# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fj00671.fasta.huge -Q ../query/KIAA1346.ptfa ./tmplib.24314 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1346, 999 aa vs ./tmplib.24314 library 1986506 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5060+/-0.00587; mu= 14.8664+/- 0.400 mean_var=121.2382+/-28.392, 0's: 0 Z-trim: 16 B-trim: 7 in 2/38 Lambda= 0.116481 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0688 ( 849 res) hk03410 ( 849) 2656 458.1 2.1e-129 KIAA1312 ( 1471 res) fh11767 (1471) 2261 392.0 2.9e-109 KIAA0366 ( 1201 res) hh00124 (1201) 1429 252.1 3.1e-67 KIAA2029 ( 1021 res) pj01256 (1021) 1027 184.5 6.1e-47 KIAA0605 ( 1031 res) hg03238a (1031) 532 101.3 6.8e-22 KIAA0021 ( 703 res) ha00117(revised) ( 703) 323 66.0 2e-11 KIAA1445 ( 1202 res) fg03469b (1202) 237 51.8 6.3e-07 KIAA0550 ( 1524 res) hh15909 (1524) 213 47.9 1.2e-05 KIAA1777 ( 954 res) fh19201x1 ( 954) 199 45.3 4.5e-05 KIAA0960 ( 1502 res) hj05779s1 (1502) 199 45.5 6e-05 KIAA1233 ( 1023 res) fh08611 (1023) 182 42.5 0.00034 KIAA2036 ( 1322 res) pf06513 (1322) 168 40.2 0.0021 KIAA0149 ( 830 res) ha01221 ( 830) 160 38.7 0.0039 >>KIAA0688 ( 849 res) hk03410 (849 aa) initn: 2633 init1: 1584 opt: 2656 Z-score: 2414.9 bits: 458.1 E(): 2.1e-129 Smith-Waterman score: 2792; 49.761% identity (72.912% similar) in 838 aa overlap (68-891:50-830) 40 50 60 70 80 90 KIAA13 PEGFGRRKLGSDMGNAERAPGSRSFGPVPTLLLLAAALLAVSDALGRPSEEDEELVVPEL :::: :.:: : :. : ..::.: :: KIAA06 PGRGLAGRWLWGAQPCLLLPIVPLSWLVWLLLLLLASLLP-SARLASPLPREEEIVFPEK 20 30 40 50 60 70 100 110 120 130 140 KIAA13 ERA---PGHGT-TRL--RLHAFDQQLDLELRPDSSFLAPGFTLQNVGRK----SGSETPL . :: :: .:: ::.:: . : :::. ::. . :.:.: .:. .:.: KIAA06 LNGSVLPGSGTPARLLCRLQAFGETLLLELEQDSGVQVEGLTVQYLGQAPELLGGAE--- 80 90 100 110 120 130 150 160 170 180 190 200 KIAA13 PETDLAHCFYSGTVNGDPSSAAALSLCEG-VRGAFYLLGEAYFIQPLPAASERLATAAPG : : . .::.:::: :.:.: : . :.. : .::: ... : ..:: KIAA06 PGT-----YLTGTINGDPESVASLHWDGGALLGVLQYRGAELHLQPLEGGTPNSA-GGPG 140 150 160 170 180 210 220 230 240 250 260 KIAA13 EKPPAPLQFHLLRRNRQGDVGGTCGVVDDEPRPTGKAETEDEDEGTEGEDEGPQWSPQDP :.:::. . . .::. . . : KIAA06 A--------HILRRK------------------------------SPASGQGPMCNVKAP 190 200 210 270 280 290 300 310 320 KIAA13 ALQGVGQPTGTGSIRKKRFVSSHRYVETMLVADQSMAEFHGSGLKHYLLTLFSVAARLYK .:.:. : :::.: :.:::..:::..:: :::.:::.::::....::. .: KIAA06 ----LGSPSPRPR-RAKRFASLSRFVETLVVADDKMAAFHGAGLKRYLLTVMAAAAKAFK 220 230 240 250 260 330 340 350 360 370 380 KIAA13 HPSIRNSVSLVVVKILVIHDEQKGPEVTSNAALTLRNFCNWQKQHNPPSDRDAEHYDTAI :::::: :::::...... . ..::.: .:: :::.:: ::. : : : : .:.:::: KIAA06 HPSIRNPVSLVVTRLVILGSGEEGPQVGPSAAQTLRSFCAWQRGLNTPEDSDPDHFDTAI 270 280 290 300 310 320 390 400 410 420 430 440 KIAA13 LFTRQDLCGSQTCDTLGMADVGTVCDPSRSCSVIEDDGLQAAFTTAHELGHVFNMPHDDA ::::::::: .::::::::::::::::.:::...::::::.:::.:::::::::: ::.. 