# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk07206.fasta.huge -Q ../query/KIAA1437.ptfa ./tmplib.24314 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1437, 811 aa vs ./tmplib.24314 library 1986694 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.4416+/-0.00521; mu= 18.2924+/- 0.357 mean_var=96.8600+/-23.299, 0's: 0 Z-trim: 29 B-trim: 4 in 1/39 Lambda= 0.130317 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0231 ( 823 res) fk16230 ( 823) 3188 610.5 2.3e-175 KIAA0147 ( 1630 res) ha01022s1 (1630) 342 75.9 4e-14 KIAA0862 ( 584 res) hk06532 ( 584) 320 71.1 3.8e-13 KIAA1225 ( 1371 res) fh04221s1 (1371) 297 67.3 1.3e-11 KIAA1016 ( 793 res) hk03719s1 ( 793) 256 59.2 1.9e-09 KIAA0806 ( 1073 res) hk04165(revised) (1073) 254 59.1 3e-09 KIAA0644 ( 887 res) hj03618 ( 887) 223 53.1 1.5e-07 KIAA0416 ( 529 res) hh00236 ( 529) 219 52.0 1.9e-07 KIAA1194 ( 575 res) fg00908 ( 575) 219 52.1 2e-07 KIAA0918 ( 966 res) hk09360(revised) ( 966) 217 52.0 3.5e-07 KIAA0405 ( 706 res) hg01274 ( 706) 214 51.3 4.3e-07 KIAA0813 ( 1618 res) pf00581 (1618) 217 52.3 4.7e-07 KIAA0814 ( 1559 res) fh16048 (1559) 206 50.3 1.9e-06 KIAA1854 ( 572 res) fg02232 ( 572) 199 48.3 2.7e-06 KIAA0931 ( 1258 res) bf00159 (1258) 202 49.4 2.9e-06 KIAA0606 ( 1369 res) ph00195 (1369) 184 46.0 3.1e-05 KIAA1465 ( 785 res) fh13187 ( 785) 179 44.8 4.4e-05 KIAA1580 ( 640 res) fj04979 ( 640) 173 43.5 8.4e-05 KIAA1910 ( 760 res) fh21867 ( 760) 172 43.4 0.00011 KIAA0848 ( 988 res) hk05607 ( 988) 171 43.4 0.00014 KIAA0012 ( 789 res) ha00413 ( 789) 169 42.9 0.00016 KIAA1916 ( 542 res) hg01117 ( 542) 166 42.1 0.00019 KIAA1497 ( 730 res) hg01608 ( 730) 163 41.7 0.00034 KIAA1469 ( 662 res) fj01881 ( 662) 148 38.8 0.0022 KIAA1246 ( 832 res) hh00149a ( 832) 148 39.0 0.0026 KIAA1674 ( 538 res) fg03838 ( 538) 146 38.3 0.0026 KIAA0230 ( 1496 res) ha02538 (1496) 150 39.7 0.0028 KIAA1764 ( 1029 res) fj10485(revised) (1029) 144 38.3 0.0049 >>KIAA0231 ( 823 res) fk16230 (823 aa) initn: 3161 init1: 2464 opt: 3188 Z-score: 3240.4 bits: 610.5 E(): 2.3e-175 Smith-Waterman score: 3188; 59.029% identity (82.814% similar) in 803 aa overlap (2-803:21-816) 10 20 30 40 KIAA14 TMIPVTELRYFADTQPAYRILKPWWDVFTDYISIVMLMIAV :: .:::. .::.: .:.::::::::: ::...::..:: KIAA02 SILDLFNFFHCISVLLQGKVMITLTELKCLADAQSSYHILKPWWDVFWYYITLIMLLVAV 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 KIAA14 FGGTLQVTQDKMIC-LPCKWVTKDSCNDSFRGWAAPGPEPTYPNSTILPTPDTGPTGIKY ..:.::.::....: :::: . : . : . :.. : : : :. 