# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fj15925.fasta.huge -Q ../query/KIAA1114.ptfa ./tmplib.24314 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1114, 1458 aa vs ./tmplib.24314 library 1986047 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4300+/-0.00836; mu= 6.4069+/- 0.568 mean_var=267.0024+/-62.732, 0's: 0 Z-trim: 7 B-trim: 3 in 1/39 Lambda= 0.078490 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1859 ( 761 res) bm01165 ( 761) 1330 165.2 4.2e-41 KIAA1587 ( 991 res) fj08327 ( 991) 648 88.1 8.6e-18 KIAA0618 ( 1052 res) hg03971 (1052) 391 59.1 5.1e-09 KIAA0023 ( 2111 res) ha00512 (2111) 325 52.0 1.4e-06 KIAA2032 ( 952 res) eh00720 ( 952) 238 41.7 0.0008 KIAA0410 ( 505 res) hg01877 ( 505) 219 39.2 0.0024 KIAA0765 ( 952 res) hk04803s1 ( 952) 210 38.5 0.0072 >>KIAA1859 ( 761 res) bm01165 (761 aa) initn: 1385 init1: 1231 opt: 1330 Z-score: 829.9 bits: 165.2 E(): 4.2e-41 Smith-Waterman score: 1425; 41.828% identity (65.512% similar) in 722 aa overlap (122-796:88-754) 100 110 120 130 140 KIAA11 RPKKSKTKKAPIKTITKAAPAAPPVPAANEIATNKPKITWQALNLPVITQ-ISQAL---P : .:.: :. : ::..: . .:: : KIAA18 EFGAFGGYGTLTSFDIHILRAFGSLGPGLRILSNEP---WELEN-PVLAQTLVEALQLDP 60 70 80 90 100 110 150 160 170 180 190 200 KIAA11 TTEVTNTQASSVT-AQPKKANKMKRVTAKAAQG--SQSPTGHEGGTIQLKSP-LQVLKLP : ...: : ... :. .:. :..: ::. :: ..:. .: :... : KIAA18 ETLANETAARAANVARAAASNRAARAAAAAARTAFSQVVASHRVATPQVSGEDTQPTTYA 120 130 140 150 160 170 210 220 230 240 250 260 KIAA11 VISQNI--HAPIANESASSQALITSIKPKKASKAKKAANKAIASATEVSLAATATHTATT . .:. . :.:. . .:: :.:: : :: .: :.... : ... .. :.: KIAA18 AEAQGPTPEPPLASPQ-TSQMLVTS---------KMAAPEAPATSAQ-SQTGSPAQEAAT 180 190 200 210 220 270 280 290 300 310 320 KIAA11 QGQITNETASIHTTAASIRTKKASKARKTIAKVINTDTEHIEALNVTDAATRQIEASVVA .: .: . : : :. : . : . ..: : : :. .: .: KIAA18 EGP---SSACAFSQAPCAREVDAN--RPSTAFLGQND--------VFDF-TQPAGVSGMA 230 240 250 260 330 340 350 360 370 KIAA11 I-RPKK-SKGKKAASRGPNSVSEISEAPLATQIVTNQALAATLRVKRGSRARKAATKARA . :::. . ...::..::...: . : : .. .::: : : ... :: .:.: KIAA18 FPRPKRPAPAQEAATEGPSAASGV---P---QTGPGREVAAT-RPKT-TKSGKALAKTRW 270 280 290 300 310 320 380 390 400 410 420 430 KIAA11 