# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/ha06448.fasta.huge -Q ../query/KIAA1424.ptfa ./tmplib.24314 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1424, 1944 aa vs ./tmplib.24314 library 1985561 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.2110+/-0.00812; mu= -2.2645+/- 0.548 mean_var=267.2410+/-63.905, 0's: 0 Z-trim: 23 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.078455 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 42, opt: 30, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1501 ( 735 res) hh12863 ( 735) 1339 166.2 2.7e-41 KIAA1304 ( 1051 res) fh04032 (1051) 414 61.7 1.1e-09 KIAA0411 ( 1061 res) hg02120 (1061) 382 58.0 1.4e-08 KIAA1722 ( 1499 res) pf00674s1 (1499) 385 58.5 1.4e-08 KIAA0672 ( 824 res) hk02382 ( 824) 366 56.1 4.1e-08 KIAA0621 ( 753 res) hg04539 ( 753) 358 55.2 7.3e-08 KIAA0456 ( 1095 res) hg00633 (1095) 348 54.2 2.1e-07 KIAA1478 ( 570 res) fj05212 ( 570) 339 52.9 2.6e-07 KIAA1204 ( 1445 res) fg03451 (1445) 341 53.5 4.4e-07 KIAA0131 ( 942 res) ha01235 ( 942) 336 52.8 4.8e-07 KIAA0712 ( 1770 res) hg04169 (1770) 302 49.2 1.1e-05 KIAA0782 ( 1281 res) hk05405s1 (1281) 293 48.0 1.8e-05 KIAA1723 ( 1554 res) pf00881 (1554) 258 44.2 0.00031 KIAA0013 ( 1086 res) ha00450s1 (1086) 250 43.1 0.00045 KIAA0580 ( 1631 res) hj00601s1 (1631) 244 42.6 0.00097 KIAA0223 ( 1165 res) ha02995 (1165) 240 42.0 0.001 KIAA1314 ( 681 res) fh12718 ( 681) 235 41.2 0.0011 KIAA0189 ( 1132 res) ha02928 (1132) 219 39.6 0.0053 >>KIAA1501 ( 735 res) hh12863 (735 aa) initn: 1852 init1: 1050 opt: 1339 Z-score: 833.3 bits: 166.2 E(): 2.7e-41 Smith-Waterman score: 1918; 48.605% identity (71.512% similar) in 681 aa overlap (716-1367:75-726) 690 700 710 720 730 740 KIAA14 AGTSDLELPVSQRNQDLSLQEAETEQSDTLDNKEAVILREKPPSGRQTP-QPLRHQSYIL : . :.::.:::.::.. : :... : KIAA15 SPASFPPEASEPPRVVRPEPSTRALEPPAEDRGDEVVLRQKPPTGRKVQLTPARQMN--L 50 60 70 80 90 100 750 760 770 780 790 800 KIAA14 AVNDQETGSDTTCWLPNDARREVHIKRMEERKASSTSPPGDSLASIPFIDEPTSPSIDHD . .:. ... .: : :. ::.. . :::::::::::::::::: . 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KIAA15 ERWQDLNVISSLLKSFFRKLPEPLFTDDKYNDFIEANRIEDARERMRTLRKLIRDLPGHY 560 570 580 590 600 610 1260 1270 1280 1290 1300 1310 KIAA14 YETLKFLSAHLKTVAENSEKNKMEPRNLAIVFGPTLVRTSEDNMTHMVTHMPDQYKIVET ::::::: .::::.:..::::::::::::.::::::::::::::: :::::::.:::::: KIAA15 YETLKFLVGHLKTIADHSEKNKMEPRNLALVFGPTLVRTSEDNMTDMVTHMPDRYKIVET 620 630 640 650 660 670 1320 1330 1340 1350 1360 1370 KIAA14 LIQHHDWFFTEEGAEEPLTTVQEESTVDSQPVPNIDHLLTNIGRTGVSPGDVSDSATSDS :::: ::::..: . : : .. . : ::::..:: ::::: : ::: KIAA15 LIQHSDWFFSDEEDKGERTPVGDK---EPQAVPNIEYLLPNIGRT-VPPGDPGSADLLEI 680 690 700 710 720 730 1380 1390 1400 1410 1420 1430 KIAA14 