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KIAA02 IPEEIQYLSNLQYFAVTNNNIEMLPDGLFQCKKLQCLLLGKNSLMNLSPHVGELSNLTHL 720 730 740 750 760 770 770 780 790 800 810 KIAA14 ELRGNRLECLPVELGECPLLKRSGLVVEEDLFNTLPPEVKERLWRADKEQA :: :: :: :: :: : :::. :.:::.:.:::: : ::: KIAA02 ELIGNYLETLPPELEGCQSLKRNCLIVEENLLNTLPLPVTERLQTCLDKC 780 790 800 810 820 >>KIAA0147 ( 1630 res) ha01022s1 (1630 aa) initn: 269 init1: 269 opt: 342 Z-score: 345.5 bits: 75.9 E(): 4e-14 Smith-Waterman score: 420; 30.588% identity (62.059% similar) in 340 aa overlap (462-799:27-354) 440 450 460 470 480 490 KIAA14 HLFMLSGIPDTVFDLVELEVLKLELIPDVTIPPSIAQLT-GLKELWLYHTAAKIEAPALA .: : . . .:.:: : . . : : KIAA01 MLKCIPLWRCNRHVESVDKRHCSLQAVPEEIYRYSRSLEELLLDANQLR-ELPKPF 10 20 30 40 50 500 510 520 530 540 550 KIAA14 FLRENLRALHIKFTDIKEIPLWIYSLKTLEELHLTGNLSAENNRYIVIDGLRELKRLKVL : ::: : .. ..:...: . .. : :: .. : : . .... : :.. KIAA01 FRLLNLRKLGLSDNEIQRLPPEVANFMQLVELDVSRNDIPE-----IPESIKFCKALEIA 60 70 80 90 100 110 560 570 580 590 600 KIAA14 RLKSN-LSKLPQVVTDVGVHLQKLSINNEGTKLIVLNSLKKMANLTELELIRCDLERIPH ...: ::.::. :.. : .:..:. . . . ... ..:::. ::: . :. .: KIAA01 DFSGNPLSRLPDGFTQLR-SLAHLALNDVSLQALP-GDVGNLANLVTLELRENLLKSLPA 120 130 140 150 160 610 620 630 640 650 660 KIAA14 SIFSLHNLQEIDLKDNNLKTIEEIISFQHLHRLTCLKLWYNHIAYIPIQIGNLTNLERLY :. : .:...:: :.:... . .. : : : : :... .: ..::: : : KIAA01 SLSFLVKLEQLDLGGNDLEVLPDTLG--ALPNLRELWLDRNQLSALPPELGNLRRLVCLD 170 180 190 200 210 220 670 680 690 700 710 720 KIAA14 LNRNKIEKIPTQLFYCRKLRYLDLSHNNLTFLPADIGLLQNLQNLAITANRIETLPPELF ...:..:..:..: : : ::.: : :: :: :..:. : . ::. . . KIAA01 VSENRLEELPAELGGLVLLTDLLLSQNLLRRLPDGIGQLKQLSILKVDQNRLCEVTEAIG 230 240 250 260 270 280 730 740 750 760 770 780 KIAA14 QCRKLRALHLGNNVLQSLPSRVGELTNLTQIELRGNRLECLPVELGECPLLKRSGLVVEE .:..: : : .:.:..:: .:.::.::.... :.:: :: :.: : : : : ... 