# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fg01155.fasta.huge -Q ../query/KIAA1294.ptfa ./tmplib.24314 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1294, 1051 aa vs ./tmplib.24314 library 1986454 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.2400+/-0.00793; mu= -2.3443+/- 0.538 mean_var=242.5312+/-56.663, 0's: 0 Z-trim: 9 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.082355 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1013 ( 1062 res) hj06791(revised) (1062) 2540 315.3 2.7e-86 KIAA0338 ( 934 res) hg01242 ( 934) 216 39.2 0.0032 >>KIAA1013 ( 1062 res) hj06791(revised) (1062 aa) initn: 2479 init1: 2177 opt: 2540 Z-score: 1641.1 bits: 315.3 E(): 2.7e-86 Smith-Waterman score: 2890; 48.783% identity (72.736% similar) in 1027 aa overlap (3-1022:54-1004) 10 20 KIAA12 LGSRIRAWESETM-AVQLVPDSALGL---LMM : .: : .: . : . : . :: .: KIAA10 SEGGGMASVFMCGVEDLLFSGSRFVWNLTVSTLRRWYTERLRACHQVLRTWCGLQDVYQM 30 40 50 60 70 80 30 40 50 60 70 80 KIAA12 TEGRRCQVHLLDDRKLELLVQPKLLAKELLDLVASHFNLKEKEYFGIAFTDETGHLNWLQ ::::.:::::::::.:::::::::::.::::::::::::::::::::.: :.::. :::: KIAA10 TEGRHCQVHLLDDRRLELLVQPKLLARELLDLVASHFNLKEKEYFGITFIDDTGQQNWLQ 90 100 110 120 130 140 90 100 110 120 130 140 KIAA12 LDRRVLEHDFPKKSGPVVLYFCVRFYIESISYLKDNATIELFFLNAKSCIYKELIDVDSE ::.:::.::.::: ::..:.: :::::::::.:::..:.::::::::.:..: :.:.:: KIAA10 LDHRVLDHDLPKKPGPTILHFAVRFYIESISFLKDKTTVELFFLNAKACVHKGQIEVESE 150 160 170 180 190 200 150 160 170 180 190 200 KIAA12 VVFELASYILQEAKGDFSSNEVVRSDLKKLPALPTQALKEHPSLAYCEDRVIEHYKKLNG ..:.::..::::::::..:.: .:.::: :::.::..:.:::::::::::::::: :..: KIAA10 TIFKLAAFILQEAKGDYTSDENARKDLKTLPAFPTKTLQEHPSLAYCEDRVIEHYLKIKG 210 220 230 240 250 260 210 220 230 240 250 260 KIAA12 QTRGQAIVNYMSIVESLPTYGVHYYAVKDKQGIPWWLGLSYKGIFQYDYHDKVKPRKIFQ :::::.:.::.:::.::::::::::::::::.:::::.::::: ::: .:::::::.:: KIAA10 LTRGQAVVQYMKIVEALPTYGVHYYAVKDKQGLPWWLGISYKGIGQYDIQDKVKPRKLFQ 270 280 290 300 310 320 270 280 290 300 310 320 KIAA12 WRQLENLYFREKKFSVEVHDPRRASVTRRTFGHSGIAVHTWYACPALIKSIWAMAISQHQ :.::::::::::::.:::::::: ::.:::::.::. :.:::: .::::::.::::::: KIAA10 WKQLENLYFREKKFAVEVHDPRRISVSRRTFGQSGLFVQTWYANSSLIKSIWVMAISQHQ 330 340 350 360 370 380 330 340 350 360 370 380 KIAA12 FYLDRKQSKSKIHAARSLSEIAIDLTETGTLKTSKLANMGSKGKIISGSSGSLLSSGSQE :::::::::.:: .::::.:::.::::::: ..:::... .:...: .:.:::.:::::. 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