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KIAA06 QDTRLRYSFFVPRPTPS-TPRPTPQDWLHRRAQILEILRRRPWAGRK 810 820 830 840 >>KIAA1312 ( 1471 res) fh11767 (1471 aa) initn: 1684 init1: 701 opt: 2261 Z-score: 2053.5 bits: 392.0 E(): 2.9e-109 Smith-Waterman score: 2261; 39.907% identity (68.213% similar) in 862 aa overlap (169-999:6-839) 140 150 160 170 180 190 KIAA13 RKSGSETPLPETDLAHCFYSGTVNGDPSSAAALSLCEGVRGAFYLLGEAYFIQPLPAASE :..::: :. :.: :::.:: . .: KIAA13 NSEHTAVISLCSGMLGTFRSHDGDYFIEPLQSMDE 10 20 30 200 210 220 230 240 250 KIAA13 RLATAAPGEKPPAPLQFHLLRR----NRQGDVG-GTCGVVDDEPRPT-GKAETEDEDEGT . .:: :.. : .:. ..: .: . . . : . : .:. . : KIAA13 Q-EDEEEQNKP------HIIYRRSAPQREPSTGRHACDTSEHKNRHSKDKKKTRARKWGE 40 50 60 70 80 260 270 280 290 300 KIAA13 E----GEDEGPQWSPQDPALQGVGQPTGTGSIRK-----KRFVSSHRYVETMLVADQSMA . :. . . . :... :. : . .. :::.: :.::...:::. :. KIAA13 RINLAGDVAALNSGLATEAFSAYGNKTDNTREKRTHRRTKRFLSYPRFVEVLVVADNRMV 90 100 110 120 130 140 310 320 330 340 350 360 KIAA13 EFHGSGLKHYLLTLFSVAARLYKHPSIRNSVSLVVVKILVIHDEQKGPEVTSNAALTLRN .:: .:.::.:::.:..: .:: ::: : ...:.:...:::.:: :: .. :: ::.: KIAA13 SYHGENLQHYILTLMSIVASIYKDPSIGNLINIVIVNLIVIHNEQDGPSISFNAQTTLKN 150 160 170 180 190 200 370 380 390 400 410 420 KIAA13 FCNWQKQHNPPSDRDAEHYDTAILFTRQDLCGSQT-CDTLGMADVGTVCDPSRSCSVIED ::.::...: :. . :.:::.:.::::.: .. :::::.:..::.::: ::::. :: KIAA13 FCQWQHSKNSPG---GIHHDTAVLLTRQDICRAHDKCDTLGLAELGTICDPYRSCSISED 210 220 230 240 250 260 430 440 450 460 470 480 KIAA13 DGLQAAFTTAHELGHVFNMPHDDAKQCASLNGVNQDSHMMASMLSNLDHSQPWSPCSAYM .::..::: :::::::::::::: ..: .::.. .:.:: :. . :: :: . KIAA13 SGLSTAFTIAHELGHVFNMPHDDNNKCKE-EGVKSPQHVMAPTLNFYTNPWMWSKCSRKY 270 280 290 300 310 320 490 500 510 520 530 540 KIAA13 ITSFLDNGHGECLMDKPQN-PIQLPGDLPGTSYDANRQCQFTFGEDSKHCPDAASTCSTL :: :::.:.::::...:.. : :: .::: :..:.::.. :: :. :: . : : KIAA13 ITEFLDTGYGECLLNEPESRPYPLPVQLPGILYNVNKQCELIFGPGSQVCPYMMQ-CRRL 330 340 350 360 370 380 550 560 570 580 590 600 KIAA13 WCTGTSGGVLVCQTKHFPWADGTSCGEGKWCINGKCVNKTDRKHFDTPF-HGSWGMWGPW ::....: :.:.: :::::: : :: : : :: :..:.: :::: :.:. KIAA13 WCNNVNGVHKGCRTQHTPWADGTECEPGKHCKYGFCVP----KEMDVPVTDGSWGSWSPF 390 400 410 420 430 610 620 630 640 650 660 KIAA13 GDCSRTCGGGVQYTMRECDNPVPKNGGKYCEGKRVRYRSCNLEDCPDNNGKTFREEQCEA : ::::::::.. ..:::. : :::::::: :.:....::: : : .. . ::.::: : KIAA13 GTCSRTCGGGIKTAIRECNRPEPKNGGKYCVGRRMKFKSCNTEPCLKQK-RDFRDEQC-A 440 450 460 470 480 490 670 680 690 700 710 KIAA13 HNEFSKASF---GSGPAVEWIPKYAGVSPKDRCKLICQAKGIGYFFVLQPKVVDGTPCSP : :. : : : :.:.:::.:. ::::::.:.. : .. :. .:.:::::. KIAA13 H--FDGKHFNINGLLPNVRWVPKYSGILMKDRCKLFCRVAGNTAYYQLRDRVIDGTPCGQ 500 510 520 530 540 550 720 730 740 750 760 770 KIAA13 DSTSVCVQGQCVKAGCDRIIDSKKKFDKCGVCGGNGSTCKKISGSVTSAKPGYHDIITIP :....:::: : .::::....:: . ::::::::..:.:: ..:. .... ::. .. :: KIAA13 DTNDICVQGLCRQAGCDHVLNSKARRDKCGVCGGDNSSCKTVAGTFNTVHYGYNTVVRIP 560 570 580 590 600 610 780 790 800 810 820 830 KIAA13 TGATNIEVKQRNQRGSRNNGSFLAIKAADGTYILNGDYTLSTLEQDIMYKGVVLRYSGSS .:::::.:.:.. : .. ..::.... : ..:::..... ...: ..:..:::: KIAA13 AGATNIDVRQHSFSGETDDDNYLALSSSKGEFLLNGNFVVTMAKREIRIGNAVVEYSGSE 620 630 640 650 660 670 840 850 860 870 880 890 KIAA13 AALERIRSFSPLKEPLTIQVLTVGNALRPKIKYTYFVKKKKESFNAIPTFSAWVIE-EWG .:.::: : . ... : .:::.::. : ..:.. . . . : : . : KIAA13 TAVERINSTDRIEQELLLQVLSVGKLYNPDVRYSFNIPIEDK-----PQQFYWNSHGPWQ 680 690 700 710 720 730 900 910 920 930 940 950 KIAA13 ECSKSCELGWQRRLVECRDINGQPASE--CAKEVKPAS-TRPCADHPCP-QWQLGEWSSC ::: :. .:.:: :. . .:. : . .:. :.::. : .:... : : KIAA13 ACSKPCQGERKRKLVCTRESDQLTVSDQRCDRLPQPGHITEPCGTD-CDLRWHVASRSEC 740 750 760 770 780 960 970 980 990 KIAA13 SKTCGKGYKKRSLKCLSH---DGGVLSHES--CDPLKKPKHFIDFCTMAECS : :: ::. .. : .. :: . . .. :. ::.. . :. .::. KIAA13 SAQCGLGYRTLDIYCAKYSRLDGKTEKVDDGFCSSHPKPSNR-EKCS-GECNTGGWRYSA 790 800 810 820 830 840 KIAA13 WTECSKSCDGGTQRRRAICVNTRNDVLDDSKCTHQEKVTIQRCSEFPCPQWKSGDWSECL 850 860 870 880 890 900 >>KIAA0366 ( 1201 res) hh00124 (1201 aa) initn: 1008 init1: 239 opt: 1429 Z-score: 1298.9 bits: 252.1 E(): 3.1e-67 Smith-Waterman score: 1498; 31.451% identity (60.244% similar) in 903 aa overlap (112-968:82-930) 90 100 110 120 130 KIAA13 LGRPSEEDEELVVPELERAPGHGTTRLRLHAFDQQLDLELRPDSSFLAPGFTLQ------ :: ... :.:.:.....::: ... KIAA03 YLSHTLSASHKKRSARDVSSNPEQLFFNITAFGKDFHLRLKPNTQLVAPGAVVEWHETSL 60 70 80 90 100 110 140 150 160 170 180 KIAA13 ---NV-----GRKSGSETP-LPETD--LAHCFYSGTVNGDPSSAAALSLCEGVRGAFYLL :. ... :: : . .:. ..: : : . :....:.: :.:. : . KIAA03 VPGNITDPINNHQPGSATYRIRKTEPLQTNCAYVGDIVDIPGTSVAISNCDGLAGMIKSD 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 KIAA13 GEAYFIQPLPAASERLATAAPGEKPPAPLQFHLLRRNRQGDVGGTCGVVDDEPRPTGKAE .: :::.:: :: . :: ..:.. . ..:.. : .: . KIAA03 NEEYFIEPL----ER-GKQMEEEKG----RIHVVYKR---------SAVEQAPIDMSK-D 180 190 200 210 250 260 270 280 290 300 KIAA13 TEDEDEGTEGEDEGPQWSPQDPALQGVGQPTGTGSIRKKRFVSSHRY-VETMLVADQSMA . .. :: :. . .. : . ..:..: .. . : .:..: .:.:.. KIAA03 FHYRESDLEGLDD------LGTVYGNIHQQLNE-TMRRRRHAGENDYNIEVLLGVDDSVV 220 230 240 250 260 310 320 330 340 350 360 KIAA13 EFHGS-GLKHYLLTLFSVAARLYKHPSIRNSVSLVVVKILVIHDEQKGPEVT-SNAALTL .:::. ...:::::.... ..:. :. ...:.:..... .. . .: . .: KIAA03 RFHGKEHVQNYLLTLMNIVNEIYHDESLGVHINVVLVRMIMLGYAKSISLIERGNPSRSL 