TESQTPNADQGAQAKIASAQTNVSALETQVAAAVQALADDYLAQLSLEPTTRTRGKRNRK .: :. : .:.::.:. : : . :::. : : : :: .: :::..: KIAA18 VEPQNVVAAAAAKAKMAT-----SIPEPEGAAAATA-------QHSAEPWARMGGKRTKK 330 340 350 360 440 450 460 KIAA11 SKHLNGDERSGSNYRRIP-----W-------------GRRPA---------------PPR ::::. . .:. . :. : : . :: ::: KIAA18 SKHLDDEYESSEEERETPAVPPTWRASQPSLTVRAQLAPRPPMAPRSQIPSRHVLCLPPR 370 380 390 400 410 420 470 480 490 500 510 520 KIAA11 DVAILQERANKLVKYLLVKDQTKIPIKRSDMLRDVIQEYDEYFPEIIERASYTLEKMFRV .:..::::::::::::..:: ::::::.:::.:::.::::.::::::::.::::: : . 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KIAA15 EASSASGQPTISEGPGTSVLPTPSEGLSTSGPPTISKGLCTSVTLAASEGRNTSRPPTSS 120 130 140 150 160 170 160 170 180 190 200 KIAA11 ASSVTAQPKKANKMKRVTAKAAQG-----SQSPTGHEGGTIQL-KSP-----LQVLKLPV :. : :... .. . : : ::..:: . .. .: .:: : KIAA15 EEPSTSVPPTASEVPSTSLPPTPGEGTSTSVPPTAYEGPSTSVVPTPDEGPSTSVLPTPG 180 190 200 210 220 230 210 220 230 240 250 260 KIAA11 ISQNIHAPIANESASSQALITSIKPKKASKAKKAANKAIASATEVSL-AATATHTATTQG . . .:.: . : .. .. .... .:...... . . . .: . .: : KIAA15 EGPGTSVPLAATEGLSTSVQATPDEGPSTSVPPTATEGLSTPVPPTRDEGPSTSVPATPG 240 250 260 270 280 290 270 280 290 300 310 320 KIAA11 QITNETASIHTTAASIRTKK--ASKARKTIAKVINTDTEHIEALNVTDAATRQIEASVVA . . ..:. .:.. .. . .... . ..: : :: . . .: .: :.: .. KIAA15 E--GPSTSVLPAASDGQSISLVPTRGKGSSTSVPPTATEGL-STSVQPTAG---EGSSTS 300 310 320 330 340 350 330 340 350 360 370 KIAA11 IRPKKSKGKKAASRGPNSVSEIS--------EAPLATQI-VTNQALAATL--RVKRGSRA . : . : ..: :... :.: :.: .. . . ...:.... .. :: . KIAA15 VPPTPGGGL-STSVPPTATEELSTSVPPTPGEGPSTSVLPIPGEGLSTSVPPTASDGSDT 360 370 380 390 400 410 380 390 400 410 420 KIAA11 RKAATKARATESQT-PNADQGAQAKI--------ASAQTNVSALETQVAAAVQALADDYL : .... . . :.: .: ... .. .. .... . . .: . . KIAA15 SVPPTPGEGASTLVQPTAPDGPGSSVLPNPGEGPSTLFSSSASVDRNPSKCSLVLPSPRV 420 430 440 450 460 470 430 440 450 460 470 KIAA11 AQLSLEPTTR-TRGKRN-------RKSKHLNGDERSGSNYRRIPWGRRPAPPRDVAILQE .. :.. .. .: .. : . :. : : :. .: : ... KIAA15 TKASVDSDSEGPKGAEGPIEFEVLRDCESPNSISIMGLNTSRVAITLKPQDP-----MEQ 480 490 500 510 520 480 490 500 510 520 530 KIAA11 RANKLVKYLLVKDQTKIPIKRSDMLRDVIQEYDEYFPEIIERASYTLEKMFRVNLKEIDK . .:...::::::.: ::..:.: . ...:: . ::::..::. :: .:: .:.:.: