# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hg02860b.fasta.huge -Q ../query/KIAA1441.ptfa ./tmplib.24314 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1441, 1258 aa vs ./tmplib.24314 library 1986247 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.4666+/-0.00949; mu= 4.5212+/- 0.641 mean_var=664.8735+/-159.723, 0's: 0 Z-trim: 17 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.049740 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1629 ( 1329 res) fh20517 (1329) 1729 140.4 1.9e-33 KIAA0211 ( 1317 res) ha02768 (1317) 641 62.3 6e-10 >>KIAA1629 ( 1329 res) fh20517 (1329 aa) initn: 2365 init1: 839 opt: 1729 Z-score: 692.4 bits: 140.4 E(): 1.9e-33 Smith-Waterman score: 2475; 36.450% identity (60.263% similar) in 1369 aa overlap (22-1252:31-1323) 10 20 30 40 50 KIAA14 ELSFPLLSLDFGAHQGLGSADMGDMKTPDFDDLLAAFDIPD-IDANEAIHS :::::::::::::::::::: .: . ::.: KIAA16 ECSRVTVTEHWSKVFPKGQGSQEHLLKLMTMGDMKTPDFDDLLAAFDIPDMVDPKAAIES 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 KIAA14 GPEENEGPGGPGKPEPGVGSESEDTAAASAGDGPGVPAQASDHGLPPPDISVVSVIVKNT : ...: :. : . : .:. .:: : .::. :.: KIAA16 GHDDHE---------------SHMKQNAHGEDDSHAPS-SSDVG-----VSVIVKNVRNI 70 80 90 120 130 140 150 160 KIAA14 VCPEQSEALAGGSAGDGAQ-----AAGVTKEGPVGPHRMQNGFGSPEPSLPGTPHSPAPP : .: . . .:.: . :... . . : . ... . : .: . : : KIAA16 DSSEGGEKDGHNPTGNGLHNGFLTASSLDSYSKDGAKSLKGDVPASEVTLKDSTFSQFSP 100 110 120 130 140 150 170 180 190 200 210 KIAA14 SGGTWK---EKGMEGKTP---LDLFAHF------GPEPGDHSDPLPP-SAPSPTREGALT ... . .. .: : :. . : : : . : : .. . .. : : KIAA16 ISSAEEFDDDEKIEVDDPPDKEDMRSSFRSNVLTGSAPQQDYDKLKALGGENSSKTGLST 160 170 180 190 200 210 220 230 240 KIAA14 PPPFPSSFELAQE------NGPGMQP----------PVSSPPL-------GALKQESCSP .. . .: : ..: :: . : :..:. . KIAA16 SGNVEKNKAVKRETEASSINLSVYEPFKVRKAEDKLKESSDKVLENRVLDGKLSSEKNDT 220 230 240 250 260 270 250 260 270 280 290 KIAA14 HHPQVLAQQGSGSSPKATDIPASAS-----------PPPVAGVPFFKQSPG--HQSPLAS :.: .. ..:: .. : : :. :::. . : ..:: :. KIAA16 SLPSVAPSKTKSSSKLSSCIAAIAALSAKKAASDSCKEPVANSRESSPLPKEVNDSPRAA 280 290 300 310 320 330 300 310 320 330 340 350 KIAA14 PKVPVCQPLKEEDDDEGPVDKSSPGSPQSPSSGAEAADEDSNDSPASSSSRPLKVRIKTI : : : : : . : :. : ::.: :: : ... : .:::.:. ::::::: KIAA16 DKSPESQNLI--DGTKKPSLKQ-PDSPRSISS--ENSSKGSPSSPAGSTPAIPKVRIKTI 340 350 360 370 380 390 360 370 380 KIAA14 KTSCGNITRTVTQV-----------PSD---------------P-------DPP-APLAE ::: :.: ::::.: ::. : .:: ::: KIAA16 KTSSGEIKRTVTRVLPEVDLDSGKKPSEQTASVMASVTSLLSSPASAAVLSSPPRAPLQS 400 410 420 430 440 450 390 400 410 420 KIAA14 GAFLAEASLLKLSP--------AT---PTSE----GPKVVSVQLGDGTRLKGTVLPVATI .. .: .:.: :: :.: : .:....:...: .:.::. .:.. KIAA16 AVVTNAVSPAELTPKQVTIKPVATAFLPVSAVKTAGSQVINLKLANNTTVKATVISAASV 460 470 480 490 500 510 430 440 450 460 470 480 KIAA14 QNASTAMLMAAS-VARKAVVLPGGTATSPKMIAKNV----LGLVPQ-ALPKADGRAGLGT :.::.:.. ::. . ...::.:... .. :.. :.: :.:.:: : .. : : KIAA16 QSASSAIIKAANAIQQQTVVVPASSLANAKLVPKTVHLANLNLLPQGAQATSELRQVLTK 520 530 540 550 560 570 490 500 510 520 530 KIAA14 GGQKVNGASV--VMVQPSKTATGPSTGGGTVISRTQSSLVEAFNKILNSKNLLPAYRPNL :... : . . :: : .. . :.: :::.::::::.:.: : .:.: ::: KIAA16 PQQQIKQAIINAAASQPPKKVSRVQ-----VVSSLQSSVVEAFNKVLSSVNPVPVYIPNL 580 590 600 610 620 540 550 560 570 580 590 KIAA14 SPPAEAGLALPPTGYRCLECGDAFSLEKSLARHYDRRSMRIEVTCNHCARRLVFFNKCSL ::::.::..:: ::.::::::.:.:::::..::::::.:::::::::.. :::.::::: KIAA16 SPPANAGITLPTRGYKCLECGDSFALEKSLTQHYDRRSVRIEVTCNHCTKNLVFYNKCSL 630 640 650 660 670 680 600 610 620 630 640 650 KIAA14 LLHAREHKDKGLVMQCSHLVMRPVALDQMVGQPDI---TPLLPVAVPPVSGPLALPALGK : ::: ::.::.:::::::...:: :::. .:. : . : .: .. . . 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KIAA16 HPGIKIGEPKIIYKCSMCDTVFTLQTLLYRHFDQHIENQKVSVFKCPDCSLLYAQKQLMM 930 940 950 960 970 980 900 910 920 930 940 950 KIAA14 EHLKNTHQSGRLEETAGKGAGGALLTPKTEPEELAVSQGGAAPATEESSSSSEEEEVPSS .:.:. : : :. : : : . .: ..:..: :...: . .:.. . KIAA16 DHIKSMH--GTLKSIEGPPNLGINLPLSIKP----ATQNSANQNKEDTKSMNGKEKLEK- 990 1000 1010 1020 1030 960 970 980 990 1000 1010 KIAA14 PEPPRPAKRPRRELGSKGLKGGGGGPGGWTCGLCHSWFPERDEYVAHMKKEHGKSVKKFP . : :.:. . .: . ..:: ::: : : .:: :..:..:::::..:: : KIAA16 -KSPSPVKK---SMETKKV----ASPG-WTCWECDCLFMQRDVYISHVRKEHGKQMKKHP 1040 1050 1060 1070 1080 1020 1030 1040 1050 1060 1070 KIAA14 CRLCERSFCSAPSLRRHVRVNHEGIKRVYPCRYCTEGKRTFSSRLILEKHVQVRHGLQLG :: :..:: :. :: :: :..:.::..:: : .: ...:::..::.::::::. ::.. KIAA16 CRQCDKSFSSSHSLCRHNRIKHKGIRKVYACSHCPDSRRTFTKRLMLEKHVQLMHGIKDP 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1080 1090 1100 1110 1120 1130 KIAA14 AQSPGRGTTLARGSSAR--AQGPGRKRRQSSDSCSEEPDSTTPPAKSPRGGPGSGGHGPL . .: . . . .. :. ::. ::: : :::. . :: KIAA16 DLKEMTDATNEEETEIKEDTKVPSPKRKL------EEPVLEFRP---PRGAITQ----PL 1150 1160 1170 1180 1190 1140 1150 1160 1170 KIAA14 R------YRSSS------STEQSLMMGLRVE----DGAQ-QCLDCGLCFASPGSLSRHRF . .. . .::. :.. .. ::.. :: .::::..: ::::: : KIAA16 KKLKINVFKVHKCAVCGFTTENLLQFHEHIPQHKSDGSSYQCRECGLCYTSHVSLSRHLF 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1180 1190 1200 1210 1220 1230 KIAA14 ISHKKRRGVGKASALGLG-DGEEEAPPSRSD--PDGGDSPLPASGGPLTCKVCGKSCDSP : :: .. .. : : :...: ::. : :::. : ::::.:. .. KIAA16 IVHKLKEPQPVSKQNGAGEDNQQENKPSHEDESPDGAVSDRK-------CKVCAKTFETE 1260 1270 1280 1290 1300 1240 1250 KIAA14 LNLKTHFRTHGMAFIRARQGAVGDN :.::.::::::::.... KIAA16 AALNTHMRTHGMAFIKSKRMSSAEK 1310 1320 >>KIAA0211 ( 1317 res) ha02768 (1317 aa) initn: 2075 init1: 519 opt: 641 Z-score: 270.5 bits: 62.3 E(): 6e-10 Smith-Waterman score: 2174; 35.965% identity (59.171% similar) in 1254 aa overlap (22-1182:51-1229) 10 20 30 40 KIAA14 ELSFPLLSLDFGAHQGLGSADMGDMKTPDFDDLLAAFDIPD---IDANEAI :::::::::::::::::::: .::.::: KIAA02 