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KIAA01 NRLAVLPPELAHTTELHVLDVAGNRLQSLPFALTHLNLKALWLAENQAQPMLRFQTEDDA 350 360 370 380 390 400 >>KIAA0862 ( 584 res) hk06532 (584 aa) initn: 1104 init1: 301 opt: 320 Z-score: 327.8 bits: 71.1 E(): 3.8e-13 Smith-Waterman score: 466; 28.908% identity (60.385% similar) in 467 aa overlap (356-799:104-562) 330 340 350 360 370 380 KIAA14 YISLVIFYGLICMYTLWWMLRRSLKKYSFESIREESSYSDIPDVKNDFAFMLHLIDQYDP :.: . : .: . ... . .: . : KIAA08 IKRPNPAPGTRKKSSNAEVIKELNKCREENSMRLDLSKRSIHILPSSIKELTQLTELY-- 80 90 100 110 120 130 390 400 410 420 430 440 KIAA14 LYSKRFAVFLSEVSE-NKLRQLNLNNEWTLDKLRQRLTKNAQDK-LELHLFMLSGIPDTV :::... . .::. .: : :. : .: .: . : . . . :.:. : ::..: KIAA08 LYSNKLQSLPAEVGCLVNLMTLALS-ENSLTSLPDSLDNLKKLRMLDLRHNKLREIPSVV 140 150 160 170 180 190 450 460 470 480 490 500 KIAA14 FDLVELEVLKLELIPDVTIPPSIAQLTGLKELWLYHTAAKIEAPALAFLRENLRALHIKF . : : .: :.. .:. .: .:. :. : . .. : . :: :: .: . KIAA08 YRLDSLTTLYLRFNRITTVEKDIKNLSKLSMLSIRENKIK-QLPAEIGELCNLITLDVAH 200 210 220 230 240 510 520 530 540 KIAA14 TDIKEIPLWIYSLKTLEELHLT-----------GNLSAENN---RYIVIDGL-RELKR-- ......: : . . .: : ::::. . :: .... : : . KIAA08 NQLEHLPKEIGNCTQITNLDLQHNELLDLPDTIGNLSSLSRLGLRYNRLSAIPRSLAKCS 250 260 270 280 290 300 550 560 570 580 590 600 KIAA14 -LKVLRLKSN-LSKLPQVVTDVGVHLQKLSINNEGTKLIVLNSLKKMANLTELELIRCDL :. : :..: .: ::. . . :.:..:.. . .: ... ...... :.. . . KIAA08 ALEELNLENNNISTLPESLLSSLVKLNSLTLARNCFQLYPVGGPSQFSTIYSLNMEHNRI 310 320 330 340 350 360 610 620 630 640 650 660 KIAA14 ERIPHSIFSLHN-LQEIDLKDNNLKTIEEIISFQHLHRLTCLKLWYNHIAYIPIQIGNLT ..:: .::: . :.....:::.: .. ..: .. :.: :... :: ....:. KIAA08 NKIPFGIFSRAKVLSKLNMKDNQLTSLP--LDFGTWTSMVELNLATNQLTKIPEDVSGLV 370 380 390 400 410 420 670 680 690 700 710 720 KIAA14 NLERLYLNRNKIEKIPTQLFYCRKLRYLDLSHNNLTFLPADIGLLQNLQNLAITANRIET .:: : :. : ..:.: : :::: ::: .:.: :: .:. :..::.:..: :.. : KIAA08 SLEVLILSNNLLKKLPHGLGNLRKLRELDLEENKLESLPNEIAYLKDLQKLVLTNNQLTT 430 440 450 460 470 480 730 740 750 760 770 780 KIAA14 LPPELFQCRKLRALHLGNNVLQSLPSRVGELTNLTQIELRGN-RLECLPVELGECPLLKR :: . . .: : ::.:.: :: ..: : :: .. : : :. ::.::. : : KIAA08 LPRGIGHLTNLTHLGLGENLLTHLPEEIGTLENLEELYLNDNPNLHSLPLELALCS--KL 490 500 510 520 530 540 790 800 810 KIAA14 SGLVVEEDLFNTLPPEVKERLWRADKEQA : . .:. .. :::.. KIAA08 SIMSIENCPLSHLPPQIVAGGPSFIIQFLKMQGPYRAMV 550 560 570 580 >>KIAA1225 ( 1371 res) fh04221s1 (1371 aa) initn: 656 init1: 274 opt: 297 Z-score: 300.6 bits: 67.3 E(): 1.3e-11 Smith-Waterman score: 399; 28.117% identity (61.008% similar) in 377 aa overlap (427-801:49-412) 