# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/ff04539.fasta.huge -Q ../query/KIAA1302.ptfa ./tmplib.24314 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1302, 2016 aa vs ./tmplib.24314 library 1985489 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.7386+/-0.00537; mu= 19.0692+/- 0.365 mean_var=103.9609+/-24.051, 0's: 0 Z-trim: 9 B-trim: 12 in 1/39 Lambda= 0.125788 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 42, opt: 30, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1455 ( 2450 res) ef02451 (2450) 9754 1783.0 0 KIAA1127 ( 2144 res) bf00005 (2144) 9576 1750.6 0 KIAA1781 ( 974 res) fg06971(revised) ( 974) 192 47.2 2.5e-05 KIAA1780 ( 1192 res) pf01012 (1192) 188 46.6 4.6e-05 KIAA0149 ( 830 res) ha01221 ( 830) 172 43.5 0.00028 KIAA0813 ( 1618 res) pf00581 (1618) 164 42.4 0.0011 KIAA0815 ( 1640 res) sh06087 (1640) 161 41.9 0.0017 >>KIAA1455 ( 2450 res) ef02451 (2450 aa) initn: 8181 init1: 4414 opt: 9754 Z-score: 9561.4 bits: 1783.0 E(): 0 Smith-Waterman score: 9984; 70.168% identity (89.445% similar) in 2018 aa overlap (1-2016:457-2450) 10 20 30 KIAA13 ACDQRACHPRCAEHGTCRDGKCECSPGWNG ::.::::::::::::::.::::::: :::: KIAA14 CSNEICSVDCGSHGVCMGGTCRCEEGWTGPACNQRACHPRCAEHGTCKDGKCECSQGWNG 430 440 450 460 470 480 40 50 60 70 80 90 KIAA13 EHCTIAHYLDRVVKEGCPGLCNGNGRCTLDLNGWHCVCQLGWRGAGCDTSMETACGDSKD ::::: ::::::::.::::::: :::::::: ::::::::..::: : :::: KIAA14 EHCTI---------EGCPGLCNSNGRCTLDQNGWHCVCQPGWRGAGCDVAMETLCTDSKD 490 500 510 520 530 100 110 120 130 140 KIAA13 NDGDGLVDCMDPDCCLQPLCHINPLCLGSPNPLDII-QETQVPVSQQNLHSFYDRIKFLV :.::::.:::::::::: :. .: : : :.: ::: : : : ::: .::::::.::. KIAA14 NEGDGLIDCMDPDCCLQSSCQNQPYCRGLPDPQDIISQSLQSP-SQQAAKSFYDRISFLI 540 550 560 570 580 590 150 160 170 180 190 200 KIAA13 GRDSTHIIPGENPFDGGHACVIRGQVMTSDGTPLVGVNISFVNNPLFGYTISRQDGSFDL : ::::.::::.::. . : ::::::.:.:::::.:::.:: . : .::::.:::: ::: KIAA14 GSDSTHVIPGESPFNKSLASVIRGQVLTADGTPLIGVNVSFFHYPEYGYTITRQDGMFDL 600 610 620 630 640 650 210 220 230 240 250 260 KIAA13 VTNGGISIILRFERAPFITQEHTLWLPWDRFFVMETIIMRHEENEIPSCDLSNFARPNPV :.::: :. : :::.::.:: ::.:.::. :.::.:..:..:::.:::::::.:.::::. KIAA14 VANGGASLTLVFERSPFLTQYHTVWIPWNVFYVMDTLVMKKEENDIPSCDLSGFVRPNPI 660 670 680 690 700 710 270 280 290 300 310 320 KIAA13 VSPSPLTSFASSCAEKGPIVPEIQALQEEISISGCKMRLSYLSSRTPGYKSVLRISLTHP . :::..: : : .::.:: :.:.:: .: : ..:::::::. ::::::.:..:. KIAA14 IVSSPLSTFFRSSPEDSPIIPETQVLHEETTIPGTDLKLSYLSSRAAGYKSVLKITMTQS 720 730 740 750 760 770 330 340 350 360 370 380 KIAA13 TIPFNLMKVHLMVAVEGRLFRKWFAAAPDLSYYFIWDKTDVYNQKVFGLSEAFVSVGYEY :::::::::::::: ::::.::: :.:.:.: :::::::.:::::.::::: ::::::: KIAA14 IIPFNLMKVHLMVAVVGRLFQKWFPASPNLAYTFIWDKTDAYNQKVYGLSEAVVSVGYEY 780 790 800 810 820 830 390 400 410 420 430 440 KIAA13 ESCPDLILWEKRTTVLQGYEIDASKLGGWSLDKHHALNIQSGILHKGNGENQFVSQQPPV ::: :: ::::::..:::::.:::..:::.:::::.:..:.:::.::::::::.:::::: KIAA14 ESCLDLTLWEKRTAILQGYELDASNMGGWTLDKHHVLDVQNGILYKGNGENQFISQQPPV 840 850 860 870 