# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hg02441b.fasta.nr -Q ../query/KIAA1440.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1440, 1377 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7827116 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2696+/-0.000186; mu= 15.0875+/- 0.010 mean_var=78.3919+/-15.200, 0's: 33 Z-trim: 34 B-trim: 26 in 1/65 Lambda= 0.144857 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|97052424|sp|Q8N201.2|INT1_HUMAN RecName: Full=I (2190) 9048 1901.6 0 gi|166214944|sp|Q6P4S8.2|INT1_MOUSE RecName: Full= (2195) 7924 1666.7 0 gi|194218769|ref|XP_001915173.1| PREDICTED: integr (2186) 7912 1664.2 0 gi|126334195|ref|XP_001367532.1| PREDICTED: simila (2192) 7521 1582.5 0 gi|37182087|gb|AAQ88846.1| HILV1821 [Homo sapiens] (1029) 6794 1430.3 0 gi|189517279|ref|XP_690622.3| PREDICTED: integrato (2194) 6190 1304.3 0 gi|51094692|gb|EAL23941.1| DKFZP586J0619 protein [ (2394) 5975 1259.4 0 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