# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hj08221.fasta.huge -Q ../query/KIAA1396.ptfa ./tmplib.24314 2
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

 KIAA1396, 551 aa
 vs ./tmplib.24314 library

1986954 residues in  2037 sequences
  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4726+/-0.00567; mu= 8.6844+/- 0.386
 mean_var=134.6218+/-33.147, 0's: 0 Z-trim: 83  B-trim: 15 in 1/39
 Lambda= 0.110539

FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width:  16
The best scores are:                                      opt bits E(2037)
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KIAA1947  ( 608 res)   fh23660                     ( 608) 1878 311.7   1e-85
KIAA1611  ( 813 res)   fj12627                     ( 813) 1873 311.1 2.1e-85
KIAA2033  ( 766 res)   ej00602s1                   ( 766) 1825 303.4 4.1e-83
KIAA0065  ( 848 res)   ha00946                     ( 848) 1738 289.6 6.5e-79
KIAA1852  ( 948 res)   fj01514                     ( 948) 1690 282.0 1.4e-76
KIAA1473  ( 574 res)   fj03262                     ( 574) 1584 264.8 1.3e-71
KIAA1559  ( 544 res)   fh19195                     ( 544) 1559 260.8 1.9e-70
KIAA1508  ( 573 res)   hk06576                     ( 573) 1520 254.6 1.5e-68
KIAA1710  ( 515 res)   fj18457                     ( 515) 1448 243.0   4e-65
KIAA1615  ( 484 res)   fj13419                     ( 484) 1445 242.5 5.4e-65
KIAA2007  ( 580 res)   fj01689                     ( 580) 1440 241.8   1e-64
KIAA1349  ( 752 res)   fj00940                     ( 752) 1439 241.8 1.4e-64
KIAA1827  ( 469 res)   fk01409                     ( 469) 1428 239.8 3.4e-64
KIAA1829  ( 557 res)   hj00069                     ( 557) 1398 235.1 1.1e-62
KIAA0798  ( 682 res)   hk06584                     ( 682) 1392 234.3 2.3e-62
KIAA1962  ( 746 res)   hm00158                     ( 746) 1371 231.0 2.5e-61
KIAA1969  ( 595 res)   fk06944                     ( 595) 1361 229.2 6.6e-61
KIAA0326  ( 927 res)   hg00579                     ( 927) 1357 228.9 1.3e-60
KIAA0628  ( 540 res)   hh01433                     ( 540) 1342 226.2 5.1e-60
KIAA1874  ( 579 res)   hk07257s1                   ( 579) 1337 225.4 9.2e-60
KIAA2003  ( 460 res)   ah02593                     ( 460) 1326 223.5 2.7e-59
KIAA1956  ( 680 res)   fk08713                     ( 680) 1326 223.7 3.4e-59
KIAA1806  ( 481 res)   fk00438                     ( 481) 1296 218.8 7.6e-58
KIAA1588  ( 613 res)   fj08823                     ( 613) 1294 218.6 1.1e-57
KIAA0412  ( 720 res)   hg03242                     ( 720) 1290 218.0 1.9e-57
KIAA1015  ( 841 res)   hk03609(revised)            ( 841) 1290 218.1 2.1e-57
KIAA0961  ( 530 res)   hj05830                     ( 530) 1256 212.4 6.7e-56
KIAA1982  ( 599 res)   fk06527(revised)            ( 599) 1250 211.5 1.4e-55
KIAA1948  ( 487 res)   fh24556                     ( 487) 1236 209.2 5.8e-55
KIAA0972  ( 702 res)   hj06859                     ( 702) 1162 197.6 2.6e-51
KIAA1141  ( 914 res)   hk01833                     ( 914) 1158 197.1 4.7e-51
KIAA1198  ( 553 res)   fg01911                     ( 553) 1116 190.1 3.6e-49
KIAA1871  ( 821 res)   hj05256s1                   ( 821) 1028 176.3 7.7e-45
KIAA1388  ( 599 res)   fj06552                     ( 599) 1018 174.5 1.9e-44
KIAA0426  ( 613 res)   hh01274                     ( 613)  922 159.2 7.9e-40
KIAA1954  ( 468 res)   fk02322                     ( 468)  875 151.6 1.2e-37
KIAA1339  ( 409 res)   fj00071                     ( 409)  812 141.5 1.2e-34
KIAA0441  ( 702 res)   hh00601s1                   ( 702)  800 139.9 6.2e-34
KIAA1979  ( 309 res)   fj09511                     ( 309)  728 127.9 1.1e-30
KIAA0924  ( 617 res)   hh02883                     ( 617)  659 117.3 3.4e-27
KIAA1951  ( 679 res)   fj05532                     ( 679)  649 115.8 1.1e-26
KIAA0557  ( 493 res)   hh01334                     ( 493)  641 114.3 2.1e-26
KIAA1285  ( 785 res)   hh11563(revised)            ( 785)  563 102.1 1.6e-22
KIAA0236  ( 1696 res)   ha04654                    (1696)  552 100.8 8.5e-22
KIAA0478  ( 1253 res)   hh05955                    (1253)  535 97.9 4.6e-21
KIAA1675  ( 1286 res)   ae00102                    (1286)  514 94.6 4.8e-20
KIAA1703  ( 1165 res)   fj16891                    (1165)  457 85.5 2.5e-17
KIAA1231  ( 1061 res)   fh08195s1                  (1061)  444 83.3 9.8e-17
KIAA1020  ( 638 res)   fg00473s1                   ( 638)  436 81.8 1.7e-16


