# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk10413.fasta.huge -Q ../query/KIAA1275.ptfa ./tmplib.24314 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1275, 1140 aa vs ./tmplib.24314 library 1986365 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.9312+/-0.0123; mu= -18.0635+/- 0.825 mean_var=556.9725+/-135.865, 0's: 0 Z-trim: 32 B-trim: 88 in 1/39 Lambda= 0.054345 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1433 ( 652 res) hh05535 ( 652) 440 50.2 1.2e-06 KIAA0378 ( 970 res) hh00502s1 ( 970) 349 43.3 0.00021 KIAA1561 ( 1416 res) fh20178s1 (1416) 342 42.9 0.0004 KIAA1509 ( 1365 res) fh14721 (1365) 321 41.2 0.0012 KIAA0866 ( 1984 res) hk00546s1 (1984) 324 41.7 0.0013 KIAA1512 ( 2010 res) fg04660y1 (2010) 316 41.0 0.0021 KIAA1749 ( 1047 res) pj02119y1 (1047) 306 39.9 0.0023 >>KIAA1433 ( 652 res) hh05535 (652 aa) initn: 454 init1: 354 opt: 440 Z-score: 211.3 bits: 50.2 E(): 1.2e-06 Smith-Waterman score: 440; 29.795% identity (65.753% similar) in 292 aa overlap (18-307:35-323) 10 20 30 40 KIAA12 AQYAIYIVSRLILLHFLLQAREDVIHMLKTEKTKPEVLEAHYGSAEP :.::. ::. ::... . .: .::. . 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KIAA03 LASAGLKRDSKLKSLEIAIEQKKEECSKLEAQLKKA-HNIEDDSRMNPEFADQIKQLDKE 670 680 690 700 710 720 640 650 660 670 680 690 KIAA12 RHRFRLEEAKSRDLKAEVQALKEKIHELMNKEDQLSQLQVDYSVLQQRFMEEENKNKNMG .: : .:. .:::. : : ..:. :.... .. .. : : :...:: KIAA03 ASYYRDECGKA---QAEVDRLLEILKEVENEKNDKDKKIAELESLTLRHMKDQNK----- 730 740 750 760 770 700 710 720 730 740 750 KIAA12 QEVLNLTKELELSKRYSRALRPSVNGRRMVDVPVTSTGVQTDAVSG--EAAEEETPAVFI .: :: .. .: :. . : : :: .. .: .: . . . : ...: :. KIAA03 -KVANLKHNQQLEKKKNAQLLEEVR-RREDSMADNSQHLQIEELMNALEKTRQELDATKA 780 790 800 810 820 830 760 770 780 790 800 KIAA12 R-----KSFQEENHIMSNLRQVGLKKPVERSSVLDRYPPAANELTMRKSWIPWMRKRENG : .:. :.. ..::: . .: .: KIAA03 RLASTQQSLAEKEAHLANLR-IERRKQLEEILEMKQEALLAAISEKDANIALLELSASKK 840 850 860 870 880 890 >>KIAA1561 ( 1416 res) fh20178s1 (1416 aa) initn: 267 init1: 93 opt: 342 Z-score: 165.9 bits: 42.9 E(): 0.0004 Smith-Waterman score: 401; 24.464% identity (56.509% similar) in 699 aa overlap (52-719:470-1126) 30 40 50 60 70 80 KIAA12 EDVIHMLKTEKTKPEVLEAHYGSAEPEKVLRVLHRDAILAQEKSIGEDVYEKPISEL-DR .: . :. . . . :: :. :..: : KIAA15 EILKKELEAMRTFCESAKQDRLKLQNELAHKVAECKALALECERVKEDSDEQ-IKQLEDA 