# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk00330.fasta.huge -Q ../query/KIAA1139.ptfa ./tmplib.24314 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. 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KIAA02 HEAALFGKTDVVQILLAAGTDVNIKDNHGLTALDTVRELP-SQKSQQIAALIEDH--MTG 300 310 320 330 340 350 210 220 230 240 250 KIAA11 VRALKDFWNLHDPTALNVRAGDVITVLEQHPDGRWKGHIHE---------SQRGTDRIGY :. :. . : . . : :. :. .: . . : ..: . : KIAA02 KRSTKEVDKTPPPQPPLISSMDSIS---QKSQGDVEKAVTELIIDFDANAEEEGPYEALY 360 370 380 390 400 410 260 270 280 290 300 KIAA11 FP---PGIVEVVSKR------VGIPAARLPSAPTPLRPGFSRTPQPPAEEPP------H- .. ..: : .. : :. .:: . : :::. :: : KIAA02 NAISCHSLDSMASGRSSDQDSTNKEAEAAGVKPAGVRP--RERPPPPAKPPPDEEEEDHI 420 430 440 450 460 310 320 330 340 KIAA11 -----PLTYSQL----PRVGLSP-----DSP------AGDRNSVGSEGSVGSIRSAGSGQ ::: :.. ::. : . : : .. : .:.. . : ..:.. 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KIAA02 ARSRAPPTSKPKAELKLSRSLSKS-DSDLLTCSPTEDATMGSRSESLSNCSIGKKRLEKS 650 660 670 680 690 700 470 480 490 500 KIAA11 KKIASEIAQL-----SIAEWLP-----------SYIPTDLLEWLCALGLPQYHKQLVSSG ..::: .. ::.: . . .. ::: ..:: ::...:. .: KIAA02 PSFASEWDEIEKIMSSIGEGIDFSQERQKISGSRTLEQSVGEWLESIGLQQYESKLLLNG 710 720 730 740 750 760 510 520 530 540 550 560 KIAA11 YDSMGLVADLTWEE--LQEIGVNKLGHQKKLMLGVKRLAELRRGLLQGEALSEGGRRLAK .:.. .... . :: :..::.. :..::. ... : ... 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KIAA15 EQDLSMADFPP---------P--EEAFFSVAS-PEPAGPSGSPELVSSPAA---SSSSAT 730 740 750 760 770 920 930 940 950 960 KIAA11 TVKRRPKCREREPLQTALLAFGVASATPGPAAPLPSPTP-----GESPPASSLPQP--EP ... .: : : : . ::..:: .: ::. : : .:: .. : : KIAA15 ALQIQPPGSPDPP--PAPPAPAPASSAPGHVAKLPQKEPVGCSKGGGPPREDVGAPLVTP 780 790 800 810 820 830 970 980 990 1000 1010 KIAA11 SSLPA---QGVPTPL-APSPAMQPPVPPCPGPGLESSAASRWNGETEPPAAPAALLKVPG : : ..: .: ::.::. : .: : :. . .:.. : ::.. :. 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KIAA16 APV---LSGRGKDSVVEFPSPPSDSDFP-PPPPETDLPLP-PIEIPAVFSGNTSPKVAVV 1040 1050 1060 1070 1080 1090 980 990 1000 1010 1020 1030 KIAA11 APSPAM--QPPVPPCPGPGLESSAASRWNGETEPPAAPAALLKVPGAGTAPKPVSVACTQ :.: . . : : : . : ..: :. :: . :.:: KIAA16 NPQPQQWSKMSVKKAPPPTRPKRNDSTRLTQAEISEQPTMATVVPQVPTSPKSSLSVQPG 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1040 1050 1060 1070 1080 1090 KIAA11 LAFSGPKLAPRLGPRPVPPPRPESTGTVGPGQAQQRLEQTSSSLAAALRAAEKSIGTKEQ KIAA16 FLADLNRTLQRKSITRHGSLSSRMSRAEPTATMDDMALPPPPPELLSDQQKAGYGGSHIS 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1124 residues in 1 query sequences 1986381 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:10:46 2008 done: Thu Dec 18 15:10:47 2008 Total Scan time: 0.740 Total Display time: 0.190 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]