TKSKGSWGSGKDQYSRELLVSSIFAAASRKRKKPKEKAQPSSSEDELDNVFFKKENVEQC >>KIAA1304 ( 1051 res) fh04032 (1051 aa) initn: 331 init1: 201 opt: 414 Z-score: 265.4 bits: 61.7 E(): 1.1e-09 Smith-Waterman score: 418; 22.857% identity (53.835% similar) in 665 aa overlap (1003-1636:343-985) 980 990 1000 1010 1020 1030 KIAA14 QPISVNACLIDISYSETKRKNVFRLTTSDCECLFQAEDRDDMLAWIKTIQESSNLNEEDT : ... .. .. :: .: .: . . : : KIAA13 AAFCPPMKFEFQSHMGDEVCQVSAQQPVQAELMLRYQQLQSRLATLKIENEEVKKTTEAT 320 330 340 350 360 370 1040 1050 1060 1070 1080 1090 KIAA14 GVTNRDLISRRIKEYNNLMSKAEQLPKTPRQSLS-IRQTLLGAKSEPKTQSPHSPKEESE : .:... :..:. .:. : .. .. : . .: : :.:. . .. ..:.: KIAA13 LQTIQDMVT--IEDYD--VSECFQHSRSTESVKSTVSETYL---SKPSIAKRRANQQETE 380 390 400 410 420 1100 1110 1120 1130 1140 KIAA14 RKLLSK-DDTSPPKDKGTWRKGIPSIMRKTFEKKPTA---TGTFGVRLDDCPPAHTNRYI . . : . .. : .. .....:. . : : . : : . ... : KIAA13 QFYFMKLREYLEGSNLITKLQAKHDLLQRTLGEGHRAEYMTTSRGRRNSHTRHQDSGQVI 430 440 450 460 470 480 1150 1160 1170 1180 1190 1200 KIAA14 PLIVDICCKLVEERGLEYTGIYRVPGNNAAISSMQEELNKGMADIDIQDDKWRDLNVISS ::::. : .... ::.. ::.:: :... ...... ...: . .:.. .:.: ... KIAA13 PLIVESCIRFINLYGLQHQGIFRVSGSQVEVNDIKNSFERGENPL-ADDQSNHDINSVAG 490 500 510 520 530 540 1210 1220 1230 1240 1250 1260 KIAA14 LLKSFFRKLPEPLFTNDKYADFIEANRKEDPLDRLKTLKRLIHDLPEHHYETLKFLSAHL .:: .:: : .::: .... :.: : .. .: ...:. ::. ....: : : KIAA13 VLKLYFRGLENPLFPKERFNDLISCIRIDNLYERALHIRKLLLTLPRSVLIVMRYLFAFL 550 560 570 580 590 600 1270 1280 1290 1300 1310 1320 KIAA14 KTVAENSEKNKMEPRNLAIVFGPTLVRTSEDNMTHMVTHMPDQYKIVETLIQHHDWFFTE . ... :..: :.: :::: :::::. . : . .:. . .:..:.: ::. .: . KIAA13 NHLSQYSDENMMDPYNLAICFGPTLMPVPE--IQDQVSCQAHVNEIIKTIIIHHETIFPD 610 620 630 640 650 660 1330 1340 1350 1360 1370 1380 KIAA14 EGAEEPLTTVQEESTV--DSQPVPNIDH-LLTNIGR-TGVSPGDVSDSATSDSTKSKGSW :.: : :. . : : .: : .. . .:. : : . .: .. KIAA13 --AKELDGPVYEKCMAGDDYCDSPYSEHGTLEEVDQDAGTEPHTSEDECEPIEAIAKFDY 670 680 690 700 710 720 1390 1400 1410 1420 1430 KIAA14 -GSGKDQYSRELLVSSI-FAAASRK----RKK------PKEKAQPSSSEDELDNVFFKKE : . . : . .: . . ::. :.. :.. .. .: ..... .: KIAA13 VGRSARELSFKKGASLLLYHRASEDWWEGRHNGIDGLVPHQYIVVQDMDDTFSDTLSQKA 730 740 750 760 770 780 1440 1450 1460 1470 1480 KIAA14 NVEQCHNDTKEE---SKKESETLGRKQKIIIAKENSTRKDPSTTKDEKISLGKESTPSEE . : . . :. :: . :. .:.. . . : .. :. : KIAA13 DSEASSGPVTEDKSSSKDMNSPTDRHPDGYLARQRKRGEPPPPVRRP----GRTSDGHCP 790 800 810 820 830 1490 1500 1510 1520 1530 1540 KIAA14 PSPPHNSKHNKSPTLSCRFAILKESPRSLLAQKS----SHLEETGSDSGTLLSTSSQASL ::: . :.: :. : ::.:: ... : .. :.: . : . :: KIAA13 LHPPH-ALSNSSVDLGS--PSLASHPRGLLQNRGLNNDSPERRRRPGHGSLTNISRHDSL 840 850 860 870 880 890 1550 1560 1570 1580 1590 1600 KIAA14 ARFS---MKKSTSPETKHSEFLANVSTITSDYSTTSSATYLTSLDSSRLSPEVQSVAESK ... ...::: ... : . . :. :.:. : : ::.:. KIAA13 