# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fh02979s1.fasta.huge -Q ../query/KIAA1428.ptfa ./tmplib.24314 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1428, 709 aa vs ./tmplib.24314 library 1986796 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1584+/-0.00621; mu= 4.4550+/- 0.421 mean_var=157.3009+/-37.370, 0's: 0 Z-trim: 6 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.102261 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1716 ( 804 res) hj06603 ( 804) 386 69.2 1.7e-12 KIAA0041 ( 781 res) ha00469s1 ( 781) 351 64.0 6.1e-11 KIAA0400 ( 1022 res) hg01091 (1022) 216 44.2 7.4e-05 KIAA0050 ( 796 res) ha01557 ( 796) 192 40.6 0.00071 KIAA1249 ( 949 res) hh04184 ( 949) 172 37.7 0.0063 >>KIAA1716 ( 804 res) hj06603 (804 aa) initn: 210 init1: 118 opt: 386 Z-score: 316.0 bits: 69.2 E(): 1.7e-12 Smith-Waterman score: 386; 24.091% identity (58.409% similar) in 440 aa overlap (20-447:19-440) 10 20 30 40 50 60 KIAA14 MPGIDKLPIEETLEDSPQTRSLLGVFEEDATAISNYMNQLYQAMHRIYDAQNELSAATHL :. . : :.. : ...: . . .: . ....: KIAA17 SPEGAEAAGDPSQPRSCFRATIDEVETDVVEIEAKLDKLVKLCSGMVEAGKAYVSTSRL 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 KIAA14 TSKLLKEYEKQRFPLGGDDEVMSSTLQQFSKVIDELSSCHAVLSTQLADAMMFPITQFKE . ... .: :: :.: ::.:. ..:. . : .: : .. . .: . KIAA17 FVSGVRDLSQQ---CQGDT-VISECLQRFADSLQEVVNYHMILFDQAQRSVRQQLQSFVK 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 KIAA14 RDLKEILTLKEVFQIASNDHDAAINRYSRLSKKRENDKVKYEVTEDVYTSRKKQHQTMMH .:.... :. :. . .: . .. : .. ..: .. :. :.: . .:: .. . KIAA17 EDVRKFKETKKQFDKVREDLELSLVRNAQAPRHRPHE-VE-EATGALTLTRKCFRHLALD 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 KIAA14 YFCALNTLQYKKKIALLEPLLGYMQAQISFFKMGSENLNEQLEEFLANIGTSVQNVRREM : .:.:: :::. .:. .:..:.:: :::..: .: .::. .. .... .... . KIAA17 YVLQINVLQAKKKFEILDSMLSFMHAQSSFFQQGY-SLLHQLDPYMKKLAAELDQLV--I 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 KIAA14 DSDIETMQQTIEDLEVASDPL---YVPDPDPTKFPVNR-NLTRKAGYLNARNKTGLVSST :: .: .. . . . : . : . ..: :. . . ::: : .... .: KIAA17 DSAVEKREMERKHAAIQQRTLLQDFSYDESKVEFDVDAPSGVVMEGYLFKRASNAF--KT 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 KIAA14 WDRQFYFTQGGNLMSQAR-GDVAGGLAMDIDNCSVMAVDCED--RRYCFQITSFDGKKSS :.:... :...:. : . :. .. :. ::: ::: ::.::.. : :: KIAA17 WNRRWFSIQNSQLVYQKKLKDALTVVVDDLRLCSVK--PCEDIERRFCFEVLS--PTKSC 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 KIAA14 ILQAESKKDHEEWICTINNISKQIYLSENPEET-AARVNQSALEAVTPSPSFQQRHESLR .:::.:.: .. :. ... . : :.:. . :....: ... : . .: : KIAA17 MLQADSEKLRQAWVQAVQASIASAY-RESPDSCYSERLDRTASPSTSSIDSATDTRE--R 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 KIAA14 PAAGQS---RPPT-ARTSSSGSLGSESTNLAALSLDSLVAPDTPIQFDIISPVCEDQPGQ . :.: : . : .:. :. :. . :...: :. 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KIAA04 FQDGLKAV-ESLKPSIETLSTDLHTIKQAQD---EERRQLIQLRDILKSALQVEQKEDSQ 250 260 270 280 290 300 280 290 300 310 320 KIAA14 F--PVNRNLTRKAG---YLNARN-----KTGLVSSTWDRQFYFTQGGNLMSQARGDVAGG . . .: . : . . :: :. . ..:... ...: ... ..: . KIAA04 IRQSTAYSLHQPQGNKEHGTERNGSLYKKSDGIRKVWQKRKCSVKNG-FLTISHGTANRP 310 320 330 340 350 360 330 340 350 360 370 KIAA14 LA-MDIDNCSVMAVDCEDRRYCFQITSFDGKKSSILQAESKKDHEEWICTINNISKQIYL : ... .:.: .. :... ::.. : : .. .:::.... . :. ...: ::. 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KIAA00 EELS-RLSQYRKELGAQLHQLVLNSARE-KRDMEQRHVLLKQKELGGEE---PEPSLREG 270 280 290 300 310 280 290 300 310 320 330 KIAA14 PVNRNLTRKAGYLNARNKTGLVSSTWDRQFYFTQGGNLMSQAR-GDVAGGLAMDIDNCSV : . . :.: : .... .::.:... :...:. : . : . .. :. :.: KIAA00 PGGLVM---EGHLFKRASNAF--KTWSRRWFTIQSNQLVYQKKYKDPVTVVVDDLRLCTV 320 330 340 350 360 370 340 350 360 370 380 390 KIAA14 MAVDCEDRRYCFQITSFDGKKSSILQAESKKDHEEWICTINNISKQIYLSENPEETAARV .::.::...: .:: .:::.:.. . :. .... :. 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