# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fh04032.fasta.nr -Q ../query/KIAA1304.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
KIAA1304, 1051 aa
vs /cdna2/lib/nr/nr library
2693465022 residues in 7827732 sequences
statistics sampled from 60000 to 7818877 sequences
Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9873+/-0.000197; mu= 10.7189+/- 0.011
mean_var=109.2077+/-20.787, 0's: 36 Z-trim: 72 B-trim: 6 in 1/64
Lambda= 0.122729
FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16
The best scores are: opt bits E(7827732)
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gi|114643999|ref|XP_001164049.1| PREDICTED: SLIT-R (1061) 6831 1221.1 0
gi|109097610|ref|XP_001116821.1| PREDICTED: simila (1059) 6806 1216.7 0
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gi|76665096|ref|XP_590495.2| PREDICTED: similar to (1075) 4711 845.8 0
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gi|219520432|gb|AAI44344.1| SRGAP2 protein [Homo s (1070) 4697 843.3 0
gi|213626327|gb|AAI71580.1| Unknown (protein for M (1071) 4657 836.2 0
gi|109035849|ref|XP_001097317.1| PREDICTED: simila (1075) 4639 833.0 0
gi|16797663|gb|AAL27030.1| GAP1 [Mus musculus] ( 714) 4583 823.0 0
gi|119584354|gb|EAW63950.1| SLIT-ROBO Rho GTPase a ( 955) 4197 754.7 5e-215
gi|119908010|ref|XP_598073.3| PREDICTED: similar t (1071) 4128 742.5 2.6e-211
gi|124375936|gb|AAI32873.1| SLIT-ROBO Rho GTPase a (1071) 4122 741.5 5.4e-211
gi|48427907|sp|O75044.2|FNBP2_HUMAN RecName: Full= (1071) 4119 741.0 7.9e-211
gi|194210238|ref|XP_001491388.2| PREDICTED: SLIT-R (1103) 4108 739.0 3.1e-210
gi|119584355|gb|EAW63951.1| SLIT-ROBO Rho GTPase a ( 935) 4105 738.4 4e-210
gi|74005918|ref|XP_848803.1| PREDICTED: similar to (1071) 4102 737.9 6.3e-210
gi|109018622|ref|XP_001089021.1| PREDICTED: SLIT-R (1071) 4092 736.2 2.2e-209
gi|122065186|sp|Q91Z67.2|FNBP2_MOUSE RecName: Full (1071) 4088 735.5 3.5e-209
gi|114572189|ref|XP_001163866.1| PREDICTED: SLIT-R (1040) 4074 733.0 1.9e-208
gi|74005924|ref|XP_857241.1| PREDICTED: similar to (1083) 4035 726.1 2.4e-206
gi|55962271|emb|CAI11583.1| novel protein similar (1035) 4030 725.2 4.2e-206
gi|74005916|ref|XP_536107.2| PREDICTED: similar to ( 836) 3986 717.3 8e-204
gi|148707762|gb|EDL39709.1| mCG131000, isoform CRA (1042) 3980 716.3 2e-203
gi|221041046|dbj|BAH12200.1| unnamed protein produ ( 789) 3956 712.0 3.1e-202
gi|74005904|ref|XP_856820.1| PREDICTED: similar to ( 789) 3934 708.1 4.6e-201
gi|119617529|gb|EAW97123.1| SLIT-ROBO Rho GTPase a ( 610) 3888 699.8 1.1e-198
gi|109097608|ref|XP_001116844.1| PREDICTED: simila (1083) 3888 700.1 1.6e-198
gi|48428624|sp|Q7Z6B7.1|SRGP1_HUMAN RecName: Full= (1085) 3888 700.1 1.6e-198
gi|114643995|ref|XP_509190.2| PREDICTED: SLIT-ROBO (1085) 3879 698.5 4.9e-198
gi|74005908|ref|XP_856904.1| PREDICTED: similar to (1079) 3877 698.1 6.3e-198
gi|74005922|ref|XP_857192.1| PREDICTED: similar to (1081) 3872 697.2 1.2e-197
gi|118102419|ref|XP_417972.2| PREDICTED: similar t (1073) 3860 695.1 5e-197
gi|73968703|ref|XP_538265.2| PREDICTED: similar to (1104) 3853 693.9 1.2e-196
gi|74005910|ref|XP_856941.1| PREDICTED: similar to (1084) 3849 693.2 2e-196
gi|149715245|ref|XP_001491726.1| PREDICTED: SLIT-R (1085) 3835 690.7 1.1e-195
gi|114572193|ref|XP_001163788.1| PREDICTED: SLIT-R ( 918) 3822 688.3 4.7e-195
gi|55662259|emb|CAH73674.1| SLIT-ROBO Rho GTPase a ( 984) 3822 688.3 5e-195
gi|114572191|ref|XP_001163825.1| PREDICTED: SLIT-R (1003) 3822 688.3 5.1e-195
gi|126306747|ref|XP_001365837.1| PREDICTED: simila (1073) 3819 687.8 7.7e-195
gi|114572187|ref|XP_001163749.1| PREDICTED: SLIT-R (1072) 3816 687.3 1.1e-194
gi|119892384|ref|XP_587244.3| PREDICTED: similar t (1085) 3814 687.0 1.4e-194
gi|124486650|ref|NP_001074506.1| SLIT-ROBO Rho GTP (1085) 3787 682.2 3.9e-193
gi|109480632|ref|XP_235213.4| PREDICTED: similar t (1085) 3780 680.9 9.3e-193
gi|74005906|ref|XP_856858.1| PREDICTED: similar to (1089) 3727 671.6 6.2e-190
>>gi|114643997|ref|XP_001164248.1| PREDICTED: SLIT-ROBO (1062 aa)
initn: 6900 init1: 6900 opt: 6900 Z-score: 6602.5 bits: 1233.4 E(): 0
Smith-Waterman score: 6900; 99.808% identity (100.000% similar) in 1040 aa overlap (12-1051:23-1062)
10 20 30 40
KIAA13 CNHPLASLLSLEIRAQLVEQQKCLEQQTEMRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|114 MSTPSRFKKDKEIIAEYESQVKEIRAQLVEQQKCLEQQTEMRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
KIAA13 TEYSRNLEKLAERFMAKTRSTKDHQQYKKDQNLLSPVNCWYLLLNQVRRESKDHATLSDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|114 TEYSRNLEKLAERFMAKTRSTKDHQQYKKDQNLLSPVNCWYLLLNQVRRESKDHATLSDI
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
KIAA13 YLNNVIMRFMQISEDSTRMFKKSKEIAFQLHEDLMKVLNELYTVMKTYHMYHAESISAES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|114 YLNNVIMRFMQISEDSTRMFKKSKEIAFQLHEDLMKVLNELYTVMKTYHMYHAESISAES
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
KIAA13 KLKEAEKQEEKQIGRSGDPVFHIRLEERHQRRSSVKKIEKMKEKRQAKYSENKLKSIKAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|114 KLKEAEKQEEKQIGRSGDPVFHIRLEERHQRRSSVKKIEKMKEKRQAKYSENKLKSIKAR