440 450 460 470 480 490 90 100 110 120 130 KIAA12 LEEKQKETYR-----RMLEQLLLAEKCHRRTVYELENEKHKHTDYM-NKSDDFTNLLEQE :.. ::. :. .... .:: : : . : . .:. :. . .. :. : KIAA15 LKDVQKRMYESEGKVKQMQTHFLALKEHLTS--EAASGNHRLTEELKDQLKDLKVKYEGA 500 510 520 530 540 550 140 150 160 170 180 190 KIAA12 RERLKKLLEQEKAYQARKEKENAKR-LNKLRDELVKLKSFALMLVDERQMHIEQLGLQSQ .. :: .: : : . :. :: .:: .: .:.. : ::. . ... . KIAA15 SAEVGKLRNQIK--QNEMIVEEFKRDEGKLIEENKRLQKELSMCEMEREKKGRKVTEMEG 560 570 580 590 600 610 200 210 220 230 240 KIAA12 KVQDLTQKLR-----EEEEKLKA-ITSKSKEDRQKLLKLEVDFEHKASRFSQ---EHEEM ....:. :: :. :..:. .... .: .::...: . :.. :.. : : :.. KIAA15 QAKELSAKLALSIPAEKFENMKSSLSNEVNEKAKKLVEMEREHEKSLSEIRQLKRELENV 620 630 640 650 660 670 250 260 270 280 290 KIAA12 NAKLANQ---ESHNR---QLRLKLVGLTQRIEELEETNKNLQKAEEELQELRDKIAKGEC .::::.. : :.. .:. : : ..: :: :..::: :.. : .:. : . KIAA15 KAKLAQHVKPEEHEQVKSRLEQKSGELGKKITELTLKNQTLQKEIEKVY-LDNKLLKEQA 680 690 700 710 720 730 300 310 320 330 340 350 KIAA12 GNSSLMAEVENLRKRVLEMEGKDEEITKTESQCRELRKKLQEEEHHSKELRLEVEKLQKR : : :..: . . .. ... . .. .: .:: . .. : .::.::: KIAA15 HN--LTIEMKN---HYVPLKVSEDMKKSHDAIIDDLNRKLLDVTQKYTEKKLEMEKLL-- 740 750 760 770 780 360 370 380 390 400 410 KIAA12 MSELEKLEEAFSKSKSECTQLHLNLEKEKNLTKDLLNELEVVKSRVKELECSESRLEKAE ::. ...::. :. . . ::... :. ..:: . ::. . :.:.: KIAA15 ---LEN--DSLSKDVSRLETVFVPPEKHEK-------EIIALKSNIVELKKQLSELKKKC 790 800 810 820 830 420 430 440 450 460 470 KIAA12 LSLKDDLTKLKSFTVMLVDERKNMMEKIKQEERKVDGLNKNFKVEQGKVMDVTEKLIEES .. . : : .. : .:.. .: .:. :: .. . ...:: .:. . . KIAA15 GEDQEKIHALTSENTNLKKMMSNQYVPVKTHEEVKMTLNDTLAKTNRELLDVKKKFEDIN 840 850 860 870 880 890 480 490 500 510 520 530 KIAA12 KKLLKLKSEMEEKVYNLTRERDELIGKLKSEEEKSSELSCSVDLLKKRLDGIEEVEREIT ....:.:.. : :: .... .. : :. ...: . ..: :. :. KIAA15 QEFVKIKDKNEILKRNLENTQNQIKAEYISLAEHEAKMSSLSQSMRKVQDSNAEIL---- 900 910 920 930 940 950 540 550 560 570 580 590 KIAA12 RGRSRKGSELTCPEDNKIKELTLEIERLKKRLQQLEVVEGDLMKTEDEYDQLEQKFR-TE . :::.: .: : ::. ::.:. .. . ... :.::. :: KIAA15 -ANYRKGQE-------EIVTLHAEIKAQKKELDTIQECIKVKYAPIVSFEECERKFKATE 960 970 980 990 1000 600 610 620 630 640 650 KIAA12 QDKANFLSQQL-------EEIKHQIAKNKAIEKGEVVSQEAELRHRFRLEEAKSRDLKAE .. . ::.: ::.:.. .: ..: :. . . .:: . : : ::.... KIAA15 KELKDQLSEQTQKYSVSEEEVKKNKQENDKLKK-EIFTLQKDLRDKTVLIE-KSHEME-- 1010 1020 1030 