# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk06471.fasta.nr -Q ../query/KIAA1270.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1270, 986 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7825246 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4233+/-0.000184; mu= 13.4176+/- 0.010 mean_var=80.4936+/-15.767, 0's: 31 Z-trim: 45 B-trim: 0 in 0/66 Lambda= 0.142953 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|124297995|gb|AAI31729.1| Alanyl-tRNA synthetase ( 985) 6562 1363.6 0 gi|74742244|sp|Q5JTZ9.1|SYAM_HUMAN RecName: Full=P ( 985) 6561 1363.4 0 gi|114607605|ref|XP_518510.2| PREDICTED: alanyl-tR ( 985) 6549 1360.9 0 gi|109071333|ref|XP_001099647.1| PREDICTED: simila ( 985) 6280 1305.4 0 gi|73973034|ref|XP_532155.2| PREDICTED: similar to ( 985) 5801 1206.6 0 gi|119915349|ref|XP_001253240.1| PREDICTED: simila ( 983) 5788 1203.9 0 gi|194039401|ref|XP_001929628.1| PREDICTED: alanyl ( 985) 5770 1200.2 0 gi|149069292|gb|EDM18733.1| alanyl-tRNA synthetase ( 985) 5552 1155.3 0 gi|115502845|sp|Q14CH7.1|SYAM_MOUSE RecName: Full= ( 980) 5514 1147.4 0 gi|51260239|gb|AAH79844.1| Aars2 protein [Mus musc ( 975) 5500 1144.5 0 gi|148691494|gb|EDL23441.1| alanyl-tRNA synthetase ( 984) 5496 1143.7 0 gi|21619898|gb|AAH33169.1| AARS2 protein [Homo sap ( 785) 5180 1078.5 0 gi|126310118|ref|XP_001367753.1| PREDICTED: simila (1109) 4814 1003.1 0 gi|187469665|gb|AAI66719.1| Aars2 protein [Rattus ( 746) 4358 908.9 0 gi|49119610|gb|AAH73734.1| LOC443692 protein [Xeno (1005) 3945 823.9 0 gi|194223559|ref|XP_001497842.2| PREDICTED: alanyl ( 962) 3673 767.7 0 gi|15488935|gb|AAH13593.1| AARS2 protein [Homo sap ( 551) 3593 751.1 3.4e-214 gi|157886445|emb|CAP09517.1| novel protein similar ( 996) 3583 749.2 2.3e-213 gi|189535307|ref|XP_001332388.2| PREDICTED: si:dke (1004) 3583 749.2 2.3e-213 gi|126632676|emb|CAM56636.1| novel protein similar ( 917) 3369 705.0 4.1e-200 gi|53136426|emb|CAG32542.1| hypothetical protein [ ( 816) 2946 617.8 6.8e-174 gi|148679537|gb|EDL11484.1| alanyl-tRNA synthetase (1055) 2796 586.9 1.7e-164 gi|74213943|dbj|BAE29394.1| unnamed protein produc ( 968) 2790 585.6 3.8e-164 gi|26336489|dbj|BAC31927.1| unnamed protein produc ( 968) 2784 584.4 8.9e-164 gi|47117019|sp|Q8BGQ7.1|SYAC_MOUSE RecName: Full=A ( 968) 2784 584.4 8.9e-164 gi|37903407|gb|AAP57355.1| Alanyl-tRNA synthase [M ( 968) 2781 583.8 1.4e-163 gi|149640708|ref|XP_001506178.1| PREDICTED: simila ( 968) 2779 583.4 1.8e-163 gi|115502460|sp|P49588.2|SYAC_HUMAN RecName: Full= ( 968) 2777 583.0 2.4e-163 gi|74196486|dbj|BAE34378.1| unnamed protein produc ( 968) 2776 582.8 2.8e-163 gi|62897207|dbj|BAD96544.1| alanyl-tRNA synthetase ( 968) 2774 582.3 3.7e-163 gi|149699352|ref|XP_001501062.1| PREDICTED: simila ( 968) 2774 582.3 3.7e-163 gi|149038198|gb|EDL92558.1| alanyl-tRNA synthetase ( 968) 2769 581.3 7.6e-163 gi|1015321|dbj|BAA06808.1| alanyl-tRNA synthetase ( 968) 2768 581.1 8.8e-163 gi|114663431|ref|XP_001169474.1| PREDICTED: alanyl ( 968) 2768 581.1 8.8e-163 gi|73957022|ref|XP_536788.2| PREDICTED: similar to ( 968) 2767 580.9 1e-162 gi|91084029|ref|XP_966465.1| PREDICTED: similar to ( 965) 2766 580.7 1.2e-162 gi|149640710|ref|XP_001506284.1| PREDICTED: simila ( 963) 2760 579.5 2.7e-162 gi|212510999|gb|EEB14065.1| Alanyl-tRNA synthetase ( 983) 2760 579.5 2.8e-162 gi|151553989|gb|AAI48084.1| AARS protein [Bos taur ( 968) 2759 579.2 3.2e-162 gi|81871231|sp|Q8CFX8.1|SYAC_MESAU RecName: Full=A ( 968) 2757 578.8 4.2e-162 gi|118763839|gb|AAI28795.1| Aars protein [Danio re ( 966) 2755 578.4 5.6e-162 gi|75042108|sp|Q5RC02.1|SYAC_PONAB RecName: Full=A ( 968) 2754 578.2 6.5e-162 gi|169154546|emb|CAQ13590.1| novel protein similar ( 988) 2754 578.2 6.6e-162 gi|169154547|emb|CAQ13591.1| novel protein similar ( 963) 2753 578.0 7.5e-162 gi|94734005|emb|CAK04586.1| alanyl-tRNA synthetase ( 991) 2747 576.8 1.8e-161 gi|94734006|emb|CAK04587.1| alanyl-tRNA synthetase ( 966) 2746 576.6 2e-161 gi|126305114|ref|XP_001362507.1| PREDICTED: simila ( 968) 2733 573.9 1.3e-160 gi|209154450|gb|ACI33457.1| Alanyl-tRNA synthetase ( 967) 2730 573.3 2e-160 gi|156215737|gb|EDO36689.1| predicted protein [Nem ( 961) 2719 571.0 9.6e-160 gi|135089|sp|P21894.1|SYAC_BOMMO RecName: Full=Ala ( 967) 2715 570.2 1.7e-159 >>gi|124297995|gb|AAI31729.1| Alanyl-tRNA synthetase 2, (985 aa) initn: 6562 init1: 6562 opt: 6562 Z-score: 7307.4 bits: 1363.6 E(): 0 Smith-Waterman score: 6562; 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