# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fh08445.fasta.nr -Q ../query/KIAA1232.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1232, 520 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7819526 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2041+/-0.000186; mu= 12.0261+/- 0.010 mean_var=79.9604+/-15.606, 0's: 32 Z-trim: 73 B-trim: 181 in 1/64 Lambda= 0.143429 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|57208852|emb|CAI41023.1| discs, large homolog 3 ( 512) 3370 707.0 3.1e-201 gi|122890593|emb|CAM15072.1| discs, large homolog ( 512) 3342 701.2 1.7e-199 gi|74007567|ref|XP_856747.1| PREDICTED: similar to ( 510) 3304 693.3 4e-197 gi|148682219|gb|EDL14166.1| discs, large homolog 3 ( 569) 3056 642.0 1.2e-181 gi|114639593|ref|XP_001175236.1| PREDICTED: chapsy ( 809) 2541 535.6 1.9e-149 gi|119595499|gb|EAW75093.1| discs, large homolog 2 ( 884) 2533 534.0 6.5e-149 gi|73980933|ref|XP_540202.2| PREDICTED: similar to ( 473) 2493 525.5 1.3e-146 gi|109054014|ref|XP_001098808.1| PREDICTED: discs, ( 926) 2483 523.7 8.7e-146 gi|34785328|gb|AAH57118.1| Discs, large homolog 1 ( 927) 2483 523.7 8.7e-146 gi|119573995|gb|EAW53610.1| discs, large homolog 1 ( 926) 2482 523.5 1e-145 gi|74002970|ref|XP_545159.2| PREDICTED: similar to ( 927) 2480 523.0 1.3e-145 gi|149731238|ref|XP_001500922.1| PREDICTED: discs, ( 927) 2480 523.0 1.3e-145 gi|149633621|ref|XP_001512806.1| PREDICTED: simila ( 930) 2480 523.0 1.3e-145 gi|114591294|ref|XP_001166204.1| PREDICTED: synaps ( 926) 2479 522.8 1.5e-145 gi|219519172|gb|AAI44652.1| Unknown (protein for M ( 892) 2477 522.4 2e-145 gi|148665339|gb|EDK97755.1| discs, large homolog 1 ( 875) 2475 522.0 2.6e-145 gi|148665340|gb|EDK97756.1| discs, large homolog 1 ( 897) 2475 522.0 2.7e-145 gi|558436|gb|AAA50598.1| homolog of Drosophila dis ( 926) 2473 521.6 3.6e-145 gi|50752245|ref|XP_422701.1| PREDICTED: similar to ( 929) 2471 521.2 4.9e-145 gi|149060747|gb|EDM11461.1| discs, large homolog 1 ( 875) 2469 520.7 6.2e-145 gi|149060746|gb|EDM11460.1| discs, large homolog 1 ( 926) 2469 520.8 6.5e-145 gi|27371538|gb|AAN87264.1| embryo-dlg/synapse-asso ( 893) 2465 519.9 1.1e-144 gi|89268935|emb|CAJ82322.1| discs, large homolog 1 ( 927) 2428 512.3 2.3e-142 gi|2228746|gb|AAC31653.1| Dlgh1 homolog [Mus muscu ( 927) 2413 509.2 2e-141 gi|194382526|dbj|BAG64433.1| unnamed protein produ ( 366) 2406 507.4 2.7e-141 gi|148744308|gb|AAI42602.1| Si:ch211-276g21.1 prot ( 366) 2218 468.5 1.4e-129 gi|166079862|gb|ABY81651.1| synapse-associated pro ( 863) 2148 454.3 6.1e-125 gi|189524343|ref|XP_001918497.1| PREDICTED: hypoth ( 638) 2132 450.9 4.8e-124 gi|68052060|sp|Q5PYH7.1|DLG2_DANRE RecName: Full=D ( 881) 2132 451.0 6.1e-124 gi|189234387|ref|XP_001815997.1| PREDICTED: simila ( 729) 2103 444.9 3.4e-122 gi|167869404|gb|EDS32787.1| conserved hypothetical ( 861) 2060 436.1 1.8e-119 gi|45446906|gb|AAS65309.1| discs