# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fh14782.fasta.huge -Q ../query/KIAA1417.ptfa ./tmplib.24314 2
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

 KIAA1417, 1379 aa
 vs ./tmplib.24314 library

1986126 residues in  2037 sequences
  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2565+/-0.00683; mu= 18.6975+/- 0.467
 mean_var=204.9004+/-50.570, 0's: 0 Z-trim: 13  B-trim: 0 in 0/40
 Lambda= 0.089599

FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width:  16
The best scores are:                                      opt bits E(2037)
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KIAA1470  ( 564 res)   fj01953                     ( 564)  276 49.4 2.2e-06
KIAA0032  ( 1054 res)   ha01920                    (1054)  253 46.9 2.3e-05
KIAA1995  ( 1011 res)   bh00088                    (1011)  223 43.0 0.00033
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KIAA1563  ( 1658 res)   fh20460s1                  (1658)  192 39.3  0.0068


>>KIAA1593  ( 953 res)   fj09260                          (953 aa)
 initn: 177 init1: 177 opt: 302  Z-score: 222.7  bits: 53.1 E(): 2.7e-07
Smith-Waterman score: 302;  31.718% identity (59.471% similar) in 227 aa overlap (122-341:3-224)

             100       110       120       130          140        
KIAA14 GVLDWLIQKGVDLLVKDKESGWTALHRSIFYGHIDCVWSLLK--HGVSL-YIQDKEGLSA
                                     . .: :: ::..   :.:   :.. ..:: 
KIAA15                             SCFPKIMCVDSLVRICSGLSYGRIRNIKSLSD
                                           10        20        30  

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KIAA14 LDLVMKDRPTHVVFKNTDPTDVYTWGDNTNFTLGHGSQNSKH-HPELVDLFSRSGIYIKQ
       ...:.     .  .  .  ..:. ::.:    :: :.. .:.  :.:  : :  :: . :
KIAA15 IQIVQVACGYYHSLALSKASEVFCWGQNKYGQLGLGTDCKKQTSPQL--LKSLLGIPFMQ
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       210       220       230       240       250       260       
KIAA14 VVLCKFHSVFLSQKGQVYTCGHGPGGRLGHGDEQTCLVPRLVEGLNGHNCSQVAAAKDHT
       :.    ::  :. .: ..  :..  :.:: .::.   :: :...: ...   .  ..:::
KIAA15 VAAGGAHSFVLTLSGAIFGWGRNKFGQLGLNDENDRYVPNLLKSLRSQKIVYICCGEDHT
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KIAA14 VVLTEDGCVYTFGLNIFHQLGIIPPPSSCNVPRQIQAKYLKGRTIIGVAAGRFHTVLWTR
       ..::..: :.::: . . :::        : ::..    : :  .  .: :: ::  .. 
KIAA15 AALTKEGGVFTFGAGGYGQLGHNSTSHEIN-PRKVFE--LMGSIVTEIACGRQHTSAFVP
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KIAA14 EA--VYTMGLNG-GQLGCLLDPNGEKCVTAPRQVSALHHKDIALSLVAASDGATVCVTTR
        .  .:..::.: ::::                                           
KIAA15 SSGRIYSFGLGGNGQLGTGSTSNRKSPFTVKGNWYPYNGQCLPDIDSEEYFCVKRIFSGG
       210       220       230       240       250       260       

>>KIAA1470  ( 564 res)   fj01953                          (564 aa)
 initn: 227 init1: 227 opt: 276  Z-score: 206.5  bits: 49.4 E(): 2.2e-06
Smith-Waterman score: 299;  27.931% identity (55.517% similar) in 290 aa overlap (201-464:188-466)

