# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hh03860.fasta.huge -Q ../query/KIAA1389.ptfa ./tmplib.24314 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1389, 1514 aa vs ./tmplib.24314 library 1985991 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4451+/-0.00738; mu= 6.7401+/- 0.503 mean_var=194.5209+/-46.761, 0's: 0 Z-trim: 6 B-trim: 136 in 1/39 Lambda= 0.091958 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0440 ( 1817 res) ah05029 (1817) 3974 541.1 7.1e-154 KIAA0545 ( 1368 res) hh00165s1 (1368) 3108 426.1 2.2e-119 KIAA0474 ( 782 res) fj12051 ( 782) 676 103.2 2e-22 KIAA1039 ( 444 res) fh02337 ( 444) 598 92.6 1.8e-19 KIAA1272 ( 1023 res) hk07611 (1023) 238 45.2 7.6e-05 >>KIAA0440 ( 1817 res) ah05029 (1817 aa) initn: 3295 init1: 2161 opt: 3974 Z-score: 2854.4 bits: 541.1 E(): 7.1e-154 Smith-Waterman score: 4923; 54.327% identity (73.658% similar) in 1583 aa overlap (53-1511:273-1815) 30 40 50 60 70 KIAA13 PEFFRCDPAISPSLHAAAQISRGEFVRISGLDYVDSA------LLMGRDRDKPFKRRLKS :: .:. : . ..:.::.::: :: KIAA04 YKDDKSDRGPTPTKLSDFLITGGGKGSGFSLDVIDGPISQRENLRLFKEREKPLKRRSKS 250 260 270 280 290 300 80 90 100 110 120 130 KIAA13 ESVETSLFRKLRTVKSEHETFKFTSELEESRLERGIRPWNCQRCFAHYDVQSILFNINEA :. ..:.:::::..:.: : : .:.::..: : ..:::.: .::::::::::::..::: KIAA04 ETGDSSIFRKLRNAKGE-ELGK-SSDLEDNRSEDSVRPWTCPKCFAHYDVQSILFDLNEA 310 320 330 340 350 360 140 150 160 170 180 190 KIAA13 MATRANVGKRKNITTGASAASQTQM---PTGQTGNCESPLGSKEDLNSKENLDADEGDGK . .: :: ::.: :::::::. ... : ..... ::.:: :::::: .:. :.:: : KIAA04 IMNRHNVIKRRNTTTGASAAAVASLVSGPLSHSASFSSPMGSTEDLNSKGSLSMDQGDDK 370 380 390 400 410 420 200 210 220 230 240 250 KIAA13 SNDLVLSCPYFRNETGGEGDRRIALSRANSSSFSSGESCSFESSLSSHCTNAGVSVLEVP ::.::.:::::::: ::::.:.:.::..::.:::. :: ::::.::::::::::.::::: KIAA04 SNELVMSCPYFRNEIGGEGERKISLSKSNSGSFSGCESASFESTLSSHCTNAGVAVLEVP 430 440 450 460 470 480 260 270 280 290 300 310 KIAA13 RENQPIHREKVKRYIIEHIDLGAYYYRKFFYGKEHQNYFGIDENLGPVAVSIRREKVEDA .:: .: ..:::::.::.:::::::::::: ::: :::: ::::::::::::::: .. KIAA04 KENLVLHLDRVKRYIVEHVDLGAYYYRKFFYQKEHWNYFGADENLGPVAVSIRREKPDEM 490 500 510 520 530 540 320 330 340 350 360 370 KIAA13 KEKEGSQFNYRVAFRTSELTTLRGAILEDAIPSTARHGTARGLPLKEVLEYVIPELSIQC ::. :: .:::. :::::: ::::..:::::::::.:.::::::::::::.:.:::..:: KIAA04 