1040 1050 660 670 680 690 700 710 KIAA12 VQALKEKIHELMNKEDQLSQLQVDYSVLQQRFMEEENKNKNMGQEVLNLTKELELSKRYS .::..: :: .. .::: .. . ......::. :. . : :: .. .. . KIAA15 -RALSRKTDELNKQLKDLSQKYTEVKNVKEKLVEENAKQTSEILAVQNLLQKQHVPLEQV 1060 1070 1080 1090 1100 1110 720 730 740 750 760 770 KIAA12 RALRPSVNGRRMVDVPVTSTGVQTDAVSGEAAEEETPAVFIRKSFQEENHIMSNLRQVGL .::. :.:: KIAA15 EALKKSLNGTIENLKEELKSMQRCYEKEQQTVTKLHQLLENQKNSSVPLAEHLQIKEAFE 1120 1130 1140 1150 1160 1170 >>KIAA1509 ( 1365 res) fh14721 (1365 aa) initn: 159 init1: 60 opt: 321 Z-score: 157.2 bits: 41.2 E(): 0.0012 Smith-Waterman score: 400; 21.603% identity (54.181% similar) in 1148 aa overlap (28-1118:112-1160) 10 20 30 40 50 KIAA12 AQYAIYIVSRLILLHFLLQAREDVIHMLKTEKTKPEVLEAHYGSAEPEKVLRVLHRD :.. . : ..::.. : : :. ..:.:: KIAA15 DLLKALGKKSERLELSYQSVSAENLRLQQSLESSSHKTQTLESELGELEAER--QALRRD 90 100 110 120 130 60 70 80 90 100 110 KIAA12 --AI-LAQEKSIGED----VYEKPISELDRLEEKQKETYRRMLEQLLLAEKCHRRTVYEL :. ::. . : . . :. ...:.. .. .. .:. .:. : . : KIAA15 LEALRLANAQLEGAEKDRKALEQEVAQLEKDKKLLEKEAKRLWQQVELKDAV-------L 140 150 160 170 180 190 120 130 140 150 160 KIAA12 ENEKHKHTDYMNKSDDFTNLLEQERERLKKLLEQEKAYQ--ARKEKENAKRLNKLRDELV .. : . ..: . . : . :. :: : :: . ... .:. :. ::..:: KIAA15 DDSTAKLSAVEKESRALDKELARCRDAAGKLKELEKDNRDLTKQVTVHARTLTTLREDLV 200 210 220 230 240 250 170 180 190 200 210 KIAA12 --KLKSFALML-VDERQMHIEQLGLQSQKV-------QDLTQKLRE--EEEKLKAITSKS :::: : .:. ....:..::. . . .: :. : .: ::. . . 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KIAA15 --SQILTLQKQSAFLQEHNTTLQTQTAKLQVENSTL--------SSQSAALTAQYTLLQN 430 440 450 460 470 390 400 410 420 430 440 KIAA12 KNLTKDLLNELEVVKSRVKELECSESRLEKAELSLKDDLTKLKSFTVMLVDERKNM-MEK .. .:. :: :. .. .: : .: .: .: . . ::.. .: KIAA15 HHTAKETENE---------SLQRQQEQLTAAYEALLQDHEHLGT-----LHERQSAEYEA 480 490 500 510 520 450 460 470 480 490 500 KIAA12 IKQEERKVDGLNKNFKVEQGKVMDVTEKLIEESKKLLKLKSEMEEKVYNLTRERDELIGK . ... . :..:...:. ..: :. .:: :.:.::. :: ::. : KIAA15 LIRQHSCLKTLHRNLELEH-------KELGERHGDMLKRKAELEEREKVLTTEREAL--- 530 540 550 560 570 510 520 530 540 550 560 KIAA12 LKSEEEKSSELSCSVDL-LKKRLDGIEEVEREITRGRSRKGSELTCPEDNKIKELTLEIE ..:.... :. . . :. .:: .. ..... .:. .. : ..... ::.. KIAA15 --QQEQRTNALAMGENQRLRGELDRVNFLHHQL-KGEYEELHAHTKELKTSLNNAQLELN 580 590 600 610 620 630 570 580 590 600 610 620 KIAA12 RLKKRLQQLEVVEGDLMKTEDEYDQLEQKFRTEQDKANFLSQQLEEIKHQIAKNKAIEKG : . :...:. . .. .: :. .. . . :. .::: .:.. . . KIAA15 RWQARFDELK-------EQHQTMDISLTKLDNHCELLSRLKGNLEEENHHL-----LSQI 640 650 660 670 630 640 650 660 670 680 KIAA12 EVVSQEAELRHRFRLEEAKSRDLKAEVQALKEKIHELMNKEDQLSQLQVDYSVLQQRFME ...::. .. . .:. .. . : . .:.. : ....: . .: : .:.. KIAA15 QLLSQQNQMLLEQNMENKEQ--YHEEQKQYIDKLNALRRHKEKLEEKIMD----QYKFYD 680 690 700 710 720 730 690 700 710 720 730 740 KIAA12 EENKNKNMGQEVLNLTKELELSKRYSRA-LRPSVNGRR-MVDVPVTSTGVQTDAVSGEAA :.:: . :.: .. .:. :: :. .:.. ... .. . .. . ..: KIAA15 PPPKKKNHWIGAKALVKLIKPKKEGSRERLKSTVDSPPWQLESSDPASPAASQPLRSQAE 740 750 760 770 780 790 750 760 770 780 790 KIAA12 EEETPAVFIRKSFQEENHIMSNLRQVGLKKPVERSS----VLDRYPPAANELTMRKSWIP . .:::. . ... : : . : :: .:.: ::: :...:.:: :: KIAA15 NPDTPALGSNCAEERDAHNGSVGKGPGDLKP-KRGSPHRGSLDR-TDASTDLAMR-SWPS 800 810 820 830 840 850 800 810 820 830 840 850 KIAA12 WMRKRENGPSITQEKGPRTNSSP--GHPGEVVLSPKQGQPLHIRVTPDHENSTATLEITS . .: . : : .: .::.: :::.. .: . : . .::. KIAA15 ELGSRTCSTSATTT-AP-SNSTPIARHPGRT-----KGY------NSDDNLCEPSLEFEV 860 870 880 890 860 870 880 890 900 910 KIAA12 PTSEEFFSSTTVIP----TLGNQKPRITIIPSPNVMPQKQKSGDTTLGPERAMSPVTITT :. ... : . . : .:..: : .. .... .. : : : .. : KIAA15 PNHRQYVSRPSSLESSRNTSSNSSPLNLKGSSEQLHGRSESFSSEDLIPSRDLA-----T 900 910 920 930 940 950 920 930 940 950 960 KIAA12 FSRE-KTPESGRGAFA--DRP---TSPI-QIMTVSTSAAPAEIAVSPESQEMPMGRTILK . :: .:: ::.:.. . : ..:. : . . ..:: ..: : : . :. KIAA15 LPREASTP--GRNALGRHEYPLPRNGPLPQEGAQKRGTAPPYVGVRPCSASPSSEMVTLE 960 970 980 990 1000 1010 970 980 990 1000 1010 1020 KIAA12 VTPEKQTVPTPVRKYNSNANIITTEDNKIHIH---LGSQFKRSPGTSGEGVS-PVITVRP :... .:.. : . . .. . .:.: .: .. ::.. :. : : KIAA15 EFLEESNRSSPTHDTPSCRDDLLSDYFRKASDPPAIGGQ--PGPPAKKEGAKMPTNFVAP 1020 1030 1040 1050 1060 1030 1040 1050 1060 1070 1080 KIAA12 VNVTAEKEVSTGTVLRSPRNHLSSRPGASKVTSTITITPVTTSSARGTQSVS-GQDGSSQ . : .: : :. : .... ... . ...: .:. ::.: :. .. KIAA15 T-VKMAAPTSEGRPLK-PGQYVKPNFRLTEAEAPPSVAP---RQAQPPQSLSLGRPRQAP 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1090 1100 1110 1120 1130 1140 KIAA12 RPTPTRIPMSKGMKAGKPVVAAPGAGNLTKFEPRAETQSMKIELKKSAASSTTSLGGGKG : .. : :.. . .. : .: : :.: : KIAA15 VPPASHAPASRSASLSRAFSLA-SADLLRASGPEACKQESPQKLGAPEALGGRETGSHTL 1130 1140 1150 1160 1170 1180 KIAA15 