270 280 290 300 310 320 370 380 390 400 410 KIAA13 RNFCNWQKQHNPPSDRDAEHYDTAILFTRQDL--CGSQTCDTLGMADVGTVCDPSRSCSV .: : : .:.. . .::.: ::..::::. : : :.: : .: : :::.. KIAA03 ENVCRWASQQQRSDLNHSEHHDHAIFLTRQDFGPAGMQ-----GYAPVTGMCHPVRSCTL 330 340 350 360 370 380 420 430 440 450 460 470 KIAA13 IEDDGLQAAFTTAHELGHVFNMPHD-DAKQCASLNGVNQDSHMMASMLSNLDHSQPWSPC ..::...::..::: :::..: :: ....:.. ..... .:: ... : :: : KIAA03 NHEDGFSSAFVVAHETGHVLGMEHDGQGNRCGDETAMGS---VMAPLVQAAFHRYHWSRC 390 400 410 420 430 480 490 500 510 520 530 KIAA13 SAYMITSFLDNGHGECLMDKP--QNPIQLPGDLPGTSYDANRQCQFTFGEDSKHCPDAAS :. . .. . .::.: : .. .:: .::: .:. ..::.: :: : : . KIAA03 SGQELKRYIHS--YDCLLDDPFDHDWPKLP-ELPGINYSMDEQCRFDFGVGYKMCTAFRT 440 450 460 470 480 490 540 550 560 570 580 590 KIAA13 --TCSTLWCTGTSGGVLVCQTKHFPWADGTSCGEGKWCINGKCVNKTDRKHFDTPFHGSW :. :::. .. . :.::. : ::: :. :::: .:.:. :. .. . :.: KIAA03 FDPCKQLWCSHPDNPYF-CKTKKGPPLDGTECAAGKWCYKGHCMWKNANQQKQD---GNW 500 510 520 530 540 550 600 610 620 630 640 650 KIAA13 GMWGPWGDCSRTCGGGVQYTMRECDNPVPKNGGKYCEGKRVRYRSCNLEDCPDNNGKTFR : : .:.:::::: ::.. :.:.::.: :::. : : .:. :: :.: ... . :: KIAA03 GSWTKFGSCSRTCGTGVRFRTRQCNNPMPINGGQDCPGVNFEYQLCNTEEC-QKHFEDFR 560 570 580 590 600 660 670 680 690 700 710 KIAA13 EEQCEAHNEFSKASFGSGPAVEWIPKYAGVSPKDRCKLICQAKGIGYFFVLQPKVVDGTP .::. .: :. . .. .:.: : .:: ::.: ::.: : .. : ::: KIAA03 AQQCQQRN--SHFEY-QNTKHHWLP-YEHPDPKKRCHLYCQSKETGDVAYMKQLVHDGTH 610 620 630 640 650 660 720 730 740 750 760 770 KIAA13 CS-PDSTSVCVQGQCVKAGCDRIIDSKKKFDKCGVCGGNGSTCKKISGSVTSA--KPGYH :: : :.::.:.:::.:::. : :.: ::::::::..: :. ..:. : . : :: KIAA03 CSYKDPYSICVRGECVKVGCDKEIGSNKVEDKCGVCGGDNSHCRTVKGTFTRTPRKLGYL 670 680 690 700 710 720 780 790 800 810 820 830 KIAA13 DIITIPTGATNIEVKQRNQRGSRNNGSFLAIKA-ADGTYILNGDYTLSTLEQDIMYKGVV .. :: :: .. ... .. . .:::: : : ::::: . . .. :: KIAA03 KMFDIPPGARHVLIQE-----DEASPHILAIKNQATGHYILNGKGEEAK-SRTFIDLGVE 730 740 750 760 770 840 850 860 870 880 KIAA13 LRYSGSSAALERIRSFSPLKEPLTIQVLTVGNALRPKIKYTYFVKKKK----ESFNAIP- :. . .: ... .::..:. . .. : : .. : :.... . .: :.: KIAA03 WDYNIEDD-IESLHTDGPLHDPVIVLIIPQENDTRSSLTYKYIIHEDSVPTINSNNVIQE 780 790 800 810 820 830 890 900 910 920 930 KIAA13 ---TFSAWVIEEWGECSKSCELGWQRRLVECR---DINGQPASECAKEVKPASTRP-CAD :: :... :.. :: : :.: :: : . : : . :: : : KIAA03 ELDTFE-WALKSWSQVSKPCGGGFQYTKYGCRRKSDNKMVHRSFCEANKKPKPIRRMCNI 840 850 860 870 880 890 940 950 960 970 980 990 KIAA13 HPC--PQWQLGEWSSCSKTCGK-GYKKRSLKCLSHDGGVLSHESCDPLKKPKHFIDFCTM . : : : :: :.::::. ::. :...:: KIAA03 QECTHPLWVAEEWEHCTKTCGSSGYQLRTVRCLQPLLDGTNRSVHSKYCMGDRPESRRPC 900 910 920 930 940 950 KIAA13 AECS KIAA03 NRVPCPAQWKTGPWSECSVTCGEGTEVRQVLCRAGDHCDGEKPESVRACQLPPCNDEPCL 960 970 980 990 