# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk08029.fasta.huge -Q ../query/KIAA1101.ptfa ./tmplib.24314 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1101, 467 aa vs ./tmplib.24314 library 1987038 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5555+/-0.00575; mu= 6.5805+/- 0.391 mean_var=144.2613+/-35.077, 0's: 0 Z-trim: 52 B-trim: 134 in 1/39 Lambda= 0.106782 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0204 ( 1164 res) ha02801 (1164) 560 98.0 3.5e-21 KIAA0551 ( 1385 res) hh00867s1 (1385) 506 89.8 1.2e-18 KIAA0687 ( 1175 res) hk02992 (1175) 498 88.5 2.6e-18 KIAA1142 ( 467 res) hh05864 ( 467) 351 65.4 9e-12 KIAA0881 ( 1064 res) hk07534 (1064) 346 65.0 2.7e-11 KIAA1264 ( 753 res) hj01058 ( 753) 343 64.4 3e-11 KIAA1361 ( 1005 res) fj02367 (1005) 339 63.9 5.5e-11 KIAA0213 ( 1626 res) ha04841s1 (1626) 341 64.4 6.3e-11 KIAA1901 ( 1265 res) hh03635 (1265) 317 60.6 6.8e-10 KIAA0537 ( 698 res) hg03925 ( 698) 312 59.6 7.7e-10 KIAA1860 ( 689 res) fh18358 ( 689) 308 59.0 1.2e-09 KIAA0722 ( 1066 res) hk02030s1 (1066) 306 58.8 2e-09 KIAA0623 ( 1100 res) hg04615 (1100) 303 58.4 2.8e-09 KIAA0781 ( 950 res) hk09678 ( 950) 299 57.7 3.8e-09 KIAA1369 ( 653 res) fj03222 ( 653) 286 55.6 1.2e-08 KIAA0787 ( 557 res) hk05521s1 ( 557) 280 54.6 2e-08 KIAA1811 ( 715 res) ha06731 ( 715) 270 53.1 6.9e-08 KIAA1760 ( 2219 res) af00030 (2219) 276 54.5 8.1e-08 KIAA1028 ( 501 res) fh00176s1 ( 501) 262 51.7 1.3e-07 KIAA1278 ( 1311 res) hg03689(revised) (1311) 267 52.9 1.5e-07 KIAA1477 ( 870 res) fj04927 ( 870) 263 52.1 1.7e-07 KIAA1995 ( 1011 res) bh00088 (1011) 251 50.3 6.7e-07 KIAA0968 ( 527 res) hj06483 ( 527) 246 49.3 7.3e-07 KIAA0151 ( 723 res) ha03241 ( 723) 243 49.0 1.2e-06 KIAA1639 ( 2584 res) af14886 (2584) 249 50.4 1.6e-06 KIAA1048 ( 897 res) hh02560 ( 897) 242 48.9 1.6e-06 KIAA0344 ( 2066 res) hg01568 (2066) 242 49.3 2.9e-06 KIAA0175 ( 656 res) ha02337 ( 656) 234 47.5 3e-06 KIAA0135 ( 1351 res) ha01203s1 (1351) 237 48.3 3.7e-06 KIAA0641 ( 1326 res) hj03494s1 (1326) 230 47.2 7.6e-06 KIAA1124 ( 1760 res) fg05708 (1760) 231 47.5 8.4e-06 KIAA0936 ( 640 res) hh04647 ( 640) 221 45.5 1.2e-05 KIAA1459 ( 853 res) fh16961 ( 853) 221 45.7 1.5e-05 KIAA0904 ( 1535 res) ha00554 (1535) 223 46.2 1.8e-05 KIAA0999 ( 1371 res) fj10213 (1371) 219 45.6 2.5e-05 KIAA0807 ( 1329 res) hk04449(revised) (1329) 218 45.4 2.8e-05 KIAA0619 ( 1428 res) hg04117 (1428) 216 45.1 3.6e-05 KIAA1297 ( 2242 res) fg03883 (2242) 210 44.4 9.3e-05 KIAA0834 ( 453 res) hj05353 ( 453) 198 41.8 0.00011 KIAA0096 ( 766 res) ha01240s1 ( 766) 198 42.1 0.00016 KIAA0973 ( 1583 res) hj06871 (1583) 197 42.2 0.00029 KIAA0965 ( 489 res) hj06174s1 ( 489) 186 