>>KIAA1431  ( 891 res)   fj00022                          (891 aa)
 initn: 3602 init1: 2088 opt: 2134  Z-score: 1849.7  bits: 352.7 E(): 6.5e-98
Smith-Waterman score: 2239;  60.980% identity (73.866% similar) in 551 aa overlap (3-551:315-779)

                                           10        20        30  
KIAA13                             TSEMTRSPFSDWESIYVTQELPLKQFMYDDAC
                                     :.: : ::  .:.. ::::  ::  : .. 
KIAA14 SDLGSAGHCVAKPDLVSLLEQEKEPWMVKRELTGSLFSGQRSVHETQELFPKQDSYAEGV
          290       300       310       320       330       340    

             40        50        60          70        80        90
KIAA13 MEGITSYGLECSTFEENWKWEDLFEKQM--GSHEMFSKKEIITHKETITKETEFKYTKFG
        .  ..  :.::.:.:::  . .: ...  :.. .: ..: :::..:..:: :  :.: :
KIAA14 TDRTSNTKLDCSSFRENWDSDYVFGRKLAVGQETQF-RQEPITHNKTLSKERERTYNKSG
          350       360       370       380        390       400   

              100       110       120       130       140       150
KIAA13 KCIHLENIEESIYNHTSDKKSFSKNSIVIKHKKVYVGKKLFKCNECDKTFTHSSSLTVHF
       .  .:.. ::...:. :  :.:.:.:.:::.  .:.:::::::::: ::::.::::::: 
KIAA14 RWSYLDDSEEKVHNRDS-IKNFQKSSVVIKQTGIYAGKKLFKCNECKKTFTQSSSLTVH-
           410       420        430       440       450       460  

              160       170       180       190       200       210
KIAA13 RIHTGEKPYACEECGKAFKQRQHLAQHHRTHTGEKLFECKECRKAFKQSEHLIQHQRIHT
                                                                   
KIAA14 ------------------------------------------------------------
                                                                   

              220       230       240       250       260       270
KIAA13 GEKPYKCKECRKAFRQPAHLAQHQRIHTGEKPYECKECGKAFSDGSSFARHQRCHTGKRP
                              ::::::::::.:.::::::::::::::::::::::.:
KIAA14 -----------------------QRIHTGEKPYKCNECGKAFSDGSSFARHQRCHTGKKP
                                    470       480       490        

              280       290       300       310       320       330
KIAA13 YECIECGKAFRYNTSFIRHWRSYHTGEKPFNCIDCGKAFSVHIGLILHRRIHTGEKPYKC
       ::::::::::  :::.::::: ::::::::.::::::::: ::::  :::::::::::::
KIAA14 YECIECGKAFIQNTSLIRHWRYYHTGEKPFDCIDCGKAFSDHIGLNQHRRIHTGEKPYKC
      500       510       520       530       540       550        

              340       350       360       370       380       390
KIAA13 DVCGKTFSSGSSRTVHQRIHTGEKPYECDICGKDFSHHASLTQHQRVHSGEKPYECKECG
       ::: :.:  ::: ::::::::::::::::.: : :::::::::::::::::::..:::::
KIAA14 DVCHKSFRYGSSLTVHQRIHTGEKPYECDVCRKAFSHHASLTQHQRVHSGEKPFKCKECG
      560       570       580       590       600       610        

              400       410       420       430       440       450
KIAA13 KAFRQNVHLVSHLRIHTGEKPYECKECGKAFRISSQLATHQRIHTGEKPYECIECGNAFK
       ::::::.::.:::::::::::.:: ::::.: ::::::::::::::::::::  :..:: 
KIAA14 KAFRQNIHLASHLRIHTGEKPFECAECGKSFSISSQLATHQRIHTGEKPYECKVCSKAFT
      620       630       640       650       660       670        

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KIAA13 QRSHLAQHQKTHTGEKPYECNECGKAFSQTCNLTQHQRIHTGEKPYKCTECGKAFSDSSS
       :..:::::::::::::::::.::::::::: .: ::::.::::::::: ::::::.:.::
KIAA14 QKAHLAQHQKTHTGEKPYECKECGKAFSQTTHLIQHQRVHTGEKPYKCMECGKAFGDNSS
      680       690       700       710       720       730        

