# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fh08195s1.fasta.huge -Q ../query/KIAA1231.ptfa ./tmplib.24314 2
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
KIAA1231, 1061 aa
vs ./tmplib.24314 library
1986444 residues in 2037 sequences
Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.8816+/-0.00876; mu= -7.2728+/- 0.590
mean_var=304.6341+/-76.339, 0's: 0 Z-trim: 56 B-trim: 133 in 1/39
Lambda= 0.073483
FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16
The best scores are: opt bits E(2037)
KIAA1954 ( 468 res) fk02322 ( 468) 504 67.5 4.8e-12
KIAA1559 ( 544 res) fh19195 ( 544) 496 66.7 9.6e-12
KIAA1710 ( 515 res) fj18457 ( 515) 483 65.3 2.4e-11
KIAA0628 ( 540 res) hh01433 ( 540) 482 65.2 2.7e-11
KIAA1349 ( 752 res) fj00940 ( 752) 482 65.4 3.4e-11
KIAA1829 ( 557 res) hj00069 ( 557) 479 64.9 3.4e-11
KIAA1611 ( 813 res) fj12627 ( 813) 473 64.4 7e-11
KIAA1806 ( 481 res) fk00438 ( 481) 465 63.4 8.6e-11
KIAA1956 ( 680 res) fk08713 ( 680) 467 63.7 9.5e-11
KIAA0065 ( 848 res) ha00946 ( 848) 464 63.5 1.4e-10
KIAA1508 ( 573 res) hk06576 ( 573) 456 62.5 1.9e-10
KIAA1962 ( 746 res) hm00158 ( 746) 457 62.7 2.1e-10
KIAA1431 ( 891 res) fj00022 ( 891) 453 62.4 3.2e-10
KIAA0441 ( 702 res) hh00601s1 ( 702) 450 62.0 3.4e-10
KIAA1948 ( 487 res) fh24556 ( 487) 446 61.4 3.5e-10
KIAA2007 ( 580 res) fj01689 ( 580) 446 61.5 4e-10
KIAA1396 ( 551 res) hj08221 ( 551) 444 61.2 4.4e-10
KIAA1473 ( 574 res) fj03262 ( 574) 438 60.6 7.1e-10
KIAA1982 ( 599 res) fk06527(revised) ( 599) 438 60.6 7.3e-10
KIAA0326 ( 927 res) hg00579 ( 927) 436 60.6 1.2e-09
KIAA1588 ( 613 res) fj08823 ( 613) 431 59.9 1.2e-09
KIAA0961 ( 530 res) hj05830 ( 530) 429 59.6 1.3e-09
KIAA2003 ( 460 res) ah02593 ( 460) 423 58.9 1.8e-09
KIAA0798 ( 682 res) hk06584 ( 682) 424 59.2 2.3e-09
KIAA1874 ( 579 res) hk07257s1 ( 579) 422 58.9 2.3e-09
KIAA1141 ( 914 res) hk01833 ( 914) 426 59.5 2.4e-09
KIAA1969 ( 595 res) fk06944 ( 595) 417 58.4 3.4e-09
KIAA0412 ( 720 res) hg03242 ( 720) 415 58.2 4.5e-09
KIAA1871 ( 821 res) hj05256s1 ( 821) 411 57.9 6.7e-09
KIAA1198 ( 553 res) fg01911 ( 553) 407 57.3 6.7e-09
KIAA1615 ( 484 res) fj13419 ( 484) 404 56.9 7.6e-09
KIAA1852 ( 948 res) fj01514 ( 948) 398 56.6 1.9e-08
KIAA1827 ( 469 res) fk01409 ( 469) 389 55.3 2.2e-08
KIAA2033 ( 766 res) ej00602s1 ( 766) 388 55.4 3.5e-08
KIAA1339 ( 409 res) fj00071 ( 409) 375 53.8 5.7e-08
KIAA0478 ( 1253 res) hh05955 (1253) 378 54.5 1e-07
KIAA0924 ( 617 res) hh02883 ( 617) 355 51.8 3.3e-07
KIAA0557 ( 493 res) hh01334 ( 493) 348 51.0 4.7e-07
KIAA0198 ( 562 res) ha02521 ( 562) 337 49.9 1.2e-06
KIAA0426 ( 613 res) hh01274 ( 613) 337 49.9 1.2e-06
KIAA1675 ( 1286 res) ae00102 (1286) 344 51.0 1.3e-06
KIAA0972 ( 702 res) hj06859 ( 702) 322 48.4 4.1e-06
KIAA0760 ( 1224 res) hk04642s1 (1224) 325 48.9 5e-06
KIAA1979 ( 309 res) fj09511 ( 309) 302 45.9 9.9e-06
KIAA1388 ( 599 res) fj06552 ( 599) 279 43.8 8.7e-05
KIAA1947 ( 608 res) fh23660 ( 608) 272 43.0 0.00015
KIAA0236 ( 1696 res) ha04654 (1696) 261 42.3 0.00069
KIAA1020 ( 638 res) fg00473s1 ( 638) 250 40.7 0.00077
KIAA1015 ( 841 res) hk03609(revised) ( 841) 252 41.0 0.00081
KIAA1485 ( 1104 res) fj07037 (1104) 254 41.4 0.00085
>>KIAA1954 ( 468 res) fk02322 (468 aa)
initn: 551 init1: 207 opt: 504 Z-score: 308.1 bits: 67.5 E(): 4.8e-12
Smith-Waterman score: 504; 27.614% identity (54.424% similar) in 373 aa overlap (409-773:55-410)
380 390 400 410 420 430
KIAA12 PQETQSSLEHEPETHTLHLQPQHEESVVPTQSTLTADDMRRAKRIRLELQNAALQHLFIR
.:.:: . .... . . :.. : ..
