# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hj00608.fasta.huge -Q ../query/KIAA1263.ptfa ./tmplib.24314 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1263, 850 aa vs ./tmplib.24314 library 1986655 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.2004+/-0.0052; mu= 19.5038+/- 0.353 mean_var=99.4584+/-23.132, 0's: 0 Z-trim: 21 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.128604 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1061 ( 693 res) hj00491 ( 693) 2925 554.0 2.1e-158 KIAA0343 ( 1187 res) hg01457 (1187) 241 56.4 2.2e-08 KIAA1514 ( 1598 res) fh00815(revised) (1598) 233 55.1 7.3e-08 KIAA1132 ( 2092 res) hh01132s1 (2092) 227 54.1 1.8e-07 KIAA1568 ( 1380 res) fh22308 (1380) 222 52.9 2.8e-07 KIAA1355 ( 1189 res) fj01564 (1189) 220 52.5 3.3e-07 KIAA1496 ( 920 res) fj09513 ( 920) 207 49.9 1.5e-06 KIAA0806 ( 1073 res) hk04165(revised) (1073) 207 50.0 1.7e-06 KIAA1628 ( 980 res) fh14247(revised) ( 980) 198 48.3 5.1e-06 KIAA0230 ( 1496 res) ha02538 (1496) 193 47.6 1.2e-05 KIAA0756 ( 1222 res) ff01911 (1222) 187 46.4 2.3e-05 KIAA1497 ( 730 res) hg01608 ( 730) 175 43.8 8.3e-05 KIAA1233 ( 1023 res) fh08611 (1023) 164 42.0 0.00041 KIAA1639 ( 2584 res) af14886 (2584) 158 41.5 0.0015 KIAA1297 ( 2242 res) fg03883 (2242) 156 41.0 0.0018 KIAA0992 ( 772 res) hk07554 ( 772) 148 38.8 0.0028 KIAA1246 ( 832 res) hh00149a ( 832) 145 38.3 0.0042 KIAA0626 ( 433 res) hh00753 ( 433) 139 36.8 0.0064 >>KIAA1061 ( 693 res) hj00491 (693 aa) initn: 2839 init1: 1856 opt: 2925 Z-score: 2935.8 bits: 554.0 E(): 2.1e-158 Smith-Waterman score: 2925; 60.315% identity (85.817% similar) in 698 aa overlap (153-849:1-692) 130 140 150 160 170 180 KIAA12 LKKQKITIVHNEDCFFKGDKCKTTEYSKMKNMLLDLQNQKYIMQENENPNGDDISRKKLL :.:: ::.. .::... : :.:.:: KIAA10 NVLLALQTRLQPLQEGDS-RQDPASQKRLL 10 20 190 200 210 220 230 240 KIAA12 VDQMFKYFDADSNGLVDINELTQ-VIKQEELGKDLFDCTLYVLLKYDDFNADKHLALEEF :...:. .:::.:: .. .::.: :.:...: .::. :. ::..::.:.:. :.:.:: KIAA10 VESLFRDLDADGNGHLSSSELAQHVLKKQDLDEDLLGCSPGDLLRFDDYNSDSSLTLREF 30 40 50 60 70 80 250 260 270 280 290 300 KIAA12 YRAFQVIQLSLPEDQKLSITAATVGQSAVLSCAIQGTLRPPIIWKRNNIILNNLDLEDIN : ::::.:::: ....:.:..::: :.::.::..: ::::::::::.. :: ::::::: KIAA10 YMAFQVVQLSLAPEDRVSVTTVTVGLSTVLTCAVHGDLRPPIIWKRNGLTLNFLDLEDIN 90 100 110 120 130 