# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hg04073.fasta.huge -Q ../query/KIAA1245.ptfa ./tmplib.24314 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1245, 892 aa vs ./tmplib.24314 library 1986613 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.8953+/-0.00627; mu= -4.2565+/- 0.419 mean_var=314.1688+/-75.993, 0's: 0 Z-trim: 10 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.072359 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1693 ( 901 res) fj10588 ( 901) 3324 361.6 2.3e-100 KIAA0454 ( 2296 res) bf02274 (2296) 271 43.3 0.00037 >>KIAA1693 ( 901 res) fj10588 (901 aa) initn: 3320 init1: 3320 opt: 3324 Z-score: 1893.6 bits: 361.6 E(): 2.3e-100 Smith-Waterman score: 3324; 94.085% identity (97.597% similar) in 541 aa overlap (337-877:1-541) 310 320 330 340 350 360 KIAA12 AEMNILEINEKLRPQLAEKKQQFRSLKEKCFVTQLAGFLAKQQNKYKYEECKDLIKSMLR :::::: :::.::::::::::::::::::: KIAA16 FVTQLACFLANQQNKYKYEECKDLIKSMLR 10 20 30 370 380 390 400 410 420 KIAA12 NELQFKEEKLAEQLKQAEELRQYKVLVHSQERELTQLREKLREGRDASRSLNEHLQALLT :: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::: KIAA16 NERQFKEEKLAEQLKQAEELRQYKVLVHSQERELTQLREKLREGRDASRSLNQHLQALLT 40 50 60 70 80 90 430 440 450 460 470 480 KIAA12 PDEPDKSQGQDLQEQLAEGCRLAQHLVQKLSPENDEDEDEDVQVEEDEKVLESSSPREMQ ::.:::::::::::::::::::::.: ::::::::::::::::::: :::::::.:::.: KIAA16 PDKPDKSQGQDLQEQLAEGCRLAQQLFQKLSPENDEDEDEDVQVEEAEKVLESSAPREVQ 100 110 120 130 140 150 490 500 510 520 530 540 KIAA12 KAEESKVPEDSLEECAITCSNSHGPCDSNQPHKNIKITFEEDKVNSSLVVDRESSHDECQ :::::::::::::::::::::::.:::::::::::.::::::::::.::::::::::::: KIAA16 KAEESKVPEDSLEECAITCSNSHSPCDSNQPHKNINITFEEDKVNSTLVVDRESSHDECQ 160 170 180 190 200 210 550 560 570 580 590 600 KIAA12 DALNILPVPGPTSSATNVSMVVSAGPLSSEKAEMNILEINEKLRPQLAEKKQQFRSLKEK ::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::.:::: KIAA16 DAVNILPVPGPTSSATNVSMVVSAGPLSSEKAEMNILEINEKLHPQLAEKKQQFRNLKEK 220 230 240 250 260 270 610 620 630 640 650 660 KIAA12 CFVTQVACFLAKQQNKYKYEECKDLIKSMLRNELQFKEEKLAEQLKQAEELRQYKVLVHS :::::.:::::.:::::: :::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::: KIAA16 CFVTQLACFLANQQNKYKNEECKDLIKSMLRNERQFKEEKLAEQLKQAEELRQYKVLVHS 280 290 300 310 320 330 670 680 690 700 710 720 KIAA12 QERELTQLREKLREGRDASRSLNEHLQALLTPDEPDKSQGQDLQEQLAEGCRLAQHLVQK ::::::::::::::::::: :::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::: KIAA16 QERELTQLREKLREGRDASCSLNQHLQALLTPDEPDKSQGQDLQEQLAEGCRLAQHLVQK 340 350 360 370 380 390 730 740 750 760 770 780 KIAA12 LSPENDNDDDEDVQVEVAEKVQKSSSPREMQKAEEKEVPEDSLEECAITCSNSHGPYDSN :::::::::::::::::::::::::.:::: ::::::::::::::::::::::::::::: KIAA16 LSPENDNDDDEDVQVEVAEKVQKSSAPREMPKAEEKEVPEDSLEECAITCSNSHGPYDSN 400 410 420 430 440 450 790 800 810 820 830 840 KIAA12 QPHRKTKITFEEDKVDSTLIGSSSHVEWEDAVHIIPENESDDEEEEEKGPVSPRNLQESE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: KIAA16 QPHRKTKITFEEDKVDSTLIGSSSHVEWEDAVHIIPENESDDEEEEEKGPVSPRNLQESE 460 470 480 490 500 510 850 860 870 880 890 KIAA12 EEEVPQESWDEGYSTLSIPPERTSVGSSEKGGPRGNRSQAQQGAAG ::::::::::::::::::::: . .: .: KIAA16 EEEVPQESWDEGYSTLSIPPEMLASYQSYSGTFHSLEEQQVCMAVDIGGHRWDQVKKEDQ 520 530 540 550 560 570 KIAA16 EATGPRLSRELLDEKGPEVLQDSLDRCYSTPSGYLELTDSCQPYRSAFYILEQQRVGWAL 580 590 600 610 620 630 >>KIAA0454 ( 2296 res) bf02274 (2296 aa) initn: 362 init1: 135 opt: 271 Z-score: 166.5 bits: 43.3 E(): 0.00037 Smith-Waterman score: 373; 22.737% identity (53.863% similar) in 906 aa overlap (32-870:858-1716) 10 20 30 40 50 60 KIAA12 AVGSDHIFHNIPDSTSSATNVSMVVSAGPWSSEKAEMNILEINEKLRPQLAENKQQFRNL : .. .. :. :. .:.. :.... . 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