1000 1010 >>KIAA2029 ( 1021 res) pj01256 (1021 aa) initn: 1125 init1: 283 opt: 1027 Z-score: 934.6 bits: 184.5 E(): 6.1e-47 Smith-Waterman score: 1563; 34.902% identity (60.784% similar) in 765 aa overlap (260-998:51-783) 230 240 250 260 270 280 KIAA13 CGVVDDEPRPTGKAETEDEDEGTEGEDEGPQWSPQDPALQGVGQPTGTGS-IRKKR-FVS .. :: : . : : .:.:: .. KIAA20 RTWELAHQPLHSSDLRLGLPQKQHFCGRRKKYMPQPPKEDLFILPDEYKSCLRHKRSLLR 30 40 50 60 70 80 290 300 310 320 330 340 KIAA13 SHRY----VETMLVADQSMAEFHGS-GLKHYLLTLFSVAARLYKHPSIRNSVSLVVVKIL :: :::..:.:..: . :: .. :.::...... :.: .: .......: .. KIAA20 YHRNEELNVETLVVVDKKMMQNHGHENITTYVLTILNMVSALFKDGTIGGNINIAIVGLI 90 100 110 120 130 140 350 360 370 380 390 400 KIAA13 VIHDEQKGPEVTSNAALTLRNFCNWQKQHNPPSDRDAEHYDTAILFTRQDLCG--SQTCD ...::: : .. .: :: .::.::. .:. ..: :::.: :.:. .. :: KIAA20 LLEDEQPGLVISHHADHTLSSFCQWQSGL---MGKDGTRHDHAILLTGLDICSWKNEPCD 150 160 170 180 190 410 420 430 440 450 KIAA13 TLGMADVGTVCDPSRSCSVIEDDGLQAAFTTAHELGHVFNMPHD-DAKQCASLNGVNQDS :::.: .. .:. :::.. :: :: ::: ::: :: :.: :: ....: . .: KIAA20 TLGFAPISGMCSKYRSCTINEDTGLGLAFTIAHESGHNFGMIHDGEGNMCKKSEG----- 200 210 220 230 240 250 460 470 480 490 500 510 KIAA13 HMMASMLSNLDHSQPWSPCSAYMITSFLDNGHGECLMDKPQNPIQ---LPGDLPGTSYDA ..:. :.. . ::::: .. .::..... :: :.:. :.. : ::: ::: KIAA20 NIMSPTLAGRNGVFSWSPCSRQYLHKFLSTAQAICLADQPK-PVKEYKYPEKLPGELYDA 260 270 280 290 300 310 520 530 540 550 560 570 KIAA13 NRQCQFTFGEDSKHCP-D-AASTCSTLWCTGTSGGVLVCQTKHFPWADGTSCGEGKWCIN : ::.. ::: .: : : . :..::: . :.:: .: :.:: ::. :: . KIAA20 NTQCKWQFGEKAKLCMLDFKKDICKALWCHRIGRK---CETKFMPAAEGTICGHDMWCRG 320 330 340 350 360 580 590 600 610 620 630 KIAA13 GKCVNKTDRKHFDTPFHGSWGMWGPWGDCSRTCGGGVQYTMRECDNPVPKNGGKYCEGKR :.::. :. : :: :. :. :. :::::::::.. : : :: :..:::.:::. KIAA20 GQCVKYGDEG--PKPTHGHWSDWSSWSPCSRTCGGGVSHRSRLCTNPKPSHGGKFCEGST 370 380 390 400 410 420 640 650 660 670 680 690 KIAA13 VRYRSCNLEDCPDNNGKTFREEQCEAHNEFSKASFGSGPAVEWIPKYAGVSPKDRCKLIC . :: . :: .. :: :: :: . : : .: : :. : .: ::: : KIAA20 RTLKLCNSQKCP-RDSVDFRAAQCAEHN---SRRF-RGRHYKWKP-YTQVEDQDLCKLYC 430 440 450 460 470 480 700 710 720 730 740 750 KIAA13 QAKGIGYFFVLQPKVVDGTPCSPDSTSVCVQGQCVKAGCDRIIDSKKKFDKCGVCGGNGS :.:. .:: :. :: :::::: :: .::..: : ..::: .. : : ::::.::.: KIAA20 IAEGFDFFFSLSNKVKDGTPCSEDSRNVCIDGICERVGCDNVLGSDAVEDVCGVCNGNNS 490 500 510 520 530 540 760 770 780 790 800 810 KIAA13 TCKKISGSVTSAKPG--YHDIITIPTGATNIEVKQRNQRGSRNNGSFLAIKAADGTYILN .: : :. . :. ..:::.:: .:.. . : . :..... : : :: KIAA20 ACTIHRGLYTKHHHTNQYYHMVTIPSGARSIRIYEMNV-----STSYISVRNALRRYYLN 550 560 570 580 590 820 830 840 850 860 870 KIAA13 GDYTLSTLEQDIMYKGVVLRYSGSSAALERIRSFSPLKEPLTIQVLTVGNALRPKIKYTY : .:.. ..:... : : : . . .: .: : ...: : : . . : KIAA20 GHWTVD-WPGRYKFSGTTFDYRRSYNEPENLIATGPTNETLIVELLFQGR--NPGVAWEY 600 610 620 630 640 650 880 890 900 910 920 KIAA13 FVKK--KKESFNAIPTFSAWVIEEWGECSKSCELGWQRRLVEC-RDINGQ-PASECAKEV . . ... : :... :.: . .::: :: : . : ::.. : : : .. KIAA20 SMPRLGTEKQPPAQPSYT-WAIVR-SECSVSCGGGQMTVREGCYRDLKFQVNMSFCNPKT 660 670 680 690 700 710 930 940 950 960 970 980 KIAA13 KPAS-TRPCADHPCP-QWQLGEWSSCSKTCGKGYKKRSLKC---LSHDGGVLSHESCDPL .:.. :: :: .:..:.::.::.::: : ..: ..: . .:. . : : KIAA20 RPVTGLVPCKVSACPPSWSVGNWSACSRTCGGGAQSRPVQCTRRVHYDSEPVPASLC-PQ 720 730 740 750 760 990 KIAA13 KKPKHFIDFCTMAECS :. . :. : KIAA20 PAPSSR-QACNSQSCPPAWSAGPWAECSHTCGKGWRKRAVACKSTNPSARAQLLPDAVCT 770 780 790 800 810 820 >>KIAA0605 ( 1031 res) hg03238a (1031 aa) initn: 486 init1: 174 opt: 532 Z-score: 485.0 bits: 101.3 E(): 6.8e-22 Smith-Waterman score: 541; 29.863% identity (56.164% similar) in 365 aa overlap (548-880:68-417) 520 530 540 550 560 570 KIAA13 RQCQFTFGEDSKHCPDAASTCSTLWCTGTSGGVLVCQTKHFPWADGT-SCGEGKW----- :. :: . .: :: .:. : KIAA06 QLVPDNLEAWALAGPRGLFPKRTLVIWKRIGAGLVVTVALLPRMDGRWQCSCWAWFLLVL 40 50 60 70 80 90 580 590 600 610 KIAA13 -CINGKCVN--KTDRKHFDTPFHGS-------WGMWGPWGDCSRTCGGGVQYTMREC--- . : :. .:: . .. ..:. :: : : ::.::::: :.: KIAA06 AVVAGDTVSTGSTDNSPTSNSLEGGTDATAFWWGEWTKWTAFSRSCGGGVTSQERHCLQQ 100 110 120 130 140 150 620 630 640 650 660 670 KIAA13 -DNPVPKNGGKYCEGKRVRYRSCNLEDCPDNNGKTFREEQCEAHNEFSKASFGSGPAVEW . :: :.. : : ::. : ...:: . :..:::::: . : . .: . .: KIAA06 RRKSVPGPGNRTCTGTSKRYQLCRVQECPPD-GRSFREEQCVSFN----SHVYNGRTHQW 160 170 180 190 200 210 680 690 700 710 720 730 KIAA13 IP----KYAGVSPKDRCKLICQAKGIGYFFVLQPKVVDGTPCS-PDSTSVCVQGQCVKAG : :. .: : : : : . : .. : . ::: :. : .:::.:.: : KIAA06 KPLYPDDYVHISSKP-CDLHCTTVD-GQRQLMVP-ARDGTSCKLTDLRGVCVSGKCEPIG 220 230 240 250 260 740 750 760 770 780 790 KIAA13 CDRIIDSKKKFDKCGVCGGNGSTCKKISGSVT--SAKPGYHDIITIPTGATNIEVKQRNQ :: .. : . .::::.: :.::.: ...:. .:. :: . ::.:: .:.. .: KIAA06 CDGVLFSTHTLDKCGICQGDGSSCTHVTGNYRKGNAHLGYSLVTHIPAGARDIQIVER-- 270 280 290 300 310 320 800 810 820 830 840 KIAA13 RGSRNNGSFLAIKAADGTYILNGDYTLSTLEQDIMYKGVVLRYSGS----SAALERIRSF ..... ::. : :..::.: ... ... :.:..: ...: : . KIAA06 ---KKSADVLALADEAGYYFFNGNYKVDS-PKNFNIAGTVVKYRRPMDVYETGIEYIVAQ 330 340 350 360 370 380 850 860 870 880 890 900 KIAA13 SPLKEPLTIQVLTVGNALRPKIKYTY-FVKKKKESFNAIPTFSAWVIEEWGECSKSCELG .: .. :...: . :. :.: . : ... .:: KIAA06 GPTNQGLNVMVWN-QNGKSPSITFEYTLLQPPHESRPQPIYYGFSESAESQGLDGAGLMG 390 400 410 420 430 440 910 920 930 940 950 960 KIAA13 WQRRLVECRDINGQPASECAKEVKPASTRPCADHPCPQWQLGEWSSCSKTCGKGYKKRSL KIAA06 FIPHNGSLYGQASSERLGLDNRLFGHPGLDMELGPSQGQETNEVCEQAGGGACEGPPRGK 450 460 470 480 490 500 >>KIAA0021 ( 703 