40.0 0.00042 KIAA0137 ( 801 res) ha02915s1 ( 801) 185 40.1 0.00066 KIAA0303 ( 2137 res) hg00009 (2137) 191 41.4 0.00069 KIAA0561 ( 1308 res) hh01676 (1308) 184 40.1 0.001 KIAA0369 ( 794 res) hh00177 ( 794) 180 39.3 0.0011 KIAA1338 ( 1495 res) fh16948 (1495) 184 40.2 0.0011 KIAA0472 ( 365 res) hh00171 ( 365) 160 35.9 0.0055 KIAA1855 ( 1270 res) fg04654 (1270) 166 37.4 0.0069 KIAA1765 ( 608 res) fj12188(revised) ( 608) 159 36.0 0.0087 >>KIAA0204 ( 1164 res) ha02801 (1164 aa) initn: 532 init1: 192 opt: 560 Z-score: 472.2 bits: 98.0 E(): 3.5e-21 Smith-Waterman score: 567; 29.501% identity (57.267% similar) in 461 aa overlap (3-451:91-505) 10 20 30 KIAA11 TPEIQAMSQCHHPNIVSYYTSFVVKDELWLVM ::. ...: :::::. .: ...::... 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KIAA02 DVWSLGITLIEMAEIEPPHHELNPMRVLLKIAKSEPPTL---AQPS----RWSSNFKDFL 230 240 250 260 270 280 210 220 230 240 250 260 KIAA11 SLCLQKDPEKRPTAAELLRHKFFQKAKNKEFLQEKTLQRAPTISERAKKVRRVPGSSGRL . ::.:. . : :...::.: : .:: ..: . ..: KIAA02 KKCLEKNVDARWTTSQLLQHPFVTVDSNKP-IRELIAEAKAEVTE--------------- 290 300 310 320 270 280 290 300 310 320 KIAA11 HKTEDGGWEWSDDEFDEESEEGKAAISQLRSPRVKESISNSELFPTTDPVGTLLQVPEQI ..::: : :: :: :.. : . ::..:: : .. . :.. KIAA02 -EVEDGKEE---DE--EEETENSLPIPASKRASSDLSIASSE----EDKLSQNACILESV 330 340 350 360 370 330 340 350 360 370 380 KIAA11 SAHLPQPAGQIATQPTQVSLPPTA-EPAKTAQALSSGSGSQETKIPISLVLRLRNSKKEL : . . .. . .. ::. :: :... .. . . . : : :.. KIAA02 SEKTERSNSEDKLNSKILNEKPTTDEPEKAVEDINEHITDAQLEAMTELHDRTAVIKENE 380 390 400 410 420 430 390 400 410 420 430 440 KIAA11 NDIR--FEFTPGRDTAEGVSQELISAGLVDGRDLVIVAANLQ---KIVEEPQSNRSVTF- . : .: : . : :. . .: : .. .. . .:.. : :: ..... : KIAA02 REKRPKLENLPDTEDQETVDINSVSEGK-ENNIMITLETNIEHNLKSEEEKDQEKQQMFE 440 450 460 470 480 490 450 460 KIAA11 -KLASGVEGSDIPDDGKLIGFAQLSIS :: .. : .: KIAA02 NKLIKSEEIKDTILQTVDLVSQETGEKEANIQAVDSEVGLTKEDTQEKLGEDDKTQKDVI 500 510 520 530 540 550 >>KIAA0551 ( 1385 res) hh00867s1 (1385 aa) initn: 538 init1: 202 opt: 506 Z-score: 426.3 bits: 89.8 E(): 1.2e-18 Smith-Waterman score: 599; 39.159% identity (64.725% similar) in 309 aa overlap (3-300:94-370) 10 20 KIAA11 TPEIQAMSQ-CHHPNIVSYYTSFVVK------ ::. ... :: ::..:: .:. : KIAA05 VYKGRHVKTGQLAAIKVMDVTGDEEEEIKQEINMLKKYSHHRNIATYYGAFIKKNPPGMD 70 80 90 100 110 120 30 40 50 60 70 80 KIAA11 DELWLVMKLLSGGSVLDIIKHIVAKGEHKSGVLDESTIATILREVLEGLEYLHKNGQIHR :.:::::.. ..::: :.::. :...: : :: : ::.:.:: .::.. ::: KIAA05 DQLWLVMEFCGAGSVTDLIKNT------KGNTLKEEWIAYICREILRGLSHLHQHKVIHR 130 140 150 160 170 90 100 110 120 130 140 KIAA11 DVKAGNILLGEDGSVQIADFGVSAFLATGGDITRNKVRKTFVGTPCWMAPEVMEQVRG-- :.:. :.:: :.. :...:::::: : : : .. :.::.::: ::::::. .. KIAA05 