# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fj01881.fasta.huge -Q ../query/KIAA1469.ptfa ./tmplib.24314 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1469, 662 aa vs ./tmplib.24314 library 1986843 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8245+/-0.00521; mu= 14.6402+/- 0.353 mean_var=94.3531+/-23.556, 0's: 0 Z-trim: 28 B-trim: 135 in 1/39 Lambda= 0.132037 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0405 ( 706 res) hg01274 ( 706) 1684 331.6 1.4e-91 KIAA1580 ( 640 res) fj04979 ( 640) 392 85.5 1.6e-17 KIAA0918 ( 966 res) hk09360(revised) ( 966) 365 80.5 7.4e-16 KIAA0814 ( 1559 res) fh16048 (1559) 320 72.2 3.8e-13 KIAA1854 ( 572 res) fg02232 ( 572) 312 70.2 5.8e-13 KIAA0862 ( 584 res) hk06532 ( 584) 309 69.6 8.7e-13 KIAA0806 ( 1073 res) hk04165(revised) (1073) 300 68.2 4.2e-12 KIAA1910 ( 760 res) fh21867 ( 760) 294 66.9 7.5e-12 KIAA0848 ( 988 res) hk05607 ( 988) 291 66.5 1.3e-11 KIAA1916 ( 542 res) hg01117 ( 542) 274 62.9 8.5e-11 KIAA1465 ( 785 res) fh13187 ( 785) 270 62.3 1.8e-10 KIAA1904 ( 821 res) af00058 ( 821) 258 60.1 9.1e-10 KIAA0813 ( 1618 res) pf00581 (1618) 252 59.3 3.1e-09 KIAA1246 ( 832 res) hh00149a ( 832) 233 55.3 2.5e-08 KIAA0416 ( 529 res) hh00236 ( 529) 203 49.4 9.8e-07 KIAA0644 ( 887 res) hj03618 ( 887) 203 49.6 1.4e-06 KIAA1497 ( 730 res) hg01608 ( 730) 189 46.9 7.7e-06 KIAA0231 ( 823 res) fk16230 ( 823) 181 45.4 2.4e-05 KIAA1016 ( 793 res) hk03719s1 ( 793) 160 41.4 0.00037 KIAA0012 ( 789 res) ha00413 ( 789) 158 41.0 0.00048 KIAA1851 ( 523 res) hg04492 ( 523) 155 40.2 0.00055 KIAA0931 ( 1258 res) bf00159 (1258) 156 40.9 0.00085 KIAA1163 ( 437 res) hj05329 ( 437) 149 39.0 0.0011 KIAA0230 ( 1496 res) ha02538 (1496) 154 40.6 0.0012 KIAA1225 ( 1371 res) fh04221s1 (1371) 151 40.0 0.0017 KIAA1437 ( 811 res) hk07206 ( 811) 148 39.1 0.0018 KIAA0606 ( 1369 res) ph00195 (1369) 149 39.6 0.0022 >>KIAA0405 ( 706 res) hg01274 (706 aa) initn: 1873 init1: 1395 opt: 1684 Z-score: 1736.0 bits: 331.6 E(): 1.4e-91 Smith-Waterman score: 1989; 47.304% identity (75.347% similar) in 649 aa overlap (28-662:70-706) 10 20 30 40 50 KIAA14 RKLPCIKTSTLLTMISAAWSIFLIGTKIGLFLQVAPLSVMAKSCPSVCRCDAGFIYC .::. ::. : .: :::::::: .:.:: KIAA04 FYFRTSEMGLQTTKWPSHGAFFLKSWLIISLGLYSQVSKL--LA--CPSVCRCDRNFVYC 40 50 60 70 80 90 60 70 80 90 100 110 KIAA14 NDRFLTSIPTGIPEDATTLYLQNNQINNAGIPSDLKNLLKVERIYLYHNSLDEFPTNLPK :.: :::.: :::: .:.:::.::::::::.:..:.:. .:. .::: :.::::: :::: KIAA04 NERSLTSVPLGIPEGVTVLYLHNNQINNAGFPAELHNVQSVHTVYLYGNQLDEFPMNLPK 100 110 120 130 140 150 120 130 140 150 160 170 KIAA14 YVKELHLQENNIRTITYDSLSKIPYLEELHLDDNSVSAVSIEEGAFRDSNYLRLLFLSRN :. ::::::::.::. .:... ::::::::::.:.:..:.::::.. :.:::::.: KIAA04 NVRVLHLQENNIQTISRAALAQLLKLEELHLDDNSISTVGVEDGAFREAISLKLLFLSKN 160 170 180 190 200 210 180 190 200 210 220 230 KIAA14 HLSTIPWGLPRTIEELRLDDNRISTISSPSLQGLTSLKRLVLDGNLLNNHGLGDKVFFNL :::..: ::: ..:::.:.:::..::. ..:.::::.::..:::::.:.:... .: .: KIAA04 HLSSVPVGLPVDLQELRVDENRIAVISDMAFQNLTSLERLIVDGNLLTNKGIAEGTFSHL 220 230 240 250 260 270 240 250 260 270 280 290 KIAA14 VNLTELSLVRNSLTAAPVNLPGTNLRKLYLQDNHINRVPPNAFSYLRQLYRLDMSNNNLS ..: :.:.:::::. : .::::.: .::::::.::..: .::: ::.: :::.:::.: KIAA04 TKLKEFSIVRNSLSHPPPDLPGTHLIRLYLQDNQINHIPLTAFSNLRKLERLDISNNQLR 280 290 300 310 320 330 300 310 320 330 340 350 KIAA14 NLPQGIFDDLDNITQLILRNNPWYCGCKMKWVRDWLQSLPVKVNVRGLMCQAPEKVRGMA : ::.::.:.:. :: :::::.: :..::: .::. .: ..::::.:::.::.::::: KIAA04 MLTQGVFDNLSNLKQLTARNNPWFCDCSIKWVTEWLKYIPSSLNVRGFMCQGPEQVRGMA 340 350 360 370 380 390 360 370 380 390 400 KIAA14 IKDLNAELFDCKDS--GIV------STIQITTAIPNTVYPAQGQW---PAPVT-KQPDIK ...:: .:..: . :. :: . :: :. : .. :.:.: : : : KIAA04 VRELNMNLLSCPTTTPGLPLFTPAPSTASPTTQPPTLSIPNPSRSYTPPTPTTSKLPTI- 400 410 420 430 440 450 410 420 430 440 450 460 KIAA14 NPKLTKDHQTTGSPSRKTITITVKSVTSDTIHISWKLALPMTALRLSWLKLGHSPAFGSI : ...: : . : .... :.. .:..:: . . : .:.:.:.::: . : . KIAA04 -PDWDGRERVT-PPISERIQLSIHFVNDTSIQVSWLSLFTVMAYKLTWVKMGHSLVGGIV 460 470 480 490 500 510 470 480 490 500 510 520 KIAA14 TETIVTGERSEYLVTALEPDSPYKVCMVPMETSNLYLFDETPVCIETETAPLRMYNPTTT : ::.::... .. ::: : :..:.::... : ..: .: :. : . : ..: KIAA04 QERIVSGEKQHLSLVNLEPRSTYRICLVPLDAFNYRAVEDT-ICSEATTHASYLNNGSNT 520 530 540 550 560 570 530 540 550 560 570 580 KIAA14 LNREQEKEPYK--NPNLPLAAIIGGAVALVTIALLALVCWYVHRNGSLFSRNCAYSKGRR . ... .. .: : ::..::::: .: ..::.. ::..:..: :.. :..::: KIAA04 ASSHEQTTSHSMGSPFL-LAGLIGGAVIFVLVVLLSVFCWHMHKKGRYTSQKWKYNRGRR 580 590 600 610 620 630 590 600 610 620 630 640 KIAA14 RKDDYAEAGTKKDNSILEIRETSFQMLPISNEPISKEEFVIHTIFPPNGMNLYKNNHSES :::: ::::::::::::. :::::.. ..:. . : .: .. :. ::: : . : KIAA04 -KDDYCEAGTKKDNSILEMTETSFQIVSLNNDQLLKGDFRLQPIYTPNGGINYTDCHIP- 640 650 660 670 680 650 660 KIAA14 SSNRSYRDSGIPDSDHSHS .: : .:..:: .: :. KIAA04 -NNMRYCNSSVPDLEHCHT 690 700 >>KIAA1580 ( 640 res) fj04979 (640 aa) initn: 385 init1: 