# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hg03689mrp1.fasta.huge -Q ../query/KIAA1278.ptfa ./tmplib.24314 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1278, 1311 aa vs ./tmplib.24314 library 1986194 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2273+/-0.00601; mu= 17.9568+/- 0.410 mean_var=122.8722+/-30.442, 0's: 0 Z-trim: 48 B-trim: 131 in 1/39 Lambda= 0.115704 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1901 ( 1265 res) hh03635 (1265) 563 106.2 3.5e-23 KIAA0204 ( 1164 res) ha02801 (1164) 542 102.7 3.8e-22 KIAA1860 ( 689 res) fh18358 ( 689) 536 101.4 5.5e-22 KIAA0537 ( 698 res) hg03925 ( 698) 529 100.2 1.3e-21 KIAA1142 ( 467 res) hh05864 ( 467) 525 99.3 1.6e-21 KIAA0999 ( 1371 res) fj10213 (1371) 522 99.4 4.2e-21 KIAA0968 ( 527 res) hj06483 ( 527) 512 97.2 7.6e-21 KIAA1765 ( 608 res) fj12188(revised) ( 608) 501 95.5 2.9e-20 KIAA0781 ( 950 res) hk09678 ( 950) 497 95.1 6.1e-20 KIAA1264 ( 753 res) hj01058 ( 753) 492 94.1 9.5e-20 KIAA0175 ( 656 res) ha02337 ( 656) 487 93.2 1.6e-19 KIAA0096 ( 766 res) ha01240s1 ( 766) 486 93.1 1.9e-19 KIAA1639 ( 2584 res) af14886 (2584) 490 94.5 2.5e-19 KIAA1811 ( 715 res) ha06731 ( 715) 474 91.1 7.4e-19 KIAA0881 ( 1064 res) hk07534 (1064) 471 90.8 1.3e-18 KIAA0834 ( 453 res) hj05353 ( 453) 466 89.5 1.4e-18 KIAA0369 ( 794 res) hh00177 ( 794) 465 89.6 2.2e-18 KIAA1361 ( 1005 res) fj02367 (1005) 463 89.4 3.2e-18 KIAA0623 ( 1100 res) hg04615 (1100) 442 86.0 3.9e-17 KIAA0551 ( 1385 res) hh00867s1 (1385) 437 85.3 8e-17 KIAA1995 ( 1011 res) bh00088 (1011) 428 83.6 1.9e-16 KIAA0619 ( 1428 res) hg04117 (1428) 427 83.6 2.6e-16 KIAA0722 ( 1066 res) hk02030s1 (1066) 406 79.9 2.5e-15 KIAA0936 ( 640 res) hh04647 ( 640) 401 78.8 3.2e-15 KIAA0787 ( 557 res) hk05521s1 ( 557) 387 76.4 1.5e-14 KIAA0344 ( 2066 res) hg01568 (2066) 388 77.3 2.9e-14 KIAA1124 ( 1760 res) fg05708 (1760) 384 76.6 4.2e-14 KIAA0687 ( 1175 res) hk02992 (1175) 378 75.3 6.7e-14 KIAA1297 ( 2242 res) fg03883 (2242) 366 73.7 3.9e-13 KIAA1477 ( 870 res) fj04927 ( 870) 353 71.0 1e-12 KIAA0213 ( 1626 res) ha04841s1 (1626) 352 71.2 1.6e-12 KIAA1760 ( 2219 res) af00030 (2219) 350 71.0 2.5e-12 KIAA1459 ( 853 res) fh16961 ( 853) 326 66.5 2.2e-11 KIAA0904 ( 1535 res) ha00554 (1535) 307 63.6 2.9e-10 KIAA0807 ( 1329 res) hk04449(revised) (1329) 305 63.2 3.3e-10 KIAA0303 ( 2137 res) hg00009 (2137) 306 63.6 4e-10 KIAA0151 ( 723 res) ha03241 ( 723) 297 61.5 5.8e-10 KIAA0561 ( 1308 res) hh01676 (1308) 300 62.4 5.9e-10 KIAA0536 ( 1028 res) hg03863 (1028) 296 61.6 8.1e-10 KIAA1101 ( 467 res) hk08029 ( 467) 267 56.3 1.4e-08 KIAA0135 ( 1351 res) ha01203s1 (1351) 258 55.4 7.8e-08 KIAA0472 ( 365 res) hh00171 ( 365) 250 53.3 8.9e-08 KIAA1028 ( 501 res) fh00176s1 ( 501) 248 53.1 1.4e-07 KIAA1790 ( 1369 res) fh24104 (1369) 222 49.4 