# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fg03353.fasta.nr -Q ../query/KIAA1202.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

 KIAA1202, 1502 aa
 vs /cdna2/lib/nr/nr library

2693465022 residues in 7827732 sequences
 statistics sampled from 60000 to 7812988 sequences
  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1898+/-0.00021; mu= 11.7508+/- 0.012
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 Lambda= 0.105182

FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
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gi|109499527|ref|XP_223229.4| PREDICTED: similar t (1986)  827 138.9 3.5e-29
gi|149033855|gb|EDL88651.1| similar to PDZ domain  (1987)  823 138.3 5.4e-29
gi|194227661|ref|XP_001488443.2| PREDICTED: simila (1538)  821 137.9 5.6e-29
gi|221042982|dbj|BAH13168.1| unnamed protein produ ( 451)  812 135.9 6.5e-29
gi|74007103|ref|XP_548854.2| PREDICTED: similar to (1630)  818 137.5   8e-29
gi|74001898|ref|XP_850003.1| PREDICTED: similar to (2151)  816 137.3 1.2e-28
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gi|189520270|ref|XP_700005.3| PREDICTED: similar t (1657)  801 134.9 4.9e-28
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gi|193785922|dbj|BAG54709.1| unnamed protein produ (1774)  801 134.9 5.1e-28
gi|109074409|ref|XP_001094662.1| PREDICTED: simila (1780)  801 134.9 5.1e-28
gi|47213455|emb|CAF95451.1| unnamed protein produc (1578)  800 134.7 5.2e-28
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gi|119626200|gb|EAX05795.1| shroom, isoform CRA_b  (1996)  801 135.0 5.5e-28
gi|109074407|ref|XP_001094783.1| PREDICTED: simila (2001)  801 135.0 5.5e-28
gi|123884799|sp|Q09JY9.1|SHRM2_XENTR RecName: Full (1726)  800 134.8 5.5e-28
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gi|74184685|dbj|BAE27948.1| unnamed protein produc (1805)  788 133.0   2e-27
gi|219519297|gb|AAI45114.1| Unknown (protein for M (1849)  788 133.0   2e-27


>>gi|147733019|sp|Q9ULL8.2|SHRM4_HUMAN RecName: Full=Pro  (1498 aa)
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Smith-Waterman score: 10251;  100.000% identity (100.000% similar) in 1498 aa overlap (5-1502:1-1498)

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           ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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KIAA12 QKKIQLIESISRKLSVLREAQRGLLEDINANSALGEEVEANLKAVCKSNEFEKYHLFVGD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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KIAA12 LDKVVNLLLSLSGRLARVENALNSIDSEANQEKLVLIEKKQQLTGQLADAKELKEHVDRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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KIAA12 NF
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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KIAA12 NF
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gi|118 NF
         

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KIAA12   AQPRMENRPGSFQYVPVQLQGGAPWGFTLKGGLEHCEPLTVSKIEDGGKAALSQKMRT
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|740 GDELVNINGTPLYGSRQEALILIKGSFRILKLIVRRRNAPVSRPHSWHVAKLLEGCPEAA
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KIAA12 TTMHFPSEAFSLSWHSGCNTSDVCVQWCPLSRHCSTEKSSSIGSMESLEQPGQATYESHL
       ::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::
gi|740 TTMHFPSEAFSLSWHSGCNTGDVCVQWCPLSRHCSTEKSSSIGSMESLEQPGQATYEGHL
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KIAA12 LPIDQNMYPNQRDSAYSSFSASSNASDCALSLRPEEPASTDCIMQGPGPTKAPSGRPNVA
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.::.::: ::.:::.:::.::
gi|740 LPIDQNMYPNQRDSAYSSFSASSNASDCALSLRPEEPGSADCVMQGSGPAKAPNGRPSVA
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KIAA12 ETSGGSRRTNGGHLTPSSQMSSRPQEGYQSGPAKAVRGPPQPPVRRDSLQASRAQLLNGE
       :::::::: ::.: : :::::: :.: ..: ::::.::::::::::::::::::::::::
gi|740 ETSGGSRRPNGSHPTLSSQMSSCPEEDHHSEPAKAARGPPQPPVRRDSLQASRAQLLNGE
         470       480       490       500       510       520     

      300       310       320       330       340       350        
KIAA12 QRRASEPVVPLPQKEKLSLEPVLPARNPNRFCCLSGHDQVTSEGHQNCEFSQPPESSQQG
       ::::::::  : :.::.::. ::  :::::::::::.::::.:::::::.:: :::::: 
gi|740 QRRASEPVDSL-QQEKVSLDTVLSPRNPNRFCCLSGQDQVTNEGHQNCELSQAPESSQQD
         530        540       550       560       570       580    

      360       370       380       390       400       410        
KIAA12 SEHLLMQASTKAVGSPKACDRASSVDSNPLNEASAELAKASFGRPPHLIGPTGHRHSAPE
       ::::.:.::.::.: :::::.:::.: .:::.::::::::::: :::: :::::::::::
gi|740 SEHLIMEASAKAAGFPKACDKASSIDYSPLNKASAELAKASFGGPPHLTGPTGHRHSAPE
          590       600       610       620       630       640    

      420       430       440       450       460       470        
KIAA12 QLLASHLQHVHLDTRGSKGMELPPVQDGHQWTLSPLHSSHKGKKSPCPPTGGTHDQSSKE
       ::::::::. ::::::::: :::  .:::.:::::::::: ::::::::::::.:: :::
gi|740 QLLASHLQYGHLDTRGSKGTELPAGHDGHEWTLSPLHSSHTGKKSPCPPTGGTQDQHSKE
          650       660       670       680       690       700    

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KIAA12 RKTRQVDDRSLVLGHQSQSSPPHGEADGHPSEKGFLDPNRTSRAASELANQQPSASGSLV
       ::.:::::: :  :::: :: : ::::::: :::: ::::.: :.:: :.:::::::::.
gi|740 RKARQVDDRPLCSGHQSPSSSPLGEADGHPPEKGFQDPNRASGAGSESASQQPSASGSLI
          710       720       730       740       750       760    

      540       550       560       570       580       590        
KIAA12 QQATDCSSTTKAASGTEAGEEGDSEPKECSRMGGRRSGGTRGRSIQNRRKSERFATNLRN
       ::. :::::::.:..::: ::::::::::. .::::  : ::::::::::::::::::::
gi|740 QQTRDCSSTTKVADSTEATEEGDSEPKECGWVGGRRHRGPRGRSIQNRRKSERFATNLRN
          770       780       790       800       810       820    

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KIAA12 EIQRRKAQLQKSKGPLSQLCDTKEPVEETQEPPESPPLTASNTSLLSSCKKPPSPRDKLF
       :::::::::::::. :::::::.::::::.:: ::::  .::.::::: :::::::::::
gi|740 EIQRRKAQLQKSKNSLSQLCDTQEPVEETEEPLESPPPPTSNSSLLSSYKKPPSPRDKLF
          830       840       850       860       870       880    

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KIAA12 NKSMMLRARSSECLSQAPESHESRTGLEGRISPGQRPGQSSLGLNTWWKAPDPSSSDPEK
       .:::.::::::::::::::::::::::::.::::::::: :::::::::. : : :: ::
gi|740 TKSMILRARSSECLSQAPESHESRTGLEGQISPGQRPGQPSLGLNTWWKVSDSSPSDSEK
          890       900       910       920       930       940    

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KIAA12 AHAHCGVRGGHWRWSPEHNSQPLVAAAMEGPSNPGDNKELKASTAQAGEDAILLPFADRR
       ...: :::::::::::::: :: :: :::.::: ::.:::::::: :::.::::::::::
gi|740 TNVHRGVRGGHWRWSPEHNLQPHVALAMESPSNLGDSKELKASTAPAGEEAILLPFADRR
          950       960       970       980       990      1000    

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KIAA12 KFFEESSKSLSTSHLPGLTTHSNKTFTQRPKPIDQNFQPMSSSCRELRRHPMDQSYHSAD
       :.:::.::::::::::::::::.:::::::::.: ::::.::: ::::.: ::::::   
gi|740 KLFEEGSKSLSTSHLPGLTTHSSKTFTQRPKPVDPNFQPLSSSYRELRHHLMDQSYH---
         1010      1020      1030      1040      1050      1060    