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
KIAA13 NEYLLTLEATNASVFKYYIHDLSDLIDCCDLGYHASLNRALRTYLSAEYNLETSRHEGLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|114 NEYLLTLEATNASVFKYYIHDLSDLIDCCDLGYHASLNRALRTYLSAEYNLETSRHEGLD
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
KIAA13 IIENAVDNLEPRSDKQRFMEMYPAAFCPPMKFEFQSHMGDEVCQVSAQQPVQAELMLRYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|114 IIENAVDNLEPRSDKQRFMEMYPAAFCPPMKFEFQSHMGDEVCQVSAQQPVQAELMLRYQ
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
KIAA13 QLQSRLATLKIENEEVKKTTEATLQTIQDMVTIEDYDVSECFQHSRSTESVKSTVSETYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|114 QLQSRLATLKIENEEVKKTTEATLQTIQDMVTIEDYDVSECFQHSRSTESVKSTVSETYL
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
KIAA13 SKPSIAKRRANQQETEQFYFMKLREYLEGSNLITKLQAKHDLLQRTLGEGHRAEYMTTSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|114 SKPSIAKRRANQQETEQFYFMKLREYLEGSNLITKLQAKHDLLQRTLGEGHRAEYMTTSR
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
KIAA13 GRRNSHTRHQDSGQVIPLIVESCIRFINLYGLQHQGIFRVSGSQVEVNDIKNSFERGENP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|114 GRRNSHTRHQDSGQVIPLIVESCIRFINLYGLQHQGIFRVSGSQVEVNDIKNSFERGENP
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530 540 550 560 570 580
KIAA13 LADDQSNHDINSVAGVLKLYFRGLENPLFPKERFNDLISCIRIDNLYERALHIRKLLLTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|114 LADDQSNHDINSVAGVLKLYFRGLENPLFPKERFNDLISCIRIDNLYERALHIRKLLLTL
550 560 570 580 590 600
590 600 610 620 630 640
KIAA13 PRSVLIVMRYLFAFLNHLSQYSDENMMDPYNLAICFGPTLMPVPEIQDQVSCQAHVNEII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|114 PRSVLIVMRYLFAFLNHLSQYSDENMMDPYNLAICFGPTLMPVPEIQDQVSCQAHVNEII
610 620 630 640 650 660
650 660 670 680 690 700
KIAA13 KTIIIHHETIFPDAKELDGPVYEKCMAGDDYCDSPYSEHGTLEEVDQDAGTEPHTSEDEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|114 KTIIIHHETIFPDAKELDGPVYEKCMAGDDYCDSPYSEHGTLEEVDQDAGTEPHTSEDEC
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710 720 730 740 750 760
KIAA13 EPIEAIAKFDYVGRSARELSFKKGASLLLYHRASEDWWEGRHNGIDGLVPHQYIVVQDMD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|114 EPIEAIAKFDYVGRSARELSFKKGASLLLYHRASEDWWEGRHNGIDGLVPHQYIVVQDMD
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770 780 790 800 810 820
KIAA13 DTFSDTLSQKADSEASSGPVTEDKSSSKDMNSPTDRHPDGYLARQRKRGEPPPPVRRPGR
:::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::
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KIAA13 TSDGHCPLHPPHALSNSSVDLGSPSLASHPRGLLQNRGLNNDSPERRRRPGHGSLTNISR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|114 TSDGHCPLHPPHALSNSSVDLGSPSLASHPRGLLQNRGLNNDSPERRRRPGHGSLTNISR
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890 900 910 920 930 940
KIAA13 HDSLKKIDSPPIRRSTSSGQYTGFNDHKPLDPETIAQDIEETMNTALNELRELERQSTAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|114 HDSLKKIDSPPIRRSTSSGQYTGFNDHKPLDPETIAQDIEETMNTALNELRELERQSTAK
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950 960 970 980 990 1000
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|114 PRMGVQLKPPALRPKPAVLPKTNPTIGPAPPPQGPTDKSCTM
1030 1040 1050 1060
>>gi|114643999|ref|XP_001164049.1| PREDICTED: SLIT-ROBO (1061 aa)
initn: 6834 init1: 3957 opt: 6831 Z-score: 6536.5 bits: 1221.1 E(): 0
Smith-Waterman score: 6831; 99.038% identity (99.423% similar) in 1040 aa overlap (12-1051:23-1061)
10 20 30 40
KIAA13 CNHPLASLLSLEIRAQLVEQQKCLEQQTEMRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|114 MSTPSRFKKDKEIIAEYESQVKEIRAQLVEQQKCLEQQTEMRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
KIAA13 TEYSRNLEKLAERFMAKTRSTKDHQQYKKDQNLLSPVNCWYLLLNQVRRESKDHATLSDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|114 TEYSRNLEKLAERFMAKTRSTKDHQQYKKDQNLLSPVNCWYLLLNQVRRESKDHATLSDI
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110 120 130 140 150 160
KIAA13 YLNNVIMRFMQISEDSTRMFKKSKEIAFQLHEDLMKVLNELYTVMKTYHMYHAESISAES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|114 YLNNVIMRFMQISEDSTRMFKKSKEIAFQLHEDLMKVLNELYTVMKTYHMYHAESISAES
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
KIAA13 KLKEAEKQEEKQIGRSGDPVFHIRLEERHQRRSSVKKIEKMKEKRQAKYSENKLKSIKAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|114 KLKEAEKQEEKQIGRSGDPVFHIRLEERHQRRSSVKKIEKMKEKRQAKYSENKLKSIKAR
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
KIAA13 NEYLLTLEATNASVFKYYIHDLSDLIDCCDLGYHASLNRALRTYLSAEYNLETSRHEGLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|114 NEYLLTLEATNASVFKYYIHDLSDLIDCCDLGYHASLNRALRTYLSAEYNLETSRHEGLD
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
KIAA13 IIENAVDNLEPRSDKQRFMEMYPAAFCPPMKFEFQSHMGDEVCQVSAQQPVQAELMLRYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|114 IIENAVDNLEPRSDKQRFMEMYPAAFCPPMKFEFQSHMGDEVCQVSAQQPVQAELMLRYQ
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
KIAA13 QLQSRLATLKIENEEVKKTTEATLQTIQDMVTIEDYDVSECFQHSRSTESVKSTVSETYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|114 QLQSRLATLKIENEEVKKTTEATLQTIQDMVTIEDYDVSECFQHSRSTESVKSTVSETYL
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410 420 430 440 450 460
