# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fj07249.fasta.huge -Q ../query/KIAA1487.ptfa ./tmplib.24314 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1487, 650 aa vs ./tmplib.24314 library 1986855 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 3.8844+/-0.00508; mu= 20.7710+/- 0.347 mean_var=87.4550+/-20.549, 0's: 0 Z-trim: 10 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.137146 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0715 ( 1498 res) pf08610 (1498) 2347 475.4 1.6e-134 KIAA0566 ( 1163 res) hh01910 (1163) 2259 457.8 2.4e-129 KIAA1939 ( 1082 res) ah01164 (1082) 1246 257.3 5e-69 KIAA1137 ( 933 res) hj03907 ( 933) 1218 251.7 2.1e-67 KIAA1021 ( 1102 res) af10412 (1102) 1128 234.0 5.4e-62 KIAA0956 ( 672 res) hj05590 ( 672) 802 169.1 1.1e-42 KIAA0611 ( 912 res) hg00483 ( 912) 529 115.3 2.3e-26 KIAA1347 ( 918 res) fj00739 ( 918) 140 38.4 0.0034 KIAA1825 ( 1203 res) fj04975 (1203) 137 38.0 0.006 >>KIAA0715 ( 1498 res) pf08610 (1498 aa) initn: 2359 init1: 1635 opt: 2347 Z-score: 2507.1 bits: 475.4 E(): 1.6e-134 Smith-Waterman score: 2347; 57.659% identity (84.682% similar) in 581 aa overlap (1-575:808-1387) 10 20 30 KIAA14 KRMSVVVRHPLSNQVVVYTKGADSVIMELL :::::::::::....::::::::::::.:: KIAA07 RTPEQVTVRLPQGTCLTFSLLCTLGFDSVRKRMSVVVRHPLTGEIVVYTKGADSVIMDLL 780 790 800 810 820 830 40 50 60 70 80 KIAA14 S--VASPDGASLEKQQMIVREKTQKHLDDYAKQGLRTLCIAKKVMSDTEYAEWLRNHFLA . :: ..::. .: .:::::: ::..:::::::::::.:. .. .: . : KIAA07 EDPACVPD-INMEKKLRKIRARTQKHLDLYARDGLRTLCIAKKVVSEEDFRRWASFRREA 840 850 860 870 880 890 90 100 110 120 130 140 KIAA14 ETSIDNREELLLESAMRLENKLTLLGATGIEDRLQEGVPESIEALHKAGIKIWMLTGDKQ :.:.:::.:::.:.:..:::.::::::::::::::::::..: .:..:::..:.:::::: KIAA07 EASLDNRDELLMETAQHLENQLTLLGATGIEDRLQEGVPDTIATLREAGIQLWVLTGDKQ 900 910 920 930 940 950 150 160 170 180 190 200 KIAA14 ETAVNIAYACKLLEPDDKLFILNTQSKDACGMLMSTILKELQK-KTQALPEQVSLSEDLL :::::::..:.::. : .. .::.....: ... :.::.. . :.. .. : KIAA07 ETAVNIAHSCRLLNQTDTVYTINTENQETCESILNCALEELKQFRELQKPDRKLFGFRLP 960 970 980 990 1000 1010 210 220 230 240 250 260 KIAA14 Q--PPVPRDSGL-RAGLIITGKTLEFALQESLQKQFLELTSWCQAVVCCRATPLQKSEVV . : . .. . .:::.: ::::. .: .:.:.:::::..:..:.:::.:::::: .: KIAA07 SKTPSITSEAVVPEAGLVIDGKTLNAIFQGKLEKKFLELTQYCRSVLCCRSTPLQKSMIV 1020 1030 1040 1050 1060 1070 270 280 290 300 310 320 KIAA14 KLVRSHLQVMTLAIGDGANDVSMIQVADIGIGVSGQEGMQAVMASDFAVSQFKHLSKLLL ::::..:.::::.::::::::::::.::::::.::::::::::.::::...::::.:::: KIAA07 KLVRDKLRVMTLSIGDGANDVSMIQAADIGIGISGQEGMQAVMSSDFAITRFKHLKKLLL 1080 1090 1100 1110 1120 1130 330 340 350 360 370 380 KIAA14 VHGHWCYTRLSNMILYFFYKNVAYVNLLFWYQFFCGFSGTSMTDYWVLIFFNLLFTSAPP :::::::.::. :..:..:::: :::::::::::::::...: ::: .:::::.::: :: KIAA07 VHGHWCYSRLARMVVYYLYKNVCYVNLLFWYQFFCGFSSSTMIDYWQMIFFNLFFTSLPP 1140 1150 1160 1170 1180 1190 390 400 410 420 430 440 KIAA14 VIYGVLEKDVSAETLMQLPELYRSGQKSEAYLPHTFWITLLDAFYQSLVCFFVPYFTYQG ...:::.::.:::::. :::::.:::.:: : ::::...:::::::.:::.::..:.: KIAA07 LVFGVLDKDISAETLLALPELYKSGQNSECYNLSTFWISMVDAFYQSLICFFIPYLAYKG 1200 1210 1220 1230 1240 1250 450 460 470 480 490 500 KIAA14 SDTDIFAFGNPLNTAALFIVLLHLVIESKSLTWIHLLVIIGSILSYFLFAIVFGAMCVTC :: :.:.::.:.:: .: .::: ..: :. : .: .:..::.: ::: .....: :: : KIAA07 SDIDVFTFGTPINTISLTTILLHQAMEMKTWTIFHGVVLLGSFLMYFLVSLLYNATCVIC 1260 1270 1280 1290 1300 1310 510 520 530 540 550 560 KIAA14 NPPSNPYWIMQEHMLDPVFYLVCILTTSIALLPRFVYRVLQGSLFPSPILRAKHFDRLTP : :.::::.:. .. .:.:::::.:: .:::::. . :::. : : .:...:.: : KIAA07 NSPTNPYWVMEGQLSNPTFYLVCFLTPVVALLPRYFFLSLQGTCGKSLISKAQKIDKLPP 1320 1330 1340 1350 1360 1370 570 580 590 600 610 620 KIAA14 EERTKALKKWRGAGKMNQVTSKYANQSAGKSGRRPMPGPSAVFAMKSATSCAIEQGNLSL ..:. ...:: KIAA07 DKRNLEIQSWRSRQRPAPVPEVARPTHHPVSSITGQDFSASTPKSSNPPKRKHVEESVLH 1380 1390 1400 1410 1420 1430 >>KIAA0566 ( 1163 res) hh01910 (1163 aa) initn: 2054 init1: 1478 opt: 2259 Z-score: 2414.1 bits: 457.8 E(): 2.4e-129 Smith-Waterman score: 2259; 54.412% identity (80.719% similar) in 612 aa overlap (1-604:411-1018) 10 20 30 KIAA14 KRMSVVVRHPLSNQVVVYTKGADSVIMELL ::::::.::::.... :::::::::.:.:: KIAA05 RLHDQVSVELPHLGRLTFELLHTLGFDSVRKRMSVVIRHPLTDEINVYTKGADSVVMDLL 390 400 410 420 430 440 40 50 60 70 80 90 KIAA14 SVASPDGASLEKQQMIVREKTQKHLDDYAKQGLRTLCIAKKVMSDTEYAEWLRNHFLAET . : : ..:. : : :::..:. :: .:::::::::.:.: ::: ::..:. ::. KIAA05 QPCSSVDARGRHQKKI-RSKTQNYLNVYAAEGLRTLCIAKRVLSKEEYACWLQSHLEAES 450 460 470 480 490 100 110 120 130 140 150 KIAA14 SIDNREELLLESAMRLENKLTLLGATGIEDRLQEGVPESIEALHKAGIKIWMLTGDKQET :..: ::::..::.:::..: ::::::::::::.::::.: :..::..::.:::::::: KIAA05 SLENSEELLFQSAIRLETNLHLLGATGIEDRLQDGVPETISKLRQAGLQIWVLTGDKQET 500 510 520 530 540 550 160 170 180 190 200 KIAA14 AVNIAYACKLLEPDDKLFILNTQSKDACGMLMSTILKELQKK-TQALPEQ----VSLSED :::::::::::. :.... ::. :..::. :.. : .:.. : ::. ::. . KIAA05 AVNIAYACKLLDHDEEVITLNATSQEACAALLDQCLCYVQSRGLQRAPEKTKGKVSMRFS 560 570 580 590 600 610 210 220 230 240 250 260 KIAA14 LLQPP-VPRDSGLRAGLIITGKTLEFALQESLQKQFLELTSWCQAVVCCRATPLQKSEVV : :: . :: : .:.: :..: .::...:. .:: :.. :..:.:::.:::::: :: KIAA05 SLCPPSTSTASGRRPSLVIDGRSLAYALEKNLEDKFLFLAKQCRSVLCCRSTPLQKSMVV 620 630 640 650 660 670 270 280 290 300 310 320 KIAA14 KLVRSHLQVMTLAIGDGANDVSMIQVADIGIGVSGQEGMQAVMASDFAVSQFKHLSKLLL :::::.:..:::::::::::::::::::.:.:.:::::::::::::::: .:..: .::. KIAA05 KLVRSKLKAMTLAIGDGANDVSMIQVADVGVGISGQEGMQAVMASDFAVPKFRYLERLLI 680 690 700 710 720 730 330 340 350 360 370 380 KIAA14 VHGHWCYTRLSNMILYFFYKNVAYVNLLFWYQFFCGFSGTSMTDYWVLIFFNLLFTSAPP .::::::.::.::.:::::::. .:.::::.:::::::...: : : ::::::::.: :: KIAA05 LHGHWCYSRLANMVLYFFYKNTMFVGLLFWFQFFCGFSASTMIDQWYLIFFNLLFSSLPP 740 750 760 770 780 790 390 400 410 420 430 440 KIAA14 VIYGVLEKDVSAETLMQLPELYRSGQKSEAYLPHTFWITLLDAFYQSLVCFFVPYFTYQG .. :::..:: :..:. :.::.:::. : : :.:::... :: .:::::: .::..: KIAA05 