QSPAPPSSHSLARERTPLVGKAGSSCQGPGPRSRPLDTRRFSLAPPKEERLAPLHQSATA 1190 1200 1210 1220 1230 1240 >>KIAA0866 ( 1984 res) hk00546s1 (1984 aa) initn: 134 init1: 92 opt: 324 Z-score: 156.6 bits: 41.7 E(): 0.0013 Smith-Waterman score: 471; 25.094% identity (57.928% similar) in 801 aa overlap (72-758:881-1672) 50 60 70 80 90 KIAA12 YGSAEPEKVLRVLHRDAILAQEKSIGEDVYEKPISELDRLEEKQKE-TYRRML--EQL-- .: .:: .::.:... : .. : ::: KIAA08 TKVKPLLQVTRQEEEMQAKEDELQKTKERQQKAENELKELEQKHSQLTEEKNLLQEQLQA 860 870 880 890 900 910 100 110 120 130 140 KIAA12 ---LLAEKCHRRTVY-----ELENEKHKHTDYMNKSDDFTNLLEQERERL-KKLLEQEKA : :: . :. :::. :. ... .: . :. ::... ...:. :. KIAA08 ETELYAEAEEMRVRLAAKKQELEEILHEMEARLEEEEDRGQQLQAERKKMAQQMLDLEEQ 920 930 940 950 960 970 150 160 170 180 190 200 KIAA12 YQARKEKENAKRLNKLRDE--LVKLKSFALMLVDERQMHIEQLGLQSQKVQDLTQKLREE . .. .. .:.:. : . ::.. :.. :. . .. : ....::: .: :: KIAA08 LEEEEAARQKLQLEKVTAEAKIKKLEDEILVMDDQNNKLSKERKLLEERISDLTTNLAEE 980 990 1000 1010 1020 1030 210 220 230 240 KIAA12 EEKLKAITS-----------------KSKEDRQKLLKLEVDFEHKASRFSQEHEEMNAKL ::: : .:. : ...::.: ::. .: :: : .. ...:.. KIAA08 EEKAKNLTKLKNKHESMISELEVRLKKEEKSRQELEKLKRKLEGDASDFHEQIADLQAQI 1040 1050 1060 1070 1080 1090 250 260 270 280 290 KIAA12 ANQESHNRQLRLKLVGLTQRIE-ELEETNKNLQKAEE------ELQELRD--KIA--KGE :. . . . . .: . :.. :. . :. :.: .: .::: : . : :.: KIAA08 AELKMQLAKKEEELQAALARLDDEIAQKNNALKKIRELEGHISDLQEDLDSERAARNKAE 1100 1110 1120 1130 1140 1150 300 310 320 330 340 350 KIAA12 CGNSSLMAEVENLRKRV---LEMEGKDEEI-TKTESQCRELRKKLQEEEH-HSKELRLEV . .: :.: :. .. :. . ..:. .: :.. :.: :.:: . : ... KIAA08 KQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTATQQELRAKREQEVTVLKKALDEETRSHEAQVQEMR 1160 1170 1180 1190 1200 1210 360 370 380 390 400 KIAA12 EKLQKRMSELEKLEEAFSKSKSECTQLHLNLEKEKNLTKDLLNELEVV------------ .: . . :: . : :...:.. . . .:::: . :: .::.:. KIAA08 QKHAQAVEELTEQLEQFKRAKANLDKNKQTLEKE---NADLAGELRVLGQAKQEVEHKKK 1220 1230 1240 1250 1260 410 420 430 440 450 KIAA12 --KSRVKELECSESRLEKAELSLKDDLTKLK----SFTVMLVD-ERK--NMMEKIKQEER ...:.::. . : :.:. :.: . ::. : : :: . : : .. . . . KIAA08 KLEAQVQELQSKCSDGERARAELNDKVHKLQNEVESVTGMLNEAEGKAIKLAKDVASLSS 1270 1280 1290 1300 1310 1320 460 470 480 490 500 KIAA12 KVDGLNKNFKVEQGKVMDVTEKL--IEESKKLLK--LKSEMEEKVYNLTRERDELIGKLK ... .. .. : . ..:. :: .:: .. :. : ::: : :: :. . : .:. KIAA08 