400 410 420 430 440 450 KIAA14 EVSENKLRQLNLNNEWTLDKLRQRLTKNAQDKLELHLFMLSGIPDTVFDLVELEVLKLEL ..: : .. .: .:. :. :.: KIAA12 GEEETVTTLDYSHCSLEQVPKEIFTFEKTLEELYLDANQIEELPKQLFNCQSLHKLSLPD 20 30 40 50 60 70 460 470 480 490 500 510 KIAA14 IPDVTIPPSIAQLTGLKELWLYHTAAKIEAPALAFLRENLRALHIKFTDIKEIPLWIYSL .:.: :::.: .:.:: . ... . : : . : .. . . :...: . .: KIAA12 NDLTTLPASIANLINLRELDVSKNGIQ-EFPENIKNCKVLTIVEASVNPISKLPDGFSQL 80 90 100 110 120 130 520 530 540 550 560 570 KIAA14 KTLEELHLTGNLSAENNRYIVIDGLRELKRLKVLRLKSN-LSKLPQVVTDVGVHLQKLSI .: .:.:. . ... . : : .:..:.:. : :. ::.... . ..:..:.. KIAA12 LNLTQLYLNDAFL----EFLPANFGR-LTKLQILELRENQLKMLPKTMNRL-TQLERLDL 140 150 160 170 180 190 580 590 600 610 620 630 KIAA14 -NNEGTKLIVLNSLKKMANLTELELIRCDLERIPHSIFSLHNLQEIDLKDNNLKTIEEII .:: :. : . :.....: :. . : :: : ::..: .:.. ::.. .:: : KIAA12 GSNEFTE--VPEVLEQLSGLKEFWMDANRLTFIPGFIGSLKQLTYLDVSKNNIEMVEEGI 200 210 220 230 240 640 650 660 670 680 690 KIAA14 SFQHLHRLTCLKLWYNHIAYIPIQIGNLTNLERLYLNRNKIEKIPTQLFYCRKLRYLDLS : . : : : : . .: ::.: :. : ...:.. .: .. ... :: : KIAA12 ST--CENLQDLLLSSNSLQQLPETIGSLKNITTLKIDENQLMYLPDSIGGLISVEELDCS 250 260 270 280 290 300 700 710 720 730 740 750 KIAA14 HNNLTFLPADIGLLQNLQNLAITANRIETLPPELFQCRKLRALHLGNNVLQSLPSRVGEL :.. ::..:: : ::...: : .. ::::. . ... .: : .: :..:: ..:.. KIAA12 FNEVEALPSSIGQLTNLRTFAADHNYLQQLPPEIGSWKNITVLFLHSNKLETLPEEMGDM 310 320 330 340 350 360 760 770 780 790 800 810 KIAA14 TNLTQIELRGNRLECLPVELGECPLLKRSGLVVEEDLFNTLPPEVKERLWRADKEQA .: :.: :::. :: . . : . ... . .. . : : :: KIAA12 QKLKVINLSDNRLKNLPFSFTK--LQQLTAMWLSDNQSKPLIPLQKETDSETQKMVLTNY 370 380 390 400 410 420 KIAA12 MFPQQPRTEDVMFISDNESFNPSLWEEQRKQRAQVAFECDEDKDEREAPPREGNLKRYPT 430 440 450 460 470 480 >>KIAA1016 ( 793 res) hk03719s1 (793 aa) initn: 395 init1: 139 opt: 256 Z-score: 261.4 bits: 59.2 E(): 1.9e-09 Smith-Waterman score: 277; 30.415% identity (61.751% similar) in 217 aa overlap (587-799:131-340) 560 570 580 590 600 610 KIAA14 SKLPQVVTDVGVHLQKLSINNEGTKLIVLNSLKKMANLTELELIRCDLERIPHSIFSLHN .:.. :: :.: :...:.. :. KIAA10 HGGTGAPGGAGGGGGGSGGFNLPLNRGLERALEEAANSGGLNLSARKLKEFPRTAAPGHD 110 120 130 140 150 160 620 630 640 650 660 670 KIAA14 LQEI---DLKDNNLKTIEEIISFQHLHRLTCLKLWYNHIAYIPIQIGNLTNLERLYLNRN :.. ::. : : .: . . :. : :.:..: : :: : :: : : :.:: KIAA10 