# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fj00739.fasta.huge -Q ../query/KIAA1347.ptfa ./tmplib.24314 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1347, 918 aa vs ./tmplib.24314 library 1986587 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.7031+/-0.00447; mu= 15.3248+/- 0.304 mean_var=76.8815+/-18.305, 0's: 0 Z-trim: 10 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.146273 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0703 ( 1051 res) hg02861(revised) (1051) 3927 839.3 0 KIAA0778 ( 1049 res) fh12074 (1049) 519 120.1 1.4e-27 KIAA1825 ( 1203 res) fj04975 (1203) 207 54.3 1e-07 KIAA1487 ( 650 res) fj07249 ( 650) 140 39.9 0.0012 KIAA0715 ( 1498 res) pf08610 (1498) 140 40.3 0.0021 >>KIAA0703 ( 1051 res) hg02861(revised) (1051 aa) initn: 3495 init1: 1509 opt: 3927 Z-score: 4473.9 bits: 839.3 E(): 0 Smith-Waterman score: 3927; 66.815% identity (87.791% similar) in 901 aa overlap (15-907:153-1047) 10 20 30 40 KIAA13 RLHVFKKIPNGENETMIPVLTSKKASELPVSEVASIL--QADLQ .. :: . : :.::.. : :.::. 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KIAA07 QYGRGQGVVIGTGESSQFGEVFKMMQAEETPKTPLQKSMDRLGKQLTLFSFGIIGLIMLI 360 370 380 390 400 410 290 300 310 320 330 340 KIAA13 GWLLGKDILEMFTISVSLAVAAIPEGLPIVVTVTLALGVMRMVKKRAIVKKLPIVETLGC :: ::..: ::::.:::::::::::::::: :::.:::.::.:::.::::::::::::: KIAA07 GWSQGKQLLSMFTIGVSLAVAAIPEGLPIVVMVTLVLGVLRMAKKRVIVKKLPIVETLGC 420 430 440 450 460 470 350 360 370 380 390 400 KIAA13 CNVICSDKTGTLTKNEMTVTHIFTSDGLHAEVTGVGYNQFGEVIV--DGDVVHGFYNPAV :.:.::::::::: ::::::.. :::::.:::.::::. : : . . .:.. : : .: KIAA07 CSVLCSDKTGTLTANEMTVTQLVTSDGLRAEVSGVGYDGQGTVCLLPSKEVIKEFSNVSV 480 490 500 510 520 530 410 420 430 440 450 460 KIAA13 SRIVEAGCVCNDAVIRNNTLMGKPTEGALIALAMKMGLDGLQQDYIRKAEYPFSSEQKWM ...:::::: :.::::.:..::.::::::.:::::: :. ....:::: : ::::::::: KIAA07 GKLVEAGCVANNAVIRKNAVMGQPTEGALMALAMKMDLSDIKNSYIRKKEIPFSSEQKWM 540 550 560 570 580 590 470 480 490 500 510 520 KIAA13 AVKCVHRTQQDRPEICFMKGAYEQVIKYCTTYQSKGQTLTLTQQQRDVYQQEKARMGSAG :::: .:. :. .: ::::: :.::.::: :.. : : :: :::. ::. :::: : KIAA07 AVKCSLKTE-DQEDIYFMKGALEEVIRYCTMYNNGGIPLPLTPQQRSFCLQEEKRMGSLG 600 610 620 630 640 650 530 540 550 560 570 580 KIAA13 LRVLALASGPELGQLTFLGLVGIIDPPRTGVKEAVTTLIASGVSIKMITGDSQETAVAIA :::::::::::::.::::::::::::::.:::::: .: ::::.::::::. :::.::. 