# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fh13826.fasta.huge -Q ../query/KIAA1322.ptfa ./tmplib.24314 2
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

 KIAA1322, 702 aa
 vs ./tmplib.24314 library

1986803 residues in  2037 sequences
  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5251+/-0.00636; mu= 8.3153+/- 0.431
 mean_var=159.3165+/-37.788, 0's: 0 Z-trim: 10  B-trim: 0 in 0/40
 Lambda= 0.101612

FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width:  16
The best scores are:                                      opt bits E(2037)
KIAA0608  ( 775 res)   hh00889b                    ( 775) 2225 338.5 1.4e-93
KIAA0019  ( 838 res)   ha00537                     ( 838)  328 60.4 7.7e-10
KIAA1108  ( 763 res)   hh03387s1                   ( 763)  307 57.3 6.1e-09
KIAA0603  ( 1348 res)   hg01488b                   (1348)  303 57.0 1.3e-08
KIAA1055  ( 868 res)   hh09512                     ( 868)  263 50.9 5.9e-07
KIAA0397  ( 1016 res)   fj00010                    (1016)  193 40.7  0.0008
KIAA0882  ( 1291 res)   hk07544s1                  (1291)  189 40.3  0.0014
KIAA0676  ( 1262 res)   hk02596                    (1262)  179 38.8  0.0038
KIAA1941  ( 1233 res)   ah04470                    (1233)  177 38.5  0.0046


>>KIAA0608  ( 775 res)   hh00889b                         (775 aa)
 initn: 2193 init1: 1314 opt: 2225  Z-score: 1771.8  bits: 338.5 E(): 1.4e-93
Smith-Waterman score: 2225;  70.626% identity (89.417% similar) in 463 aa overlap (242-701:316-774)

             220       230       240       250       260           
KIAA13 VTLSSIKETRGLHQQDCVHEAEEGSKLKILGPFSNFFARNLLARKQSARLDK--HNDLGW
                                     : :..::.:::.  :.. .: .  :.  ::
KIAA06 RDHLPPAGPPVPLPAAEQGPAGASARARRSGGFADFFTRNLFP-KRTKELKSVVHSAPGW
         290       300       310       320        330       340    

     270       280       290       300       310       320         
KIAA13 KLFGKAPLRENAQKDSKRIQKEYEDKAGRPSKPPSPKQNVRKNLDFEPLSTTALILEDRP
       :::::.: ::: :: :: ::.::: ..::  ::: :... :::..:::::::::::::::
KIAA06 KLFGKVPPRENLQKTSKIIQQEYEARTGRTCKPP-PQSSRRKNFEFEPLSTTALILEDRP
          350       360       370        380       390       400   

     330       340       350       360       370       380         
KIAA13 ANLPAKPAEEAQKHRQQYEEMVVQAKKRELKEAQRRKKQLEERCRVEESIGNAVLTWNNE
       .::::: .::: .:::.:.:::..:::::.:::..::. ..:: . ::.:..:.. : ::
KIAA06 SNLPAKSVEEALRHRQEYDEMVAEAKKREIKEAHKRKRIMKERFKQEENIASAMVIWINE
           410       420       430       440       450       460   

     390       400       410       420       430       440         
KIAA13 ILPNWETMWCSRKVRDLWWQGIPPSVRGKVWSLAIGNELNITHELFDICLARAKERWRSL
       ::::::.:  .:.::.:::::.::::::::::::.::::::: ::..: :.::::::.:.
KIAA06 ILPNWEVMRSTRRVRELWWQGLPPSVRGKVWSLAVGNELNITPELYEIFLSRAKERWKSF
           470       480       490       500       510       520   

     450       460       470       480       490       500         
KIAA13 STGGSEVENEDAGFSAADREASLELIKLDISRTFPNLCIFQQGGPYHDMLHSILGAYTCY
       :  .:  ::.  : :.:::::::::::::::::::.: :::.::::::.:::::::::::
KIAA06 SETSS--ENDTEGVSVADREASLELIKLDISRTFPSLYIFQKGGPYHDVLHSILGAYTCY
             530       540       550       560       570       580 