5e-06 KIAA0973 ( 1583 res) hj06871 (1583) 182 42.8 0.00056 KIAA1048 ( 897 res) hh02560 ( 897) 179 41.9 0.00056 KIAA1369 ( 653 res) fj03222 ( 653) 162 38.9 0.0033 KIAA0965 ( 489 res) hj06174s1 ( 489) 152 37.1 0.0089 >>KIAA1901 ( 1265 res) hh03635 (1265 aa) initn: 519 init1: 339 opt: 563 Z-score: 508.0 bits: 106.2 E(): 3.5e-23 Smith-Waterman score: 563; 35.926% identity (67.037% similar) in 270 aa overlap (17-281:7-275) 10 20 30 40 50 60 KIAA12 LFTVSTFFLLRDPETSVMEKYHVLEMIGEGSFGRVYKGRRKYSAQVVALKFIPKLGRSEK .:::: :. :::::::.. . ... ..: : : : KIAA19 RCLRKRIMEKYVRLQKIGEGSFGKAILVKSTEDGRQYVIKEINISRMSSK 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 KIAA12 ELRNLQREIEIMRGLRHPNIVHMLDSFETDKEVVVVTDYAEG-ELFQ-ILEDDGKL-PED : .. .::. .. ...:::::.. .::: . . .: :: :: .::. : . : : :: KIAA19 EREESRREVAVLANMKHPNIVQYRESFEENGSLYIVMDYCEGGDLFKRINAQKGVLFQED 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 KIAA12 QVQAIAAQLVSALYYLHSHRILHRDMKPQNILLAKGGGIKLCDFGFARAMSTNTMVLTSI :. .:. :: ..:...:::::.: :::.:.: : ..: :::.::...... . . KIAA19 QILDWFVQICLALKHVHDRKILHRDIKSQNIFLTKDGTVQLGDFGIARVLNSTVELARTC 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 KIAA12 KGTPLYMSPELVEERPYDHTADLWSVGCILYELAVGTPPFYATSIFQLVSLILKDPVRWP ::: :.:::. :..::.. .:.:..::.:::: . : : :. .:: :.. : KIAA19 IGTPYYLSPEICENKPYNNKSDIWALGCVLYELCTLKHAFEAGSMKNLVLKIISGSFP-P 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 KIAA12 STISPCF--KNFLQGLLTKDPRQRLSWPDLLYHPFIAGHVTIITEPAGPDLGTPFTSRLP .. . ..... :. ..::.: : ..: . ::: .. . : KIAA19 VSLHYSYDLRSLVSQLFKRNPRDRPSVNSILEKGFIAKRIEKFLSPQLIAEEFCLKTFSK 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 KIAA12 PELQVLKDEQAHRLAPKGNQSRILTQAYKRMAEEAMQKKHQNTGPALEQEDKTSKVAPGT KIAA19 FGSQPIPAKRPASGQNSISVMPAQKITKPAAKYGIPLAYKKYGDKKLHEKKPLQKHKQAH 290 300 310 320 330 340 >>KIAA0204 ( 1164 res) ha02801 (1164 aa) initn: 435 init1: 221 opt: 542 Z-score: 489.5 bits: 102.7 E(): 3.8e-22 Smith-Waterman score: 542; 36.015% identity (65.517% similar) in 261 aa overlap (21-271:46-304) 10 20 30 40 50 KIAA12 LFTVSTFFLLRDPETSVMEKYHVLEMIGEGSFGRVYKGRRKYSAQVVALK .... .:.:.::.:::.. : .. ..: : KIAA02 FSFRKIFKLGSEKKKKQYEHVKRDLNPEDFWEIIGELGDGAFGKVYKAQNKETSVLAAAK 20 30 40 50 60 70 60 70 80 90 100 KIAA12 FIPKLGRSEKELRNLQREIEIMRGLRHPNIVHMLDSFETDKEVVVVTDYAEGELFQ--IL : .::.::.. . ::.:. . :::::..::.: .... .. .. : . .: KIAA02 VIDT--KSEEELEDYMVEIDILASCDHPNIVKLLDAFYYENNLWILIEFCAGGAVDAVML 80 90 100 110 120 130 110 120 130 140 150 160 KIAA12 EDDGKLPEDQVQAIAAQLVSALYYLHSHRILHRDMKPQNILLAKGGGIKLCDFGFARAMS : . : :.:.:.. : ..:: :::...:.:::.: :::.. : ::: ::: . . KIAA02 ELERPLTESQIQVVCKQTLDALNYLHDNKIIHRDLKAGNILFTLDGDIKLADFGVSAKNT 140 150 160 170 180 190 170 180 190 200 210 220 KIAA12 TNTMVLTSIKGTPLYMSPELV-----EERPYDHTADLWSVGCILYELAVGTPPFYATSIF . . :. ::: .:.::.: ..::::. ::.::.: : :.: :: . . . KIAA02 RTIQRRDSFIGTPYWMAPEVVMCETSKDRPYDYKADVWSLGITLIEMAEIEPPHHELNPM 200 210 220 230 240 250 230 240 250 260 270 280 KIAA12 QLVSLILK-DP--VRWPSTISPCFKNFLQGLLTKDPRQRLSWPDLLYHPFIAGHVTIITE ... : : .: . :: : ::.::. : :. : . .:: :::. KIAA02 RVLLKIAKSEPPTLAQPSRWSSNFKDFLKKCLEKNVDARWTTSQLLQHPFVTVDSNKPIR 260 270 280 290 300 310 290 300 310 320 330 340 KIAA12 PAGPDLGTPFTSRLPPELQVLKDEQAHRLAPKGNQSRILTQAYKRMAEEAMQKKHQNTGP KIAA02 ELIAEAKAEVTEEVEDGKEEDEEEETENSLPIPASKRASSDLSIASSEEDKLSQNACILE 320 330 340 350 360 370 >>KIAA1860 ( 689 res) fh18358 (689 aa) initn: 532 init1: 290 opt: 536 Z-score: 486.5 bits: 101.4 E(): 5.5e-22 Smith-Waterman score: 536; 29.500% identity (59.750% similar) in 400 aa overlap (21-412:60-452) 10 20 30 40 50 KIAA12 LFTVSTFFLLRDPETSVMEKYHVLEMIGEGSFGRVYKGRRKYSAQVVALK :..:. ::.:.:..: .:. ... ::.: KIAA18 KGPSWSSRSLGARCRNSIASCPEEQPHVGNYRLLRTIGKGNFAKVKLARHILTGREVAIK 30 40 50 60 70 80 60 70 80 90 100 KIAA12 FIPKLGRSEKELRNLQREIEIMRGLRHPNIVHMLDSFETDKEVVVVTDYAE-GELFQILE .: : . . :..: ::..::.:: :::::.... .::.: . .: .:: ::.:. : KIAA18 IIDKTQLNPSSLQKLFREVRIMKGLNHPNIVKLFEVIETEKTLYLVMEYASAGEVFDYLV 90 100 110 120 130 140 110 120 130 140 150 160 KIAA12 DDGKLPEDQVQAIAAQLVSALYYLHSHRILHRDMKPQNILLAKGGGIKLCDFGFARAMST . :.. : ...: :.:::..: :.. :.:::.: .:.:: ..::. ::::. .. KIAA18 SHGRMKEKEARAKFRQIVSAVHYCHQKNIVHRDLKAENLLLDAEANIKIADFGFSNEFTL 150 160 170 180 190 200 170 180 190 200 210 220 KIAA12 NTMVLTSIKGTPLYMSPELVEERPYDHT-ADLWSVGCILYELAVGTPPFYATSIFQLVSL .. : .. :.: : .::: . . :: .:.::.: ::: :. :. :: . .. .: KIAA18 GSK-LDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDIWSLGVILYTLVSGSLPFDGHNLKELRER 210 220 230 240 250 260 230 240 250 260 270 280 KIAA12 ILKDPVRWPSTISPCFKNFLQGLLTKDPRQRLSWPDLLYHPFIA-GH----VTIITEPAG .:. : : .: ...:. .:. .: .: . ... .: :. . ::: KIAA18 VLRGKYRVPFYMSTDCESILRRFLVLNPAKRCTLEQIMKDKWINIGYEGEELKPYTEPE- 270 280 290 300 310 320 290 300 310 320 330 340 KIAA12 PDLGTPFTSRLPPELQVLKDEQAHRL-APKGNQSRILTQAYKRMAEEAMQKKHQNTGPAL :.: .. . ..: . : . : :. : .::. .. : :: KIAA18 EDFGDTKRIEVMVGMGYTREEIKESLTSQKYNEVTATYLLLGRKTEEGGDR--GAPGLAL 330 340 350 360 370 380 350 360 370 380 390 400 KIAA12 EQEDKTSKVAPGTAPLPRLGATPQESSLLAGILASELKSSWAKSGTGEVPSAPRENRTTP . : .. ::. . . . : . .. .:.. : . .: :... :. KIAA18 ARVRAPSDTTNGTSSSKGTSHSKGQRSSSSTYHRQRRHSDFC--GPSPAPLHPKRSPTST 390 400 410 420 430 440 410 420 430 440 450 460 KIAA12 DCERAFPEERPEVLGQRSTDVVDLENEEPDSDNEWQHLLETTEPVPIQLKAPLTLLCNPD : . ::: KIAA18 G-EAELKEERLPGRKASCSTAGSGSRGLPPSSPMVSSAHNPNKAEIPERRKDSTSTPNNL 450 460 470 480 490 500 >>KIAA0537 ( 698 res) hg03925 (698 aa) initn: 283 init1: 225 opt: 529 Z-score: 480.2 bits: 100.2 E(): 1.3e-21 Smith-Waterman score: 551; 25.160% identity (56.891% similar) in 624 aa overlap (20-606:91-694) 10 20 30 40 KIAA12 LFTVSTFFLLRDPETSVMEKYHVLEMIGEGSFGRVYKGRRKYSAQVVAL .:.. : .:.:..:.: .. ...:..:::. KIAA05 REAVAGATAALEPRKPHGVKRHHHKHNLKHRYELQETLGKGTYGKVKRATERFSGRVVAI 70 80 90 100 110 120 50 60 70 80 90 100 KIAA12 KFIPKLG-RSEKELRNLQREIEIMRGLRHPNIVHMLDSFETDKEVVVVTDYA-EGELFQI : : : ..:... ...:::::: .: ::.:. . . ::. ..:.. .:: .:::.. KIAA05 KSIRKDKIKDEQDMVHIRREIEIMSSLNHPHIISIYEVFENKDKIVIIMEYASKGELYDY 130 140 150 160 170 180 110 120 130 140 150 160 KIAA12 LEDDGKLPEDQVQAIAAQLVSALYYLHSHRILHRDMKPQNILLAKGGGIKLCDFGFARAM . . .: : ... . :.:::..: :.. ..:::.: .:::: . .::. :::.. . KIAA05 ISERRRLSERETRHFFRQIVSAVHYCHKNGVVHRDLKLENILLDDNCNIKIADFGLSNLY 190 200 210 220 230 240 170 180 190 200 210 220 KIAA12 STNTMVLTSIKGTPLYMSPELVEERPY-DHTADLWSVGCILYELAVGTPPFYATSIFQLV . . . : .. :.::: :::.:. ::: .: :..: .:: :. :: :: . . .:. KIAA05 QKDKF-LQTFCGSPLYASPEIVNGRPYRGPEVDSWALGVLLYTLVYGTMPFDGFDHKNLI 250 260 270 280 290 230 240 250 260 270 280 KIAA12 SLILKDPVRWPSTISPCFKNFLQGLLTKDPRQRLSWPDLLYHPFIA-GHVTIITE-PAGP : . : :. : ..... .: .: .: . :. : .. :. . . . : KIAA05 RQISSGEYREPTQPSDA-RGLIRWMLMVNPDRRATIEDIANHWWVNWGYKSSVCDCDALH 300 310 320 330 340 350 290 300 310 320 330 KIAA12 DLGTPFTSRL------PPELQVLKDEQAHRLAPKGNQSRILTQAYKRMAEEAMQKKHQNT : .:. .:. ::. . . . :: : . :... . . . . .. .. KIAA05 DSESPLLARIIDWHHRSTGLQADTEAKMKGLA-KPTTSEVMLERQRSLKKSKKENDFAQS 360 370 380 390 400 410 340 350 360 370 380 KIAA12 GPAL--EQEDKTSKVAPGTAPLPRLGATPQESS--LLAGILASELKSSWA------KSGT : :. .: :. : : .. . : .. :... : :.. ..:. KIAA05 GQDAVPESPSKLSSKRPKGILKKRSNSEHRSHSTGFIEGVVGPALPSTFKMEQDLCRTGV 420 430 440 450 460 470 390 400 410 420 430 440 KIAA12 GEVPSAPREN---RTTPDCERAFPEERPEVLGQRSTDVVDLENEEPDSDNEWQHLLETTE .::.:. . . .: ..:.. .: ... . . :. .: ..::.... KIAA05 -LLPSSPEAEVPGKLSPKQSATMPKKG--IL-KKTQQRESGYYSSPER-SESSELLDSND 480 490 500 510 520 530 450 460 470 480 490 500 KIAA12 PVPIQLKAPLTLLCNPDFCQRIQSQLHEAGGQILKGILEGASHILPAFRVLSSLLSSCSD . .. .: .: :. : : . . ::::. .:. : . .:.: KIAA05 VMGSSIPSP-----SPPDPARVTS--HSLSCR-RKGILKHSSKY-SAGTMDPALVSPEMP 540 550 560 570 580 510 520 530 540 550 KIAA12 SVALYSFCREAGLP--GLLLSLLRHSQ---ESNSLQQQSWYGTFLQDLMAVIQAYFACT- .. : : :.: :: : : :. ... :...:. ::. . : .:. KIAA05 TLESLS---EPGVPAEGLSRSYSRPSSVISDDSVLSSDSFDLLDLQENRPARQRIRSCVS 590 600 610 620 630 640 560 570 580 590 600 610 KIAA12 ---F----NLERSQTSDSLQVFQEAANLFLDLLGKLLAQPDDSEQTLRRDSLMCFTVLCE : ..: :. : ... : . : .::.. :: :. .. .: KIAA05 AENFLQIQDFEGLQNRPRPQYLKRYRNRLADSSFSLLTDMDDVTQVYKQALEICSKLN 650 660 670 680 690 620 630 640 650 660 670 KIAA12 AMDGNSRAISKAFYSSLLTTQQVVLDGLLHGLTVPQLPVHTPQGAPQVSQPLREQSEDIP >>KIAA1142 ( 467 res) hh05864 (467 aa) initn: 513 init1: 367 opt: 525 Z-score: 478.4 bits: 99.3 E(): 1.6e-21 Smith-Waterman score: 525; 35.341% identity (65.060% similar) in 249 aa overlap (27-272:203-449) 10 20 30 40 50 KIAA12 