880 890 450 460 470 480 490 500 KIAA13 IGSIMGNGRRRSISCPSCNGLADGNKLLAPVALTCGSDGSLYVGDFNYIRRIFPSGNVTN ..:::::::::::::::::: ::::::::::::.:: :::::::::::.::::::::::. KIAA14 VSSIMGNGRRRSISCPSCNGQADGNKLLAPVALACGIDGSLYVGDFNYVRRIFPSGNVTS 900 910 920 930 940 950 510 520 530 540 550 560 KIAA13 ILELRNKDFRHSHSPAHKYYLATDPMSGAVFLSDSNSRRVFKIKSTVVVKDLVKNSEVVA .::: : .:::.:::::::..: ...::.:.::... :: . .:::.::.:::: KIAA14 VLEL-------SSNPAHRYYLATDPVTGDLYVSDTNTRRIYRPKSLTGAKDLTKNAEVVA 960 970 980 990 1000 570 580 590 600 610 620 KIAA13 GTGDQCLPFDDTRCGDGGKATEATLTNPRGITVDKFGLIYFVDGTMIRRIDQNGIISTLL :::.::::::..::::::::.:::: .:.:..::: ::::::::::::..:::::::::: KIAA14 GTGEQCLPFDEARCGDGGKAVEATLMSPKGMAVDKNGLIYFVDGTMIRKVDQNGIISTLL 1010 1020 1030 1040 1050 1060 630 640 650 660 670 680 KIAA13 GSNDLTSARPLSCDSVMDISQVHLEWPTDLAINPMDNSLYVLDNNVVLQISENHQVRIVA :::::::::::.::. : ::::.:::::::::::::::.:::::::::::.::.::::.: KIAA14 GSNDLTSARPLTCDTSMHISQVRLEWPTDLAINPMDNSIYVLDNNVVLQITENRQVRIAA 1070 1080 1090 1100 1110 1120 690 700 710 720 730 740 KIAA13 GRPMHCQVPGIDHFLLSKVAIHATLESATALAVSHNGVLYIAETDEKKINRIRQVTTSGE ::::::::::.. . ..: :...:::::::.:::..:::::.:::::::::::::::.:: KIAA14 GRPMHCQVPGVE-YPVGKHAVQTTLESATAIAVSYSGVLYITETDEKKINRIRQVTTDGE 1130 1140 1150 1160 1170 1180 750 760 770 780 790 800 KIAA13 ISLVAGAPSGCDCKNDANCDCFSGDDGYAKDAKLNTPSSLAVCADGELYVADLGNIRIRF :::::: :: :::::::::::... :::::::::..:::::. :: ::.::::::::: KIAA14 ISLVAGIPSECDCKNDANCDCYQSGDGYAKDAKLSAPSSLAASPDGTLYIADLGNIRIRA 1190 1200 1210 1220 1230 1240 810 820 830 840 850 860 KIAA13 IRKNKPFLNTQNMYELSSPIDQELYLFDTTGKHLYTQSLPTGDYLYNFTYTGDGDITLIT . ::::.::..:.::..:: :::::.:: .: : :: :: ::::::::.:..:.::: .: KIAA14 VSKNKPLLNSMNFYEVASPTDQELYIFDINGTHQYTVSLVTGDYLYNFSYSNDNDITAVT 1250 1260 1270 1280 1290 1300 870 880 890 900 910 920 KIAA13 DNNGNMVNVRRDSTGMPLWLVVPDGQVYWVTMGTNSALKSVTTQGHELAMMTYHGNSGLL :.::: . .::: . ::. .: ::.:: :.:.:::. :::.:.:: ::...::::::::: KIAA14 DSNGNTLRIRRDPNRMPVRVVSPDNQVIWLTIGTNGCLKSMTAQGLELVLFTYHGNSGLL 1310 1320 1330 1340 1350 1360 930 940 950 960 970 980 KIAA13 ATKSNENGWTTFYEYDSFGRLTNVTFPTGQVSSFRSDTDSSVHVQVETSSKD-DVTITTN ::::.:.:::::..::: ::::::::::: :.....: :... :..:.::.. ::.::.: KIAA14 ATKSDETGWTTFFDYDSEGRLTNVTFPTGVVTNLHGDMDKAITVDIESSSREEDVSITSN 1370 1380 1390 1400 1410 1420 990 1000 1010 1020 1030 1040 KIAA13 LSASGAFYTLLQDQVRNSYYIGADGSLRLLLANGMEVALQTEPHLLAGTVNPTVGKRNVT ::. .:::..:::.:::: :: :::::.. :.:.. :::::.::::.::::.:::.: KIAA14 LSSIDSFYTMVQDQLRNSYQIGYDGSLRIIYASGLDSHYQTEPHVLAGTANPTVAKRNMT 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1050 1060 1070 1080 1090 1100 KIAA13 LPIDNGLNLVEWRQRKEQARGQVTVFGRRLRVHNRNLLSLDFDRVTRTEKIYDDHRKFTL :: .:: :::::: :::::.:.:.::::.:::..:::::.::::.:.::::::::::: : KIAA14 LPGENGQNLVEWRFRKEQAQGKVNVFGRKLRVNGRNLLSVDFDRTTKTEKIYDDHRKFLL 1490 1500 1510 1520 1530 1540 1110 1120 1130 1140 1150 1160 KIAA13 RILYDQAGRPSLWSPSSRLNGVNVTYSPGGYIAGIQRGIMSERMEYDQAGRITSRIFADG :: :: .:.:.:: :::.: .:::::: : ::.:::: ::...:: :::.::.:::: KIAA14 