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KIAA07 PPRSVRDTILSRALILKILMSAAIIISGTLFIFWKEMPEDRASTPRTTTMTFTCFVFFDL 900 910 920 930 940 950 820 830 840 850 860 870 KIAA13 FNALSSRSQTKSVFEIGLCSNRMFCYAVLGSIMGQLLVIYFPPLQKVFQTESLSILDLLF ::::. ::::: .::::. :.:: :.:::::.::: :::.::::.:::::.:. ::::: KIAA07 FNALTCRSQTKLIFEIGFLRNHMFLYSVLGSILGQLAVIYIPPLQRVFQTENLGALDLLF 960 970 980 990 1000 1010 880 890 900 910 KIAA13 LLGLTSSVCIVAEIIKKVER---SREKIQKHVSSTSSSFLEV : ::.::: :..:..: :. : ...: : KIAA07 LTGLASSVFILSELLKLCEKYCCSPKRVQMHPEDV 1020 1030 1040 1050 >>KIAA0778 ( 1049 res) fh12074 (1049 aa) initn: 1119 init1: 471 opt: 519 Z-score: 587.1 bits: 120.1 E(): 1.4e-27 Smith-Waterman score: 1300; 32.075% identity (63.797% similar) in 848 aa overlap (27-804:72-906) 10 20 30 40 50 KIAA13 RLHVFKKIPNGENETMIPVLTSKKASELPVSEVASILQADLQNGLNKCEVSHRRAF .: ..:.. :.::..::.. ... : KIAA07 ATTAENGGGKKKQKEKELDELKKEVAMDDHKLSLDELGRKYQVDLSKGLTNQRAQDVLAR 50 60 70 80 90 100 60 70 80 90 100 KIAA13 HGWNEFDISEDEPLWKKYISQFKNPLIMLLLASAVISVLMHQFDDAV-----------SI : : . : : :. :. . . .:: .:.. : . .. :. .. KIAA07 DGPNALTPPPTTPEWVKFCRQLFGGFSILLWIGAILCFLAYGIQAAMEDEPSNDNLYLGV 110 120 130 140 150 160 110 120 130 140 150 160 KIAA13 TVAILIVVT--VAFVQEYRSEKSLEELSKLVPPECHCVREGKLEHTLARDLVPGDTVCLS ..: ...:: .. :: .: : .. ....:: . .:::. . :...: :: : .. KIAA07 VLAAVVIVTGCFSYYQEAKSSKIMDSFKNMVPQQALVIREGEKMQINAEEVVVGDLVEVK 170 180 190 200 210 220 170 180 190 200 210 220 KIAA13 VGDRVPADLRLFEAVDLSIDESSLTGETTPCSKVTAPQPAATNGDLASRSNIAFMGTLVR :::::::::.. . ..:.::::::. : .. .:. . : : .: :: :..: KIAA07 GGDRVPADLRIISSHGCKVDNSSLTGESEPQTR--SPEFTHEN-PLETR-NICFFSTNCV 230 240 250 260 270 230 240 250 260 270 280 KIAA13 CGKAKGVVIGTGENSEFGEVFKMMQAEEAPKTPLQKSMDLLGKQLSFYSFGIIGIIMLV- : :.:.::.::. . .:.. . .. :. .::. .. . . .. . ..:. ..: KIAA07 EGTARGIVIATGDRTVMGRIATLASGLEVGRTPIAMEIEHFIQLITGVAV-FLGVSFFVL 280 290 300 310 320 330 290 300 310 320 330 340 KIAA13 GWLLGKDILEMFTISVSLAVAAIPEGLPIVVTVTLALGVMRMVKKRAIVKKLPIVETLGC . .:: . :: . ... :: .:::: .::: :.: . ::..: .::.: ::::: KIAA07 SLILGYSWLEAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNCLVKNLEAVETLGS 340 350 360 370 380 390 350 360 370 380 390 KIAA13 CNVICSDKTGTLTKNEMTVTHIFTSDGLH-AEVT----GVGYNQFGEVIVDGDVVHGFYN ..::::::::::.:.:::.:.. .. .: :..: :. ... . . . . . :. : KIAA07 TSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTEDQSGATFDKRSPTWTALSRIAGLCN 