# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fh12401b.fasta.nr -Q ../query/KIAA1450.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1450, 1139 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7826498 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5748+/-0.000188; mu= 12.9228+/- 0.011 mean_var=84.9062+/-16.217, 0's: 35 Z-trim: 38 B-trim: 68 in 1/64 Lambda= 0.139189 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|149698341|ref|XP_001498983.1| PREDICTED: follic (1097) 6016 1218.7 0 gi|109464967|ref|XP_227287.4| PREDICTED: similar t (1214) 5782 1171.8 0 gi|172046118|sp|Q80TD3.2|FNIP2_MOUSE Folliculin-in (1108) 5621 1139.4 0 gi|149412087|ref|XP_001510294.1| PREDICTED: simila (1151) 4790 972.5 0 gi|148683517|gb|EDL15464.1| mCG20638 [Mus musculus (1189) 4483 910.9 0 gi|152941046|gb|AAI16317.1| Fnip2 protein [Mus mus ( 888) 4298 873.7 0 gi|73978358|ref|XP_532705.2| PREDICTED: similar to (1073) 4148 843.6 0 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PECPEGTDSRDLGLKPDKEANRRPEQGSEACSAGCLGPASDASWKPQNAFCGDEKN-KEA :::.: :.: :::::.:. : :: : : :.:::::.: :::.. ::: gi|149 AGVPEGVDIRELCPKPDKEGNKSSEVGS----MGYQETALDSSWKPQDASVGDEESEKEA 580 590 600 610 620 630 690 700 710 720 730 740 KIAA14 PQDGSSRLPSCEVLGAGMKMDQQAVCELLKVEMPTRLPDRSVAWPCPDRHLREKPSLEKV :.:::::. ::: ::::... ::.: : :: ::: .:::::.:::::::: :::: :::: gi|149 PRDGSSRFSSCEGLGAGLQIGQQTVIEELKGEMPKKLPDRSAAWPCPDRHSREKPPLEKV 640 650 660 670 680 690 750 760 770 780 790 KIAA14 TFQIGSFASPESDFESRMKKMEERVKACG--------PSLEASEAADVAQDPQVSRSPFK :::::: .::::::::: ::::::.:.: :: : : :: :::: :::: : gi|149 TFQIGSSVSPESDFESRTKKMEERLKGCRQYPESASCPSAEPSGAAHVAQDQQVSRCSFM 700 710 720 730 740 750 800 810 820 830 840 850 KIAA14 PGFQENVCCPQNRLSEGDEGESDKGFAEDRGSRNDMAADIAGQLSHAADLGTASHGAGGT ::::.:::::::. ::: :. : ::::::: :. ..:: :: :.... : . . .:.:. gi|149 PGFQKNVCCPQNQSSEGGESACDWGFAEDRGIRTKVTADAAGLLDRSVHLLAPNDSAAGA 760 770 780 790 800 810 860 870 880 890 900 910 KIAA14 GGRRLEATRGLYVKAAEGPVLEPVAPRCVQRGPGLVAGANIPCGDDNKKANFRTEGDIPR : : :: :::::.:.::: ..::: ::::. . . :..:::: ..::.:: :::::: gi|149 GQRTLEKTRGLYLKVAEGSLVEPVPSRCVQQDSDFSVEADVPCGDADRKADFRIEGDIPR 820 830 840 850 860 870 920 930 940 950 960 970 KIAA14 NESSDSALGDSDDEACASAMLDLGHGGDRTGGSLEVELPLPRSQSISTQNVRNFGRSLLA ::::::::::::::::::: :::::..:: ::::::::::::::::. ::::::::::: gi|149 NESSDSALGDSDDEACASATLDLGHSSDRPEGSLEVELPLPRSQSISNPNVRNFGRSLLA 880 890 900 910 920 930 980 990 1000 1010 1020 1030 KIAA14 GYCPTYMPDLVLHGTGSDEKLKQCLVADLVHTVHHPVLDEPIAEAVCIIADTDKWSVQVA :::::::::::::::.:::::.:::.:::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|149 GYCPTYMPDLVLHGTSSDEKLRQCLLADLVHTVHHPVLDEPIAEAVCIIADTDKWSVQVA 940 950 960 970 980 990 1040 1050 1060 1070 1080 1090 KIAA14 TSQRKVTDNMKLGQDVLVSSQVSSLLQSILQLYKLHLPADFCIMHLEDRLQEMYLKSKML :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|149 TSQRKVTDNMKLGQDVLVSSQVSSLLQSILQLYKLHLPADFCIMHLEDRLQEMYLKSKML 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1100 1110 1120 1130 KIAA14 SEYLRGHTRVHVKELGVVLGIESNDLPLLTAIASTHSPYVAQILL ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|149 SEYLRGHTRVHVKELGVVLGIESNDLPLLTAIASTHSPYVAQILL 1060 1070 1080 1090 >>gi|109464967|ref|XP_227287.4| PREDICTED: similar to CG (1214 aa) initn: 5133 init1: 3440 opt: 5782 Z-score: 6267.9 bits: 1171.8 E(): 0 Smith-Waterman score: 5782; 78.404% identity (87.944% similar) in 1153 aa overlap (1-1139:77-1214) 10 20 KIAA14 AAAAPGCALSRRPPERHGRSCGGGI--MAP :::: ::::::: ::: :: :. . ::: gi|109 PAAAAPHLPSAAAVRRSRPSGRPRPRRHGPAAAALGCALSRRVPER-GRP-GSRVHAMAP 50 60 70 80 90 100 30 40 50 60 70 80 KIAA14 TLLQKLFNKRGSSGSSAAASAQGRAPKEGPAFSWSCSEFDLNEIRLIVYQDCDRRGRQVL :::::::::::. .:::::.: ::: ::::::::::::..:::::::::.::::::. gi|109 TLLQKLFNKRGG----GAASAQARPPKEEPAFSWSCSEFDLSDIRLIVYQDCERRGRQVM 110 120 130 140 150 160 90 100 110 120 130 140 KIAA14 FDSKAVQKIEEVTAQKTEDVPIKISAKCCQGSSSVSSSSSSSISSHSS--SGGSSHHAKE :::.::::.::..:::.::::::.::.::: :.::::::::: .: :: :::::.:::: gi|109 FDSRAVQKVEETAAQKAEDVPIKMSARCCQESGSVSSSSSSSSNSSSSQSSGGSSQHAKE 170 180 190 200 210 220 150 160 170 180 190 200 KIAA14 QLPKYQYTRPASDVNMLGEMMFGSVAMSYKGSTLKIHYIRSPPQLMISKVFSARMGSFCG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|109 QLPKYQYTRPASDVNMLGEMMFGSVAMSYKGSTLKIHYIRSPPQLMISKVFSARMGSFCG 230 240 250 260 270 280 210 220 230 240 250 260 KIAA14 STNNLQDSFEYINQDPNLGKLNTNQNSLGPCRTGSNLAHSTPVDMPSRGQNEDRDSGIAR ::::::::::::::::. :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|109 STNNLQDSFEYINQDPQAGKLNTNQNSLGPCRTGSNLAHSTPVDMPSRGQNEDRDSGIAR 290 300 310 320 330 340 270 280 290 300 310 320 KIAA14 SASLSSLLITPFPSPSSSTSSSSSYQRRWLRSQTTSLENGIIPRRSTDETFSLAEETCSS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::: gi|109 SASLSSLLITPFPSPSSSTSSSSSYQRRWLRSQTTSLENGIFPRRSTDETFSLAEETCSS 350 360 370 380 390 400 330 340 350 360 370 380 KIAA14 NPAMVRRKKIAISIIFSLCEKEEAQRNFQDFFFSHFPLFESHMNRLKSAIEKAMISCRKI ::..::::::::::::::::.: :::.::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|109 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.:::.::::::::::::::.::::::::::::::::::: gi|172 SSSSGSSSSGSSSSHGFGGSLQHAKQQLPKYQYTRPASDVSMLGEMMFGSVAMSYKGSTL 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 240 KIAA14 KIHYIRSPPQLMISKVFSARMGSFCGSTNNLQDSFEYINQDPNLGKLNTNQNSLGPCRTG ::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::. ::::::: .::: ::: gi|172 KIHYIRSPPQLMISKVFSATMGSFCGSTNNLQDSFEYINQDPQAGKLNTNQYNLGPFRTG 160 170 180 190 200 210 250 260 270 280 290 300 KIAA14 SNLAHSTPVDMPSRGQNEDRDSGIARSASLSSLLITPFPSPSSSTSSSSSYQRRWLRSQT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|172 SNLAHSTPVDMPSRGQNEDRDSGIARSASLSSLLITPFPSPSSSTSSSSSYQRRWLRSQT 220 230 240 250 260 270 310 320 330 340 350 360 KIAA14 TSLENGIIPRRSTDETFSLAEETCSSNPAMVRRKKIAISIIFSLCEKEEAQRNFQDFFFS :::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.: :::.::::::: gi|172 TSLENGIFPRRSTDETFSLAEETCSSNPAMVRRKKIAISIIFSLCEREAAQRDFQDFFFS 280 290 300 310 320 330 370 380 390 400 410 420 KIAA14 HFPLFESHMNRLKSAIEKAMISCRKIAESSLRVQFYVSRLMEALGEFRGTIWNLYSVPRI 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