KIAA19 GHNADLLNENNILAKKKPYKCDKCRKAFIHRSSLTKHE--KTHKGEGAFPNGTDQGIYPG
30 40 50 60 70 80
440 450 460 470 480 490
KIAA12 KSFRPFKCLQCGKAFREKDKLDQHLRFHGREGNCPLTCDLCNKGFISSTSLESHMKLHSD
: . .: .:::.: : .: .: :.: :. :. :..:.:.: :.:: .: . :.
KIAA19 K--KHHECTDCGKTFLWKTQLTEHQRIH--TGEKPFECNVCGKAFRHSSSLGQHENAHTG
90 100 110 120 130
500 510 520 530 540 550
KIAA12 QKTYSCIFCPESFDRLDLLKDHVAIHINDGYFTCPTCKKRFPDFIQVKKHVRSFHSEKIY
.: :.: .: ..:.: . : .: :: .. . : : . : .. .: . .:: .
KIAA19 EKPYQCSLCGKAFQRSSSLVQHQRIHTGEKPYRCNLCGRSFRHGTSLTQHEVTHSGEKPF
140 150 160 170 180 190
560 570 580 590 600 610
KIAA12 QCTECDKAFCRPDKLRLHMLRHSDRKDFLCSTCGKQFKRKDKLREHMQRMHNPEREAKKA
:: :: ::: : ..: : :. .: : :: ::. : .. .: .:: :.: ...:
KIAA19 QCKECGKAFSRCSSLVQHERTHTGEKPFECSICGRAFGQSPSLYKHM-RIH---KRGKPY
200 210 220 230 240 250
620 630 640 650 660 670
KIAA12 DRISRSKTFKPRITSTDYDSF-----TFKCRLCMMGFRRRGMLVNHLSKRHPDMKIEEVP
. . : :: . :. .: ...: : : . ...: . . .
KIAA19 QSSNYSIDFKHSTSLTQDESTLTEVKSYHCNDCGEDFSHITDFTDHQRIHTAENPYDCEQ
260 270 280 290 300 310
680 690 700 710 720 730
KIAA12 ELTLPIIK-PN-RDYFCQYCDKVYKSASKRKAHILKNHPGAELPPSIRKLRPAGPGEPDP
.. :. :. . : :. : :..: ... : . : : : : . ::
KIAA19 AFSQQAISHPGEKPYQCNVCGKAFKRSTSFIEH-HRIHTG-EKPYECNEC-----GEAFS
320 330 340 350 360
740 750 760 770 780 790
KIAA12 MLSTHTQLTGT-IATPPVCCPHCSKQYSSKTKMVQHIRKKHPEFAQLSNTIHTPLTTAVI
:. :: : . : : :.: .:......:: : . :
KIAA19 RRSSLTQHERTHTGEKPYECIDCGKAFSQSSSLIQHERTHTGEKPYECNECGRAFRKKTN
370 380 390 400 410 420
800 810 820 830 840 850
KIAA12 SATPAVLTTDSATGETVVTTDLLTQAMTELSQTLTTDYRTPQGDYQRIQYIPVSQSASGL
KIAA19 LHDHQRIHTGEKPYSCKECGKNFSRSSALTKHQRIHTRNKL
430 440 450 460
>>KIAA1559 ( 544 res) fh19195 (544 aa)
initn: 876 init1: 252 opt: 496 Z-score: 302.7 bits: 66.7 E(): 9.6e-12
Smith-Waterman score: 537; 30.294% identity (51.765% similar) in 340 aa overlap (433-768:200-511)
410 420 430 440 450 460
KIAA12 ESVVPTQSTLTADDMRRAKRIRLELQNAALQHLFIRKSFRPFKCLQCGKAFREKDKLDQH
::: :. . .:.:: .::.:::.. .: .:
KIAA15 LTEYQIVHNGEKVYECKECRKTFIRRSTLSQHLRIHTGEKPYKCKECGQAFRQRAHLIRH
170 180 190 200 210 220
470 480 490 500 510 520
KIAA12 LRFHGREGNCPLTCDLCNKGFISSTSLESHMKLHSDQKTYSCIFCPESFDRLDLLKDHVA
..: :. : : :.:.: : .:..::. .: : : : ..: . : :
KIAA15 HKLH--TGEKPYECKECGKAFTVLQELTQHQRLHTGEKPYECKECGKAFRVHQQLARHQR
230 240 250 260 270 280
530 540 550 560 570 580