              520       530       540       550                    
KIAA13 CAQHQRLHTGQRPYQCFECGKAFRRKLSLICHQRSHTGEEP                   
       :.::::::::::::.:.::::::. : :::::.::::::.:                   
KIAA14 CTQHQRLHTGQRPYECIECGKAFKTKSSLICHRRSHTGEKPYECSVCGKAFSHRQSLSVH
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KIAA14 QRIHSGKKPYECKECRKTFIQIGHLNQHKRVHTGERSYNYKKSRKVFRQTAHLAHHQRIH
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>>KIAA1947  ( 608 res)   fh23660                          (608 aa)
 initn: 5620 init1: 1171 opt: 1878  Z-score: 1630.9  bits: 311.7 E(): 1e-85
Smith-Waterman score: 1878;  54.120% identity (78.396% similar) in 449 aa overlap (103-551:136-583)

             80        90       100       110       120       130  
KIAA13 THKETITKETEFKYTKFGKCIHLENIEESIYNHTSDKKSFSKNSIVIKHKKVYVGKKLFK
                                     :. :.  :.: ..  ...:.:... .. ..
KIAA19 SDLQQQALHSGWKPHRDTHGVEAFQSGQNNYSCTQCGKDFCHQHTLFEHQKIHTEERPYE
         110       120       130       140       150       160     

            140       150       160       170       180       190  
KIAA13 CNECDKTFTHSSSLTVHFRIHTGEKPYACEECGKAFKQRQHLAQHHRTHTGEKLFECKEC
       :.:: : : ..:.:  : : ::::.:: : ::::::. . ...::.. ::::. .::.::
KIAA19 CSECGKLFRYNSDLIKHQRNHTGERPYKCSECGKAFSLKYNVVQHQKIHTGERPYECSEC
         170       180       190       200       210       220     

            200       210       220       230       240       250  
KIAA13 RKAFKQSEHLIQHQRIHTGEKPYKCKECRKAFRQPAHLAQHQRIHTGEKPYECKECGKAF
        ::: .. ::.:::::::  .:: :.:: :::   :::. ::.:::::.:: :.:::: :
KIAA19 GKAFLRKSHLLQHQRIHTRPRPYVCSECGKAFLTQAHLVGHQKIHTGERPYGCNECGKYF
         230       240       250       260       270       280     

            260       270       280       290       300       310  
KIAA13 SDGSSFARHQRCHTGKRPYECIECGKAFRYNTSFIRHWRSYHTGEKPFNCIDCGKAFSVH
         .:.. :::. :::.::. : :::: :  . ..: : :  ::::::..: .::: :  .
KIAA19 MYSSALIRHQKVHTGERPFYCCECGKFFMDSCTLIIHQR-VHTGEKPYECNECGKFFRYR
         290       300       310       320        330       340    

            320       330       340       350       360       370  
KIAA13 IGLILHRRIHTGEKPYKCDVCGKTFSSGSSRTVHQRIHTGEKPYECDICGKDFSHHASLT
         :: :...:::::::.:. ::: : . :.  .:::.:::::::::. ::: : .  .:.
KIAA19 STLIRHQKVHTGEKPYECSECGKFFMDTSTLIIHQRVHTGEKPYECNKCGKFFRYCFTLN
          350       360       370       380       390       400    

            380       390       400       410       420       430  
KIAA13 QHQRVHSGEKPYECKECGKAFRQNVHLVSHLRIHTGEKPYECKECGKAFRISSQLATHQR
       .::::::::.::::.:::: : ..  : :: :.::::.:.::. :::.::  : : ::::
KIAA19 RHQRVHSGERPYECSECGKFFVDSCTLKSHQRVHTGERPFECSICGKSFRCRSTLDTHQR
          410       420       430       440       450       460    

            440       450       460       470       480       490  
KIAA13 IHTGEKPYECIECGNAFKQRSHLAQHQKTHTGEKPYECNECGKAFSQTCNLTQHQRIHTG
       :::::.:::: :::. :.. :.  .:...: ::. .::.:::..:::. .: .::..:: 
KIAA19 IHTGERPYECSECGKFFRHNSNHIRHRRNHFGERSFECTECGRVFSQNSHLIRHQKVHTR
          470       480       490       500       510       520    

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KIAA13 EKPYKCTECGKAFSDSSSCAQHQRLHTGQRPYQCFECGKAFRRKLSLICHQRSHTGEEP 
       :. :::..::: : :::.  .:.:.:::..::.: ::::.:: . ::: :.: ::::.: 
KIAA19 ERTYKCSKCGKFFMDSSTLISHERVHTGEKPYECSECGKVFRYNSSLIKHRRIHTGERPY
          530       540       550       560       570       580    