              180       190       200       210         220        
KIAA14 YTWGDNTNFTLGHGSQNSKHHPELVDLFSRSGIYIKQVVL--CKFHSVFLSQKGQVYTCG
                                     .:. .. ::   :  ::.... .:.... :
KIAA14 LIGRKEVPKQQAAYRNLGQNLWGPHRYGCLAGVRVRTVVSGSCAAHSLLITTEGKLWSWG
       160       170       180       190       200       210       

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KIAA14 HGPGGRLGHGDEQTCLVPRLVEGLNGHNCSQVAAAKDHTVVLTEDGCVYTFGLNIFHQLG
       ..  :.::::: .   .:::.:::. .   ..: ...::..::: : :..:: : . :::
KIAA14 RNEKGQLGHGDTKRVEAPRLIEGLSHEVIVSAACGRNHTLALTETGSVFAFGENKMGQLG
       220       230       240       250       260       270       

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KIAA14 IIPPPSSCNVPRQIQAKYLKGRTIIGVAAG-RFHTVLWTREAVYTMGL-NGGQLGCLLDP
       .    ..  ::   :  : .:. :  .: : .:  ..  .  .:..:  . ::::   . 
KIAA14 LGNQTDA--VPSPAQIMY-NGQPITKMACGAEFSMIMDCKGNLYSFGCPEYGQLGH--NS
       280         290        300       310       320       330    

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KIAA14 NGEKCVTAPR--QVSALHHKDIALSLVAASDGATVCVTTRGDIYLLADYQCKKMASKQLN
       .:.  . : :      :  . .:. .  ..::  . : .     .. :  :    .  :.
KIAA14 DGKFIARAQRIEYDCELVPRRVAIFIEKTKDGQILPVPN----VVVRDVACGANHTLVLD
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KIAA14 LKKVLVS-G-------GHMEYKVD--PEHLKE-----NGGQKI-----CILAMDGAGRVF
        .: . : :       :: : : .  :. .:       :...:     : .:.. .: .:
KIAA14 SQKRVFSWGFGGYGRLGHAEQKDEMVPRLVKLFDFPGRGASQIYAGYTCSFAVSEVGGLF
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KIAA14 CWRSVNSSLKQCRWAYPRQVFISDIALNRNEILFVTQDGEGFRGRWFEEKRKSSEKKEIL
        : ..:.: ..    ::. :                                        
KIAA14 FWGATNTSREST--MYPKAVQDLCGWRIRSLACGKSSIIVAADESTISWGPSPTFGELGY
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>>KIAA0032  ( 1054 res)   ha01920                         (1054 aa)
 initn: 172 init1: 160 opt: 253  Z-score: 188.1  bits: 46.9 E(): 2.3e-05
Smith-Waterman score: 330;  30.690% identity (57.241% similar) in 290 aa overlap (129-404:11-284)

      100       110       120       130       140       150        
KIAA14 QKGVDLLVKDKESGWTALHRSIFYGHIDCVWSLLKHGVSLYIQDKEGLSALDLV---MKD
                                     ::: . :.:  .:   :. :   :   ..:
KIAA00                     KIRTMLCWGYWSLGQPGISTNLQ---GIVAEPQVCGFISD
                                   10        20           30       

                 160       170       180       190       200       
KIAA14 RPT--------HVVFKNTDPTDVYTWGDNTNFTLGHGSQNSKHHPELVDLFSRSGIYIKQ
       : .        : ::   :  .::: : ::.  :::  ...:  :: .  .. .  .: .
KIAA00 RSVKEVACGGNHSVFLLEDG-EVYTCGLNTKGQLGHEREGNK--PEQIGALADQ--HIIH
        40        50         60        70          80          90  