KIAA12 IHINDGYFTCPTCKKRFPDFIQVKKHVRSFHSEKIYQCTECDKAF-CRPDKLRLHMLRHS
:: .. . : : : : . .. .: : .::.:.: :: ::: : :: ::.:. :
KIAA15 IHTGEKPYECKDCGKTFRQCTHLTRHQRLHTAEKLYECKECGKAFVCGPD-LRVHQKIHF
290 300 310 320 330 340
590 600 610 620 630
KIAA12 DRKDFLCSTCGKQFKRKDKLREHMQRMHNPER--EAKKADRISRSKTFKPRITSTDYDSF
.: . :. ::: :. ..: : : .:. :. : :. . : . :
KIAA15 GEKPYECKECGKAFRICQQLTVH-QSIHTGEKPYECKECGKTFRLRQQLVRHQRIHTREK
350 360 370 380 390 400
640 650 660 670 680 690
KIAA12 TFKCRLCMMGFRRRGMLVNHLSKRHPDMKIEEVPELTLPIIKPNRDYFCQYCDKVYKSAS
..: : : ..:..: : ..: : : : :. : :... :
KIAA15 PYECMECWKTFSSYSQLISHQS-----IHIGERP------------YECEECGKAFRLLS
410 420 430 440
700 710 720 730 740 750
KIAA12 KRKAHILKNHPGAELPPSIRKLRPAGPGEPDPMLSTHTQLTGT-IATPPVCCPHCSKQYS
. : . : : : : .. : .: .:: :: . . : : .:.: .
KIAA15 QLTQH-QSIHTG-EKPYECKECR-----KPFRLLSQLTQHQSIHTGEKPYECKECGKAFR
450 460 470 480 490 500
760 770 780 790 800 810
KIAA12 SKTKMVQHIRKKHPEFAQLSNTIHTPLTTAVISATPAVLTTDSATGETVVTTDLLTQAMT
. ..:: :
KIAA15 LYSFLTQHQRIHTGEKPYKCKECKKAFRQHSHLTQHQKIHNGI
510 520 530 540
>>KIAA1710 ( 515 res) fj18457 (515 aa)
initn: 723 init1: 302 opt: 483 Z-score: 295.5 bits: 65.3 E(): 2.4e-11
Smith-Waterman score: 517; 25.835% identity (53.007% similar) in 449 aa overlap (328-768:66-483)
300 310 320 330 340 350
KIAA12 FSRTRGRGRGRGKRRFGPGRRPGRPPKFIRLEITSENGEKSDDGTQDLLHFPTKEQFDEA
. .: :. . : . .:: . .:.. ..
KIAA17 SPWRRTLVLEMAATLLMAGSQAPVTFEDMAMYLTREEWRPLDAAQRDLYRDVMQENYGNV
40 50 60 70 80 90
360 370 380 390 400 410
KIAA12 EPATLNGLDQPEQTTIPIPQLPQETQSSLEHEPETHTLHLQPQHEESVVP-TQSTLTADD
..:. . :. . : .. ...: . : ... . .:. ::. .: :
KIAA17 --VSLDFEIRSENEVNPKQEISEDVQFGTTSERPAENAEENPESEEGFESGDRSERQWGD
100 110 120 130 140 150
420 430 440 450 460 470
KIAA12 MRRAKRIRLELQNAA--LQHLFIRKSFRPFKCLQCGKAFREKDKLDQHLRFHGREGNCPL
. . . :: .. : : .. ..: : .::::: . . :..: . : :. :
KIAA17 LTAEEWVSYPLQPVTDLLVHKEVHTGIRYHICSHCGKAFSQISDLNRHQKTH--TGDRPY
160 170 180 190 200 210
480 490 500 510 520 530
KIAA12 TCDLCNKGFISSTSLESHMKLHSDQKTYSCIFCPESFDRLDLLKDHVAIHINDGYFTCPT
: :.::: :. : .:.. :. .. :.: : .:: : . : .: .:: .. :
KIAA17 KCYECGKGFSRSSHLIQHQRTHTGERPYDCNECGKSFGRSSHLIQHQTIHTGEKPHKCNE
220 230 240 250 260 270
540 550 560 570 580 590
KIAA12 CKKRFPDFIQVKKHVRSFHSEKIYQCTECDKAFCRPDKLRLHMLRHSDRKDFLCSTCGKQ
: : : . .. .: :. .:: :.: :: :.: : ..: :. :. .: . :. ::.