RIAYDTSGHPTLWLPSSKLMAVNVTYSSTGQIASIQRGTTSEKVDYDGQGRIVSRVFADG 1550 1560 1570 1580 1590 1600 1170 1180 1190 1200 1210 1220 KIAA13 KTWSYTYLEKSMVLLLHSQRQYIFEFDKNDRLSSVTMPNVARQTLETIRSVGYYRNIYQP :::::::::::::::::::::::::.: ::::..:::.:::.:..::::.:::::::.: KIAA14 KTWSYTYLEKSMVLLLHSQRQYIFEYDMWDRLSAITMPSVARHTMQTIRSIGYYRNIYNP 1610 1620 1630 1640 1650 1660 1230 1240 1250 1260 1270 1280 KIAA13 PEGNASVIQDFTEDGHLLHTFYLGTGRRVIYKYGKLSKLAETLYDTTKVSFTYDETAGML ::.:::.: :..:.: ::.: .:::.:::..:: . ..:.: :::.:.::::::::::.: KIAA14 PESNASIITDYNEEGLLLQTAFLGTSRRVLFKYRRQTRLSEILYDSTRVSFTYDETAGVL 1670 1680 1690 1700 1710 1720 1290 1300 1310 1320 1330 1340 KIAA13 KTINLQNEGFTCTIRYRQIGPLIDRQIFRFTEEGMVNARFDYNYDNSFRVTSMQAVINET ::.:::..:: :::::::::::::::::::.:.:::::::::.:::::::::::.::::: KIAA14 KTVNLQSDGFICTIRYRQIGPLIDRQIFRFSEDGMVNARFDYSYDNSFRVTSMQGVINET 1730 1740 1750 1760 1770 1780 1350 1360 1370 1380 1390 1400 KIAA13 PLPIDLYRYDDVSGKTEQFGKFGVIYYDINQIITTAVMTHTKHFDAYGRMKEVQYEIFRS :::::::..::.:::.:::::::::::::::::.:::::.::::::.::.::.::::::: KIAA14 PLPIDLYQFDDISGKVEQFGKFGVIYYDINQIISTAVMTYTKHFDAHGRIKEIQYEIFRS 1790 1800 1810 1820 1830 1840 1410 1420 1430 1440 1450 1460 KIAA13 LMYWMTVQYDNMGRVVKKELKVGPYANTTRYSYEYDADGQLQTVSINDKPLWRYSYDLNG ::::.:.::::::::.:.:.:.::.::::.:.::::.::::::: .:.: .:::.::::: KIAA14 LMYWITIQYDNMGRVTKREIKIGPFANTTKYAYEYDVDGQLQTVYLNEKIMWRYNYDLNG 1850 1860 1870 1880 1890 1900 1470 1480 1490 1500 1510 1520 KIAA13 NLHLLSPGNSARLTPLRYDIRDRITRLGDVQYKMDEDGFLRQRGGDIFEYNSAGLLIKAY :::::.:.:::::::::::.::::::::::::..:::::::::: .::::.: ::: ..: KIAA14 NLHLLNPSNSARLTPLRYDLRDRITRLGDVQYRLDEDGFLRQRGTEIFEYSSKGLLTRVY 1910 1920 1930 1940 1950 1960 1530 1540 1550 1560 1570 1580 KIAA13 NRAGSWSVRYRYDGLGRRVSSKSSHSHHLQFFYADLTNPTKVTHLYNHSSSEITSLYYDL .....:.: :::::::::::::.: ..:::::::::: ::..::.::::::::::::::: KIAA14 SKGSGWTVIYRYDGLGRRVSSKTSLGQHLQFFYADLTYPTRITHVYNHSSSEITSLYYDL 1970 1980 1990 2000 2010 2020 1590 1600 1610 1620 1630 1640 KIAA13 QGHLFAMELSSGDEFYIACDNIGTPLAVFSGTGLMIKQILYTAYGEIYMDTNPNFQIIIG ::::::::.::::::::: :: ::::::::..:::.::: ::::::::.:.: .::..:: KIAA14 QGHLFAMEISSGDEFYIASDNTGTPLAVFSSNGLMLKQIQYTAYGEIYFDSNIDFQLVIG 2030 2040 2050 2060 2070 2080 1650 1660 1670 1680 1690 1700 KIAA13 YHGGLYDPLTKLVHMGRRDYDVLAGRWTSPDHELWKHLSSSNVMPFNLYMFKNNNPISNS .:::::::::::.:.:.::::.::::::.:: :.::.... . :::::::.:::: :. KIAA14 FHGGLYDPLTKLIHFGERDYDILAGRWTTPDIEIWKRIGK-DPAPFNLYMFRNNNPASKI 2090 2100 2110 2120 2130 2140 1710 1720 1730 1740 1750 1760 KIAA13 QDIKCFMTDVNSWLLTFGFQLHNVIPGYPKPDMDAMEPSYELIHTQMKTQEWDNSKSILG .:.: ..:::::::.::::.:::.:::.: : .: ::::::. :.:.::. :.: KIAA14 HDVKDYITDVNSWLVTFGFHLHNAIPGFPVPKFDLTEPSYELV----KSQQWDDIPPIFG 2150 2160 2170 2180 2190 2200 1770 1780 1790 1800 1810 1820 KIAA13 VQCEVQKQLKAFVTLERFDQLYGSTITSCQQAPKTKKFASSGSVFGKGVKFALKDGRVTT :: .: .: :::..: .. .. : : . ::. :..:::: .:...::: : KIAA14 VQQQVARQAKAFLSLGKMAEVQVSR-RRAGGAQSWLWFATVKSLIGKGVMLAVSQGRVQT 2210 2220 2230 2240 2250 2260 1830 1840 1850 1860 1870 