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KIAA12 QPYHATDQSYHSMSPLQSETPTYSECFASKGLENSMCCKPLHCGDFDYHRTCSYSCSVQG
           ::::::::.: :::::: :::::::::::.::::::::::::::::::::::::::
gi|740 ----ATDQSYHSVSLLQSETPPYSECFASKGLEQSMCCKPLHCGDFDYHRTCSYSCSVQG
                1070      1080      1090      1100      1110       

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KIAA12 ALVHDPCIYCSGEICPALLKRNMMPNCYNCRCHHHQCIRCSVCYHNPQHSALEDSSLAPG
       :.:::::.:::::::::: ::::::::::: ::::::.:::.:::::::.. ::.:::::
gi|740 AIVHDPCMYCSGEICPALRKRNMMPNCYNCWCHHHQCFRCSACYHNPQHNSPEDGSLAPG
      1120      1130      1140      1150      1160      1170       

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KIAA12 NTWKPRKLTVQEFPGDKWNPITGNRKTSQSGREMAHSKTSFSWATPFHPCLENPALDLSS
       ::::::: ::::::::::.::::::::::::::::: :.:.::::::::::::: :::::
gi|740 NTWKPRKPTVQEFPGDKWKPITGNRKTSQSGREMAHPKASLSWATPFHPCLENPPLDLSS
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KIAA12 YRAISSLDLLGDFKHALKKSEETSVYEEGSSLASMPHPLRSRAFSESHISLAPQSTRAWG
       :::::::::::::::. ::..:::.:::: :.::.:.::::::::::::.: :::.::::
gi|740 YRAISSLDLLGDFKHSSKKTDETSLYEEGRSMASVPYPLRSRAFSESHINLEPQSSRAWG
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KIAA12 QHRRELFSKGDETQSDLLGARKKAFPPPRPPPPNWEKYRLFRAAQQQKQQQQQQQQQQKQ
       :::::::.: :::: : ::::::::::::::::::::::::::.:::.::::::::::  
gi|740 QHRRELFTKVDETQPDPLGARKKAFPPPRPPPPNWEKYRLFRAVQQQQQQQQQQQQQQ--
      1300      1310      1320      1330      1340      1350       

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KIAA12 QEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEAEEEEEELPPQYFSSETSGSCALNPEEVLEQPQPLSFG
            ::: :.::.::.::. :   ::::::::::::::.:  ::.:::::::::::.::
gi|740 -----EEEAEDEEDEEQEERGEKGGEEEELPPQYFSSETTGMSALHPEEVLEQPQPLGFG
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     1200      1210      1220      1230      1240      1250        
KIAA12 HLEGSRQGSQSVPAEQESFALHSSDFLPPIRGHLGSQPEQAQPPCYYGIGGLWRTSGQEA
       :::. :::  : ::::::: :: ..::::::.:::: ::.:: : ::: ::::::: .:.
gi|740 HLEAPRQGLPSFPAEQESFDLHPGNFLPPIRSHLGSPPEKAQHPGYYGTGGLWRTSEKET
             1420      1430      1440      1450      1460      1470

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KIAA12 TESAKQEFQHFSPPSGAPGIPTSYSAYYNISVAKAELLNKLKDQPEMAEIGLGEEEVDHE
       :.: :::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :
gi|740 TDSPKQEFQHFSPPLGAPGIPTSYSAYYNISVAKAELLNKLKDQPEMAEIGLGEEEVDPE
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KIAA12 LAQKKIQLIESISRKLSVLREAQRGLLEDINANSALGEEVEANLKAVCKSNEFEKYHLFV
       ::::::::::::.:::::::::::::::::.:::::::::::::::.:::::::::.::.
gi|740 LAQKKIQLIESIGRKLSVLREAQRGLLEDISANSALGEEVEANLKAICKSNEFEKYRLFI
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KIAA12 GDLDKVVNLLLSLSGRLARVENALNSIDSEANQEKLVLIEKKQQLTGQLADAKELKEHVD
       ::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::: ::::::::::
gi|740 GDLDKVVNLLLSLSGRLARVENALNSIDAEANQEKLVLIEKKQQLTGQLQDAKELKEHVD
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KIAA12 RREKLVFGMVSRYLPQDQLQDYQHFVKMKSALIIEQRELEEKIKLGEEQLKCLRESLLLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|740 RREKLVFGMVSRYLPQDQLQDYQHFVKMKSALIIEQRELEEKIKLGEEQLKCLRESLLLG
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     1500  
KIAA12 PSNF
       ::::
gi|740 PSNF
           

>>gi|109130785|ref|XP_001083331.1| PREDICTED: similar to  (1400 aa)
 initn: 7719 init1: 6234 opt: 6234  Z-score: 5116.1  bits: 959.2 E():    0
Smith-Waterman score: 8253;  83.651% identity (85.161% similar) in 1523 aa overlap (44-1502:26-1400)

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KIAA12 YVPVQLQGGAPWGFTLKGGLEHCEPLTVSKIEDGGKAALSQKMRTGDELVNINGTPLYGS
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
gi|109      MNSWPDAVVQETVCARTQKVAAERAIEDGGKAALSQKMRTGDELVNINGTPLYGS
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KIAA12 RQEALILIKGSFRILKLIVRRRNAPVSRPHSWHVAKLLEGCPEAATTMHFPSEAFSLSWH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|109 SGCNTSDVCVQWCPLSRHCSTEKSSSIGSMESLEQPGQATYESHLLPIDQNMYPNQRDSA
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KIAA12 YSSFSASSNASDCALSLRPEEPASTDCIMQGPGPTKAPSGRPNVAETSGGSRRTNGGHLT
       ::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|109 YSSFSASSNASDCALSLRPEEAASTDCIMQGPGPTKAPSGRPNVAETSGGSRRTNGGHLT
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KIAA12 PSSQMSSRPQEGYQSGPAKAVRGPPQPPVRRDSLQASRAQLLNGEQRRASEPVVPLPQKE
       ::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|109 PSSQMSSRPQEGHQSGPAKAVRGPPQPPVRRDSLQASRAQLLNGEQRRASEPVVPLPQKE
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KIAA12 KLSLEPVLPARNPNRFCCLSGHDQVTSEGHQNCEFSQPPESSQQGSEHLLMQASTKAVGS
       ::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|109 KLSLETVLPARNPNRFCCLSGHDQVTSEGHQNCEFSQPPESSQQGSEHLLMQASTKAVGS
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KIAA12 PKACDRASSVDSNPLNEASAELAKASFGRPPHLIGPTGHRHSAPEQLLASHLQHVHLDTR
       :::::.:::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|109 PKACDKASSTDSNPLNEASAELAKASFGRPPHLIGPTGHRHSAPEQLLASHLQHVHLDTR
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KIAA12 GSKGMELPPVQDGHQWTLSPLHSSHKGKKSPCPPTGGTHDQSSKERKTRQVDDRSLVLGH
       ::::::::: :::.::::::::::::::::::::.:::::::::::::::.:::::::::
gi|109 GSKGMELPPGQDGQQWTLSPLHSSHKGKKSPCPPAGGTHDQSSKERKTRQMDDRSLVLGH
         420       430       440       450       460       470     

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KIAA12 QSQSSPPHGEADGHPSEKGFLDPNRTSRAASELANQQPSASGSLVQQATDCSSTTKAASG
       :::::::::::::::::::.:::::::::..:::::::::::::::.: :::::::.:.:
gi|109 QSQSSPPHGEADGHPSEKGLLDPNRTSRAGNELANQQPSASGSLVQKARDCSSTTKVAGG
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KIAA12 TEAGEEGDSEPKECSRMGGRRSGGTRGRSIQNRRKSERFATNLRNEIQRRKAQLQKSKGP
       :::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|109 TEAGEEGDSEHKECSRMGGRRSGGTRGRSIQNRRKSERFATNLRNEIQRRKAQLQKSKGP
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KIAA12 LSQLCDTKEPVEETQEPPESPPLTASNTSLLSSCKKPPSPRDKLFNKSMMLRARSSECLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|109 LSQLCDTKEPVEETQEPPESPPLTASNTSLLSSCKKPPSPRDKLFNKSMMLRARSSECLS
         600       610       620       630       640       650     