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KIAA13 RPDVGYVQGMSFIAAVLILNLDTADAFIAFSNLLNKPCQMAFFRVDHGLMLTYFAAFEVF
       :::::::::::::::::::::. :::::::.::::::::.:::::::..:: :::.::::
KIAA06 RPDVGYVQGMSFIAAVLILNLEEADAFIAFANLLNKPCQLAFFRVDHSMMLKYFATFEVF
             590       600       610       620       630       640 

     570       580       590       600       610       620         
KIAA13 FEENLPKLFAHFKKNNLTPDIYLIDWIFTLYSKSLPLDLACRIWDVFCRDGEEFLFRTAL
       ::::: ::: :::. .::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::.:
KIAA06 FEENLSKLFLHFKSYSLTPDIYLIDWIFTLYSKSLPLDLACRVWDVFCRDGEEFLFRTGL
             650       660       670       680       690       700 

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KIAA13 GILKLFEDILTKMDFIHMAQFLTRLPEDLPAEELFASIATIQMQSRNKKWAQVLTALQKD
       :::.:.:::: .:::::.:::::.::::. .:.::. ::.::::. .:::.::.....::
KIAA06 GILRLYEDILLQMDFIHIAQFLTKLPEDITSEKLFSCIAAIQMQNSTKKWTQVFASVMKD
             710       720       730       740       750       760 

     690        700  
KIAA13 SREMEKGS-PSLRH
        .: .:.: :.:. 
KIAA06 IKEGDKNSSPALKS
             770     

>>KIAA0019  ( 838 res)   ha00537                          (838 aa)
 initn: 295 init1: 135 opt: 328  Z-score: 268.5  bits: 60.4 E(): 7.7e-10
Smith-Waterman score: 378;  26.923% identity (56.154% similar) in 390 aa overlap (303-682:7-364)

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KIAA13 GKAPLRENAQKDSKRIQKEYEDKAGRPSKPPSPKQNVRKNLDFEPLSTTALILE--DRP-
                                     : : .:  ... ..  .  : :.   ::  
KIAA00                         LGQHSDPFPVMNSDQDVALKLAQERAEIVAKYDRGR
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     330       340       350       360          370       380      
KIAA13 ANLPAKPAEEAQKHRQQYEEMVVQAKKRELKE---AQRRKKQLEERCRVEESIGNAVLTW
        .   .: :.:.    .  .     ...:: .   : .:.:.::    .:..       :
KIAA00 EGAEIEPWEDADYLVYKVTDRFGFLHEEELPDHNVAVERQKHLE----IERTT-----KW
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KIAA13 NNEILPNWETMWCSRKVRDLWWQGIPPSVRGKVWSLAIGNELNITHELFDICLARAKERW
         ..: .:: .  ..: .   ..::: ..::.::.:           :..:   . ::. 
KIAA00 L-KMLKGWEKYKNTEKFHRRIYKGIPLQLRGEVWAL-----------LLEI--PKMKEET
         90       100       110       120                    130   

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KIAA13 RSLSTGGSEVENEDAGFSAADREASLELIKLDISRTFPNLCIFQ-QGGPYHDMLHSILGA
       :.:    :.....  : :   :.     : ::..::: .  .:. . :  .. :  .:.:
KIAA00 RDLY---SKLKHRARGCSPDIRQ-----IDLDVNRTFRDHIMFRDRYGVKQQSLFHVLAA
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         510       520       530       540         550       560   
KIAA13 YTCYRPDVGYVQGMSFIAAVLILNLDTADAFIAFSNLLNKP--CQMAFFRVDHGLMLTYF
       :. :  .::: :::: :.:.:.. ..  ::: :. .:.. :   . .::      .: . 
KIAA00 YSIYNTEVGYCQGMSQITALLLMYMNEEDAFWALVKLFSGPKHAMHGFFVQGFPKLLRFQ
         190       200       210       220       230       240     