KIAA19 QCSECGRVFNQNSHLIQHQKVHTR
          590       600        

>>KIAA1611  ( 813 res)   fj12627                          (813 aa)
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      80        90       100       110       120       130         
KIAA13 KETEFKYTKFGKCIHLENIEESIYNHTSDKKSFSKNSIVIKHKKVYVGKKLFKCNECDKT
                                     :.:..:: . .:.... :.: .::.:: ::
KIAA16 KYHELNHFSLLTQRRKANSCGKPYKCNECGKAFTQNSNLTSHRRIHSGEKPYKCSECGKT
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KIAA13 FTHSSSLTVHFRIHTGEKPYACEECGKAFKQRQHLAQHHRTHTGEKLFECKECRKAFKQS
       ::  :.::.:  :::::::: :.::::.:.. ..:: :.: ::::: ..:.:: :::.  
KIAA16 FTVRSNLTIHQVIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFRGH
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KIAA13 EHLIQHQRIHTGEKPYKCKECRKAFRQPAHLAQHQRIHTGEKPYECKECGKAFSDGSSFA
        .:  :: :::::::.::.:: : : : .:: .: :::::::::.:.:::::::  ::.:
KIAA16 SNLTTHQLIHTGEKPFKCNECGKLFTQNSHLISHWRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLA
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KIAA13 RHQRCHTGKRPYECIECGKAFRYNTSFIRHWRSYHTGEKPFNCIDCGKAFSVHIGLILHR
        ::  :::..::.: ::::.::::. . :: :  ::::::..: .::::::.: .:  :.
KIAA16 IHQTIHTGEKPYKCNECGKVFRYNSYLGRH-RRVHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLATHQ
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KIAA13 RIHTGEKPYKCDVCGKTFSSGSSRTVHQRIHTGEKPYECDICGKDFSHHASLTQHQRVHS
        :::: ::.::. :.:.:...:. . :.:::::::::.:. ::: :: ..::: :: .::
KIAA16 VIHTGTKPFKCNECSKVFTQNSQLANHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLTTHQAIHS
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KIAA13 GEKPYECKECGKAFRQNVHLVSHLRIHTGEKPYECKECGKAFRISSQLATHQRIHTGEKP
       :::::.: ::::.: :. :: ::  ::.:::::.:.::::.:  .:::: : :.::::::
KIAA16 GEKPYKCIECGKSFTQKSHLRSHRGIHSGEKPYKCNECGKVFAQTSQLARHWRVHTGEKP
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KIAA13 YECIECGNAFKQRSHLAQHQKTHTGEKPYECNECGKAFSQTCNLTQHQRIHTGEKPYKCT
       :.: .:: ::..:: :. ::  :::::::.:.::::.: ..  :. :.:::::::::::.
KIAA16 YKCNDCGRAFSDRSSLTFHQAIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEKPYKCN
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KIAA13 ECGKAFSDSSSCAQHQRLHTGQRPYQCFECGKAFRRKLSLICHQRSHTGEEP        
       :::::::  :. . :. .:::..::.: .:::.: ..  :  :::.::::.:        
KIAA16 ECGKAFSMHSNLTTHKVIHTGEKPYKCNQCGKVFTQNSHLANHQRTHTGEKPYRCNECGK
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KIAA16 AFSVRSSLTTHQAIHTGKKPYKCNECGKVFTQNAHLANHRRIHTGEKPYRCTECGKAFRV
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>>KIAA2033  ( 766 res)   ej00602s1                        (766 aa)
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Smith-Waterman score: 1828;  46.545% identity (74.364% similar) in 550 aa overlap (12-550:217-764)