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KIAA12 QAPESHESRTGLEGRISPGQRPGQSSLGLNTWWKAPDPSSSDPEKAHAHCGVRGGHWRWS
       ::::::::::::::::::::: ::::: ::::::::::::::::::.:::::.:::::::
gi|109 QAPESHESRTGLEGRISPGQRLGQSSLVLNTWWKAPDPSSSDPEKARAHCGVHGGHWRWS
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KIAA12 PEHNSQPLVAAAMEGPSNPGDNKELKASTAQAGEDAILLPFADRRKFFEESSKSLSTSHL
        :::::::::.:::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::
gi|109 REHNSQPLVAVAMEGPSNPGDNKELKASTAQAGEDAVLLPFADRRKFFEESSKSLSTSHL
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       ::::::::::::::::::::::::.::. :::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       :::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::: :::    
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KIAA12 ------------------------------------------------------------
                                                                   
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KIAA12 EEEEEEEEEEEAEEEEEELPPQYFSSETSGSCALNPEEVLEQPQPLSFGHLEGSRQGSQS
                                                                   
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KIAA12 VPAEQESFALHSSDFLPPIRGHLGSQPEQAQPPCYYGIGGLWRTSGQEATESAKQEFQHF
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gi|109 ------------------------------------------------------QEFQPF
                                                                   

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       ::: :::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. :::::::::::::
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       :.:::::.::::::::::::::::::::::.:::: ::::.:.::::::. . . ::.::
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       ::.:. :.:::.: .:. ::  .::..::::: :::::.::::::::::::::::::::.
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       ::::::  : :::: .:: .:: :. :.:::.::.::::.: :::::.:.: ::::.  .
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       :. :  :..:... ::: ::::.:::: .:.::::::: :::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::: ::::::::::::: :::.::: : :. ::  :.:::
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       :::.:::::::::::: :: ..:.:::::.::::: :::::.::::::: : :. : :::
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       ..::::: :::::::::::::..:.:.::::::::::::. : :.:::.: ::::.: ::
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KIAA12 HRRELFSKGDETQSDLLGARKKAFPPPRPPPPNWEKYRLFRAAQQQKQQQQQQQQQQKQQ
       ..:: ::::.::: : ::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::.::
gi|626 QQRESFSKGSETQPDTLGARKKAFPPPRPPPPNWEKYRLFRAAQQQQQQQQQQQQQQQQQ
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KIAA12 EEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEAEEEEEELPPQYFSSETSGSCALNPEEVLEQPQPLSFGH
       ... :.:::::.:.::.      :.::.::::::::::.::::   ::   ::: :..::
gi|626 QQQCEKEEEEEKEQEEK-----GEKEEDLPPQYFSSETTGSCAPITEE---QPQSLKMGH
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KIAA12 LEGSRQGSQSVPAEQESFALHSSDFLPPIRGHLGSQPEQAQPPCYYGIGGLWRTSGQEAT
        :.:::.:::.  :::..:.: :.:.: .:..  .:::.::::::::  :::::. ::::
gi|626 QEASRQSSQSLQ-EQEAYAVHPSNFVPAVRSYPVTQPEKAQPPCYYGAHGLWRTTEQEAT
        1190       1200      1210      1220      1230      1240    

    1260      1270      1280      1290      1300      1310         
KIAA12 ESAKQEFQHFSPPSGAPGIPTSYSAYYNISVAKAELLNKLKDQPEMAEIGLGEEEVDHEL
        . ::::::::::.:: ::::::::::::::::::::::::.:::::: ::::: ::.::
gi|626 VTPKQEFQHFSPPTGASGIPTSYSAYYNISVAKAELLNKLKQQPEMAEAGLGEEGVDYEL
         1250      1260      1270      1280      1290      1300    

    1320      1330      1340      1350      1360      1370         
KIAA12 AQKKIQLIESISRKLSVLREAQRGLLEDINANSALGEEVEANLKAVCKSNEFEKYHLFVG
       ::::::::::::::::::::::::::.:::::.:::::::.::::::::::.::::::.:
gi|626 AQKKIQLIESISRKLSVLREAQRGLLDDINANAALGEEVEVNLKAVCKSNELEKYHLFIG
         1310      1320      1330      1340      1350      1360    

    1380      1390      1400      1410      1420      1430         
KIAA12 DLDKVVNLLLSLSGRLARVENALNSIDSEANQEKLVLIEKKQQLTGQLADAKELKEHVDR
       :::::::::::::::::::::::::::.:.::::::: :::::::.::::::::::::::
gi|626 DLDKVVNLLLSLSGRLARVENALNSIDAESNQEKLVLREKKQQLTNQLADAKELKEHVDR
         1370      1380      1390      1400      1410      1420    

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KIAA12 REKLVFGMVSRYLPQDQLQDYQHFVKMKSALIIEQRELEEKIKLGEEQLKCLRESLLLGP
       ::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::: :::
gi|626 REKLVFSMVSRYLPQDQLQDYQHFVKMKSALIIEQRELEEKIKLGEEQLKCLKESLHLGP
         1430      1440      1450      1460      1470      1480    

    1500  
KIAA12 SNF
       :::
gi|626 SNF
          

>>gi|149744516|ref|XP_001496242.1| PREDICTED: shroom fam  (1483 aa)
 initn: 6581 init1: 2451 opt: 5051  Z-score: 4145.6  bits: 779.7 E():    0
Smith-Waterman score: 8997;  88.526% identity (94.463% similar) in 1499 aa overlap (5-1502:1-1483)