KIAA17 CGKSFCRLSHLIQHQRTHSGEKPYECEECGKSFSRSSHLAQHQRTHTGEKPYECNECGRG
280 290 300 310 320 330
600 610 620 630 640
KIAA12 FKRKDKLREHMQRMHNPEREAKKADRISR-----SKTFKPRITSTDYDSFTFKCRLCMMG
:.... : .:. :.:. :: : :. .. : . : . : . .: : .
KIAA17 FSERSDLIKHY-RVHTGERPYK-CDECGKNFSQNSDLVRHRRAHTGEKPY--HCNECGEN
340 350 360 370 380
650 660 670 680 690 700
KIAA12 FRRRGMLVNHLSKRHPDMKIEEVPELTLPIIKPNRDYFCQYCDKVYKSASKRKAHILKNH
: : . ::.: .. : : : : :. : : .. .:. .: : :
KIAA17 FSRISHLVQH-QRTHTGEK---------P-------YECNACGKSFSRSSHLITH-QKIH
390 400 410 420
710 720 730 740 750 760
KIAA12 PGAELPPSIRKLRPAGPGEPDPMLSTHTQLTGTIATPPVCCPHCSKQYSSKTKMVQHIRK
: : : . . :: . ... . :: : : .:.: ........ : :
KIAA17 TG-EKPYECNECWRSF-GERSDLIKHQRTHTGE---KPYECVQCGKGFTQSSNLITHQRV
430 440 450 460 470 480
770 780 790 800 810 820
KIAA12 KHPEFAQLSNTIHTPLTTAVISATPAVLTTDSATGETVVTTDLLTQAMTELSQTLTTDYR
KIAA17 HTGEKPYECTECEKSFSRSSALIKHKRVHTD
490 500 510
>>KIAA0628 ( 540 res) hh01433 (540 aa)
initn: 866 init1: 292 opt: 482 Z-score: 294.7 bits: 65.2 E(): 2.7e-11
Smith-Waterman score: 498; 29.720% identity (57.692% similar) in 286 aa overlap (432-704:199-481)
410 420 430 440 450 460
KIAA12 EESVVPTQSTLTADDMRRAKRIRLELQNAALQHLFIRKSFRPFKCLQCGKAFREKDKLDQ
..: .... .:::: :::::: ... : .
KIAA06 HLMEHQRIHTGERLYVCNVCGKDFIHYSGLIEHQRVHSGEKPFKCAQCGKAFCHSSDLIR
170 180 190 200 210 220
470 480 490 500 510 520
KIAA12 HLRFHGREGNCPLTCDLCNKGFISSTSLESHMKLHSDQKTYSCIFCPESFDRLDLLKDHV
: : : :: :. : :.::: .:. : :...:. .. : : : .:: : . : :
KIAA06 HQRVHTRER--PFECKECGKGFSQSSLLIRHQRIHTGERPYECNECGKSFIRSSSLIRHY
230 240 250 260 270 280
530 540 550 560 570 580
KIAA12 AIHINDGYFTCPTCKKRFPDFIQVKKHVRSFHSEKIYQCTECDKAFCRPDKLRLHMLRHS
:: . . : : : : .. .: : .:. ..:.:: ::: : .:: :. :.
KIAA06 QIHTEVKQYECKECGKAFRHRSDLIEHQRIHTGERPFECNECGKAFIRSSKLIQHQRIHT
290 300 310 320 330 340
590 600 610 620 630
KIAA12 DRKDFLCSTCGKQFKRKDKLREHMQRMHNPER--EAKKADRISRSKTFKPRITSTDYDSF
.. ..:. :::.:.. ... .: ::.:. :. : .. . ... : .
KIAA06 GERPYVCNECGKRFSQTSNFTQH-QRIHTGEKLYECNECGKAFFLSSYLIRHQKIHTGER
350 360 370 380 390 400
640 650 660 670 680
KIAA12 TFKCRLCMMGFRRRGMLVNHLSKRHPDMKIE---------EVPELTL-PIIKPN-RDYFC
...:. : .: ... :..: . . : .: . .: : ::. . . : :
KIAA06 VYECKECGKAFLQKAHLTEHQKIHSGDRPFECKDCGKAFIQSSKLLLHQIIHTGEKPYVC
410 420 430 440 450 460
690 700 710 720 730 740
KIAA12 QYCDKVYKSASKRKAHILKNHPGAELPPSIRKLRPAGPGEPDPMLSTHTQLTGTIATPPV
.:: : . . :. :
KIAA06 SYCGKGFIQRSNFLQHQKIHTEEKLYECSQYGRDFNSTTNVKNNQRVHQEGLSLSKAPIH
470 480 490 500 510 520
>>KIAA1349 ( 752 res) fj00940 (752 aa)
initn: 1019 init1: 317 opt: 482 Z-score: 292.8 bits: 65.4 E(): 3.4e-11
Smith-Waterman score: 537; 29.464% identity (57.143% similar) in 336 aa overlap (442-771:329-633)
420 430 440 450 460 470
KIAA12 LTADDMRRAKRIRLELQNAALQHLFIRKSFRPFKCLQCGKAFREKDKLDQHLRFHGREGN
.:..: .:::.:.. .. : :.: :.
