# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fj02442.fasta.huge -Q ../query/KIAA1364.ptfa ./tmplib.24314 2
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

 KIAA1364, 811 aa
 vs ./tmplib.24314 library

1986694 residues in  2037 sequences
  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9452+/-0.00544; mu= 11.1047+/- 0.370
 mean_var=116.6772+/-27.480, 0's: 0 Z-trim: 5  B-trim: 0 in 0/40
 Lambda= 0.118736

FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width:  16
The best scores are:                                      opt bits E(2037)
KIAA0750  ( 1125 res)   hk04329                    (1125) 2504 440.5 4.6e-124
KIAA0302  ( 2414 res)   hf00409s2                  (2414)  333 68.9   7e-12
KIAA0903  ( 962 res)   hk09970                     ( 962)  324 67.0 1.1e-11
KIAA1668  ( 791 res)   fh11717                     ( 791)  244 53.2 1.2e-07


>>KIAA0750  ( 1125 res)   hk04329                         (1125 aa)
 initn: 2850 init1: 1778 opt: 2504  Z-score: 2319.2  bits: 440.5 E(): 4.6e-124
Smith-Waterman score: 2521;  48.898% identity (62.539% similar) in 953 aa overlap (1-733:167-1110)

                                             10        20        30
KIAA13                               LLKVALILGIEIHVNVEFQGLIQPPEDQEN
                                     :.::::.::.::::::::  ...:::::::
KIAA07 DLRGLGAKKFYGKFCAGSIDHISIRQLQLILFKVALMLGVEIHVNVEFVKVLEPPEDQEN
        140       150       160       170       180       190      

               40        50        60        70        80        90
KIAA13 ERIGWRALVHPKTHPVSEYEFEVIIGGDGRRNTLEGFRRKEFRGKLAIAITANFINRNTT
       ..:::::   :  : .::.::.::::.:::::::::::::::::::::::::::::::.:
KIAA07 QKIGWRAEFLPTDHSLSEFEFDVIIGADGRRNTLEGFRRKEFRGKLAIAITANFINRNST
        200       210       220       230       240       250      

              100       110       120       130       140       150
KIAA13 AEAKVEEISGVAFIFNQKFFQELREATGIDLENIVYYKDDTHYFVMTAKKQSLLDKGVIL
       :::::::::::::::::::::.:.: ::::::::::::: :::::::::::::::::::.
KIAA07 AEAKVEEISGVAFIFNQKFFQDLKEETGIDLENIVYYKDCTHYFVMTAKKQSLLDKGVII
        260       270       280       290       300       310      

              160       170       180       190       200       210
KIAA13 HDYADTELLLSRENVDQEALLSYAREAADFSTQQQLPSLDFAINHYGQPDVAMFDFTCMY
       .:: :::.::  :::.:. :::::::::::.:. ::::::::.:::::::::::::::::
KIAA07 NDYIDTEMLLCAENVNQDNLLSYAREAADFATNYQLPSLDFAMNHYGQPDVAMFDFTCMY
        320       330       340       350       360       370      

              220       230       240       250       260       270
KIAA13 ASENAALVREQNGHQLLVALVGDSLLEPFWPMGTGIARGFLAAMDSAWMVRSWSLGTSPL
       ::::::::::...:::::::::::::::::::::: :::::::.:.::::.::. :: ::
KIAA07 ASENAALVRERQAHQLLVALVGDSLLEPFWPMGTGCARGFLAAFDTAWMVKSWNQGTPPL
        380       390       400       410       420       430      

              280       290       300       310       320       330
KIAA13 EVLAERESIYRLLPQTTPENVSKNFSQYSIDPVTRYPNINVNFLRPSQVRHLYDTGETKD
       :.::::::.:::::::::::..::: ::..:: :::::.: . .:: ::.::: : : . 
KIAA07 ELLAERESLYRLLPQTTPENINKNFEQYTLDPGTRYPNLNSHCVRPHQVKHLYITKELE-
        440       450       460       470       480       490      

              340       350       360       370       380       390
KIAA13 IHLEMESLVNSRTTPKLTRNESVARSSKLLGWCQRQTDGYAGVNVTDLTMSWKSGLALCA
        :  .: : . : . .:.:.::  : :::: :::.::.::  ::::::: ::.:::::::
KIAA07 -HYPLERLGSVRRSVNLSRKESDIRPSKLLTWCQQQTEGYQHVNVTDLTTSWRSGLALCA
          500       510       520       530       540       550    