               10        20        30        40        50        60
KIAA12 AQPRMENRPGSFQYVPVQLQGGAPWGFTLKGGLEHCEPLTVSKIEDGGKAALSQKMRTGD
           ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|149     MENRPGSFQYVPVQLQGGAPWGFTLKGGLEHCEPLTVSKIEDGGKAALSQKMRTGD
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::.::::
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       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:::::::::.::::::.:
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       ::::.:::::::: :::::: ::: ..:::::..::::::::::::::::::::::::::
gi|149 SGGSQRTNGGHLTSSSQMSSCPQEVHHSGPAKTTRGPPQPPVRRDSLQASRAQLLNGEQR
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       ::::::  : :::: ::: .:  :::::::::::.::::.:::::::.:: :: ::::::
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KIAA12 HLLMQASTKAVGSPKACDRASSVDSNPLNEASAELAKAS-FGRPPHLIGPTGHRHSAPEQ
       ::::.::.:::: ::: :.::::::.:::.::::::::: ::   ::   ::::::::::
gi|149 HLLMEASAKAVGFPKAYDKASSVDSSPLNKASAELAKASSFGSTLHL---TGHRHSAPEQ
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KIAA12 LLASHLQHVHLDTRGSKGMELPPVQDGHQWTLSPLHSSHKGKKSPCPPTGGTHDQSSKER
       :::::::.::::::::::.:::  ::::.::::::::::  :::::: .:::.:: ::::
gi|149 LLASHLQRVHLDTRGSKGIELPTGQDGHEWTLSPLHSSHTEKKSPCPSAGGTQDQPSKER
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KIAA12 KTRQVDDRSLVLGHQSQSSPPHGEADGHPSEKGFLDPNRTSRAASELANQQPSASGSLVQ
       ::: :::: :  :::: :: ::::::::: :.:: ::::..   :::: :::::: ::.:
gi|149 KTRPVDDRPLGSGHQSPSSSPHGEADGHPPERGFQDPNRVG---SELAIQQPSASDSLIQ
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KIAA12 QATDCSSTTKAASGTEAGEEGDSEPKECSRMGGRRSGGTRGRSIQNRRKSERFATNLRNE
       :. :::.:::. ..::: ::::.:::::.:.::::.::::::::::::::::::::::::
gi|149 QTRDCSATTKVPGSTEATEEGDKEPKECGRVGGRRNGGTRGRSIQNRRKSERFATNLRNE
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KIAA12 IQRRKAQLQKSKGPLSQLCDTKEPVEETQEPPESPPLTASNTSLLSSCKKPPSPRDKLFN
       ::::::::::::.:::::::::::::::.:: ::: :  ::.::::: ::::::::::::
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KIAA12 KSMMLRARSSECLSQAPESHESRTGLEGRISPGQRPGQSSLGLNTWWKAPDPSSSDPEKA
       :::.::::::::::::::::::::::::.:::::::::.:::::::::: :::::: ::.
gi|149 KSMILRARSSECLSQAPESHESRTGLEGQISPGQRPGQASLGLNTWWKASDPSSSDSEKT
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KIAA12 HAHCGVRGGHWRWSPEHNSQPLVAAAMEGPSNPGDNKELKASTAQAGEDAILLPFADRRK
        .:::::::.:::::::: :: :: ::::::::::::::::::.::::..::::::::::
gi|149 DVHCGVRGGQWRWSPEHNLQPHVALAMEGPSNPGDNKELKASTSQAGEETILLPFADRRK
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KIAA12 FFEESSKSLSTSHLPGLTTHSNKTFTQRPKPIDQNFQPMSSSCRELRRHPMDQSYHSADQ
       ::::::::.:::::::::::.::::::::::::.:::::::. ::::::::::       
gi|149 FFEESSKSVSTSHLPGLTTHGNKTFTQRPKPIDRNFQPMSSTYRELRRHPMDQ-------
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KIAA12 PYHATDQSYHSMSPLQSETPTYSECFASKGLENSMCCKPLHCGDFDYHRTCSYSCSVQGA
       ::::::::::::::::::::::::::.:::::.::::::::::::::::::::::.::::
gi|149 PYHATDQSYHSMSPLQSETPTYSECFVSKGLEQSMCCKPLHCGDFDYHRTCSYSCNVQGA
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KIAA12 LVHDPCIYCSGEICPALLKRNMMPNCYNCRCHHHQCIRCSVCYHNPQHSALEDSSLAPGN
       .:::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::.:.::::::.::::::::::
gi|149 VVHDPCIYCSGEICPALRKRNMMPNCYNCRCHHHQCIRCSACHHNPQHSTLEDSSLAPGN
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KIAA12 TWKPRKLTVQEFPGDKWNPITGNRKTSQSGREMAHSKTSFSWATPFHPCLENPALDLSSY
       :::::: ::::::::::.:::::::::::::::::::.::::::::::: ::::::::::
gi|149 TWKPRKPTVQEFPGDKWKPITGNRKTSQSGREMAHSKASFSWATPFHPCTENPALDLSSY
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KIAA12 RAISSLDLLGDFKHALKKSEETSVYEEGSSLASMPHPLRSRAFSESHISLAPQSTRAWGQ
       ::::::::::::::.:::.:::::::::::.::.:.:::::::::::::: :::.:::::
gi|149 RAISSLDLLGDFKHSLKKTEETSVYEEGSSMASVPRPLRSRAFSESHISLEPQSSRAWGQ
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KIAA12 HRRELFSKGDETQSDLLGARKKAFPPPRPPPPNWEKYRLFRAAQQQKQQQQQQQQQQKQQ
       ::::.:.: :::: : ::::::::::::::::::::::::::   :.::::::::::.:.
gi|149 HRREIFTKVDETQPDPLGARKKAFPPPRPPPPNWEKYRLFRA---QQQQQQQQQQQQQQE
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KIAA12 EEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEAEEEEEELPPQYFSSETSGSCALNPEEVLEQPQPLSFGH
       :::::::::::::::  :::: : ::::::::::::::..::.::::::: : ::..:::
gi|149 EEEEEEEEEEEEEEEGVEEEEEEGEEEELPPQYFSSETTSSCTLNPEEVLVQAQPMAFGH
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KIAA12 LEGSRQGSQSVPAEQESFALHSSDFLPPIRGHLGSQPEQAQPPCYYGIGGLWRTSGQEAT
       :: :::::::.:::::::. ::::::: ::::::::::.:::::::::::::::: ::.:
gi|149 LETSRQGSQSLPAEQESFVHHSSDFLPSIRGHLGSQPEKAQPPCYYGIGGLWRTSEQETT
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KIAA12 ESAKQEFQHFSPPSGAPGIPTSYSAYYNISVAKAELLNKLKDQPEMAEIGLGEEEVDHEL
       .: ::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
gi|149 DSPKQEFQHFSPPQGAPGIPTSYSAYYNISVAKAELLNKLKDQPEMVEIGLGEEEVDHEL
             1250      1260      1270      1280      1290      1300

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KIAA12 AQKKIQLIESISRKLSVLREAQRGLLEDINANSALGEEVEANLKAVCKSNEFEKYHLFVG
       :::::::::::.:::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::.:
gi|149 AQKKIQLIESIGRKLSVLREAQRGLLEDISANSALGEEVEANLKAVCKSNEFEKYHLFIG
             1310      1320      1330      1340      1350      1360

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KIAA12 DLDKVVNLLLSLSGRLARVENALNSIDSEANQEKLVLIEKKQQLTGQLADAKELKEHVDR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|149 DLDKVVNLLLSLSGRLARVENALNSIDSEANQEKLVLIEKKQQLTGQLADAKELKEHVDR
             1370      1380      1390      1400      1410      1420

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KIAA12 REKLVFGMVSRYLPQDQLQDYQHFVKMKSALIIEQRELEEKIKLGEEQLKCLRESLLLGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|149 REKLVFGMVSRYLPQDQLQDYQHFVKMKSALIIEQRELEEKIKLGEEQLKCLRESLLLGP
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    1500  
KIAA12 SNF
       :::
gi|149 SNF
          

>>gi|15421201|gb|AAK95579.1| SHAP-A [Homo sapiens]     g  (723 aa)
 initn: 4990 init1: 4990 opt: 4990  Z-score: 4099.2  bits: 770.1 E():    0
Smith-Waterman score: 4990;  100.000% identity (100.000% similar) in 723 aa overlap (121-843:1-723)

              100       110       120       130       140       150
KIAA12 IVRRRNAPVSRPHSWHVAKLLEGCPEAATTMHFPSEAFSLSWHSGCNTSDVCVQWCPLSR
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
gi|154                               MHFPSEAFSLSWHSGCNTSDVCVQWCPLSR
                                             10        20        30

              160       170       180       190       200       210
KIAA12 HCSTEKSSSIGSMESLEQPGQATYESHLLPIDQNMYPNQRDSAYSSFSASSNASDCALSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|154 HCSTEKSSSIGSMESLEQPGQATYESHLLPIDQNMYPNQRDSAYSSFSASSNASDCALSL
               40        50        60        70        80        90

              220       230       240       250       260       270
KIAA12 RPEEPASTDCIMQGPGPTKAPSGRPNVAETSGGSRRTNGGHLTPSSQMSSRPQEGYQSGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|154 RPEEPASTDCIMQGPGPTKAPSGRPNVAETSGGSRRTNGGHLTPSSQMSSRPQEGYQSGP
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KIAA12 AKAVRGPPQPPVRRDSLQASRAQLLNGEQRRASEPVVPLPQKEKLSLEPVLPARNPNRFC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|154 AKAVRGPPQPPVRRDSLQASRAQLLNGEQRRASEPVVPLPQKEKLSLEPVLPARNPNRFC
              160       170       180       190       200       210

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KIAA12 CLSGHDQVTSEGHQNCEFSQPPESSQQGSEHLLMQASTKAVGSPKACDRASSVDSNPLNE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|154 CLSGHDQVTSEGHQNCEFSQPPESSQQGSEHLLMQASTKAVGSPKACDRASSVDSNPLNE
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KIAA12 ASAELAKASFGRPPHLIGPTGHRHSAPEQLLASHLQHVHLDTRGSKGMELPPVQDGHQWT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|154 ASAELAKASFGRPPHLIGPTGHRHSAPEQLLASHLQHVHLDTRGSKGMELPPVQDGHQWT
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KIAA12 LSPLHSSHKGKKSPCPPTGGTHDQSSKERKTRQVDDRSLVLGHQSQSSPPHGEADGHPSE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|154 LSPLHSSHKGKKSPCPPTGGTHDQSSKERKTRQVDDRSLVLGHQSQSSPPHGEADGHPSE
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KIAA12 KGFLDPNRTSRAASELANQQPSASGSLVQQATDCSSTTKAASGTEAGEEGDSEPKECSRM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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KIAA12 GGRRSGGTRGRSIQNRRKSERFATNLRNEIQRRKAQLQKSKGPLSQLCDTKEPVEETQEP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|154 GGRRSGGTRGRSIQNRRKSERFATNLRNEIQRRKAQLQKSKGPLSQLCDTKEPVEETQEP
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KIAA12 PESPPLTASNTSLLSSCKKPPSPRDKLFNKSMMLRARSSECLSQAPESHESRTGLEGRIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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KIAA12 PGQRPGQSSLGLNTWWKAPDPSSSDPEKAHAHCGVRGGHWRWSPEHNSQPLVAAAMEGPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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KIAA12 NPGDNKELKASTAQAGEDAILLPFADRRKFFEESSKSLSTSHLPGLTTHSNKTFTQRPKP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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KIAA12 IDQNFQPMSSSCRELRRHPMDQSYHSADQPYHATDQSYHSMSPLQSETPTYSECFASKGL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::                           
gi|154 IDQNFQPMSSSCRELRRHPMDQSYHSADQPYHA                           
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KIAA12 ENSMCCKPLHCGDFDYHRTCSYSCSVQGALVHDPCIYCSGEICPALLKRNMMPNCYNCRC