QLQDTQELLQEETRQKLNVSTKLRQLEEERNSLQDQLDEEMEAK-QNLERHISTLNIQLS 1330 1340 1350 1360 1370 1380 510 520 530 540 550 KIAA12 SEEEKSSELSCSVDLL---KKRLDG-IEEVER------------EITRGR-SRKGSELTC . ..: .... .:. : :::.. ::.. . : :..: ... ..:. KIAA08 DSKKKLQDFASTVEALEEGKKRFQKEIENLTQQYEEKAAAYDKLEKTKNRLQQELDDLVV 1390 1400 1410 1420 1430 1440 560 570 580 590 600 KIAA12 PEDNKIKELTLEIERLKKRLQQLEVVEGDLM-KTEDEYDQLEQKFRTEQDKANFLSQQLE ::. ..:. ..:. .....:: . : .. : :: :. : . : .. :: :.. :: KIAA08 DLDNQ-RQLVSNLEKKQRKFDQLLAEEKNISSKYADERDRAEAEAREKETKALSLARALE 1450 1460 1470 1480 1490 1500 610 620 630 640 650 660 KIAA12 EI---KHQIAKNKAIEKGEV---VSQEAEL-RHRFRLEEAKSRDLKAEVQALKEKIHELM : :... ... . :.:. ::.. .. .. .::..: : :..... .: ...:: KIAA08 EALEAKEELERTNKMLKAEMEDLVSSKDDVGKNVHELEKSK-RALETQMEEMKTQLEELE 1510 1520 1530 1540 1550 1560 670 680 690 700 710 KIAA12 NK----EDQLSQLQVDYSVLQQRFMEE--------ENKNKNMGQEVLNLTKELELSKRYS .. :: .:.:....:. .: .. :.: ... ... . ::: ..: . KIAA08 DELQATEDAKLRLEVNMQALKGQFERDLQARDEQNEEKRRQLQRQLHEYETELE-DERKQ 1570 1580 1590 1600 1610 1620 720 730 740 750 760 KIAA12 RALRPSVNGRRMVDVPVTSTGVQTD-AVSG--EAAEEETPAVFIRKSFQEENHIMSNLRQ ::: .. ... .. . . .:.: :..: :: .. :.::.: KIAA08 RAL--AAAAKKKLEGDLKDLELQADSAIKGREEAIKQLRKLQAQMKDFQRELEDARASRD 1630 1640 1650 1660 1670 1680 770 780 790 800 810 820 KIAA12 VGLKKPVERSSVLDRYPPAANELTMRKSWIPWMRKRENGPSITQEKGPRTNSSPGHPGEV KIAA08 EIFATAKENEKKAKSLEADLMQLQEDLAAAERARKQADLEKEELAEELASSLSGRNALQD 1690 1700 1710 1720 1730 1740 >>KIAA1512 ( 2010 res) fg04660y1 (2010 aa) initn: 228 init1: 86 opt: 316 Z-score: 153.1 bits: 41.0 E(): 0.0021 Smith-Waterman score: 386; 23.301% identity (54.490% similar) in 824 aa overlap (18-777:1086-1865) 10 20 30 40 KIAA12 AQYAIYIVSRLILLHFLLQAREDVIHMLKTEKTKPEV-LEAHYGSAE :::.:: . : : . : .: : : KIAA15 EEMAALDESVARLTKEKKALQEAHQQALGDLQAEEDRVSALTKAKLRLEQQVEDLECSLE 1060 1070 1080 1090 1100 1110 50 60 70 80 90 KIAA12 PEKVLRV--------LHRDAILAQEKSIGEDVYEKPISELDRLEEKQKE----TYRRMLE :: ::. :. : :.:: :... . .: : ..:..:..: . : : KIAA15 QEKKLRMDTERAKRKLEGDLKLTQE-SVADAAQDKQQLE-EKLKKKDSELSQLSLRVEDE 1120 1130 1140 1150 1160 1170 100 110 120 130 140 KIAA12 QLLLAEKCHRRTVYELENEKHKHTDYMNKSDDFTNLLEQER-------ERLKKLLEQEKA ::: :. .. . ::. . .. . .. .:..: :.:.. ::. . KIAA15 QLLGAQ--MQKKIKELQARAEELEEELEAERAARARVEKQRAEAARELEELSERLEEAGG 1180 1190 1200 1210 1220 1230 150 160 170 180 190 