KEN-GSPYNYRIIFRTSELMTLRGSVLEDAIPSTAKHSTARGLPLKEVLEHVVPELNVQC 550 560 570 580 590 380 390 400 410 420 430 KIAA13 LRQASNSPKVSEQLLKLDEQGLSFQHKIGILYCKAGQSTEEEMYNNETAGPAFEEFLDLL :: : :.:::.:::.:::::::..:.:.::.::::::::::::::::.:::::::::.:: KIAA04 LRLAFNTPKVTEQLMKLDEQGLNYQQKVGIMYCKAGQSTEEEMYNNESAGPAFEEFLQLL 600 610 620 630 640 650 440 450 460 470 480 490 KIAA13 GQRVRLKGFSKYRAQLDNKTDSTGTHSLYTTYKDYELMFHVSTLLPYMPNNRQQLLRKRH :.::::::: :::::::.::::::::::::::::::.::::::.::: :::.:::::::: KIAA04 GERVRLKGFEKYRAQLDTKTDSTGTHSLYTTYKDYEIMFHVSTMLPYTPNNKQQLLRKRH 660 670 680 690 700 710 500 510 520 530 540 550 KIAA13 IGNDIVTIVFQEPGALPFTPKSIRSHFQHVFVIVKVHNPCTENVCYSVGVSRSKDVPPFG ::::::::::::::: ::.::.::::::::::::.:::::...:::::.:.::.::: :: KIAA04 IGNDIVTIVFQEPGAQPFSPKNIRSHFQHVFVIVRVHNPCSDSVCYSVAVTRSRDVPSFG 720 730 740 750 760 770 560 570 580 590 600 610 KIAA13 PPIPKGVTFPKSAVFRDFLLAKVINAENAAHKSEKFRAMATRTRQEYLKDLAENFVTTAT :::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. ::.. KIAA04 PPIPKGVTFPKSNVFRDFLLAKVINAENAAHKSEKFRAMATRTRQEYLKDLAEKNVTNTP 780 790 800 810 820 830 620 630 640 650 660 670 KIAA13 VDTSVKFSFITLGAKKKEKVKPRKDAHLFSIGAIMWHVIARDFGQSADIECLLGISNEFI .: : :: ::.:..::::: :: :.: :.:::.: : :.:.... ...:::::::::: KIAA04 IDPSGKFPFISLASKKKEKSKPYPGAELSSMGAIVWAVRAEDYNKAMELDCLLGISNEFI 840 850 860 870 880 890 680 690 700 710 720 730 KIAA13 MLIEKDSKNVVFNCSCRDVIGWTSGLVSIKVFYERGECVLLSSVDNCAEDIREIVQRLVI .:::...:.::::::::::::::: .:.:.:::::::: ..: : :.:.:::.:: . KIAA04 VLIEQETKSVVFNCSCRDVIGWTSTDTSLKIFYERGECVSVGSFIN-IEEIKEIVKRLQF 900 910 920 930 940 950 740 750 760 770 780 790 KIAA13 VTRGCETVEMTLRRNGLGQLGFHVNFEGIVADVEPFGFAWKAGLRQGSRLVEICKVAVAT :..:::.::::::::::::::::::.:::::::::.:.::.::::::::::::::::::: KIAA04 VSKGCESVEMTLRRNGLGQLGFHVNYEGIVADVEPYGYAWQAGLRQGSRLVEICKVAVAT 960 970 980 990 1000 1010 800 810 820 830 840 850 KIAA13 LTHEQMIDLLRTSVTVKVVIIQPHDDGSPRRGCSELCRIPMVEYKLDSEGTPCEYKTPFR :.::::::::::::::::::: :::: .:::.::: :.:..:::.. ::. :.: ::: KIAA04 LSHEQMIDLLRTSVTVKVVIIPPHDDCTPRRSCSETYRMPVMEYKMN-EGVSYEFKFPFR 1020 1030 1040 1050 1060 1070 860 870 880 890 900 KIAA13 RNTTWHR----------VPTPALQPL-SRASPIPGTPDRLPCQQLLQQAQAAIPRSTSFD :. :.: ::. . .:. :: . : : . : :::: : : KIAA04 NNNKWQRNASKGPHSPQVPSQVQSPMTSRLNAGKGDGKMPP-----PERAANIPRSISSD 