YGDRGRGGSKAERGGPYLPRIPVSPCQHPAMGDMKTPDFDDLLAAFDIPDPTSLDAKEAI 30 40 50 60 70 80 50 60 70 80 90 100 KIAA14 HSGPEENEGPGGPGKPEPGVGSESEDTAAASAGDGPGVPAQASDHGLPPPDISVVSVIVK .. ::::.: : ::. .:... . .:..: ::: :::::: KIAA02 QTPSEENESPLKP----PGI-CMDESVSLSHSGSAPDVPA--------------VSVIVK 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 KIAA14 NTVCPEQSEALAGGSAGDGAQAAGVTKEGPVGPH---RMQNGF--GSPEPSLPGTPHSPA :: :. :: . . . . .. : :: .... : :. :.:: . : KIAA02 NTSRQESFEAEKDHITPSLLHNGFRGSDLPPDPHNCGKFDSTFMNGDSARSFPGKLEPPK 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 KIAA14 PPSGGTWKE-KGMEGKTPLDLFAH--FGPEPGDHSDP-LPP-----SAPSPTREGALTPP :... . . . : : . :: .: ::: .:: .. .:. : ::. KIAA02 SEPLPTFNQFSPISSPEPEDPIKDNGFGIKP-KHSDSYFPPPLGCGAVGGPVLE-ALAKF 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 KIAA14 PFPSSFELAQENGPGMQPPVSSP-PLGALK------QESCSPHH-PQVLAQQGSG----S : : :: . . . : : :::. . :.. ::. :.. : . : KIAA02 PVP---ELHMFDHFCKKEPKPEPLPLGSQQEHEQSGQNTVEPHKDPDATRFFGEALEFNS 240 250 260 270 280 290 270 280 290 300 KIAA14 SPK---------ATDIPASASPPPVAGV-PFFKQSPGHQSPLASPKVPVCQPLKEED--- :. : .. . .: :: . : .. . . :.. .. . .:: KIAA02 HPSNSIGESKGLARELGTCSSVPPRQRLKPAHSKLSSCVAALVALQAKRVASVTKEDQPG 300 310 320 330 340 350 310 320 330 340 KIAA14 ---DDEGPVDKSS------PGSPQSPSSGAEA---------------ADEDSNDSPASSS : ::. .:: : ::.:: : :: .: .:. ::. .. KIAA02 HTKDLSGPTKESSKGSPKMPKSPKSPRSPLEATRKSIKPSDSPRSICSDSSSKGSPSVAA 360 370 380 390 400 410 350 360 370 380 390 KIAA14 SRPL---KVRIKTIKTSCGNITRTVTQVPSDPDPPA--PLAE--GAFLAEASLLKLSPAT : : :::::::::: :.: ::::.. ::: :. :.. :. .::: . . KIAA02 SSPPAIPKVRIKTIKTSSGEIKRTVTRILPDPDDPSKSPVGSPLGSAIAEAPSEMPGDEV 420 430 440 450 460 470 400 410 420 430 440 450 KIAA14 PTSEGPKVVSVQLGD--GTRLKGTVLPVATIQNASTAMLMAASVARKAVVLPGG-TATSP :. : .... :. :.: :: . . ...: . . : . :. ::. :. . KIAA02 PVEEHFPEAGTNSGSPQGAR-KGDESMTKASDSSSPSCSSGPRVPKGAA--PGSQTGKKQ 480 490 500 510 520 530 460 470 480 490 500 510 KIAA14 KMIAKNVLGLVPQAL-PKADGRAGLGTGGQKVNGASVVMVQPSKTATGPSTGGGTV---- . : .. :.: : ::: :.:. ..: .:::. . . . :. .: KIAA02 QSTALQASTLAPANLLPKAVHLANLNLVPHSV-AASVTAKSSVQRRSQPQLTQMSVPLVH 540 550 560 570 580 590 520 530 540 550 560 KIAA14 -ISRTQSSLVEAFNKILNSKNLLPAYRPNLSPPAEAGLALPPTGYRCLECGDAFSLEKSL .... .::.:::.:.:.: .: : :::::::.. . .: .:: ::::::::.::::: KIAA02 QVKKAAPLIVEVFNKVLHSSNPVPLYAPNLSPPADSRIHVPASGYCCLECGDAFALEKSL 600 610 620 630 640 650 570 580 590 600 610 620 KIAA14 ARHYDRRSMRIEVTCNHCARRLVFFNKCSLLLHAREHKDKGLVMQCSHLVMRPVALDQMV ..:: :::..::: :. :.. :.:::::::: :::.::.::::::::.:...:.. ::: KIAA02 SQHYGRRSVHIEVLCTLCSKTLLFFNKCSLLRHARDHKSKGLVMQCSQLLVKPISADQMF 660 670 680 690 700 710 630 640 650 660 670 680 KIAA14 GQPDITPLLPVAVPPVSGPLALPALGKGEGAITSSAITTVAAEAPVLPLSTEPPAAPATS . .. :.: : :.: .: ..:: . :.::: .: . 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