# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fj07037.fasta.huge -Q ../query/KIAA1485.ptfa ./tmplib.24314 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1485, 1104 aa vs ./tmplib.24314 library 1986401 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0464+/-0.0075; mu= 7.5989+/- 0.512 mean_var=210.8922+/-52.049, 0's: 0 Z-trim: 68 B-trim: 16 in 1/39 Lambda= 0.088317 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1710 ( 515 res) fj18457 ( 515) 477 74.2 5.5e-14 KIAA1508 ( 573 res) hk06576 ( 573) 448 70.5 7.6e-13 KIAA1349 ( 752 res) fj00940 ( 752) 438 69.4 2.2e-12 KIAA0065 ( 848 res) ha00946 ( 848) 425 67.8 7.4e-12 KIAA1947 ( 608 res) fh23660 ( 608) 418 66.7 1.1e-11 KIAA1871 ( 821 res) hj05256s1 ( 821) 380 62.0 3.9e-10 KIAA0628 ( 540 res) hh01433 ( 540) 363 59.7 1.3e-09 KIAA1829 ( 557 res) hj00069 ( 557) 362 59.5 1.5e-09 KIAA0441 ( 702 res) hh00601s1 ( 702) 360 59.4 2.1e-09 KIAA1396 ( 551 res) hj08221 ( 551) 355 58.6 2.8e-09 KIAA1615 ( 484 res) fj13419 ( 484) 353 58.3 3e-09 KIAA2033 ( 766 res) ej00602s1 ( 766) 355 58.8 3.4e-09 KIAA1388 ( 599 res) fj06552 ( 599) 353 58.4 3.5e-09 KIAA1473 ( 574 res) fj03262 ( 574) 346 57.5 6.2e-09 KIAA1431 ( 891 res) fj00022 ( 891) 348 58.0 6.9e-09 KIAA1015 ( 841 res) hk03609(revised) ( 841) 344 57.5 9.5e-09 KIAA1956 ( 680 res) fk08713 ( 680) 340 56.8 1.2e-08 KIAA0924 ( 617 res) hh02883 ( 617) 339 56.7 1.2e-08 KIAA1982 ( 599 res) fk06527(revised) ( 599) 335 56.1 1.7e-08 KIAA0972 ( 702 res) hj06859 ( 702) 336 56.4 1.7e-08 KIAA0426 ( 613 res) hh01274 ( 613) 328 55.3 3.2e-08 KIAA1611 ( 813 res) fj12627 ( 813) 327 55.3 4.2e-08 KIAA1969 ( 595 res) fk06944 ( 595) 322 54.5 5.3e-08 KIAA0961 ( 530 res) hj05830 ( 530) 320 54.2 5.9e-08 KIAA0798 ( 682 res) hk06584 ( 682) 320 54.3 6.9e-08 KIAA0236 ( 1696 res) ha04654 (1696) 324 55.3 8.6e-08 KIAA0326 ( 927 res) hg00579 ( 927) 317 54.1 1.1e-07 KIAA1806 ( 481 res) fk00438 ( 481) 312 53.1 1.1e-07 KIAA0296 ( 1838 res) hf00260 (1838) 320 54.8 1.3e-07 KIAA0412 ( 720 res) hg03242 ( 720) 304 52.3 2.9e-07 KIAA1827 ( 469 res) fk01409 ( 469) 290 50.3 7.7e-07 KIAA1675 ( 1286 res) ae00102 (1286) 294 51.3 1e-06 KIAA1951 ( 679 res) fj05532 ( 679) 288 50.2 1.2e-06 KIAA1962 ( 746 res) hm00158 ( 746) 285 49.9 1.6e-06 KIAA1198 ( 553 res) fg01911 ( 553) 281 49.2 1.9e-06 KIAA1979 ( 309 res) fj09511 ( 309) 264 46.7 5.9e-06 KIAA1852 ( 948 res) fj01514 ( 948) 269 48.0 7.7e-06 KIAA0390 ( 1312 res) hj00075 (1312) 271 48.4 7.9e-06 KIAA0478 ( 1253 res) hh05955 (1253) 269 48.1 9.1e-06 KIAA1141 ( 914 res) hk01833 ( 914) 262 47.1 1.4e-05 KIAA1954 ( 468 res) fk02322 ( 468) 255 45.8 1.7e-05 KIAA0222 ( 1204 res) ha02586 (1204) 257 46.6 2.6e-05 KIAA1231 ( 1061 res) fh08195s1 (1061) 254 46.1 3.1e-05 KIAA1285 ( 785 res) hh11563(revised) ( 785) 251 45.6 3.3e-05 KIAA2007 ( 580 res) fj01689 ( 580) 243 44.4 5.6e-05 KIAA1703 ( 1165 res) fj16891 (1165) 243 44.8 8.7e-05 KIAA1588 ( 613 res) fj08823 ( 613) 238 43.8 9e-05 KIAA0557 ( 493 res) hh01334 ( 493) 233 43.0 0.00012 KIAA1190 ( 174 res) hg03443a ( 174) 220 40.8 0.0002 KIAA1572 ( 492 res) fh23424 ( 492) 222 41.6 0.00032 >>KIAA1710 ( 515 res) fj18457 (515 aa) initn: 437 init1: 188 opt: 477 Z-score: 342.9 bits: 74.2 E(): 5.5e-14 Smith-Waterman score: 477; 30.690% identity (58.621% similar) in 290 aa overlap (601-882:207-489) 580 590 600 610 620 KIAA14 SGITAFMKVLNSLQKKQMNTSLCERIRKVYGD--LECEYCGKLFWYQVHFDMHVRTHTRE :: .: ::: : . :. .: :::: : KIAA17 HTGIRYHICSHCGKAFSQISDLNRHQKTHTGDRPYKCYECGKGFSRSSHLIQHQRTHTGE 180 190 200 210 220 230 630 640 650 660 670 680 KIAA14 HLYYCSQCHYSSITKNCLKRHVIQKHSNILLKCPTDGCDYSTPDKYKLQAHLKVHTALDK . : :..: : .. : .: . .. :: . : : .: : ..:.. . 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KIAA00 HTGQKPFACPECGKFF-SHKSTLSQHYRTHTGEKPYECHECGKIFYNKSYLTKHNRTHTG 590 600 610 620 630 640 800 810 820 830 840 850 KIAA14 EKTHLCDMCGKKFKSKGTLKSHKLLHTADGKQFKCTVCDYTAAQKPQLLRHMEQHVSFKP :: . :. ::: : .:. : .:. .: .. : .::. : . .: :. :.. :.. :: KIAA00 EKPYECNECGKAFYQKSQLTQHQRIHIGE-KPYKCNECGKAFCHKSALIVHQRTHTQEKP 650 660 670 680 690 700 860 870 880 890 900 KIAA14 FRCAHCHYSCNISGSLKRHYNRKHPNEE-YANVGTGEL---AAEVLIQQ---GGLK---C ..: .: : ....: : .::: .:. : :.. . . ... : : : KIAA00 YKCNECGKSFCVKSGLIFH-ERKHTGEKPYECNECGKFFRHKSSLTVHHRAHTGEKSCQC 710 720 730 740 750 760 910 920 930 940 950 960 KIAA14 PVCSFVYGTKWEFNRHLKNKHGLKVVEIDGDPKWETATEAPEEPSTQYLHITEA---EED :. .. : :. .: ... : : : . : : .. . : :: : : : KIAA00 NECGKIFYRKSELAQHQRSHTGEKPYECNTCRK--TFSQKSNLIVHQRRHIGENLMNEMD 770 780 790 800 810 970 980 990 1000 1010 1020 KIAA14 