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KIAA13                    TSEMTRSPFSDWESIYVTQELPLKQFMYDDACMEGITSYGL
                                     :.:  .::.  ...   .  : :.  ... 
KIAA20 SIHDASLVSTAQRISCRPKTHISNNHGNNFWNSSLLTQKQEVHMREKSFQCNESGKAFNY
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KIAA13 ECSTFEENW--KWEDLFEKQMGSHEMFSKKEIITHKETITKETEFKYTKFGK--------
         : ....   .  : .. .. .. . .:...  :..  : :. .: .. ::        
KIAA20 S-SLLRKHQIIHLADKYKCDVCGKLFNQKRNLACHRRCHTGENPYKCNECGKTFSQTSSL
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KIAA13 -CIHLENIEESIYNHTSDKKSFSKNSIVIKHKKVYVGKKLFKCNECDKTFTHSSSLTVHF
        : .  .  :. :.     :.:  .::. .:. ... .: .::::: ::: ..: :: : 
KIAA20 TCHRRLHTGEKPYKCEECDKAFHFKSILERHRIIHTEEKPYKCNECGKTFRQKSILTRHH
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KIAA13 RIHTGEKPYACEECGKAFKQRQHLAQHHRTHTGEKLFECKECRKAFKQSEHLIQHQRIHT
       :.::::::: :.::::.:.... :. ::: ::::: ..:.:: :.:...  :  :.:.::
KIAA20 RLHTGEKPYKCNECGKTFSHKSSLTCHHRLHTGEKPYKCNECGKTFSHKSSLTCHRRLHT
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KIAA13 GEKPYKCKECRKAFRQPAHLAQHQRIHTGEKPYECKECGKAFSDGSSFARHQRCHTGKRP
       :::::::.:: ::.   ...  :..::: .. :.:.::::.::  ::.. :.: :::..:
KIAA20 GEKPYKCEECDKAYSFRSNFEIHRKIHTEDNAYKCNECGKTFSRTSSLTCHRRRHTGEQP
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KIAA13 YECIECGKAFRYNTSFIRHWRSYHTGEKPFNCIDCGKAFSVHIGLILHRRIHTGEKPYKC
       :.: :: ::::..... :: :  ::::::..: .:::.:: .  :  :.:.::::: :::
KIAA20 YKCEECDKAFRFKSNLERH-RRIHTGEKPYKCNECGKTFSRKSYLTCHHRLHTGEKAYKC
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KIAA13 DVCGKTFSSGSSRTVHQRIHTGEKPYECDICGKDFSHHASLTQHQRVHSGEKPYECKECG
       . :.::::  :: : :.:.:.:::::.:  ::: :... .: .:.:.::::.::.:..  
KIAA20 NECSKTFSWKSSLTCHRRLHSGEKPYKCKECGKTFNQQLTLKRHRRLHSGENPYKCEDSD
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KIAA13 KAFRQNVHLVSHLRIHTGEKPYECKECGKAFRISSQLATHQRIHTGEKPYECIECGNAFK
       ::.  . .:  : .::: ..::.:.::::.:  .:.:. :.:.:::::::.: :: .::.
KIAA20 KAYSFKSNLEIHQKIHTEQNPYKCNECGKTFSRTSSLTCHRRLHTGEKPYKCEECDKAFR
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KIAA13 QRSHLAQHQKTHTGEKPYECNECGKAFSQTCNLTQHQRIHTGEKPYKCTECGKAFSDSSS
        .:.:  :.. :::::::.::::::.::.   .. :.:.:::::::::.:::: ::..::
KIAA20 VKSNLEGHRRIHTGEKPYKCNECGKTFSRKSYFVCHHRLHTGEKPYKCNECGKNFSQKSS
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KIAA13 CAQHQRLHTGQRPYQCFECGKAFRRKLSLICHQRSHTGEEP 
          :.:::::..::.: ::::.: .: .: ::.: ::::.  
KIAA20 LICHHRLHTGEKPYKCNECGKTFSQKSNLTCHRRLHTGEKQV
          730       740       750       760      