LSDTVQADLSKNRL--VEVPMELCHFVSLEILNLYHNCIRVIPEAIVNLQMLTYLNLSRN 170 180 190 200 210 680 690 700 710 720 730 KIAA14 KIEKIPTQLFYCR-KLRYLDLSHNNLTFLPADIGLLQNLQNLAITANRIETLPPELFQCR .. .:. : : :. : :.:.: :: .:: :..:..: .. :.: .:: .. : . KIAA10 QLSALPACL--CGLPLKVLIASNNKLGSLPEEIGQLKQLMELDVSCNEITALPQQIGQLK 220 230 240 250 260 270 740 750 760 770 780 790 KIAA14 KLRALHLGNNVLQSLPSRVGELTNLTQIELRGNRLECLPVELGECPLLKRSGLVVEEDLF .:: :.. : :. ::... .: :..... :.. .:. . : :. :..:.. . KIAA10 SLRELNVRRNYLKVLPQELVDLP-LVKFDFSCNKVLVIPICFREMKQLQV--LLLENNPL 280 290 300 310 320 330 800 810 KIAA14 NTLPPEVKERLWRADKEQA .. : .. KIAA10 QSPPAQICTKGKVHIFKYLSIQACQIKTADSLYLHTMERPHLHQHVEDGKKDSDSGVGSD 340 350 360 370 380 390 >>KIAA0806 ( 1073 res) hk04165(revised) (1073 aa) initn: 75 init1: 75 opt: 254 Z-score: 258.0 bits: 59.1 E(): 3e-09 Smith-Waterman score: 264; 25.581% identity (54.942% similar) in 344 aa overlap (464-770:72-409) 440 450 460 470 480 490 KIAA14 FMLSGIPDTVFDLVELEVLKLELIPDVTIPPSIAQLTGL---KELWLYHTAAKIEAPALA :: :.:: : . .. .. KIAA08 LLPAAGAGLCPAPCSCRIPLLDCSRRKLPAPSWRALSGLLPPDTAILDFSHNRLSNWNIS 50 60 70 80 90 100 500 510 520 530 540 550 KIAA14 FLRENLRALHIKFTDIKEIPLWIYSLKTLEELHLTGNLSAENNRYIVIDGLRELKRLKVL . ..:. ........ ::: . ... : :. :. : : ..:. :. : KIAA08 LESQTLQEVKMNYNELTEIPYFGEPTSNITLLSLVHNIIPEIN----AQALQFYPALESL 110 120 130 140 150 560 570 580 590 600 KIAA14 RLKSNLSKLPQVVTDVGVHLQKLSINNEGTKLIVLNSLKKMAN-LTELELIRCDLERIPH :.::. . .. . ..:. :...:. . . . .... : ..: : . :: KIAA08 DLSSNIISEIKTSSFPRMQLKYLNLSNNRITTLEAGCFDNLSSSLLVVKLNRNRMSMIPP 160 170 180 190 200 210 610 620 630 640 650 KIAA14 SIFSLHNLQEIDLKDNNLKTIEEIISFQHLHRLTCLKLWYNHIAYIP------------- .::.: .:: ..:: : .: .: . .:: : : ::. : :. . KIAA08 KIFKLPHLQFLELKRNRIKIVEGL-TFQGLDSLRSLKMQRNGISKLKDGAFFGLNNMEEL 220 230 240 250 260 270 660 670 680 690 700 KIAA14 -IQIGNLTN-----------LERLYLNRNKIEKI-PTQLFYCRKLRYLDLSHNNLTFLP- .. .::: :..::...: ::.: : .:..: ::::.:.:: : KIAA08 ELEHNNLTRVNKGWLYGLRMLQQLYVSQNAIERISPDAWEFCQRLSELDLSYNQLTRLDE 280 290 300 310 320 330 710 720 730 740 750 KIAA14 -ADIGLLQNLQNLAITANRIETLPPELFQC-RKLRALHLGNN----VLQSLPSRVGELTN : .:: . :. : . ::. . .:. .:..: : :: .... . ::. KIAA08 SAFVGL-SLLERLNLGDNRVTHIADGVFRFLSNLQTLDLRNNEISWAIEDASEAFAGLTS 340 350 360 370 380 390 760 770 780 790 800 810 KIAA14 