>>gi|148701934|gb|EDL33881.1| mCG49121 [Mus musculus]     (1358 aa)
 initn: 5230 init1: 1911 opt: 3451  Z-score: 2833.9  bits: 536.9 E(): 3.8e-149
Smith-Waterman score: 6975;  72.928% identity (84.530% similar) in 1448 aa overlap (56-1502:1-1358)

          30        40        50        60        70        80     
KIAA12 GFTLKGGLEHCEPLTVSKIEDGGKAALSQKMRTGDELVNINGTPLYGSRQEALILIKGSF
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
gi|148                               MRTGDELVNINGTPLYGSRQEALILIKGSF
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       :::::::::::.::::::::::::::::::..:::::::::::::::::::::::: :::
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KIAA12 CPLSRHCSTEKSSSIGSMESLEQPGQATYESHLLPIDQNMYPNQRDSAYSSFSASSNASD
       :::::::::::::::::::::::::: :::.:::::::::::.:::::::::::::::::
gi|148 CPLSRHCSTEKSSSIGSMESLEQPGQPTYEGHLLPIDQNMYPSQRDSAYSSFSASSNASD
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KIAA12 CALSLRPEEPASTDCIMQGPGPTKAPSGRPNVAETSGGSRRTNGGHLTPSSQMSSRPQEG
       :::::.:::: ::::.: :::: :. . . ::.:.::.:. :.  :.: .:. ::  .::
gi|148 CALSLKPEEPPSTDCVMPGPGPIKVTDDQANVSENSGSSHSTSEDHVTSTSHASSYSDEG
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KIAA12 YQSGPAKAVRGPPQPPVRRDSLQASRAQLLNGEQRRASEPVVPLPQKEKLSLEPVLPARN
       ..::::: .::::.:::: ::: :::::::::::.::::::  :::::: .:: ::: :.
gi|148 HHSGPAKMARGPPEPPVRSDSLPASRAQLLNGEQHRASEPVDSLPQKEKPGLETVLPPRS
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KIAA12 PNRFCCLSGHDQVTSEGHQNCEFSQPPESSQQGSEHLLMQASTKAVGSPKACDRASSVDS
        :.::::::.::::.: :::::.:.: ::::.  ::::.. :.::. :::: :..:. . 
gi|148 SNQFCCLSGQDQVTDEDHQNCELSKPSESSQDDCEHLLIEDSSKALDSPKAHDKGSNKEF
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KIAA12 NPLNEASAELAKA-SFGRPPHLIGPTGHRHSAPEQLLASHLQHVHLDTRGSKGMELPPVQ
       . :.::::.::.. .::  ::: :   :::::::::::::::.::::.:::::::::  :
gi|148 GLLKEASADLANTLNFGAIPHLRGTMEHRHSAPEQLLASHLQQVHLDSRGSKGMELPIGQ
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KIAA12 DGHQWTLSPLHSSHKGKKSPCPPTGGTHDQSSKERKTRQVDDRSLVLGHQSQSSPPHGEA
       ::::::.::::.. ::::::  :::::.::. :::::  .::. ..  :::::.   ::.
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KIAA12 DGHPSEKGFLDPNRTSRAASELANQQPSASGSLVQQATDCSSTTKAASGTEAGEEGDSEP
       ::::        ::..::.:.:..:::::. : :::. :  :. : .. :::.::::.::
gi|148 DGHP--------NRAGRASSDLTSQQPSATCSSVQQTRDFLSAHKIVDHTEASEEGDNEP
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KIAA12 KECSRMGGRRSGGTRGRSIQNRRKSERFATNLRNEIQRRKAQLQKSKGPLSQLCDTKEPV
       :::.:.::::::: :::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::.: :
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KIAA12 EETQEPPESPPLTASNTSLLSSCKKPPSPRDKLFNKSMMLRARSSECLSQAPESHESRTG
       ::::::::::::.:::.::: : :. ::: ::.:::::.:::::::::::: :: ..: :
gi|148 EETQEPPESPPLSASNASLLPSYKNVPSPGDKVFNKSMILRARSSECLSQASESSKARGG
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KIAA12 LEGRISPGQRPGQSSLGLNTWWKAPDPSSSDPEKAHAHCGVRGGHWRWSPEHNSQPLVAA
       .:::.::::: :::::.::::::: : :. : :::.:: ::  ::::::::::.:: :: 
gi|148 VEGRMSPGQRSGQSSLALNTWWKASDSSTLDTEKANAHHGVCRGHWRWSPEHNAQPQVAL
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KIAA12 AMEGPSNPGDNKELKASTAQAGEDAILLPFADRRKFFEESSKSLSTSHLPGLTTHSNKTF
       . :.:::: :.::::.:: ::::.:.:.:::::::::::::::::::::::::::.:: :
gi|148 STEAPSNPDDSKELKTSTPQAGEEAVLMPFADRRKFFEESSKSLSTSHLPGLTTHNNKPF
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KIAA12 TQRPKPIDQNFQPMSSSCRELRRHPMDQSYHSADQPYHATDQSYHSMSPLQSETPTYSEC
        :: ::::::::  : : :.:: ::.::::::::: :::.::::::.:::::::::: ::
gi|148 IQRQKPIDQNFQ--SVSYRDLRCHPLDQSYHSADQSYHAADQSYHSLSPLQSETPTYPEC
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KIAA12 FASKGLENSMCCKPLHCGDFDYHRTCSYSCSVQGALVHDPCIYCSGEICPALLKRNMMPN
       ::.:: .::.::::.: :: :::::::. ::.::.. ::::: :::::::::::::..:.
gi|148 FATKGRDNSLCCKPVHHGDCDYHRTCSHPCSAQGTVRHDPCICCSGEICPALLKRNLLPK
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KIAA12 CYNCRCHHHQCIRCSVCYHNPQHSALEDSSLAPGNTWKPRKLTVQEFPGDKWNPITGNRK
       :.::::::::::::. : :.::::: ::::.::::.:: :: ..:::: :::.:::::::
gi|148 CHNCRCHHHQCIRCTGCCHGPQHSAHEDSSMAPGNAWKSRKAAIQEFPVDKWKPITGNRK
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KIAA12 TSQSGREMAHSKTSFSWATPFHPCLENPALDLSSYRAISSLDLLGDFKHALKKSEETSVY
       ::.:::::::::..:: .:::.::.::::::::.:::.::::.:::::.: .: ::.:::
gi|148 TSHSGREMAHSKAGFSLSTPFRPCIENPALDLSNYRAVSSLDILGDFKRASNKPEESSVY
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KIAA12 EEGSSLASMPHPLRSRAFSESHISLAPQSTRAWGQHRRELFSKGDETQSDLLGARKKAFP
       :. .:.::::.:::::::::::::: ::.:.:::.:.:: ::::.::: : ::::::.::
gi|148 EDENSVASMPRPLRSRAFSESHISLEPQNTQAWGKHQRESFSKGSETQPDTLGARKKVFP
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KIAA12 PPRPPPPNWEKYRLFRAAQQQKQQQQQQQQQQKQQEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEAEEE
       ::::::::::::::::::: :.::::::::::.:. :::::.:.:::           :.
gi|148 PPRPPPPNWEKYRLFRAAQLQQQQQQQQQQQQQQRCEEEEEKEQEEEG----------EK
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KIAA12 EEELPPQYFSSETSGSCALNPEEVLEQPQPLSFGHLEGSRQGSQSVPAEQESFALHSSDF
       ::.::::::::: .:::: : ::   ::: :..:: :.:::::::.  :::.:::: :.:
gi|148 EEDLPPQYFSSELTGSCAPNTEE---QPQSLKMGHQEASRQGSQSLQ-EQEAFALHPSNF
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KIAA12 LPPIRGHLGSQPEQAQPPCYYGIGGLWRTSGQEATESAKQEFQHFSPPSGAPGIPTSYSA
       .::.::    :::.:: :::::  :::::. ::::          .:             
gi|148 VPPVRGCTVPQPEKAQHPCYYGTHGLWRTTEQEAT---------VTP-------------
       1150      1160      1170      1180                          