140 310 320 330 340 350 360 KIAA12 DFGDDGSLYITKVTTTHVGNYTCYADGYEQVYQTHIFQVNVPPVIRVYPESQAREPGVTA :::.: ::::::::: :.:::::.:.:.::..:::..::::::::::::::::.::::.: KIAA10 DFGEDDSLYITKVTTIHMGNYTCHASGHEQLFQTHVLQVNVPPVIRVYPESQAQEPGVAA 150 160 170 180 190 200 370 380 390 400 410 420 KIAA12 SLRCHAEGIPKPQLGWLKNGIDITPKLSKQLTLQANGSEVHISNVRYEDTGAYTCIAKNE :::::::::: :.. :::::.:.. ..::::.: :::::.:::.:::::::::::::::: KIAA10 SLRCHAEGIPMPRITWLKNGVDVSTQMSKQLSLLANGSELHISSVRYEDTGAYTCIAKNE 210 220 230 240 250 260 430 440 450 460 470 480 KIAA12 AGVDEDISSLFVEDSARKTLANILWREEGLGIGNMFYVFYEDGIKVIQPIECEFQRHIKP .::::::::::.::::::::::::::::::..::::::: .::: ::.:..::.:::.:: KIAA10 VGVDEDISSLFIEDSARKTLANILWREEGLSVGNMFYVFSDDGIIVIHPVDCEIQRHLKP 270 280 290 300 310 320 490 500 510 520 530 540 KIAA12 SEKLLGFQDEVCPKAEGDEVQRCVWASAVNVKDKFIYVAQPTLDRVLIVDVQSQKVVQAV .::.. .:.::. : . .: : :.:::::....::::::.:.:::.::.:.:::.:.. 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KIAA10 TTVVWVGEV 690 >>KIAA0343 ( 1187 res) hg01457 (1187 aa) initn: 221 init1: 111 opt: 241 Z-score: 242.3 bits: 56.4 E(): 2.2e-08 Smith-Waterman score: 241; 29.193% identity (60.248% similar) in 161 aa overlap (266-423:273-427) 240 250 260 270 280 290 KIAA12 LALEEFYRAFQVIQLSLPEDQKLSITAATVGQSAVLSCAIQGTLRPPIIWKRNNIILNNL :. : : .: : : : ... .: . KIAA03 VKVISAKSSRERPPTFLTPEGNASNKEELRGNVLSLECIAEGLPTPIIYWAKEDGMLPK- 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 KIAA12 DLEDINDFGDDGSLYITKVTTTHVGNYTCYA-DGYEQVYQTHIFQVNVPPVIRVYPESQA . ..: . .: : .:. . ::: : : .. ...: .:.. : . :.. . KIAA03 NRTVYKNF--EKTLQIIHVSEADSGNYQCIAKNALGAIHHTISVRVKAAPYWITAPQNLV 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 KIAA12 REPGVTASLRCHAEGIPKPQLGWLKNG--IDITPKLSKQLTLQANGSEVHISNVRYEDTG :: ..: :.:.: :::...:: :: :.:.: .. . .:. . .:::. .... KIAA03 LSPGEDGTLICRANGNPKPRISWLTNGVPIEIAPDDPSR---KIDGDTIIFSNVQERSSA 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 KIAA12 AYTCIAKNEAGVDEDISSLFVEDSARKTLANILWREEGLGIGNMFYVFYEDGIKVIQPIE .: : :.:: : KIAA03 VYQCNASNEYGYLLANAFVNVLAEPPRILTPANTLYQVIANRPALLDCAFFGSPLPTIEW 420 430 440 450 460 470 >>KIAA1514 ( 1598 res) fh00815(revised) (1598 aa) initn: 99 init1: 85 opt: 233 Z-score: 233.0 bits: 55.1 E(): 7.3e-08 Smith-Waterman score: 236; 24.277% identity (52.601% similar) in 346 aa overlap (266-603:93-423) 240 