KIAA13 SKPSIAKRRANQQETEQFYFMKLREYLEGSNLITKLQAKHDLLQRTLGEGHRAEYMTTSR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: . : .:
gi|114 SKPSIAKRRANQQETEQFYFMKLREYLEGSNLITKLQAKHDLLQRTLGEGDKRE-CGRDR
430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
KIAA13 GRRNSHTRHQDSGQVIPLIVESCIRFINLYGLQHQGIFRVSGSQVEVNDIKNSFERGENP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|114 GRRNSHTRHQDSGQVIPLIVESCIRFINLYGLQHQGIFRVSGSQVEVNDIKNSFERGENP
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
KIAA13 LADDQSNHDINSVAGVLKLYFRGLENPLFPKERFNDLISCIRIDNLYERALHIRKLLLTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|114 LADDQSNHDINSVAGVLKLYFRGLENPLFPKERFNDLISCIRIDNLYERALHIRKLLLTL
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
KIAA13 PRSVLIVMRYLFAFLNHLSQYSDENMMDPYNLAICFGPTLMPVPEIQDQVSCQAHVNEII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|114 PRSVLIVMRYLFAFLNHLSQYSDENMMDPYNLAICFGPTLMPVPEIQDQVSCQAHVNEII
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680 690 700
KIAA13 KTIIIHHETIFPDAKELDGPVYEKCMAGDDYCDSPYSEHGTLEEVDQDAGTEPHTSEDEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|114 KTIIIHHETIFPDAKELDGPVYEKCMAGDDYCDSPYSEHGTLEEVDQDAGTEPHTSEDEC
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750 760
KIAA13 EPIEAIAKFDYVGRSARELSFKKGASLLLYHRASEDWWEGRHNGIDGLVPHQYIVVQDMD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|114 EPIEAIAKFDYVGRSARELSFKKGASLLLYHRASEDWWEGRHNGIDGLVPHQYIVVQDMD
720 730 740 750 760 770
770 780 790 800 810 820
KIAA13 DTFSDTLSQKADSEASSGPVTEDKSSSKDMNSPTDRHPDGYLARQRKRGEPPPPVRRPGR
:::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::
gi|114 DTFSDTLSQKADSEASSGPITEDKSSSKDMNSPTDRHPDSYLARQRKRGEPPPPVRRPGR
780 790 800 810 820 830
830 840 850 860 870 880
KIAA13 TSDGHCPLHPPHALSNSSVDLGSPSLASHPRGLLQNRGLNNDSPERRRRPGHGSLTNISR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|114 TSDGHCPLHPPHALSNSSVDLGSPSLASHPRGLLQNRGLNNDSPERRRRPGHGSLTNISR
840 850 860 870 880 890
890 900 910 920 930 940
KIAA13 HDSLKKIDSPPIRRSTSSGQYTGFNDHKPLDPETIAQDIEETMNTALNELRELERQSTAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|114 HDSLKKIDSPPIRRSTSSGQYTGFNDHKPLDPETIAQDIEETMNTALNELRELERQSTAK
900 910 920 930 940 950
950 960 970 980 990 1000
KIAA13 HAPDVVLDTLEQVKNSPTPATSTESLSPLHNVALRSSEPQIRRSTSSSSDTMSTFKPMVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|114 HAPDVVLDTLEQVKNSPTPATSTESLSPLHNVALRSSEPQIRRSTSSSSDTMSTFKPMVA
960 970 980 990 1000 1010
1010 1020 1030 1040 1050
KIAA13 PRMGVQLKPPALRPKPAVLPKTNPTIGPAPPPQGPTDKSCTM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|114 PRMGVQLKPPALRPKPAVLPKTNPTIGPAPPPQGPTDKSCTM
1020 1030 1040 1050 1060
>>gi|109097610|ref|XP_001116821.1| PREDICTED: similar to (1059 aa)
initn: 6401 init1: 3971 opt: 6806 Z-score: 6512.6 bits: 1216.7 E(): 0
Smith-Waterman score: 6806; 98.942% identity (99.423% similar) in 1040 aa overlap (12-1051:23-1059)
10 20 30 40
KIAA13 CNHPLASLLSLEIRAQLVEQQKCLEQQTEMRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|109 MSTPSRFKKDKEIIAEYESQVKEIRAQLVEQQKCLEQQTEMRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
KIAA13 TEYSRNLEKLAERFMAKTRSTKDHQQYKKDQNLLSPVNCWYLLLNQVRRESKDHATLSDI
:::::::::::::::::::::::::::: . ::::::::::::::::::::::::::::
gi|109 TEYSRNLEKLAERFMAKTRSTKDHQQYKPE--LLSPVNCWYLLLNQVRRESKDHATLSDI
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
KIAA13 YLNNVIMRFMQISEDSTRMFKKSKEIAFQLHEDLMKVLNELYTVMKTYHMYHAESISAES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|109 YLNNVIMRFMQISEDSTRMFKKSKEIAFQLHEDLMKVLNELYTVMKTYHMYHAESISAES
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
KIAA13 KLKEAEKQEEKQIGRSGDPVFHIRLEERHQRRSSVKKIEKMKEKRQAKYSENKLKSIKAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|109 KLKEAEKQEEKQIGRSGDPVFHIRLEERHQRRSSVKKIEKMKEKRQAKYSENKLKSIKAR
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
KIAA13 NEYLLTLEATNASVFKYYIHDLSDLIDCCDLGYHASLNRALRTYLSAEYNLETSRHEGLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|109 NEYLLTLEATNASVFKYYIHDLSDLIDCCDLGYHASLNRALRTYLSAEYNLETSRHEGLD
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
KIAA13 IIENAVDNLEPRSDKQRFMEMYPAAFCPPMKFEFQSHMGDEVCQVSAQQPVQAELMLRYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|109 IIENAVDNLEPRSDKQRFMEMYPAAFCPPMKFEFQSHMGDEVCQVSAQQPVQAELMLRYQ
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
KIAA13 QLQSRLATLKIENEEVKKTTEATLQTIQDMVTIEDYDVSECFQHSRSTESVKSTVSETYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|109 QLQSRLATLKIENEEVKKTTEATLQTIQDMVTIEDYDVSECFQHSRSTESVKSTVSETYL
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
KIAA13 SKPSIAKRRANQQETEQFYFMKLREYLEGSNLITKLQAKHDLLQRTLGEGHRAEYMTTSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..:. :.:
gi|109 SKPSIAKRRANQQETEQFYFMKLREYLEGSNLITKLQAKHDLLQRTLGEGEEAD-CGTDR
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
KIAA13 GRRNSHTRHQDSGQVIPLIVESCIRFINLYGLQHQGIFRVSGSQVEVNDIKNSFERGENP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|109 GRRNSHTRHQDSGQVIPLIVESCIRFINLYGLQHQGIFRVSGSQVEVNDIKNSFERGENP
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530 540 550 560 570 580
KIAA13 LADDQSNHDINSVAGVLKLYFRGLENPLFPKERFNDLISCIRIDNLYERALHIRKLLLTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|109 LADDQSNHDINSVAGVLKLYFRGLENPLFPKERFNDLISCIRIDNLYERALHIRKLLLTL