KIAA15 NVAELLQFLLVKDQSKYPIRESEMREYIVKEYRNQFPEILRRAAAHLECIFRFELRELDP 530 540 550 560 570 580 540 550 560 570 580 590 KIAA11 QSSLYILISTQESSAGILGT--TKDTPKLGLLMVILSVIFMNGNKASEAVIWEVLRKLGL .. :::.. . . . . : . . ::.::::.::. ::.:::.:.:: :::.: ..:. KIAA15 EAHTYILLN-KLGPVPFEGLEESPNGPKMGLLMMILGQIFLNGNQAKEAEIWEMLWRMGV 590 600 610 620 630 640 600 610 620 630 640 650 KIAA11 RPGVRHSLFGEVRKLITDEFVKQKYLEYKRVPNSRPPEYEFFWGLRSYHETSKMKVLKFA . : :.::. ..:.. ::: :.::.:. : . .: ::::::: ::. ::.:::.::: KIAA15 QRERRLSIFGNPKRLLSVEFVWQRYLDYRPVTDCKPVEYEFFWGPRSHLETTKMKILKFM 650 660 670 680 690 700 660 670 680 690 700 710 KIAA11 CRVQKKDPKDWAVQYREAVEMEVQAAAVAVAEAEARAEARAQMGIGEEAVAGPWNWDDMD .. .::: :: .: ::.: . :: : :: KIAA15 AKIYNKDPMDWPEKYNEALEED---AARAFAEGWQALPHFRRPFFEEAAAEVPSPDSEVS 710 720 730 740 750 760 720 730 740 750 760 770 KIAA11 IDCLTREELGDDAQAWSRFSFEIEARAQENADASTNVNFSRGASTRAGFSDGASISFNGA KIAA15 SYSSKYAPHSWPESRLESKARKLVQLFLLMDSTKLPIPKKGILYYIGRECSKVFPDLLNR 770 780 790 800 810 820 >>KIAA0618 ( 1052 res) hg03971 (1052 aa) initn: 325 init1: 119 opt: 391 Z-score: 253.7 bits: 59.1 E(): 5.1e-09 Smith-Waterman score: 474; 28.105% identity (57.680% similar) in 612 aa overlap (766-1330:427-1009) 740 750 760 770 780 790 KIAA11 ARAQENADASTNVNFSRGASTRAGFSDGASISFNGAPS--SSGGFSGGPGITF-GV--AP .: .: :. : .:.. : :. :. :: KIAA06 SLPPCPESAGAATTEALSPPKTPSLLPPLGLSQSGPPGLLPSPSFDSKPPTTLLGLIPAP 400 410 420 430 440 450 800 810 820 830 840 KIAA11 STSASFSNTASISFGGTLSTSSSFSSAASIS------FGCAHSTSTSFSSEASISFGGMP : . .. : .. . .:. . .:: : . :: ... .: .. :. : . : KIAA06 SMVPATDTKAPPTLQAETATKPQATSAPSPAPKQSFLFGTQNTSPSSPAAPAASS--APP 460 470 480 490 500 510 850 860 870 880 890 900 KIAA11 CTSASFSGGVSSSFSGPL--STSATFSGGASSGFGGTLSTTAG-FSGVLSTSTSFGSAPT . :.. .: :: . :.: .. .::.. : :::: :. :.:. .:.: KIAA06 MFKPIFTAPPKSEKEGPTPPGPSVTATAPSSSSLPTTTSTTAPTFQPVFSSMGPPASVPL 520 530 540 550 560 570 910 920 930 940 950 KIAA11 TSTVFSSALSTSTG-------FGGILSTSVCFGGSPSSSGSFGGTLSTSICFGGSPCTST . :... . .:. : :. :.. . :.: : .. . .. :: . .:. KIAA06 PAPFFKQTTTPATAPTTTAPLFTGLASATSAVAPITSASPSTDSASKPAFGFGINSVSSS 580 590 600 610 620 630 960 970 980 990 1000 KIAA11 GFGGTLSTSVS------FGGSSSTSANFGGTLSTSICFDGSP-----STGAGFGGALNT- . . : ::... ::. ....:.: .... . : : .: . :. .:.: KIAA06 SVSTTTSTATAASQPFLFGAPQASAASFTPAMGSIFQFGKPPALPTTTTVTTFSQSLHTA 640 650 660 670 680 690 1010 1020 1030 1040 1050 KIAA11 --SASFGSVLNTSTGFGGAMSTSADFGGTLSTSVCFGGS--PGTSVSFGSALNTN-AGYG .:. .:. . : :::....::: .. : . :... : .. :::. .. .: KIAA06 VPTATSSSAADFS-GFGSTLATSAPATSSQPT-LTFSNTSTPTFNIPFGSSAKSPLPSYP 700 710 720 730 740 750 1060 1070 1080 1090 1100 1110 KIAA11 GAVSTNTDFGGTLSTSVCFGGSPSTSAGFGGALNTNASFGCAVSTSASFSGAVSTSACFS :: . . ::.. . ...:. . .::.... . : . :.. . . . ... . KIAA06 GA-NPQPAFGAAEGQPPG-AAKPALAPSFGSSFTFGNSAAPAAAPTPAPPSMIKVVPAYV 760 770 780 790 800 810 1120 1130 1140 1150 1160 1170 KIAA11 GAPITNPGFGGAFSTSAGFGGALSTAADFGGTPSNSIGFGAAPSTSVSFGGA----HGTS .:: .: :::: : ..:: .::. ::. :.. .::. ::.: ::.: :.. 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KIAA06 -LNTPAPGVGTSGSSLSFGASSAPAQGFVG----VAPFGNTFAHQQEHSPRKGPNNLSKR 980 990 1000 1010 1020 1350 1360 1370 1380 1390 1400 KIAA11 RPNASFDRGLSTIIGFGSGSNTSTGFTGEPSTSTGFSSGPSSIVGFSGGPSTGVGFCSGP KIAA06 KLLPAVRAQGPPRRGQASSFPTRKE 1030 1040 1050 >>KIAA0023 ( 2111 res) ha00512 (2111 aa) initn: 212 init1: 136 opt: 325 Z-score: 210.2 bits: 52.0 E(): 1.4e-06 Smith-Waterman score: 510; 28.070% identity (55.331% similar) in 741 aa overlap (772-1455:1320-2021) 750 760 770 780 790 KIAA11 ADASTNVNFSRGASTRAGFSDGASISFNGAPSSSGGFSGGP--GITFGVAPSTSASFSNT ::: .: . : :. : : ... ... KIAA00 SRPVAPSGTALSTTSSKLETPPSKLGELLFPSSLAGETLGSFSGLRVGQADDSTKPTNKA 1290 1300 1310 1320 1330 1340 800 810 820 830 840 850 KIAA11 ASISFGGTLSTSSS-----FSSAASISFGCAHSTSTSFSSEASISFGGMPCTSASFSGGV .: :. .: :..: :. .: .: :. :: .. : . ::.: KIAA00 SSTSLTSTQPTKTSGVPSGFNFTAPPVLG-KHTEPPVTSSATTTSVAPPAATSTS----- 1350 1360 1370 1380 1390 1400 860 870 880 890 900 910 KIAA11 SSSFSGPLSTSATFSGGASSGFGGTLSTTAGFSGVLSTSTSFGSAPTTSTVFSSALSTST :.. : : .... :.:. : :::: : .:: .:: :::: :.::: :: .: KIAA00 STAVFGSLPVTSAGSSGVIS-FGGT-SLSAG-----KTSFSFGSQQTNSTVPPSAPPPTT 1410 1420 1430 1440 1450 920 930 940 950 960 KIAA11 GFGGILST--SVCFGG--SPSSSGSFGGTLSTSICFGGSPCTSTGFGGT-LSTSVSFGGS . . .. .. ::. : ... :. . . : . : : . .:.:.. 