241 opt: 392 Z-score: 406.4 bits: 85.5 E(): 1.6e-17 Smith-Waterman score: 472; 30.114% identity (60.511% similar) in 352 aa overlap (31-374:35-357) 10 20 30 40 50 KIAA14 RKLPCIKTSTLLTMISAAWSIFLIGTKIGLFLQVAPLSVMAKSCPSVCRCDAGF--IYCN .: :: : : :..::::: :. : . : KIAA15 MTLHPQQIMIGPRFNRALFDPLLVVLLALQLLVVAGL-VRAQTCPSVCSCSNQFSKVICV 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 KIAA14 DRFLTSIPTGIPEDATTLYLQNNQINNAGIPSDLKNLLKVERIYLYHNSLDEFPTNLPKY . : .: :: .. : :..:::. ..:: ::. .. .. KIAA15 RKNLREVPDGISTNTRLLNLHENQIQ----------IIKV-------NSFKHL-----RH 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 KIAA14 VKELHLQENNIRTITYDSLSKIPYLEELHLDDNSVSAVSIEEGAFRDSNYLRLLFLSRNH .. :.:..:.:::: ... . :. :.: :: .. .: .::: . :. :.: : KIAA15 LEILQLSRNHIRTIEIGAFNGLANLNTLELFDNRLT--TIPNGAFVYLSKLKELWLRNNP 110 120 130 140 150 180 190 200 210 220 230 KIAA14 LSTIP-WGLPRTIEELRLDDN---RISTISSPSLQGLTSLKRLVLDGNLLNNHGLGDKVF . .:: ... : ::: . :.: :: ...::..:. : : . : . . . . KIAA15 IESIPSYAFNRIPSLRRLDLGELKRLSYISEGAFEGLSNLRYLNL--AMCNLREIPN--L 160 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 KIAA14 FNLVNLTELSLVRNSLTAA-PVNLPGT-NLRKLYLQDNHINRVPPNAFSYLRQLYRLDMS :..: ::.: : :.: : .. : .:.::.. ...:. . :::. :..: ..... KIAA15 TPLIKLDELDLSGNHLSAIRPGSFQGLMHLQKLWMIQSQIQVIERNAFDNLQSLVEINLA 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 KIAA14 NNNLSNLPQGIFDDLDNITQLILRNNPWYCGCKMKWVRDWLQSLPVKVNVRGLMCQAPEK .:::. ::. .: : .. .. :..::: :.: . :. :.... . .. :..: . KIAA15 HNNLTLLPHDLFTPLHHLERIHLHHNPWNCNCDILWLSWWIKDMAPSNTACCARCNTPPN 280 290 300 310 320 330 360 370 380 390 400 410 KIAA14 VRGMAIKDLNAELFDCKDSGIVSTIQITTAIPNTVYPAQGQWPAPVTKQPDIKNPKLTKD ..: : .:. . : : :: KIAA15 LKGRYIGELDQNYFTCYAPVIVEPPADLNVTEGMAAELKCRASTSLTSVSWITPNGTVMT 340 350 360 370 380 390 >>KIAA0918 ( 966 res) hk09360(revised) (966 aa) initn: 480 init1: 239 opt: 365 Z-score: 376.6 bits: 80.5 E(): 7.4e-16 Smith-Waterman score: 365; 29.630% identity (64.609% similar) in 243 aa overlap (172-407:422-657) 150 160 170 180 190 KIAA14 YLEELHLDDNSVSAVSIEEGAFRDSNYLRLLFLSRNHLSTIPWG--LPRT-IEELRLDDN ..:..:..... : : .. :.: .: KIAA09 ISDLGLNVNCQERKIESIAELQPKPYNPKKMYLTENYIAVVRRTDFLEATGLDLLHLGNN 400 410 420 430 440 450 200 210 220 230 240 250 KIAA14 RISTISSPSLQGLTSLKRLVLDGNLLNNHGLGDKVFFNLVNLTELSLVRNSLTAAPVNL- ::: :.. .. ::.:.:: :.:: .. :. ..:..: .: : : : . . KIAA09 RISMIQDRAFGDLTNLRRLYLNGNRIER--LSPELFYGLQSLQYLFLQYNLIREIQSGTF 460 470 480 490 