200 KIAA12 YQARKEKENAKR---LNKLRDEL--VKLKSFALMLVDERQMH--IEQLGLQSQKVQDLTQ .: ... :: :..:: :: . :. : . . .:.. .:: : ...: . : KIAA15 ASAGQREGCRKREAELGRLRRELEEAALRHEATVAALRRKQAEGAAELGEQVDSLQRVRQ 1240 1250 1260 1270 1280 1290 210 220 230 240 250 KIAA12 KLREEEEKLKAITSKSKEDRQKLL-------KLEVDFEHKASRFSQEHEEMNAKLANQES ::..:. .:. .. . . : :: .: . :. . . ::.. .::. . KIAA15 KLEKEKSELRMEVDDLAANVETLTRAKASAEKLCRTYEDQLSEAKIKVEELQRQLADAST 1300 1310 1320 1330 1340 1350 260 270 280 290 300 KIAA12 HNRQLRLKLVGLTQRIEELEETNKNLQK----AEEELQELRDKIAKGECGNSSLMAEVEN . .:. . :.. .:: : ..:.. : . :.::: .. . ..:.: :. KIAA15 QRGRLQTESGELSRLLEEKECLISQLSRGKALAAQSLEELRRQLEEESKAKSALAHAVQA 1360 1370 1380 1390 1400 1410 310 320 330 340 350 360 KIAA12 LRKRVLEMEGKDEEITKTESQCRELRKKLQEE--------EHHSKELRLEVEKLQKRMS- ::. .. . :: ...... ..: .: . : : . . :.:. .:... KIAA15 LRHDCDLLREQHEEEAEAQAELQRLLSKANAEVAQWRSKYEADAIQRTEELEEAKKKLAL 1420 1430 1440 1450 1460 1470 370 380 390 400 410 420 KIAA12 ELEKLEEAFSKSKSECTQLHLNLEKEKNLTKDLLNELEVVKSRVKELECSESRLEKAELS .:.. ::. ....:..:. . .. ..:. ::: . : . :. .. .::.: KIAA15 RLQEAEEGVEAANAKCSSLEKAKLRLQTESEDVTLELERATSAAAALDKKQRHLERA--- 1480 1490 1500 1510 1520 430 440 450 460 470 KIAA12 LKDDLTKLKSFTVMLVDERKNMMEKIKQE----ERKVDGLNKN-FKVEQG--KVMDVTEK ..::. . :....: .:. ::. . :....: ..... : KIAA15 ---------------LEERRRQEEEMQRELEAAQRESRGLGTELFRLRHGHEEALEALET 1530 1540 1550 1560 1570 480 490 500 510 520 530 KIAA12 LIEESKKLLKLKSEMEEKVYNLTRERDELIGKLKSEEEKSSELSCSVDLLKKRLDGIEEV : .:.:.: . :.. ..: . .:: :. : ..::.. ... . .: :. KIAA15 LKRENKNLQEEISDLTDQVSLSGKSIQELEKTKKALEGEKSEIQAALE----EAEGALEL 1580 1590 1600 1610 1620 540 550 560 570 580 590 KIAA12 EREITRGRSRKGSELTCPEDNKIKELTLEIERLKKRLQQ-LEVVEGDL-MKTEDEYDQLE :. : . . :.. : :. : : :.. :. .: ....: .:. . . :. KIAA15 EETKTLRIQLELSQVKAEVDRKLAEKDEECANLRRNHQRAVESLQASLDAETRARNEALR 1630 1640 1650 1660 1670 1680 600 610 620 630 640 650 KIAA12 QKFRTEQDKANFLSQQLEEIKHQIAKNKAIEKGEVVSQEAELRHRFRLEEAKSRDLKAEV : . : : : : :: . .: .. .: . ..:.:. :: .:: : KIAA15 LKKKMEGD-LNDLELQLGHATRQATEAQAATR----LMQAQLK-----EEQAGRD---EE 1690 1700 1710 1720 1730 660 670 680 690 700 710 KIAA12 QALKEKIHELMNK-EDQLSQLQVDYSVLQQRFMEEENKNKNMGQEVLNLTKELELSKRYS : : ..:: . : . : : .. :. . . : . . ::.:. :..:.: . . KIAA15 QRLAAELHEQAQALERRASLLAAELEELRAALEQGERSRRLAEQELLEATERLNLLHSQN 1740 1750 