1880 KIAA13 DIISVANEDGRRVAAILNHAHYLENLHFTIDGVDTHYFVKPGPSEGDLAILGLSGGRRTL .....:::: .:::.::.: :::::::::.: :::::.: :.::. : :..::..: KIAA14 NVLNIANEDCIKVAAVLNNAFYLENLHFTIEGKDTHYFIKTTTPESDLGTLRLTSGRKAL 2270 2280 2290 2300 2310 2320 1890 1900 1910 1920 1930 1940 KIAA13 ENGVNVTVSQINTVLNGRTRRYTDIQLQYGALCLNTRYGTTLDEEKARVLELARQRAVRQ :::.:::::: .::.::::::..:...:.::: :..::: ::::::::.:: :::::. . KIAA14 ENGINVTVSQSTTVVNGRTRRFADVEMQFGALALHVRYGMTLDEEKARILEQARQRALAR 2330 2340 2350 2360 2370 2380 1950 1960 1970 1980 1990 2000 KIAA13 AWAREQQRLREGEEGLRAWTEGEKQQVLSTGRVQGYDGFFVISVEQYPELSDSANNIHFM ::::::::.:.:::: : ::::::.:.::.:.::::::..:.::::::::.::::::.:. KIAA14 AWAREQQRVRDGEEGARLWTEGEKRQLLSAGKVQGYDGYYVLSVEQYPELADSANNIQFL 2390 2400 2410 2420 2430 2440 2010 KIAA13 RQSEMGRR ::::.::: KIAA14 RQSEIGRR 2450 >>KIAA1127 ( 2144 res) bf00005 (2144 aa) initn: 5941 init1: 4300 opt: 9576 Z-score: 9387.5 bits: 1750.6 E(): 0 Smith-Waterman score: 9578; 66.519% identity (88.593% similar) in 2025 aa overlap (1-2016:134-2144) 10 20 30 KIAA13 ACDQRACHPRCAEHGTCRDGKCECSPGWNG :::::.::::: :::::.:::::: :::: KIAA11 CSVEVCSVDCGTHGVCIGGACRCEEGWTGAACDQRVCHPRCIEHGTCKDGKCECREGWNG 110 120 130 140 150 160 40 50 60 70 80 90 KIAA13 EHCTIAHYLDRVVKEGCPGLCNGNGRCTLDLNGWHCVCQLGWRGAGCDTSMETACGDSKD :::::.. . .::: :::::::::: :.:.:::: :::: ::...:::.:.:.:: KIAA11 EHCTIGRQTAGTETDGCPDLCNGNGRCTLGQNSWQCVCQTGWRGPGCNVAMETSCADNKD 170 180 190 200 210 220 100 110 120 130 140 150 KIAA13 NDGDGLVDCMDPDCCLQPLCHINPLCLGSPNPLDIIQETQVPVSQQNLHSFYDRIKFLVG :.:::::::.::::::: :. . :: :: .::::::. :. . ..:::::::.:.: KIAA11 NEGDGLVDCLDPDCCLQSACQNSLLCRGSRDPLDIIQQGQT--DWPAVKSFYDRIKLLAG 230 240 250 260 270 280 160 170 180 190 200 210 KIAA13 RDSTHIIPGENPFDGGHACVIRGQVMTSDGTPLVGVNISFVNNPLFGYTISRQDGSFDLV .::::::::::::... . .:::::.:.:::::::::.:::. : .::::.::::.:::. KIAA11 KDSTHIIPGENPFNSSLVSLIRGQVVTTDGTPLVGVNVSFVKYPKYGYTITRQDGTFDLI 290 300 310 320 330 340 220 230 240 250 260 270 KIAA13 TNGGISIILRFERAPFITQEHTLWLPWDRFFVMETIIMRHEENEIPSCDLSNFARPNPVV .::: :. :.::::::..::.:.::::. :..:.:..:. ::: :::::::.:.::.:.. KIAA11 ANGGASLTLHFERAPFMSQERTVWLPWNSFYAMDTLVMKTEENSIPSCDLSGFVRPDPII 350 360 370 380 390 400 280 290 300 310 320 330 KIAA13 SPSPLTSFASSCAEKGPIVPEIQALQEEISISGCKMRLSYLSSRTPGYKSVLRISLTHPT :::..: :. ..::::: :.:.::: . : ...: :::::: ::::.:.:..:. : KIAA11 ISSPLSTFFSAAPGQNPIVPETQVLHEEIELPGSNVKLRYLSSRTAGYKSLLKITMTQST 410 420 430 440 450 460 340 350 360 370 380 390 KIAA13 IPFNLMKVHLMVAVEGRLFRKWFAAAPDLSYYFIWDKTDVYNQKVFGLSEAFVSVGYEYE .:.::..:::::::::.::.: : :.:.:.: :::::::.:.:.:.:::.: ::::.::: KIAA11 VPLNLIRVHLMVAVEGHLFQKSFQASPNLAYTFIWDKTDAYGQRVYGLSDAVVSVGFEYE 470 480 490 500 510 520 400 410 420 430 440 450 KIAA13 SCPDLILWEKRTTVLQGYEIDASKLGGWSLDKHHALNIQSGILHKGNGENQFVSQQPPVI .::.::::::::..:::.:.: :.:::::::::: ::..:::::::.:::::..::: .: KIAA11 TCPSLILWEKRTALLQGFELDPSNLGGWSLDKHHILNVKSGILHKGTGENQFLTQQPAII 530 540 550 560 570 580 460 470 480 490 500 510 KIAA13 GSIMGNGRRRSISCPSCNGLADGNKLLAPVALTCGSDGSLYVGDFNYIRRIFPSGNVTNI ::::::::::::::::::::.::::::::::. : :::::::::::::::::: :::.: KIAA11 TSIMGNGRRRSISCPSCNGLAEGNKLLAPVALAVGIDGSLYVGDFNYIRRIFPSRNVTSI 590 600 610 620 630 640 520 530 540 550 560 570 KIAA13 LELRNKDFRHSHSPAHKYYLATDPMSGAVFLSDSNSRRVFKIKSTVVVKDLVKNSEVVAG ::::::.:.::..::::::::.::.::....::.::::....:: .:::. ::::::: KIAA11 LELRNKEFKHSNNPAHKYYLAVDPVSGSLYVSDTNSRRIYRVKSLSGTKDLAGNSEVVAG 650 660 670 680 690 700 580 590 600 610 620 630 KIAA13 TGDQCLPFDDTRCGDGGKATEATLTNPRGITVDKFGLIYFVDGTMIRRIDQNGIISTLLG ::.::::::..:::::::: .::: .::::.::: ::.::::.::::..::::::::::: KIAA11 TGEQCLPFDEARCGDGGKAIDATLMSPRGIAVDKNGLMYFVDATMIRKVDQNGIISTLLG 710 720 730 740 750 760 640 650 660 670 680 690 KIAA13 SNDLTSARPLSCDSVMDISQVHLEWPTDLAINPMDNSLYVLDNNVVLQISENHQVRIVAG :::::..::::::: ::..::.::::::::.::::::::::.:::.:.:.::::: :.:: KIAA11 SNDLTAVRPLSCDSSMDVAQVRLEWPTDLAVNPMDNSLYVLENNVILRITENHQVSIIAG 770 780 790 800 810 820 700 710 720 730 740 750 KIAA13 RPMHCQVPGIDHFLLSKVAIHATLESATALAVSHNGVLYIAETDEKKINRIRQVTTSGEI ::::::::::: . :::.:::..::::.:.:.::.:::::.:::::::::.:::::.::: KIAA11 RPMHCQVPGID-YSLSKLAIHSALESASAIAISHTGVLYITETDEKKINRLRQVTTNGEI 830 840 850 860 870 880 760 770 780 790 800 810 KIAA13 SLVAGAPSGCDCKNDANCDCFSGDDGYAKDAKLNTPSSLAVCADGELYVADLGNIRIRFI :.::: : ::::::.::.:.::::.:: :: ::.:::::: :: .:.::::::::: . KIAA11 CLLAGAASDCDCKNDVNCNCYSGDDAYATDAILNSPSSLAVAPDGTIYIADLGNIRIRAV 890 900 910 920 930 940 820 830 840 850 860 870 KIAA13 RKNKPFLNTQNMYELSSPIDQELYLFDTTGKHLYTQSLPTGDYLYNFTYTGDGDITLITD :::: ::. :.:: .:: .::::.:.. : : :: :: ::.:::::::. :.:.: . : KIAA11 SKNKPVLNAFNQYEAASPGEQELYVFNADGIHQYTVSLVTGEYLYNFTYSTDNDVTELID 950 960 970 980 990 1000 880 890 900 910 920 930 KIAA13 NNGNMVNVRRDSTGMPLWLVVPDGQVYWVTMGTNSALKSVTTQGHELAMMTYHGNSGLLA :::: ...::::.::: :..::.:. .:.:::..:: :.::. ::..::: ::.:::: KIAA11 NNGNSLKIRRDSSGMPRHLLMPDNQIITLTVGTNGGLKVVSTQNLELGLMTYDGNTGLLA 1010 1020 1030 1040 1050 1060 940 950 960 970 980 KIAA13 TKSNENGWTTFYEYDSFGRLTNVTFPTGQVSSFRSDTDSSVHVQVETSSKDD-VTITTNL :::.:.::::::.:: ::::::: ::: :.:.. . ..:. ...:.:..:: ::. ::: KIAA11 TKSDETGWTTFYDYDHEGRLTNVTRPTGVVTSLHREMEKSITIDIENSNRDDDVTVITNL 1070 1080 1090 1100 1110 1120 990 1000 1010 1020 1030 1040 KIAA13 SASGAFYTLLQDQVRNSYYIGADGSLRLLLANGMEVALQTEPHLLAGTVNPTVGKRNVTL :. : ::..:::::::: . .:.::.. :::: .....:::.::::..::.:. :..: KIAA11 SSVEASYTVVQDQVRNSYQLCNNGTLRVMYANGMGISFHSEPHVLAGTITPTIGRCNISL 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1050 1060 1070 1080 1090 1100 KIAA13 PIDNGLNLVEWRQRKEQARGQVTVFGRRLRVHNRNLLSLDFDRVTRTEKIYDDHRKFTLR :..:::: .::: :::: .:.::.:::.::::.:::::.:.:: ::::::::::::::: KIAA11 PMENGLNSIEWRLRKEQIKGKVTIFGRKLRVHGRNLLSIDYDRNIRTEKIYDDHRKFTLR 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1110 1120 1130 1140 1150 1160 KIAA13 ILYDQAGRPSLWSPSSRLNGVNVTYSPGGYIAGIQRGIMSERMEYDQAGRITSRIFADGK :.:::.::: :: ::: : .:::.: .: .::.::: :::: . :. :::.::.::::: KIAA11 IIYDQVGRPFLWLPSSGLAAVNVSYFFNGRLAGLQRGAMSERTDIDKQGRIVSRMFADGK 