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KIAA13 AAFEVFFEENLPKLFAHFKKNNLTPDIYLIDWIFTLYSKSLPLDLACRIWDVFCRDGEEF
          : .... : ::  :. ....  ..: . :.:  .    :. :  ::::..  .::. 
KIAA00 EHHEKILNKFLSKLKQHLDSQEIYTSFYTMKWFFQCFLDRTPFTLNLRIWDIYIFEGERV
         250       260       270       280       290       300     

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KIAA13 LFRTALGILKLFEDILTKMDFIHMAQFLTR-LPEDLPAEELFASIATIQMQSRNKKWAQV
       :   .  :::: .  : :... ....:. . : .:.  :. :. :  .:..  . : :..
KIAA00 LTAMSYTILKLHKKHLMKLSMEELVEFFQETLAKDFFFEDDFV-IEQLQISMTELKRAKL
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            690       700                                          
KIAA13 LTALQKDSREMEKGSPSLRH                                        
                                                                   
KIAA00 DLPEPGKEDEYPKKPLGQLPPELQSWGVHHLSNGQRSVGRPSPLASGRRESGAPHRRHEH
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>>KIAA1108  ( 763 res)   hh03387s1                        (763 aa)
 initn: 234 init1: 234 opt: 307  Z-score: 252.3  bits: 57.3 E(): 6.1e-09
Smith-Waterman score: 324;  20.797% identity (52.686% similar) in 577 aa overlap (146-694:122-655)

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KIAA13 LPSCAPPAPSSTEREQSVRKSSTFPRTGYDSVKLYSPTSKALTR-SDDVSVCSVSSLG-T
                                     :: : :  :..:.  : . :::   .:  .
KIAA11 KNKAKRSLTESLESILSRGNKARGLQEHSISVDLDSSLSSTLSNTSKEPSVCEKEALPIS
             100       110       120       130       140       150 

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KIAA13 ELSTTLSVSNEDILDLVVTSSSSAIVTLENDDDPQFTNVTLSSIKETRGLHQQDCVHEAE
       : :  :  :.::.       ::..   : ..  :   . ..    .: .    .: .  .
KIAA11 ESSFKLLGSSEDL-------SSDSESHLPEEPAPLSPQQAFRRRANTLSHFPIECQEPPQ
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KIAA13 E-----GSKLKILGPFSNFFARNLLARKQSARLDKHNDLGWKLFGKAPLRENAQKDSKRI
             : . . :  . .  ...   ::.    .: : :: .  : .:..  ... : : 
KIAA11 PARGSPGVSQRKLMRYHSVSTETPHERKDFE--SKANHLGDS--GGTPVK--TRRHSWRQ
          210       220       230         240         250          

      290       300       310        320       330       340       
KIAA13 QKEYEDKAGRPSKPPSPKQNVRKNL-DFEPLSTTALILEDRPANLPAKPAEEAQKH-RQQ
       :   .  . . .   : . .  ..: .. : :    . :: : . : .  ...... :. 
KIAA11 QIFLRVATPQKACDSSSRYEDYSELGELPPRSPLEPVCEDGPFGPPPEEKKRTSRELREL
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        350         360           370       380       390       400
KIAA13 YEEMVVQAKK--RELKEAQRRKKQ----LEERCRVEESIGNAVLTWNNEILPNWETMWCS
       ... ..:     :  :: :. . .    :..: ...    .  :   .:.   :: :  .
KIAA11 WQKAILQQILLLRMEKENQKLQASENDLLNKRLKLDYEEITPCL---KEVTTVWEKMLST
      320       330       340       350       360          370     

                        410       420       430       440       450
KIAA13 ----------RKVRDLWWQGIPPSVRGKVWSLAIGNELNITHELFDICLARAKERWRSLS
                 .:...   ::.:   ::..:.. ....... :..                
KIAA11 PGRSKIKFDMEKMHSAVGQGVPRHHRGEIWKF-LAEQFHLKHQF----------------
         380       390       400        410                        

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KIAA13 TGGSEVENEDAGFSAADREASLEL--IKLDISRTFPNLCIFQ-QGGPYHDMLHSILGAYT
          :. . .:. ..   .. . .   : .:..::::.   :. : :  .  :..:: ::.
KIAA11 --PSKQQPKDVPYKELLKQLTSQQHAILIDLGRTFPTHPYFSAQLGAGQLSLYNILKAYS
        420       430       440       450       460       470      