KIAA13 GEKPYKCDDCGKAFRNKSYLSVHQKTHTEEKPYQCNECGKSFKNTTIFNVHQRIH--TGE
300 310 320 330 340 350
480 490 500 510 520 530
KIAA12 CPLTCDLCNKGFISSTSLESHMKLHSDQKTYSCIFCPESFDRLDLLKDHVAIHINDGYFT
:. :. :.:.. :..:: :.. :. .: : : : ..:.:. . .: :: .. .
KIAA13 KPFRCNECGKAYRSNSSLIVHIRTHTGEKPYECNECGKAFNRIANFTEHQRIHTGEKPYK
360 370 380 390 400 410
540 550 560 570 580 590
KIAA12 CPTCKKRFPDFIQVKKHVRSFHSEKIYQCTECDKAFCRPDKLRLHMLRHSDRKDFLCSTC
: : : : .. . : : .:: :.:::: ::: : ..: .:. :...: .::. :
KIAA13 CNECGKAFINYSCLTVHHRMHTGEKPYKCTECGKAFMRSSSLIIHQRIHTEEKPYLCNEC
420 430 440 450 460 470
600 610 620 630 640
KIAA12 GKQFKRKDKLREHMQRMHNPEREAKKADRISRSKTFKPRITSTDYDSF-----TFKCRLC
:..:. :..: : ::.:. :. : .: ..: .. ..... .:: :
KIAA13 GESFRIKSHLTVH-QRIHTGEKPYKCTDC---ERAFTKMVNLKEHQKIHTGVKPYKCYDC
480 490 500 510 520 530
650 660 670 680 690 700
KIAA12 MMGFRRRGMLVNHLSKRHPDMKIEEVPELTLPIIKPNRDYFCQYCDKVYKSASKRKAHIL
.:: ...:. : .. : : : : :. :.:.. ..:. .:
KIAA13 GKSFRTKSYLIVH-QRTHTGEK---------P-------YKCNECEKAFTNTSQLTVH-Q
540 550 560 570
710 720 730 740 750 760
KIAA12 KNHPGAELPPSIRKLRPAGPG-EPDPMLSTHTQLTGTIATPPVCCPHCSKQYSSKTKMVQ
. : : : : : : . ..:: : : : . : : :.: .:. .....
KIAA13 RRHTG-EKP---YKCNECGKVFTSNSGFNTH-QRTHT-GEKPFKCNDCGKAFSQMVHVTE
580 590 600 610 620
770 780 790 800 810 820
KIAA12 HIRKKHPEFAQLSNTIHTPLTTAVISATPAVLTTDSATGETVVTTDLLTQAMTELSQTLT
: .: :
KIAA13 H-QKIHSGEKPYKCDVCGKAFRRGSYLTVHWRTHTGEKPYTCKECGKGCITLSQLTLHQR
630 640 650 660 670 680
>>KIAA1829 ( 557 res) hj00069 (557 aa)
initn: 967 init1: 337 opt: 479 Z-score: 292.8 bits: 64.9 E(): 3.4e-11
Smith-Waterman score: 506; 28.909% identity (53.687% similar) in 339 aa overlap (437-773:243-555)
410 420 430 440 450 460
KIAA12 PTQSTLTADDMRRAKRIRLELQNAALQHLFIRKSFRPFKCLQCGKAFREKDKLDQHLRFH
:... .:. : .::::: . :..: : :
KIAA18 QTTHFGKLPHGYDECGDAFSCYSFFTQPQRIHSGEKPYACNDCGKAFSHDFFLSEHQRTH
220 230 240 250 260 270
470 480 490 500 510 520
KIAA12 GREGNCPLTCDLCNKGFISSTSLESHMKLHSDQKTYSCIFCPESFDRLDLLKDHVAIHIN
:. : : :::.: .:. : .:...:. .: ..: : ..:.: .: .: :: .