              400       410       420       430       440       450
KIAA13 IIHRYRPDLIDFDSLDEQNVEKNNQLAFDIAEKELGISPIMTGKEMASVGEPDKLSMVMY
       ::::.::.::.::::.:... .:::::::.::.:.:: :. :::::::. ::::::::::
KIAA07 IIHRFRPELINFDSLNEDDAVENNQLAFDVAEREFGIPPVTTGKEMASAQEPDKLSMVMY
          560       570       580       590       600       610    

              460        470       480       490       500         
KIAA13 LTQFYEMFKDS-LPSSDTLDLNAEEKAVLIASTRSPISFLSKLGQTISRKRSPK-DKKEK
       :..:::.:. . :   :.   :  :.: : . ..: ::  . :. :. :::.:. : .  
KIAA07 LSKFYELFRGTPLRPVDSWRKNYGENADL-SLAKSSISN-NYLNLTFPRKRTPRVDGQTG
          620       630       640        650        660       670  

      510       520       530       540       550       560        
KIAA13 DLDGAGKRRKTSQSEEEEAPRGHRGERPTLVSTLTDRRMDVAVGNQNKVKYMATQLLAKF
       . :   .:::   . .: .  . :.     ...  .   .   ::::::: ::.::::::
KIAA07 ENDMNKRRRKGFTNLDEPSNFSSRS-----LGSNQECGSSKEGGNQNKVKSMANQLLAKF
            680       690            700       710       720       

      570                                              580         
KIAA13 EENA---------------------------------------PAQSIGIRRQ-------
       ::..                                       :. :  ..::       
KIAA07 EESTRNPSLMKQERRVSGIGKPVLCSSSGPPVHSCCPKPEEATPSPSPPLKRQFPSVVVT
       730       740       750       760       770       780       

               590         600                                     
KIAA13 ---LTQERGASQPSCCL--PGQVR----------------PAPTPR--------WK----
          : . . .:  : ::  : ..:                :.  ::        :.    
KIAA07 GHVLRELKQVSAGSECLSRPWRARAKSDLQLGGTENFATLPSTRPRAQALSGVLWRLQQV
       790       800       810       820       830       840       

                                                  610              
KIAA13 ---------------------------------------------QG-------------
                                                    .:             
KIAA07 EEKILQKRAQNLANREFHTKNIKEKAAHLASMFGHGDFPQNKLLSKGLSHTHPPSPPSRL
       850       860       870       880       890       900       

                                                                   
KIAA13 ------------------------------------------------------------
                                                                   
KIAA07 PSPDPAASSSPSTVDSASPARKEKKSPSGFHFHPSHLRTVHPQLTVGKVSSGIGAAAEVL
       910       920       930       940       950       960       

                                 620       630       640       650 
KIAA13 --------------------SMKKEFPQNLGGSDTCYFCQKRVYVMERLSAEGKFFHRSC
                           ::.: :: :::::::::::.:::::::::::::.:::: :
KIAA07 VNLYMNDHRPKAQATSPDLESMRKSFPLNLGGSDTCYFCKKRVYVMERLSAEGHFFHREC
       970       980       990      1000      1010      1020       

             660       670       680       690        700       710
KIAA13 FKCEYCATTLRLSAYAYDIEDGKFYCKPHYCYRLSGYAQRKRPA-VAPLSGKEAKGPLQD
       :.:  :::::::.::..: ..::::::::. .  ..  :::: : .     .::    :.
KIAA07 FRCSICATTLRLAAYTFDCDEGKFYCKPHFIHCKTNSKQRKRRAELKQQREEEATWQEQE
      1030      1040      1050      1060      1070      1080       

              720       730       740       750       760       770
KIAA13 GATTDANGRANAVASSTERTPGSGVNGLEEPSIAKRLRGTPERIELENYRLSLRQAEALQ
       .   :.  ... ....     ::                                     
KIAA07 APRRDTPTESSCAVAAIGTLEGSPPVHFSLPVLHPLLG                      
      1090      1100      1110      1120                           

>>KIAA0302  ( 2414 res)   hf00409s2                       (2414 aa)
 initn: 343 init1: 280 opt: 333  Z-score: 305.1  bits: 68.9 E(): 7e-12
Smith-Waterman score: 333;  43.363% identity (78.761% similar) in 113 aa overlap (348-458:193-304)

       320       330       340       350         360       370     
KIAA13 QVRHLYDTGETKDIHLEMESLVNSRTTPKLTRNESVARSSK--LLGWCQRQTDGYAGVNV
                                     :....  .:.:  :: ::: .: :: .:::
KIAA03 HDIVDGNHRLTLGLVWTIILRFQIQDISVETEDNKEKKSAKDALLLWCQMKTAGYPNVNV
            170       180       190       200       210       220  