       510       520       530       540       550       560       
KIAA13 CYRPDVGYVQGMSFIAAVLILNLDTADAFIAFSNLLNKPCQMAFFRVDHGLMLTYFAAFE
           .::: ::.::.:..:.:...  .::  .. :.        .: :  ..   .  . 
KIAA11 LLDQEVGYCQGLSFVAGILLLHMSEEEAFKMLKFLMFDMGLRKQYRPDMIILQIQMYQLS
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       570       580       590       600       610       620       
KIAA13 VFFEENLPKLFAHFKKNNLTPDIYLIDWIFTLYSKSLPLDLACRIWDVFCRDGEEFLFRT
        ....    :. :...... :..:   :..:......:: .. :..:..  .: : .:..
KIAA11 RLLHDYHRDLYNHLEEHEIGPSLYAAPWFLTMFASQFPLGFVARVFDMIFLQGTEVIFKV
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KIAA13 ALGILKLFEDILTKMDFIHMAQFLTRLPEDLPAEELFASIATIQMQSRNKKWAQVLTALQ
       ::..:   . .. . .  ..  ..  .   ::      ... .::..  ..  ..  : :
KIAA11 ALSLLGSHKPLILQHE--NLETIVDFIKSTLP------NLGLVQMEKTINQVFEMDIAKQ
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KIAA13 KDSREMEKGSPSLRH                                             
        .. :.:                                                     
KIAA11 LQAYEVEYHVLQEELIDSSPLSDNQRMDKLEKTNSSLRKQNLDLLEQLQVANGRIQSLEA
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KIAA13 SLQSVDSGIPTLEIGNPEPVPCSAVHVRRKQSDSDLIPERAFQSACALPSCAPPAPSSTE
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KIAA13 REQSVRKSSTFPRTGYDSVKLYSPTSKALTRSD--DVSVCSVSSLGTELSTTLSVSNEDI
        .   ...:  :.    .  .  : :..  . .  :  . .: :   . :.. . :: . 
KIAA06 WQTFPEEDSDSPQFRRRAHTFSHPPSSTKRKLNLQDGRAQGVRSPLLRQSSSEQCSNLSS
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KIAA13 LDLVV--TSSSSAIVTLEND-DDPQFTNVT-LSSIKETRGLH--------QQDCVHEAEE
       .  .   ..:::.. .:... . :.::  . :.:. .. :          .:: . :. .
KIAA06 VRRMYKESNSSSSLPSLHTSFSAPSFTAPSFLKSFYQNSGRLSPQYENEIRQDTASESSD
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KIAA13 GSKLKILGPFSNFFARNLLARKQSARLDKHNDLGWKLFGKAPLRENAQKDSKRIQKEYED
       :   :     :.  . . :.   ..   .. .   ..: ..    : . .. . :   . 
KIAA06 GEGRKRT---SSTCSNESLSVGGTSVTPRRISWRQRIFLRVASPMNKSPSAMQQQDGLDR
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KIAA13 KAGRPSKPPSPKQNVRKNLDFEPLSTTALILEDRPANLPAKPAEEAQKH------RQQYE
       .   : .: ::      ... ::: .  :  :: : ..  .   .  .       .::  
KIAA06 NELLPLSPLSP------TMEEEPL-VIFLSGEDDPEKIEERKKSKELRSLWRKAIHQQIL
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KIAA13 EMVVQAKKRELKEAQRRKKQLEERCRVE-ESIG----NAVLTWNNEILPNWETMWCSRK-
        . .. ....:. :.: . :  .. ... : .:    ....::....:     . :. . 
KIAA06 LLRMEKENQKLEGASRDELQ-SRKVKLDYEEVGACQKEVLITWDKKLLNCRAKIRCDMED
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KIAA13 VRDLWWQGIPPSVRGKVWSLAIGNELNITHELFDICLARAKERWRSLSTGGSEVENEDAG
       .. :  .:.: : ::..:.. .. .  . :.: .      :..  ..:   .:. ..   
KIAA06 IHTLLKEGVPKSRRGEIWQF-LALQYRLRHRLPN------KQQPPDISY--KELLKQ---