1080 1090 1100 1110 1120 1130 910 920 930 KIAA13 -----RKLPDGT----------------RSSPSNQSSSSDPGPGGSGPWRPQVGYDGC-- :.: :. :.:::: ::::: : : : .: . .: KIAA04 GRPLERRLSPGSDIYVTVSSMALARSQCRNSPSNLSSSSDTGSVG-GTYRQKSMPEGFGV 1140 1150 1160 1170 1180 1190 940 950 960 970 KIAA13 --QSPLLLEHQ-------GSGPLECDGARERE---DTMEAS-RHP--------------E .:: ...: ::: . : .. : : : : : : KIAA04 SRRSPASIDRQNTQSDIGGSGKSTPSWQRSEDSIADQMAYSYRGPQDFNSFVLEQHEYTE 1200 1210 1220 1230 1240 1250 980 990 1000 1010 1020 KIAA13 TKWHGPP-SKVLGSYKE----RALQKDGSCKDSPNKLSHIGDKSCSSHSSSNTLSSNTSS : : :::: ...: : ...: . :::: .: .:. ::::::::::::.:: KIAA04 PTCHLPAVSKVLPAFRESPSGRLMRQDPVVHLSPNKQGH-SDSHYSSHSSSNTLSSNASS 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1030 1040 1050 1060 1070 KIAA13 NSDDKHFGSGDLMDPELLGLTYIKGASTDSGIDTAPCMPA----TILG-----PVHLAGS .:... .:: . :: . .:..:.:.::::::. :. . :: : :. KIAA04 AHSDEKWYDGDRTESELNSYNYLQGTSADSGIDTTSYGPSHGSTASLGAATSSPRSGPGK 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1080 1090 1100 1110 1120 KIAA13 RS---LIHSRAE--QWAD---AADVSGPDDEPAKLYS--VHGYASAISAGSAAEGSMGDL .. : :: .: . :: .. : : . . : .:. ..: :. . :.: .. KIAA04 EKVAPLWHSSSEVISMADRTLETESHGLDRKTESSLSLDIHSKSQAGSTPLTRENSTFSI 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1130 1140 1150 1160 1170 KIAA13 SEISSHSS--GSHHSGSPSAHCSKSSGSLDSSKVYIVSHSSGQQVPG------SMSKP-- .. .::.: .:.::.:: . : : : : . . .: .:. : : : KIAA04 NDAASHTSTMSSRHSASPVVFTSARS----SPKEELHPAAPSQLAPSFSSSSSSSSGPRS 1440 1450 1460 1470 1480 1180 1190 1200 1210 1220 1230 KIAA13 -YHRQGAVNKYVIGWKKSEGSPPPEEPEVTECPGMYSEMDVMSTATQHQTVVGDAVAE-T : ::::..::.::::: ::. :. . . .. : . .: : . : KIAA04 FYPRQGATSKYLIGWKKPEGTINSVGFMDTRKRHQSDGNEIAHTRLRASTRDLRASPKPT 1490 1500 1510 1520 1530 1540 1240 1250 1260 1270 1280 KIAA13 QHVLSKEDFLKLMLPDSPLVEEGRRKFSFYGNLSP----------RRSLYRTLSDESICS .. .::. ::. .:: . :....:.:.. :: ::.:.:::::::: . KIAA04 SKSTIEEDLKKLIDLESP-TPESQKSFKFHALSSPQSPFPSTPTSRRALHRTLSDESIYN 1550 1560 1570 1580 1590 1600 1290 1300 1310 1320 1330 1340 KIAA13 NRRGSSFGSSRSSVLDQALPNDILFSTT-PPYHSTLPPRAHPAPSMG--SLRNEFWFSDG ..: : .::.:.::::::::.:::.: : ..:: : .:. ..: ::..:: ::. KIAA04 SQR-EHFFTSRASLLDQALPNDVLFSSTYPSLPKSLPLR-RPSYTLGMKSLHGEFSASDS 1610 1620 1630 1640 1650 1660 1350 1360 1370 