KKIDSPPIRRSTSS-GQYTGFNDHKPLDPETIAQDIEETMNTALNELR-ELERQSTAKHA 900 910 920 930 940 950 1610 1620 1630 1640 1650 1660 KIAA14 GDEADDERSELISEGRPVETDSESEFPVFPTALTSERLFRGKLQEVTKSSRRNSEGSELS : . : .. . :. :..:: :. .:: : KIAA13 PDVVLDTLEQVKNSPTPA-TSTESLSPLHNVALRSSEPQIRRSTSSSSDTMSTFKPMVAP 960 970 980 990 1000 1010 1670 1680 1690 1700 1710 1720 KIAA14 CTEGSLTSSLDSRRQLFSSHKLIECDTLSRKKSARFKSDSGSLGDAKNEKEAPSLTKVFD KIAA13 RMGVQLKPPALRPKPAVLPKTNPTIGPAPPPQGPTDKSCTM 1020 1030 1040 1050 >>KIAA0411 ( 1061 res) hg02120 (1061 aa) initn: 355 init1: 248 opt: 382 Z-score: 245.8 bits: 58.0 E(): 1.4e-08 Smith-Waterman score: 382; 30.601% identity (71.038% similar) in 183 aa overlap (1143-1325:477-656) 1120 1130 1140 1150 1160 1170 KIAA14 IPSIMRKTFEKKPTATGTFGVRLDDCPPAHTNRYIPLIVDICCKLVEERGLEYTGIYRVP ... :::.:. : . .. ::. ::.::: KIAA04 DLLKQTLGEGERAECGTTRGRRNARTRNQDSGQAIPLVVESCIRYINLYGLQQQGIFRVP 450 460 470 480 490 500 1180 1190 1200 1210 1220 1230 KIAA14 GNNAAISSMQEELNKGMADIDIQDDKWRDLNVISSLLKSFFRKLPEPLFTNDKYADFIEA :... ...... ...: : ..:.. ::.: ....:: .:: : .::: .... :.: . KIAA04 GSQVEVNDIKNSFERG-EDPLVDDQNERDINSVAGVLKLYFRGLENPLFPKERFQDLIST 510 520 530 540 550 560 1240 1250 1260 1270 1280 1290 KIAA14 NRKEDPLDRLKTLKRLIHDLPEHHYETLKFLSAHLKTVAENSEKNKMEPRNLAIVFGPTL . :.: .:.. ..... ::. ....: : :. ... :..: :.: :::: ::::: KIAA04 IKLENPAERVHQIQQILVTLPRVVIVVMRYLFAFLNHLSQYSDENMMDPYNLAICFGPTL 570 580 590 600 610 620 1300 1310 1320 1330 1340 1350 KIAA14 VRTSEDNMTHMVTHMPDQYKIVETLIQHHDWFFTEEGAEEPLTTVQEESTVDSQPVPNID .. . . :. . ....:.: ::. .: KIAA04 MHIPDGQ--DPVSCQAHINEVIKTIIIHHEAIFPSPRELEGPVYEKCMAGGEEYCDSPHS 630 640 650 660 670 680 1360 1370 1380 1390 1400 1410 KIAA14 HLLTNIGRTGVSPGDVSDSATSDSTKSKGSWGSGKDQYSRELLVSSIFAAASRKRKKPKE KIAA04 EPGAIDEVDHDNGTEPHTSDEEVEQIEAIAKFDYMGRSPRELSFKKGASLLLYHRASEDW 690 700 710 720 730 740 >>KIAA1722 ( 1499 res) pf00674s1 (1499 aa) initn: 407 init1: 247 opt: 385 Z-score: 245.7 bits: 58.5 E(): 1.4e-08 Smith-Waterman score: 404; 28.014% identity (62.057% similar) in 282 aa overlap (1052-1333:1179-1444) 1030 1040 1050 1060 1070 1080 KIAA14 QESSNLNEEDTGVTNRDLISRRIKEYNNLMSKAEQLPKTPRQSLSIRQTLLGAKSEPKTQ : : : .. . : : .. . KIAA17 VSIVSKPVLYRTRCTRLGRFASYRTSFSVGSDDELGPIRKKEEDQASQGYKGDNAVIPYE 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1090 1100 1110 1120 1130 1140 KIAA14 SPHSPKEESERKLLSKDDTSPPKDKGTWRKGIPSIMRKTFEKKPTATGTFGVRLDDCPPA . ..:.... . : .. :. :: : ::: . :.: .. ::: : . KIAA17 TDEDPRRRNILRSLRRN-TKKPKPKPR-----PSITKATWE-----SNYFGVPLTTV--V 1210 1220 1230 1240 1250 1150 1160 1170 1180 1190 1200 KIAA14 HTNRYIPLIVDICCKLVEERGLEYTGIYRVPGNNAAISSMQEELNKGMADIDIQDDKWRD .. ::.... : . .: :: ::::: ::.. . :.:..... ..:. . . KIAA17 TPEKPIPIFIERCIEYIEATGLSTEGIYRVSGNKSEMESLQRQFDQDH-NLDLAEKDFT- 