>>KIAA0065  ( 848 res)   ha00946                          (848 aa)
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KIAA13 MYDDACMEGITSYGLECSTFEENWKWEDLFEKQMGSHEMFSKKEIITHKETITKETEFKY
                                     :: .  .  .:: . .. :.    :.  ..
KIAA00 EFGRTLCDSSSLLFHQISPSRDNHYEFSDCEKFLCVKSTLSKPHGVSMKHYDCGESGNNF
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KIAA13 TKFGKCI-HLENIEESIYNHTSDK--KSFSKNSIVIKHKKVYVGKKLFKCNECDKTFTHS
        .   :. ::.. ...  .   ..  :.: ..: . .:..:..:.: :.::::.:.:  .
KIAA00 RR-KLCLSHLQKGDKGEKHFECNECGKAFWEKSHLTRHQRVHTGQKPFQCNECEKAFWDK
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KIAA13 SSLTVHFRIHTGEKPYACEECGKAFKQRQHLAQHHRTHTGEKLFECKECRKAFKQSEHLI
       :.:: : : ::::::. :.::::::.... :. :.::::::: ..:. : :.: :.  : 
KIAA00 SNLTKHQRSHTGEKPFECNECGKAFSHKSALTLHQRTHTGEKPYQCNACGKTFCQKSDLT
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KIAA13 QHQRIHTGEKPYKCKECRKAFRQPAHLAQHQRIHTGEKPYECKECGKAFSDGSSFARHQR
       .::: ::: :::.: :: :.::  .::  ::: ::::::.:: ::::.::. :....:::
KIAA00 KHQRTHTGLKPYECYECGKSFRVTSHLKVHQRTHTGEKPFECLECGKSFSEKSNLTQHQR
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KIAA13 CHTGKRPYECIECGKAFRYNTSFIRHWRSYHTGEKPFNCIDCGKAFSVHIGLILHRRIHT
        : : . :::  :::.: ... . :: .  ::: ::..: .:::.: ..  : .:.: ::
KIAA00 IHIGDKSYECNACGKTFYHKSLLTRH-QIIHTGWKPYECYECGKTFCLKSDLTVHQRTHT
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KIAA13 GEKPYKCDVCGKTFSSGSSRTVHQRIHTGEKPYECDICGKDFSHHASLTQHQRVHSGEKP
       :.::. :  ::: ::  :. . : : :::::::::  ::: : ... ::.:.:.:.::::
KIAA00 GQKPFACPECGKFFSHKSTLSQHYRTHTGEKPYECHECGKIFYNKSYLTKHNRTHTGEKP
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KIAA13 YECKECGKAFRQNVHLVSHLRIHTGEKPYECKECGKAFRISSQLATHQRIHTGEKPYECI
       :::.:::::: :. .:..: ::: :::::.:.::::::  .: : .::: :: ::::.: 
KIAA00 YECNECGKAFYQKSQLTQHQRIHIGEKPYKCNECGKAFCHKSALIVHQRTHTQEKPYKCN
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KIAA13 ECGNAFKQRSHLAQHQKTHTGEKPYECNECGKAFSQTCNLTQHQRIHTGEKPYKCTECGK
       :::..:  .: :  :.. :::::::::::::: : .  .:: :.: :::::  .:.::::
KIAA00 ECGKSFCVKSGLIFHERKHTGEKPYECNECGKFFRHKSSLTVHHRAHTGEKSCQCNECGK
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KIAA13 AFSDSSSCAQHQRLHTGQRPYQCFECGKAFRRKLSLICHQRSHTGEEP            
        :  .:  ::::: :::..::.:  : :.: .: .:: ::: : ::              
KIAA00 IFYRKSELAQHQRSHTGEKPYECNTCRKTFSQKSNLIVHQRRHIGENLMNEMDIRNFQPQ
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KIAA00 VSLHNASEYSHCGESPDDILNVQ
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>>KIAA1852  ( 948 res)   fj01514                          (948 aa)
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         70        80        90       100       110       120      
KIAA13 SKKEIITHKETITKETEFKYTKFGKCIHLENIEESIYNHTSDKKSFSKNSIVIKHKKVYV
                                     .. :. ::.   .. :  .:. ..:.:. .
KIAA18 GIHTGEKLYEYKECHQIFNQSPSFNEHPRLHVGENQYNYKEYENIFYFSSF-MEHQKIGT
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KIAA13 GKKLFKCNECDKTFTHSSSLTVHFRIHTGEKPYACEECGKAFKQRQHLAQHHRTHTGEKL
        .: .: :: .:.: ..: :: :   .:.::::  .::: .:   ..: ::..:::::: 
KIAA18 VEKAYKYNEWEKVFGYDSFLTQHTSTYTAEKPYDYNECGTSFIWSSYLIQHKKTHTGEKP
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KIAA13 FECKECRKAFKQSEHLIQHQRIHTGEKPYKCKECRKAFRQPAHLAQHQRIHTGEKPYECK
       .:: .: :.:..   : .:.: ::: :::.:..: :::   .::  :.::::::::: :.
KIAA18 YECDKCGKVFRNRSALTKHERTHTGIKPYECNKCGKAFSWNSHLIVHKRIHTGEKPYVCN
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KIAA13 ECGKAFSDGSSFARHQRCHTGKRPYECIECGKAFRYNTSFIRHWRSYHTGEKPFNCIDCG
       ::::.:. .: .  ::: :::..:.:: ::::.: ... .: : : .:::::::.: .: 
KIAA18 ECGKSFNWNSHLIGHQRTHTGEKPFECTECGKSFSWSSHLIAHMR-MHTGEKPFKCDECE
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KIAA13 KAFSVHIGLILHRRIHTGEKPYKCDVCGKTFSSGSSRTVHQRIHTGEKPYECDICGKDFS
       :::  . .:  :.: :.: :::::  :::.:: .:   .::: :::::::.:. ::: : 
KIAA18 KAFRDYSALSKHERTHSGAKPYKCTECGKSFSWSSHLIAHQRTHTGEKPYNCQECGKAFR
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KIAA13 HHASLTQHQRVHSGEKPYECKECGKAFRQNVHLVSHLRIHTGEKPYECKECGKAFRISSQ
       ....::.:. .::: :::::..:::.  : .::: : : :::::::::..:::.:  : .
KIAA18 ERSALTKHEIIHSGIKPYECNKCGKSCSQMAHLVRHQRTHTGEKPYECNKCGKSFSQSCH
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KIAA13 LATHQRIHTGEKPYECIECGNAFKQRSHLAQHQKTHTGEKPYECNECGKAFSQTCNLTQH
       :..:.:::::::::.: .:  .:.  :::  :..::::::::.::::::::... .:  :
KIAA18 LVAHRRIHTGEKPYKCNQCERSFNCSSHLIAHRRTHTGEKPYRCNECGKAFNESSSLIVH
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KIAA13 QRIHTGEKPYKCTECGKAFSDSSSCAQHQRLHTGQRPYQCFECGKAFRRKLSLICHQRSH
        : :::::::::..: :::  .::   :::.:.:.. . : ::::::  . .:. :::.:
KIAA18 LRNHTGEKPYKCNHCEKAFCKNSSLIIHQRMHSGEKRFICSECGKAFSGHSALLQHQRNH
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        550  
KIAA13 TGEEP 
       . :.  
KIAA18 SEEKLN
             