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
KIAA13 PRSVLIVMRYLFAFLNHLSQYSDENMMDPYNLAICFGPTLMPVPEIQDQVSCQAHVNEII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|109 PRSVLIVMRYLFAFLNHLSQYSDENMMDPYNLAICFGPTLMPVPEIQDQVSCQAHVNEII
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650 660 670 680 690 700
KIAA13 KTIIIHHETIFPDAKELDGPVYEKCMAGDDYCDSPYSEHGTLEEVDQDAGTEPHTSEDEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|109 KTIIIHHETIFPDAKELDGPVYEKCMAGDDYCDSPYSEHGTLEEVDQDAGTEPHTSEDEC
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750 760
KIAA13 EPIEAIAKFDYVGRSARELSFKKGASLLLYHRASEDWWEGRHNGIDGLVPHQYIVVQDMD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|109 EPIEAIAKFDYVGRSARELSFKKGASLLLYHRASEDWWEGRHNGIDGLVPHQYIVVQDMD
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770 780 790 800 810 820
KIAA13 DTFSDTLSQKADSEASSGPVTEDKSSSKDMNSPTDRHPDGYLARQRKRGEPPPPVRRPGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|109 DTFSDTLSQKADSEASSGPVTEDKSSSKDMNSPTDRHPDGYLARQRKRGEPPPPVRRPGR
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KIAA13 TSDGHCPLHPPHALSNSSVDLGSPSLASHPRGLLQNRGLNNDSPERRRRPGHGSLTNISR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|109 TSDGHCPLHPPHALSNSSVDLGSPSLASHPRGLLQNRGLNNDSPERRRRPGHGSLTNISR
840 850 860 870 880 890
890 900 910 920 930 940
KIAA13 HDSLKKIDSPPIRRSTSSGQYTGFNDHKPLDPETIAQDIEETMNTALNELRELERQSTAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|109 HDSLKKIDSPPIRRSTSSGQYTGFNDHKPLDPETIAQDIEETMNTALNELRELERQSTAK
900 910 920 930 940 950
950 960 970 980 990 1000
KIAA13 HAPDVVLDTLEQVKNSPTPATSTESLSPLHNVALRSSEPQIRRSTSSSSDTMSTFKPMVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|109 HAPDVVLDTLEQVKNSPTPATSTESLSPLHNVALRSSEPQIRRSTSSSSDTMSTFKPMVA
960 970 980 990 1000 1010
1010 1020 1030 1040 1050
KIAA13 PRMGVQLKPPALRPKPAVLPKTNPTIGPAPPPQGPTDKSCTM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|109 PRMGVQLKPPALRPKPAVLPKTNPTIGPAPPPQGPTDKSCTM
1020 1030 1040 1050
>>gi|119617528|gb|EAW97122.1| SLIT-ROBO Rho GTPase activ (1022 aa)
initn: 6794 init1: 6794 opt: 6794 Z-score: 6501.3 bits: 1214.6 E(): 0
Smith-Waterman score: 6794; 100.000% identity (100.000% similar) in 1022 aa overlap (30-1051:1-1022)
10 20 30 40 50 60
KIAA13 CNHPLASLLSLEIRAQLVEQQKCLEQQTEMRVQLLQDLQDFFRKKAEIETEYSRNLEKLA
:::::::::::::::::::::::::::::::
gi|119 MRVQLLQDLQDFFRKKAEIETEYSRNLEKLA
10 20 30
70 80 90 100 110 120
KIAA13 ERFMAKTRSTKDHQQYKKDQNLLSPVNCWYLLLNQVRRESKDHATLSDIYLNNVIMRFMQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|119 ERFMAKTRSTKDHQQYKKDQNLLSPVNCWYLLLNQVRRESKDHATLSDIYLNNVIMRFMQ
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KIAA13 ISEDSTRMFKKSKEIAFQLHEDLMKVLNELYTVMKTYHMYHAESISAESKLKEAEKQEEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|119 ISEDSTRMFKKSKEIAFQLHEDLMKVLNELYTVMKTYHMYHAESISAESKLKEAEKQEEK
100 110 120 130 140 150
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KIAA13 QIGRSGDPVFHIRLEERHQRRSSVKKIEKMKEKRQAKYSENKLKSIKARNEYLLTLEATN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|119 QIGRSGDPVFHIRLEERHQRRSSVKKIEKMKEKRQAKYSENKLKSIKARNEYLLTLEATN
160 170 180 190 200 210
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KIAA13 ASVFKYYIHDLSDLIDCCDLGYHASLNRALRTYLSAEYNLETSRHEGLDIIENAVDNLEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|119 ASVFKYYIHDLSDLIDCCDLGYHASLNRALRTYLSAEYNLETSRHEGLDIIENAVDNLEP
220 230 240 250 260 270
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KIAA13 RSDKQRFMEMYPAAFCPPMKFEFQSHMGDEVCQVSAQQPVQAELMLRYQQLQSRLATLKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|119 RSDKQRFMEMYPAAFCPPMKFEFQSHMGDEVCQVSAQQPVQAELMLRYQQLQSRLATLKI
280 290 300 310 320 330
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KIAA13 ENEEVKKTTEATLQTIQDMVTIEDYDVSECFQHSRSTESVKSTVSETYLSKPSIAKRRAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|119 ENEEVKKTTEATLQTIQDMVTIEDYDVSECFQHSRSTESVKSTVSETYLSKPSIAKRRAN
340 350 360 370 380 390
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KIAA13 QQETEQFYFMKLREYLEGSNLITKLQAKHDLLQRTLGEGHRAEYMTTSRGRRNSHTRHQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|119 QQETEQFYFMKLREYLEGSNLITKLQAKHDLLQRTLGEGHRAEYMTTSRGRRNSHTRHQD
400 410 420 430 440 450
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KIAA13 SGQVIPLIVESCIRFINLYGLQHQGIFRVSGSQVEVNDIKNSFERGENPLADDQSNHDIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|119 SGQVIPLIVESCIRFINLYGLQHQGIFRVSGSQVEVNDIKNSFERGENPLADDQSNHDIN
460 470 480 490 500 510
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KIAA13 SVAGVLKLYFRGLENPLFPKERFNDLISCIRIDNLYERALHIRKLLLTLPRSVLIVMRYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|119 SVAGVLKLYFRGLENPLFPKERFNDLISCIRIDNLYERALHIRKLLLTLPRSVLIVMRYL
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
KIAA13 FAFLNHLSQYSDENMMDPYNLAICFGPTLMPVPEIQDQVSCQAHVNEIIKTIIIHHETIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|119 FAFLNHLSQYSDENMMDPYNLAICFGPTLMPVPEIQDQVSCQAHVNEIIKTIIIHHETIF
580 590 600 610 620 630