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1210 1220 1230 1240 1250 1260 KIAA14 LNVISSLLKSFFRKLPEPLFTNDKYADFIEANRKEDPLDRLKTLKRLIHDLPEHHYETLK .:.... .:::: .::.:: . :..::.. .: ..:..::.... .:....:..: KIAA17 VNTVAGAMKSFFSELPDPLVPYNMQIDLVEAHKINDREQKLHALKEVLKKFPKENHEVFK 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1270 1280 1290 1300 1310 1320 KIAA14 FLSAHLKTVAENSEKNKMEPRNLAIVFGPTLVRTSEDNMTHMVTHMPDQYKIVETLIQHH .. .::. :..:.. : : .::.: : :::.: . ..: ... : :.: .::. KIAA17 YVISHLNKVSHNNKVNLMTSENLSICFWPTLMRPDFSTMDALTATRTYQ-TIIELFIQQC 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1330 1340 1350 1360 1370 1380 KIAA14 DWFFTEEGAEEPLTTVQEESTVDSQPVPNIDHLLTNIGRTGVSPGDVSDSATSDSTKSKG .:: .. :: KIAA17 PFFFYNRPITEPPGARPSSPSAVASTVPFLTSTPVTSQPSPPQSPPPTPQSPMQPLLPSQ 1440 1450 1460 1470 1480 1490 >>KIAA0672 ( 824 res) hk02382 (824 aa) initn: 247 init1: 200 opt: 366 Z-score: 237.4 bits: 56.1 E(): 4.1e-08 Smith-Waterman score: 366; 29.200% identity (64.400% similar) in 250 aa overlap (1113-1352:243-484) 1090 1100 1110 1120 1130 1140 KIAA14 PHSPKEESERKLLSKDDTSPPKDKGTWRKGIPSI--MRKTFEKKPTATGTFGVRLDDCPP .:.: ..... .::. :: :.. KIAA06 KEIDYANYFQTLIEVQAEYHRKSLTLLQAVLPQIKAQQEAWVEKPS----FGKPLEEHLT 220 230 240 250 260 1150 1160 1170 1180 1190 1200 KIAA14 AHTNRYIPLIVDICCKLVEERGLEYTGIYRVPGNNAAISSMQEELNKGMADIDIQDDKWR ..: : . .. : .. : :.. :..:: . . ..... :. . .:.:. . KIAA06 I-SGREIAFPIEACVTMLLECGMQEEGLFRVAPSASKLKKLKAALDCCV--VDVQEYS-A 270 280 290 300 310 320 1210 1220 1230 1240 1250 1260 KIAA14 DLNVISSLLKSFFRKLPEPLFTNDKYADFIEANRKEDPLDRLKTLKRLIHDLPEHHYETL : ..:.. :::..:.:::::.: . : ..:.:. .. .:..: . ::. ..... KIAA06 DPHAIAGALKSYLRELPEPLMTFELYDEWIQASNVQEQDKKLQALWNACEKLPKANHNNI 330 340 350 360 370 380 1270 1280 1290 1300 1310 KIAA14 KFLSAHLKTVAENSEKNKMEPRNLAIVFGPTLVRT-SEDNMTHMVTHMPDQY-KIVETLI ..: :. ..: .. ::: : :.:::.::.:. .: :.:.:.: . : :.: .: KIAA06 RYLIKFLSKLSEYQDVNKMTPSNMAIVLGPNLLWPQAEGNITEMMTTVSLQIVGIIEPII 390 400 410 420 430 440 1320 1330 1340 1350 1360 1370 KIAA14 QHHDWFFTEE------GAEEPLTTVQEESTVDSQPVPNIDHLLTNIGRTGVSPGDVSDSA :: :::: : : . :..... .:.: :..: KIAA06 QHADWFFPGEIEFNITGNYGSPVHVNHNANYSSMPSPDMDPADRRQPEQARRPLSVATDN 450 460 470 480 490 500 1380 1390 1400 1410 1420 1430 KIAA14 TSDSTKSKGSWGSGKDQYSRELLVSSIFAAASRKRKKPKEKAQPSSSEDELDNVFFKKEN KIAA06 MMLEFYKKDGLRKIQSMGVRVMDTNWVARRGSSAGRKVSCAPPSMQPPAPPAELAAPLPS 510 520 530 540 550 560 >>KIAA0621 ( 753 res) hg04539 (753 aa) initn: 317 init1: 231 opt: 358 Z-score: 233.1 bits: 55.2 E(): 7.3e-08 Smith-Waterman score: 358; 31.707% identity (65.366% similar) in 205 aa overlap (1150-1347:331-532) 1120 1130 1140 1150 1160 1170 KIAA14 TFEKKPTATGTFGVRLDDCPPAHTNRYIPLIVDICCKLVEERGLEYTGIYRVPGNNAAIS :. : . :: ::.. :.::. : :. .. KIAA06 EAMDGREPVYNSNKDSQSEGTAQLDSIGFSIIRKCIHAVETRGINEQGLYRIVGVNSRVQ 