       210       220       230        240       250       260      
KIAA14 VVLCKFHSVFLSQKGQVYTCGHGPGGRLG-HGDEQTCLVPRLVEGLNGHNCSQVAAAKDH
       :.  . ::. ::..::... : :  :.::    :..  ::::.. :: ..  ::. .. :
KIAA00 VACGESHSLALSDRGQLFSWGAGSDGQLGLMTTEDSVAVPRLIQKLNQQTILQVSCGNWH
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KIAA14 TVVLTEDGCVYTFGLNIFHQLGIIPPPSSCNVPRQIQAKYLKGRTIIGVAAGRFHT-VLW
        ..:. ::  .:.: :   :::.     :   :.....  :.:  .  ::::  :. .: 
KIAA00 CLALAADGQFFTWGKNSHGQLGLGKEFPSQASPQRVRS--LEGIPLAQVAAGGAHSFALS
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KIAA14 TREAVYTMGLNG-GQLGCLLDPNGEKCVTAPRQVSALHHKDIALSLVAASDGATVCVTTR
          ::.  :.:. :::: : :   ::   .: .:. :. . ..   .. ..  :. .:  
KIAA00 LSGAVFGWGMNNAGQLG-LSD---EKDRESPCHVKLLRTQKVV--YISCGEEHTAVLTKS
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KIAA14 GDIYLLADYQCKKMASKQLNLKKVLVSGGHMEYKVDPEHLKENGGQKICILAMDGAGRVF
       : .. ..  .: ...  ..:                                        
KIAA00 GGVFTFGAGSCGQLGHDSMNDEVNPRRVLELMGSEVTQIACGRQHTLAFVPSSGLIYAFG
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>>KIAA1995  ( 1011 res)   bh00088                         (1011 aa)
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Smith-Waterman score: 229;  27.899% identity (55.072% similar) in 276 aa overlap (157-421:370-615)

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KIAA19 LRKRRREMEEKVTLLNAPTKRPRSSTVTEAPIAVVTSRT--SEVYVWG------------
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KIAA14 NSKHHPELVDLFSRSGIYIKQVVLCKFHSVFLSQKGQVYTCGHGPGG-----RLGHGDEQ
       ..:  :. .:.. .::   .::   . : . .. . ..::  .  ::     .:::::. 
KIAA19 GGKSTPQKLDVI-KSGCSARQVCAGNTHFAVVTVEKELYTWVNMQGGTKLHGQLGHGDKA
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       .   :. :: :.:.   ::. . : :: .:..: .:.:: . .  .:.  .  :   .: 
KIAA19 SYRQPKHVEKLQGKAIHQVSCGDDFTVCVTDEGQLYAFGSDYYGCMGVDKVAGP---EVL
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KIAA14 RQIQAKYLKGRTIIGVAAGRFHTVLWTR-EAVYTMGLNG-GQLGCLLDPNGEKCVTAPRQ
       . .: ... .  .  :. :  :.:. :: . ::. : .  :.::  ::  .:.   .:..
KIAA19 EPMQLNFFLSNPVEQVSCGDNHVVVLTRNKEVYSWGCGEYGRLG--LD--SEEDYYTPQK
             510       520       530       540           550       

       360       370       380       390       400       410       
KIAA14 VSALHHKDIALSLVAASDGATVCVTTRGDIYLLADYQCKKMASKQLNLKKVLVSG--GHM
       :. . .  : ...  . :: :  .:  : .  ::   :     ..:.:.. . ::  .: 
KIAA19 VD-VPKALIIVAVQCGCDG-TFLLTQSGKV--LA---CGLNEFNKLGLNQCM-SGIINHE
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KIAA14 EYKVDPEHLKENGGQKICILAMDGAGRVFCWRSVNSSLKQCRWAYPRQVFISDIALNRNE
        :.  :                                                      
KIAA19 AYHEVPYTTSFTLAKQLSFYKIRTIAPGKTHTAAIDERGRLLTFGCNKCGQLGVGNYKKR
     610       620       630       640       650       660         

>>KIAA0469  ( 559 res)   hg01666                          (559 aa)
 initn: 266 init1: 137 opt: 203  Z-score: 155.5  bits: 39.9 E(): 0.0015
Smith-Waterman score: 203;  30.818% identity (61.635% similar) in 159 aa overlap (785-941:45-196)

