# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk09836s1.fasta.nr -Q ../query/KIAA1274.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1274, 861 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7827205 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1669+/-0.000186; mu= 13.9764+/- 0.010 mean_var=72.5507+/-14.363, 0's: 31 Z-trim: 35 B-trim: 756 in 1/67 Lambda= 0.150575 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|194679333|ref|XP_603024.4| PREDICTED: similar t ( 856) 4963 1087.8 0 gi|197313711|ref|NP_001029300.2| paladin [Rattus n ( 857) 4719 1034.8 0 gi|187951755|gb|AAI37696.1| X99384 protein [Mus mu ( 857) 4663 1022.7 0 gi|26353606|dbj|BAC40433.1| unnamed protein produc ( 859) 4654 1020.7 0 gi|219518419|gb|AAI44848.1| CDNA sequence X99384 [ ( 859) 4643 1018.3 0 gi|219518417|gb|AAI44847.1| X99384 protein [Mus mu ( 860) 4641 1017.9 0 gi|81886938|sp|P70261.1|PALD_MOUSE RecName: Full=P ( 859) 4625 1014.4 0 gi|149038738|gb|EDL93027.1| rCG21974, isoform CRA_ ( 786) 4190 919.9 0 gi|146325027|sp|Q8JHZ8|PALD_CHICK Paladin ( 868) 2557 565.2 4.3e-158 gi|53131194|emb|CAG31799.1| hypothetical protein [ ( 843) 2455 543.0 2e-151 gi|149440485|ref|XP_001505981.1| PREDICTED: simila ( 652) 2442 540.1 1.1e-150 gi|149038737|gb|EDL93026.1| rCG21974, isoform CRA_ ( 449) 2437 538.9 1.8e-150 gi|148700199|gb|EDL32146.1| cDNA sequence X99384, ( 451) 2384 527.4 5.3e-147 gi|82236012|sp|Q6DIR8.1|PALD_XENTR RecName: Full=P ( 872) 2370 524.6 7.3e-146 gi|47216063|emb|CAG04802.1| unnamed protein produc ( 865) 2078 461.1 9e-127 gi|45219820|gb|AAH66756.1| Paladin [Danio rerio] ( 860) 2041 453.1 2.3e-124 gi|82177028|sp|Q803E0|PALD_BRARE Paladin gi|27 ( 860) 2029 450.5 1.4e-123 gi|220678151|emb|CAX14786.1| novel protein (zgc:16 ( 883) 1933 429.6 2.8e-117 gi|141795817|gb|AAI39565.1| Zgc:162303 protein [Da ( 863) 1930 429.0 4.3e-117 gi|51593737|gb|AAH80827.1| X99384 protein [Mus mus ( 257) 1392 311.7 2.5e-82 gi|115675639|ref|XP_791972.2| PREDICTED: similar t ( 819) 961 218.5 9.5e-54 gi|156218844|gb|EDO39735.1| predicted protein [Nem ( 330) 812 185.8 2.6e-44 gi|156218845|gb|EDO39736.1| predicted protein [Nem ( 255) 688 158.8 2.7e-36 gi|72012797|ref|XP_781355.1| PREDICTED: similar to ( 343) 670 155.0 5.2e-35 gi|190581624|gb|EDV21700.1| hypothetical protein T ( 799) 629 146.3 4.8e-32 gi|71682384|gb|AAI00094.1| Pald protein [Rattus no ( 104) 537 125.7 1e-26 gi|115615080|ref|XP_780714.2| PREDICTED: similar t ( 174) 514 120.9 4.9e-25 gi|115939641|ref|XP_001195273.1| PREDICTED: simila ( 179) 514 120.9 5e-25 gi|47200202|emb|CAF88821.1| unnamed protein produc ( 262) 466 110.6 9.2e-22 gi|47196389|emb|CAF88365.1| unnamed protein produc ( 263) 466 110.6 9.2e-22 gi|70880014|gb|EAN93141.1| hypothetical protein, c (1504) 280 70.7 5.2e-09 gi|62359217|gb|AAX79660.1| hypothetical protein, c (1518) 271 68.8 2e-08 gi|134062276|emb|CAM36664.1| hypothetical protein, (1712) 255 65.3 2.5e-07 gi|134069945|emb|CAM68275.1| hypothetical protein, (1680) 249 64.0 6.1e-07 gi|159105827|gb|EDP44712.1| hypothetical protein M (1357) 243 62.6 1.3e-06 gi|68126557|emb|CAJ04967.1| hypothetical protein, (1565) 241 62.3 1.9e-06 gi|70861734|gb|EAN80875.1| hypothetical protein, c ( 194) 229 59.0 2.3e-06 gi|54311237|gb|AAH84811.1| LOC495348 protein [Xeno ( 151) 203 53.3 9.5e-05 gi|56788847|gb|AAH88542.1| Dual specificity phosph ( 132) 183 48.9 0.0017 gi|115641733|ref|XP_001204152.1| PREDICTED: simila ( 60) 175 46.9 0.0031 >>gi|194679333|ref|XP_603024.4| PREDICTED: similar to Pa (856 aa) initn: 5246 init1: 4963 opt: 4963 Z-score: 5819.3 bits: 1087.8 E(): 0 Smith-Waterman score: 4963; 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