400 410 420 430 440 450 400 410 420 430 440 450 KIAA13 PAVSRIVEAGCVCNDAVIRNNTLMGKPTEGALIA-LAMKMGLDGLQQDYIRK-AEYPFSS :: . :: : .: . .: : .:.::. . .. : ..: : :: ::.: KIAA07 RAVFK---AGQE-NISVSKRDT-AGDASESALLKCIELSCGSVRKMRDRNPKVAEIPFNS 460 470 480 490 500 510 460 470 480 490 500 510 KIAA13 EQKWMAVKCVHRTQQDRPE--ICFMKGAYEQVIKYCTTYQSKGQTLTLTQQQRDVYQQEK .:.. .:. ..: :. . :::: :... :.: .:. . : ....:..:. KIAA07 TNKYQL--SIHE-REDSPQSHVLVMKGAPERILDRCSTILVQGKEIPLDKEMQDAFQNAY 520 530 540 550 560 520 530 540 550 KIAA13 ARMGSAGLRVLA-----LASG--P--------ELG----QLTFLGLVGIIDPPRTGVKEA ..:. : :::. : :: : ::. .: :.::...:::::..: .: KIAA07 MELGGLGERVLGFCQLNLPSGKFPRGFKFDTDELNFPTEKLCFVGLMSMIDPPRAAVPDA 570 580 590 600 610 620 560 570 580 590 KIAA13 VTTLIASGVSIKMITGDSQETAVAIASRLGLYSKTSQSVS-------------------- : ..:... :.::: :: :::. .:. :. ...: KIAA07 VGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAARLNIPMSQVNPREAKA 630 640 650 660 670 680 600 610 620 630 640 KIAA13 ----GEEIDAMDVQQLSQIVPKVA--VFYRASPRHKMKIIKSLQKNGSVVAMTGDGVNDA : .. : .::..:. . . :: :.::..:. :... :..:..::.:::::::. KIAA07 CVVHGSDLKDMTSEQLDEILKNHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVAVTGDGVNDS 690 700 710 720 730 740 650 660 670 680 690 700 KIAA13 VALKAADIGVAMGQTGTDVCKEAADMILVDDDFQTIMSAIEEGKGIYNNIKNFVRFQLST ::: ::::.::: .:.:: :.::::::.::.: .:....:::. :..:.:. . . :.. KIAA07 PALKKADIGIAMGISGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIAYTLTS 750 760 770 780 790 800 710 720 730 740 750 760 KIAA13 SIAALTLISLATLMNFPNPLNAMQILWINIIMDGPPAQSLGVEPVDKDVIRKPPRNWKDS .: .: . : . :.: ::... :: :.. : :: ::. : ...:.... ::: . . KIAA07 NIPEITPFLLFIIANIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEAAESDIMKRQPRNSQTD 810 820 830 840 850 860 770 780 790 800 810 820 KIAA13 ILTKNLILKILVSSIIIV--CGTLFVFWRELRDNVITPRDTTMTFTCFVFFDMFNALSSR :... .... ..: .. : .:... : .: . : KIAA07 KLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFTYFVILAENGFLPSRLLGIRLDWDDRTMNDLEDSY 870 880 890 900 910 920 830 840 850 860 870 880 KIAA13 SQTKSVFEIGLCSNRMFCYAVLGSIMGQLLVIYFPPLQKVFQTESLSILDLLFLLGLTSS KIAA07 GQEWTYEQRKVVEFTCHTAFFASIVVVQWADLIICKTRRNSVFQQGMKNKILIFGLLEET 930 940 950 960 970 980 >>KIAA1825 ( 1203 res) fj04975 (1203 aa) initn: 370 init1: 200 opt: 207 Z-score: 230.6 bits: 54.3 E(): 1e-07 Smith-Waterman score: 