LFTVSTFFLLRDPETSVMEKYHVLEMIGEGSFGRVYKGRRKYSAQVVALKFIPKLG ::::: : : . . :...::.: . KIAA11 QRVSHEQFRAALQLVVDPGDPRSYLDNFIKIGEGSTGIVCIATVRSSGKLVAVKKMDLRK 180 190 200 210 220 230 60 70 80 90 100 110 KIAA12 RSEKELRNLQREIEIMRGLRHPNIVHMLDSFETDKEVVVVTDYAEGELFQILEDDGKLPE ....:: : :. ::: .: :.:.: .:. . :. :: .. :: . . .. : KIAA11 QQRREL--LFNEVVIMRDYQHENVVEMYNSYLVGDELWVVMEFLEGGALTDIVTHTRMNE 240 250 260 270 280 290 120 130 140 150 160 170 KIAA12 DQVQAIAAQLVSALYYLHSHRILHRDMKPQNILLAKGGGIKLCDFGFARAMSTNTMVLTS .:. :. ...:: ::.. ..:::.: ..:::.. : .:: :::: .: .. : KIAA11 EQIAAVCLAVLQALSVLHAQGVIHRDIKSDSILLTHDGRVKLSDFGFCAQVSKEVPRRKS 300 310 320 330 340 350 180 190 200 210 220 230 KIAA12 IKGTPLYMSPELVEERPYDHTADLWSVGCILYELAVGTPPFYATSIFQLVSLILKD-PVR . ::: .:.:::. . :: .:.::.: .. :.. : ::.. .. ...: . : : KIAA11 LVGTPYWMAPELISRLPYGPEVDIWSLGIMVIEMVDGEPPYFNEPPLKAMKMIRDNLPPR 360 370 380 390 400 410 240 250 260 270 280 290 KIAA12 WPST--ISPCFKNFLQGLLTKDPRQRLSWPDLLYHPFIAGHVTIITEPAGPDLGTPFTSR . .:: .:.::. ::..:: :: . .:: :::.: KIAA11 LKNLHKVSPSLKGFLDRLLVRDPAQRATAAELLKHPFLAKAGPPASIVPLMRQNRTR 420 430 440 450 460 300 310 320 330 340 350 KIAA12 LPPELQVLKDEQAHRLAPKGNQSRILTQAYKRMAEEAMQKKHQNTGPALEQEDKTSKVAP >>KIAA0999 ( 1371 res) fj10213 (1371 aa) initn: 457 init1: 265 opt: 522 Z-score: 470.7 bits: 99.4 E(): 4.2e-21 Smith-Waterman score: 545; 24.299% identity (53.138% similar) in 749 aa overlap (11-725:106-809) 10 20 30 40 KIAA12 LFTVSTFFLLRDPETSVMEKYHVLEMIGEGSFGRVYKGRR : : . . :.. . ::.:.:. : .. . KIAA09 LLPPPAPGSPAAPAAVSPAAGQPRPPAPASRGPMPARIGYYEIDRTIGKGNFAVVKRATH 80 90 100 110 120 130 50 60 70 80 90 100 KIAA12 KYSAQVVALKFIPKLGRSEKELRNLQREIEIMRGLRHPNIVHMLDSFETDKEVVVVTDYA . ::.:.: : .:..:... ::..::. : ::.:... . .::.. . .::.:: KIAA09 LVTKAKVAIKIIDKTQLDEENLKKIFREVQIMKMLCHPHIIRLYQVMETERMIYLVTEYA 140 150 160 170 180 190 110 120 130 140 150 KIAA12 EG-ELFQILEDDGKLPEDQVQAIAAQLVSALYYLHSHRILHRDMKPQNILLAKGGGIKLC : :.:. : :.. : ... :.:.:.:. : . :.:::.: .:.:: . .::. KIAA09 SGGEIFDHLVAHGRMAEKEARRKFKQIVTAVYFCHCRNIVHRDLKAENLLLDANLNIKIA 200 210 220 230 240 250 160 170 180 190 200 210 KIAA12 DFGFARAMSTNTMVLTSIKGTPLYMSPELVEERPYDHT-ADLWSVGCILYELAVGTPPFY ::::. . : ..: . :.: : .::: : . :: .:.::.: .:: :. :. :: KIAA09 DFGFSN-LFTPGQLLKTWCGSPPYAAPELFEGKEYDGPKVDIWSLGVVLYVLVCGALPFD 260 270 280 290 300 310 220 230 240 250 260 270 KIAA12 ATSIFQLVSLILKDPVRWPSTISPCFKNFLQGLLTKDPRQRLSWPDLLYHPFIAGHVTII .... .: . .:. : : .: ..... .:. :: .::: .. : .. KIAA09 GSTLQNLRARVLSGKFRIPFFMSTECEHLIRHMLVLDPNKRLSMEQICKHKWMK------ 320 330 340 350 360 280 290 300 310 320 330 KIAA12 TEPAGPDLGTPFTSRLPPELQVLKDEQAHRLAPKGNQSRILTQAYKRMAEEAMQKKHQNT : :.. .:: : : ::.: : . :.. .: :.. :. . : .. KIAA09 LGDADPNF-----DRLIAECQQLKEE---RQVDPLNEDVLL--AMEDMGLDKEQTLQSLR 370 380 390 400 410 340 350 360 370 380 390 KIAA12 GPALEQEDKTSKVA---PGTAPLPRLGATPQESSLLAGILASELKSSWAKSGTGEVPSAP . : .. . .. :::: :. :: . . .. . ..::. :.: KIAA09 SDAYDHYSAIYSLLCDRHKRHKTLRLGALPSMPRALA--FQAPVNIQAEQAGTAMNISVP 420 430 440 450 460 470 400 410 420 430 440 KIAA12 RENRTTPDCERAFP------------EERPEVLGQRST---DVVDLENEEPDSDNEWQHL . . .:. . . : : ::.: . . .: . . . . .. :.: KIAA09 QVQLINPENQIVEPDGTLNLDSDEGEEPSPEALVRYLSMRRHTVGVADPRTEVMEDLQKL 480 490 500 510 520 530 450 460 470 480 490 KIAA12 LETTEPVPIQLKAP-LTLLCNPDFCQRIQS-QLHEAGGQIL---KGILEGAS-HILPAFR : : : :: : . : .: . . : . ::. ...:. . ..: .. KIAA09 LPGFPGVNPQ--APFLQVAPNVNFMHNLLPMQNLQPTGQLEYKEQSLLQPPTLQLLNGMG 540 550 560 570 580 590 500 510 520 530 540 550 KIAA12 VLSSLLSSCSDSVALYS---FCREAGLPGLLLSLLRHSQESNSLQQQSWYGTFLQDLMAV :. :. . .. :.. . : : :. :... . ....: : : :: KIAA09 PLGRRASDGGANIQLHAQQLLKRPRG-PSPLVTMTPAVPAVTPVDEESSDGE--PDQEAV 600 610 620 630 640 650 560 570 580 590 600 KIAA12 IQAYF--ACTFNLERSQTSDSLQVFQEAANLFLDLLGKLLAQPDDSEQTLRRDSLMCFTV .. . . :..: . : .. :...: . . ..: . ..: .... . : . KIAA09 QSSTYKDSNTLHLPTERFSP-VRRFSDGAASIQAFKAHLEKMGNNS--SIKQLQQECEQL 660 670 680 690 700 610 620 630 640 650 660 KIAA12 LCEAMDG---NSRAISKAFYSSLLTTQQVVLDGLLHGLTVPQLPVHTPQGAPQVSQPLRE . : : . :.. : : :: .: . . : .. :: : ::. KIAA09 --QKMYGGQIDERTLEK-------TQQQHMLYQQEQHHQILQQQIQDSICPPQPSPPLQA 710 720 730 740 750 670 680 690 700 710 720 KIAA12 QSEDIPGAISSALAAICTAPVGLPDCWDAKEQVCWHLANQLTEDSSQLRPSLISGLQHPI :. :. .. : . : . : : :.: .. :. : . :.. .: KIAA09 ACENQPALLTHQLQRLRIQPSSPPPN---------HPNNHLFRQPSNSPPPMSSAMIQPH 760 770 780 790 800 810 730 740 750 760 770 780 KIAA12 LCLHLLKVLYSCCLVSEGLCRLLGQEPLALESLFMLIQGKVKVVDWEESTEVTLYFLSLL KIAA09 GAASSSQFQGLPSRSAIFQQQPENCSSPPNVALTCLGMQQPAQSQQVTIQVQEPVDMLSN 820 830 840 850 860 870 >>KIAA0968 ( 527 res) hj06483 (527 aa) initn: 306 init1: 214 opt: 512 Z-score: 466.1 bits: 97.2 E(): 7.6e-21 Smith-Waterman score: 512; 32.967% identity (63.370% similar) in 273 aa overlap (15-279:56-328) 10 20 30 40 KIAA12 LFTVSTFFLLRDPETSVMEKYHVLEMIGEGSFGRVYKGRRKYSA : :.:...: .:.:.:. : . . .. KIAA09 SGAEQQRLSPGPPVPSLTCLPSARMATITCTRFTEEYQLFEELGKGAFSVVRRCVKVLAG 30 40 50 60 70 80 50 60 70 80 90 100 KIAA12 QVVALKFIPKLGRSEKELRNLQREIEIMRGLRHPNIVHMLDSFETDKEVVVVTDYAEG-E : : :.: : .. ..:.:: .: : :.:::::.. ::. . . .. : . : : KIAA09 QEYAAKIINTKKLSARDHQKLEREARICRLLKHPNIVRLHDSISEEGHHYLIFDLVTGGE 90 100 110 120 130 140 110 120 130 140 150 160 KIAA12 LFQILEDDGKLPEDQVQAIAAQLVSALYYLHSHRILHRDMKPQNILLA---KGGGIKLCD ::. . : ... :.. :. . :. ..:::.::.:.::: ::...:: : KIAA09 LFEDIVAREYYSEADASHCIQQILEAVLHCHQMGVVHRDLKPENLLLASKLKGAAVKLAD 150 160 170 180 190 200 170 180 190 200 210 220 KIAA12 FGFARAMSTNTMVLTSIKGTPLYMSPELVEERPYDHTADLWSVGCILYELAVGTPPFYAT ::.: . . .. .. ::: :.:::.... :: . .:::. : ::: : :: :::. KIAA09 FGLAIEVEGEQQAWFGFAGTPGYLSPEVLRKDPYGKPVDLWACGVILYILLVGYPPFWDE 210 220 230 240 250 260 