500 260 270 280 290 300 310 KIAA14 -PGTNLRKLYLQDNHINRVPPNAFSYLRQLYRLDMSNNNLSNLP-QGIFDDLDNITQLIL : ::. :.:..: .. .: ..:: : : ::.. .:....:: .:..:.: .. :. : KIAA09 DPVPNLQLLFLNNNLLQAMPSGVFSGLT-LLRLNLRSNHFTSLPVSGVLDQLKSLIQIDL 510 520 530 540 550 560 320 330 340 350 360 370 KIAA14 RNNPWYCGCKMKWVRDWLQSLPVKVNVRGLMCQAPEKVRGMAIKDLNAELFDCKDSGIVS ..::: : : . .. :...: : : : ..:.::.: ......::. : : : KIAA09 HDNPWDCTCDIVGMKLWVEQLKVGVLVDEVICKAPKKFAETDMRSIKSELL-CPD---YS 570 580 590 600 610 620 380 390 400 410 420 430 KIAA14 TIQITTAIPNTVY-PAQGQWPAPVTKQPDIKNPKLTKDHQTTGSPSRKTITITVKSVTSD . ..: :... ::. . .:... . : KIAA09 DVVVSTPTPSSIQVPARTSAVTPAVRLNSTGAPASLGAGGGASSVPLSVLILSLLLVFIM 630 640 650 660 670 680 440 450 460 470 480 490 KIAA14 TIHISWKLALPMTALRLSWLKLGHSPAFGSITETIVTGERSEYLVTALEPDSPYKVCMVP KIAA09 SVFVAAGLFVLVMKRRKKNQSDHTSTNNSDVSSFNMQYSVYGGGGGTGGHPHAHVHHRGP 690 700 710 720 730 740 >>KIAA0814 ( 1559 res) fh16048 (1559 aa) initn: 601 init1: 228 opt: 320 Z-score: 327.8 bits: 72.2 E(): 3.8e-13 Smith-Waterman score: 336; 24.851% identity (49.503% similar) in 503 aa overlap (7-371:30-524) 10 20 30 KIAA14 RKLPCIKTSTLLTMISAAWSIFLIGTKIGLFLQVAPL ....: :: . .:. ... : : .: KIAA08 LRRPLPRPPALPARLLGLHASCPAEAASSRSGALHTM-APGWAGVGAAVRARLALALALA 10 20 30 40 50 40 50 60 70 80 KIAA14 SVM----AKSCPSVCRCDAGFIYCNDRFLTSIPTGIPEDATTLYLQNNQINN------AG ::. : .::. : :.:. . :. : ..: :::..: : :. :.:. :: KIAA08 SVLSGPPAVACPTKCTCSAASVDCHGLGLRAVPRGIPRNAERLDLDRNNITRITKMDFAG 60 70 80 90 100 110 90 100 110 120 KIAA14 IPS-------D----------LKNLLKVERIYLYHNSLDEFPTNL----PKYVKELHLQE . . : ...: ..::. : .:.:. .: : :: .. : :.: KIAA08 LKNLRVLHLEDNQVSVIERGAFQDLKQLERLRLNKNKLQVLPELLFQSTPKLTR-LDLSE 120 130 140 150 160 170 130 140 150 160 170 KIAA14 NNIRTITYDSLSKIPYLEELHLDDNSVSAVSIEEGAFR-----------DSNYLRLLFLS :.:. : .. : ...:.::.: .: ::.:::: ..: :.: : KIAA08 NQIQGIPRKAFRGITDVKNLQLDNNHIS--CIEDGAFRALRDLEILTLNNNNISRILVTS 180 190 200 210 220 230 KIAA14 RNH--------------------------------------------------------- :: KIAA08 FNHMPKIRTLRLHSNHLYCDCHLAWLSDWLRQRRTVGQFTLCMAPVHLRGFNVADVQKKE 240 250 260 270 280 290 180 190 200 KIAA14 -------------------------------------LSTIPWGLPRTIEELRLDDNRIS : :: .::. : :.::..: :. KIAA08 YVCPAPHSEPPSCNANSISCPSPCTCSNNIVDCRGKGLMEIPANLPEGIVEIRLEQNSIK 300 310 320 330 340 350 210 220 230 240 250 KIAA14 TISSPSLQGLTSLKRLVLDGNLLNNHGLGDKVFFNLVNLTELSLVRNSLTAAPVNL-PG- .: . .. .:::. .. : ... .. .: .: .:: : : :..: .: : KIAA08 AIPAGAFTQYKKLKRIDISKNQISD--IAPDAFQGLKSLTSLVLYGNKITEIAKGLFDGL 360 370 380 390 400 410 260 270 280 290 300 310 KIAA14 TNLRKLYLQDNHINRVPPNAFSYLRQLYRLDMSNNNLSNLPQGIFDDLDNITQLILRNNP ..:. : :. :.:: . :.:. :..: :.. .:.:... .:.: :..: : : .:: KIAA08 VSLQLLLLNANKINCLRVNTFQDLQNLNLLSLYDNKLQTISKGLFAPLQSIQTLHLAQNP 420 430 440 450 460 470 320 330 340 350 360 370 KIAA14 WYCGCKMKWVRDWLQSLPVKVNVRGLMCQAPEKVRGMAIKDLNAELFDCKDSGIVSTIQI . : :..::. :.::. :.... : :..:... . :...... : :. : KIAA08 FVCDCHLKWLADYLQDNPIETS--GARCSSPRRLANKRISQIKSKKFRCSGSEDYRSRFS 480 490 500 510 520 530 380 390 400 410 420 430 KIAA14 TTAIPNTVYPAQGQWPAPVTKQPDIKNPKLTKDHQTTGSPSRKTITITVKSVTSDTIHIS KIAA08 SECFMDLVCPEKCRCEGTIVDCSNQKLVRIPSHLPEYVTDLRLNDNEVSVLEATGIFKKL 540 550 560 570 580 590 >>KIAA1854 ( 572 res) fg02232 (572 aa) initn: 350 init1: 153 opt: 312 Z-score: 324.6 bits: 70.2 E(): 5.8e-13 Smith-Waterman score: 312; 33.158% identity (63.158% similar) in 190 aa overlap (172-355:386-572) 150 160 170 180 190 KIAA14 YLEELHLDDNSVSAVSIEEGAFRDSNYLRLLFLSRNHLSTIPWG--LPRT-IEELRLDDN :.:. :.:.:. . : . .. :.: .: KIAA18 SSDNGLNVNCQERKFTNISDLQPKPTSPKKLYLTGNYLQTVYKNDLLEYSSLDLLHLGNN 360 370 380 390 400 410 200 210 220 230 240 250 KIAA14 RISTISSPSLQGLTSLKRLVLDGNLLNNHGLGDKVFFNLVNLTELSLVRNSLTAA-PVNL ::..:. .. .::::.:: :.:: :. : ..: .: .: : : : . :... KIAA18 RIAVIQEGAFTNLTSLRRLYLNGNYLEV--LYPSMFDGLQSLQYLYLEYNVIKEIKPLTF 420 430 440 450 460 470 260 270 280 290 300 310 KIAA14 PGT-NLRKLYLQDNHINRVPPNAFSYLRQLYRLDMSNNNLSNLP-QGIFDDLDNITQLIL . ::. :.:..: . .: : :. : ::.. ::..:.:: .:..:.: . :. : KIAA18 DALINLQLLFLNNNLLRSLPDNIFGGT-ALTRLNLRNNHFSHLPVKGVLDQLPAFIQIDL 480 490 500 510 520 530 320 330 340 350 360 370 KIAA14 RNNPWYCGCKMKWVRDWLQSLPVKVNVRGLMCQAPEKVRGMAIKDLNAELFDCKDSGIVS ..::: : : . ..:: . : . . :..: : : KIAA18 QENPWDCTCDIMGLKDWTEHANSPVIINEVTCESPAKHAG 540 550 560 570 380 390 400 410 420 430 KIAA14 TIQITTAIPNTVYPAQGQWPAPVTKQPDIKNPKLTKDHQTTGSPSRKTITITVKSVTSDT >>KIAA0862 ( 584 res) hk06532 (584 aa) initn: 267 init1: 113 opt: 309 Z-score: 321.4 bits: 69.6 E(): 8.7e-13 Smith-Waterman score: 309; 27.124% identity (60.131% similar) in 306 aa overlap (21-318:190-483) 10 20 30 40 50 KIAA14 RKLPCIKTSTLLTMISAAWSIFLIGTKIGLFLQVAPLSVMAKSCPSVCRC .. . . :.:. .... :. .. . KIAA08 LTSLPDSLDNLKKLRMLDLRHNKLREIPSVVYRLDSLTTLYLRFNRITTVEKDIKNLSKL 160 170 180 190 200 210 60 70 80 90 100 KIAA14 DAGFIYCNDRFLTSIPTGIPE--DATTLYLQNNQINNAGIPSDLKNLLKVERIYLYHNSL . : : . ..:. : : . :: . .::... .:... : .. . : :: : KIAA08 SMLSIRENK--IKQLPAEIGELCNLITLDVAHNQLEH--LPKEIGNCTQITNLDLQHNEL 220 230 240 250 260 270 110 120 130 140 150 160 KIAA14 DEFPTNLPKY--VKELHLQENNIRTITYDSLSKIPYLEELHLDDNSVSAVSIEEGAFRDS ..: .. . ...: :. : . .: ::.: ::::.:..:..: .. :. . . KIAA08 LDLPDTIGNLSSLSRLGLRYNRLSAIPR-SLAKCSALEELNLENNNIS--TLPESLLSSL 280 290 300 310 320 330 170 180 190 200 210 220 KIAA14 NYLRLLFLSRNHLSTIPWGLPR---TIEELRLDDNRISTISSPSLQGLTSLKRLVLDGNL : : :.:: .. : : : :: : .. :::. : .. :..: . : KIAA08 VKLNSLTLARNCFQLYPVGGPSQFSTIYSLNMEHNRINKIPFGIFSRAKVLSKLNMKDNQ 340 350 360 370 380 390 230 240 250 260 270 280 KIAA14 LNNHGLGDKVFFNLVNLTELSLVRNSLTAAPVNLPG-TNLRKLYLQDNHINRVPPNAFSY :.. : : . ....::.:. :.:: : .. : ..:. : :..: ....: .... KIAA08 LTSLPLD---FGTWTSMVELNLATNQLTKIPEDVSGLVSLEVLILSNNLLKKLP-HGLGN 400 410 420 430 440 290 300 310 320 330 340 KIAA14 LRQLYRLDMSNNNLSNLPQGIFDDLDNITQLILRNNPWYCGCKMKWVRDWLQSLPVKVNV ::.: .::. .:.: .::. : : .. .:.: :: KIAA08 LRKLRELDLEENKLESLPNEI-AYLKDLQKLVLTNNQLTTLPRGIGHLTNLTHLGLGENL 450 460 470 480 490 500 350 360 370 380 390 400 KIAA14 RGLMCQAPEKVRGMAIKDLNAELFDCKDSGIVSTIQITTAIPNTVYPAQGQWPAPVTKQP KIAA08 LTHLPEEIGTLENLEELYLNDNPNLHSLPLELALCSKLSIMSIENCPLSHLPPQIVAGGP 510 520 530 540 550 560 >>KIAA0806 ( 1073 res) hk04165(revised) (1073 aa) initn: 390 init1: 136 opt: 300 Z-score: 309.1 bits: 68.2 E(): 4.2e-12 Smith-Waterman score: 350; 26.857% identity (58.857% similar) in 350 aa overlap (58-392:184-520) 30 40 50 60 70 80 KIAA14 IGLFLQVAPLSVMAKSCPSVCRCDAGFIYCNDRFLTSIPTGIPEDATT--LYLQNNQINN :.: .:.. .: .. .. : .. :. KIAA08 LESLDLSSNIISEIKTSSFPRMQLKYLNLSNNR-ITTLEAGCFDNLSSSLLVVKLNRNRM 160 170 180 190 200 210 90 100 110 120 130 140 KIAA14 AGIPSDLKNLLKVERIYLYHNSL---DEFPTNLPKYVKELHLQENNIRTITYDSLSKIPY . :: . .: ... . : .: . . . . .. :..:.:.: . .. . KIAA08 SMIPPKIFKLPHLQFLELKRNRIKIVEGLTFQGLDSLRSLKMQRNGISKLKDGAFFGLNN 220 230 240 250 260 270 150 160 170 180 190 KIAA14 LEELHLDDNSVSAVSIEEGAFRDSNYLRLLFLSRNHLSTI-P--WGLPRTIEELRLDDNR .:::.:. :... :. .: . .:. :..:.: . : : : . . . :: :. :. KIAA08 MEELELEHNNLTRVN--KGWLYGLRMLQQLYVSQNAIERISPDAWEFCQRLSELDLSYNQ 280 290 300 310 320 330 200 210 220 230 240 250 KIAA14 ISTISSPSLQGLTSLKRLVLDGNLLNNHGLGDKVFFNLVNLTELSLVRNSLTAAPVN--- .. .. .. ::. :.:: : : ... ..: :: : :: :.: : .. : . KIAA08 LTRLDESAFVGLSLLERLNLGDNRVTH--IADGVFRFLSNLQTLDLRNNEISWAIEDASE 340 350 360 370 380 260 270 280 290 300 310 KIAA14 -LPG-TNLRKLYLQDNHINRVPPNAFSYLRQLYRLDMSNNNLSNLPQGIFDDLDNITQLI . : :.: :: :: :.:. . .:: :..: .::..:: . .. .. :.. .. .:: KIAA08 AFAGLTSLTKLILQGNQIKSITKKAFIGLESLEHLDLNNNAIMSIQENAFSQT-HLKELI 390 400 410 420 430 440 320 330 340 350 360 370 KIAA14 LRNNPWYCGCKMKWVRDWL--QSLPVKVNVRGLMCQAPEKVRGMAIKDLNAELFDCKDSG : .. : :..::. .:: ... .::: : :: . :..: ... . : : : KIAA08 LNTSSLLCDCHLKWLLQWLVDNNFQHSVNVS---CAHPEWLAGQSILNVDLKDFVCDD-- 450 460 470 480 490 500 380 390 400 410 420 430 KIAA14 IVSTIQITTAIPNTVYPAQGQWPAPVTKQPDIKNPKLTKDHQTTGSPSRKTITITVKSVT :: : :.:. .: KIAA08 -FLKPQIRTH-PETIIALRGMNVTLTCTAVSSSDSPMSTVWRKDSEILYDVDTENFVRYW 510 520 530 540 550 560 >>KIAA1910 ( 760 res) fh21867 (760 aa) initn: 171 init1: 124 opt: 294 Z-score: 304.7 bits: 66.9 E(): 7.5e-12 Smith-Waterman score: 301; 27.143% identity (61.071% similar) in 280 aa overlap (145-418:101-367) 120 130 140 150 160 170 KIAA14 LPKYVKELHLQENNIRTITYDSLSKIPYLEELHLDDNSVSAVSIEEGAFRDSNYLRLLFL .::.: .. . .:... . :.. .: :: KIAA19 LLETSLCFAAGNVTGDVCKEKICSCNEIEGDLHVDCEKKGFTSLQRFTAPTSQFYHL-FL 80 90 100 110 120 180 190 200 210 220 230 KIAA14 SRNHLSTI-PWGLPRTIEE--LRLDDNRISTISSPSLQGLTSLKRLVLDGNLLNNHGLGD : :. . : . . :....: . : .. :: .::: ...: ... . 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KIAA19 APTRLQG---KDLN-ETTE-QDLCPLKN-RVDSSLPAP--PAQEETFAP-GPLPTPFKTN 310 320 330 340 350 410 420 430 440 450 460 KIAA14 LTKDHQTTGSPSRKTITITVKSVTSDTIHISWKLALPMTALRLSWLKLGHSPAFGSITET .:: : :: KIAA19 GQEDHATPGSAPNGGTKIPGNWQIKIRPTAAIATGSSRNKPLANSLPCPGGCSCDHIPGS 360 370 380 390 400 410 >>KIAA0848 ( 988 res) hk05607 (988 aa) initn: 320 init1: 171 opt: 291 Z-score: 300.3 bits: 66.5 E(): 1.3e-11 Smith-Waterman score: 300; 25.402% identity (58.842% similar) in 311 aa overlap (116-402:356-652) 90 100 110 120 130 140 KIAA14 AGIPSDLKNLLKVERIYLYHNSLDEFPTNLPKYVKELHLQENNIRTITYDSLSKIPYLE- :. . :. :. :.. :: . KIAA08 SSVHFTASSVEYKSSNKQPKPTKQPRTPRPPSTSQALYPGPNQPPIAPYQTRPPIPIICP 330 340 350 360 370 380 150 160 170 180 KIAA14 -----ELHLDDNSVSAVSIEEGAFRDSNYL-------RLLFLSRNHLSTIP----WGLPR .::..: ... :. .: .: . . : . :.:: : .. : :.. KIAA08 TGCTCNLHINDLGLT-VNCKERGFNNISELLPRPLNAKKLYLSSNLIQKIYRSDFWNFS- 390 400 410 420 430 440 190 200 210 220 230 240 KIAA14 TIEELRLDDNRISTISSPSLQGLTSLKRLVLDGNLLNNHGLGDKVFFNLVNLT----ELS ... :.: .:::: ... .. .: .:: : :.:: ... : .: .: .: :.. KIAA08 SLDLLHLGNNRISYVQDGAFINLPNLKSLFLNGNDIEK--LTPGMFRGLQSLHYLYFEFN 450 460 470 480 490 500 