# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fh13187.fasta.huge -Q ../query/KIAA1465.ptfa ./tmplib.24314 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1465, 785 aa vs ./tmplib.24314 library 1986720 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.2650+/-0.00711; mu= 7.6904+/- 0.480 mean_var=232.1700+/-54.986, 0's: 0 Z-trim: 25 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.084173 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0230 ( 1496 res) ha02538 (1496) 411 63.5 1.8e-10 KIAA0813 ( 1618 res) pf00581 (1618) 383 60.2 2e-09 KIAA0814 ( 1559 res) fh16048 (1559) 355 56.7 2.1e-08 KIAA0405 ( 706 res) hg01274 ( 706) 325 52.7 1.6e-07 KIAA1904 ( 821 res) af00058 ( 821) 309 50.8 6.7e-07 KIAA1580 ( 640 res) fj04979 ( 640) 289 48.2 3.1e-06 KIAA1531 ( 1206 res) ph00937 (1206) 284 48.0 6.9e-06 KIAA0416 ( 529 res) hh00236 ( 529) 271 45.9 1.3e-05 KIAA1469 ( 662 res) fj01881 ( 662) 270 45.9 1.6e-05 KIAA0848 ( 988 res) hk05607 ( 988) 269 46.0 2.2e-05 KIAA1854 ( 572 res) fg02232 ( 572) 262 44.9 2.8e-05 KIAA1851 ( 523 res) hg04492 ( 523) 256 44.1 4.4e-05 KIAA0918 ( 966 res) hk09360(revised) ( 966) 252 44.0 9e-05 KIAA1910 ( 760 res) fh21867 ( 760) 230 41.2 0.00049 KIAA1246 ( 832 res) hh00149a ( 832) 230 41.2 0.00052 KIAA1497 ( 730 res) hg01608 ( 730) 223 40.3 0.00087 KIAA0806 ( 1073 res) hk04165(revised) (1073) 210 38.9 0.0033 KIAA0862 ( 584 res) hk06532 ( 584) 195 36.8 0.008 >>KIAA0230 ( 1496 res) ha02538 (1496 aa) initn: 379 init1: 308 opt: 411 Z-score: 279.8 bits: 63.5 E(): 1.8e-10 Smith-Waterman score: 412; 28.431% identity (55.882% similar) in 306 aa overlap (14-312:12-296) 10 20 30 40 50 KIAA14 GHNTCVYLAWAIFPALPRRVWRRGFSPRTFTESRRILGAAMFPLRALWLVWALLGVAGS- :. : . .:. .: .:: : : . :. .:. :.:... 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KIAA08 DFRCEEGQEEGGCLP---RPQCPQECACLDTVVRC-SNKHLRALPKGIPKNVTELYLDGN 800 810 820 830 840 850 320 330 340 350 360 370 KIAA14 TVVLEPPVLSGEDDGVGAEEGEGEGDGDLLTQTQAQTPTPAPAWPAPPATPRFLALANGS .: : :: KIAA08 QFTLVPGQLSTFKYLQLVDLSNNKISSLSNSSFTNMSQLTTLILSYNALQCIPPLAFQGL 860 870 880 890 900 910 >>KIAA0814 ( 1559 res) fh16048 (1559 aa) initn: 696 init1: 298 opt: 355 Z-score: 242.9 bits: 56.7 E(): 2.1e-08 Smith-Waterman score: 396; 31.373% identity (63.235% similar) in 204 aa overlap (60-262:541-737) 30 40 50 60 70 80 KIAA14 FTESRRILGAAMFPLRALWLVWALLGVAGSCPEPCACVDKYAHQFADCAYKELREVPEGL ::: : : ..::. ..: ..: : KIAA08 ISQIKSKKFRCSGSEDYRSRFSSECFMDLVCPEKCRC----EGTIVDCSNQKLVRIPSHL 520 530 540 550 560 90 100 110 120 130 140 KIAA14 PANVTTLSLSANKITVLR-RGAFADVTQVTSLWLAHNEVRTVEPGALAVLSQLKNLDLSH : :: : :. :...::. : : . .. .. :..:... :. ::. .....: :. KIAA08 PEYVTDLRLNDNEVSVLEATGIFKKLPNLRKINLSNNKIKEVREGAFDGAASVQELMLTG 570 580 590 600 610 620 150 160 170 180 190 200 KIAA14 NFISSFPWSDLRNLSALQLLKMNHNRLGSLPRDALGALPDLRSLRINNNRLRTLAPGTFD : . . .:.::.:. : . : .: . :....: ..: : . .::. :..::.: KIAA08 