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KIAA12 YYNISVAKAELLNKLKDQPEMAEIGLGEEEVDHELAQKKIQLIESISRKLSVLREAQRGL
                                                   .:::::::::::::::
gi|148 --------------------------------------------NISRKLSVLREAQRGL
                                                     1190      1200

         1350      1360      1370      1380      1390      1400    
KIAA12 LEDINANSALGEEVEANLKAVCKSNEFEKYHLFVGDLDKVVNLLLSLSGRLARVENALNS
       :.:::::.:::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::
gi|148 LDDINANAALGEEVEANLKAVCKSNEFEKYHLFIGDLDKVVNLLLSLSGRLARVENALNS
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

         1410      1420      1430      1440      1450      1460    
KIAA12 IDSEANQEKLVLIEKKQQLTGQLADAKELKEHVDRREKLVFGMVSRYLPQDQLQDYQHFV
       ::::.:::::::::::::::.::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::
gi|148 IDSESNQEKLVLIEKKQQLTNQLADAKELKEHVDGREKLVFGMVSRYLPQDQLQDYQHFV
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

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KIAA12 KMKSALIIEQRELEEKIKLGEEQLKCLRESLLLGPSNF
       :::::::::::::::::::::::::::.::: ::::::
gi|148 KMKSALIIEQRELEEKIKLGEEQLKCLKESLHLGPSNF
             1330      1340      1350        

>>gi|123122092|emb|CAM20542.1| shroom family member 4 [M  (1359 aa)
 initn: 4584 init1: 1911 opt: 3451  Z-score: 2833.9  bits: 536.9 E(): 3.8e-149
Smith-Waterman score: 7086;  76.211% identity (88.286% similar) in 1383 aa overlap (121-1502:1-1359)

              100       110       120       130       140       150
KIAA12 IVRRRNAPVSRPHSWHVAKLLEGCPEAATTMHFPSEAFSLSWHSGCNTSDVCVQWCPLSR
                                     ::::::::::::::::::::: ::::::::
gi|123                               MHFPSEAFSLSWHSGCNTSDVSVQWCPLSR
                                             10        20        30

              160       170       180       190       200       210
KIAA12 HCSTEKSSSIGSMESLEQPGQATYESHLLPIDQNMYPNQRDSAYSSFSASSNASDCALSL
       ::::::::::::::::::::: :::.:::::::::::.::::::::::::::::::::::
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       .:::: ::::.: :::: :. . . ::.:.::.:. :.  :.: .:. ::  .::..:::
gi|123 KPEEPPSTDCVMPGPGPIKVTDDQANVSENSGSSHSTSEDHVTSTSHASSYSDEGHHSGP
              100       110       120       130       140       150

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       :: .::::.:::: ::: :::::::::::.::::::  :::::: .:: ::: :. :.::
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KIAA12 CLSGHDQVTSEGHQNCEFSQPPESSQQGSEHLLMQASTKAVGSPKACDRASSVDSNPLNE
       ::::.::::.: :::::.:.: ::::.  ::::.. :.::. :::: :..:. . . :.:
gi|123 CLSGQDQVTDEDHQNCELSKPSESSQDDCEHLLIEDSSKALDSPKAHDKGSNKEFGLLKE
              220       230       240       250       260       270

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KIAA12 ASAELAKA-SFGRPPHLIGPTGHRHSAPEQLLASHLQHVHLDTRGSKGMELPPVQDGHQW
       :::.::.. .::  ::: :   :::::::::::::::.::::.:::::::::  ::::::
gi|123 ASADLANTLNFGAIPHLRGTMEHRHSAPEQLLASHLQQVHLDSRGSKGMELPIGQDGHQW
              280       290       300       310       320       330

     450       460       470       480       490       500         
KIAA12 TLSPLHSSHKGKKSPCPPTGGTHDQSSKERKTRQVDDRSLVLGHQSQSSPPHGEADGHPS
       :.::::.. ::::::  :::::.::. :::::  .::. ..  :::::.   ::.:::: 
gi|123 TVSPLHNNPKGKKSPSLPTGGTQDQTRKERKTTPLDDKLMASVHQSQSDVLLGEVDGHP-
              340       350       360       370       380          

     510       520       530       540       550       560         
KIAA12 EKGFLDPNRTSRAASELANQQPSASGSLVQQATDCSSTTKAASGTEAGEEGDSEPKECSR
              ::..::.:.:..:::::. : :::. :  :. : .. :::.::::.:::::.:
gi|123 -------NRAGRASSDLTSQQPSATCSSVQQTRDFLSAHKIVDHTEASEEGDNEPKECGR
            390       400       410       420       430       440  

     570       580       590       600       610       620         
KIAA12 MGGRRSGGTRGRSIQNRRKSERFATNLRNEIQRRKAQLQKSKGPLSQLCDTKEPVEETQE
       .::::::: :::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::.: ::::::
gi|123 LGGRRSGGPRGRSIQNRRRSERFATNLRNEIQRRKAQLQKSKGPLSQLCDTNEAVEETQE
            450       460       470       480       490       500  

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KIAA12 PPESPPLTASNTSLLSSCKKPPSPRDKLFNKSMMLRARSSECLSQAPESHESRTGLEGRI
       :::::::.:::.::: : :. ::: ::.:::::.:::::::::::: :: ..: :.:::.
gi|123 PPESPPLSASNASLLPSYKNVPSPGDKVFNKSMILRARSSECLSQASESSKARGGVEGRM
            510       520       530       540       550       560  

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KIAA12 SPGQRPGQSSLGLNTWWKAPDPSSSDPEKAHAHCGVRGGHWRWSPEHNSQPLVAAAMEGP
       ::::: :::::.::::::: : :. : :::.:: ::  ::::::::::.:: :: . :.:
gi|123 SPGQRSGQSSLALNTWWKASDSSTLDTEKANAHHGVCRGHWRWSPEHNAQPQVALSTEAP
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KIAA12 SNPGDNKELKASTAQAGEDAILLPFADRRKFFEESSKSLSTSHLPGLTTHSNKTFTQRPK
       ::: :.::::.:: ::::.:.:.:::::::::::::::::::::::::::.:: : :: :
gi|123 SNPDDSKELKTSTPQAGEEAVLMPFADRRKFFEESSKSLSTSHLPGLTTHNNKPFIQRQK
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KIAA12 PIDQNFQPMSSSCRELRRHPMDQSYHSADQPYHATDQSYHSMSPLQSETPTYSECFASKG
       :::::::  : : :.:: ::.::::::::: :::.::::::.:::::::::: ::::.::
gi|123 PIDQNFQ--SVSYRDLRCHPLDQSYHSADQSYHAADQSYHSLSPLQSETPTYPECFATKG
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KIAA12 LENSMCCKPLHCGDFDYHRTCSYSCSVQGALVHDPCIYCSGEICPALLKRNMMPNCYNCR
        .::.::::.: :: :::::::. ::.::.. ::::: :::::::::::::..:.:.:::
gi|123 RDNSLCCKPVHHGDCDYHRTCSHPCSAQGTVRHDPCICCSGEICPALLKRNLLPKCHNCR
              750       760       770       780       790       800