KIAA18 I--GEKPYECKECNKAFRQSAHLAQHQRIHTGEKPFACNECGKAFSRYAFLVEHQRIHTG
280 290 300 310 320 330
530 540 550 560 570 580
KIAA12 DGYFTCPTCKKRFPDFIQVKKHVRSFHSEKIYQCTECDKAFCRPDKLRLHMLRHSDRKDF
. . : :.: : . ....: : .:: :.:..: ::: : : ::. :. .: :
KIAA18 EKPYECKECNKAFRQSAHLNQHQRIHTGEKPYECNQCGKAFSRRIALTLHQRIHTGEKPF
340 350 360 370 380 390
590 600 610 620 630 640
KIAA12 LCSTCGKQFKRKDKLREHMQRMHNPER--EAKKADRISRSKTFKPRITSTDYDSFTFKCR
:: ::: : ...: .: ::.:. :. : : .. :. . : :.:
KIAA18 KCSECGKTFGYRSHLNQH-QRIHTGEKPYECIKCGKFFRTDSQLNRHHRIHTGERPFECS
400 410 420 430 440
650 660 670 680 690 700
KIAA12 LCMMGFRRRGMLVNHLSKRHPDMKIEEVPELTLPIIKPNRDYFCQYCDKVYKSASKRKAH
: .: .:..: .. : : : : :. : :... .: . :
KIAA18 KCGKAFSDALVLIHH-KRSHAGEK---------P-------YECNKCGKAFSCGSYLNQH
450 460 470 480 490
710 720 730 740 750 760
KIAA12 ILKNHPGAELPPSIRKLRPAGPGEPDPMLSTHTQLTGTIATPPVCCPHCSKQYSSKTKMV
. : : : : . : . . .:: . . . : : .:....: . .
KIAA18 -QRIHTG-EKP---YECSECGKAFHQ-ILSLRLHQRIHAGEKPYKCNECGNNFSCVSALR
500 510 520 530 540
770 780 790 800 810 820
KIAA12 QHIRKKHPEFAQLSNTIHTPLTTAVISATPAVLTTDSATGETVVTTDLLTQAMTELSQTL
.: : .. :
KIAA18 RHQRIHNRETL
550
>>KIAA1611 ( 813 res) fj12627 (813 aa)
initn: 1564 init1: 295 opt: 473 Z-score: 287.2 bits: 64.4 E(): 7e-11
Smith-Waterman score: 502; 28.024% identity (54.867% similar) in 339 aa overlap (434-767:466-775)
410 420 430 440 450 460
KIAA12 SVVPTQSTLTADDMRRAKRIRLELQNAALQHLFIRKSFRPFKCLQCGKAFREKDKLDQHL
: :. . .:::: .:.:.: ....: .:
KIAA16 GRHRRVHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLATHQVIHTGTKPFKCNECSKVFTQNSQLANHR
440 450 460 470 480 490
470 480 490 500 510 520
KIAA12 RFHGREGNCPLTCDLCNKGFISSTSLESHMKLHSDQKTYSCIFCPESFDRLDLLKDHVAI
:.: :. : :. :.:.: .:: .:. .:: .: :.:: : .:: . . :..: .:
KIAA16 RIH--TGEKPYKCNECGKAFSVRSSLTTHQAIHSGEKPYKCIECGKSFTQKSHLRSHRGI
500 510 520 530 540 550
530 540 550 560 570 580
KIAA12 HINDGYFTCPTCKKRFPDFIQVKKHVRSFHSEKIYQCTECDKAFCRPDKLRLHMLRHSDR
: .. . : : : : . :. .: : .:: :.:..: .:: ..: .:. :. .
KIAA16 HSGEKPYKCNECGKVFAQTSQLARHWRVHTGEKPYKCNDCGRAFSDRSSLTFHQAIHTGE
560 570 580 590 600 610
590 600 610 620 630 640
KIAA12 KDFLCSTCGKQFKRKDKLREHMQRMHNPEREAKKADRISRSKTFKPRITSTDY---DSFT
: . : ::: :.... : : .:.:. :. : .. ... ... .:.
KIAA16 KPYKCHECGKVFRHNSYLATH-RRIHTGEKPYK-CNECGKAFSMHSNLTTHKVIHTGEKP
620 630 640 650 660 670
650 660 670 680 690 700
KIAA12 FKCRLCMMGFRRRGMLVNHLSKRHPDMKIEEVPELTLPIIKPNRDYFCQYCDKVYKSASK
.:: : : . . :.:: .. : : : : :. : :... :.
KIAA16 YKCNQCGKVFTQNSHLANH-QRTHTGEK-------------PYR---CNECGKAFSVRSS
680 690 700 710
710 720 730 740 750
KIAA12 RKAHILKNHPGAELPPSIRKLRPAGPG-EPDPMLSTHTQL-TGTIATPPVCCPHCSKQYS
.: : : . : : : . :..: .. :: : : .:.: .