NQLETVHGRVFRGLSGLKTLMLRSNLIGCVSNDTFAGLSSVRLLSLYDNRITTITPGAFT 630 640 650 660 670 680 210 220 230 240 250 260 KIAA14 ALSALSHLQLYHNPFHCGCGLVWLQAWAASTRVSLPEPDSIACASPPALQGVPVYRLPAL .: .:: ..: :::.:.: :.:: : . :. .: : .: :. .:. KIAA08 TLVSLSTINLLSNPFNCNCHLAWLGKWLRKRRIVSGNP---RCQKPFFLKEIPIQDVAIQ 690 700 710 720 730 740 270 280 290 300 310 320 KIAA14 PCAPPSVHLSAEPPLEAPGTPLRAGLAFVLHCIADGHPTPRLQWQLQIPGGTVVLEPPVL KIAA08 DFTCDGNEESSCQLSPRCPEQCTCMETVVRCSNKGLRALPRGMPKDVTELYLEGNHLTAV 750 760 770 780 790 800 >>KIAA0405 ( 706 res) hg01274 (706 aa) initn: 277 init1: 181 opt: 325 Z-score: 227.0 bits: 52.7 E(): 1.6e-07 Smith-Waterman score: 325; 26.235% identity (53.395% similar) in 324 aa overlap (13-327:149-467) 10 20 30 40 KIAA14 GHNTCVYLAWAIFPA-LPRRVWRRGFSPRTFTESRRILGAAM :: ::. : .. .. : : . 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KIAA04 NNPWFCDCSIKWVTEWLKYIPSSL-NVRGFMCQGPEQVRGMAVRELNMNLLSCPTTTPGL 360 370 380 390 400 410 280 290 300 310 320 330 KIAA14 HLSAEPPLEAPGTPLRAGLAFVLHCIADGHPTPRLQWQLQIPG--GTVVLEPPVLSGEDD : . : : : :.. . ::: . :: : . ::. KIAA04 PLFTPAPSTASPTTQPPTLSIPNPSRSYTPPTPTTSKLPTIPDWDGRERVTPPISERIQL 420 430 440 450 460 470 340 350 360 370 380 390 KIAA14 GVGAEEGEGEGDGDLLTQTQAQTPTPAPAWPAPPATPRFLALANGSLLVPLLSAKEAGVY KIAA04 SIHFVNDTSIQVSWLSLFTVMAYKLTWVKMGHSLVGGIVQERIVSGEKQHLSLVNLEPRS 480 490 500 510 520 530 >>KIAA1904 ( 821 res) af00058 (821 aa) initn: 364 init1: 299 opt: 309 Z-score: 215.8 bits: 50.8 E(): 6.7e-07 Smith-Waterman score: 323; 26.359% identity (51.902% similar) in 368 aa overlap (52-409:11-366) 30 40 50 60 70 KIAA14 RRGFSPRTFTESRRILGAAMFPLRALWLVWALLGVA--GSCPEPCACV--DKYAHQFADC ::: : :. : . :: .: : KIAA19 AMLRLGLCAAALLCVCRPGAVRADCWLIEGDKGYVWLAIC 10 20 30 40 80 90 100 110 120 130 KIAA14 AYKE--LREVPEGLPANVTTLSLSANKITVLRRGAFADVTQVTSLWLAHNEVRTVEPGAL . .. . .:. . ..: : :. ::. .. ... ..:.: :..::. .: ::. KIAA19 SQNQPPYETIPQHINSTVHDLRLNENKLKAVLYSSLNRFGNLTDLNLTKNEISYIEDGAF 50 60 70 80 90 100 140 150 160 170 180 190 KIAA14 AVLSQLKNLDLSHNFISSFPWSDLRNLSALQLLKMNHNRLGSLPRDALGALPDLRSLRIN :.:. :.:..: .:.. . ::..: ::.: ..:: . . :.. :.: :. .. KIAA19 LGQSSLQVLQLGYNKLSNLTEGMLRGMSRLQFLFVQHNLIEVVTPTAFSECPSLISIDLS 110 120 130 140 150 160 200 210 220 230 240 250 KIAA14 NNRLRTLAPGTFDALSALSHLQLYHNPFHCGCGLVWLQAWAASTRVSLPEPDSIACASPP .::: : .:: .:..: .: :::.: : : . :: . . : . : :: KIAA19 SNRLSRLDGATFASLASLMVCELAGNPFNCECDLFGFLAWLVVFNNVTKNYDRLQCESPR 170 180 190 200 210 220 260 270 280 290 300 310 KIAA14 ALQGVPVYRLPALPCAPPSVHLSAEPPLEAPGTPLRAGLAFVLHCIADGHPTPRLQWQLQ . : :. .: : :.: :.: : : : .:::: . KIAA19 EFAGYPLL-VPR-----PYHSLNAIIVLQAK---CRNG---SLPARPVSHPTPYSTDAQR 230 240 250 260 320 330 340 350 360 370 KIAA14 IPGGTVVLEPPVLSGEDDGVGAEEGEGEGDGDLLTQTQAQTPTPAPAWPAPPATPRFLAL : . ..: . . . ... . : . : .. . : . : : . .:. KIAA19 EPDENSGFNPDEILSVEPPASSTTDASAGPAIKLHHVTFTSATLVVIIPHPYSKMYILVQ 270 280 290 300 310 320 380 390 400 410 420 430 KIAA14 ANGSLLVPLLSAKEAG-VYTC---RAHNELGANSTSIRVAVAATGPPKHAPGAGGEPDGQ :.: . ... :. . : :::.: ::.: KIAA19 YNNSYFSDVMTLKNKKEIVTLDKLRAHTEYTFCVTSLRNSRRFNHTCLTFTTRDPVPGDL 330 340 350 360 370 380 440 450 460 470 480 490 KIAA14 APTSERKSTAKGRGNSVLPSKPEGKIKGQGLAKVSILGETETEPEEDTSEGEEAEDQILA KIAA19 APSTSTTTHYIMTILGCLFGMVIVLGAVYYCLRKRRMQEEKQKSVNVKKTILEMRYGADV 390 400 410 420 430 440 >>KIAA1580 ( 640 res) fj04979 (640 aa) initn: 407 init1: 189 opt: 289 Z-score: 203.8 bits: 48.2 E(): 3.1e-06 Smith-Waterman score: 354; 26.126% identity (53.378% similar) in 444 aa overlap (40-418:21-450) 10 20 30 40 50 60 KIAA14 WAIFPALPRRVWRRGFSPRTFTESRRILGAAMF-PLRALWLVWALLGVAG-----SCPEP :.: :: .. :. :: ::: .:: KIAA15 MLNKMTLHPQQIMIGPRFNRALFDPLLVVLLALQLLVVAGLVRAQTCPSV 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 KIAA14 CACVDKYAHQFADCAYKELREVPEGLPANVTTLSLSANKITVLRRGAFADVTQVTSLWLA :.: ..... . :. :.:::::.:. .:. :.: :.: ... ..: . .. : :. KIAA15 CSCSNQFSKVI--CVRKNLREVPDGISTNTRLLNLHENQIQIIKVNSFKHLRHLEILQLS 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 KIAA14 HNEVRTVEPGALAVLSQLKNLDLSHNFISSFPWSDLRNLSALQLLKMNHNRLGSLPRDAL .:..::.: ::. :..:..:.: : ....: . . :: :. : . .: . :.: :. KIAA15 RNHIRTIEIGAFNGLANLNTLELFDNRLTTIPNGAFVYLSKLKELWLRNNPIESIPSYAF 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 KIAA14 GALPDLRSLRINN-NRLRTLAPGTFDALSALSHLQLYHNPFHCGCGLVWLQAWAASTRVS . .:.:: : ... .:: .. :.:..:: : .:.: :.: . . .. KIAA15 NRIPSLRRLDLGELKRLSYISEGAFEGLSNLRYLNLAM------CNLREIPN--LTPLIK 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 KIAA14 LPEPD----SIACASPPALQGV-PVYRLPALPCAPPSVHLSAEPPLEA------------ : : : .. : ..::. . .: . .. .: :.. KIAA15 LDELDLSGNHLSAIRPGSFQGLMHLQKLWMIQSQIQVIERNAFDNLQSLVEINLAHNNLT 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 KIAA14 --PG---TPLRAGLAFVLH-----CIADGHPTPRLQWQLQ--IPGGTVVLE----PPVLS : :::. . :: : : :.: .. :..:. :: :. KIAA15 LLPHDLFTPLHHLERIHLHHNPWNCNCD---ILWLSWWIKDMAPSNTACCARCNTPPNLK 290 300 310 320 330 330 340 350 360 370 KIAA14 GEDDGV----------------GAEEGEGEGDGDLLTQTQAQTPTPAPAWPAPPATP--- :. : :. . :: . : . .:.: . .: .: .: KIAA15 GRYIGELDQNYFTCYAPVIVEPPADLNVTEGMAAEL-KCRASTSLTSVSWITPNGTVMTH 340 350 360 370 380 390 380 390 400 410 420 KIAA14 -----RFLALANGSLLVPLLSAKEAGVYTCRAHNELGANSTSIRVAV-AATGPPKHAPGA :. .:..:.: ......:.::: . : .: ...: . : ::: : KIAA15 GAYKVRIAVLSDGTLNFTNVTVQDTGMYTCMVSNSVGNTTASATLNVTAATTTPFSYFST 400 410 420 430 440 450 430 440 450 460 470 480 KIAA14 GGEPDGQAPTSERKSTAKGRGNSVLPSKPEGKIKGQGLAKVSILGETETEPEEDTSEGEE KIAA15 VTVETMEPSQDEARTTDNNVGPTPVVDWETTNVTTSLTPQSTRSTEKTFTIPVTDINSGI 460 470 480 490 500 510 >>KIAA1531 ( 1206 res) ph00937 (1206 aa) initn: 439 init1: 228 opt: 284 Z-score: 197.5 bits: 48.0 E(): 6.9e-06 Smith-Waterman score: 326; 31.148% identity (51.475% similar) in 305 aa overlap (34-312:91-366) 10 20 30 40 50 KIAA14 TCVYLAWAIFPALPRRVWRRGFSPRTFTESRRILGAA---MFPLRALWLVWALL----GV ::. :: ..:: ::. : :. 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