large 1, isoform ( 911) 2050 434.1 8e-119 gi|158031792|gb|ABW09394.1| discs large 1, isoform ( 911) 2050 434.1 8e-119 gi|51704269|sp|P31007.2|DLG1_DROME RecName: Full=D ( 970) 2050 434.1 8.4e-119 gi|115658945|ref|XP_001190785.1| PREDICTED: simila ( 780) 2033 430.5 8.2e-118 gi|198429307|ref|XP_002131501.1| PREDICTED: simila ( 926) 2006 425.0 4.5e-116 gi|157018886|gb|EAA06750.5| AGAP000255-PA [Anophel ( 905) 1992 422.1 3.3e-115 gi|126343443|ref|XP_001364535.1| PREDICTED: simila ( 916) 1977 419.0 2.8e-114 gi|122890894|emb|CAM12903.1| discs, large (Drosoph ( 828) 1958 415.0 4e-113 gi|47227219|emb|CAG00581.1| unnamed protein produc ( 799) 1931 409.4 1.9e-111 gi|193900971|gb|EDV99837.1| GH12185 [Drosophila gr ( 828) 1921 407.3 8.1e-111 gi|109108133|ref|XP_001093187.1| PREDICTED: simila ( 344) 1821 386.3 7.2e-105 gi|193669316|ref|XP_001944265.1| PREDICTED: simila ( 735) 1790 380.2 1.1e-102 gi|193641191|ref|XP_001948578.1| PREDICTED: simila ( 836) 1681 357.7 7.3e-96 gi|210120688|gb|EEA68405.1| hypothetical protein B ( 371) 1663 353.6 5.3e-95 gi|156225241|gb|EDO46060.1| predicted protein [Nem ( 364) 1547 329.6 8.7e-88 gi|156537510|ref|XP_001607413.1| PREDICTED: simila ( 356) 1506 321.1 3.1e-85 gi|74007569|ref|XP_856788.1| PREDICTED: similar to ( 849) 1492 318.6 4.4e-84 gi|74007571|ref|XP_549062.2| PREDICTED: similar to ( 849) 1492 318.6 4.4e-84 gi|57208850|emb|CAI41021.1| discs, large homolog 3 ( 849) 1490 318.2 5.8e-84 >>gi|57208852|emb|CAI41023.1| discs, large homolog 3 (ne (512 aa) initn: 3370 init1: 3370 opt: 3370 Z-score: 3769.0 bits: 707.0 E(): 3.1e-201 Smith-Waterman score: 3370; 100.000% identity (100.000% similar) in 512 aa overlap (9-520:1-512) 10 20 30 40 50 60 KIAA12 AARRERGAMERARKFSGSGLAMGLGSASASAWRRASQRWAWPLRSLRPGGDAREPRKIIL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|572 MERARKFSGSGLAMGLGSASASAWRRASQRWAWPLRSLRPGGDAREPRKIIL 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 KIAA12 HKGSTGLGFNIVGGEDGEGIFVSFILAGGPADLSGELRRGDRILSVNGVNLRNATHEQAA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|572 HKGSTGLGFNIVGGEDGEGIFVSFILAGGPADLSGELRRGDRILSVNGVNLRNATHEQAA 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 KIAA12 AALKRAGQSVTIVAQYRPEEYSRFESKIHDLREQMMNSSMSSGSGSLRTSEKRSLYVRAL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|572 AALKRAGQSVTIVAQYRPEEYSRFESKIHDLREQMMNSSMSSGSGSLRTSEKRSLYVRAL 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 KIAA12 FDYDRTRDSCLPSQGLSFSYGDILHVINASDDEWWQARLVTPHGESEQIGVIPSKKRVEK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|572 FDYDRTRDSCLPSQGLSFSYGDILHVINASDDEWWQARLVTPHGESEQIGVIPSKKRVEK 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 KIAA12 KERARLKTVKFHARTGMIESNRSIKTKRKKSFRLSRKFPFYKSKENMAQESSIQEQGVTS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|572 KERARLKTVKFHARTGMIESNRSIKTKRKKSFRLSRKFPFYKSKENMAQESSIQEQGVTS 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 