1380 1390 KIAA13 SLSD-----KSKCADPGLMPLPDTATGLDWTHLVDAARAFEGLDSDEELGLLCHHTSYLD ::.: .. :::::::::::. :::..:::::.:.: ...:.. KIAA04 SLTDIQETRRQPMPDPGLMPLPDTAADLDWSNLVDAAKAYE-----------VQRASFFA 1670 1680 1690 1700 1710 1400 1410 1420 1430 1440 1450 KIAA13 QRVASFCTLTDMQHGQDLEGAQELPLCVDPGSGKEFMDTTGERSPSPLTGKVNQLELILR . :. .....:: : :: . : :.:. ::. :..::.::: .:. KIAA04 ASDENHRPLSAASNSDQLED-QALPQ-MKPYSSKD-------SSPT-LASKVDQLEGMLK 1720 1730 1740 1750 1760 1460 1470 1480 1490 1500 1510 KIAA13 QLQTDLRKEKQDKAVLQAEVQHLRQDNMRLQEESQTATAQLRKFTEWFFTTIDKKS .:. ::.:::.::: :::::::::.::.:::::::.:. .:.::::: :.::: KIAA04 MLREDLKKEKEDKAHLQAEVQHLREDNLRLQEESQNASDKLKKFTEWVFNTIDMS 1770 1780 1790 1800 1810 >>KIAA0545 ( 1368 res) hh00165s1 (1368 aa) initn: 3487 init1: 2587 opt: 3108 Z-score: 2235.0 bits: 426.1 E(): 2.2e-119 Smith-Waterman score: 3932; 50.393% identity (70.664% similar) in 1401 aa overlap (188-1506:1-1361) 160 170 180 190 200 210 KIAA13 QTQMPTGQTGNCESPLGSKEDLNSKENLDADEGDGKSNDLVLSCPYFRNETGGEGDRRIA : :: .::::.::::.:::: ::: .: .. KIAA05 DLGDDNSNDLLLSCPHFRNEIGGECERNVS 10 20 30 220 230 240 250 260 270 KIAA13 LSRANSSSFSSGESCSFESSLSSHCTNAGVSVLEVPRENQPIHREKVKRYIIEHIDLGAY .:::. .: ::::. : .::.. :::..::::::.:.: . . ..: :::.:::: KIAA05 FSRASVGSPSSGEGHLAEPALSAYRTNASISVLEVPKEQQRTQS-RPRQYSIEHVDLGAR 40 50 60 70 80 280 290 300 310 320 330 KIAA13 YYRKFFYGKEHQNYFGIDENLGPVAVSIRREKVEDAKEKEGSQFNYRVAFRTSELTTLRG ::. .: :::: ::::.::.::::::::.:::.:: ::. : :..::. ::: :: :::: KIAA05 YYQDYFVGKEHANYFGVDEKLGPVAVSIKREKLEDHKEH-GPQYQYRIIFRTRELITLRG 90 100 110 120 130 140 340 350 360 370 380 390 KIAA13 AILEDAIPSTARHGTARGLPLKEVLEYVIPELSIQCLRQASNSPKVSEQLLKLDEQGLSF .::::: :....:::.::::::..::::::::.:.::: : :.:::.::::::::::: KIAA05 SILEDATPTATKHGTGRGLPLKDALEYVIPELNIHCLRLALNTPKVTEQLLKLDEQGLCR 150 160 170 180 190 200 400 410 420 430 440 450 KIAA13 QHKIGILYCKAGQSTEEEMYNNETAGPAFEEFLDLLGQRVRLKGFSKYRAQLDNKTDSTG .::.::::::::::.:::::::: :::::::::.:.:..: ::::.:: :::: :::::: KIAA05 KHKVGILYCKAGQSSEEEMYNNEEAGPAFEEFLSLIGEKVCLKGFTKYAAQLDVKTDSTG 210 220 230 240 250 260 460 470 480 490 500 510 KIAA13 THSLYTTYKDYELMFHVSTLLPYMPNNRQQLLRKRHIGNDIVTIVFQEPGALPFTPKSIR :::::: :.:::.:::::::::: ::::::::::::::::::::.::::::::::::.:: KIAA05 THSLYTMYQDYEIMFHVSTLLPYTPNNRQQLLRKRHIGNDIVTIIFQEPGALPFTPKNIR 