VQGTQAAVAALQDLRYTSESGDRLDPTAVNILQQIIELGAETHDATALASVVAMAPGTVT ... : :. :.. :. :. : KIAA00 IRNFQPQVS-LHNASEYSHCGESPDDILNVQ 820 830 840 >>KIAA1947 ( 608 res) fh23660 (608 aa) initn: 659 init1: 164 opt: 418 Z-score: 301.5 bits: 66.7 E(): 1.1e-11 Smith-Waterman score: 458; 25.301% identity (53.253% similar) in 415 aa overlap (535-931:67-473) 510 520 530 540 550 560 KIAA14 DQESHGAQSPLGEGQNMAVLSAGDPDPSRCLRSNPAEASDLLPPVAGGGDTITHQPDSCK :: . ..... : .. . .... .: KIAA19 SLLKDILHLAEHDGTHPKRTAKLYLHQKEHLREKLTRSDEGRPSFVNDSVHLAKRNLTCM 40 50 60 70 80 90 570 580 590 600 610 620 KIAA14 AAPEHRSGITAFMK-VLNSLQKKQMNTSLCERIRKVYGDLECEYCGKLFWYQVHFDMHVR . . .: . ... .:.: : . .: : ... .. : ::: : .: . : . KIAA19 QGGKDFTGDSDLQQQALHSGWKPHRDTHGVEAFQSGQNNYSCTQCGKDFCHQHTLFEHQK 100 110 120 130 140 150 630 640 650 660 670 680 KIAA14 THTREHLYYCSQCHYSSITKNCLKRHVIQKHSNILLKCPTDGCDYSTPDKYKLQAHLKVH ::.:. : ::.: .. : .: .. .. :: : .: ::.. : :.: KIAA19 IHTEERPYECSECGKLFRYNSDLIKHQRNHTGERPYKCSECGKAFSL--KYNVVQHQKIH 160 170 180 190 200 210 690 700 710 720 730 KIAA14 TALDKRSYSCPVCEKSFSEDRLIKSHIKTN---HPEVSMSTISEVLGRRVQLKGL----I :. .: : : : :.: . . .: . . .: : : .... ...: : KIAA19 TG--ERPYECSECGKAFLRKSHLLQHQRIHTRPRPYVC-SECGKAFLTQAHLVGHQKIHT 220 230 240 250 260 270 740 750 760 770 780 790 KIAA14 GKRAMKCPYCDFYFMKNGSDLQRHIWAHEGVKPFKCSLCEYATRSKSNLKAHMNRHSTEK :.: . : : ::: . : : :: .: : .:: : : .. .: :. :. :: KIAA19 GERPYGCNECGKYFMYS-SALIRHQKVHTGERPFYCCECGKFFMDSCTLIIHQRVHTGEK 280 290 300 310 320 330 800 810 820 830 840 850 KIAA14 THLCDMCGKKFKSKGTLKSHKLLHTADGKQFKCTVCDYTAAQKPQLLRHMEQHVSFKPFR . :. ::: :. ..:: :. .::.. : ..:. : . :. :.. :.. ::.. 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KIAA18 LKHWVSPLKDAMRHLPSQESGIREMHIIPQKAIVGEIGHGCNEGEKI-LSAGESSHRYEV 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 KIAA14 QQTPYEQPMKSSRLGPTQL----KIFTCEYCNKVFKFKHSLQAHLRIHTNEKPYKCPQCS . ..: ::. .. : . :. :.:.:. . .: : ::::..::: : .:. KIAA18 SGQNFKQ--KSGLTEHQKIHNINKTYECKECEKTFNRSSNLIIHQRIHTGNKPYVCNECG 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 KIAA14 YASAIKANLNVHLRKHTGEK-FACDYCSFTCLSKGHLKVHIERVHKKIKQH-CRFCKKKY : ..:: .: : :::.: . : :. ....: : ...:. . . :. : : . KIAA18 KDSNQSSNLIIHQRIHTGKKPYICHECGKDFNQSSNLVRH-KQIHSGGNPYECKECGKAF 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 