LVTGVLDRDVPANVLLTNPQLYKSGQNMEEYRPRTFWFNMADAAFQSLVCFSIPYLAYYD 800 810 820 830 840 850 450 460 470 480 490 500 KIAA14 SDTDIFAFGNPLNTAALFIVLLHLVIESKSLTWIHLLVIIGSILSYFLFAIVFGAMCVTC :..:.:..:.:. : ::. :::: ::.:. ::.. .. :.: .: :....: :.:: KIAA05 SNVDLFTWGTPIVTIALLTFLLHLGIETKTWTWLNWITCGFSVLLFFTVALIYNASCATC 860 870 880 890 900 910 510 520 530 540 550 560 KIAA14 NPPSNPYWIMQEHMLDPVFYLVCILTTSIALLPRFVYRVLQGSLFPSPILRAKHFDRLTP ::::::: :: . ::::::.:..: :::::. .: ::: .::. . :... : .: KIAA05 YPPSNPYWTMQALLGDPVFYLTCLMTPVAALLPRLFFRSLQGRVFPTQLQLARQLTRKSP 920 930 940 950 960 970 570 580 590 600 610 620 KIAA14 EERTKALKKWRGAGKMNQVTSKYANQSAGKSGRR--PMPGPSAVFAMKSATSCAIEQGNL . : .: :. . :.. . .. ...:.:.. . :. :: KIAA05 R-RCSAPKETFAQGRLPKDSG--TEHSSGRTVKTSVPLSQPSWHTQQPVCSLEASGEPST 980 990 1000 1010 1020 1030 630 640 650 KIAA14 SLCETALDQGYSETKAFEMAGPSKGKES KIAA05 VDMSMPVREHTLLEGLSAPAPMSSAPGEAVLRSPGGCPEESKVRAASTGRVTPLSSLFSL 1040 1050 1060 1070 1080 1090 >>KIAA1939 ( 1082 res) ah01164 (1082 aa) initn: 1221 init1: 790 opt: 1246 Z-score: 1331.1 bits: 257.3 E(): 5e-69 Smith-Waterman score: 1306; 35.103% identity (66.372% similar) in 678 aa overlap (1-641:432-1082) 10 20 30 KIAA14 KRMSVVVRHPLSNQVVVYTKGADSVIMELL :::::.::.: .:. .:.::::....: KIAA19 SRTPETITIEELGTLVTYQLLAFLDFNNTRKRMSVIVRNP-EGQIKLYSKGADTILFE-- 410 420 430 440 450 40 50 60 70 80 90 KIAA14 SVASPDGASLEKQQMIVREKTQKHLDDYAKQGLRTLCIAKKVMSDTEYAEWLRNHFLAET .:. .. .. :. ::...: .::::: :: . ..: . :: . :.. KIAA19 --------KLHPSNEVLLSLTSDHLSEFAGEGLRTLAIAYRDLDDKYFKEWHKMLEDANA 460 470 480 490 500 510 100 110 120 130 140 150 KIAA14 SIDNREELLLESAMRLENKLTLLGATGIEDRLQEGVPESIEALHKAGIKIWMLTGDKQET . ..:.: . : ..: : :::::..::.::::: :.. .: :.::::.:::::::: KIAA19 ATEERDERIAELYEEIERDLMLLGATAVEDKLQEGVIETVTSLSLANIKIWVLTGDKQET 520 530 540 550 560 570 160 170 180 190 200 KIAA14 AVNIAYACKLLEPD-DKLFILNTQSKDACGMLMSTILKELQKKTQALPEQV-SLSEDLL- :.::.:::..: : . .:.. : . .::.: : : : ..:. . KIAA19 AINIGYACNMLTDDMNDVFVIA-------GNNAVEVREELRKAKQNLFGQNRNFSNGHVV 580 590 600 610 620 210 220 230 240 250 KIAA14 ---QPPVPRDSGLRA------GLIITGKTLEFALQESLQKQFLELTSWCQAVVCCRATPL . . :: .. .:::.:..: ::. ......:::. :..:.:::.::: KIAA19 CEKKQQLELDSIVEETITGDYALIINGHSLAHALESDVKNDLLELACMCKTVICCRVTPL 630 640 650 660 670 680 260 270 280 290 300 310 KIAA14 QKSEVVKLVRSHLQVMTLAIGDGANDVSMIQVADIGIGVSGQEGMQAVMASDFAVSQFKH ::..::.::... ...::::::::::::::. : ::.:.:::::.:::.:::.. .::.. KIAA19 QKAQVVELVKKYRNAVTLAIGDGANDVSMIKSAHIGVGISGQEGLQAVLASDYSFAQFRY 690 700 710 720 730 740 320 330 340 350 360 370 KIAA14 LSKLLLVHGHWCYTRLSNMILYFFYKNVAYVNLLFWYQFFCGFSGTSMTDYWVLIFFNLL :..::::::.: : :. ... :::::: :.. . ::. ::::::. .. : : . .::.. KIAA19 LQRLLLVHGRWSYFRMCKFLCYFFYKNFAFTLVHFWFGFFCGFSAQTVYDQWFITLFNIV 750 760 770 780 790 800 380 390 400 410 420 430 KIAA14 FTSAPPVIYGVLEKDVSAETLMQLPELYRSGQKSEAYLPHTFWITLLDAFYQSLVCFFVP .:: : . .:....::: .. .. :.::. :: . . . :.: .: ..: ::: ::.: KIAA19 YTSLPVLAMGIFDQDVSDQNSVDCPQLYKPGQLNLLFNKRKFFICVLHGIYTSLVLFFIP 810 820 830 840 850 860 440 450 460 470 480 490 KIAA14 Y---FTYQGSD----TDIFAFGNPLNTAALFIVLLHLVIESKSLTWIHLLVIIGSILSYF : .. : : .: .:. . :. ...: ........ :.:. . : ::: :: KIAA19 YGAFYNVAGEDGQHIADYQSFAVTMATSLVIVVSVQIALDTSYWTFINHVFIWGSIAIYF 870 880 890 900 910 920 500 510 520 530 540 KIAA14 --LFAI----VFGAMCVTCNPPSNPYWIMQEHML-DPVFYLVCILTTSIALLPRFVYRVL ::.. .:: . : . :. .: : . ..:: .::: ...: ..: : KIAA19 SILFTMHSNGIFGIF-----PNQFPFVGNARHSLTQKCIWLVILLTTVASVMPVVAFRFL 930 940 950 960 970 550 560 570 580 590 KIAA14 QGSLFPSPILRAKHFDRLTPEERTKALKKWRGAGKMNQVTS-KYANQ-------SAGKSG . .:.:. . ..... . : . .. : . .. .. .:.: ..::. KIAA19 KVDLYPTLSDQIRRWQKAQKKARPPSSRRPRTRRSSSRRSGYAFAHQEGYGELITSGKNM 980 990 1000 1010 1020 1030 600 610 620 630 640 650 KIAA14 RRPMPGPSAVFAMKSATSCA-IEQGNLSLCETALD--QGYSETKAFEMAGPSKGKES : : :.. . .: . :: .::. . : ...:. :. .. KIAA19 RAKNPPPTSGLEKTHYNSTSWIE----NLCKKTTDTVSSFSQDKTVKL 1040 1050 1060 1070 1080 >>KIAA1137 ( 933 res) hj03907 (933 aa) initn: 1149 init1: 741 opt: 1218 Z-score: 1301.8 bits: 251.7 E(): 2.1e-67 Smith-Waterman score: 1276; 35.341% identity (67.829% similar) in 631 aa overlap (1-614:285-902) 10 20 30 KIAA14 KRMSVVVRHPLSNQVVVYTKGADSVIMELL :::::.::.: ... .: ::::..... : KIAA11 SRTPKTITVHEMGTAITYQLLAILDFNNIRKRMSVIVRNP-EGKIRLYCKGADTILLDRL 260 270 280 290 300 310 40 50 60 70 80 90 KIAA14 SVASPDGASLEKQQMIVREKTQKHLDDYAKQGLRTLCIAKKVMSDTEYAEWLRNHFLAET .. :... . :. ::..:: .::::: .: : ... : :: . .. : KIAA11 HHST--------QELL--NTTMDHLNEYAGEGLRTLVLAYKDLDEEYYEEWAERRLQASL 320 330 340 350 360 100 110 120 130 140 150 KIAA14 SIDNREELLLESAMRLENKLTLLGATGIEDRLQEGVPESIEALHKAGIKIWMLTGDKQET . :.::. : ..::.. :::::.:::.::.::::.: : :.::::.:::::::: KIAA11 AQDSREDRLASIYEEVENNMMLLGATAIEDKLQQGVPETIALLTLANIKIWVLTGDKQET 370 380 390 400 410 420 160 170 180 190 200 KIAA14 AVNIAYACKLLEPD-DKLFILNTQSKDACGMLMSTILKELQKKTQALPE----QVSLSED ::::.:.::.: : ..::.. .. . .... ..... . : .:: . KIAA11 AVNIGYSCKMLTDDMTEVFIVTGHTVLEVREELRKAREKMMDSSRSVGNGFTYQDKLSSS 430 440 450 460 470 480 210 220 230 240 250 260 KIAA14 LLQPPVPRDSGLRAGLIITGKTLEFALQESLQKQFLELTSWCQAVVCCRATPLQKSEVVK : . .: : :.:.:..: ::. ... .::: . :.::.:::.:::::..::. KIAA11 KLTSVLEAVAGEYA-LVINGHSLAHALEADMELEFLETACACKAVICCRVTPLQKAQVVE 490 500 510 520 530 540 270 280 290 300 310 320 KIAA14 LVRSHLQVMTLAIGDGANDVSMIQVADIGIGVSGQEGMQAVMASDFAVSQFKHLSKLLLV ::... ...:::::: :::::::..: ::.:.:::::.:::.:::.. :::: :..:::: KIAA11 LVKKYKKAVTLAIGDEANDVSMIKTAHIGVGISGQEGIQAVLASDYSFSQFKFLQRLLLV 550 560 570 580 590 600 330 340 350 360 370 380 KIAA14 HGHWCYTRLSNMILYFFYKNVAYVNLLFWYQFFCGFSGTSMTDYWVLIFFNLLFTSAPPV ::.: : :. ... :::::: :.. . ::. ::::::. .. : . . ..:...:: : . KIAA11 HGRWSYLRMCKFLCYFFYKNFAFTMVHFWFGFFCGFSAQTVYDQYFITLYNIVYTSLPVL 610 620 630 640 650 660 390 400 410 420 430 440 KIAA14 IYGVLEKDVSAETLMQLPELYRSGQKSEAYLPHTFWITLLDAFYQSLVCFFVPYFTY--- .::...:: . :. :.::. :: . . . :.: . ...: :.. ::.:: .. KIAA11 AMGVFDQDVPEQRSMEYPKLYEPGQLNLLFNKREFFICIAQGIYTSVLMFFIPYGVFADA 670 680 690 700 710 720 450 460 470 480 490 KIAA14 ---QGSD-TDIFAFGNPLNTAALFIVLLHLVIESKSLTWIHLLVIIGSILSYFLFAIVFG .:.. .: .:. . :. ...: ... ... : :. . : ::. :: . ... KIAA11 TRDDGTQLADYQSFAVTVATSLVIVVSVQIGLDTGYWTAINHFFIWGSLAVYFAILFAMH 730 740 750 760 770 780 500 510 520 530 540 550 KIAA14 AMCVTCNPPSNPYWI--MQEHMLDPVFYLVCILTTSIALLPRFVYRVLQGSLFPSPILRA . . :.. .. :. . .:. .:. .::: . ..: ..: :. .: :. . . KIAA11 SNGLFDMFPNQFRFVGNAQNTLAQPTVWLTIVLTTVVCIMPVVAFRFLRLNLKPD-LSDT 790 800 810 820 830 840 560 570 580 590 600 610 KIAA14 KHFDRLTPEERTKALKKWRGAGKMNQVTSKYANQSAGKSGRRPMPGPS---AVFAMKSAT .. .:. ... . : .:. .. : :: . :. : : . . .:..: : KIAA11 VRYTQLVRKKQKAQHRCMRRVGRTGSRRSGYAFSHQEGFGELIMSGKNMRLSSLALSSFT 850 860 870 880 890 900 620 630 640 650 KIAA14 SCAIEQGNLSLCETALDQGYSETKAFEMAGPSKGKES . KIAA11 TRSSSSWIESLRRKKSDSASSPSGGADKPLKG 910 920 930 >>KIAA1021 ( 1102 res) af10412 (1102 aa) initn: 1149 init1: 531 opt: 1128 Z-score: 1204.9 bits: 234.0 E(): 5.4e-62 Smith-Waterman score: 1171; 37.955% identity (66.898% similar) in 577 aa overlap (1-557:526-1077) 10 20 30 KIAA14 KRMSVVVRHPLSNQVVVYTKGADSVIMELL .::::.:. .... .. ::::: :. . KIAA10 LKDNYMEILNRENHIERFELLEILSFDSVRRRMSVIVKSA-TGEIYLFCKGADSSIFPRV 500 510 520 530 540 550 40 50 60 70 80 90 KIAA14 SVASPDGASLEKQQMIVREKTQKHLDDYAKQGLRTLCIAKKVMSDTEYAEWLRNHFLAET .: . .: ..... : .::::::.: : . . :: . :.. KIAA10 ---------IEGKVDQIRARVERN----AVEGLRTLCVAYKRLIQEEYEGICKLLQAAKV 560 570 580 590 600 100 110 120 130 140 150 KIAA14 SIDNREELLLESAMRLENKLTLLGATGIEDRLQEGVPESIEALHKAGIKIWMLTGDKQET ....::. : :. ..:. :::::::..:::::: . ..::::.:::::.:.:::::.:: KIAA10 ALQDREKKLAEAYEQIEKDLTLLGATAVEDRLQEKAADTIEALQKAGIKVWVLTGDKMET 610 620 630 640 650 660 160 170 180 190 200 210 KIAA14 AVNIAYACKLLEPDDKLFILNTQSKDACGMLMSTILKELQKKTQALPEQVSLSEDLLQPP :. :::::.. . .:. :.:. . . . .: ::.: .: .. ::..: : KIAA10 AAATCYACKLFRRNTQLLELTTKRIEEQS--LHDVLFELSKT--VLRHSGSLTRDNL--- 670 680 690 700 710 220 230 240 250 KIAA14 VPRDSGLRA-----GLIITGKTLEFALQE-------SLQKQFLELTSWCQAVVCCRATPL ::: : :::: : .: . .. . .. :::. :.::.::: .:: KIAA10 ----SGLSADMQDYGLIIDGAALSLIMKPREDGSSGNYRELFLEICRSCSAVLCCRMAPL 720 730 740 750 760 770 260 270 280 290 300 310 KIAA14 QKSEVVKLVR-SHLQVMTLAIGDGANDVSMIQVADIGIGVSGQEGMQAVMASDFAVSQFK ::...:::.. :. . .:::::::::::::: : .:::: :.:: ::. ::.:. .:: KIAA10 QKAQIVKLIKFSKEHPITLAIGDGANDVSMILEAHVGIGVIGKEGRQAARNSDYAIPKFK 780 790 800 810 820 830 320 330 340 350 360 370 KIAA14 HLSKLLLVHGHWCYTRLSNMILYFFYKNVAYVNLLFWYQFFCGFSGTSMTDYWVLIFFNL ::.:.::::::. : :.:... ::::::: .. : :::::::: .. : : ..:. KIAA10 HLKKMLLVHGHFYYIRISELVQYFFYKNVCFIFPQFLYQFFCGFSQQTLYDTAYLTLYNI 840 850 860 870 880 890 380 390 400 410 420 430 KIAA14 LFTSAPPVIYGVLEKDVSAETLMQLPELYRSGQKSEAYLPHTFWITLLDAFYQSLVCFFV ::: : ..:...:. :. ..: . : :::. :. ..: : .....:: :: KIAA10 