LTQIELRGNRLECLPVELGECPLLKRSGLVVEEDLFNTLPPEVKERLWRADKEQA ::.. :.::... . KIAA08 LTKLILQGNQIKSITKKAFIGLESLEHLDLNNNAIMSIQENAFSQTHLKELILNTSSLLC 400 410 420 430 440 450 >>KIAA0644 ( 887 res) hj03618 (887 aa) initn: 103 init1: 71 opt: 223 Z-score: 227.4 bits: 53.1 E(): 1.5e-07 Smith-Waterman score: 232; 25.312% identity (57.812% similar) in 320 aa overlap (462-769:124-439) 440 450 460 470 480 KIAA14 HLFMLSGIPDTVFDLVELEVLKLELIPDVTIPPSIAQLTGLKELWLYHTAAKI--EAPAL . :. ..: . ... : .... . :. KIAA06 ALPPLAEPVCPERCDCQHPQHLLCTNRGLRVVPKTSSLPSPHDVLTYSLGGNFITNITAF 100 110 120 130 140 150 490 500 510 520 530 540 KIAA14 AFLREN-LRALHIKFTDIKEI-PLWIYSLKTLEELHLTGNLSAENNRYIVIDGLRELKRL : : . :: : .....:. . : . .:. ::::.: .:: . .. : :..: KIAA06 DFHRLGQLRRLDLQYNQIRSLHPKTFEKLSRLEELYLGNNLL----QALAPGTLAPLRKL 160 170 180 190 200 550 560 570 580 590 600 KIAA14 KVLRLKSN-LSKLPQVVTDVGVHLQKLSINNEGTKLIVLNSLKKMANLTELELIRCDLER ..: ..: .:.: . . : :: ..... . . ..:: :.: .. 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KIAA06 RLGLLSLRGNQLTHLAPEAFWGLEALRELRLEGNRLSQLPTALLEPLHSLEALDLSGNEL 330 340 350 360 370 380 730 740 750 760 770 KIAA14 ETLPPELF-QCRKLRALHLGNNVLQSLPSRVGELT-NLTQIELRGNRLECLPVELGECPL .: : : . .:: : : ::.:..: . . . : ...: :: : KIAA06 SALHPATFGHLGRLRELSLRNNALSALSGDIFAASPALYRLDLDGNGWTCDCRLRGLKRW 390 400 410 420 430 440 780 790 800 810 KIAA14 LKRSGLVVEEDLFNTLPPEVKERLWRADKEQA KIAA06 MGDWHSQGRLLTVFVQCRHPPALRGKYLDYLDDQQLQNGSCADPSPSASLTADRRRQPLP 450 460 470 480 490 500 >>KIAA0416 ( 529 res) hh00236 (529 aa) initn: 194 init1: 75 opt: 219 Z-score: 225.6 bits: 52.0 E(): 1.9e-07 Smith-Waterman score: 219; 35.099% identity (64.901% similar) in 151 aa overlap (645-790:79-228) 620 630 640 650 660 670 KIAA14 HNLQEIDLKDNNLKTIEEIISFQHLHRLTCLKLWYNHIAYIPI-QIGNLTNLERLYLNRN :.: .:::. . :......: :.:..: KIAA04 PKCRCEKLLFYCDSQGFHSVPNATDKGSLGLSLRHNHITELERDQFASFSQLTWLHLDHN 50 60 70 80 90 100 680 690 700 710 720 730 KIAA14 KIEKIPTQLFY-CRKLRYLDLSHNNLTFLP-ADIGLLQNLQNLAITANRIETLPPELFQ- .: . . : ::. : :: :.. .:: . . : ::::: .. :.. .: :::: KIAA04 QISTVKEDAFQGLYKLKELILSSNKIFYLPNTTFTQLINLQNLDLSFNQLSSLHPELFYG 110 120 130 140 150 160 740 750 760 770 780 KIAA14 CRKLRALHLGNNVLQSLPSRV-GELTNLTQIELRGNRLECLPVELGECPLLKRSGLVVEE :::..::: .: :...: :. . .: ..: :::. : .. : :.: : .:. 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