KIAA16 LTTH-QAIHTGKK-P---YKCNECGKVFTQNAHLANHRRIHTGE---KPYRCTECGKAFR
720 730 740 750 760
760 770 780 790 800 810
KIAA12 SKTKMVQHIRKKHPEFAQLSNTIHTPLTTAVISATPAVLTTDSATGETVVTTDLLTQAMT
..... :.
KIAA16 VRSSLTTHMAIHTGEKRYKCNECGKVFRQSSNLASHHRMHTGEKPYK
770 780 790 800 810
>>KIAA1806 ( 481 res) fk00438 (481 aa)
initn: 682 init1: 286 opt: 465 Z-score: 285.6 bits: 63.4 E(): 8.6e-11
Smith-Waterman score: 465; 36.066% identity (65.027% similar) in 183 aa overlap (428-609:277-456)
400 410 420 430 440 450
KIAA12 QPQHEESVVPTQSTLTADDMRRAKRIRLELQNAALQ-HLFIRKSFRPFKCLQCGKAFREK
: ..:. :. . . .::.: ::::::::.
KIAA18 FTRNFNLILHQRNHTGEKPYECKDCGKAFNQPSSLRSHVRTHTGEKPFECSQCGKAFREH
250 260 270 280 290 300
460 470 480 490 500 510
KIAA12 DKLDQHLRFHGREGNCPLTCDLCNKGFISSTSLESHMKLHSDQKTYSCIFCPESFDRLDL
..: ::: : :: : :. :.: : .:: :. : ..:. .: : : : . ..::.
KIAA18 SSLKTHLRTHTREK--PYECNQCGKPFRTSTHLNVHKRIHTGEKLYECATCGQVLSRLST
310 320 330 340 350 360
520 530 540 550 560 570
KIAA12 LKDHVAIHINDGYFTCPTCKKRFPDFIQVKKHVRSFHSEKIYQCTECDKAFCRPDKLRLH
::.:. : .. ..: : . : . ...::.:. ..: : : :: .:: . ..: .:
KIAA18 LKSHMRTHTGEKPYVCQECGRAFSEPSSLRKHARTHSGKKPYACQECGRAFGQSSHLIVH
370 380 390 400 410 420
580 590 600 610 620 630
KIAA12 MLRHSDRKDFLCSTCGKQFKRKDKLREHMQRMHNPEREAKKADRISRSKTFKPRITSTDY
. :: . . :. : : :.....: : .: :
KIAA18 VRTHSAGRPYQCNQCEKAFRHSSSLTVH-KRTHVGRETIRNGSLPLSMSHPYCGPLAN
430 440 450 460 470 480
640 650 660 670 680 690
KIAA12 DSFTFKCRLCMMGFRRRGMLVNHLSKRHPDMKIEEVPELTLPIIKPNRDYFCQYCDKVYK
>>KIAA1956 ( 680 res) fk08713 (680 aa)
initn: 799 init1: 160 opt: 467 Z-score: 284.8 bits: 63.7 E(): 9.5e-11
Smith-Waterman score: 511; 28.863% identity (54.519% similar) in 343 aa overlap (434-771:252-564)
410 420 430 440 450 460
KIAA12 SVVPTQSTLTADDMRRAKRIRLELQNAALQHLFIRKSFRPFKCLQCGKAFREKDKLDQHL
: .. . ::..: .:::.: .: .: ::
KIAA19 FVQQQRLPSREECYCWECGKSFSKYDSVSNHQRVHTGKRPYECGECGKSFSHKGSLVQHQ
230 240 250 260 270 280
470 480 490 500 510 520
KIAA12 RFHGREGNCPLTCDLCNKGFISSTSLESHMKLHSDQKTYSCIFCPESFDRLDLLKDHVAI
: : :. : : :.:.: . :: .:...:. .. : : : .::.. : : .
KIAA19 RVH--TGKRPYECGECGKSFSHKGSLVQHQRVHTGERPYECGECGKSFSQNGTLIKHQRV
290 300 310 320 330
530 540 550 560 570 580
KIAA12 HINDGYFTCPTCKKRFPDFIQVKKHVRSFHSEKIYQCTECDKAFCRPDKLRLHMLRHSDR
: .. . : : : : . .. .: :. ::. :.: :: : : . : : :. .
KIAA19 HTGERPYECEECGKCFTQKGNLIQHQRGHTSERPYECEECGKCFSQKGTLTEHHRVHTRE
340 350 360 370 380 390
590 600 610 620 630 640
KIAA12 KDFLCSTCGKQFKRKDKLREHMQRMHNPEREAKKAD---RISRSKTFKPRITSTDYDSFT
. . :. :::.:.:: .::.: :: :. :: . .. .::. .. . : .