230 240 250 260 270 KIAA12 SIFQLVSLILKDPVRWPS----TISPCFKNFLQGLLTKDPRQRLSWPDLLYHPFIAGHVT . .: . : .:: :..: :.... .:: .: .:.. . : ::.:. . : KIAA09 DQHRLYQQIKAGAYDFPSPEWDTVTPEAKDLINKMLTINPSKRITAAEALKHPWISHRST 270 280 290 300 310 320 280 290 300 310 320 330 KIAA12 IITEPAGPDLGTPFTSRLPPELQVLKDEQAHRLAPKGNQSRILTQAYKRMAEEAMQKKHQ . . KIAA09 VASCMHRQETVDCLKKFNARRKLKGAILTTMLATRNFSGGKSGGNKKSDGVKESSESTNT 330 340 350 360 370 380 >>KIAA1765 ( 608 res) fj12188(revised) (608 aa) initn: 448 init1: 147 opt: 501 Z-score: 455.5 bits: 95.5 E(): 2.9e-20 Smith-Waterman score: 501; 32.491% identity (66.787% similar) in 277 aa overlap (16-278:311-582) 10 20 30 40 KIAA12 LFTVSTFFLLRDPETSVMEKYHVLEMIGEGSFGRVYKGRRKYSAQ .: ..:.. ..::.:.:. : . :.. . : KIAA17 LEKEPKTRPEENKPERPSGRKPRPMGIIAANVEKHYETGRVIGDGNFAVVKECRHRETRQ 290 300 310 320 330 340 50 60 70 80 90 100 KIAA12 VVALKFIPKLGRSEKELRNLQREIEIMRGLRHPNIVHMLDSFETDKEVVVVTDYAEG-EL . :.:.: : .: . . .. :: :...: :::::.. . .::: :. .. .:..: .: KIAA17 AYAMKIIDK-SRLKGKEDMVDSEILIIQSLSHPNIVKLHEVYETDMEIYLILEYVQGGDL 350 360 370 380 390 110 120 130 140 150 160 KIAA12 FQILEDDGKLPEDQVQAIAAQLVSALYYLHSHRILHRDMKPQNILLA----KGGGIKLCD :. . .. :.:: .. . .: .:: ..:.. :.:::.::.:.:. :. .:: : KIAA17 FDAIIESVKFPEPDAALMIMDLCKALVHMHDKSIVHRDLKPENLLVQRNEDKSTTLKLAD 400 410 420 430 440 450 170 180 190 200 210 220 KIAA12 FGFARAMSTNTMVLTSIKGTPLYMSPELVEERPYDHTADLWSVGCILYELAVGTPPFYAT ::.:. . . .. ::: :..::.. :. : .:.:..: ::: : : ::: . KIAA17 FGLAKHVVRP---IFTVCGTPTYVAPEILSEKGYGLEVDMWAAGVILYILLCGFPPFRSP 460 470 480 490 500 510 230 240 250 260 270 KIAA12 S-----IFQLVSLILKD--PVRWPSTISPCFKNFLQGLLTKDPRQRLSWPDLLYHPFI-- .:....: . : : . :: :.... ::. ::..: . ..: ::.: KIAA17 ERDQDELFNIIQLGHFEFLPPYWDN-ISDAAKDLVSRLLVVDPKKRYTAHQVLQHPWIET 520 530 540 550 560 570 280 290 300 310 320 330 KIAA12 AGHVTIITEPAGPDLGTPFTSRLPPELQVLKDEQAHRLAPKGNQSRILTQAYKRMAEEAM ::... . KIAA17 AGKTNTVKRQKQVSPSSEGHFRSQHKRVVEQVS 580 590 600 >>KIAA0781 ( 950 res) hk09678 (950 aa) initn: 440 init1: 292 opt: 497 Z-score: 449.8 bits: 95.1 E(): 6.1e-20 Smith-Waterman score: 508; 27.924% identity (59.189% similar) in 419 aa overlap (21-416:44-459) 10 20 30 40 50 KIAA12 LFTVSTFFLLRDPETSVMEKYHVLEMIGEGSFGRVYKGRRKYSAQVVALK : . .:.:.:. : ::.. . ::.: KIAA07 SCPPCLAAGPSMVMADGPRHLQRGPVRVGFYDIEGTLGKGNFAVVKLGRHRITKTEVAIK 20 30 40 50 60 70 60 70 80 90 100 KIAA12 FIPKLGRSEKELRNLQREIEIMRGLRHPNIVHMLDSFETDKEVVVVTDYAE-GELFQILE .: : . .:... ::..::. : ::.:... . .:: . . .::.::. ::.:. : KIAA07 IIDKSQLDAVNLEKIYREVQIMKMLDHPHIIKLYQVMETKSMLYLVTEYAKNGEIFDYLA 80 90 100 110 120 130 110 120 130 140 150 160 KIAA12 DDGKLPEDQVQAIAAQLVSALYYLHSHRILHRDMKPQNILLAKGGGIKLCDFGFARAMST . :.: :.... :..::. : :...:.:::.: .:.:: .. .::. ::::. ... KIAA07 NHGRLNESEARRKFWQILSAVDYCHGRKIVHRDLKAENLLLDNNMNIKIADFGFGNFFKS 140 150 160 170 180 190 170 