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KIAA13 PDAKELDGPVYEKCMAGDDYCDSPYSEHGTLEEVDQDAGTEPHTSEDECEPIEAIAKFDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|119 PDAKELDGPVYEKCMAGDDYCDSPYSEHGTLEEVDQDAGTEPHTSEDECEPIEAIAKFDY
640 650 660 670 680 690
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KIAA13 VGRSARELSFKKGASLLLYHRASEDWWEGRHNGIDGLVPHQYIVVQDMDDTFSDTLSQKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|119 VGRSARELSFKKGASLLLYHRASEDWWEGRHNGIDGLVPHQYIVVQDMDDTFSDTLSQKA
700 710 720 730 740 750
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KIAA13 DSEASSGPVTEDKSSSKDMNSPTDRHPDGYLARQRKRGEPPPPVRRPGRTSDGHCPLHPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|119 DSEASSGPVTEDKSSSKDMNSPTDRHPDGYLARQRKRGEPPPPVRRPGRTSDGHCPLHPP
760 770 780 790 800 810
850 860 870 880 890 900
KIAA13 HALSNSSVDLGSPSLASHPRGLLQNRGLNNDSPERRRRPGHGSLTNISRHDSLKKIDSPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|119 HALSNSSVDLGSPSLASHPRGLLQNRGLNNDSPERRRRPGHGSLTNISRHDSLKKIDSPP
820 830 840 850 860 870
910 920 930 940 950 960
KIAA13 IRRSTSSGQYTGFNDHKPLDPETIAQDIEETMNTALNELRELERQSTAKHAPDVVLDTLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|119 IRRSTSSGQYTGFNDHKPLDPETIAQDIEETMNTALNELRELERQSTAKHAPDVVLDTLE
880 890 900 910 920 930
970 980 990 1000 1010 1020
KIAA13 QVKNSPTPATSTESLSPLHNVALRSSEPQIRRSTSSSSDTMSTFKPMVAPRMGVQLKPPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|119 QVKNSPTPATSTESLSPLHNVALRSSEPQIRRSTSSSSDTMSTFKPMVAPRMGVQLKPPA
940 950 960 970 980 990
1030 1040 1050
KIAA13 LRPKPAVLPKTNPTIGPAPPPQGPTDKSCTM
:::::::::::::::::::::::::::::::
gi|119 LRPKPAVLPKTNPTIGPAPPPQGPTDKSCTM
1000 1010 1020
>>gi|122066214|sp|Q91Z69.2|SRGP1_MOUSE RecName: Full=SLI (1062 aa)
initn: 6775 init1: 6775 opt: 6775 Z-score: 6482.9 bits: 1211.2 E(): 0
Smith-Waterman score: 6775; 97.885% identity (99.423% similar) in 1040 aa overlap (12-1051:23-1062)
10 20 30 40
KIAA13 CNHPLASLLSLEIRAQLVEQQKCLEQQTEMRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|122 MSTPSRFKKDKEIIAEYESQVKEIRAQLVEQQKCLEQQTEMRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
KIAA13 TEYSRNLEKLAERFMAKTRSTKDHQQYKKDQNLLSPVNCWYLLLNQVRRESKDHATLSDI
::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|122 TEYSRNLEKLAERFMAKTRSTKDHQQFKKDQNLLSPVNCWYLLLNQVRRESKDHATLSDI
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
KIAA13 YLNNVIMRFMQISEDSTRMFKKSKEIAFQLHEDLMKVLNELYTVMKTYHMYHAESISAES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::
gi|122 YLNNVIMRFMQISEDSTRMFKKSKEIAFQLHEDLMKVLNELYTVMKTYHMYHSESISAES
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
KIAA13 KLKEAEKQEEKQIGRSGDPVFHIRLEERHQRRSSVKKIEKMKEKRQAKYSENKLKSIKAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|122 KLKEAEKQEEKQIGRSGDPVFHIRLEERHQRRSSVKKIEKMKEKRQAKYSENKLKSIKAR
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
KIAA13 NEYLLTLEATNASVFKYYIHDLSDLIDCCDLGYHASLNRALRTYLSAEYNLETSRHEGLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|122 NEYLLTLEATNASVFKYYIHDLSDLIDCCDLGYHASLNRALRTYLSAEYNLETSRHEGLD
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
KIAA13 IIENAVDNLEPRSDKQRFMEMYPAAFCPPMKFEFQSHMGDEVCQVSAQQPVQAELMLRYQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :
gi|122 IIENAVDNLEPRSDKQRFMEMYPAAFCPPMKFEFQSHMGDEVCQVSAQQPVQAELMLRNQ
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
KIAA13 QLQSRLATLKIENEEVKKTTEATLQTIQDMVTIEDYDVSECFQHSRSTESVKSTVSETYL
::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|122 QLQSRLATLKIESEEVKKTTEATLQTIQDMVTIEDYDVSECFQHSRSTESVKSTVSETYL
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
KIAA13 SKPSIAKRRANQQETEQFYFMKLREYLEGSNLITKLQAKHDLLQRTLGEGHRAEYMTTSR
:::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|122 SKPSIAKRRANQQETEQFYFMKLREFLEGSNLITKLQAKHDLLQRTLGEGHRAEYMTTSR
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
KIAA13 GRRNSHTRHQDSGQVIPLIVESCIRFINLYGLQHQGIFRVSGSQVEVNDIKNSFERGENP
::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|122 GRRNSHARHQDSGQVIPLIVESCIRFINLYGLQHQGIFRVSGSQVEVNDIKNSFERGENP
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570 580
KIAA13 LADDQSNHDINSVAGVLKLYFRGLENPLFPKERFNDLISCIRIDNLYERALHIRKLLLTL
:.:.::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::
gi|122 LSDEQSNHDINSVAGVLKLYFRGLENPLFPKERFTDLISCIRIDNLYERALHIRKLLLTL
550 560 570 580 590 600
590 600 610 620 630 640
KIAA13 PRSVLIVMRYLFAFLNHLSQYSDENMMDPYNLAICFGPTLMPVPEIQDQVSCQAHVNEII
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
gi|122 PRSVLIVMRYLFAFLNHLSQYSDENMMDPYNLAICFGPTLMPVPEIQDQVSCQAHVNEIV
610 620 630 640 650 660
650 660 670 680 690 700
KIAA13 KTIIIHHETIFPDAKELDGPVYEKCMAGDDYCDSPYSEHGTLEEVDQDAGTEPHTSEDEC
:::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::
gi|122 KTIIIHHETIFPDAKELDGPVYEKCMAGGDYCDSPYSEHGTLEEVDQDAGTEPHTSEDEC
670 680 690 700 710 720
710 720 730 740 750 760
KIAA13 EPIEAIAKFDYVGRSARELSFKKGASLLLYHRASEDWWEGRHNGIDGLVPHQYIVVQDMD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|122 EPIEAIAKFDYVGRSARELSFKKGASLLLYHRASEDWWEGRHNGIDGLVPHQYIVVQDMD
730 740 750 760 770 780
770 780 790 800 810 820
KIAA13 DTFSDTLSQKADSEASSGPVTEDKSSSKDMNSPTDRHPDGYLARQRKRGEPPPPVRRPGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :.:::::::::::::: :::::