250 260 270 280 290 KIAA12 LALEEFYRAFQVIQLSLPEDQKLSITAATVGQSAVLSCAIQGTLRPPIIWKRNNIIL--N :.:.::.: .:. :: : :.... :: . KIAA15 AGEVQTSTYLAVTSIAPNITRGPLDSTVIDGMSVVLACETSGAPRPAITWQKGERILASG 70 80 90 100 110 120 300 310 320 330 340 350 KIAA12 NLDLEDINDFGDDGSLYITKVTTTHVGNYTCYADGYEQVYQTHI-FQVNVPPVIRVYPES ...: .. . ..::: :. . . .:.::: : . . : .. . : . : :.. KIAA15 SVQLPRFTPL-ESGSLLISPTHISDAGTYTCLATNSRGVDEASADLVVWARTRITKPPQD 130 140 150 160 170 180 360 370 380 390 400 410 KIAA12 QAREPGVTASLRCHAEGIPKPQLG--WLKNGIDITPKLSKQLTLQANGSEVHISNVRYED :. :. ::. : . :. . : :.: . . .. :. ::: .:::.. : KIAA15 QSVIKGTQASMVCGVTHDPRVTIRYIWEKDGATLGTESHPRIRLDRNGS-LHISQTWSGD 190 200 210 220 230 240 420 430 440 450 460 KIAA12 TGAYTCIAKNEAGVDEDISSLFVED--SARKTLANILWREEGLGIGNMFYVFYEDGIKVI :.::: . . .: : . : :.. : . . : : .: :. .. :: . . KIAA15 IGTYTCRVISAGGNDSRSAHLRVRQLPHAPEHPVATLSTVERRAI-NLTWTKPFDGNSPL 250 260 270 280 290 470 480 490 500 510 520 KIAA12 QPIECEFQRHIKPSEKLLGFQDEVCPKAEGDEVQRCVWASAVNVKDKFIY-VAQPTLDRV :.... : ::. : ::: . :. : : . . . . :.. ... KIAA15 IRYILEMSENNAPWTVLLASVD---PKATSVTVKGLVPARSYQFRLCAVNDVGKGQFSK- 300 310 320 330 340 350 530 540 550 560 570 580 KIAA12 LIVDVQSQKVVQAVSTDPVPVKLHYDKSHDQVWVLSWGTLEKTSPTLQVITLASGNVPHH :.. .. . : : : .. . .: ...: . : . . .: . .. KIAA15 ---DTERVSLPEEPPTAP-PQNVIASGRTNQSIMIQW----QPPPESHQNGILKGYIIRY 360 370 380 390 400 590 600 610 620 630 640 KIAA12 TIHTQPVGKQFDRVDDFFIPTTTLIITHMRFGFILHKDEAALQKIDLETMSYIKTINLKD . ::: :: . : KIAA15 CLAGLPVGYQFKNITDADVNNLLLEDLIIWTNYEIEVAAYNSAGLGVYSSKVTEWTLQGV 410 420 430 440 450 460 >>KIAA1132 ( 2092 res) hh01132s1 (2092 aa) initn: 272 init1: 76 opt: 227 Z-score: 225.9 bits: 54.1 E(): 1.8e-07 Smith-Waterman score: 244; 29.474% identity (56.316% similar) in 190 aa overlap (253-433:636-822) 230 240 250 260 270 280 KIAA12 VLLKYDDFNADKHLALEEFYRAFQVIQLSLPEDQKLSITAATVGQSAVLSCAIQ-GTLRP : : . . :..:: . :... : . KIAA11 GMDEGEYLCSVLIQPQLSISQSVHVAVKVPPLIQPFEFPPASIGQLLYIPCVVSSGDMPI 610 620 630 640 650 660 290 300 310 320 330 340 KIAA12 PIIWKRNNIILNNLDLEDINDFGDDGSLYITKVTTTHVGNYTCYA-DGYEQVYQTHIFQV : :.... .. . . :.. .:: :..:. : ::::: : .. : . . . : KIAA11 RITWRKDGQVIISGSGVTIESKEFMSSLQISSVSLKHNGNYTCIASNAAATVSRERQLIV 670 680 690 700 710 720 350 360 370 380 390 KIAA12 NVPPVIRVYPESQAREPGVTASLRCHAEGIPKPQLGWLKNGIDITPK------LSKQLTL ::: . : :..: : .. : : ..: : :.. : . . .:. :. .. . KIAA11 RVPPRFVVQPNNQDGIYGKAGVLNCSVDGYPPPKVMWKHAKGSGNPQQYHPVPLTGRIQI 730 740 750 760 770 780 400 410 420 430 440 450 KIAA12 QANGSEVHISNVRYEDTGAYTCIAKNEAGVDEDIS-SLFVEDSARKTLANILWREEGLGI :.: . : .: :: : : : :.: :: ::: :.:. KIAA11 LPNSSLL-IRHVLEEDIGYYLCQASN--GVGTDISKSMFLTVKIPAMITSHPNTTIAIKG 790 800 810 820 830 840 460 470 480 490 500 510 KIAA12 GNMFYVFYEDGIKVIQPIECEFQRHIKPSEKLLGFQDEVCPKAEGDEVQRCVWASAVNVK KIAA11 HAKELNCTARGERPIIIRWEKGDTVIDPDRVMRYAIATKDNGDEVVSTLKLKPADRGDSV 850 860 870 880 890 900 >>KIAA1568 ( 1380 res) fh22308 (1380 aa) initn: 185 init1: 111 opt: 222 Z-score: 222.6 bits: 52.9 E(): 2.8e-07 Smith-Waterman score: 266; 30.055% identity (59.016% similar) in 183 aa overlap (253-423:322-497) 230 240 250 260 270 280 KIAA12 VLLKYDDFNADKHLALEEFYRAFQVIQLSLPEDQKLSITAATVGQSAVLSCAIQGTLRPP :.:: :.: :..... : .:. .: KIAA15 TYMCIAENRVGKMEASATLTVRAPPQFVVRPRDQ---IVAQ--GRTVTFPCETKGNPQPA 300 310 320 330 340 290 300 310 320 330 KIAA12 IIWKRN---NIILNNLDLEDIN--DFGDDGSLYITKVTTTHVGNYTCYA---DGY----E ..:... :... : . . . . :.: ::.. . .: : : : : KIAA15 VFWQKEGSQNLLFPNQPQQPNSRCSVSPTGDLTITNIQRSDAGYYICQALTVAGSILAKA 350 360 370 380 390 400 340 350 360 370 380 390 KIAA12 QVYQTHIFQVNVPPVIRVYPESQAREPGVTASLRCHAEGIPKPQLGWLKNGIDITPKLSK :. : .. ::.: : .:. :: :.:.: : : : ..:::.:. . : . KIAA15 QLEVTDVLTDRPPPIILQGPANQTLAVDGTALLKCKATGDPLPVISWLKEGFTF-PGRDP 410 420 430 440 450 460 400 410 420 430 440 450 KIAA12 QLTLQANGSEVHISNVRYEDTGAYTCIAKNEAGVDEDISSLFVEDSARKTLANILWREEG . :.: .:. ..:.:.: :::.:::.: . .: KIAA15 RATIQEQGT-LQIKNLRISDTGTYTCVATSSSGETSWSAVLDVTESGATISKNYDLSDLP 470 480 490 500 510 520 460 470 480 490 500 510 KIAA12 LGIGNMFYVFYEDGIKVIQPIECEFQRHIKPSEKLLGFQDEVCPKAEGDEVQRCVWASAV KIAA15 GPPSKPQVTDVTKNSVTLSWQPGTPGTLPASAYIIEAFSQSVSNSWQTVANHVKTTLYTV 530 540 550 560 570 580 >>KIAA1355 ( 1189 res) fj01564 (1189 aa) initn: 137 init1: 84 opt: 220 Z-score: 221.2 bits: 52.5 E(): 3.3e-07 Smith-Waterman score: 221; 26.512% identity (57.209% similar) in 215 aa overlap (217-420:116-315) 190 200 210 220 230 240 KIAA12 FKYFDADSNGLVDINELTQVIKQEELGKDLFDCTLYVLLKY---DDFNADK--HLALEEF ..: .. : .. ::: . ::... 