270 280 290 300 310 320 520 530 540 550 560 570 KIAA13 SHFQHVFVIVKVHNPCTENVCYSVGVSRSKDVPPFGPPIPKGVTFPKSAVFRDFLLAKVI :::::::.::.::::::.:::::..:.::::.::::::::.:.:: :: ::::::::::: KIAA05 SHFQHVFIIVRVHNPCTDNVCYSMAVTRSKDAPPFGPPIPSGTTFRKSDVFRDFLLAKVI 330 340 350 360 370 380 580 590 600 610 620 630 KIAA13 NAENAAHKSEKFRAMATRTRQEYLKDLAENFVTTATVDTSVKFSFITLGAKKKEKVKPRK :::::::::.::..:::::::::::::::: :... .:.. ::..:.: .:::::.: : KIAA05 NAENAAHKSDKFHTMATRTRQEYLKDLAENCVSNTPIDSTGKFNLISLTSKKKEKTKARA 390 400 410 420 430 440 640 650 660 670 680 690 KIAA13 DAHLFSIGAIMWHVIARDFGQSADIECLLGISNEFIMLIEKDSKNVVFNCSCRDVIGWTS :. : ::: :.:.:.:..:...:.:.:::::::..:.. .:.::::: : :::::: KIAA05 GAEQHSAGAIAWRVVAQDYAQGVEIDCILGISNEFVVLLDLRTKEVVFNCYCGDVIGWTP 450 460 470 480 490 500 700 710 720 730 740 750 KIAA13 GLVSIKVFYERGECVLLSSVDNCAEDIREIVQRLVIVTRGCETVEMTLRRNGLGQLGFHV ..:.:: ::. ..:..... .:::::::::: ..: : :::.::::::::::::::: KIAA05 DSSTLKIFYGRGDHIFLQATEGSVEDIREIVQRLKVMTSGWETVDMTLRRNGLGQLGFHV 510 520 530 540 550 560 760 770 780 790 800 810 KIAA13 NFEGIVADVEPFGFAWKAGLRQGSRLVEICKVAVATLTHEQMIDLLRTSVTVKVVIIQPH ...: ::.:: .::::.:::::::::::::::::.::::.::::::::::::::::: : KIAA05 KYDGTVAEVEDYGFAWQAGLRQGSRLVEICKVAVVTLTHDQMIDLLRTSVTVKVVIIPPF 570 580 590 600 610 620 820 830 840 850 860 870 KIAA13 DDGSPRRGCSELCRIPMVEYKLDSEGTPCEYKTPFRRNTTWHRVPTPALQ---PLSR-AS .::.:::: : . : : ..:. . :.: :. :. :: . : :. :. KIAA05 EDGTPRRGWPETYDMNTSEPKTEQESITPGGRPPYRSNAPWQW-SGPASHNSLPASKWAT 630 640 650 660 670 680 880 890 900 910 920 KIAA13 PI-PGTPDRL--PCQQL----LQQAQAA-IPRSTSFDRK----LPDGT-RSSPSNQSSSS : :: . : : .: ....: : .:: . : :. : : : :.: KIAA05 PTTPGHAQSLSRPLKQTPIVPFRESQPLHSKRPVSFPETPYTVSPAGADRVPPYRQPSGS 690 700 710 720 730 740 930 940 950 960 970 KIAA13 DPGPGGSGPWRPQVG---YDGCQSPLL-----LEHQG--SGPLECDGAREREDTMEASRH ::.. : . . : . ::: . :.: :: : .:.::: .. KIAA05 FSTPGSATYVRYKPSPERYTAAPHPLLSLDPHFSHDGTSSGDSSSGGLTSQESTMERQK- 750 760 770 780 790 800 980 990 1000 1010 1020 KIAA13 PETKWHGPP----SKVLGSYKER-ALQKDGSCKDSPNKLSHIGDKSCSSHSSSNTLSSN- :: :: : : . :: .. ..:.. :::::. :. :. . :::::::::::: KIAA05 PEPLWHVPAQARLSAIAGSSGNKHPSRQDAAGKDSPNRHSK-GEPQYSSHSSSNTLSSNA 810 820 830 840 850 860 1030 1040 1050 1060 KIAA13 TSSNSDDKHFGSGDLMDPELLGLTYIKGASTDSGIDT-----AP-CM----------PAT .::.:::. : : ..:: :. ::.:.:::::: .: :: : KIAA05 SSSHSDDRWFDPLDPLEPEQDPLS--KGGSSDSGIDTTLYTSSPSCMSLAKAPRPAKPHK 870 880 890 900 910 920 1070 1080 1090 1100 1110 1120 KIAA13 ILGPVHLAGSRSLIHSRAEQWADAADVSGPDDEPAKLYSVHGYASAI-SAGSAAEGSM-- : . : :. .:... :: .: :: . .:: . :.::.. .. KIAA05 PPGSMGLCGGGREAAGRSHH-ADRRREVSP--APAVAGQSKGYRPKLYSSGSSTPTGLAG 930 940 950 960 970 980 1130 1140 1150 1160 1170 1180 KIAA13 GDLSEISSHSSGSHHSGSPSAHCSKSSGSLDSSKVYIVSHSSGQQVPGSMSKPYH-RQGA :. . . :. . . : : :. :.. : .. . ... : :. .:. : . .: . KIAA05 GSRDPPRQPSDMGSRVGYP-AQVYKTA-SAETPRPSQLAQPSPFQLSASVPKSFFSKQPV 990 1000 1010 1020 1030 1190 1200 1210 1220 1230 1240 KIAA13 VNKYVIGWKKSEGSPPPEEPEVTECPGMYSEMDVMSTATQHQTVVG--DAVAETQHVLS- ::. :::..: :::. : : . .. .. : . .. : . .. : KIAA05 RNKHPTGWKRTE-EPPPR-PLPFSDPKKQVDTNTKNVFGQPRLRASLRDLRSPRKNYKST 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1250 1260 1270 1280 1290 1300 KIAA13 -KEDFLKLMLPDSPLVEEGRRKFSFYGNLSPRRSLYRTLSDESICSNRRGSSFGSSRSSV ..:. ::.. :. : : .: :. ::...: :::::::.::.:: ::.: . KIAA05 IEDDLKKLIIMDN-LGPEQERDT---GQ-SPQKGLQRTLSDESLCSGRREPSFASPAG-- 1100 1110 1120 1130 1140 1310 1320 1330 1340 KIAA13 LDQALPNDILFSTTPPY-HSTLPPR---AHPAPSMGS------------LRNEFWFSDGS :. .::.:.::..: . :::: : :: : .: .. . :. : KIAA05 LEPGLPSDVLFTSTCAFPSSTLPARRQHQHPHPPVGPGATPAAGSGFPEKKSTISASELS 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1350 1360 1370 1380 1390 1400 KIAA13 LSDKS----KCADPGLMPLPDTATGLDWTHLVDAARAFEGLDSDEELGLLCHHTSYLDQR :.: . :::::::::::.::.:. ::.::.:.: :: KIAA05 LADGRDRPLRRLDPGLMPLPDTAAGLEWSSLVNAAKAYEV------------------QR 1210 1220 1230 1240 1250 1410 1420 1430 1440 1450 KIAA13 VASFCTLTDMQHGQDLEGAQ-----ELPLCVDPGSGKEFMDTTGERSPSPLTGKVNQLEL ..:. .:.: . :. :. .: : : . . : .:. : ::::: :::. KIAA05 AVSLFSLNDPALSPDIPPAHSPVHSHLSLERGPPTPRT-TPTMSEEPPLDLTGKVYQLEV 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1460 1470 1480 1490 1500 1510 KIAA13 ILRQLQTDLRKEKQDKAVLQAEVQHLRQDNMRLQEESQTATAQLRKFTEWFFTTIDKKS .:.::.:::.::::::.:::.:: :::.:.:::::::.:. :::::.: : KIAA05 MLKQLHTDLQKEKQDKVVLQSEVASLRQNNQRLQEESQAASEQLRKFAEIFCREKKEL 1320 1330 1340 1350 1360 >>KIAA0474 ( 782 res) fj12051 (782 aa) initn: 772 init1: 422 opt: 676 Z-score: 494.3 bits: 103.2 E(): 2e-22 Smith-Waterman