1760 1770 1780 1790 720 730 740 750 760 KIAA12 RALRPSVNGRRMV--DVPVTSTGVQTDAVSGEAAEEE-----TPAVFIRKSFQEENHIMS .: .: .. . :. : :. : . :::. : :... . ...:. . KIAA15 TGL---LNQKKKLEADLAQLSGEVEEAAQERREAEEKAKKAITDAAMMAEELKKEQDTSA 1800 1810 1820 1830 1840 1850 770 780 790 800 810 820 KIAA12 NLRQVGLKKPVERSSVLDRYPPAANELTMRKSWIPWMRKRENGPSITQEKGPRTNSSPGH .:.. .:: .:.. KIAA15 HLER--MKKTLEQTVRELQARLEEAEQAALRGGKKQVQKLEAKVRELEAELDAEQKKHAE 1860 1870 1880 1890 1900 1910 >>KIAA1749 ( 1047 res) pj02119y1 (1047 aa) initn: 213 init1: 89 opt: 306 Z-score: 152.2 bits: 39.9 E(): 0.0023 Smith-Waterman score: 423; 24.310% identity (57.687% similar) in 761 aa overlap (48-740:328-1046) 20 30 40 50 60 70 KIAA12 LQAREDVIHMLKTEKTKPEVLEAHYGSAEPEKVLRVLHRDAILAQEKSIGEDVYEKPISE ::. . : : :: :.. . :: KIAA17 ETAKQILYNYLKEGSTDNDDATKRKVNLVFEKIQTLKSRAAGSAQ----GNNQACNSTSE 300 310 320 330 340 350 80 90 100 110 120 KIAA12 L-DRLEEKQKETYR--RMLEQLLLAEKCHR-------RTVYELENEKHKHTDYMNKSDDF . : ::.:.: : . .. .:: : : .. : .::. . .:.. ..... . KIAA17 VKDLLEQKSKLTIEVAELQRQLQLEVKNQQNIKEERERMRANLEELRSQHNEKVEENSTL 360 370 380 390 400 410 130 140 150 160 170 180 KIAA12 TNLLEQERERLKKLLEQEKAYQARKEKENAK-RLNKLRDELVKLKSF---ALMLVD-ERQ . ::. . .:.: ::. .:.. :.:. . .. :.:.: .... : : :. 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KIAA17 ENELEAAQGNLSQTTQEQKQLSEKLKEE-SEQKEQLRRLKNEMENERWHLGKTIEKLQKE 650 660 670 680 690 700 400 410 420 430 440 450 KIAA12 LLNELEVVKSRVKELECS-ESRLEKAELSLKDDLTKLKSFTVMLVDERKNMMEKIKQEER . . .:. .. . ::. . . :: . : . .:: :. : . : :...: : KIAA17 MADIVEASRTSTLELQNQLDEYKEKNRRELAEMQRQLKEKTLEAEKSRLTAM-KMQDEMR 710 720 730 740 750 760 460 470 480 490 500 KIAA12 KVDGLNKNFKVEQGKVM---DVTEKLIEESKKLLKLKSEMEEKVYNLTRERDELIGKLKS .. .... : ... .. :. ... . :. ::.... :... .. ...:. KIAA17 LMEEELRDYQRAQDEALTKRQLLEQTLKDLEYELEAKSHLKDDRSRLVKQMEDKVSQLEM 770 780 790 800 810 820 510 520 530 540 550 560 KIAA12 EEEKSSELSCSVDLLKKRL----DGIEEVEREITRGRSRKGSELTCPEDNKIKELTLEIE : :. . : :::..:. . .:.:. :. . :. . ..: : .::. : . . 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KIAA17 TFSKDSTVASQI 1040 1140 residues in 1 query sequences 1986365 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:15:45 2008 done: Thu Dec 18 15:15:47 2008 Total Scan time: 0.730 Total Display time: 0.360 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]