# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hh07943.fasta.huge -Q ../query/KIAA1251.ptfa ./tmplib.24314 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1251, 1483 aa vs ./tmplib.24314 library 1986022 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.6357+/-0.00858; mu= -7.5125+/- 0.576 mean_var=345.2403+/-85.526, 0's: 0 Z-trim: 26 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.069026 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0465 ( 4433 res) hg01123s2 (4433) 9431 955.3 0 KIAA0728 ( 1637 res) fh22477 (1637) 327 48.3 1.5e-05 KIAA0866 ( 1984 res) hk00546s1 (1984) 295 45.2 0.00015 KIAA0796 ( 1876 res) hk06116s1 (1876) 291 44.7 0.00019 KIAA2034 ( 1571 res) ah04445 (1571) 257 41.3 0.0018 KIAA1512 ( 2010 res) fg04660y1 (2010) 253 41.0 0.0028 KIAA0004 ( 1307 res) ha00065 (1307) 234 38.9 0.0078 >>KIAA0465 ( 4433 res) hg01123s2 (4433 aa) initn: 9431 init1: 9431 opt: 9431 Z-score: 5086.2 bits: 955.3 E(): 0 Smith-Waterman score: 9431; 100.000% identity (100.000% similar) in 1475 aa overlap 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KIAA08 ERQQKAENELKELEQKHSQLTEEKNLLQEQLQAETELYAEAEEMRVRLAAKKQELEEILH 880 890 900 910 920 930 370 380 390 400 410 420 KIAA12 ERNLDLERYQEKGSQLQERWHRVIAQ---LEIRQSELESIQEVLGDYRACHGTLIKWIEE : . ::. ...:.::: . ... : :: . : :. .. : .. . :: .:. KIAA08 EMEARLEEEEDRGQQLQAERKKMAQQMLDLEEQLEEEEAARQKLQLEKVTAEAKIKKLED 940 950 960 970 980 990 430 440 450 460 470 480 KIAA12 TTAQQEMMKPGQAEDSRVLSEQLSQQTALFAEIERNQTKLDQCQKFSQQYSTIVKDYELQ .. .. ... ..: :..:. :. .:: :.. .: :..... ..... :.. 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