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1170 1180 1190 1200 1210 1220 KIAA13 TWSYTYLEKSMVLLLHSQRQYIFEFDKNDRLSSVTMPNVARQTLETIRSVGYYRNIYQPP .:::.::.:::::::.::::::::.:..::: .::::.:::... : :.:: ::::.:: KIAA11 VWSYSYLDKSMVLLLQSQRQYIFEYDSSDRLLAVTMPSVARHSMSTHTSIGYIRNIYNPP 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1230 1240 1250 1260 1270 1280 KIAA13 EGNASVIQDFTEDGHLLHTFYLGTGRRVIYKYGKLSKLAETLYDTTKVSFTYDETAGMLK :.::::: :...::..:.: .:::::.:.:::::::::.: .::.: :.: ::::.:.:: KIAA11 ESNASVIFDYSDDGRILKTSFLGTGRQVFYKYGKLSKLSEIVYDSTAVTFGYDETTGVLK 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1290 1300 1310 1320 1330 1340 KIAA13 TINLQNEGFTCTIRYRQIGPLIDRQIFRFTEEGMVNARFDYNY-DNSFRVTSMQAVINET .:::. ::.::::::.::::.:.::.::.:::::::::::.: :::::..:.. ::.:: KIAA11 MVNLQSGGFSCTIRYRKIGPLVDKQIYRFSEEGMVNARFDYTYHDNSFRIASIKPVISET 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1350 1360 1370 1380 1390 1400 KIAA13 PLPIDLYRYDDVSGKTEQFGKFGVIYYDINQIITTAVMTHTKHFDAYGRMKEVQYEIFRS :::.::::::..:::.:.::::::::::::::::::::: .::::..::.::::::.::: KIAA11 PLPVDLYRYDEISGKVEHFGKFGVIYYDINQIITTAVMTLSKHFDTHGRIKEVQYEMFRS 1490 1500 1510 1520 1530 1540 1410 1420 1430 1440 1450 1460 KIAA13 LMYWMTVQYDNMGRVVKKELKVGPYANTTRYSYEYDADGQLQTVSINDKPLWRYSYDLNG ::::::::::.::::.:.:::.:::::::.:.:.::.:::::.:..::.: ::::::::: KIAA11 LMYWMTVQYDSMGRVIKRELKLGPYANTTKYTYDYDGDGQLQSVAVNDRPTWRYSYDLNG 1550 1560 1570 1580 1590 1600 1470 1480 1490 1500 1510 1520 KIAA13 NLHLLSPGNSARLTPLRYDIRDRITRLGDVQYKMDEDGFLRQRGGDIFEYNSAGLLIKAY :::::.::::.:: :::::.:::::::::::::.:.::.: :::.::::::: ::: .:: KIAA11 NLHLLNPGNSVRLMPLRYDLRDRITRLGDVQYKIDDDGYLCQRGSDIFEYNSKGLLTRAY 1610 1620 1630 1640 1650 1660 1530 1540 1550 1560 1570 1580 KIAA13 NRAGSWSVRYRYDGLGRRVSSKSSHSHHLQFFYADLTNPTKVTHLYNHSSSEITSLYYDL :.:..:::.:::::.:::.: :.. .::::.::.:: :::..::.::::.:::::::::: KIAA11 NKASGWSVQYRYDGVGRRASYKTNLGHHLQYFYSDLHNPTRITHVYNHSNSEITSLYYDL 1670 1680 1690 1700 1710 1720 1590 1600 1610 1620 1630 1640 KIAA13 QGHLFAMELSSGDEFYIACDNIGTPLAVFSGTGLMIKQILYTAYGEIYMDTNPNFQIIIG :::::::: :::.:.:.: :: :::::::: .: ::::. ::::::::.:.::.::..:: KIAA11 QGHLFAMESSSGEEYYVASDNTGTPLAVFSINGPMIKQLQYTAYGEIYYDSNPDFQMVIG 1730 1740 1750 1760 1770 1780 1650 1660 1670 1680 1690 1700 KIAA13 YHGGLYDPLTKLVHMGRRDYDVLAGRWTSPDHELWKHLSSSNVMPFNLYMFKNNNPISNS .:::::::::::::. .::::::::::::::. .::.... . ::::::::.:::.:. KIAA11 FHGGLYDPLTKLVHFTQRDYDVLAGRWTSPDYTMWKNVGKEPA-PFNLYMFKSNNPLSSE 1790 1800 1810 1820 1830 1710 1720 1730 1740 1750 1760 KIAA13 QDIKCFMTDVNSWLLTFGFQLHNVIPGYPKPDMDAMEPSYELIHTQMKTQEWDNSKSILG :.: ..:::.:::. ::::: :.:::.:. : . : ::: ..: . .:.. : : KIAA11 LDLKNYVTDVKSWLVMFGFQLSNIIPGFPRAKMYFVPPPYELSESQAS----ENGQLITG 1840 1850 1860 1870 1880 1890 1770 1780 1790 1800 1810 1820 KIAA13 VQCEVQKQLKAFVTLERFDQLYGSTITSCQQAPKTKK----FASSGSVFGKGVKFALKDG :: .... .::..:: :..::. .: .: ::.. ..:::. ::.:.: KIAA11 VQQTTERHNQAFMALE------GQVITKKLHASIREKAGHWFATTTPIIGKGIMFAIKEG 1900 1910 1920 1930 1940 1830 1840 1850 1860 