# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/bg00289.fasta.huge -Q ../query/KIAA1451.ptfa ./tmplib.24314 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1451, 939 aa vs ./tmplib.24314 library 1986566 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7514+/-0.00652; mu= 14.3551+/- 0.445 mean_var=155.9548+/-36.040, 0's: 0 Z-trim: 5 B-trim: 5 in 1/39 Lambda= 0.102701 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1534 ( 865 res) fh03661(revised) ( 865) 2055 317.1 6e-87 KIAA0772 ( 469 res) hk05119 ( 469) 455 79.6 9.6e-16 KIAA0704 ( 919 res) hg02921s2 ( 919) 337 62.5 2.6e-10 KIAA1664 ( 920 res) fj04751s1 ( 920) 334 62.1 3.6e-10 >>KIAA1534 ( 865 res) fh03661(revised) (865 aa) initn: 2936 init1: 1944 opt: 2055 Z-score: 1652.9 bits: 317.1 E(): 6e-87 Smith-Waterman score: 3113; 55.632% identity (78.391% similar) in 870 aa overlap (100-939:25-865) 70 80 90 100 110 120 KIAA14 KDVLGPSTVVANSDESQLLTPGKMSQRQGKEAYP-TPTKDLHQPSLSPASPHSQGFERGK : :: .: ::. .:. .:. :...: KIAA15 EEGGHREKRRRRKASRNLLLSGDNELYPLSPGKDM-EPN-GPSLPRDEG----- 10 20 30 40 130 140 150 160 170 180 KIAA14 EDISQNKDESSLSMSKSKSESKLYNGSEKDS-STSSKLTKKESLKVQKKNYREEKKRATK : . . .: .: :::.:. : ....::::.::.::.:::.::::::. 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KIAA07 ESLLLDSPAVAKSGDNLAEENSRDENRALVHQLSNESRLSITDSLSE--FFDAQEVLLSP 440 450 460 470 480 490 390 400 410 420 430 440 KIAA14 SDKENDQEHDESDNEVMGKSEESDTDTSERQDDSYIEPEPVEPLKETTYTEQSHEELGEA :..::. : :. : :.. . :. . :. : . . :. .. .:... KIAA07 SSSENEISDD--DSYVSDISDNLSLDNLSNDLDN--ERQTLGPVLDSGREAKSRRRTCLP 500 510 520 530 540 450 460 470 480 490 500 KIAA14 GEASQTETVSEENKSLIWTLLKQVRPGMDLSKVVLPTFILEPRSFLDKLSDYYYHADFLS . .. ..: .:..:.. : :::::..:. . :: . :..: . ....:. KIAA07 APCPSSSNIS------LWNILRN-NIGKDLSKVAMPVELNEPLNTLQRLCEELEYSELLD 550 560 570 580 590 600 510 520 530 540 550 KIAA14 EAALEENPYFRLKKVVKWYLSGFYKKP-KGLKKPYNPILGETFRCLWIHPRTNSKTFYIA .:: .: :. :. . .:.. .. .. .::.::.::::..:. : .. ... KIAA07 KAAQIPSPLERMVYVAAFAISAYASSYYRAGSKPFNPVLGETYECI----REDKGFQFFS 610 620 630 640 650 560 570 580 590 600 610 KIAA14 EQVSHHPPISAFYVSNRKDGFCLSGSILAKSKFYGNSLSAILEGEARLTFLNRGEDYVMT ::::::::::: .. .:. : . .. :.::.:.:. . : ...:. :. . . 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