>>KIAA1473  ( 574 res)   fj03262                          (574 aa)
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Smith-Waterman score: 1704;  47.638% identity (74.016% similar) in 508 aa overlap (43-550:89-574)

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KIAA13 ESIYVTQELPLKQFMYDDACMEGITSYGLECSTFEENWKWEDLFEKQMGSHEMFSKKEII
                                     :: : .     ::. :: :....:.:  .:
KIAA14 SKPDLITCLEQGKEPWNVKRHEMVAEPPVVCSYFAR-----DLWPKQ-GKKNYFQK--VI
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KIAA13 THKETITKETEFKYTKFGKCIHLENIEESIYNHTSDKKSFSKNSIVIKHKKVYVGKKLFK
        ..       ...  :. : .   ....  ::  ..  . ..:             :.:.
KIAA14 LRRYKKCGCENLQLRKYCKSMDECKVHKECYNGLNQCLTTTQN-------------KIFQ
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KIAA13 CNECDKTFTHSSSLTVHFRIHTGEKPYACEECGKAFKQRQHLAQHHRTHTGEKLFECKEC
       :..  :.: . :. . :   :::.: . :.:: :.: . .:::::.: :.::: ..::::
KIAA14 CDKYVKVFHKFSNSNRHTIRHTGKKSFKCKECEKSFCMLSHLAQHKRIHSGEKPYKCKEC
       160       170       180       190       200       210       

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KIAA13 RKAFKQSEHLIQHQRIHTGEKPYKCKECRKAFRQPAHLAQHQRIHTGEKPYECKECGKAF
        ::.... .:  :.:::::.:::::.:: ::: . .::. :. ::::.:::.:.::::::
KIAA14 GKAYNETSNLSTHKRIHTGKKPYKCEECGKAFNRLSHLTTHKIIHTGKKPYKCEECGKAF
       220       230       240       250       260       270       

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KIAA13 SDGSSFARHQRCHTGKRPYECIECGKAFRYNTSFIRHWRSYHTGEKPFNCIDCGKAFSVH
       ....... :.: :::..::.: :::.::  ....  : .  :.::::..: .::::::  
KIAA14 NQSANLTTHKRIHTGEKPYKCEECGRAFSQSSTLTAH-KIIHAGEKPYKCEECGKAFSQS
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KIAA13 IGLILHRRIHTGEKPYKCDVCGKTFSSGSSRTVHQRIHTGEKPYECDICGKDFSHHASLT
         :  :. :::::: :::. :::.::. :  :.:.:::.:::::.:. ::: :.. ..::
KIAA14 STLTTHKIIHTGEKFYKCEECGKAFSQLSHLTTHKRIHSGEKPYKCEECGKAFKQSSTLT
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KIAA13 QHQRVHSGEKPYECKECGKAFRQNVHLVSHLRIHTGEKPYECKECGKAFRISSQLATHQR
        :.:.:.::: :.:. :.::: .  ::..: :::::::::.:.:::::: .::::.::. 
KIAA14 THKRIHAGEKFYKCEVCSKAFSRFSHLTTHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNLSSQLTTHKI
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KIAA13 IHTGEKPYECIECGNAFKQRSHLAQHQKTHTGEKPYECNECGKAFSQTCNLTQHQRIHTG
       ::::::::.: :::.::.: : :..:.  :::::::. .::::::.:. .:: :. ::::
KIAA14 IHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLSKHKVIHTGEKPYKYEECGKAFNQSSHLTTHKMIHTG
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KIAA13 EKPYKCTECGKAFSDSSSCAQHQRLHTGQRPYQCFECGKAFRRKLSLICHQRSHTGEEP
       :::::: ::::::..::   .:. .:::.. :.   :..:     ..  ..:. .::. 
KIAA14 EKPYKCEECGKAFNNSSILNRHKMIHTGEKLYKPESCNNACDNIAKISKYKRNCAGEK 
        520       530       540       550       560       570     

>>KIAA1559  ( 544 res)   fh19195                          (544 aa)
 initn: 7277 init1: 1181 opt: 1559  Z-score: 1356.5  bits: 260.8 E(): 1.9e-70
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KIAA13                             TSEMTRSPFSDWESIYVTQEL-PLKQ------
                                     : ::    : :: : :. : : :.      
KIAA15 NFISLGPSISKPDVITLLDEERKEPGMVVREGTRRYCPDLESRYRTNTLSPEKDIYEIYS
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KIAA13 FMYDDACMEGITSYGLECSTFEENWKWEDLFEKQMGSHEMFSKKEIITHKETITKETEFK
       :..:   :: : ::.:. : :...:.                :..:  .::   .:  : 
KIAA15 FQWD--IMERIKSYSLQGSIFRNDWE---------------CKSKIEGEKE--QQEGYFG
               120       130                      140         150  