310 320 330 340 350 360 1180 1190 1200 1210 1220 1230 KIAA14 SMQEELNKGMADIDIQDD---KWRDLNVISSLLKSFFRKLPEPLFTNDKYADFIEANRKE .. : . . . : .: ....:.: ::...: :: ::. . .::.: . : KIAA06 KLLSVLMDPKTASETETDICAEW-EIKTITSALKTYLRMLPGPLMMYQFQRSFIKAAKLE 370 380 390 400 410 1240 1250 1260 1270 1280 1290 KIAA14 DPLDRLKTLKRLIHDLPEHHYETLKFLSAHLKTVAENSEKNKMEPRNLAIVFGPTLVRTS . .:.. .. :.: :::.. . :..: :: .::.: ..: : ::..::::::.: . KIAA06 NQESRVSEIHSLVHRLPEKNRQMLQLLMNHLANVANNHKQNLMTVANLGVVFGPTLLRPQ 420 430 440 450 460 470 1300 1310 1320 1330 1340 1350 KIAA14 EDNMTHMVTHMPDQYKIVETLIQHHDWFFTEEGAEEPLTTVQ----EESTVDSQPVPNID :.... . . : ..: ::..:. .:. . :::..: .... ::.: KIAA06 EETVA-AIMDIKFQNIVIEILIENHEKIFNTV-PDMPLTNAQLHLSRKKSSDSKPPSCSE 480 490 500 510 520 530 1360 1370 1380 1390 1400 1410 KIAA14 HLLTNIGRTGVSPGDVSDSATSDSTKSKGSWGSGKDQYSRELLVSSIFAAASRKRKKPKE KIAA06 RPLTLFHTVQSTEKQEQRNSIINSSLESVSSNPNSILNSSSSLQPNMNSSDPDLAVVKPT 540 550 560 570 580 590 >>KIAA0456 ( 1095 res) hg00633 (1095 aa) initn: 317 init1: 184 opt: 348 Z-score: 224.8 bits: 54.2 E(): 2.1e-07 Smith-Waterman score: 359; 20.405% identity (52.822% similar) in 691 aa overlap (1015-1662:401-1044) 990 1000 1010 1020 1030 1040 KIAA14 SYSETKRKNVFRLTTSDCECLFQAEDRDDMLAWIKTIQESSNLNEEDTGVTNRDLISRRI :. .: .: . . : : : .:... . KIAA04 PHMGDMASQLCAQQPVQSELVQRCQQLQSRLSTLKIENEEVKKTMEATLQTIQDIVT--V 380 390 400 410 420 1050 1060 1070 1080 1090 1100 KIAA14 KEYNNLMSKAEQLPKTPRQSLS-IRQTLLGAKSEPKTQSPHSPKEESERKLLSK-DDTSP .... .: : .. .. : . .:.. :.:. . .. ..:.:. ..: . KIAA04 EDFD--VSDCFQYSNSMESVKSTVSETFM---SKPSIAKRRANQQETEQFYFTKMKEYLE 430 440 450 460 470 480 1110 1120 1130 1140 1150 1160 KIAA14 PKDKGTWRKGIPSIMRKTFEKKPTATGTFGVRLDDCPPAHTNRYIPLIVDICCKLVEERG .. : .. ....::. .. . ... : . ... :::.:. : ... ..: KIAA04 GRNLITKLQAKHDLLQKTLGESQRTDCSLARRSSTVRKQDSSQAIPLVVESCIRFISRHG 490 500 510 520 530 540 1170 1180 1190 1200 1210 1220 KIAA14 LEYTGIYRVPGNNAAISSMQEELNKGMADIDIQDDKWRDLNVISSLLKSFFRKLPEPLFT :.. ::.:: :... ...... ...: : :.. .:.. :...:: .:: : .::: KIAA04 LQHEGIFRVSGSQVEVNDIKNAFERG-EDPLAGDQNDHDMDSIAGVLKLYFRGLEHPLFP 550 560 570 580 590 600 1230 1240 1250 1260 1270 1280 KIAA14 NDKYADFIEANRKEDPLDRLKTLKRLIHDLPEHHYETLKFLSAHLKTVAENSEKNKMEPR .: . :.. .. .: ..... ::. ...: : :. ... ::.: :.: KIAA04 KDIFHDLMACVTMDNLQERALHIRKVLLVLPKTTLIIMRYLFAFLNHLSQFSEENMMDPY 610 620 630 640 650 660 1290 1300 1310 1320 1330 KIAA14 NLAIVFGPTLVRTSED-NMTHMVTHMPDQYKIVETLIQHHDWFFTEEGAEEPL------- :::: :::.:. . : ... .:. . : . .:::.. : . . : :. KIAA04 NLAICFGPSLMSVPEGHDQVSCQAHVNELIKTI--IIQHENIFPSPRELEGPVYSRGGSM 670 680 690 700 710 720 1340 1350 1360 1370 KIAA14 ----------TTVQEESTVD-----------SQPVPNIDHLLTNIGRTGVSPGDVSDSAT :: :.:: : .:. : .. .:::. . . .. KIAA04 EDYCDSPHGETTPVEDSTQDVTAEHHTSDDECEPIEAIAKF-DYVGRTARELSFKKGASL 