gi|122 DTFSDTLSQKADSEASSGPVTEDKSSSKDMNSPTDRHSDSYLARQRKRGEPPPPGRRPGR
790 800 810 820 830 840
830 840 850 860 870 880
KIAA13 TSDGHCPLHPPHALSNSSVDLGSPSLASHPRGLLQNRGLNNDSPERRRRPGHGSLTNISR
::::::::::::::::::.:::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|122 TSDGHCPLHPPHALSNSSIDLGSPNLASHPRGLLQNRGLNNDSPERRRRPGHGSLTNISR
850 860 870 880 890 900
890 900 910 920 930 940
KIAA13 HDSLKKIDSPPIRRSTSSGQYTGFNDHKPLDPETIAQDIEETMNTALNELRELERQSTAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
gi|122 HDSLKKIDSPPIRRSTSSGQYTGFNDHKPLDPETIAQDIEETMNTALNELRELERQSTVK
910 920 930 940 950 960
950 960 970 980 990 1000
KIAA13 HAPDVVLDTLEQVKNSPTPATSTESLSPLHNVALRSSEPQIRRSTSSSSDTMSTFKPMVA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::.::::::::::
gi|122 HAPDVVLDTLEQVKNSPTPATSTESLSPLHNVALRGSEPQIRRSTSSSSETMSTFKPMVA
970 980 990 1000 1010 1020
1010 1020 1030 1040 1050
KIAA13 PRMGVQLKPPALRPKPAVLPKTNPTIGPAPPPQGPTDKSCTM
:::::::::::::::::::::::::.::: : ::::::::::
gi|122 PRMGVQLKPPALRPKPAVLPKTNPTMGPAAPSQGPTDKSCTM
1030 1040 1050 1060
>>gi|34604126|gb|AAQ79776.1| Rho GTPase activating prote (1064 aa)
initn: 6689 init1: 5492 opt: 6689 Z-score: 6400.6 bits: 1196.0 E(): 0
Smith-Waterman score: 6689; 95.969% identity (99.040% similar) in 1042 aa overlap (12-1051:23-1064)
10 20 30 40
KIAA13 CNHPLASLLSLEIRAQLVEQQKCLEQQTEMRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
::::::.:::::::::::::::::::::::::::.:::
gi|346 MSTPSRFKKDKEIIAEYESQVKEIRAQLIEQQKCLEQQTEMRVQLLQDLQDFFRKKSEIE
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
KIAA13 TEYSRNLEKLAERFMAKTRSTKDHQQYKKDQNLLSPVNCWYLLLNQVRRESKDHATLSDI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|346 MEYSRNLEKLAERFMAKTRSTKDHQQYKKDQNLLSPVNCWYLLLNQVRRESKDHATLSDI
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
KIAA13 YLNNVIMRFMQISEDSTRMFKKSKEIAFQLHEDLMKVLNELYTVMKTYHMYHAESISAES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|346 YLNNVIMRFMQISEDSTRMFKKSKEIAFQLHEDLMKVLNELYTVMKTYHMYHAESISAES
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
KIAA13 KLKEAEKQEEKQIGRSGDPVFHIRLEERHQRRSSVKKIEKMKEKRQAKYSENKLKSIKAR
::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|346 KLKEAEKQEEKQIGRSGDPVFHIRLEDRHQRRSSVKKIEKMKEKRQAKYSENKLKSIKAR
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
KIAA13 NEYLLTLEATNASVFKYYIHDLSDLIDCCDLGYHASLNRALRTYLSAEYNLETSRHEGLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|346 NEYLLTLEATNASVFKYYIHDLSDLIDCCDLGYHASLNRALRTYLSAEYNLETSRHEGLD
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
KIAA13 IIENAVDNLEPRSDKQRFMEMYPAAFCPPMKFEFQSHMGDEVCQVSAQQPVQAELMLRYQ
:::::::.:::::::::::::.:.:::::::::::::::::::::.::::::::::::::
gi|346 IIENAVDSLEPRSDKQRFMEMFPTAFCPPMKFEFQSHMGDEVCQVTAQQPVQAELMLRYQ
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
KIAA13 QLQSRLATLKIENEEVKKTTEATLQTIQDMVTIEDYDVSECFQHSRSTESVKSTVSETYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|346 QLQSRLATLKIENEEVKKTTEATLQTIQDMVTIEDYDVSECFQHSRSTESVKSTVSETYL
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
KIAA13 SKPSIAKRRANQQETEQFYFMKLREYLEGSNLITKLQAKHDLLQRTLGEGHRAEYMTTSR
::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::.::::::::::::::
gi|346 SKPSIAKRRANQQETEQFYFMKFREYLEGSNLITKLQAKHDLLQRALGEGHRAEYMTTSR
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
KIAA13 GRRNSHTRHQDSGQVIPLIVESCIRFINLYGLQHQGIFRVSGSQVEVNDIKNSFERGENP
::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|346 GRRNSHARHQDSGQVIPLIVESCIRFINLYGLQHQGIFRVSGSQVEVNDIKNSFERGENP
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570 580
KIAA13 LADDQSNHDINSVAGVLKLYFRGLENPLFPKERFNDLISCIRIDNLYERALHIRKLLLTL
:::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|346 LADDQSNHDINSVAGVLKLYFRGLENPVFPKERFNDLISCIRIDNLYERALHIRKLLLTL
550 560 570 580 590 600
590 600 610 620 630 640
KIAA13 PRSVLIVMRYLFAFLNHLSQYSDENMMDPYNLAICFGPTLMPVPEIQDQVSCQAHVNEII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::
gi|346 PRSVLIVMRYLFAFLNHLSQYSDENMMDPYNLAICFGPTLMPVPDIQDQVSCQAHVNEII
610 620 630 640 650 660
650 660 670 680 690 700
KIAA13 KTIIIHHETIFPDAKELDGPVYEKCMAGDDYCDSPYSEHGTLEEVDQDAGTEPHTSEDEC
::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::
gi|346 KTIIIHHEAIFPDAKELDGPVYEKCMAGDDYCDSPYSEHGTLEEVDQDASTEPHTSEDEC
670 680 690 700 710 720
710 720 730 740 750 760
KIAA13 EPIEAIAKFDYVGRSARELSFKKGASLLLYHRASEDWWEGRHNGIDGLVPHQYIVVQDMD
:::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|346 EPIEAIAKFDYIGRSARELSFKKGASLLLYHRASEDWWEGRHNGIDGLVPHQYIVVQDMD
730 740 750 760 770 780
770 780 790 800 810 820
KIAA13 DTFSDTLSQKADSEASSGPVTEDKSSSKDMNSPTDRHPDGYLARQRKRGEPPPPVRRPGR
:::::::::::::::::::.::::::::::::::::: : ::.:::::.:::::.:::::
gi|346 DTFSDTLSQKADSEASSGPITEDKSSSKDMNSPTDRHSDVYLGRQRKRSEPPPPLRRPGR
790 800 810 820 830 840
830 840 850 860 870 880
KIAA13 TSDGHCPLHPPHALSNSSVDLGSPSLASH--PRGLLQNRGLNNDSPERRRRPGHGSLTNI
.::::::.:::: :::::::::::.::.: :: :::::.:: :::::::::::::::::
gi|346 SSDGHCPVHPPHPLSNSSVDLGSPNLATHCSPRTLLQNRNLNADSPERRRRPGHGSLTNI
850 860 870 880 890 900
890 900 910 920 930 940
KIAA13 SRHDSLKKIDSPPIRRSTSSGQYTGFNDHKPLDPETIAQDIEETMNTALNELRELERQST
:::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::.