SFTSLPILLYSLMEQHVGIDVLKRDPTLYRDVAKNALLRWRVFIYWTLLGLFDALVFFFG 900 910 920 930 940 950 440 450 460 470 480 490 KIAA14 PYFTYQG----SDTDIFA---FGNPLNTAALFIVLLHLVIESKSLTWIHLLVIIGSILSY ::.... :. .::. ::. . :. .: : :.:..... :::. .:: ::.: : KIAA10 AYFVFENTTVTSNGQIFGNWTFGTLVFTVMVFTVTLKLALDTHYWTWINHFVIWGSLLFY 960 970 980 990 1000 1010 500 510 520 530 540 550 KIAA14 FLFAIVFGAMCVTCNPPSNPYWIMQEHMLDPVFYLVCILTTSIALLPRFVYRVLQGSLFP .:....:.. . :... . . . .:. .: ..:.::: . .:: .:.: KIAA10 VVFSLLWGGVIWPFLNYQRMYYVFIQMLSSGPAWLAIVLLVTISLLPDVLKKVLCRQLWP 1020 1030 1040 1050 1060 1070 560 570 580 590 600 610 KIAA14 SPILRAKHFDRLTPEERTKALKKWRGAGKMNQVTSKYANQSAGKSGRRPMPGPSAVFAMK . :.. KIAA10 TATERVQTKSQCLSVEQSTIFMLSQTSSSLSF 1080 1090 1100 >>KIAA0956 ( 672 res) hj05590 (672 aa) initn: 1057 init1: 512 opt: 802 Z-score: 858.3 bits: 169.1 E(): 1.1e-42 Smith-Waterman score: 1144; 36.620% identity (66.549% similar) in 568 aa overlap (1-557:72-601) 10 20 30 KIAA14 KRMSVVVRHPLSNQVVVYTKGADSVIMELL .::::.:. : :.. ....:::.: :. KIAA09 GNSEETMEVKTLGKLERYKLLHILEFDSDRRRMSVIVQAP-SGEKLLFAKGAESSIL--- 50 60 70 80 90 40 50 60 70 80 90 KIAA14 SVASPDGASLEKQQMIVREKTQKHLDDYAKQGLRTLCIAKKVMSDTEYAEWLRNHFLAET : . : :::. :.:..: .:::::::: . ... :: : . : :.: KIAA09 ----PKCIGGEI------EKTRIHVDEFALKGLRTLCIAYRKFTSKEYEEIDKRIFEART 100 110 120 130 140 100 110 120 130 140 150 KIAA14 SIDNREELLLESAMRLENKLTLLGATGIEDRLQEGVPESIEALHKAGIKIWMLTGDKQET ....::: : . .:. : :::::..:::::. : :.::::. ::::.:.:::::.:: KIAA09 ALQQREEKLAAVFQFIEKDLILLGATAVEDRLQDKVRETIEALRMAGIKVWVLTGDKHET 150 160 170 180 190 200 160 170 180 190 200 KIAA14 AVNIAYAC-KLLEPDDKLFILNTQSKDACGMLMSTILKELQKKTQALPEQVSLSEDLLQP ::... .: .. . . : ..: .: . : . :..: .. ..:: . KIAA09 AVSVSLSCGHFHRTMNILELINQKSDSEC----AEQLRQLARR---------ITEDHV-- 210 220 230 240 250 210 220 230 240 250 260 KIAA14 PVPRDSGLRAGLIITGKTLEFALQESLQKQFLELTSWCQAVVCCRATPLQKSEVVKLVR- .. ::.. : .: .::.: .: :.:. :.::.::: .::::..:..:.. KIAA09 -------IQHGLVVDGTSLSLALREH-EKLFMEVCRNCSAVLCCRMAPLQKAKVIRLIKI 260 270 280 290 300 270 280 290 300 310 320 KIAA14 SHLQVMTLAIGDGANDVSMIQVADIGIGVSGQEGMQAVMASDFAVSQFKHLSKLLLVHGH : . .:::.::::::::::: : .:::. :.:: ::. ::.:...:: :::::.:::: KIAA09 SPEKPITLAVGDGANDVSMIQEAHVGIGIMGKEGRQAARNSDYAIARFKFLSKLLFVHGH 310 320 330 340 350 360 330 340 350 360 370 380 KIAA14 WCYTRLSNMILYFFYKNVAYVNLLFWYQFFCGFSGTSMTDYWVLIFFNLLFTSAPPVIYG . : :..... ::::::: ... : :::.: :: .. : : ..:. ::: : .::. KIAA09 FYYIRIATLVQYFFYKNVCFITPQFLYQFYCLFSQQTLYDSVYLTLYNICFTSLPILIYS 370 380 390 400 410 420 390 400 410 420 430 440 KIAA14 VLEKDVSAETLMQLPELYRSGQKSEAYLPHTFWITLLDAFYQSLVCFFVPYFTYQGSDTD .::. :. ..:.. : :::. .:.. .:: . .: .... :: :. :.::. KIAA09 LLEQHVDPHVLQNKPTLYRDISKNRLLSIKTFLYWTILGFSHAFIFFFGSYLLI-GKDTS 430 440 450 460 470 480 450 460 470 480 490 KIAA14 IFA---------FGNPLNTAALFIVLLHLVIESKSLTWIHLLVIIGSILSYFLFAIVFGA ... ::. . :. .. : .....:.. :::. :: :::. ::.:.. .:. KIAA09 LLGNGQMFGNWTFGTLVFTVMVITVTVKMALETHFWTWINHLVTWGSIIFYFVFSLFYGG 