180 190 200 210 220 KIAA12 NTMVLTSIKGTPLYMSPELVEERPYDHTA-DLWSVGCILYELAVGTPPFYATSIFQLVSL . . :.. :.: : .::. : . :. :.::.: .:: :. :. :: . .. : . KIAA07 GEL-LATWCGSPPYAAPEVFEGQQYEGPQLDIWSMGVVLYVLVCGALPFDGPTLPILRQR 200 210 220 230 240 250 230 240 250 260 270 280 KIAA12 ILKDPVRWPSTISPCFKNFLQGLLTKDPRQRLSWPDLLYHPFIAGHVTI---ITEPAG-- .:. : : .: ..... .:. :: .::. .. : .. .: . . : KIAA07 VLEGRFRIPYFMSEDCEHLIRRMLVLDPSKRLTIAQIKEHKWMLIEVPVQRPVLYPQEQE 260 270 280 290 300 310 290 300 310 320 330 340 KIAA12 --PDLGTPFTSRLPPELQVLKDEQAHRLAPKGNQSRILTQAYKRMAEEAMQKKHQNTGPA :..: :. .. .. : .: . . :.: : . : . :.:... :. KIAA07 NEPSIGE-FNEQVLRLMHSLGIDQQKTIESLQNKSYNHFAAIYFLLVERL-KSHRSSFPV 320 330 340 350 360 370 350 360 370 380 KIAA12 LEQED----KTSKVAPGTAP------LPRLGATPQESSLLAGIL--ASELKS-SWAKSGT .. : . : .: :. :: .:. : ...: ::.... :. :: KIAA07 EQRLDGRQRRPSTIAEQTVAKAQTVGLPVTMHSPNMRLLRSALLPQASNVEAFSFPASGC 380 390 400 410 420 430 390 400 410 420 430 440 KIAA12 -GEVPSAPRENRTTPDCERAFPEERPEVLGQRSTDVVDLENEEPDSDNEWQHLLETTEPV .:. .: :: . . . : :: KIAA07 QAEAAFMEEECVDTPKVNGCLLDPVPPVLVRKGCQSLPSNMMETSIDEGLETEGEAEEDP 440 450 460 470 480 490 >>KIAA1264 ( 753 res) hj01058 (753 aa) initn: 477 init1: 363 opt: 492 Z-score: 446.4 bits: 94.1 E(): 9.5e-20 Smith-Waterman score: 492; 33.871% identity (63.306% similar) in 248 aa overlap (27-271:489-734) 10 20 30 40 50 KIAA12 LFTVSTFFLLRDPETSVMEKYHVLEMIGEGSFGRVYKGRRKYSAQVVALKFIPKLG ::::: : : . .:.... ::.: . KIAA12 SRVSHEQFRAALQLVVSPGDPREYLANFIKIGEGSTGIVCIATEKHTGKQVAVKKMDLRK 460 470 480 490 500 510 60 70 80 90 100 110 KIAA12 RSEKELRNLQREIEIMRGLRHPNIVHMLDSFETDKEVVVVTDYAEGELFQILEDDGKLPE ....:: : :. ::: .: :.: : .:. . :. :: .. :: . . .. : KIAA12 QQRREL--LFNEVVIMRDYHHDNVVDMYSSYLVGDELWVVMEFLEGGALTDIVTHTRMNE 520 530 540 550 560 570 120 130 140 150 160 170 KIAA12 DQVQAIAAQLVSALYYLHSHRILHRDMKPQNILLAKGGGIKLCDFGFARAMSTNTMVLTS .:. .. ... :: :::.. ..:::.: ..:::.. : ::: :::: .: .. : KIAA12 EQIATVCLSVLRALSYLHNQGVIHRDIKSDSILLTSDGRIKLSDFGFCAQVSKEVPKRKS 580 590 600 610 620 630 180 190 200 210 220 230 KIAA12 IKGTPLYMSPELVEERPYDHTADLWSVGCILYELAVGTPPFYATSIFQLVSLI---LKDP . ::: .:.::.. . :: .:.::.: .. :. : ::.. .: . : : KIAA12 LVGTPYWMAPEVISRLPYGTEVDIWSLGIMVIEMIDGEPPYFNEPPLQAMRRIRDSLPPR 640 650 660 670 680 690 240 250 260 270 280 290 KIAA12 VRWPSTISPCFKNFLQGLLTKDPRQRLSWPDLLYHPFIAGHVTIITEPAGPDLGTPFTSR :. .: ...::. .:...: :: . .:: :::. KIAA12 VKDLHKVSSVLRGFLDLMLVREPSQRATAQELLGHPFLKLAGPPSCIVPLMRQYRHH 700 710 720 730 740 750 300 310 320 330 340 350 KIAA12 LPPELQVLKDEQAHRLAPKGNQSRILTQAYKRMAEEAMQKKHQNTGPALEQEDKTSKVAP 1311 residues in 1 query sequences 1986194 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:15:54 2008 done: Thu Dec 18 15:15:55 2008 Total Scan time: 0.800 Total Display time: 0.280 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]