# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/ha04795.fasta.nr -Q ../query/KIAA1412.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1412, 1386 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7827002 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2874+/-0.000184; mu= 14.8269+/- 0.010 mean_var=76.1343+/-14.647, 0's: 31 Z-trim: 32 B-trim: 3 in 1/66 Lambda= 0.146989 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|74753330|sp|Q9UHN6.1|TMEM2_HUMAN RecName: Full= (1383) 9377 1998.9 0 gi|114624984|ref|XP_001141007.1| PREDICTED: transm (1383) 9351 1993.4 0 gi|73946811|ref|XP_541287.2| PREDICTED: similar to (1430) 8767 1869.6 0 gi|119922708|ref|XP_593521.3| PREDICTED: similar t (1383) 8671 1849.2 0 gi|49901411|gb|AAH76570.1| Transmembrane protein 2 (1383) 8321 1775.0 0 gi|81882895|sp|Q5FWI3.1|TMEM2_MOUSE RecName: Full= (1383) 8321 1775.0 0 gi|119582923|gb|EAW62519.1| transmembrane protein (1191) 7897 1685.0 0 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