res) ha00117(revised) (703 aa) initn: 235 init1: 90 opt: 323 Z-score: 297.1 bits: 66.0 E(): 2e-11 Smith-Waterman score: 385; 25.190% identity (49.621% similar) in 659 aa overlap (159-785:2-575) 130 140 150 160 170 180 KIAA13 APGFTLQNVGRKSGSETPLPETDLAHCFYSGTVNGDPSSAAALSLCEGVRGAFYLLGEAY : :.: .:. ::: : :.:: ..: . .: KIAA00 QGYVEGVHNSSIALSDCFGLRGLLHLENASY 10 20 30 190 200 210 220 230 240 KIAA13 FIQPLPAASERLATAAPGEKPPAPLQF-HLLRRNRQGDVGGTCGVVDDEPRPTGKAETED :.:: .: .: :.. :. :: :: : .. . KIAA00 GIEPLQNSS----------------HFEHIIY--RMDDVY-------KEPLKCGVSNKDI 40 50 60 250 260 270 280 290 300 KIAA13 EDEGTEGEDEGPQWSPQDPALQGVGQPTGTGSIRKKRFVSSH-RYVETMLVADQSMAEFH : : .. :.: : :. : .:..: : . :::: ..:.:. .. KIAA00 EKETAKDEEEEP--------------PSMTQLLRRRRAVLPQTRYVELFIVVDKERYDMM 70 80 90 100 110 310 320 330 340 350 360 KIAA13 G---SGLKHYLLTLFSVAARLYKHPSIRNSVSLVVVKILVIHDEQKGPEVTSNAALTLRN : ..... .. : . .: .:: .:. : : . . .....:. .: : KIAA00 GRNQTAVREEMILLANYLDSMYIMLNIR-----IVLVGLEIWTNGNLINIVGGAGDVLGN 120 130 140 150 160 370 380 390 400 410 420 KIAA13 FCNWQKQHNPPSDRDAEHYDTAILFTRQDLCGSQTCDTLGMADVGTVCDPSRSCSV-IED : .:... : .:.: : .. . : : ::: :::::. :.. .. . KIAA00 FVQWREKFLITRRR----HDSAQLVLKKGFGG-----TAGMAFVGTVCSRSHAGGINVFG 170 180 190 200 210 430 440 450 460 470 480 KIAA13 DGLQAAFTT--AHELGHVFNMPHDDAKQCASLNGVNQDSHMMASMLSNLDHSQPWSPCSA . .:.. :::::: ..: :::...:. :.. : .: : :. :. .: ::: KIAA00 QITVETFASIVAHELGHNLGMNHDDGRDCSC--GAK--SCIMNSGASG---SRNFSSCSA 220 230 240 250 260 270 490 500 510 520 530 KIAA13 YMITSFLDNGHGECLMD--KPQNPIQLPGDLPGTSYDANRQCQFTFGEDSKHCPDAASTC . .. : :.::.. ::.. . :. . ::...:. :.: . : KIAA00 EDFEKLTLNKGGNCLLNIPKPDEAYSAPS-CGNKLVDAGEECDCG---TPKEC--ELDPC 280 290 300 310 320 540 550 560 570 580 590 KIAA13 STLWCTGTSGGVLVCQTKHFPW-ADGTSCGEGKWCINGK-CVNKTDRKHFDTPFHGSWGM : :.. :. : : : : : . .. .: : .::.. .:: . KIAA00 ----CEGST-----CKLKSFAECAYGDCCKDCRFLPGGTLCRGKTSECDVPEYCNGSSQF 330 340 350 360 370 600 610 620 630 640 650 KIAA13 WGPWGDCSRTCGGGVQYTMRECDNPVPKNGGKYCE---GKRVRYRSCNLEDC-PDNNGKT : : : : . : : . . :. :.... .:: . :.: KIAA00 CQP--DVFIQNGYPCQNNKAYCYNGMCQYYDAQCQVIFGSKAKAAP---KDCFIEVNSKG 380 390 400 410 420 430 660 670 680 690 700 KIAA13 FREEQCE-AHNEFSKASFGSG-------PAVEWIPKYAGVSPK--DRCKLICQAKGIGYF : .: . ::..: . :.. :. :: . :. : . . . :. . KIAA00 DRFGNCGFSGNEYKKCATGNALCGKLQCENVQEIPVF-GIVPAIIQTPSRGTKCWGVDFQ 440 450 460 470 480 490 710 720 730 740 750 KIAA13 F---VLQPKVVD-GTPCSPDSTSVCVQGQCVKAGC-DRIIDSKKKFDKCGVCGGNGST-C . : .: .:. :: :. . ..: . ::: :. . : .:: :::..: . : KIAA00 LGSDVPDPGMVNEGTKCG--AGKICRNFQCVDASVLNYDCDVQKKCHGHGVCNSNKNCHC 500 510 520 530 540 760 770 780 790 800 810 KIAA13 KKISGSVTSAKPGYHDIITIPTGATNIEVKQRNQRGSRNNGSFLAIKAADGTYILNGDYT .. . . :: .. .: : :. KIAA00 ENGWAPPNCETKGYGG--SVDSGPTYNEMNTALRDGLLVFFFLIVPLIVCAIFIFIKRDQ 550 560 570 580 590 600 >>KIAA1445 ( 1202 res) fg03469b (1202 aa) initn: 385 init1: 229 opt: 237 Z-score: 216.3 bits: 51.8 E(): 6.3e-07 Smith-Waterman score: 270; 26.761% identity (47.042% similar) in 355 aa overlap (329-647:519-823) 300 310 320 330 340 350 KIAA13 DQSMAEFHGSGLKHYLLTLFSVAARLYKHPSIRNS---VSLVVVKILVIHDEQKGPE--- :.: : :.:: .: . : : : KIAA14 TERSLQDAQRLFLMSEAVQPVTPEPCVTQDSVRFSHLVVDLVQAKDTLYHVLYIGTESGT 490 500 510 520 530 540 360 370 380 390 400 KIAA13 ---VTSNAALTLRNFCNWQKQHNPPSDRDAEHYDTAILFTRQDLCGSQTCDTLGMADVGT . :.:. .:.. : .. : : : . :: . . : .:. : :. KIAA14 ILKALSTASRSLHG-CYLEELHVLPPGRREPLRSLRILHSARALF-------VGLRD-GV 550 560 570 580 590 410 420 430 440 450 460 KIAA13 VCDPSRSCSVIEDDGLQAAFTTAHELGHVFNMPHD--DAKQ--CASLNGVNQDSHMMASM . : . :.. ...: : :.. :. :.:: :..: .:: :. KIAA14 LRVPLERCAAYRSQG---ACLGARD-------PYCGWDGKQQRCSTL----EDSSNMSLW 600 610 620 630 640 470 480 490 500 510 520 KIAA13 LSNLDHSQPWSPCSAYMITSFLDNGHGECLMDKPQNPIQLPGDLPGTSYDANRQCQFTFG .:. . : . .: :.: : : .: : : : : . .: KIAA14 TQNI------TACPVRNVTR--DGGFG------PWSPWQPCEHLDG---DNSGSCLCR-- 650 660 670 680 530 540 550 560 570 KIAA13 EDSKHCPDAASTCSTLWCTGTSGGVLVCQTKH--FPWAD----GTSCGEG-----KWCIN .. : . :. : : : . . :. . ::.. .:::: : . : : KIAA14 --ARSCDSPRPRCGGLDCLGPAIHIANCSRNGAWTPWSSWALCSTSCGIGFQVRQRSCSN 690 700 710 720 730 740 580 590 600 610 620 KIAA13 ------GK-CVNKTDRKHF---DTPFHGS--WGMWGPWGDCSRTCGGGVQYTMRECDNPV :. ::.:. ...: .:: :. :: :. :: .::::.: : :.: KIAA14 PAPRHGGRICVGKSREERFCNENTPCPVPIFWASWGSWSKCSSNCGGGMQSRRRACEN-- 750 760 770 780 790 800 630 640 650 660 670 680 KIAA13 PKNGGKYCEGKRVRYRSCNLEDCPDNNGKTFREEQCEAHNEFSKASFGSGPAVEWIPKYA :. : : :....:: : ::. KIAA14 ----GNSCLGCGVEFKTCNPEGCPEVRRNTPWTPWLPVNVTQGGARQEQRFRFTCRAPLA 810 820 830 840 850 >>KIAA0550 ( 1524 res) hh15909 (1524 aa) initn: 214 init1: 137 opt: 213 Z-score: 193.3 bits: 47.9 E(): 1.2e-05 Smith-Waterman score: 233; 23.214% identity (46.726% similar) in 336 aa overlap (335-646:213-510) 310 320 330 340 350 360 KIAA13 FHGSGLKHYLLTLFSVAARLYKHPSIRNSVSLVVVKILVIH-DEQKGPEVTSNAALTLRN ::.... .:. .:: .:.. : . KIAA05 SENGRTESCGIMYTKCTCPQHLGEWGIDDQSLILLNNVVLPLNEQTEGCLTQE--LQTTQ 190 200 210 220 230 240 370 380 390 400 410 KIAA13 FCNWQKQ-HNPPSDRDAEHYDTAILFTR-----QDLCGSQTCDTLG-MADVGT--VCDPS :: .. . ::... . : .: : . .. :. ::..: : . : KIAA05 VCNLTREAKRPPKEEFGMMGDHTIKSQRPRSVHEKRVPQEQADAAKFMAQTGESGVEEWS 250 260 270 280 290 300 420 430 440 450 460 470 KIAA13 R--SCSVIEDDGLQA-AFTTAHELGHVFNMPHDDAKQCASLNGVNQDSHMMASMLSNLDH . .::: .: :. . : . : . : ... : .. . . . .. 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