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KIAA13 FSAADREASLELIKLDISRTFPNLCIFQ-QGGPYHDMLHSILGAYTCYRPDVGYVQGMSF
         .:...: :    .:..::::.   :. : :: .  : ..: ::.    .::: ::.::
KIAA06 -LTAQQHAIL----VDLGRTFPTHPYFSVQLGPGQLSLFNLLKAYSLLDKEVGYCQGISF
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KIAA13 IAAVLILNLDTADAFIAFSNLLNKPCQMAFFRVDHGLMLTYFAAFEVFFEENLPKLFAHF
       .:.::.:...  .::  .. :.        .: :   .   .  .  ....    :. :.
KIAA06 VAGVLLLHMSEEQAFEMLKFLMYDLGFRKQYRPDMMSLQIQMYQLSRLLHDYHRDLYNHL
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KIAA13 KKNNLTPDIYLIDWIFTLYSKSLPLDLACRIWDVFCRDGEEFLFRTALGILKLFEDILTK
       ..:...:..:   :..::..... : .. :..:..  .: : .:..::..:.  : .. .
KIAA06 EENEISPSLYAAPWFLTLFASQFSLGFVARVFDIIFLQGTEVIFKVALSLLSSQETLIME
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KIAA13 MD-FIHMAQFLTRLPEDLPAEELFASIATIQMQSRNKKWAQVLTALQKDSREMEKGSPSL
        . : ....::     :. . :.   :. .                              
KIAA06 CESFENIVEFLKNTLPDMNTSEMEKIITQVFEMDISKQLHAYEVEYHVLQDELQESSYSC
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>>KIAA1055  ( 868 res)   hh09512                          (868 aa)
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KIAA13 TELSTTLSVSNEDILDLVVTSSSSAIVTLENDDDPQFTNVTLSSIKETRGLHQQDCVHEA
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KIAA13 EEGSKLKILGPFSNFFARNLLARKQSARLDKHNDLGWKLFG-KAPLRENAQKDSKRIQKE
        .: : .  . : :    .: : ...:.  .. ::  :  . .: :    : .:: .   
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KIAA13 YEDKAGRPSKPPSPKQNVRKNLDFEPLSTTALILEDRPANLPAKPAEEAQKHRQQYEEMV
        : :.   :.  .: ..:  .:  . :.. .   ...: .  .::   ..     ..  :
KIAA10 QEMKTPVCSEDQGPTREVIAQLLEDALQVES---QEQPEQAFVKPHLVSEYDIYGFRT-V
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KIAA13 VQAKKRELKEAQRRKKQLEERCRVEESIGNAVLTWNNEILP--NWETMWCSRKVRDLWWQ
        .  ..:   :. :  .:.    .:..  .. . :.: .    : : : :: ....:   
KIAA10 PEDDEEEKLVAKVRALDLKTLYLTENQEVSTGVKWENYFASTVNREMM-CSPELKNLIRA
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KIAA13 GIPPSVRGKVWSLAIGNELNITHELFDICLARAKERWRSLSTGGSEVENEDAGFSAADRE
       :::   :.:::.                :. :  ..... .  :      . ..   .  
KIAA10 GIPHEHRSKVWKW---------------CVDRHTRKFKDNTEPGHFQTLLQKALEKQN-P
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KIAA13 ASLELIKLDISRTFPN----LCIFQQGGPYHDMLHSILGAYTCYRPDVGYVQGMSFIAAV
       :: . :.::. ::.::     :  ..:    . :...: :..   ::.:: ::.. ..::
KIAA10 AS-KQIELDLLRTLPNNKHYSCPTSEGI---QKLRNVLLAFSWRNPDIGYCQGLNRLVAV
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KIAA13 LILNLDTADAFIAFSNLLNKPCQMAFF-RVDHGLMLTYFAAFEVFFEENLPKLFAHFKKN
        .: :.  :::  . ....      .. ..  : ..    .:. .. :.::.: .::.. 
KIAA10 ALLYLEQEDAFWCLVTIVEVFMPRDYYTKTLLGSQVDQ-RVFRDLMSEKLPRLHGHFEQY
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KIAA13 NLTPDIYLIDWIFTLYSKSLPLDLACRIWDVFCRDGEEFLFRTALGILKL-FEDILTKMD