730 740 750 760 770 1380 1390 1400 1410 1420 1430 KIAA14 SDSTKSKGSWGSGKDQYSRELLVSSIFAAASRKRKKPKEKAQPSSSEDELDNVFFKKENV ... .: :. . . . :. . ... . :...:.: :.. . KIAA04 LLYQRASDDWWEGR-HNGIDGLIPHQYIVVQDTEDGVVERSSPKS---EIEVI------S 780 790 800 810 820 1440 1450 1460 1470 1480 KIAA14 EQCHNDTKEESKKESETLGRKQKIIIAKENSTRKDPSTTKDEKI----SLGKESTPSEEP : .. . .. . :. : .:. :. :: : . . .: : : :. .. KIAA04 EPPEEKVTARAGASCPSGGHVADIYLANINKQRKRPESGSIRKTFRSDSHGLSSSLTDSS 830 840 850 860 870 880 1490 1500 1510 1520 1530 1540 KIAA14 SPPHNSKHNKSPTLSCRFAILKESPRSLLAQKSSHLEETGSDSGTLLSTSSQASLARFSM :: .. ::: : . ...:. : . : :. .. . .: :..: : KIAA04 SPGVGA--------SCR-----PSSQPIMSQS---LPKEGPDKCSISGHGSLNSISRHSS 890 900 910 920 930 1550 1560 1570 1580 1590 1600 KIAA14 KKST--SPETKHSEFLANVSTITSDYSTTSSATYLTSLDSSRLSPEVQSVAESKGDEADD :. ::. .. :. . ..: . .: .. ..... .: .: . KIAA04 LKNRLDSPQIRK----------TATAGRSKSFNNHRPMDPEVIAQDIEATMNSALNELRE 940 950 960 970 980 1610 1620 1630 1640 1650 1660 KIAA14 -ERSELISEGRPVETDSESEF---PVF-PTALTSERLFRGKLQEVTKSSRRN-SEGSELS ::. ... : :. . :: ::. : : :.. . .:. : ..... KIAA04 LERQSSVKHTPDVVLDTLEPLKTSPVVAPTSEPSSPLHTQLLKDPEPAFQRSASTAGDIA 990 1000 1010 1020 1030 1040 1670 1680 1690 1700 1710 1720 KIAA14 CTEGSLTSSLDSRRQLFSSHKLIECDTLSRKKSARFKSDSGSLGDAKNEKEAPSLTKVFD : KIAA04 CAFRPVKSVKMAAPVKPPATRPKPTVFPKTNATSPGVNSSTSPQSTDKSCTV 1050 1060 1070 1080 1090 >>KIAA1478 ( 570 res) fj05212 (570 aa) initn: 354 init1: 143 opt: 339 Z-score: 223.0 bits: 52.9 E(): 2.6e-07 Smith-Waterman score: 341; 27.586% identity (58.333% similar) in 348 aa overlap (1017-1351:180-508) 990 1000 1010 1020 1030 1040 KIAA14 SETKRKNVFRLTTSDCECLFQAEDRDDMLAWIKTIQESSNLNEEDTGVTNRDLISRRIKE : .. .....:. .. : : ::... KIAA14 NESIVAKTTVTVPNDGGPIEAVSTIETVPYWTRSRRKTGTLQPWNSDST---LNSRQLEP 150 160 170 180 190 200 1050 1060 1070 1080 1090 1100 KIAA14 YNNLMSKAEQLPKTPRQSLSIRQTLLGAKS--EPKTQSPHSPKEESERKLLSKDD---TS .. : . ::... ..: . .:. .:.. : . . . . :. : .: KIAA14 RTETDSVG-----TPQSNGGMRLHDFVSKTVIKPESCVPCGKRIKFGKLSLKCRDCRVVS 210 220 230 240 250 260 1110 1120 1130 1140 1150 1160 KIAA14 PPKDKGTWRKGIPSIMRKTFEKKPTATGTFGVRLDDCPPAHTNRYIPLIVDICCKLVEER :. . : .: : :. :. : :. : ..:. .:: :: : . .:.: KIAA14 HPECRD--RCPLPCI--PTLIGTPVKIGE-GMLADFV--SQTSPMIPSIVVHCVNEIEQR 270 280 290 300 310 1170 1180 1190 1200 1210 1220 KIAA14 GLEYTGIYRVPGNNAAISSMQEELNKGMADIDIQDDKWRDLNVISSLLKSFFRKLPEPLF :: ::.::. : . ... ..:.. . . . . . : :...: ::::.:.:.: :::. KIAA14 GLTETGLYRISGCDRTVKELKEKFLR-VKTVPLLS-KVDDIHAICSLLKDFLRNLKEPLL 320 330 340 350 360 370 1230 1240 1250 1260 1270 1280 KIAA14 TNDKYADFIEANRKEDPLDRLKTLKRLIHDLPEHHYETLKFLSAHLKTVAENSEKNKMEP : :.:: . : . . .. . . .::. . .:: :: ::. ::. : ..::. KIAA14 TFRLNRAFMEAAEITDEDNSIAAMYQAVGELPQANRDTLAFLMIHLQRVAQ-SPHTKMDV 