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KIAA13 Q----NGTLRIRRVERGSSGVYTCQASSTEGS-ATHATQLLVLGPPVIVVPPKNSTVNAS 200 210 220 230 240 250 360 370 380 390 400 410 KIAA12 VTASLRCHAEGIPKP-QLGWLKNGIDI--TPKLSKQLTLQANGSEVHISNVRYEDTGAYT .:: ::::. : .:....:.. .:. .. . ..:: ... .. .:.: :: KIAA13 QDVSLACHAEAYPANLTYSWFQDNINVFHISRLQPRVRILVDGS-LRLLATQPDDAGCYT 260 270 280 290 300 310 420 430 440 450 460 470 KIAA12 CIAKNEAGVDEDISSLFVEDSARKTLANILWREEGLGIGNMFYVFYEDGIKVIQPIECEF :. .: KIAA13 CVPSNGLLHPPSASAYLTVLYPAQVTAMPPETPLPIGMPGVIRCPVRANPPLLFVSWTKD 320 330 340 350 360 370 >>KIAA1496 ( 920 res) fj09513 (920 aa) initn: 245 init1: 104 opt: 207 Z-score: 209.3 bits: 49.9 E(): 1.5e-06 Smith-Waterman score: 219; 30.435% identity (54.891% similar) in 184 aa overlap (259-423:22-196) 230 240 250 260 270 280 KIAA12 DFNADKHLALEEFYRAFQVIQLSLPEDQKLSITAATVGQSAVLSCAI---QGTLRPPIIW : ... ::..:: :. .: : : KIAA14 IVSREAKLQFAYLENFKTKMRSTVSVREGQGVVLLCGPPPHSGELS--YAW 10 20 30 40 290 300 310 320 330 340 KIAA12 KRNNIILNNLDLEDINDF--GDDGSLYITKVTTTHVGNYTCYADGYEQVYQTHIFQVNVP :. .. :: : . : :::.:: . :::::: . .. : ..... .: KIAA14 IFNEY--PSFVEEDSRRFVSQETGHLYISKVEPSDVGNYTCVVTSM--VTNARVLGSPTP 50 60 70 80 90 100 350 360 370 380 KIAA12 PVIRV--------------YPESQAREPGVTASLRCHAEGIPKPQLGWLKNGIDITPKLS :.: .::. : :..:.: : : : ::..: .. : : .: KIAA14 LVLRSDGVMGEYEPKIEVQFPETLPAAKGSTVKLECFALGNPIPQINWRRS--DGLP-FS 110 120 130 140 150 160 390 400 410 420 430 440 KIAA12 KQLTLQANGSEVHISNVRYEDTGAYTCIAKNEAGVDEDISSLFVEDSARKTLANILWREE ... :. .. ..: : . ::.:.: :::.: : KIAA14 SKIKLRKFSGVLEIPNFQQEDAGSYECIAENSRGKNVARGRLTYYAKPHWVQLIKDVEIA 170 180 190 200 210 220 450 460 470 480 490 500 KIAA12 GLGIGNMFYVFYEDGIKVIQPIECEFQRHIKPSEKLLGFQDEVCPKAEGDEVQRCVWASA KIAA14 VEDSLYWECRASGKPKPSYRWLKNGAALVLEERTQIENGALTISNLSVTDSGMFQCIAEN 230 240 250 260 270 280 >>KIAA0806 ( 1073 res) hk04165(revised) (1073 aa) initn: 250 init1: 91 opt: 207 Z-score: 208.6 bits: 50.0 E(): 1.7e-06 Smith-Waterman score: 269; 24.272% identity (57.605% similar) in 309 aa overlap (162-436:398-703) 140 150 160 170 180 190 KIAA12 HNEDCFFKGDKCKTTEYSKMKNMLLDLQNQKYIMQENENPNGDDISRKKLLVDQMFKYFD : :.: :. . :..: .. . ....: KIAA08 NLQTLDLRNNEISWAIEDASEAFAGLTSLTKLILQGNQIKS---ITKKAFIGLESLEHLD 370 380 390 400 410 420 200 210 220 230 240 KIAA12 ADSNGLVDINE--LTQV-IKQEELGKD--LFDCTLYVLLKY---DDFNADKHL--ALEEF ..:....:.: ..:. .:. :. . : :: : ::.. ..:. . .. : :. 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