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KIAA00 STAAATPQVSSSGF-SSPAFGTTAPGVFGQTTFGQASVFGQSASSAASVFSFSQPGFSSV 1700 1710 1720 1730 1740 1750 1200 1210 1220 1230 1240 KIAA11 --FGGPPSTSACFSGATSPSFCDGPSTSTGFSFGNGLSTNAGFG--GGLNTSA-----GF :: : :.. .... . .. :.:..::::.. : :.: : : :. : :: KIAA00 PAFGQPASSTPTSTSGSVFGAASSTSSSSSFSFGQS-SPNTGGGLFGQSNAPAFGQSPGF 1760 1770 1780 1790 1800 1250 1260 1270 1280 1290 KIAA11 GGGLGTSAGFSGGLST--SSGFD----GGLGTS-AGFGGGPGTSTG---FGGGLGTSAGF : : .. .: :.. .: .:::. .:.:.: .: : ..::: :: ..:.: KIAA00 GQGGSVFGGTSAATTTAATSGFSFCQASGFGSSNTGSVFGQAASTGGIVFGQQSSSSSGS 1810 1820 1830 1840 1850 1860 1300 1310 1320 1330 1340 1350 KIAA11 SGGLGTSAGFGGGLVTSDGFGGGLGTNASFGSTLGTSAGFSGGLSTSDGFGSRPNASFDR : :.. : :::. . :.:: . .:. . .....: :. .::. : . KIAA00 VFGSGNT-GRGGGFFS--GLGGKPSQDAANKNPFSSASGGFGSTATSN----TSNLFGNS 1870 1880 1890 1900 1910 1920 1360 1370 1380 1390 1400 1410 KIAA11 GLSTIIGFGSGSNTSTGFTGEPSTSTGFSSGPSSIVGFSGGPSTGVGFCSGPSTSGFSGG : .:. ::.:.: : :: . . :::: .:.. : : :: : .:.::... KIAA00 GAKTFGGFASSS-----F-GEQKPTGTFSSGGGSVA------SQGFGFSSPNKTGGFGAA 1930 1940 1950 1960 1970 1420 1430 1440 1450 KIAA11 PSTGAG--FGGGPNTGA--GFGGGPS------TSAG--FGSGAASLGACGFSYG : :. :::.:. :. .::..:. ...: :: :.:. .: :: KIAA00 PVFGSPPTFGGSPGFGGVPAFGSAPAFTSPLGSTGGKVFGEGTAAASAGGFGSLAMSLSP 1980 1990 2000 2010 2020 2030 KIAA00 TLKGRLLLMRPKAGGGREQAAPGRKSNESRSLGHLCMERALTSPLKVWEQQQHHILRHAR 2040 2050 2060 2070 2080 2090 >>KIAA2032 ( 952 res) eh00720 (952 aa) initn: 189 init1: 81 opt: 238 Z-score: 160.5 bits: 41.7 E(): 0.0008 Smith-Waterman score: 259; 24.511% identity (52.331% similar) in 665 aa overlap (765-1411:360-947) 740 750 760 770 780 790 KIAA11 EARAQENADASTNVNFSRGASTRAGFSDGASISFNGAPSSSGGFSG--GPGITFGVAPST : . . .:: .:. . ::. : .: : KIAA20 SAVHTPQPSIPNPTVIRTPSLPTAPVTSIHSTTTTPVPSIFSGLVSLPGPSATPTAATPT 330 340 350 360 370 380 800 810 820 830 840 850 KIAA11 SASFSNTASISFGGTLSTSSSFSSAASISFGCAHSTSTSFSSEASISFGGMPCTSASFSG . .. : . :::. :.: . . : :::. :. : :.:.: : KIAA20 PGPTPRSTLGSSEAFASTSAPFTSLPFSTSSSAASTSNPNSASLSSVFAGLPLPLPPTSQ 390 400 410 420 430 440 860 870 880 890 900 910 KIAA11 GVSSSFSGPLSTSATFSGGASSGFGGTLSTTAGFSGVLSTSTSFGSAPTTSTVFSSALST :.:. : . ...::.. . .: :... : .::. .: .. :. . :::::. 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