380 390 400 410 420 430 1290 1300 1310 1320 1330 KIAA14 RNLAIVFGPTLVRTSEDNMTHMVTHMPD---QYKIVETLIQH--HDW---FFTEEGAEEP ::: :::::.: . : :: . : : :.:: :.. . : ...:. .: KIAA14 ANLAKVFGPTIVAHAVPN-PDPVTMLQDIKRQPKVVERLLSLPLEYWSQFMMVEQENIDP 440 450 460 470 480 490 1340 1350 1360 1370 1380 1390 KIAA14 LTTVQEESTVDSQPVPNIDHLLTNIGRTGVSPGDVSDSATSDSTKSKGSWGSGKDQYSRE : .... .. .. .:.: KIAA14 LHVIENSNAFSTPQTPDIKVSLLGPVTTPEHQLLKTPSSSSLSQRVRSTLTKNTPRFGSK 500 510 520 530 540 550 >>KIAA1204 ( 1445 res) fg03451 (1445 aa) initn: 280 init1: 280 opt: 341 Z-score: 219.0 bits: 53.5 E(): 4.4e-07 Smith-Waterman score: 363; 21.605% identity (54.630% similar) in 648 aa overlap (1123-1742:12-632) 1100 1110 1120 1130 1140 1150 KIAA14 KLLSKDDTSPPKDKGTWRKGIPSIMRKTFEKKPTATGTFGVRLDDCPPAHTNRYIPLIVD :. :...:: : . . ... .: .. KIAA12 LMKNKGAKQKLKRKGAASAFGCDLTEYLES-SGQDVPYVLK 10 20 30 40 1160 1170 1180 1190 1200 1210 KIAA14 ICCKLVEERGLEYTGIYRVPGNNAAISSMQEELNKGMADIDIQDDKWRDLNVISSLLKSF : ...: .:. ::::. : .. :. ...:... . .. .:.. ..:: : . KIAA12 SCAEFIETHGI-VDGIYRLSGVTSNIQRLRQEFGSDQCPDLTREVYLQDIHCVGSLCKLY 50 60 70 80 90 1220 1230 1240 1250 1260 1270 KIAA14 FRKLPEPLFTNDKYADFIEANRKEDPLDRLKTLKRLIHDLPEHHYETLKFLSAHLKTVAE ::.::.::.: . : : :: . .: .. .:..:: ::.::..: :: .: KIAA12 FRELPNPLLTYELYEKFTEAVSHCPEEGQLARIQNVIQELPPSHYRTLEYLIRHLAHIAS 100 110 120 130 140 150 1280 1290 1300 1310 1320 KIAA14 NSEKNKMEPRNLAIVFGPTLVRTSEDNMTH-----MVTHMPDQYKIVETLIQHHDWFFTE : :..:. ::::.:..:.:.:..: . : . : ..: ...: : .:.. KIAA12 FSSKTNMHARNLALVWAPNLLRSKEIEATGCNGDAAFLAVRVQQVVIEFILNHVDQIFNN 160 170 180 190 200 210 1330 1340 1350 1360 1370 1380 KIAA14 EGAEEPLTTVQEESTVDSQPVPNIDHLLTNIGRTGVSPGDVSDSATSDSTKSKGSWGSGK :: : . ... . : .: .. . .. . ... . ::. .... . KIAA12 -GAPGSLENDENRPIMKSLTLPALSLPMKLVS---LEEAQARSLATNHPARKE------R 220 230 240 250 260 1390 1400 1410 1420 1430 1440 KIAA14 DQYSRELLVSSIFAAASRKRKKPKEKAQPSSSEDELDNVFFKKENVEQCHNDTKEESKKE . : .: . . . : .: . ::. . ..: :. . .:.: . ... KIAA12 RENSLPEIVPPMGTLFHTVLELPDNKRKLSSKSKKWKSIF----NLGRSGSDSKSKLSRN 270 280 290 300 310 320 1450 1460 1470 1480 1490 KIAA14 SETLGRKQKIIIAKENSTRKDPSTTKDEKISL---GKESTPSEEPSP-------PHNSKH . .. : :.. . : . : :. . : :. :::. . . . : .. : KIAA12 GSVFVRGQRLSVEKA-TIR--PAKSMDSLCSVPVEGKETKGNFNRTVTTGGFFIPATKMH 330 340 350 360 370 380 1500 1510 1520 1530 1540 1550 KIAA14 NKSPTLSCRFAILK-ESPRSLLAQKSSHLEETGSDSGTLLSTSSQASLARFSM-KKSTSP . . :: .. . : . . . ...:: . : ..... .... . .: KIAA12 STGTGSSCDLTKQEGEWGQEGMPPGAEGGFDVSSDRSHLQGAQARPPPEQLKVFRPVEDP 390 400 410 420 430 440 1560 1570 1580 1590 1600 1610 KIAA14 ETKHSEFLANVSTITSDYSTTSSATYLTSLDSSRLSPEVQ----SVAESKGDEADDERSE :.... ::. : ..:. . .:: . . ::. : ...: . . . : KIAA12 ESEQTAPKMLGMFYTSNDSPSKSV-FTSSLFQMEPSPRNQRKALNISEPFAVSVPLRVSA 