490 500 510 520 530 540 500 510 520 530 540 550 KIAA14 MCVTCNPPSNPYWIMQEHMLDPVFYLVCILTTSIALLPRFVYRVLQGSLFPSPILRAKHF . .: :... . . . ... :: . :. .. .:.. : :. .:. KIAA09 ILWPFLGSQNMYFVFIQLLSSGSAWFAIILMVVTCLFLDIIKKVFDRHLHPTSTEKAQLT 550 560 570 580 590 600 560 570 580 590 600 610 KIAA14 DRLTPEERTKALKKWRGAGKMNQVTSKYANQSAGKSGRRPMPGPSAVFAMKSATSCAIEQ KIAA09 ETNAGIKCLDSMCCFPEGEAACASVGRMLERVIGRCSPTHISRSWSASDPFYTNDRSILT 610 620 630 640 650 660 >>KIAA0611 ( 912 res) hg00483 (912 aa) initn: 702 init1: 399 opt: 529 Z-score: 565.1 bits: 115.3 E(): 2.3e-26 Smith-Waterman score: 749; 28.623% identity (59.058% similar) in 552 aa overlap (1-550:414-904) 10 20 30 KIAA14 KRMSVVVRHPLSNQVVVYTKGADSVIMELL :::...:: ..... : :::: :. .. KIAA06 RDQSSMQLRTPGDQILNFTILQIFPFTYESKRMGIIVRDESTGEITFYMKGADVVMAGIV 390 400 410 420 430 440 40 50 60 70 80 90 KIAA14 SVASPDGASLEKQQMIVREKTQKHLDDYAKQGLRTLCIAKKVMSDTEYAEWLRNHFLAET . . ... ..:..:::.: .::: ... .: .. . :. KIAA06 QYN---------------DWLEEECGNMAREGLRVLVVAKKSLAEEQYQDFEARYVQAKL 450 460 470 480 100 110 120 130 140 150 KIAA14 SIDNREELLLESAMRLENKLTLLGATGIEDRLQEGVPESIEALHKAGIKIWMLTGDKQET :. .: . :: .. :: ::.::.:: : ..:.:..::::.::::::: :: KIAA06 SVHDRSLKVATVIESLEMEMELLCLTGVEDQLQADVRPTLETLRNAGIKVWMLTGDKLET 490 500 510 520 530 540 160 170 180 190 200 210 KIAA14 AVNIAYACKLLEPDDKLFILNTQSKDACGMLMSTILKELQKKTQALPEQVSLSEDLLQPP :. : .:. .. . .. .. . . : :. ...: . KIAA06 ATCTAKNAHLVTRNQDIHVFRLVTNRGEAHLE---LNAFRRKHDC--------------- 550 560 570 580 590 220 230 240 250 260 270 KIAA14 VPRDSGLRAGLIITGKTLEFALQESLQKQFLELTSWCQAVVCCRATPLQKSEVVKLVRSH .:.:.: .:: :. . .:.::. : :::::: .: ::...:.:.. . KIAA06 ---------ALVISGDSLEVCLKY-YEYEFMELACQCPAVVCCRCAPTQKAQIVRLLQER 600 610 620 630 640 280 290 300 310 320 330 KIAA14 LQVMTLAIGDGANDVSMIQVADIGIGVSGQEGMQAVMASDFAVSQFKHLSKLLLVHGHWC .: :.:::.::::::: .: :.:: :.:: :: .:.::...:::::..::.:::. KIAA06 TGKLTCAVGDGGNDVSMIQESDCGVGVEGKEGKQASLAADFSITQFKHLGRLLMVHGRNS 650 660 670 680 690 700 340 350 360 370 380 390 KIAA14 YTRLSNMILYFFYKNVAYVNLLFWYQFFCGFSGTSMTDYWVLIFFNLLFTSAPPVIYGVL : : . . . ..... .. .. :... . . ...: .. ..: ::. :: KIAA06 YKRSAALSQFVIHRSLCISTMQAVFSSVFYFASVPLYQGFLIIGYSTIYT-MFPVFSLVL 710 720 730 740 750 400 410 420 430 440 450 KIAA14 EKDVSAETLMQLPELYRSGQKSEAYLPHTFWITLLDAFYQSLVCFFVPYFTYQGSDTDIF .:::..:. : ::::.. :.. .:: : .: ..::. . .. . ... . : KIAA06 DKDVKSEVAMLYPELYKDLLKGRPLSYKTFLIWVLISIYQGSTIMYGALLLFESEFVHIV 760 770 780 790 800 810 460 470 480 490 500 KIAA14 AFGNPLNTAALFIVLLHLVIESKSLTWIHLLVIIGSILSY--FLFAIVFGAMCVTCNPPS : .. ..:... : :.. :: : :. .. .:: .. ..:: . KIAA06 A----ISFTSLILTEL-LMVALTIQTW-HWLMTVAELLSLACYIASLVFLHEFI------ 820 830 840 850 860 510 520 530 540 550 560 KIAA14 NPYWIMQEHMLDPVFYLVCILTTSIALLPRFVYRVLQGSLFPSPILRAKHFDRLTPEERT . :.: .: . : ..: .. :: .: . :. . : KIAA06 DVYFIATLSFL----WKVSVITL-VSCLPLYVLKYLRRRFSPPSYSKLTS 870 880 890 900 910 570 580 590 600 610 