       ..   .  ..:.....  :.  :.  .::: :  .: . .:: ::...:   :.::  .:
KIAA10 KVDYTLITFNWFLVVFVDSVVSDILFKIWDSFLYEGPKVIFRFALALFKYKEEEILKLQD
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KIAA13 FIHMAQFLTRLPEDLPAEELFASIATIQMQSRNKKWAQVLTALQKDSREMEKGSPSLRH
        . . ..:                                                   
KIAA10 SMSIFKYLRYFTRTILDARSGTDAPTTWRKSGWS                         
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>>KIAA0397  ( 1016 res)   fj00010                         (1016 aa)
 initn: 105 init1:  73 opt: 193  Z-score: 160.5  bits: 40.7 E(): 0.0008
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KIAA13 RAKERWRSLSTGGSEVENEDAGFSAADREASLELIKLDISRTFPNLCIFQQGGPYHDMLH
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KIAA03 PQAGELEAGEELAAVCAAAYTIELLDTVALNLHRIDKDVQRCDRNYWYFTP--PNLERLR
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KIAA13 SILGAYTCYRPDVGYVQGMSFIAAVLILNLDTAD-AFIAFSNLLNKPCQMAFFRVDHGLM
       ... .:.  . ::::::::  . : :...::. . :.  ::.:...  :  :   . : :
KIAA03 DVMCSYVWEHLDVGYVQGMCDLLAPLLVTLDNDQLAYSCFSHLMKRMSQ-NF--PNGGAM
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KIAA13 LTYFAAFEVFFEENLPKLFAHFKKNNLTPDIYL-IDWIFTLYSKSLPLDLACRIWDVF--
        :.:: .. ...    .::  ...:.    .:.   :..  ... :  . .  .:.:.  
KIAA03 DTHFANMRSLIQILDSELFELMHQNGDYTHFYFCYRWFLLDFKRELLYEDVFAVWEVIWA
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KIAA13 CR--DGEEFLFRTALGILKLFEDIL--TKMDFIHMAQFLTRLPEDLPAEELFAS----IA
        :  ..:.:..  ::.... ...:.  ..:::  . .:...  :   :.:..      . 
KIAA03 ARHISSEHFVLFIALALVEAYREIIRDNNMDFTDIIKFFNERAEHHDAQEILRIARDLVH
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KIAA13 TIQMQSRNKKWAQVLTALQKDSREMEKGSPSLRH
        .::  .::                         
KIAA03 KVQMLIENK                         
      1010                               

>>KIAA0882  ( 1291 res)   hk07544s1                       (1291 aa)
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KIAA13 KQLEERCRVEESIGNAVLTWNNEILPNWETMWCSRKVRDLWWQGIPPSVRGKVWSLAIG-
                                     :. ..:.:.:  .::: :.::..: :  : 
KIAA08 PEEFNPKLAKEFLKEQAWKIHFAEYGQGICMYRTEKTRELVLKGIPESMRGELWLLLSGA
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KIAA13 -NELNITHELFDICLARAKERWRSLSTGGSEVENEDAGFSAADREASLELIKLDISRTFP
        :: . ::  .          ...:      ::.  . .. : .:     :. :. :..:
KIAA08 INE-KATHPGY----------YEDL------VEKSMGKYNLATEE-----IERDLHRSLP
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KIAA13 NLCIFQQGGPYHDMLHSILGAYTCYRPDVGYVQGMSFIAAVLILNLDTADAFIAFSNLLN
       .   ::.       :. .: ::.   :..:: :.:.....::.:     .::  .  : .
KIAA08 EHPAFQNEMGIA-ALRRVLTAYAFRNPNIGYCQAMNIVTSVLLLYAKEEEAFWLLVALCE
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Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]