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KIAA12 CHHHQCIRCSVCYHNPQHSALEDSSLAPGNTWKPRKLTVQEFPGDKWNPITGNRKTSQSG
       :::::::::. : :.::::: ::::.::::.:: :: ..:::: :::.:::::::::.::
gi|123 CHHHQCIRCTGCCHGPQHSAHEDSSMAPGNAWKSRKAAIQEFPVDKWKPITGNRKTSHSG
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KIAA12 REMAHSKTSFSWATPFHPCLENPALDLSSYRAISSLDLLGDFKHALKKSEETSVYEEGSS
       :::::::..:: .:::.::.::::::::.:::.::::.:::::.: .: ::.::::. .:
gi|123 REMAHSKAGFSLSTPFRPCIENPALDLSNYRAVSSLDILGDFKRASNKPEESSVYEDENS
              870       880       890       900       910       920

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KIAA12 LASMPHPLRSRAFSESHISLAPQSTRAWGQHRRELFSKGDETQSDLLGARKKAFPPPRPP
       .::::.:::::::::::::: ::.:.:::.:.:: ::::.::: : ::::::.:::::::
gi|123 VASMPRPLRSRAFSESHISLEPQNTQAWGKHQRESFSKGSETQPDTLGARKKVFPPPRPP
              930       940       950       960       970       980

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KIAA12 PPNWEKYRLFRAAQQQKQQQQQQQQQQKQQEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEAEEEEEELP
       :::::::::::::: :.::::::::::.:. :::::.:.::: :.::          .::
gi|123 PPNWEKYRLFRAAQLQQQQQQQQQQQQQQRCEEEEEKEQEEEGEKEE----------DLP
              990      1000      1010      1020                1030

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KIAA12 PQYFSSETSGSCALNPEEVLEQPQPLSFGHLEGSRQGSQSVPAEQESFALHSSDFLPPIR
       ::::::: .:::: : ::   ::: :..:: :.:::::::.  :::.:::: :.:.::.:
gi|123 PQYFSSELTGSCAPNTEE---QPQSLKMGHQEASRQGSQSLQ-EQEAFALHPSNFVPPVR
             1040         1050      1060       1070      1080      

    1230      1240      1250      1260      1270      1280         
KIAA12 GHLGSQPEQAQPPCYYGIGGLWRTSGQEATESAKQEFQHFSPPSGAPGIPTSYSAYYNIS
       :    :::.:: :::::  :::::. :::: . ::::::::::.:: :::::::::::::
gi|123 GCTVPQPEKAQHPCYYGTHGLWRTTEQEATVTPKQEFQHFSPPKGASGIPTSYSAYYNIS
       1090      1100      1110      1120      1130      1140      

    1290      1300      1310      1320      1330      1340         
KIAA12 VAKAELLNKLKDQPEMAEIGLGEEEVDHELAQKKIQLIESISRKLSVLREAQRGLLEDIN
       :::::::::::.:::::: ::::: ::.::::::::::::::::::::::::::::.:::
gi|123 VAKAELLNKLKQQPEMAEAGLGEEGVDYELAQKKIQLIESISRKLSVLREAQRGLLDDIN
       1150      1160      1170      1180      1190      1200      

    1350      1360      1370      1380      1390      1400         
KIAA12 ANSALGEEVEANLKAVCKSNEFEKYHLFVGDLDKVVNLLLSLSGRLARVENALNSIDSEA
       ::.:::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::.
gi|123 ANAALGEEVEANLKAVCKSNEFEKYHLFIGDLDKVVNLLLSLSGRLARVENALNSIDSES
       1210      1220      1230      1240      1250      1260      

    1410      1420      1430      1440      1450      1460         
KIAA12 NQEKLVLIEKKQQLTGQLADAKELKEHVDRREKLVFGMVSRYLPQDQLQDYQHFVKMKSA
       :::::::::::::::.::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::
gi|123 NQEKLVLIEKKQQLTNQLADAKELKEHVDGREKLVFGMVSRYLPQDQLQDYQHFVKMKSA
       1270      1280      1290      1300      1310      1320      

    1470      1480      1490      1500  
KIAA12 LIIEQRELEEKIKLGEEQLKCLRESLLLGPSNF
       ::::::::::::::::::::::.::: ::::::
gi|123 LIIEQRELEEKIKLGEEQLKCLKESLHLGPSNF
       1330      1340      1350         

>>gi|116487394|gb|AAI25737.1| Hypothetical protein MGC14  (1721 aa)
 initn: 2129 init1: 561 opt: 1252  Z-score: 1029.3  bits: 203.3 E(): 1.2e-48
Smith-Waterman score: 2749;  35.989% identity (56.936% similar) in 1795 aa overlap (5-1495:1-1721)

                 10        20        30        40        50        
KIAA12 AQPRMENRP--GSFQYVPVQLQGGAPWGFTLKGGLEHCEPLTVSKIEDGGKAALSQKMRT
           :. .:  :: : . ::::::::::::::::::: ::: .::::.::::.. .::..
gi|116     MDPQPADGSSQCIHVQLQGGAPWGFTLKGGLEHGEPLIISKIENGGKASMCEKMEV
                   10        20        30        40        50      

       60        70        80        90       100       110        
KIAA12 GDELVNINGTPLYGSRQEALILIKGSFRILKLIVRRRNAPVSRPHSWHVAKLLEGCPEAA
       ::::::::::::::::::::::::::..::..::::::  : ::::::.::: :  :..:
gi|116 GDELVNINGTPLYGSRQEALILIKGSYKILRMIVRRRNLSVIRPHSWHLAKLTEVHPDVA
         60        70        80        90       100       110      

      120       130       140       150       160       170        
KIAA12 TTMHFPSEAFSLSWHSGCNTSDVCVQWCPLSRHCSTEKSSSIGSMESLEQPGQATYESHL
       . :..:..::::::::::..:.. .:: ::::::::.:::::::::::.:::.  ::. :
gi|116 S-MQYPTDAFSLSWHSGCENSELPMQWNPLSRHCSTDKSSSIGSMESLDQPGHNYYEGTL
         120       130       140       150       160       170     

      180       190       200       210       220       230        
KIAA12 LPIDQNMYPNQRDSAYSSFSASSNASDCALSLRPEEPASTDCIMQGPGPTKAPSGRPNVA
        ::: .:: :.:::::::::::::::: .:: : :: .. ::. ..  :    .::    
gi|116 SPIDPSMYQNKRDSAYSSFSASSNASDYTLSARAEESSQMDCVADSSKPC---DGR--YL
         180       190       200       210       220            230

      240         250       260        270       280       290     
KIAA12 ETSGGSR--RTNGGHLTPSSQMSSRPQE-GYQSGPAKAVRGPPQPPVRRDSLQASRAQLL
       .:. :.   . . . :.:: . ..::.   ....  . ...:::::.:::::.::. :. 
gi|116 HTGQGAIEIQQETSSLSPS-EHQQRPSSFPFDANHLSFIKSPPQPPIRRDSLRASKNQIC
              240        250       260       270       280         

         300       310       320       330             340         
KIAA12 NGEQRRASEPVVPLPQKEKLSLEPVLPARNPNRFCCLSG------HDQVTSEGHQNCEFS
       .::.:::: :   :  .   : :     .: .   :  :      : .    . :   .:
gi|116 HGERRRASAPGDSLQISGMWSSEN-QQHKNSDTSQCKCGIEFCTVHLKNGLSSDQYYMLS
     290       300       310        320       330       340        

     350       360       370       380          390        400     
KIAA12 QPPESSQQGSEHLLMQASTKAVGSPKACDRASSV---DSNPLNEA-SAELAKASF--GRP
       .  ....:....: .  : . .  :. : . .:    :.  .... . :. ..:.  .. 
gi|116 SQTDGGNQSTDQLAL--SDREM--PSCCTEMQSRWPRDGRNIKQTINKEMENSSYHSAQT
      350       360           370       380       390       400    

           410       420       430       440       450       460   
KIAA12 PHLIGPTGHRHSAPEQLLASHLQHVHLDTRGSKGMELPPVQDGHQWTLSPLHSSHKGKKS
        . .  .  .:  :  :   :..   :    .. . .      ..:  . :. . . . :
gi|116 VKTVKDSLSKH--PSCL---HMKSSSLPQSEQEEVSVQTKFHRKEWRNTLLQENFQCQTS
          410            420       430       440       450         

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KIAA12 PCPPTGGTHDQSSKERKTR--QVDDRSLVLGHQSQSSPPHGEADGHPS--EKGFLDPNRT
        :   .. . . . .: ..  :::  . . :  :: :  . : . : .  :..  .::..
gi|116 ECNGISSQELKCNINRDSEIYQVDTLTDT-GDFSQLSGKNKEQSQHITTLERSVSEPNEV
     460       470       480        490       500       510        