         380       390       400       410       420       430     
KIAA13 TDLTMSWKSGLALCAIIHRYRPDLIDFDSLDEQNVEKNNQLAFDIAEKELGISPIMTGKE
        ..: ::..:::. ::.:..::::.::.:: . :.. : : ::..::::::.. ..  ..
KIAA03 HNFTTSWRDGLAFNAIVHKHRPDLLDFESLKKCNAHYNLQNAFNLAEKELGLTKLLDPED
            230       240       250       260       270       280  

         440       450       460       470       480       490     
KIAA13 MASVGEPDKLSMVMYLTQFYEMFKDSLPSSDTLDLNAEEKAVLIASTRSPISFLSKLGQT
       . .: .::. :.. :.. .:..:                                     
KIAA03 V-NVDQPDEKSIITYVATYYHYFSKMKALAVEGKRIGKVLDHAMEAERLVEKYESLASEL
             290       300       310       320       330       340 

>>KIAA0903  ( 962 res)   hk09970                          (962 aa)
 initn: 348 init1: 257 opt: 324  Z-score: 301.9  bits: 67.0 E(): 1.1e-11
Smith-Waterman score: 324;  40.870% identity (76.522% similar) in 115 aa overlap (344-458:167-278)

           320       330       340       350       360       370   
KIAA13 LRPSQVRHLYDTGETKDIHLEMESLVNSRTTPKLTRNESVARSSKLLGWCQRQTDGYAGV
                                     .: : :. ....:  :: ::.. : .: ::
KIAA09 VLSPKTGVLNENTVSAGKDLSTSPKPSPIPSPVLGRKPNASQS--LLVWCKEVTKNYRGV
        140       150       160       170         180       190    

           380       390       400       410       420       430   
KIAA13 NVTDLTMSWKSGLALCAIIHRYRPDLIDFDSLDEQNVEKNNQLAFDIAEKELGISPIMTG
       ..:..: ::..::..:::.:..::::::. ::. :....::. :.: .   .::: ..  
KIAA09 KITNFTTSWRNGLSFCAILHHFRPDLIDYKSLNPQDIKENNKKAYD-GFASIGISRLLEP
          200       210       220       230       240        250   

           440       450       460       470       480       490   
KIAA13 KEMASVGEPDKLSMVMYLTQFYEMFKDSLPSSDTLDLNAEEKAVLIASTRSPISFLSKLG
       ..:. .. ::::... :: :.   :                                   
KIAA09 SDMVLLAIPDKLTVMTYLYQIRAHFSGQELNVVQIEENSSKSTYKVGNYETDTNSSVDQE
           260       270       280       290       300       310   

>>KIAA1668  ( 791 res)   fh11717                          (791 aa)
 initn: 329 init1: 217 opt: 244  Z-score: 228.9  bits: 53.2 E(): 1.2e-07
Smith-Waterman score: 245;  28.889% identity (54.444% similar) in 180 aa overlap (588-755:42-219)

       560       570       580       590           600         610 
KIAA13 KYMATQLLAKFEENAPAQSIGIRRQLTQERGASQP----SCCLPGQVRPAP--TPRWKQG
                                     :.: :    . : : .: :.:  .    ::
KIAA16 DMVSMSVPDCLSIMTYVSQYYNHFCSPGQAGVSPPRKGLAPCSPPSVAPTPVESEDVAQG
              20        30        40        50        60        70 

                620         630       640       650       660      
KIAA13 ---SMKKEFPQNLGG--SDTCYFCQKRVYVMERLSAEGKFFHRSCFKCEYCATTLRLSAY
          :  .   :. :   :.::  ::..:....:  :.:...:: ::.:. :..::  .::
KIAA16 EELSSGSLSEQGTGQTPSSTCAACQQHVHLVQRYLADGRLYHRHCFRCRRCSSTLLPGAY
              80        90       100       110       120       130 

        670       680        690       700       710       720     
KIAA13 AYDIEDGKFYCKPHYCYRLS-GYAQRKRPAVAPLSGKEAKGPLQDGATTDANGRANAVAS
           :.: : :  : : ::. :  .  ::.      .. .  : . :    .:  .. : 
KIAA16 ENGPEEGTFVCAEH-CARLGPGTRSGTRPGPFSQPKQQHQQQLAEDAKDVPGGGPSSSAP
             140        150       160       170       180       190

         730       740       750       760       770       780     
KIAA13 STERTPGSGVNGLEEPSIAKRLRGTPERIELENYRLSLRQAEALQEVPEETQAEHNLSSV
       .  .. :  ..   .:.:  . : .: ...                              
KIAA16 AGAEADGPKASPEARPQIPTKPR-VPGKLQELASPPAGRPTPAPRKASESTTPAPPTPRP
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811 residues in 1 query   sequences
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