KIAA19 RPYECGECGKSFSRKGHLRNH-QRGHTGERPYECGECGKSFSRKGNLIQHQRSHTGER-P
400 410 420 430 440 450
650 660 670 680 690 700
KIAA12 FKCRLCMMGFRRRGMLVNHLSKRHPDMKIEEVPELTLPIIKPNRDYFCQYCDKVYKSASK
..:: : :: .. :..: .. : .: : :. : : ....:
KIAA19 YECRECRKLFRGKSHLIEH-QRVHTG----------------ERPYECNECGKSFQDSSG
460 470 480 490 500
710 720 730 740 750
KIAA12 RKAHILKNHPGAELPPSIRKLRPAGPGEPDPM-LSTHTQL-TGTIATPPVCCPHCSKQYS
..: . : : : : . : . :. : : .. :: : : .:.:..
KIAA19 FRVH-QRVHTG-EKP---FECSECGKSFPQSCSLLRHRRVHTGE---RPYECGECGKSFH
510 520 530 540 550
760 770 780 790 800 810
KIAA12 SKTKMVQHIRKKHPEFAQLSNTIHTPLTTAVISATPAVLTTDSATGETVVTTDLLTQAMT
.......: .: :
KIAA19 QSSSLLRH-QKTHTAERPYECRECGKFFSSLLEHRRVHTGERPYECRECGKTFTRRSAHF
560 570 580 590 600 610
>>KIAA0065 ( 848 res) ha00946 (848 aa)
initn: 1015 init1: 223 opt: 464 Z-score: 281.8 bits: 63.5 E(): 1.4e-10
Smith-Waterman score: 488; 27.920% identity (53.276% similar) in 351 aa overlap (439-773:361-699)
410 420 430 440 450 460
KIAA12 QSTLTADDMRRAKRIRLELQNAALQHLFIRKSFRPFKCLQCGKAFREKDKLDQHLRFHGR
:. . :.: .::::: ::..: .: : :
KIAA00 HGVSMKHYDCGESGNNFRRKLCLSHLQKGDKGEKHFECNECGKAFWEKSHLTRHQRVH--
340 350 360 370 380
470 480 490 500 510 520
KIAA12 EGNCPLTCDLCNKGFISSTSLESHMKLHSDQKTYSCIFCPESFDRLDLLKDHVAIHINDG
:. :. :. :.:.: ....: .:.. :. .: . : : ..:.. . : : : ..
KIAA00 TGQKPFQCNECEKAFWDKSNLTKHQRSHTGEKPFECNECGKAFSHKSALTLHQRTHTGEK
390 400 410 420 430 440
530 540 550 560 570 580
KIAA12 YFTCPTCKKRFPDFIQVKKHVRSFHSEKIYQCTECDKAFCRPDKLRLHMLRHSDRKDFLC
. : .: : : . .. :: :. . : :.: :: :.: ..:..:. :. .: : :
KIAA00 PYQCNACGKTFCQKSDLTKHQRTHTGLKPYECYECGKSFRVTSHLKVHQRTHTGEKPFEC
450 460 470 480 490 500
590 600 610 620 630 640
KIAA12 STCGKQFKRKDKLREHMQRMHNPER--EAKKADRISRSKTFKPR--ITSTDYDSFTFKCR
:::.:..:..: .: ::.: .. : . . :.. : : : . . .:
KIAA00 LECGKSFSEKSNLTQH-QRIHIGDKSYECNACGKTFYHKSLLTRHQIIHTGWKPY--ECY
510 520 530 540 550 560
650 660 670 680 690
KIAA12 LCMMGFRRRGMLVNHLSKRHPDMKIEEVPEL--------TLP----IIKPNRDYFCQYCD
: : .. :. : .. : .: :: :: .. : :. :
KIAA00 ECGKTFCLKSDLTVH-QRTHTGQKPFACPECGKFFSHKSTLSQHYRTHTGEKPYECHECG
570 580 590 600 610 620
700 710 720 730 740 750
KIAA12 KVYKSASKRKAHILKNHPGAELPPSIRKLRPAGPGEPDPMLSTHTQLTGTIATPPVCCPH
:.. . : : ..: : : : . : . .:. : .. :. : : .
KIAA00 KIFYNKSYLTKHN-RTHTG-EKPYECNECGKAFYQKS--QLTQHQRI--HIGEKPYKCNE
630 640 650 660 670
760 770 780 790 800 810
KIAA12 CSKQYSSKTKMVQHIRKKHPEFAQLSNTIHTPLTTAVISATPAVLTTDSATGETVVTTDL
:.: . :. .. : : . :
KIAA00 CGKAFCHKSALIVHQRTHTQEKPYKCNECGKSFCVKSGLIFHERKHTGEKPYECNECGKF
680 690 700 710 720 730
1061 residues in 1 query sequences
1986444 residues in 2037 library sequences
Scomplib [34.26]
start: Thu Dec 18 15:14:03 2008 done: Thu Dec 18 15:14:04 2008
Total Scan time: 0.680 Total Display time: 0.180
Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]