gi|346 SRHDSLKKIDSPPIRRSTSSGQYTGFNDHKPLDPESIAQDIEETMNTALNELRELERQSS
910 920 930 940 950 960
950 960 970 980 990 1000
KIAA13 AKHAPDVVLDTLEQVKNSPTPATSTESLSPLHNVALRSSEPQIRRSTSSSSDTMSTFKPM
::::::::::::::.:::::::::::::::::.:.:::::::::::::::::::::::::
gi|346 AKHAPDVVLDTLEQMKNSPTPATSTESLSPLHSVVLRSSEPQIRRSTSSSSDTMSTFKPM
970 980 990 1000 1010 1020
1010 1020 1030 1040 1050
KIAA13 VAPRMGVQLKPPALRPKPAVLPKTNPTIGPAPPPQGPTDKSCTM
:::::::::::::::::: :::::::.:::.:: :::.::::::
gi|346 VAPRMGVQLKPPALRPKPIVLPKTNPSIGPSPPSQGPADKSCTM
1030 1040 1050 1060
>>gi|148692479|gb|EDL24426.1| mCG114195 [Mus musculus] (1022 aa)
initn: 6660 init1: 6660 opt: 6660 Z-score: 6373.1 bits: 1190.8 E(): 0
Smith-Waterman score: 6660; 97.847% identity (99.413% similar) in 1022 aa overlap (30-1051:1-1022)
10 20 30 40 50 60
KIAA13 CNHPLASLLSLEIRAQLVEQQKCLEQQTEMRVQLLQDLQDFFRKKAEIETEYSRNLEKLA
:::::::::::::::::::::::::::::::
gi|148 MRVQLLQDLQDFFRKKAEIETEYSRNLEKLA
10 20 30
70 80 90 100 110 120
KIAA13 ERFMAKTRSTKDHQQYKKDQNLLSPVNCWYLLLNQVRRESKDHATLSDIYLNNVIMRFMQ
:::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|148 ERFMAKTRSTKDHQQFKKDQNLLSPVNCWYLLLNQVRRESKDHATLSDIYLNNVIMRFMQ
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
KIAA13 ISEDSTRMFKKSKEIAFQLHEDLMKVLNELYTVMKTYHMYHAESISAESKLKEAEKQEEK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::
gi|148 ISEDSTRMFKKSKEIAFQLHEDLMKVLNELYTVMKTYHMYHSESISAESKLKEAEKQEEK
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
KIAA13 QIGRSGDPVFHIRLEERHQRRSSVKKIEKMKEKRQAKYSENKLKSIKARNEYLLTLEATN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|148 QIGRSGDPVFHIRLEERHQRRSSVKKIEKMKEKRQAKYSENKLKSIKARNEYLLTLEATN
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
KIAA13 ASVFKYYIHDLSDLIDCCDLGYHASLNRALRTYLSAEYNLETSRHEGLDIIENAVDNLEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|148 ASVFKYYIHDLSDLIDCCDLGYHASLNRALRTYLSAEYNLETSRHEGLDIIENAVDNLEP
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
KIAA13 RSDKQRFMEMYPAAFCPPMKFEFQSHMGDEVCQVSAQQPVQAELMLRYQQLQSRLATLKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::
gi|148 RSDKQRFMEMYPAAFCPPMKFEFQSHMGDEVCQVSAQQPVQAELMLRNQQLQSRLATLKI
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
KIAA13 ENEEVKKTTEATLQTIQDMVTIEDYDVSECFQHSRSTESVKSTVSETYLSKPSIAKRRAN
:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|148 ESEEVKKTTEATLQTIQDMVTIEDYDVSECFQHSRSTESVKSTVSETYLSKPSIAKRRAN
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
KIAA13 QQETEQFYFMKLREYLEGSNLITKLQAKHDLLQRTLGEGHRAEYMTTSRGRRNSHTRHQD
::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
gi|148 QQETEQFYFMKLREFLEGSNLITKLQAKHDLLQRTLGEGHRAEYMTTSRGRRNSHARHQD
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
KIAA13 SGQVIPLIVESCIRFINLYGLQHQGIFRVSGSQVEVNDIKNSFERGENPLADDQSNHDIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:::::::
gi|148 SGQVIPLIVESCIRFINLYGLQHQGIFRVSGSQVEVNDIKNSFERGENPLSDEQSNHDIN
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
KIAA13 SVAGVLKLYFRGLENPLFPKERFNDLISCIRIDNLYERALHIRKLLLTLPRSVLIVMRYL
:::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|148 SVAGVLKLYFRGLENPLFPKERFTDLISCIRIDNLYERALHIRKLLLTLPRSVLIVMRYL
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
KIAA13 FAFLNHLSQYSDENMMDPYNLAICFGPTLMPVPEIQDQVSCQAHVNEIIKTIIIHHETIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::
gi|148 FAFLNHLSQYSDENMMDPYNLAICFGPTLMPVPEIQDQVSCQAHVNEIVKTIIIHHETIF
580 590 600 610 620 630
670 680 690 700 710 720
KIAA13 PDAKELDGPVYEKCMAGDDYCDSPYSEHGTLEEVDQDAGTEPHTSEDECEPIEAIAKFDY
::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|148 PDAKELDGPVYEKCMAGGDYCDSPYSEHGTLEEVDQDAGTEPHTSEDECEPIEAIAKFDY
640 650 660 670 680 690
730 740 750 760 770 780
KIAA13 VGRSARELSFKKGASLLLYHRASEDWWEGRHNGIDGLVPHQYIVVQDMDDTFSDTLSQKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|148 VGRSARELSFKKGASLLLYHRASEDWWEGRHNGIDGLVPHQYIVVQDMDDTFSDTLSQKA
700 710 720 730 740 750
790 800 810 820 830 840
KIAA13 DSEASSGPVTEDKSSSKDMNSPTDRHPDGYLARQRKRGEPPPPVRRPGRTSDGHCPLHPP
:::::::::::::::::::::::::: :.:::::::::::::: ::::::::::::::::
gi|148 DSEASSGPVTEDKSSSKDMNSPTDRHSDSYLARQRKRGEPPPPGRRPGRTSDGHCPLHPP
760 770 780 790 800 810
850 860 870 880 890 900
KIAA13 HALSNSSVDLGSPSLASHPRGLLQNRGLNNDSPERRRRPGHGSLTNISRHDSLKKIDSPP
:::::::.:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|148 HALSNSSIDLGSPNLASHPRGLLQNRGLNNDSPERRRRPGHGSLTNISRHDSLKKIDSPP
820 830 840 850 860 870
910 920 930 940 950 960
KIAA13 IRRSTSSGQYTGFNDHKPLDPETIAQDIEETMNTALNELRELERQSTAKHAPDVVLDTLE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::
gi|148 IRRSTSSGQYTGFNDHKPLDPETIAQDIEETMNTALNELRELERQSTVKHAPDVVLDTLE
880 890 900 910 920 930
970 980 990 1000 1010 1020
KIAA13 QVKNSPTPATSTESLSPLHNVALRSSEPQIRRSTSSSSDTMSTFKPMVAPRMGVQLKPPA
::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::.:::::::::::::::::::::
gi|148 QVKNSPTPATSTESLSPLHNVALRGSEPQIRRSTSSSSETMSTFKPMVAPRMGVQLKPPA
940 950 960 970 980 990
1030 1040 1050
KIAA13 LRPKPAVLPKTNPTIGPAPPPQGPTDKSCTM
::::::::::::::.::: : ::::::::::
gi|148 LRPKPAVLPKTNPTMGPAAPSQGPTDKSCTM
1000 1010 1020
>>gi|149029195|gb|EDL84471.1| similar to SLIT-ROBO Rho G (1022 aa)
initn: 6644 init1: 6644 opt: 6644 Z-score: 6357.8 bits: 1188.0 E(): 0
Smith-Waterman score: 6644; 97.456% identity (99.315% similar) in 1022 aa overlap (30-1051:1-1022)
10 20 30 40 50 60
KIAA13 CNHPLASLLSLEIRAQLVEQQKCLEQQTEMRVQLLQDLQDFFRKKAEIETEYSRNLEKLA
:::::::::::::::::::::::::::::::
gi|149 MRVQLLQDLQDFFRKKAEIETEYSRNLEKLA
10 20 30
70 80 90 100 110 120
KIAA13 ERFMAKTRSTKDHQQYKKDQNLLSPVNCWYLLLNQVRRESKDHATLSDIYLNNVIMRFMQ
:::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|149 ERFMAKTRSTKDHQQFKKDQNLLSPVNCWYLLLNQVRRESKDHATLSDIYLNNVIMRFMQ