KIAA12 NTSDSESSSKGQEDAILSYEPVTRQEIHYARPVIILGPMKDRVNDDLISEFPHKFGSCVP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|572 NTSDSESSSKGQEDAILSYEPVTRQEIHYARPVIILGPMKDRVNDDLISEFPHKFGSCVP 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 420 KIAA12 HTTRPRRDNEVDGQDYHFVVSREQMEKDIQDNKFIEAGQFNDNLYGTSIQSVRAVAERGK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|572 HTTRPRRDNEVDGQDYHFVVSREQMEKDIQDNKFIEAGQFNDNLYGTSIQSVRAVAERGK 360 370 380 390 400 410 430 440 450 460 470 480 KIAA12 HCILDVSGNAIKRLQQAQLYPIAIFIKPKSIEALMEMNRRQTYEQANKIYDKAMKLEQEF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|572 HCILDVSGNAIKRLQQAQLYPIAIFIKPKSIEALMEMNRRQTYEQANKIYDKAMKLEQEF 420 430 440 450 460 470 490 500 510 520 KIAA12 GEYFTAIVQGDSLEEIYNKIKQIIEDQSGHYIWVPSPEKL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|572 GEYFTAIVQGDSLEEIYNKIKQIIEDQSGHYIWVPSPEKL 480 490 500 510 >>gi|122890593|emb|CAM15072.1| discs, large homolog 3 (D (512 aa) initn: 3342 init1: 3342 opt: 3342 Z-score: 3737.6 bits: 701.2 E(): 1.7e-199 Smith-Waterman score: 3342; 99.023% identity (99.805% similar) in 512 aa overlap (9-520:1-512) 10 20 30 40 50 60 KIAA12 AARRERGAMERARKFSGSGLAMGLGSASASAWRRASQRWAWPLRSLRPGGDAREPRKIIL :: :::::::.::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|122 METARKFSGSSLALGLGSASASAWRRASQRWAWPLRSLRPGGDAREPRKIIL 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 KIAA12 HKGSTGLGFNIVGGEDGEGIFVSFILAGGPADLSGELRRGDRILSVNGVNLRNATHEQAA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|122 HKGSTGLGFNIVGGEDGEGIFVSFILAGGPADLSGELRRGDRILSVNGVNLRNATHEQAA 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 KIAA12 AALKRAGQSVTIVAQYRPEEYSRFESKIHDLREQMMNSSMSSGSGSLRTSEKRSLYVRAL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|122 AALKRAGQSVTIVAQYRPEEYSRFESKIHDLREQMMNSSMSSGSGSLRTSEKRSLYVRAL 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 KIAA12 FDYDRTRDSCLPSQGLSFSYGDILHVINASDDEWWQARLVTPHGESEQIGVIPSKKRVEK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|122 FDYDRTRDSCLPSQGLSFSYGDILHVINASDDEWWQARLVTPHGESEQIGVIPSKKRVEK 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 KIAA12 KERARLKTVKFHARTGMIESNRSIKTKRKKSFRLSRKFPFYKSKENMAQESSIQEQGVTS ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::: gi|122 KERARLKTVKFHARTGMIESNRSIKTKRKKSFRLSRKFPFYKSKENMAQENSIQEQGVTS 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 KIAA12 NTSDSESSSKGQEDAILSYEPVTRQEIHYARPVIILGPMKDRVNDDLISEFPHKFGSCVP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|122 NTSDSESSSKGQEDAILSYEPVTRQEIHYARPVIILGPMKDRVNDDLISEFPHKFGSCVP 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 420 KIAA12 HTTRPRRDNEVDGQDYHFVVSREQMEKDIQDNKFIEAGQFNDNLYGTSIQSVRAVAERGK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|122 HTTRPRRDNEVDGQDYHFVVSREQMEKDIQDNKFIEAGQFNDNLYGTSIQSVRAVAERGK 360 370 380 390 400 410 430 440 450 460 470 480 KIAA12 