# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fj04709.fasta.nr -Q ../query/KIAA1377.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1377, 988 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7826425 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5976+/-0.000187; mu= 11.4925+/- 0.010 mean_var=88.3207+/-16.990, 0's: 32 Z-trim: 39 B-trim: 148 in 2/66 Lambda= 0.136472 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|193787767|dbj|BAG52970.1| unnamed protein produ (1073) 6412 1273.3 0 gi|114640039|ref|XP_001150420.1| PREDICTED: hypoth (1068) 6180 1227.7 0 gi|114640035|ref|XP_508716.2| PREDICTED: hypotheti (1112) 6180 1227.7 0 gi|114640037|ref|XP_001150291.1| PREDICTED: hypoth (1101) 6084 1208.8 0 gi|194382954|dbj|BAG59033.1| unnamed protein produ ( 918) 5960 1184.3 0 gi|109108430|ref|XP_001095649.1| PREDICTED: hypoth (1116) 5952 1182.8 0 gi|73955242|ref|XP_546552.2| PREDICTED: hypothetic (1114) 3130 627.2 1.4e-176 gi|148693007|gb|EDL24954.1| mCG121542 [Mus musculu (1108) 2822 566.5 2.5e-158 gi|149259487|ref|XP_001475067.1| PREDICTED: simila (1118) 2822 566.5 2.5e-158 gi|109483054|ref|XP_235805.4| PREDICTED: similar t (1332) 1796 364.6 1.8e-97 gi|157422834|gb|AAI53359.1| LOC100127586 protein [ ( 573) 309 71.5 1.3e-09 gi|157888661|emb|CAP09556.1| novel protein [Danio (1060) 292 68.4 2.1e-08 gi|189531827|ref|XP_689978.3| PREDICTED: hypotheti (1061) 292 68.4 2.1e-08 gi|189532051|ref|XP_001339875.2| PREDICTED: si:ch2 (1059) 289 67.8 3.2e-08 gi|148725802|emb|CAK04256.2| novel protein [Danio (1061) 289 67.8 3.2e-08 gi|146144392|gb|EAS01433.2| cyclic nucleotide-bind (1645) 212 52.8 0.0016 gi|190346606|gb|EDK38732.2| hypothetical protein P (1432) 202 50.8 0.0058 gi|50419075|ref|XP_458060.1| hypothetical protein (2042) 200 50.5 0.01 >>gi|193787767|dbj|BAG52970.1| unnamed protein product [ (1073 aa) initn: 6412 init1: 6412 opt: 6412 Z-score: 6819.0 bits: 1273.3 E(): 0 Smith-Waterman score: 6412; 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