.:: ..: . : .. .. . .. . ..:..: .:. :...:...: :: KIAA02 APGDILIFMPGQEDIEVTSDQIVEHLEELENAPALAVLPIYSQLPSDLQAKIFQKAPDGV 770 780 790 800 810 820 390 400 410 420 430 440 KIAA14 RKIVIATNIAETSITIDDVVYVIDGGKIKETHFDTQNNISTMSAEWVSKANAKQRKGRAG :: ..::::::::.:.: ...:::.: : :. . ...... .:.:::.::.:::: KIAA02 RKCIVATNIAETSLTVDGIMFVIDSGYCKLKVFNPRIGMDALQIYPISQANANQRSGRAG 830 840 850 860 870 880 450 460 470 480 490 500 KIAA14 RVQPGHCYHLY--NGLRASLLDDYQLPEILRTPLEELCLQIKILRLGGIAYFLSRLMDPP :. ::.:..:: .. . :: .::: :: : .. : .: : . . : ..:::: KIAA02 RTGPGQCFRLYTQSAYKNELLTT-TVPEIQRTNLANVVLLLKSLGVQDLLQF--HFMDPP 890 900 910 920 930 940 510 520 530 540 550 560 KIAA14 SNEAVLLSIRHLMELNALDKQEELTPLGVHLARLPVEPHIGKMILFGALFCCLDPVLTIA .. .: :. .: :.:::. :: : ....:..: ..::.. . . : . .: :. KIAA02 PEDNMLNSMYQLWILGALDNTGGLTSTGRLMVEFPLDPALSKMLIVSCDMGCSSEILLIV 950 960 970 980 990 1000 570 580 590 600 610 620 KIAA14 ASLSFKDPFVIPLGKEKIADARRKELAKDTRSDHLTVVNAFEGWEEARRRGFRYEKDYCW . :: : : :.:. .: :...: .::::: .:.. :.. : .: KIAA02 SMLSVPAIFYRPKGREEESDQIREKFAVP-ESDHLTYLNVYLQWKNNN-----YSTIWCN 1010 1020 1030 1040 1050 630 640 650 660 670 680 KIAA14 EYFLSSNTLQMLHNMKGQFAEHLLGAGFVSSRNPKDPESNINSDNEKIIKAVICAGLYPK ..:. ..... ......:. . . :..: .. ..: . :.. :::. . . KIAA02 DHFIHAKAMRKVREVRAQLKDIM-----VQQRM---SLASCGTDWD-IVRKCICAAYFHQ 1060 1070 1080 1090 1100 690 700 710 720 730 740 KIAA14 VAKIRLNLGKKRKMVKVYTKTDGLVAVHPKSVNVEQTDFHYNWLIYHLKMRTSSIYLYDC .::.. ..:. : .: .:: : .. . ....:: . :.. :. KIAA02 AAKLK-GIGEY-----VNIRTGMPCHLHPTS-SLFGMGYTPDYIVYHELVMTTKEYMQCV 1110 1120 1130 1140 1150 1160 750 760 770 780 790 800 KIAA14 TEVSPYCLLFFGGDISIQKDNDQETIAVDEWIVFQSPARIAHLVKELRKELDILLQEKIE : : KIAA02 TAVDGEWLAELGPMFYSVKQAGKSRQENRRRAKEEASAMEEEMALAEEQLRARRQEQEKR 1170 1180 1190 1200 1210 1220 >>KIAA0134 ( 587 res) ha04001 (587 aa) initn: 877 init1: 380 opt: 586 Z-score: 641.5 bits: 129.2 E(): 1.3e-30 Smith-Waterman score: 801; 31.685% identity (53.663% similar) in 546 aa overlap (31-575:153-544) 10 20 30 40 50 60 KIAA14 IRNRSYIDRDSEYLLQENEPDGTLDQKLLEDLQKKKNDLRYIEMQHFREKLPSYGMQKEL :. .:. : ..:. : :: . ... KIAA01 GPATRGSQGLGRHLPAERVAEFRRALLHYLDFGQKQAFGRLAKLQRERAALPIAQYGNRI 130 140 150 160 170 180 70 80 90 100 110 120 KIAA14 VNLIDNHQVTVISGETGCGKTTQVTQFILDNYIERGKGSACRIVCTQPRRISAISVAERV .. . .:::.:..:.:::::.::: :..: .. ...:::::::. ::.:.:: KIAA01 LQTLKEHQVVVVAGDTGCGKSTQVPQYLL-------AAGFSHVACTQPRRIACISLAKRV 190 200 210 220 230 130 140 150 160 170 KIAA14 AAERAESCGSGNSTGYQIRLQSRLPRKQGS-ILYCTTGIILQWLQSDPYLSSVSHIVLDE . : . :: ..:::::..: :. .. :.. :.:..:. .: .: : . ...:: KIAA01 GFESLSQYGS--QVGYQIRFES--TRSAATKIVFLTVGLLLRQIQREPSLPQYEVLIVDE 240 250 260 270 280 290 180 190 200 210 220 230 KIAA14 IHERNLQSDVLMTVVKDLLNFRSDLKVILMSATLNAEKFSEYFGNCPMIHIPGFTFPVVE .:::.:..: :. :.. :: : ::::::::::.: :: ::.: :....:: ::.. 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