HCILDVSGNAIKRLQQAQLYPIAIFIKPKSIEALMEMNRRQTYEQANKIYDKAMKLEQEF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::: gi|122 HCILDVSGNAIKRLQQAQLYPIAIFIKPKSIEALMEMNRRQTYEQANKIFDKAMKLEQEF 420 430 440 450 460 470 490 500 510 520 KIAA12 GEYFTAIVQGDSLEEIYNKIKQIIEDQSGHYIWVPSPEKL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|122 GEYFTAIVQGDSLEEIYNKIKQIIEDQSGHYIWVPSPEKL 480 490 500 510 >>gi|74007567|ref|XP_856747.1| PREDICTED: similar to syn (510 aa) initn: 3270 init1: 3270 opt: 3304 Z-score: 3695.2 bits: 693.3 E(): 4e-197 Smith-Waterman score: 3304; 98.438% identity (99.023% similar) in 512 aa overlap (9-520:1-510) 10 20 30 40 50 60 KIAA12 AARRERGAMERARKFSGSGLAMGLGSASASAWRRASQRWAWPLRSLRPGGDAREPRKIIL :: : :::: .::.:::::: :::::::::::::::::::::::::::::: gi|740 MEGACKFSGPSLALGLGSAS--AWRRASQRWAWPLRSLRPGGDAREPRKIIL 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 KIAA12 HKGSTGLGFNIVGGEDGEGIFVSFILAGGPADLSGELRRGDRILSVNGVNLRNATHEQAA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|740 HKGSTGLGFNIVGGEDGEGIFVSFILAGGPADLSGELRRGDRILSVNGVNLRNATHEQAA 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 KIAA12 AALKRAGQSVTIVAQYRPEEYSRFESKIHDLREQMMNSSMSSGSGSLRTSEKRSLYVRAL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|740 AALKRAGQSVTIVAQYRPEEYSRFESKIHDLREQMMNSSMSSGSGSLRTSEKRSLYVRAL 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 KIAA12 FDYDRTRDSCLPSQGLSFSYGDILHVINASDDEWWQARLVTPHGESEQIGVIPSKKRVEK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|740 FDYDRTRDSCLPSQGLSFSYGDILHVINASDDEWWQARLVTPHGESEQIGVIPSKKRVEK 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 KIAA12 KERARLKTVKFHARTGMIESNRSIKTKRKKSFRLSRKFPFYKSKENMAQESSIQEQGVTS :::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|740 KERARLKTVKFHARTGMMESNRSIKTKRKKSFRLSRKFPFYKSKENMAQESSIQEQGVTS 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 KIAA12 NTSDSESSSKGQEDAILSYEPVTRQEIHYARPVIILGPMKDRVNDDLISEFPHKFGSCVP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|740 NTSDSESSSKGQEDAILSYEPVTRQEIHYARPVIILGPMKDRVNDDLISEFPHKFGSCVP 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 420 KIAA12 HTTRPRRDNEVDGQDYHFVVSREQMEKDIQDNKFIEAGQFNDNLYGTSIQSVRAVAERGK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|740 HTTRPRRDNEVDGQDYHFVVSREQMEKDIQDNKFIEAGQFNDNLYGTSIQSVRAVAERGK 360 370 380 390 400 410 430 440 450 460 470 480 KIAA12 HCILDVSGNAIKRLQQAQLYPIAIFIKPKSIEALMEMNRRQTYEQANKIYDKAMKLEQEF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|740 HCILDVSGNAIKRLQQAQLYPIAIFIKPKSIEALMEMNRRQTYEQANKIYDKAMKLEQEF 420 430 440 450 460 470 490 500 510 520 KIAA12 GEYFTAIVQGDSLEEIYNKIKQIIEDQSGHYIWVPSPEKL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|740 GEYFTAIVQGDSLEEIYNKIKQIIEDQSGHYIWVPSPEKL 480 490 500 510 >>gi|148682219|gb|EDL14166.1| discs, large homolog 3 (Dr (569 aa) initn: 3056 init1: 3056 opt: 3056 Z-score: 3417.2 bits: 642.0 E(): 1.2e-181 Smith-Waterman score: 3056; 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