KIAA14 SDVKNLIKHIRDAHDPQDKKVKEALDELCLMTREGKRQLLYDCHICERKFKNELDRDRHM . .::. : : . .: :: : :. : . :.. : : KIAA18 KGSSNLVLHQR------------------IHSR-GKP---YLCNKCGKAFSQSTDLIIHH 240 250 260 270 290 300 310 320 330 340 KIAA14 LVHGDKWPFACELCGHGATKYQALELHVRKH----PFVYVCAVCRKKFVSSIRLRTHIKE .: . :. : ::. .. . : : : : :. : :.: : . .: : .. KIAA18 RIHTGEKPYECYDCGQMFSQSSHLVPHQRIHTGEKPL--KCNECEKAFRQHSHLTEH-QR 280 290 300 310 320 350 360 370 380 390 400 KIAA14 VHGAAQEALVFTSSINQSFCLLEPGGDIQQEALGDQLQLVEEEFALQGVNALKEEACPGD .:.. : ...: :. :.... :. :. . . :.:: KIAA18 LHSG--EKPYECHRCGKTFSGRTAFLKHQRLHAGEKIEECEKTFSKD--EELREEQ---R 330 340 350 360 370 380 410 420 430 440 450 KIAA14 TQLEEGRKEPEAPGEMPAPAVHLASPQAESTALPP--C-ELETTVVSSSDLHSQEVVSDD . :: . :. . : :. :. : : : : .:::: .. . . KIAA18 IHQEEKAYWCNQCGRNFQGTSDLIRHQVTHTGEKPYECKECGKTFNQSSDLLRHHRIHSG 390 400 410 420 430 440 460 470 480 490 500 510 KIAA14 FLLKNDTSSAEAHAAPEKPPDMQHRSSVQTQGEVITLLLSKAQSAGSDQESHGAQSPLGE .. .. . . :. .. :.: :: :. .: : :.:: : KIAA18 ---EKPCVCSKCGKSFRGSSDLIRHHRVHT-GEK-PYECSECGKAFS-QRSH-----LVT 450 460 470 480 490 520 530 540 550 560 570 KIAA14 GQNMAVLSAGDPDPSRCLRSNPA-EASDLLPPVAGGGDTITHQPDSCKAAPEHRSGITAF :.. .:. : .: . . : . .:: . ..: :: . ::: KIAA18 HQKI---HTGEK-PYQCTECGKAFRRRSLL--IQHRRIHSGEKPYECKECGKLFIWRTAF 500 510 520 530 540 580 590 600 610 620 KIAA14 MK--VLNSLQKKQMNTSLC--ERIR---KVYGDLE---CEYCGKLFWYQVHFDMHVRTHT .: :.. .: . . .. :..: :.. . . :. ::. : . . : ::: KIAA18 LKHQSLHTGEKLECEKTFSQDEELRGEQKIHQEAKAYWCNQCGRAFQGSSDLIRHQVTHT 550 560 570 580 590 600 630 640 650 660 670 680 KIAA14 REHLYYCSQCHYS-SITKNCLKRHVIQKHSNILLKCPTDGCDYSTPDKYKLQAHLKVHTA ::. : :..: . . ... :..: :.. . . : . : : . : : ..::. KIAA18 REKPYECKECGKTFNQSSDLLRHHRIHSGEKPYV-C--NKCGKSFRGSSDLIKHHRIHTG 610 620 630 640 650 660 690 700 710 720 730 740 KIAA14 LDKRSYSCPVCEKSFSEDRLIKSHIKTNHPEVSMSTISEVLGRRVQLKGLIGKRAMKCPY .. : : : :.::. .::. : : .. :.. ..: KIAA18 --EKPYECSECGKAFSQ----RSHLAT-HQKIHT-----------------GEKPYQCSE 670 680 690 750 760 770 780 790 800 KIAA14 CDFYFMKNGSDLQRHIWAHEGVKPFKCSLCEYATRSKSNLKAHMNRHSTEKTHLCDMCGK : : . : : .: : : ::..:. : .. . :. :. :: . :. : KIAA18 CGNAFRRR-SLLIQHRRLHSGEKPYECKECGKLFMWHTAFLKHQRLHAGEKLEECE---K 700 710 720 730 740 750 810 820 830 840 850 860 KIAA14 