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KIAA13 YTKFGKCIHLENIEESIYNHTSDK-KSFSKNSIVIKHKKVYVGKKLFKCNECDKTFTHSS
        .:.                ::.:  ........ ... :. :.:...:.:: ::: . :
KIAA15 QVKI----------------TSEKMTTYKRHNFLTEYQIVHNGEKVYECKECRKTFIRRS
                            160       170       180       190      

          150       160       170       180       190       200    
KIAA13 SLTVHFRIHTGEKPYACEECGKAFKQRQHLAQHHRTHTGEKLFECKECRKAFKQSEHLIQ
       .:. :.::::::::: :.:::.::.:: :: .::. ::::: .::::: :::   ..: :
KIAA15 TLSQHLRIHTGEKPYKCKECGQAFRQRAHLIRHHKLHTGEKPYECKECGKAFTVLQELTQ
        200       210       220       230       240       250      

          210       220       230       240       250       260    
KIAA13 HQRIHTGEKPYKCKECRKAFRQPAHLAQHQRIHTGEKPYECKECGKAFSDGSSFARHQRC
       :::.:::::::.:::: ::::   .::.::::::::::::::.:::.: . . ..:::: 
KIAA15 HQRLHTGEKPYECKECGKAFRVHQQLARHQRIHTGEKPYECKDCGKTFRQCTHLTRHQRL
        260       270       280       290       300       310      

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KIAA13 HTGKRPYECIECGKAFRYNTSFIRHWRSYHTGEKPFNCIDCGKAFSVHIGLILHRRIHTG
       ::... ::: ::::::  . ..  : .  : ::::..: .::::: .   : .:. ::::
KIAA15 HTAEKLYECKECGKAFVCGPDLRVHQK-IHFGEKPYECKECGKAFRICQQLTVHQSIHTG
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KIAA13 EKPYKCDVCGKTFSSGSSRTVHQRIHTGEKPYECDICGKDFSHHASLTQHQRVHSGEKPY
       ::::.:  :::::   .. . :::::: ::::::  : : :: ...: .:: .: ::.::
KIAA15 EKPYECKECGKTFRLRQQLVRHQRIHTREKPYECMECWKTFSSYSQLISHQSIHIGERPY
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KIAA13 ECKECGKAFRQNVHLVSHLRIHTGEKPYECKECGKAFRISSQLATHQRIHTGEKPYECIE
       ::.:::::::   .:..:  ::::::::::::: : ::. :::. :: :::::::::: :
KIAA15 ECEECGKAFRLLSQLTQHQSIHTGEKPYECKECRKPFRLLSQLTQHQSIHTGEKPYECKE
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KIAA13 CGNAFKQRSHLAQHQKTHTGEKPYECNECGKAFSQTCNLTQHQRIHTGEKPYKCTECGKA
       ::.::.  : :.:::. :::::::.:.:: ::: :  .:::::.::.:            
KIAA15 CGKAFRLYSFLTQHQRIHTGEKPYKCKECKKAFRQHSHLTQHQKIHNGI           
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          510       520       530       540       550 
KIAA13 FSDSSSCAQHQRLHTGQRPYQCFECGKAFRRKLSLICHQRSHTGEEP

>>KIAA1508  ( 573 res)   hk06576                          (573 aa)
 initn: 7129 init1: 1106 opt: 1520  Z-score: 1322.6  bits: 254.6 E(): 1.5e-68
Smith-Waterman score: 1668;  52.750% identity (79.500% similar) in 400 aa overlap (119-518:173-571)

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KIAA13 FGKCIHLENIEESIYNHTSDKKSFSKNSIVIKHKKVYVGKKLFKCNECDKTFTHSSSLTV
                                     :.: .: .:.: .: .:  :.: ..: .  
KIAA15 TFGEVGRDFSATSGLLQHQVTPTIERPHSRIRHLRVPTGRKPLKYTESRKSFREKSVFIQ
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KIAA13 HFRIHTGEKPYACEECGKAFKQRQHLAQHHRTHTGEKLFECKECRKAFKQSEHLIQHQRI
       : :  .::.:: : ::::.:.: . . .:...:   .  ::.:: :.:... :: ::::.
KIAA15 HQRADSGERPYKCSECGKSFSQSSGFLRHRKAHGRTRTHECSECGKSFSRKTHLTQHQRV
            210       220       230       240       250       260  

      210       220       230       240       250       260        
KIAA13 HTGEKPYKCKECRKAFRQPAHLAQHQRIHTGEKPYECKECGKAFSDGSSFARHQRCHTGK
       ::::.:: :.:: :.::: . : ::::.::::.::::.::::.:: .... ::.  ::. 
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Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]