1870 1880 KIAA13 RVTTDIISVANEDGRRVAAILNHAHYLENLHFTIDGVDTHYFVKPGPSEGDLAILGLSGG :::: . :.:.::.:.::..::.:.::...:..:.: ::::::: : ..:::. :: . : KIAA11 RVTTGVSSIASEDSRKVASVLNNAYYLDKMHYSIEGKDTHYFVKIGSADGDLVTLGTTIG 1950 1960 1970 1980 1990 2000 1890 1900 1910 1920 1930 1940 KIAA13 RRTLENGVNVTVSQINTVLNGRTRRYTDIQLQYGALCLNTRYGTT---LDEEKARVLELA :..::.:::::::: . ..::::::.:.:..::..: :. ::: : :::::::::. : KIAA11 RKVLESGVNVTVSQPTLLVNGRTRRFTNIEFQYSTLLLSIRYGLTPDTLDEEKARVLDQA 2010 2020 2030 2040 2050 2060 1950 1960 1970 1980 1990 2000 KIAA13 RQRAVRQAWAREQQRLREGEEGLRAWTEGEKQQVLSTGRVQGYDGFFVISVEQYPELSDS ::::. :::.:::. :.:.:: : ::::::::.:::::::::.:..:. :::::::.:: KIAA11 RQRALGTAWAKEQQKARDGREGSRLWTEGEKQQLLSTGRVQGYEGYYVLPVEQYPELADS 2070 2080 2090 2100 2110 2120 2010 KIAA13 ANNIHFMRQSEMGRR ..::.:.::.:::.: KIAA11 SSNIQFLRQNEMGKR 2130 2140 >>KIAA1781 ( 974 res) fg06971(revised) (974 aa) initn: 227 init1: 105 opt: 192 Z-score: 187.6 bits: 47.2 E(): 2.5e-05 Smith-Waterman score: 201; 27.439% identity (53.659% similar) in 164 aa overlap (6-159:635-784) 10 20 30 KIAA13 ACDQRACHPRCAEHG--TC--RDGKCECSPGWNGE :: :. :. .: .:: :.:.:::.: KIAA17 CSPIDGSCQCFPGWIGKDCSQACPPGFWGPACFHACSCHNGASCSAEDGACHCTPGWTGL 610 620 630 640 650 660 40 50 60 70 80 KIAA13 HCTI---AHYLDRVVKEGCPGLCNGNGRCTLDLNGWHCVCQLGWRGAGCDTSMETACGDS :: : .. . . : :.... : : . .:.:. :. : : : :. . KIAA17 FCTQRCPAAFFGKDCGRVCQ--CQNGASC--DHISGKCTCRTGFTGQHC----EQRCAPG 670 680 690 700 710 90 100 110 120 130 140 KIAA13 KDNDG-DGLVDCMDPDCCLQPLCHINPLCLGSPNPLDIIQETQVPVSQQNLHSFYDRIKF . : . : .::. . : :.. : ::. . :. :. . ...:. : .:. KIAA17 TFGYGCQQLCECMNNSTCD----HVTGTCYCSPG-FKGIRCDQAALMMEELNP-YTKISP 720 730 740 750 760 770 150 160 170 180 190 200 KIAA13 LVG--RDSTHIIPGENPFDGGHACVIRGQVMTSDGTPLVGVNISFVNNPLFGYTISRQDG .: : :. . : KIAA17 ALGAERHSVGAVTGIMLLLFFIVVLLGLFAWHRRRQKEKGRDLAPRVSYTPAMRMTSTDY 780 790 800 810 820 830 >>KIAA1780 ( 1192 res) pf01012 (1192 aa) initn: 329 init1: 104 opt: 188 Z-score: 182.8 bits: 46.6 E(): 4.6e-05 Smith-Waterman score: 188; 29.412% identity (49.580% similar) in 119 aa overlap (7-120:764-873) 10 20 30 KIAA13 ACDQRACHPRCAEHGT--CR--DGKCECSPGWNGEH : : :. : ::.:.:.:::.: . KIAA17 NPIDRSCQCYPGWIGSDCSQPCPPAHWGPNCIHTCNCHNGAFCSAYDGECKCTPGWTGLY 740 750 760 770 780 790 40 50 60 70 80 90 KIAA13 CTIAHYLDRVVKEGCPGLCNGNGRCTLDLNGWHCVCQLGWRGAGCDTSMETACGDSKDND :: : :. : .:. .. : . .:.:. :. : : : : .. . KIAA17 CTQRCPLGFYGKD-CALICQCQNGADCDHISGQCTCRTGFMGRHC----EQKCPSGTYGY 800 810 820 830 840 100 110 120 130 140 150 KIAA13 G-DGLVDCMDPDCCLQPLCHINPLCLGSPNPLDIIQETQVPVSQQNLHSFYDRIKFLVGR : . ::.. . : ::. : :: KIAA17 GCRQICDCLNNSTCD----HITGTCYCSPGWKGARCDQAGVIIVGNLNSLSRTSTALPAD 850 860 870 880 890 900 >>KIAA0149 ( 830 res) ha01221 (830 aa) initn: 89 init1: 73 opt: 172 Z-score: 168.8 bits: 43.5 E(): 0.00028 Smith-Waterman score: 174; 30.894% identity (50.407% similar) in 123 aa overlap (2-113:52-166) 10 20 KIAA13 ACDQRACH-PR-CAEHGTC-RDGKCECSPGW : :. : : . .: . : :.:.::. KIAA01 