KFKSKGTLKSHKLLHTADGKQFKCTVCDYTAAQKPQLLRHMEQHVSFKPFRCAHCHYSCN :.. :.... : . : . :. :. : . .:.::. :. ::..: .: KIAA18 TFSKDEELRKEQRTHQ-EKKVYWCNQCSRTFQGSSDLIRHQVTHTREKPYECKECGKTQS 760 770 780 790 800 810 870 880 890 900 910 920 KIAA14 ISGSLKRHYNRKHPNEEYANVGTGELAAEVLIQQGGLKCPVCSFVYGTKWEFNRHLKNKH KIAA18 ELRPSETS 820 >>KIAA0628 ( 540 res) hh01433 (540 aa) initn: 311 init1: 160 opt: 363 Z-score: 264.2 bits: 59.7 E(): 1.3e-09 Smith-Waterman score: 433; 27.035% identity (54.360% similar) in 344 aa overlap (605-931:157-492) 580 590 600 610 620 630 KIAA14 AFMKVLNSLQKKQMNTSLCERIRKVYGDLECEYCGKLFWYQVHFDMHVRTHTREHLYYCS :. ::: : . :. : : :: :.:: :. 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KIAA06 FSQTSNFTQHQRIHTGE-KLYECNECGKAFFLSSYLIRHQKIHTGERVYECKECGKAFLQ 360 370 380 390 400 410 870 880 890 900 910 KIAA14 SGSLKRHYNRKHPNEEYANVGTGEL---AAEVLIQQ---GGLKCPVCSFV---YGTKWEF .. : .: . . .. . :. ....:..: : : :::. . . .: KIAA06 KAHLTEHQKIHSGDRPFECKDCGKAFIQSSKLLLHQIIHTGEKPYVCSYCGKGFIQRSNF 420 430 440 450 460 470 920 930 940 950 960 970 KIAA14 NRHLKNKHGLKVVEIDGDPKWETATEAPEEPSTQYLHITEAEEDVQGTQAAVAALQDLRY .: : . :. : KIAA06 LQHQKIHTEEKLYECSQYGRDFNSTTNVKNNQRVHQEGLSLSKAPIHLGERSVDKGEHTG 480 490 500 510 520 530 >>KIAA1829 ( 557 res) hj00069 (557 aa) initn: 578 init1: 200 opt: 362 Z-score: 263.4 bits: 59.5 E(): 1.5e-09 Smith-Waterman score: 453; 29.333% identity (57.000% similar) in 300 aa overlap (592-881:265-555) 570 580 590 600 610 KIAA14 SCKAAPEHRSGITAFMKVLNSLQKKQMNTSLCERIRKVYGD--LECEYCGKLFWYQVHFD : :. : :. ::. :.: : ..:. KIAA18 SFFTQPQRIHSGEKPYACNDCGKAFSHDFFLSEHQRTHIGEKPYECKECNKAFRQSAHLA 240 250 260 270 280 290 620 630 640 650 660 670 KIAA14 MHVRTHTREHLYYCSQCHYSSITKNCLKRHVIQKHSNILLKCPTDGCDYSTPDKYKLQAH .: : :: :. . :..: . : .: . .. .: :. . .. .:. : KIAA18 QHQRIHTGEKPFACNECGKAFSRYAFLVEHQRIHTGEKPYECKE--CNKAFRQSAHLNQH 300 310 320 330 340 350 680 690 700 710 720 730 KIAA14 LKVHTALDKRSYSCPVCEKSFSEDRLIKSH--IKTNHPEVSMSTISEVLGRRVQL----K ..::. .. : : : :.::. . : :.:.. . : ....: : .: . KIAA18 QRIHTG--EKPYECNQCGKAFSRRIALTLHQRIHTGEKPFKCSECGKTFGYRSHLNQHQR 360 370 380 390 400 410 740 750 760 770 780 790 KIAA14 GLIGKRAMKCPYCDFYFMKNGSDLQRHIWAHEGVKPFKCSLCEYATRSKSNLKAHMNRHS :.. ..: : .: .. :.:.:: : : .::.:: : : . : : :. 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