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KIAA12 SRAASELANQQPSASGSLVQQATDCSSTTKAASGTEAGEEGDSEPKECSRMGGRRSGGTR
        : .  .   . :..:    . ..::: :         ::  :. .: :.   .. :..:
gi|116 -RESFPVLLPKHSVGG----MRSSCSSETLL-------EE--SHEQEESQGPTKKPGSSR
       520       530           540                550       560    

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KIAA12 GRSIQNRRKSERFATNLRNEIQRRKAQLQKSKGPLSQLCDTKEPVEETQEPPES------
        :: : ::.:.:::::::::::::::::::.::    ::  .::::: .:: ::      
gi|116 HRSAQMRRRSDRFATNLRNEIQRRKAQLQKNKGSSVLLCG-EEPVEEREEPTESQSPPRP
          570       580       590       600        610       620   

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KIAA12 --PPLTASNTSLLSSCKKP---------------------PSPRD---------------
         ::   .: : :   :.                      :: ::               
gi|116 MPPPPPPKNKSRLLELKRANAEQFHKGTDHQHLEQNKQSLPSNRDTDKDNQKTEENSLNA
           630       640       650       660       670       680   

              660                            670                   
KIAA12 -----KLFNKSMMLRAR---------------------SSE-------------------
            .  .::.. ..:                     :::                   
gi|116 VENVTRANDKSLISKSRLQNESNKSFVYDPRQKDHQRVSSELNNESTMPSAENCREEWRT
           690       700       710       720       730       740   

                                                      680          
KIAA12 -----------CLSQ-APE----------------------------SHE----------
                  :: :  ::                            :::          
gi|116 REPDFQRQHSKCLEQREPELGNVAESSATTVRWNEVSRASPNPDVKVSHEMWRASSSLSI
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                                                            690    
KIAA12 ----SRT------GLEG------------------------------------RIS----
           :.:      :.:.                                    :::    
gi|116 NSVGSQTENFRGIGVESHSHYSGHKSLDADASFNGLLSSKEQLYSDGSSNDDWRISCLDN
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KIAA12 --PGQR--------PGQSSLGLNTW---WKAPDPSSSDPEKAHAHCGVRGGHWRWSPEHN
         : ::        ::.::   . .   :..   :::: :  :..    ::.:.:::::.
gi|116 EEPMQRGREMMFSEPGRSSDHTSLFAAQWRSRH-SSSDFEDPHVQQMPNGGRWKWSPEHK
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KIAA12 SQPLVAAAMEGPSNPGDNKELKASTAQ-----AGEDAILLPFADRRKFFEESSKSLSTSH
         :     . . ..: : . ..:  :.     :.:. .:.::::::.:::.:::  ..::
gi|116 LLP---HPQLSKGSPPDVSVVHAEGASLPNRVASEENVLMPFADRRRFFENSSKVPNVSH
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KIAA12 LPGLTTHSNKTFTQRPKPIDQNFQPMSSSCRELRRHPMDQSYHSADQPYHATDQSYHSMS
       .: :  .:::.          :.      :  .   :..:.  :: .  :..:..::  :
gi|116 IP-LQIKSNKN----------NY------CPSFPDPPLSQKVVSALR-RHSVDHTYHPSS
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KIAA12 PLQSETPT-YSECFASKGLENSMCC-KPLHCGDFDYHRTCSYSCSVQGALVHDPCIYCSG
       : ....   ::.  ... ..  .:: .  : ... .: : .:.: :     :. :  ::.
gi|116 PNRQDSALPYSDYCVNHTVDPLLCCSQGGHAAEYIHHPT-GYGCRV-----HESCHCCSS
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KIAA12 EICPALLKRNMMPNCYNCRC-----HHHQCIRCSVCYHNPQHSALEDSSLAPGNTWKPRK
       ..::::.::::  .  .:.      ::::  ::.      :::.::...   :. :. .:
gi|116 DVCPALVKRNMPMSHLSCHFLHHHHHHHQWSRCGDYLCPAQHSTLEEGTSLHGDPWHLQK
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KIAA12 LTVQEFPGDKWNPITG--NRKTSQSGREMAHSKTSFSWATPFHPCLENPALDLSS-YRAI
        ..:: :  .:.      ::: :::: .. ::...:  : ::.:: .:   :. . ::..
gi|116 PVLQEVPLKEWTQQLKIPNRKCSQSGSDLCHSNSGFHRAGPFRPCCDNSEQDFPQCYRTV
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KIAA12 SSLDLLGDFKHALKKSEETSVYEEGSSLASMPHPLRSRAFSESHISLAPQSTRAWGQHRR
       :: ::  . .:...  : .: ..: :.     .  :.::.: :...:   . :   ....
gi|116 SSYDL--SCEHSIRP-ELSSHHDEPSD----QNLGRGRAYSVSQLNLDCLALR---DKKE
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KIAA12 ELFSKGDETQSDLLGARKKAFPPPRPPPPNWEKYRLFRAAQQ------QKQQQQ------
         .:: .: . . :. ..:   :::::::::.::.  ::..:      ......      
gi|116 TSLSKLEEHMPSALAKKQK---PPRPPPPNWDKYKERRASHQLTNSILSRHRENSVGSGH
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KIAA12 -------QQQQQQKQQEE---EEEEEEEEEEEEEEEEEEEAEEEEEELPPQYFSSETSGS
              .:..:.  .:.   . .:. .   : :. . ..      .: : .   .::..
gi|116 SISMEAVRQRSQSLPMERILLKANENYHPSSECEHPQIRDCSPVPSDLRPAHQEPDTSAD
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KIAA12 ----------------CALNPEEV-------LEQPQPLSFGHLEGSRQGSQ----SVPAE
                       :  .:...       :   .:.. .: . .   :     :.   
gi|116 TVSTTFEHARQEPFSDCRNSPRDASPPRTDHLVPSDPVTSSHHQTTDFYSPLEGGSIEEP
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KIAA12 QESFALHSSD-FLPP--IRGHLGSQ-PEQAQPPC--------YYGIGGLWRTSGQ-EATE
       ..: : .: :  .::   . :.. . ::. .:          :      : :. . : . 
gi|116 SNSVAEESEDGVIPPKSTHDHISPDIPEREHPANLLDGFDSGYRHYEDEWSTDRESEISI
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KIAA12 SAKQEFQHFSPPSGAPGI-PTSYSAYYNISVAKAELLNKLKDQPEMAE-IGLGEE-EVDH
         . ::: .:::    .. ::: .:::: :.::::::::.:. : . : .:  :: : . 
gi|116 PERYEFQPISPPPVCGAVSPTSCAAYYNTSAAKAELLNKMKELPGLQEEVGDQEEVEEED
           1490      1500      1510      1520      1530      1540  

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KIAA12 ELAQKKIQLIESISRKLSVLREAQRGLLEDINANSALGEEVEANLKAVCKSNEFEKYHLF
       ::. ::.:::::::::.:::.:::.:: ::::::..:: :.   :: .:: ::.::.. :
gi|116 ELSLKKVQLIESISRKVSVLHEAQQGLQEDINANTTLGCEMADLLKNLCKPNEYEKFRTF
           1550      1560      1570      1580      1590      1600  

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KIAA12 VGDLDKVVNLLLSLSGRLARVENALNSIDSEAN-QEKLVLIEKKQQLTGQLADAKELKEH
       .:::.:::::::::::::::::..:.: : : . .::: :.:::.::: :: :::::. :
gi|116 IGDLEKVVNLLLSLSGRLARVESVLSSEDPEPSVDEKLNLLEKKKQLTEQLEDAKELRAH
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KIAA12 VDRREKLVFGMVSRYLPQDQLQDYQHFVKMKSALIIEQRELEEKIKLGEEQLKCLRESLL
       : :::..:.  ::::: ..:::::.:.::: ::::.::::::.::.::::::.:::::: 
gi|116 VTRREHMVLESVSRYLNEEQLQDYHHYVKMTSALIVEQRELEDKIRLGEEQLRCLRESL 
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KIAA12 LGPSNF




1502 residues in 1 query   sequences
2693465022 residues in 7827732 library sequences
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Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]