# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fj15925.fasta.nr -Q ../query/KIAA1114.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1114, 1458 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7803051 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5482+/-0.000205; mu= 9.0024+/- 0.011 mean_var=146.4922+/-28.026, 0's: 32 Z-trim: 129 B-trim: 19 in 1/65 Lambda= 0.105966 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|152031714|sp|Q12816.3|TROP_HUMAN RecName: Full= (1431) 9241 1425.9 0 gi|119613608|gb|EAW93202.1| trophinin, isoform CRA (1387) 8928 1378.0 0 gi|119613612|gb|EAW93206.1| trophinin, isoform CRA (1401) 8928 1378.0 0 gi|123232336|emb|CAM26848.1| trophinin [Homo sapie (1034) 6714 1039.4 0 gi|194382928|dbj|BAG59020.1| unnamed protein produ ( 962) 6308 977.3 0 gi|193786104|dbj|BAG51387.1| unnamed protein produ ( 814) 5353 831.3 0 gi|109511662|ref|XP_001067331.1| PREDICTED: simila (1828) 5058 786.5 0 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