450 460 470 480 490 500 1620 1630 1640 1650 1660 1670 KIAA14 LIS-EGRPVETDSESEFPVFPTALTSERLFRGKLQEVTKSSRRNSEGSELSCTEGSLTSS .:: .. : .: . :. . . : :.:. . ... :.: : . .. KIAA12 VISTNSTPCRTPPK-ELQSLSS--LEEFSFHGS-ESGGWPEEEKPLGAETSAASVPKKAG 510 520 530 540 550 1680 1690 1700 1710 1720 KIAA14 LDSRRQLFSSHKLIECDT-LSRKKSARF---KSDSGSLGDAK-NEKEA-PSLTKVFDVMK :.. . . . .::. ::.. .:.. :. .::.. . :: : :. :: .. KIAA12 LEDAKAVPEAPGTVECSKGLSQEPGAHLEEKKTPESSLSSQHLNELEKRPNPEKV---VE 560 570 580 590 600 610 1730 1740 1750 1760 1770 1780 KIAA14 KGKSTGSLLTPTRGESEKQEPTWKTKIADRLKLRPRAPADDMFGVGNHKVNAETAKRKSI .:. .: . . : :: . KIAA12 EGREAGEMESSTLQESPRARAEAVLLHEMDEDDLANALIWPEIQQELKIIESEEELSSLP 620 630 640 650 660 670 >>KIAA0131 ( 942 res) ha01235 (942 aa) initn: 291 init1: 215 opt: 336 Z-score: 218.3 bits: 52.8 E(): 4.8e-07 Smith-Waterman score: 340; 25.387% identity (57.895% similar) in 323 aa overlap (1008-1325:391-691) 980 990 1000 1010 1020 1030 KIAA14 NACLIDISYSETKRKNVFRLTTSDCECLFQAEDRDDMLAWIKTIQESSNLNEEDTGVTNR : : :.: ..: . .:. .. .: KIAA01 IQSRLDRQTIETEEVNKTLKATLQALLEVVASDDGDVLDSFQTSPSTESLKSTSSDPGSR 370 380 390 400 410 420 1040 1050 1060 1070 1080 1090 KIAA14 DLISRRIKEYNNLMSKAEQLPKTPRQSLSIRQTLLGAKSEPKTQSPHSPKEESERKLLSK . :: .. . ... : : .. :: :. : : :. : .:. :.. KIAA01 QAGRRRGQQQE---TETFYLTKL-QEYLSGRSIL------AKLQAKHEKLQEA----LQR 430 440 450 460 1100 1110 1120 1130 1140 1150 KIAA14 DDTSPPKDKGTWRKGIPSIMRKTFEKKPTATGT---FGVRLDDCPPAHTNRYIPLIVDIC : ... .: . ..:. . .:.. . :: .. . ... .::.:. : KIAA01 GDKE--EQEVSWTQYTQRKFQKSRQPRPSSQYNQRLFGGDMEKFIQS-SGQPVPLVVESC 470 480 490 500 510 520 1160 1170 1180 1190 1200 1210 KIAA14 CKLVEERGLEYTGIYRVPGNNAAISSMQEELNKGMADIDIQDDKWRDLNVISSLLKSFFR .... ::.. ::.:: : . .: ... ...: : .. .::. ....:: .:: KIAA01 IRFINLNGLQHEGIFRVSGAQLRVSEIRDAFERG-EDPLVEGCTAHDLDSVAGVLKLYFR 530 540 550 560 570 580 1220 1230 1240 1250 1260 1270 KIAA14 KLPEPLFTNDKYADFIEANRKEDPLDRLKTLKRLIHDLPEHHYETLKFLSAHLKTVAENS .: ::: : ..... ... : .:.. ..::. :: .:..: . :. .:. : KIAA01 SLEPPLFPPDLFGELLASSELEATAERVEHVSRLLWRLPAPVLVVLRYLFTFLNHLAQYS 590 600 610 620 630 640 1280 1290 1300 1310 1320 1330 KIAA14 EKNKMEPRNLAIVFGPTL--VRTSEDNMTHMVTHMPDQYKIVETLIQHHDWFFTEEGAEE ..: :.: :::. ::::: : ...: :. . ..:.::: . : : KIAA01 DENMMDPYNLAVCFGPTLLPVPAGQDP----VALQGRVNQLVQTLIVQPDRVFPPLTSLP 650 660 670 680 690 1340 1350 1360 1370 1380 1390 KIAA14 PLTTVQEESTVDSQPVPNIDHLLTNIGRTGVSPGDVSDSATSDSTKSKGSWGSGKDQYSR KIAA01 GPVYEKCMAPPSASCLGDAQLESLGADNEPELEAEMPAQEDDLEGVVEAVACFAYTGRTA 700 710 720 730 740 750 1944 residues in 1 query sequences 1985561 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:21:56 2008 done: Thu Dec 18 15:21:58 2008 Total Scan time: 0.990 Total Display time: 0.520 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]