# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hj05336mrp1.fasta.nr -Q ../query/KIAA1418.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1418, 889 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7826978 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4333+/-0.000186; mu= 12.8154+/- 0.010 mean_var=81.8057+/-15.984, 0's: 26 Z-trim: 28 B-trim: 405 in 1/64 Lambda= 0.141802 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|169125668|gb|ACA48221.1| SKNY protein [Homo sap ( 866) 5864 1209.9 0 gi|119576001|gb|EAW55597.1| hypothetical protein F ( 866) 5852 1207.4 0 gi|124015179|sp|Q9NXE4.2|NSMA3_HUMAN RecName: Full ( 827) 5596 1155.0 0 gi|109494763|ref|XP_001063553.1| PREDICTED: simila (1024) 5190 1072.1 0 gi|109493602|ref|XP_001058775.1| PREDICTED: simila (1024) 5183 1070.6 0 gi|194043412|ref|XP_001929623.1| PREDICTED: sphing ( 868) 5167 1067.3 0 gi|73996001|ref|XP_543560.2| PREDICTED: similar to ( 827) 5154 1064.6 0 gi|119909670|ref|XP_583777.3| PREDICTED: sphingomy ( 867) 5097 1053.0 0 gi|149019750|gb|EDL77898.1| rCG36774 [Rattus norve ( 823) 5086 1050.7 0 gi|148745032|gb|AAI42451.1| SMPD4 protein [Bos tau ( 856) 5047 1042.7 0 gi|124015180|sp|Q6ZPR5.2|NSMA3_MOUSE RecName: Full ( 823) 5039 1041.1 0 gi|149720162|ref|XP_001488324.1| PREDICTED: sphing ( 852) 5033 1039.9 0 gi|12859688|dbj|BAB31737.1| unnamed protein produc ( 823) 5031 1039.5 0 gi|40674045|gb|AAH64947.1| SMPD4 protein [Homo sap ( 735) 4958 1024.5 0 gi|118098719|ref|XP_415236.2| PREDICTED: similar t ( 827) 4268 883.4 0 gi|124015181|sp|Q5XHG1.2|NSMA3_XENLA RecName: Full ( 824) 3755 778.4 0 gi|54035150|gb|AAH84096.1| Smpd4 protein [Xenopus ( 854) 3755 778.4 0 gi|209155782|gb|ACI34123.1| Sphingomyelin phosphod ( 813) 3455 717.0 8e-204 gi|119576004|gb|EAW55600.1| hypothetical protein F ( 530) 3432 712.2 1.5e-202 gi|194386342|dbj|BAG59735.1| unnamed protein produ ( 615) 3432 712.2 1.7e-202 gi|7020298|dbj|BAA91070.1| unnamed protein product ( 798) 3432 712.3 2.1e-202 gi|102467484|ref|NP_060221.2| neutral sphingomyeli ( 837) 3432 712.3 2.1e-202 gi|119576005|gb|EAW55601.1| hypothetical protein F ( 837) 3432 712.3 2.1e-202 gi|194391350|dbj|BAG60793.1| unnamed protein produ ( 607) 3428 711.4 2.9e-202 gi|194387634|dbj|BAG61230.1| unnamed protein produ ( 764) 3427 711.3 4e-202 gi|194382754|dbj|BAG64547.1| unnamed protein produ ( 724) 3422 710.3 7.9e-202 gi|55250448|gb|AAH85900.1| Smpd4 protein [Rattus n ( 493) 3120 648.3 2.3e-183 gi|194382616|dbj|BAG64478.1| unnamed protein produ ( 502) 3116 647.5 4.1e-183 gi|119576003|gb|EAW55599.1| hypothetical protein F ( 912) 3112 646.9 1.2e-182 gi|7021055|dbj|BAA91368.1| unnamed protein product ( 605) 3107 645.7 1.7e-182 gi|74216796|dbj|BAE37796.1| unnamed protein produc ( 637) 3035 631.0 4.8e-178 gi|20071251|gb|AAH26767.1| Smpd4 protein [Mus musc ( 794) 3035 631.1 5.7e-178 gi|26330998|dbj|BAC29229.1| unnamed protein produc ( 794) 3035 631.1 5.7e-178 gi|26327537|dbj|BAC27512.1| unnamed protein produc ( 794) 3035 631.1 5.7e-178 gi|148665056|gb|EDK97472.1| sphingomyelin phosphod ( 835) 3035 631.1 6e-178 gi|194043414|ref|XP_001929624.1| PREDICTED: sphing ( 839) 3026 629.3 2.1e-177 gi|148665055|gb|EDK97471.1| sphingomyelin phosphod ( 833) 3008 625.6 2.7e-176 gi|26326955|dbj|BAC27221.1| unnamed protein produc ( 793) 3004 624.8 4.7e-176 gi|50949353|emb|CAB66671.2| hypothetical protein [ ( 431) 2884 600.0 7.1e-169 gi|119576002|gb|EAW55598.1| hypothetical protein F ( 758) 2885 600.4 9.6e-169 gi|49065526|emb|CAG38581.1| FLJ20297 [Homo sapiens ( 428) 2868 596.7 6.9e-168 gi|55733541|emb|CAH93448.1| hypothetical protein [ ( 428) 2853 593.7 5.8e-167 gi|90084423|dbj|BAE91053.1| unnamed protein produc ( 428) 2810 584.9 2.6e-164 gi|149531352|ref|XP_001509989.1| PREDICTED: simila ( 509) 2587 539.3 1.6e-150 gi|118098721|ref|XP_001232199.1| PREDICTED: simila ( 797) 2529 527.6 8.4e-147 gi|7022351|dbj|BAA91567.1| unnamed protein product ( 363) 2383 497.5 4.5e-138 gi|34533603|dbj|BAC86751.1| unnamed protein produc ( 398) 2276 475.6 1.9e-131 gi|74211258|dbj|BAE37694.1| unnamed protein produc ( 807) 2272 475.0 5.7e-131 gi|160773900|gb|AAI55502.1| LOC100127861 protein [ ( 796) 2245 469.5 2.6e-129 gi|66910748|gb|AAH97653.1| Smpd4 protein [Xenopus ( 796) 2238 468.1 7e-129 >>gi|169125668|gb|ACA48221.1| SKNY protein [Homo sapiens (866 aa) initn: 5864 init1: 5864 opt: 5864 Z-score: 6478.6 bits: 1209.9 E(): 0 Smith-Waterman score: 5864; 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