# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fj01719.fasta.nr -Q ../query/KIAA1468.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1468, 985 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7827083 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4195+/-0.000182; mu= 12.5466+/- 0.010 mean_var=75.7827+/-14.772, 0's: 43 Z-trim: 45 B-trim: 0 in 0/65 Lambda= 0.147329 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|114673391|ref|XP_001144763.1| PREDICTED: hypoth (1250) 6474 1386.2 0 gi|114673395|ref|XP_512162.2| PREDICTED: hypotheti (1216) 4334 931.4 0 gi|114673393|ref|XP_001144840.1| PREDICTED: hypoth (1216) 4334 931.4 0 gi|55727606|emb|CAH90558.1| hypothetical protein [ ( 973) 4325 929.4 0 gi|109122335|ref|XP_001089393.1| PREDICTED: hypoth (1216) 4314 927.1 0 gi|73945449|ref|XP_857532.1| PREDICTED: hypothetic (1213) 4065 874.2 0 gi|73945443|ref|XP_533386.2| PREDICTED: hypothetic (1213) 4065 874.2 0 gi|73945447|ref|XP_857493.1| PREDICTED: hypothetic (1193) 4029 866.5 0 gi|26333625|dbj|BAC30530.1| unnamed protein produc ( 908) 4006 861.6 0 gi|26327357|dbj|BAC27422.1| unnamed protein produc (1216) 4007 861.9 0 gi|37994548|gb|AAH60194.1| 2310035C23Rik protein [ (1022) 4006 861.6 0 gi|109734553|gb|AAI17951.1| 2310035C23Rik protein (1192) 4006 861.7 0 gi|170014746|ref|NP_083625.1| hypothetical protein (1192) 4006 861.7 0 gi|148707925|gb|EDL39872.1| RIKEN cDNA 2310035C23, (1216) 4006 861.7 0 gi|149037235|gb|EDL91735.1| similar to RIKEN cDNA (1218) 3966 853.2 0 gi|126320899|ref|XP_001365200.1| PREDICTED: simila (1221) 3867 832.1 0 gi|126320897|ref|XP_001365134.1| PREDICTED: simila (1221) 3867 832.1 0 gi|189067855|dbj|BAG37793.1| unnamed protein produ ( 860) 3736 804.2 0 gi|114673397|ref|XP_001144698.1| PREDICTED: hypoth ( 860) 3725 801.8 0 gi|118086503|ref|XP_418993.2| PREDICTED: hypotheti (1101) 3641 784.0 0 gi|148707926|gb|EDL39873.1| RIKEN cDNA 2310035C23, ( 633) 3274 705.9 1.6e-200 gi|47223462|emb|CAF97949.1| unnamed protein produc ( 641) 2528 547.3 8.6e-153 gi|149589355|ref|XP_001520447.1| PREDICTED: hypoth ( 566) 2394 518.8 2.9e-144 gi|210100247|gb|EEA48329.1| hypothetical protein B (1087) 1803 393.4 3.2e-106 gi|73945445|ref|XP_857452.1| PREDICTED: hypothetic ( 222) 1379 302.8 1.2e-79 gi|149601029|ref|XP_001521598.1| PREDICTED: hypoth ( 475) 1343 295.4 4.5e-77 gi|47223463|emb|CAF97950.1| unnamed protein produc ( 237) 1277 281.1 4.3e-73 gi|26327965|dbj|BAC27723.1| unnamed protein produc ( 187) 1200 264.7 3e-68 gi|156212872|gb|EDO33912.1| predicted protein [Nem ( 624) 1104 244.6 1.1e-61 gi|156555664|ref|XP_001603957.1| PREDICTED: hypoth (1126) 1072 238.0 2e-59 gi|190589010|gb|EDV29032.1| hypothetical protein T (1086) 1070 237.6 2.5e-59 gi|115933880|ref|XP_001188840.1| PREDICTED: hypoth ( 523) 961 214.2 1.3e-52 gi|115688706|ref|XP_001201019.1| PREDICTED: hypoth ( 504) 960 214.0 1.5e-52 gi|215507776|gb|EEC17230.1| conserved hypothetical (1061) 928 207.4 3e-50 gi|26332543|dbj|BAC29989.1| unnamed protein produc ( 133) 834 186.8 6e-45 gi|210094919|gb|EEA43092.1| hypothetical protein B ( 592) 837 187.9 1.3e-44 gi|110765289|ref|XP_624982.2| PREDICTED: hypotheti (1101) 837 188.1 2.1e-44 gi|60464442|gb|EAL62589.1| hypothetical protein DD (1169) 695 157.9 2.7e-35 gi|91078776|ref|XP_969177.1| PREDICTED: hypothetic (1110) 693 157.4 3.4e-35 gi|222424518|dbj|BAH20214.1| AT5G16210 [Arabidopsi ( 374) 672 152.7 3.2e-34 gi|222848803|gb|EEE86350.1| predicted protein [Pop (1140) 673 153.2 6.7e-34 gi|17978919|gb|AAL47427.1| AT5g16210/T21H19_130 [A (1180) 672 153.0 8e-34 gi|9755831|emb|CAC01862.1| putative protein [Arabi (1189) 672 153.0 8e-34 gi|157341465|emb|CAO49372.1| unnamed protein produ (1154) 665 151.5 2.2e-33 gi|162690116|gb|EDQ76484.1| predicted protein [Phy (1037) 657 149.8 6.5e-33 gi|162690234|gb|EDQ76602.1| predicted protein [Phy (1136) 657 149.8 7e-33 gi|56201783|dbj|BAD73233.1| HEAT repeat-containing (1183) 655 149.4 9.8e-33 gi|218188329|gb|EEC70756.1| hypothetical protein O (1199) 655 149.4 9.9e-33 gi|222618554|gb|EEE54686.1| hypothetical protein O (1199) 655 149.4 9.9e-33 gi|156212873|gb|EDO33913.1| predicted protein [Nem ( 202) 640 145.7 2.2e-32 >>gi|114673391|ref|XP_001144763.1| PREDICTED: hypothetic (1250 aa) initn: 6474 init1: 6474 opt: 6474 Z-score: 7428.0 bits: 1386.2 E(): 0 Smith-Waterman score: 6474; 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