score: 754; 36.842% identity (67.036% similar) in 361 aa overlap (249-608:164-502) 220 230 240 250 260 270 KIAA13 SRANSSSFSSGESCSFESSLSSHCTNAGVSVLEVPRENQPIHREKVKRYIIEHIDLGAYY . .: :..:.. .: . . . : KIAA04 VHEVLGREGPFPLILLPQFGGYWIEGTNHEITSIP-ETEPLQSPTTK--VKLECNPTARI 140 150 160 170 180 190 280 290 300 310 320 330 KIAA13 YRKFFYGKEHQNYFGIDENLGPVAVSIRREKVEDAKEKEGSQFNYRVAFRTSELTTLRGA ::: : :::: ::...: :: .. :.. . . :.: . :. .::. : KIAA04 YRKHFLGKEHFNYYSLDAALGHLVFSLKYDVI-------GDQEHLRLLLRTKCRT----- 200 210 220 230 340 350 360 370 380 390 KIAA13 ILEDAIPSTARHGTARGLP-LKEVLEYVIPELSIQCLRQASNSPKVSEQLLKLDEQGLSF .:.:: . .: . .. . : ..... . . ::.:. .. .::. .: KIAA04 -YHDVIPISC----LTEFPNVVQMAKLVCEDVNVDRFYPVLY-PKASRLIVTFDEHVISN 240 250 260 270 280 290 400 410 420 430 440 450 KIAA13 QHKIGILYCKAGQSTEEEMYNNETAGPAFEEFLDLLGQRVRLKGFSKYRAQLDNKTDSTG . :.:..: : ::..:::..... .::: :::..:::.:.:. :. .:. :: .:: KIAA04 NFKFGVIYQKLGQTSEEELFSTNEESPAFVEFLEFLGQKVKLQDFKGFRGGLDVTHGQTG 300 310 320 330 340 350 460 470 480 490 500 510 KIAA13 THSLYTTYKDYELMFHVSTLLPYMPNNRQQLLRKRHIGNDIVTIVFQEPGALPFTPKSIR :.:.: .... :.:::::: ::: .. ::: ::::::::::..:::. .. ::.: : KIAA04 TESVYCNFRNKEIMFHVSTKLPYTEGDAQQLQRKRHIGNDIVAVVFQDENT-PFVPDMIA 360 370 380 390 400 410 520 530 540 550 560 570 KIAA13 SHFQHVFVIVKVHNPCTENVCYSVGVSRSKDVPPFGPPIPKGVTFPKSAVFRDFLLAKVI :.: :..:.:.... .. :.:.:. ::: ::::.: ..: :. :..:::.:.: KIAA04 SNFLHAYVVVQAEGGGPDGPLYKVSVTARDDVPFFGPPLPDPAVFRKGPEFQEFLLTKLI 420 430 440 450 460 470 580 590 600 610 620 630 KIAA13 NAENAAHKSEKFRAMATRTRQEYLKDLAENFVTTATVDTSVKFSFITLGAKKKEKVKPRK ::: : .:.::: . ::: :. : :.. KIAA04 NAEYACYKAEKFAKLEERTRAALLETLYEELHIHSQSMMGLGGDEDKMENGSGGGGFFES 480 490 500 510 520 530 640 650 660 670 680 690 KIAA13 DAHLFSIGAIMWHVIARDFGQSADIECLLGISNEFIMLIEKDSKNVVFNCSCRDVIGWTS KIAA04 FKRVIRSRSQSMDAMGLSNKKPNTVSTSHSGSFAPNNPDLAKAAGISLLIPGKSASRFGR 540 550 560 570 580 590 >>KIAA1039 ( 444 res) fh02337 (444 aa) initn: 630 init1: 311 opt: 598 Z-score: 441.4 bits: 92.6 E(): 1.8e-19 Smith-Waterman score: 598; 49.727% identity (75.956% similar) in 183 aa overlap (426-608:1-182) 400 410 420 430 440 450 KIAA13 SFQHKIGILYCKAGQSTEEEMYNNETAGPAFEEFLDLLGQRVRLKGFSKYRAQLDNKTDS :.:::::::. . :. :. .:. :: . 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