# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fh09696s1.fasta.nr -Q ../query/KIAA1237.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1237, 1268 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7807655 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3843+/-0.000201; mu= 8.7694+/- 0.011 mean_var=128.6319+/-23.854, 0's: 40 Z-trim: 118 B-trim: 0 in 0/67 Lambda= 0.113084 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|147645934|sp|Q9ULI3.3|HEG1_HUMAN RecName: Full= (1381) 8159 1343.7 0 gi|168273206|dbj|BAG10442.1| HEG homolog 1 [synthe (1482) 5575 922.2 0 gi|194664090|ref|XP_589074.4| PREDICTED: similar t (1372) 4929 816.8 0 gi|114588930|ref|XP_516708.2| PREDICTED: HEG homol (1391) 4757 788.7 0 gi|74002918|ref|XP_545138.2| PREDICTED: similar to (1050) 3517 586.3 3.4e-164 gi|148665433|gb|EDK97849.1| mCG127133, isoform CRA (1313) 3431 572.3 6.7e-160 gi|153792725|ref|NP_780465.4| HEG homolog 1 [Mus m (1082) 3423 571.0 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platelet binding protei (3072) 462 88.3 8e-14 gi|154816266|gb|ABS87372.1| flocculin [Saccharomyc (1360) 455 86.8 9.8e-14 gi|8885520|dbj|BAA97453.1| streptococcal hemagglut (2178) 455 87.0 1.4e-13 gi|194180578|gb|EDW94189.1| GE20182 [Drosophila ya (1247) 443 84.8 3.6e-13 >>gi|147645934|sp|Q9ULI3.3|HEG1_HUMAN RecName: Full=Prot (1381 aa) initn: 8159 init1: 8159 opt: 8159 Z-score: 7195.4 bits: 1343.7 E(): 0 Smith-Waterman score: 8159; 99.842% identity (99.921% similar) in 1268 aa overlap (1-1268:114-1381) 10 20 30 KIAA12 ESNTEAHVENITFYQNQEDFSTVSSKEGVM :::::::::::::::::::::::::::::: gi|147 APEPGAATQRGPSGRAPRGGSADAAWKHWPESNTEAHVENITFYQNQEDFSTVSSKEGVM 90 100 110 120 130 140 40 50 60 70 80 90 KIAA12 VQTSGKSHAASDAPENLTLLAETADARGRSGSSSRTNFTILPVGYSLEIATALTSQSGNL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|147 VQTSGKSHAASDAPENLTLLAETADARGRSGSSSRTNFTILPVGYSLEIATALTSQSGNL 150 160 170 180 190 200 100 110 120 130 140 150 KIAA12 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:.:: :: .::::::.::::::..:... .:.. .:.:.::: . .:..: gi|148 PPGAPWSPALTGFSTGPALPATSTSLAQMSPALTSAMPQTTHSPVTSPSTLSHVEALTSG 750 760 770 780 790 800 760 770 780 790 800 810 KIAA12 PIAVQTTAGKQLSLTHPEILVPQISTEGGISTERNRVIVDATTGLIPLTSVPTSAKEMTT ..:.:: : :.::::::.:::::.:.:: :: .: :: ::::. ::: : :: gi|148 AVVVHTTPKKPHLPTNPEILVPHISTEGAITTEGNREHTDPTTQPIPLTTSTTSAGERTT 810 820 830 840 850 860 820 830 840 850 860 870 KIAA12 KLGVTAEYSPASRSLGTSPSPQTTVVSTAEDLAPKSATFAVQSSTQSPTTLSSSASVNSC .:: . : ::. . : ::::: ::::: :. . :::.::..::::.: . :::: gi|148 ELGRAEESSPSH--FLTPSSPQTTDVSTAEMLTSRYITFAAQSTSQSPTALPPLTPVNSC 870 880 890 900 910 920 880 890 900 910 920 930 KIAA12 AVNPCLHNGECVADNTSRGYHCRCPPSWQGDDCSVDVNECLSNPCPSTATCNNTQGSFIC .::::::.:.:..: :.:::.: :::.:::..::::::::::.::: :.:::::::: : gi|148 TVNPCLHDGKCIVDLTGRGYRCVCPPAWQGENCSVDVNECLSSPCPPLAACNNTQGSFTC 930 940 950 960 970 980 940 950 960 970 980 990 KIAA12 KCPVGYQLEKGICNLVRTFVTEFKLKRTFLNTTVEKHSDLQEVENEITKTLNMCFSALPS .:::::::::::::::::::::::::.::::::.:.::. 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