620 KIAA14 KALKKWRGAGKMNQVTSKYANQSAGKSGRRPMPGPSAVFAMKSATSCAIEQGNLSLCETA >>KIAA1347 ( 918 res) fj00739 (918 aa) initn: 195 init1: 138 opt: 140 Z-score: 149.2 bits: 38.4 E(): 0.0034 Smith-Waterman score: 188; 20.264% identity (53.304% similar) in 454 aa overlap (98-543:524-897) 70 80 90 100 110 120 KIAA14 IAKKVMSDTEYAEWLRNHFLAETSIDNREELLLESAMRLENKLTLLGATGIEDRLQEGVP : : :. .: ..::.:: .:: : . :: KIAA13 SKGQTLTLTQQQRDVYQQEKARMGSAGLRVLALASGPEL-GQLTFLGLVGIIDPPRTGVK 500 510 520 530 540 550 130 140 150 160 170 180 KIAA14 ESIEALHKAGIKIWMLTGDKQETAVNIAYACKLLEPDDKLFILNTQSKDACGMLMSTILK :.. .: .:..: :.:::.::::: :: ..: . . :... : .... 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KIAA13 LNAMQILWI----NIIMDGPPAQSLGV--EPVDKDVIRKPPRNWKDSILTKNLILKILVS 730 740 750 760 770 780 430 440 450 460 470 480 KIAA14 TLLDAFYQSLVCFFVPYFTYQGSDTDIFAFGNPLNTAALFIVLLHLVIESKSLTWIHLLV ... .:: . : . :. : . .. . . . . .. :.: : . . KIAA13 SII------IVCGTLFVFWRELRDNVITPRDTTMTFTCFVFFDMFNALSSRSQTKSVFEI 790 800 810 820 830 490 500 510 520 530 KIAA14 IIGS--ILSYFLFAIVFGAMCVTCNPP-SNPYWIMQEHMLDPVFYLVCILTTSIALLPRF . : .. : ... ..: . : :: .. . . .:: .: : ::.:. .. .. KIAA13 GLCSNRMFCYAVLGSIMGQLLVIYFPPLQKVFQTESLSILDLLFLL--GLTSSVCIVAEI 840 850 860 870 880 890 540 550 560 570 580 590 KIAA14 VYRVLQGSLFPSPILRAKHFDRLTPEERTKALKKWRGAGKMNQVTSKYANQSAGKSGRRP . .: KIAA13 IKKVERSREKIQKHVSSTSSSFLEV 900 910 >>KIAA1825 ( 1203 res) fj04975 (1203 aa) initn: 80 init1: 80 opt: 137 Z-score: 144.8 bits: 38.0 E(): 0.006 Smith-Waterman score: 168; 27.604% identity (54.167% similar) in 192 aa overlap (106-297:708-880) 80 90 100 110 120 130 KIAA14 TEYAEWLRNHFLAETSIDNREELLLESAMRLENKLTLLGATGIEDRLQEGVPESIEALHK :: .: ..: . :. :. ... KIAA18 SREGARVLALGYKELGHLTHQQAREVKREALECSLKFVGFIVVSCPLKADSKAVIREIQN 680 690 700 710 720 730 140 150 160 170 180 190 KIAA14 AGIKIWMLTGDKQETAVNIAYACKLLEPDDKLFILNTQSKDACGMLMSTILKELQKKTQA :. .. :.:::. :: ..: ...: : ::. :. : : . .. KIAA18 ASHRVVMITGDNPLTACHVAQELHFIEKAHTL-ILQPPSE-----------KGRQCEWRS 740 750 760 770 780 200 210 220 230 240 250 KIAA14 LPEQVSLSEDLLQPPVPRDSGLRAGLIITGKTLEFALQESLQKQFLELTSWCQAVVCCRA . .. : : :. .:. .: .:: : :: . .:.:.: : : :. KIAA18 IDGSIVLP---LARGSPKALALEYALCLTGDGLAH-LQATDPQQLLRLIPHVQ--VFARV 790 800 810 820 830 260 270 280 290 300 310 KIAA14 TPLQKSEVVKLVRSHLQVMTLAIGDGANDVSMIQVADIGIGVSGQEGMQAVMASDFAVSQ .: :: :. .. .: .:: :::.:::. .. ::.:... KIAA18 APKQKEFVITSLK-ELGYVTLMCGDGTNDVGALKHADVGVALLANAPERVVERRRRPRDS 840 850 860 870 880 890 320 330 340 350 360 370 KIAA14 FKHLSKLLLVHGHWCYTRLSNMILYFFYKNVAYVNLLFWYQFFCGFSGTSMTDYWVLIFF KIAA18 PTLSNSGIRATSRTAKQRSGLPPSEEQPTSQRDRLSQVLRDLEDESTPIVKLGDASIAAP 900 910 920 930 940 950 650 residues in 1 query sequences 1986855 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:24:25 2008 done: Thu Dec 18 15:24:26 2008 Total Scan time: 0.520 Total Display time: 0.220 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]