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
KIAA13 ISEDSTRMFKKSKEIAFQLHEDLMKVLNELYTVMKTYHMYHAESISAESKLKEAEKQEEK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::
gi|149 ISEDSTRMFKKSKEIAFQLHEDLMKVLNELYTVMKTYHMYHSESISAESKLKEAEKQEEK
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
KIAA13 QIGRSGDPVFHIRLEERHQRRSSVKKIEKMKEKRQAKYSENKLKSIKARNEYLLTLEATN
:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|149 QMGRSGDPVFHIRLEERHQRRSSVKKIEKMKEKRQAKYSENKLKSIKARNEYLLTLEATN
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
KIAA13 ASVFKYYIHDLSDLIDCCDLGYHASLNRALRTYLSAEYNLETSRHEGLDIIENAVDNLEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|149 ASVFKYYIHDLSDLIDCCDLGYHASLNRALRTYLSAEYNLETSRHEGLDIIENAVDNLEP
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
KIAA13 RSDKQRFMEMYPAAFCPPMKFEFQSHMGDEVCQVSAQQPVQAELMLRYQQLQSRLATLKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::
gi|149 RSDKQRFMEMYPAAFCPPMKFEFQSHMGDEVCQVSAQQPVQAELMLRNQQLQSRLATLKI
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
KIAA13 ENEEVKKTTEATLQTIQDMVTIEDYDVSECFQHSRSTESVKSTVSETYLSKPSIAKRRAN
:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|149 ESEEVKKTTEATLQTIQDMVTIEDYDVSECFQHSRSTESVKSTVSETYLSKPSIAKRRAN
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
KIAA13 QQETEQFYFMKLREYLEGSNLITKLQAKHDLLQRTLGEGHRAEYMTTSRGRRNSHTRHQD
::::::::::::::.::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
gi|149 QQETEQFYFMKLREFLEGSSLITKLQAKHDLLQRTLGEGHRAEYMTTSRGRRNSHARHQD
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
KIAA13 SGQVIPLIVESCIRFINLYGLQHQGIFRVSGSQVEVNDIKNSFERGENPLADDQSNHDIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|149 SGQVIPLIVESCIRFINLYGLQHQGIFRVSGSQVEVNDIKNSFERGENPLADDQSNHDIN
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
KIAA13 SVAGVLKLYFRGLENPLFPKERFNDLISCIRIDNLYERALHIRKLLLTLPRSVLIVMRYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::
gi|149 SVAGVLKLYFRGLENPLFPKERFNDLISCIRIDNLYERALHIHKLLLTLPRSVLIVMRYL
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
KIAA13 FAFLNHLSQYSDENMMDPYNLAICFGPTLMPVPEIQDQVSCQAHVNEIIKTIIIHHETIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::
gi|149 FAFLNHLSQYSDENMMDPYNLAICFGPTLMPVPEIQDQVSCQAHVNEIVKTIIIHHETIF
580 590 600 610 620 630
670 680 690 700 710 720
KIAA13 PDAKELDGPVYEKCMAGDDYCDSPYSEHGTLEEVDQDAGTEPHTSEDECEPIEAIAKFDY
::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|149 PDAKELDGPVYEKCMAGGDYCDSPYSEHGTLEEVDQDAGTEPHTSEDECEPIEAIAKFDY
640 650 660 670 680 690
730 740 750 760 770 780
KIAA13 VGRSARELSFKKGASLLLYHRASEDWWEGRHNGIDGLVPHQYIVVQDMDDTFSDTLSQKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|149 VGRSARELSFKKGASLLLYHRASEDWWEGRHNGIDGLVPHQYIVVQDMDDTFSDTLSQKA
700 710 720 730 740 750
790 800 810 820 830 840
KIAA13 DSEASSGPVTEDKSSSKDMNSPTDRHPDGYLARQRKRGEPPPPVRRPGRTSDGHCPLHPP
::::::::: :::::::::::::::: :.:::::::::::::: ::::::::::::::::
gi|149 DSEASSGPVPEDKSSSKDMNSPTDRHSDSYLARQRKRGEPPPPGRRPGRTSDGHCPLHPP
760 770 780 790 800 810
850 860 870 880 890 900
KIAA13 HALSNSSVDLGSPSLASHPRGLLQNRGLNNDSPERRRRPGHGSLTNISRHDSLKKIDSPP
:::::::.:::::.:..:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|149 HALSNSSIDLGSPNLTGHPRGLLQNRGLNNDSPERRRRPGHGSLTNISRHDSLKKIDSPP
820 830 840 850 860 870
910 920 930 940 950 960
KIAA13 IRRSTSSGQYTGFNDHKPLDPETIAQDIEETMNTALNELRELERQSTAKHAPDVVLDTLE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::
gi|149 IRRSTSSGQYTGFNDHKPLDPETIAQDIEETMNTALNELRELERQSTVKHAPDVVLDTLE
880 890 900 910 920 930
970 980 990 1000 1010 1020
KIAA13 QVKNSPTPATSTESLSPLHNVALRSSEPQIRRSTSSSSDTMSTFKPMVAPRMGVQLKPPA
:::::::::::::::::::.:.:::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
gi|149 QVKNSPTPATSTESLSPLHSVTLRSSEPQLRRSTSSSSDTMSTFKPMVAPRMGVQLKPPA
940 950 960 970 980 990
1030 1040 1050
KIAA13 LRPKPAVLPKTNPTIGPAPPPQGPTDKSCTM
::::::::::::::.::: : ::::::::::
gi|149 LRPKPAVLPKTNPTVGPAAPSQGPTDKSCTM
1000 1010 1020
>>gi|76665096|ref|XP_590495.2| PREDICTED: similar to SLI (1075 aa)
initn: 3668 init1: 2145 opt: 4711 Z-score: 4507.8 bits: 845.8 E(): 0
Smith-Waterman score: 4711; 69.143% identity (86.952% similar) in 1050 aa overlap (12-1047:23-1062)
10 20 30 40
KIAA13 CNHPLASLLSLEIRAQLVEQQKCLEQQTEMRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
:::.::::: ::::::.: :.:::::::.:::.:::::
gi|766 MSSQTKFKKDKEIIAEYEAQIKEIRTQLVEQFKCLEQQSESRLQLLQDLQEFFRRKAEIE
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
KIAA13 TEYSRNLEKLAERFMAKTRSTKDHQQYKKDQNLLSPVNCWYLLLNQVRRESKDHATLSDI
::::.:::::::: .: ::...:: .:::: ::::::::::.:.:.::::.:::::.::
gi|766 LEYSRSLEKLAERFSSKIRSSREHQ-FKKDQYLLSPVNCWYLVLHQTRRESRDHATLNDI
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
KIAA13 YLNNVIMRFMQISEDSTRMFKKSKEIAFQLHEDLMKVLNELYTVMKTYHMYHAESISAES
..::::.:. ::::: :.:::::::..:.::.:.:: ::::::::::::::::::::::
gi|766 FMNNVIVRLSQISEDVIRLFKKSKEIGLQMHEELLKVTNELYTVMKTYHMYHAESISAES
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
KIAA13 KLKEAEKQEEKQIGRSGDPVFHI-RLEERHQRRSSVKKIEKMKEKRQAKYSENKLKSIKA
::::::::::::...::: ... : :.: :::::::::::::::::::::::::: ::
gi|766 KLKEAEKQEEKQFNKSGDLSMNLLRHEDRPQRRSSVKKIEKMKEKRQAKYSENKLKCTKA
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
KIAA13 RNEYLLTLEATNASVFKYYIHDLSDLIDCCDLGYHASLNRALRTYLSAEYNLETSRHEGL
::.:::.: ::::.. ::::::.::::::::::.:::: :..::::::::::::::::::
gi|766 RNDYLLNLAATNAAISKYYIHDVSDLIDCCDLGFHASLARTFRTYLSAEYNLETSRHEGL
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
KIAA13 DIIENAVDNLEPRSDKQRFMEMYPAAFCPPMKFEFQSHMGDEVCQVSAQQPVQAELMLRY
:.::::::::. ::::. :.: .::::.::::: ::::::::::::::::.::..::
gi|766 DVIENAVDNLDSRSDKHTVMDMCNQVFCPPLKFEFQPHMGDEVCQVSAQQPVQTELLMRY
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