          760       770       780       790         800       810  
KIAA14 FSNLSSRLDGVRFENEKINVIAKNTGNKLKLSQKKC--SFLCDVTMKSVDGKEFPCHKCV
                                     ::: .   .:: :::.... :..:: :. :
KIAA04 QPIEGAMERPAPLAVLPFSDPAHALSLLRGLSQLRAERKFL-DVTLEAAGGRDFPAHRAV
           20        30        40        50         60        70   

            820       830       840       850       860       870  
KIAA14 LCARLEYFHSMLSSSWIEASSCAALEMPIHSDILKVILDYLYTDEAVVIKESQNVDFICS
       : :   ::..:....  :. .  .    .  :.:...::. :: ...:   ..:..    
KIAA04 LAAASPYFRAMFAGQLRESRAERVRLHGVPPDMLQLLLDFSYTGRVAV--SGDNAE---P
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KIAA14 VLVVADQLLITRLKEICEVALTEKLTLKNAAMLLEFAAMYSAKQLKLSCLQFIGLNMAAL
       .: .:: : .  .:: : . : ..: : :   . .::  .: . :  .  .:: :  .. 
KIAA04 LLRAADLLQFPAVKEACGAFLQQQLDLANCLDMQDFAEAFSCSGLASAAQRFI-LRHVGE
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KIAA14 LEARSLDVLSDGVLKDLSEFYRKMIPAMDRRVITPYQDGPDISYLEVEDGDIFLKEEINM
       : :..:. :                                                   
KIAA04 LGAEQLERLPLARLLRYLRDDGLCVPKEEAAYQLALRWVRADPPRRAAHWPQLLEAVRLP
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>>KIAA1561  ( 1416 res)   fh20178s1                       (1416 aa)
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KIAA14 HLCVLAFSFFKISFHDSEVSGIKTVRMSSPMPDCTSKCRSLKHALD-------VLSVVTK
                                :.. : :  ..   .  :: :       ..... .
KIAA15                 MKSLKSRLRRQDVPGPASSGAAAASAHAADWNKYDDRLMKAAER
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KIAA14 GSENQIKAFLSSHCYNAATIKDVFGRNALHLVSSCGKKGVLDWLIQKGVDLLVKDKESGW
       :. ... ..:...  : . . :: ::...:.:.: :.   :. .. .:::. ..:  .: 
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       .::: .  :::  :. .::...      : .: .:: : .: : :. . .     ..: .
KIAA15 NALHLAAKYGHALCLQKLLQYNCPTEHADLQGRTALHDAAMADCPSSIQLLCDHGASVNA
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          .    :  ..: :.  : . .:.   :  ...    .  ...:   :  : :  .  
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         . .: . .     :...: ::. :  :   :.  .::                     
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KIAA14 PSSCNVPRQIQAKYLKGRTIIGVAAGRFHTVLWTREAVYTMGLNGGQLGCLLDPNGEKCV
                                                                   
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>>KIAA1563  ( 1658 res)   fh20460s1                       (1658 aa)
 initn: 143 init1: 143 opt: 192  Z-score: 143.8  bits: 39.3 E(): 0.0068
Smith-Waterman score: 192;  30.682% identity (55.682% similar) in 176 aa overlap (166-335:470-636)

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KIAA15 SAIGPEGLKDSREEQVKQESMQGKKSSSLVDIREEETEGGSRRLSLPGLLSQVS---PRL
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       .   .:  .  . :::   .:     .. : . .:.: :.:  :.:::::    : :  :
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KIAA14 EGLNGHNCSQVAAAKDHTVVLTEDGCVYTFGLNIFHQLGIIPPPSSCNVPRQIQAKYLKG
       . :.:..  .. :.  :...::  . ::..: : : :::    :..  :::  . .  .:
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         . ..:::: .... .    .  ::                                  
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Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]