# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hj07546.fasta.nr -Q ../query/KIAA1394.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1394, 1003 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7826412 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3430+/-0.000189; mu= 14.4370+/- 0.011 mean_var=83.7783+/-16.700, 0's: 41 Z-trim: 45 B-trim: 2839 in 2/64 Lambda= 0.140123 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|148839342|ref|NP_065862.1| ATP-grasp domain con ( 827) 5584 1139.1 0 gi|182662419|sp|A5YM72.2|ATPG1_HUMAN RecName: Full ( 827) 5579 1138.1 0 gi|148701080|gb|EDL33027.1| mCG3875 [Mus musculus] ( 970) 5394 1100.8 0 gi|126338844|ref|XP_001378878.1| PREDICTED: simila ( 994) 4910 1003.0 0 gi|182662420|sp|Q6ZPS2.2|ATPG1_MOUSE RecName: Full ( 827) 4692 958.8 0 gi|149061958|gb|EDM12381.1| rCG47297, isoform CRA_ ( 704) 3860 790.6 0 gi|194376086|dbj|BAG57387.1| unnamed protein produ ( 924) 3622 742.6 2.1e-211 gi|149270258|ref|XP_907538.3| PREDICTED: hypotheti ( 883) 3298 677.0 1.1e-191 gi|148744257|gb|AAI42165.1| Unknown (protein for I ( 505) 3172 651.4 3.3e-184 gi|194218531|ref|XP_001916976.1| PREDICTED: simila ( 854) 2700 556.1 2.6e-155 gi|158260899|dbj|BAF82627.1| unnamed protein produ ( 385) 2650 545.8 1.6e-152 gi|73983603|ref|XP_540816.2| PREDICTED: hypothetic ( 926) 2643 544.7 8e-152 gi|109105216|ref|XP_001106682.1| PREDICTED: hypoth ( 385) 2620 539.7 1e-150 gi|149595004|ref|XP_001517114.1| PREDICTED: simila ( 492) 2401 495.5 2.7e-137 gi|23272174|gb|AAH23699.1| AI790298 protein [Mus m ( 330) 2021 418.5 2.6e-114 gi|194379906|dbj|BAG58305.1| unnamed protein produ ( 300) 1983 410.8 5e-112 gi|18044012|gb|AAH19736.1| AI790298 protein [Mus m ( 224) 1396 292.1 2.1e-76 gi|149510275|ref|XP_001517624.1| PREDICTED: simila ( 401) 587 128.7 5.6e-27 gi|149061959|gb|EDM12382.1| rCG47297, isoform CRA_ ( 125) 572 125.3 1.9e-26 gi|149061960|gb|EDM12383.1| rCG47297, isoform CRA_ ( 106) 553 121.4 2.4e-25 gi|158283327|gb|EDP09078.1| predicted protein [Chl ( 440) 376 86.1 4.2e-14 gi|85775373|gb|ABC82210.1| Biotin carboxylase-like ( 424) 313 73.4 2.8e-10 gi|167585203|ref|ZP_02377591.1| hypothetical prote ( 408) 299 70.5 1.9e-09 gi|196171681|gb|ACG72654.1| protein of unknown fun ( 424) 289 68.5 8e-09 gi|219954478|gb|ACL64862.1| protein of unknown fun ( 424) 287 68.1 1.1e-08 gi|167738519|ref|ZP_02411293.1| argininosuccinate ( 413) 286 67.9 1.2e-08 gi|167824122|ref|ZP_02455593.1| argininosuccinate ( 424) 286 67.9 1.2e-08 gi|167815742|ref|ZP_02447422.1| argininosuccinate ( 427) 286 67.9 1.2e-08 gi|167918891|ref|ZP_02505982.1| argininosuccinate ( 849) 286 68.1 2e-08 gi|167845660|ref|ZP_02471168.1| argininosuccinate ( 850) 286 68.1 2e-08 gi|167902623|ref|ZP_02489828.1| argininosuccinate ( 854) 286 68.1 2.1e-08 gi|52209743|emb|CAH35714.1| putative bifunctional ( 894) 286 68.2 2.1e-08 gi|126227822|gb|ABN91362.1| putative lyase [Burkho ( 900) 286 68.2 2.1e-08 gi|134251129|gb|EBA51208.1| putative lyase [Burkho ( 900) 286 68.2 2.1e-08 gi|167894228|ref|ZP_02481630.1| argininosuccinate ( 336) 275 65.6 4.8e-08 gi|126219414|gb|ABN82920.1| Argininosuccinate lyas ( 900) 277 66.3 7.5e-08 gi|76580658|gb|ABA50133.1| argininosuccinate lyase ( 914) 277 66.4 7.6e-08 gi|161621457|ref|NP_085768.2| argininosuccinate ly ( 905) 275 65.9 1e-07 gi|30172934|sp|Q981V0.1|ARLY2_RHILO RecName: Full= ( 927) 275 66.0 1e-07 gi|167562682|ref|ZP_02355598.1| argininosuccinate ( 846) 271 65.1 1.7e-07 gi|167569866|ref|ZP_02362740.1| argininosuccinate ( 864) 271 65.1 1.7e-07 gi|133915388|emb|CAM05501.1| putative fusion prote ( 421) 265 63.6 2.3e-07 gi|197703285|gb|EDY49097.1| hypothetical protein S ( 451) 265 63.7 2.4e-07 gi|152027871|gb|ABS25639.1| protein of unknown fun ( 424) 256 61.8 8.1e-07 gi|149949687|gb|ABR48215.1| protein of unknown fun ( 414) 249 60.4 2.1e-06 gi|157916586|gb|ABV98013.1| protein of unknown fun ( 414) 244 59.4 4.3e-06 gi|36784613|emb|CAE13512.1| unnamed protein produc ( 507) 239 58.5 1e-05 gi|115363523|gb|EAU62661.1| argininosuccinate lyas ( 366) 237 57.9 1e-05 gi|28270217|emb|CAD63118.1| unknown [Lactobacillus ( 413) 235 57.6 1.5e-05 gi|20804029|emb|CAD31606.1| PUTATIVE LIGASE/CARBOX ( 425) 234 57.4 1.8e-05 >>gi|148839342|ref|NP_065862.1| ATP-grasp domain contain (827 aa) initn: 5584 init1: 5584 opt: 5584 Z-score: 6095.7 bits: 1139.1 E(): 0 Smith-Waterman score: 5584; 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