327; 24.316% identity (49.392% similar) in 658 aa overlap (106-660:268-880) 80 90 100 110 120 130 KIAA13 SQFKNPLIMLLLASAVISVLMHQFDDAVSITVAILIVVTVAFVQEYRSEKSLEELSKL-- :...:.. ...::. . ... :. :. KIAA18 KERATAPFFVFQVFCVGLWCLDEYWYYSVFTLSMLVAFEASLVQQ--QMRNMSEIRKMGN 240 250 260 270 280 290 140 150 160 170 180 KIAA13 VPPECHCVREGKLEHTLARDLVPGDTVCLSVG-----DRVPADLRLFEAVDLSIDESSLT : . : : . . ..:::: : :.: . :: :. :... . .::. :: KIAA18 KPHMIQVYRSRKWRPIASDEIVPGDIV--SIGRSPQENLVPCDVLLLRGRCI-VDEAMLT 300 310 320 330 340 350 190 200 210 220 230 KIAA13 GETTPCSK--VTAPQPA-ATNGDLASRSNIAFMGTLVRCG----KA----KGV------- ::..: : . .: . . . :: .. : :: : :: : : KIAA18 GESVPQMKEPIEDLSPDRVLDLQADSRLHVIFGGTKVVQHIPPQKATTGLKPVDSGCVAY 360 370 380 390 400 410 240 250 260 270 280 KIAA13 VIGTGENSEFGEVFKMMQAEEAPKTPLQKSMDLLGKQLSFYSFGIIGIIMLVGWLLG-KD :. :: :. :.... . . : .... . : . :.: . .. :. : :: KIAA18 VLRTGFNTSQGKLLRTILF--GVKRVTANNLETFIFILFLLVFAIAAAAYV--WIEGTKD 420 430 440 450 460 290 300 310 320 330 340 KIAA13 I----LEMFTISVSLAVAAIPEGLPIVVTVTLALGVMRMVKKRAIVKKLPIVETLGCCNV ..: . . ....: ::: ..... ... ..: . . : .: KIAA18 PSRNRYKLFLECTLILTSVVPPELPIELSLAVNTSLIALAKLYMYCTEPFRIPFAGKVEV 470 480 490 500 510 520 350 360 370 380 390 400 KIAA13 ICSDKTGTLTKNEMTVTHIF-TSDGLHAEVTGVGYNQFGEVIVDGDVVHGFYNPAVSRIV : :::::::.. ..: . :: ::: :. :. .. . KIAA18 CCFDKTGTLTSDSLVVRGVAGLRDG--KEVTPVSSI-----------------PVETHRA 530 540 550 560 410 420 430 440 450 KIAA13 EAGCVCNDAVIRNNTLMGKPTEGALIALAMKMGLDGLQQDYIRKAE---------YPFSS :.: . . ..::.: : : :... :. : .. . :. . . :.: KIAA18 LASC-HSLMQLDDGTLVGDPLEKAMLT-AVDWTLTKDEKVFPRSIKTQGLKIHQRFHFAS 570 580 590 600 610 620 460 470 480 490 500 510 KIAA13 EQKWMAVKCVHRTQQDRPEICFM---KGAYEQVIKYCTTYQSKGQTLTLTQQQRDVYQQE : :.: .. . ..:.. ::: : : .: ..: : :.. KIAA18 ALKRMSVLASYE-KLGSTDLCYIAAVKGAPE-------TLHS-----MFSQCPPD-YHHI 630 640 650 660 670 520 530 540 550 KIAA13 KARMGSAGLRVLALASGPELGQLT-----------------FLGLVGIIDPPRTGVKEAV ..... : :::::. :::.:: :.:.. . : .. : .. KIAA18 HTEISREGARVLALGY-KELGHLTHQQAREVKREALECSLKFVGFIVVSCPLKADSKAVI 680 690 700 710 720 730 560 570 580 590 KIAA13 TTLIASGVSIKMITGDSQETAVAIASRLGLYSKTS----------------QSVSGE--- . .. . :::::. :: .:..: . :. .:..: KIAA18 REIQNASHRVVMITGDNPLTACHVAQELHFIEKAHTLILQPPSEKGRQCEWRSIDGSIVL 740 750 760 770 780 790 600 610 620 630 KIAA13 ------------------------EIDAMDVQQLSQIVPKVAVFYRASPRHKMKIIKSLQ ...: : ::: ...:.: :: :..:..: .: ::. KIAA18 PLARGSPKALALEYALCLTGDGLAHLQATDPQQLLRLIPHVQVFARVAPKQKEFVITSLK 800 810 820 830 840 850 640 650 660 670 680 690 KIAA13 KNGSVVAMTGDGVNDAVALKAADIGVAMGQTGTDVCKEAADMILVDDDFQTIMSAIEEGK . : :. : :::.::. ::: ::.:::. KIAA18 ELGYVTLMCGDGTNDVGALKHADVGVALLANAPERVVERRRRPRDSPTLSNSGIRATSRT 860 870 880 890 900 910 >>KIAA1487 ( 650 res) fj07249 (650 aa) initn: 195 init1: 138 opt: 140 Z-score: 157.4 bits: 39.9 E(): 0.0012 Smith-Waterman score: 188; 20.264% identity (54.185% similar) in 454 aa overlap (524-897:98-543) 500 510 520 530 540 550 KIAA13 SKGQTLTLTQQQRDVYQQEKARMGSAGLRVLALASGPEL-GQLTFLGLVGIIDPPRTGVK : : :. .: ..::.:: .:: : . :: KIAA14 IAKKVMSDTEYAEWLRNHFLAETSIDNREELLLESAMRLENKLTLLGATGIEDRLQEGVP 70 80 90 100 110 120 560 570 580 590 600 KIAA13 EAVTTLIASGVSIKMITGDSQETAVAIA---------SRLGLYSKTSQSVSGEEIDAM-- :.. .: .:..: :.:::.::::: :: ..: . . :... : .... KIAA14 ESIEALHKAGIKIWMLTGDKQETAVNIAYACKLLEPDDKLFILNTQSKDACGMLMSTILK 130 140 150 160 170 180 610 KIAA13 DVQQLSQIVP-------------------------------------------------- ..:. .: .: KIAA14 ELQKKTQALPEQVSLSEDLLQPPVPRDSGLRAGLIITGKTLEFALQESLQKQFLELTSWC 190 200 210 220 230 240 620 630 640 650 660 KIAA13 KVAVFYRASPRHKMKIIKSLQKNGSVVAMT-GDGVNDAVALKAADIGVAM-GQTGTDVCK ...: ::.: .: ...: .... .:.... :::.::. ...::::... :: : .. KIAA14 QAVVCCRATPLQKSEVVKLVRSHLQVMTLAIGDGANDVSMIQVADIGIGVSGQEGMQAVM 250 260 270 280 290 300 670 680 690 700 710 720 KIAA13 EAADMILVDDDFQTIMSAIE-EGKGIYNNIKNFVRFQLSTSIAALTLISLATLM-NFPNP :.:. . ..:. . . . .:. :. ..:.. . . ..: ..:. .. .: . KIAA14 -ASDFAV--SQFKHLSKLLLVHGHWCYTRLSNMILYFFYKNVAYVNLLFWYQFFCGFSG- 310 320 330 340 350 360 730 740 750 760 770 780 KIAA13 LNAMQILWI----NIIMDGPPAQSLGV--EPVDKDVIRKPPRNWKDSILTKNLILKILVS ..: :. :... . : :: . :. ... . :. .... .. . . . KIAA14 -TSMTDYWVLIFFNLLFTSAPPVIYGVLEKDVSAETLMQLPELYRSGQKSEAYLPHTFWI 370 380 390 400 410 420 790 800 810 820 830 KIAA13 SII------IVCGTLFVFWRELRDNVITPRDTTMTFTCFVFFDMFNALSSRSQTKSVFEI ... .:: . : . :. : . .. : .:. ... : .:.. . ... KIAA14 TLLDAFYQSLVCFFVPYFTYQGSDTDIFAFGNPLN-TAALFIVLLH-LVIESKSLTWIHL 430 440 450 460 470 480 840 850 860 870 880 890 KIAA13 GLCSNRMFCYAVLGSIMGQLLVIYFPPLQKVFQTESLSILDLLFLLG--LTSSVCIVAEI . . .. : ... ..: . : :: .. . . .:: .: : ::.:. .. .. 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