250 260 270 280 290 300 KIAA14 LVRNSLTAAPVNLPGTNLRKLYLQDNHINRVPPNAFSYLRQLYRLDMSNNNLSNLP-QGI ..:. :: .: ::. :.:..: . .: .::. .: ::.. .: . :: :. KIAA08 VIREIQPAAFSLMP--NLKLLFLNNNLLRTLPTDAFAGT-SLARLNLRKNYFLYLPVAGV 510 520 530 540 550 310 320 330 340 350 360 KIAA14 FDDLDNITQLILRNNPWYCGCKMKWVRDWLQSLPVKVNVRG-LMCQAPEKVRGMAIKDLN .. :. :.:. : .::: : : . ..:.... .:.: : ..:..::.. .. .. KIAA08 LEHLNAIVQIDLNENPWDCTCDLVPFKQWIETIS-SVSVVGDVLCRSPENLTHRDVRTIE 560 570 580 590 600 610 370 380 390 400 410 420 KIAA14 AELFDCKDSGIVSTIQITTAIPNTVYPAQGQW-PAPVTKQPDIKNPKLTKDHQTTGSPSR :.. : . .... : . . :.... ::.. .: KIAA08 LEVL-CPE-----MLHVAPAGESPAQPGDSHLIGAPTSASPYEFSPPGGPVPLSVLILSL 620 630 640 650 660 670 430 440 450 460 470 480 KIAA14 KTITITVKSVTSDTIHISWKLALPMTALRLSWLKLGHSPAFGSITETIVTGERSEYLVTA KIAA08 LVLFFSAVFVAAGLFAYVLRRRRKKLPFRSKRQEGVDLTGIQMQCHRLFEDGGGGGGGSG 680 690 700 710 720 730 >>KIAA1916 ( 542 res) hg01117 (542 aa) initn: 326 init1: 195 opt: 274 Z-score: 285.7 bits: 62.9 E(): 8.5e-11 Smith-Waterman score: 274; 28.500% identity (60.500% similar) in 200 aa overlap (231-425:75-270) 210 220 230 240 250 KIAA14 STISSPSLQGLTSLKRLVLDGNLLNNHGLGDKVFFNLVNLTELSLVRNSLTAAPVN-LPG :..: .: .: : : ::.: . . : KIAA19 ICVGSSWVPRIVPGDISSLSLVNGTFSEIKDRMFSHLPSLQLLLLNSNSFTIIRDDAFAG 50 60 70 80 90 100 260 270 280 290 300 310 KIAA14 T-NLRKLYLQDNHINRVPPNAFSYLRQLYRLDMSNNNLSNLPQGIFDDLDNITQLILRNN .:. :... :.:. . ::: ::.: .:...::... ::. .:.:::.. .: ::.: KIAA19 LFHLEYLFIEGNKIETISRNAFRGLRDLTHLSLANNHIKALPRDVFSDLDSLIELDLRGN 110 120 130 140 150 160 320 330 340 350 360 370 KIAA14 PWYCGCKMKWVRDWLQSLPVKVNVRGLMCQAPEKVRGMAIKDLNAELFDCKDSGIV--ST . : :: ::. ::. .. .: ..: .: . . ..:... ..: . .: .: KIAA19 KFECDCKAKWLYLWLKM--TNSTVSDVLCIGPPEYQEKKLNDVTSFDYECTTTDFVVHQT 170 180 190 200 210 220 380 390 400 410 420 430 KIAA14 IQITTAIPNTVYPAQGQWPAPVTKQPDIKNPKLTK-DHQTTGSPSRKTITITVKSVTSDT . .. .: . . : ::...: . . :: . : .:: KIAA19 LPYQSVSVDTFNSKNDVYVA--IAQPSMENCMVLEWDHIEMNFRSYDNITGQSIVGCKAI 230 240 250 260 270 280 440 450 460 470 480 490 KIAA14 IHISWKLALPMTALRLSWLKLGHSPAFGSITETIVTGERSEYLVTALEPDSPYKVCMVPM KIAA19 LIDDQVFVVVAQLFGGSHIYKYDESWTKFVKFQDIEVSRISKPNDIELFQIDDETFFVIA 290 300 310 320 330 340 662 residues in 1 query sequences 1986843 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:23:43 2008 done: Thu Dec 18 15:23:44 2008 Total Scan time: 0.530 Total Display time: 0.150 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]