# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fg01844.fasta.nr -Q ../query/KIAA1197.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1197, 1487 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7803563 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7821+/-0.000208; mu= 9.2299+/- 0.011 mean_var=165.4275+/-31.508, 0's: 28 Z-trim: 107 B-trim: 88 in 1/64 Lambda= 0.099717 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|114590626|ref|XP_001135033.1| PREDICTED: YEATS (1547) 9287 1349.5 0 gi|85542165|sp|Q9ULM3.2|YETS2_HUMAN RecName: Full= (1422) 9260 1345.6 0 gi|194222631|ref|XP_001915718.1| PREDICTED: simila (1415) 8715 1267.2 0 gi|126314414|ref|XP_001366314.1| PREDICTED: simila (1428) 7531 1096.9 0 gi|157279351|gb|AAI53294.1| YEATS2 protein [Bos ta (1412) 5148 754.0 1.7e-214 gi|126314416|ref|XP_001366373.1| PREDICTED: simila (1346) 4421 649.4 5e-183 gi|52078390|gb|AAH82270.1| YEATS2 protein [Homo sa ( 588) 3782 557.1 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278.6 7.2e-72 gi|10435277|dbj|BAB14546.1| unnamed protein produc ( 345) 1643 249.1 4e-63 gi|21595404|gb|AAH32368.1| YEATS2 protein [Homo sa ( 195) 1176 181.7 4.6e-43 gi|210117365|gb|EEA65104.1| hypothetical protein B (1099) 1187 184.1 4.9e-43 gi|213625675|gb|AAI71098.1| Hypothetical protein L (1236) 1099 171.5 3.5e-39 gi|220673148|emb|CAX13980.1| novel protein similar ( 476) 1090 169.7 4.5e-39 gi|163915795|gb|AAI57665.1| LOC100135359 protein [ (1236) 1095 170.9 5.2e-39 gi|37589360|gb|AAH59303.1| MGC68945 protein [Xenop (1237) 1093 170.6 6.3e-39 gi|189516311|ref|XP_684249.3| PREDICTED: similar t ( 376) 1059 165.2 8.4e-38 gi|210114749|gb|EEA62506.1| hypothetical protein B (1679) 1028 161.4 5.1e-36 gi|198426008|ref|XP_002129695.1| PREDICTED: simila ( 960) 932 147.3 5e-32 gi|115647188|ref|XP_793746.2| PREDICTED: hypotheti (1627) 895 142.3 2.9e-30 gi|110762586|ref|XP_392847.3| PREDICTED: similar t ( 842) 786 126.3 9.6e-26 gi|190587074|gb|EDV27127.1| hypothetical protein T ( 624) 740 119.5 7.7e-24 gi|156215537|gb|EDO36494.1| predicted protein [Nem ( 776) 718 116.4 8e-23 gi|221102665|ref|XP_002166558.1| PREDICTED: hypoth ( 712) 687 111.9 1.7e-21 gi|47228298|emb|CAG07693.1| unnamed protein produc ( 210) 568 94.3 1e-16 gi|189241544|ref|XP_970708.2| PREDICTED: similar t ( 685) 569 94.9 2.1e-16 gi|60473555|gb|EAL71498.1| YEATS family protein [D ( 717) 546 91.7 2.1e-15 gi|28828350|gb|AAL93017.2|AC116032_6 hypothetical ( 791) 546 91.7 2.3e-15 gi|212509421|gb|EEB12808.1| yeats2, putative [Pedi ( 708) 524 88.5 1.9e-14 gi|215504785|gb|EEC14279.1| yeats2, putative [Ixod ( 206) 492 83.3 2e-13 gi|190616264|gb|EDV31788.1| GF14374 [Drosophila an ( 955) 490 83.7 6.9e-13 gi|194170343|gb|EDW85244.1| GK18381 [Drosophila wi ( 918) 489 83.6 7.4e-13 gi|198137790|gb|EAL34491.2| GA12258 [Drosophila ps ( 965) 483 82.7 1.4e-12 gi|194114875|gb|EDW36918.1| GL25797 [Drosophila pe ( 633) 466 80.1 5.7e-12 gi|194114872|gb|EDW36915.1| GL25798 [Drosophila pe ( 965) 465 80.1 8.4e-12 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9260 Z-score: 7204.1 bits: 1345.6 E(): 0 Smith-Waterman score: 9260; 100.000% identity (100.000% similar) in 1422 aa overlap (66-1487:1-1422) 40 50 60 70 80 90 KIAA11 SLTSPCSLAAAGGARAAAGDPEKGEELNVIMSGIKRTIKETDPDYEDVSVALPNKRHKAI :::::::::::::::::::::::::::::: gi|855 MSGIKRTIKETDPDYEDVSVALPNKRHKAI 10 20 30 100 110 120 130 140 150 KIAA11 ENSARDAAVQKIETIIKEQFALEMKNKEHEIEVIDQRLIEARRMMDKLRACIVANYYASA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|855 ENSARDAAVQKIETIIKEQFALEMKNKEHEIEVIDQRLIEARRMMDKLRACIVANYYASA 40 50 60 70 80 90 160 170 180 190 200 210 KIAA11 GLLKVSEGSKTCDTMVFNHPAIKKFLESPSRSSSPANQRAETPSANHSESDSLSQHNDFL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|855 GLLKVSEGSKTCDTMVFNHPAIKKFLESPSRSSSPANQRAETPSANHSESDSLSQHNDFL 100 110 120 130 140 150 220 230 240 250 260 270 KIAA11 SDKDNNSNMDIEERLSNNMEQRPSRNTGRDTSRITGSHKTEQRNADLTDETSRLFVKKTI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|855 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