LDPKGQHVCVASSPSAELQCCAGWRQKDQECTIPICEGPDACQKDEVCVKPGLCRCKPGF 30 40 50 60 70 80 30 40 50 60 70 80 KIAA13 NGEHCTI---AHYLDRVVKEGCPGLCNGNGRCTLDLNGWHCVCQLGWRGAGCDTSMETAC : ::. ..: .:.:: :. .:.: .: : :: :: :. . :: KIAA01 FGAHCSSRCPGQYWGPDCRESCP--CHPHGQCE-PATG-ACQCQADRWGARCE--FPCAC 90 100 110 120 130 90 100 110 120 130 140 KIAA13 GDSKDND-GDGLVDCMDP----DCCLQPLCHINPLCLGSPNPLDIIQETQVPVSQQNLHS : : . :. : .: . : .: :. : KIAA01 GPHGRCDPATGVCHC-EPGWWSSTCRRP-CQCNTAAARCEQATGACVCKPGWWGRRCSFR 140 150 160 170 180 190 150 160 170 180 190 200 KIAA13 FYDRIKFLVGRDSTHIIPGENPFDGGHACVIRGQVMTSDGTPLVGVNISFVNNPLFGYTI KIAA01 CNCHGSPCEQDSGRCACRPGWWGPECQQQCECVRGRCSAASGECTCPPGFRGARCELPCP 200 210 220 230 240 250 >>KIAA0813 ( 1618 res) pf00581 (1618 aa) initn: 146 init1: 82 opt: 164 Z-score: 157.8 bits: 42.4 E(): 0.0011 Smith-Waterman score: 174; 25.185% identity (54.074% similar) in 135 aa overlap (1-120:1123-1244) 10 20 KIAA13 ACDQRA--CHPR---CAEHGTCR---DG-K ::.: . : : : ... : :: . KIAA08 CVDHACANGGVCVDGVGNYTCQCPLQYEGKACEQLVDLCSPDLNPCQHEAQCVGTPDGPR 1100 1110 1120 1130 1140 1150 30 40 50 60 70 KIAA13 CECSPGWNGEHCTIAHYLDRVVKEGC-PGLCNGNGRCTLDLNGWHCVCQLGWRGAGCDT- ::: ::. :..:. .. : :.....: ..:.. :.: :. : :. KIAA08 CECMPGYAGDNCSEN-------QDDCRDHRCQNGAQCMDEVNSYSCLCAEGYSGQLCEIP 1160 1170 1180 1190 1200 80 90 100 110 120 130 KIAA13 ----SMETACGDSKDNDGDGLVDCMDPDCCLQPLCHINPLCLGSPNPLDIIQETQVPVSQ . .. : .. ..: ..:.: .:.:. : .:.: KIAA08 PHLPAPKSPCEGTECQNG---ANCVDQGN--RPVCQCLP-GFGGPECEKLLSVNFVDRDT 1210 1220 1230 1240 1250 140 150 160 170 180 190 KIAA13 QNLHSFYDRIKFLVGRDSTHIIPGENPFDGGHACVIRGQVMTSDGTPLVGVNISFVNNPL KIAA08 YLQFTDLQNWPRANITLQVSTAEDNGILLYNGDNDHIAVELYQGHVRVSYDPGSYPSSAI 1260 1270 1280 1290 1300 1310 >>KIAA0815 ( 1640 res) sh06087 (1640 aa) initn: 196 init1: 94 opt: 161 Z-score: 154.8 bits: 41.9 E(): 0.0017 Smith-Waterman score: 192; 31.538% identity (50.769% similar) in 130 aa overlap (2-110:1074-1194) 10 20 KIAA13 ACDQRACHPRCAEHGTCRD--GKCECSPGWN :.: :: : . ..: :.:.:.::: KIAA08 DAVNGSCLCPAGRRGPRCAETCPAHTYGHNCSQ-ACA--CFNGASCDPVHGQCHCAPGWM 1050 1060 1070 1080 1090 1100 30 40 50 60 70 80 KIAA13 GEHCTIAH----YLDRVVKEGCPGLCNGNGRCTLDLNGWHCVCQLGWRGAGCDT-----S : : : : : ...: ::...: : : . ::.: :: : .:. . KIAA08 GPSCLQACPAGLYGDNC-RHSC--LCQNGGTC--DPVSGHCACPEGWAGLACEKECLPRD 1110 1120 1130 1140 1150 90 100 110 120 130 KIAA13 METACGDSKDNDGDGLVD-----CMDP-----DCCLQPLCHINPLCLGSPNPLDIIQETQ ....: : . :: : :. : : : .: : KIAA08 VRAGCRHSGGCLNGGLCDPHTGRCLCPAGWTGDKCQSP-CLRGWFGEACAQRCSCPPAAA 1160 1170 1180 1190 1200 1210 140 150 160 170 180 190 KIAA13 VPVSQQNLHSFYDRIKFLVGRDSTHIIPGENPFDGGHACVIRGQVMTSDGTPLVGVNISF KIAA08 CHHVTGACRCPPGFTGSGCEQACPPGSFGEDCAQMCQCPGENPACHPATGTCSCAAGYHG 1220 1230 1240 1250 1260 1270 2016 residues in 1 query sequences 1985489 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:16:53 2008 done: Thu Dec 18 15:16:55 2008 Total Scan time: 0.960 Total Display time: 0.750 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]