DIKGQNVLLTENAEVKLVDFGVSAQL----DRTVGR-RNTFIGTPYWMAPEVIACDENPD 180 190 200 210 220 230 150 160 170 180 190 200 KIAA11 --YDFKADIWSFGITAIELATGAAPYHKYPPMKVLMLTLQNDPPSLETGVQDKEMLKKYG ::::.:.::.::::::.: :: : . ::..:.: .: : :.. ::.. KIAA05 ATYDFKSDLWSLGITAIEMAEGAPPLCDMHPMRALFLIPRNPAPRLKS--------KKWS 240 250 260 270 280 210 220 230 240 250 260 KIAA11 KSFRKMISLCLQKDPEKRPTAAELLRHKFFQKAKNKEFLQEKTLQRAPTISERAKKVRRV :.:...: :: :. .::.. .:..: :.. :. .. .: : .:.:: : KIAA05 KKFQSFIESCLVKNHSQRPATEQLMKHPFIRDQPNE---RQVRIQLKDHI-DRTKKKR-- 290 300 310 320 330 270 280 290 300 310 320 KIAA11 PGSSGRLHKTEDGGWEWSDDEFDEESEEGKAAISQLRSPRVKESISNSELFPTTDPVGTL :. .:: .:.: .: .:: ... : : : KIAA05 ----GEKDETE---YEYSGSEEEEEENDSGEPSSILNLPGESTLRRDFLRLQLANKERSE 340 350 360 370 380 390 330 340 350 360 370 380 KIAA11 LQVPEQISAHLPQPAGQIATQPTQVSLPPTAEPAKTAQALSSGSGSQETKIPISLVLRLR KIAA05 ALRRQQLEQQQRENEEHKRQLLAERQKRIEEQKEQRRRLEEQQRREKELRKQQEREQRRH 400 410 420 430 440 450 >>KIAA0687 ( 1175 res) hk02992 (1175 aa) initn: 596 init1: 189 opt: 498 Z-score: 420.6 bits: 88.5 E(): 2.6e-18 Smith-Waterman score: 580; 38.983% identity (65.424% similar) in 295 aa overlap (3-286:32-294) 10 20 KIAA11 TPEIQAMSQ-CHHPNIVSYYTSFVVK------ ::. ... :: ::..:: .:. : KIAA06 VYKGRHVKTGQLAAIKVMDVTEDEEEEIKLEINMLKKYSHHRNIATYYGAFIKKSPPGHD 10 20 30 40 50 60 30 40 50 60 70 80 KIAA11 DELWLVMKLLSGGSVLDIIKHIVAKGEHKSGVLDESTIATILREVLEGLEYLHKNGQIHR :.:::::.. ..::. :..:. :...: :. :: : ::.:.:: .:: . ::: KIAA06 DQLWLVMEFCGAGSITDLVKNT------KGNTLKEDWIAYISREILRGLAHLHIHHVIHR 70 80 90 100 110 90 100 110 120 130 140 KIAA11 DVKAGNILLGEDGSVQIADFGVSAFLATGGDITRNKVRKTFVGTPCWMAPEVMEQVRG-- :.:. :.:: :.. :...:::::: : : : .. :.::.::: ::::::. .. KIAA06 DIKGQNVLLTENAEVKLVDFGVSAQL----DRTVGR-RNTFIGTPYWMAPEVIACDENPD 120 130 140 150 160 170 150 160 170 180 190 200 KIAA11 --YDFKADIWSFGITAIELATGAAPYHKYPPMKVLMLTLQNDPPSLETGVQDKEMLKKYG ::...:.:: ::::::.: :: : . ::..:.: .: :: :.. ::.. KIAA06 ATYDYRSDLWSCGITAIEMAEGAPPLCDMHPMRALFLIPRNPPPRLKS--------KKWS 180 190 200 210 220 210 220 230 240 250 260 KIAA11 KSFRKMISLCLQKDPEKRPTAAELLRHKFFQKAKNKEFLQEKTLQRAPTISERAKKVRRV :.: ..: :: :. .::.. .::.: :.. :. .. .: : .:..: : KIAA06 KKFFSFIEGCLVKNYMQRPSTEQLLKHPFIRDQPNE---RQVRIQLKDHI-DRTRKKR-- 230 240 250 260 270 270 280 290 300 310 320 KIAA11 PGSSGRLHKTEDGGWEWSDDEFDEESEEGKAAISQLRSPRVKESISNSELFPTTDPVGTL :. .:: .:.: .: .:: KIAA06 ----GEKDETE---YEYSGSEEEEEEVPEQEGEPSSIVNVPGESTLRRDFLRLQQENKER 280 290 300 310 320 >>KIAA1142 ( 467 res) hh05864 (467 aa) initn: 506 init1: 148 opt: 351 Z-score: 303.2 bits: 65.4 E(): 9e-12 Smith-Waterman score: 551; 39.655% identity (66.810% similar) in 232 aa overlap (3-234:242-451) 10 20 30 KIAA11 TPEIQAMSQCHHPNIVSYYTSFVVKDELWLVM :. : . .: :.: .:.:..: ::::.:: KIAA11 CIATVRSSGKLVAVKKMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQHENVVEMYNSYLVGDELWVVM 220 230 240 250 260 270 40 50 60 70 80 90 KIAA11 KLLSGGSVLDIIKHIVAKGEHKSGVLDESTIATILREVLEGLEYLHKNGQIHRDVKAGNI ..: ::.. ::. : ..: ::.. ::..: :: .: ::::.:. .: KIAA11 EFLEGGALTDIVTHTR---------MNEEQIAAVCLAVLQALSVLHAQGVIHRDIKSDSI 280 290 300 310 320 100 110 120 130 140 150 KIAA11 LLGEDGSVQIADFGVSAFLATGGDITRNKVRKTFVGTPCWMAPEVMEQVRGYDFKADIWS :: .:: :...::: : .. .. : ::..:::: :::::.. .. : ..:::: KIAA11 LLTHDGRVKLSDFGFCAQVSK--EVPR---RKSLVGTPYWMAPELISRL-PYGPEVDIWS 330 340 350 360 370 160 170 180 190 200 210 KIAA11 FGITAIELATGAAPYHKYPPMKVLMLTLQNDPPSLETGVQDKEMLKKYGKSFRKMISLCL .:: .::.. : :: . ::.:.. . .: :: :.. :.: . :.. ... : KIAA11 LGIMVIEMVDGEPPYFNEPPLKAMKMIRDNLPPRLKN-------LHKVSPSLKGFLDRLL 380 390 400 410 420 220 230 240 250 260 270 KIAA11 QKDPEKRPTAAELLRHKFFQKAKNKEFLQEKTLQRAPTISERAKKVRRVPGSSGRLHKTE .:: .: ::::::.: :. :: KIAA11 VRDPAQRATAAELLKHPFLAKAGPPASIVPLMRQNRTR 430 440 450 460 >>KIAA0881 ( 1064 res) hk07534 (1064 aa) initn: 601 init1: 188 opt: 346 Z-score: 294.6 bits: 65.0 E(): 2.7e-11 Smith-Waterman score: 514; 33.119% identity (63.344% similar) in 311 aa overlap (3-309:91-375) 10 20 30 KIAA11 TPEIQAMSQCHHPNIVSYYTSFVVKDELWLVM :.. ... .::: ..: .. . :::: KIAA08 RDVRNSEVVAIKKMSYSGKQSNEKWQDIIKEVRFLQKLRHPNTIQYRGCYLREHTAWLVM 70 80 90 100 110 120 40 50 60 70 80 90 KIAA11 KLLSGGSVLDIIKHIVAKGEHKSGVLDESTIATILREVLEGLEYLHKNGQIHRDVKAGNI . ::. :... ::. :.: ::.. . .:.:: :::....:::::::::: KIAA08 EY-CLGSASDLLE------VHKKP-LQEVEIAAVTHGALQGLAYLHSHNMIHRDVKAGNI 130 140 150 160 170 100 110 120 130 140 150 KIAA11 LLGEDGSVQIADFGVSAFLATGGDITRNKVRKTFVGTPCWMAPEVMEQV-RG-YDFKADI ::.: : :...::: ....: .. .::::: ::::::. . .: :: :.:. KIAA08 LLSEPGLVKLGDFGSASIMAPAN---------SFVGTPYWMAPEVILAMDEGQYDGKVDV 180 190 200 210 220 160 170 180 190 200 210 KIAA11 WSFGITAIELATGAAPYHKYPPMKVLMLTLQNDPPSLETGVQDKEMLKKYGKSFRKMISL ::.::: :::: : .. :..:. ::. : :..: .... ::.... KIAA08 WSLGITCIELAERKPPLFNMNAMSALYHIAQNESPVLQSG--------HWSEYFRNFVDS 230 240 250 260 270 220 230 240 250 260 270 KIAA11 CLQKDPEKRPTAAELLRHKFFQKAKNKEFLQEKTLQRAPTISERAKKVRRVPGSSGRLHK :::: :. :::. ::.:.: . . ... .::. .. ... .. ... KIAA08 CLQKIPQDRPTSEVLLKHRFVLRERPPTVIMD-LIQRTKDAVRELDNLQYRKMKKILFQE 280 290 300 310 320 330 280 290 300 310 320 KIAA11 TEDG-GWEWSDDEFDEESEEGKAA-ISQLRSPRVKESISNSELFPTTDPVGTLLQVPEQI . .: : : ..: . : .:. ...:.: . :.: : KIAA08 APNGPGAEAPEEEEEAEPYMHRAGTLTSLESSHSVPSMSISASSQSSSVNSLADASDNEE 340 350 360 370 380 390 330 340 350 360 370 380 KIAA11 SAHLPQPAGQIATQPTQVSLPPTAEPAKTAQALSSGSGSQETKIPISLVLRLRNSKKELN KIAA08 EEEEEEEEEEEEEGPEAREMAMMQEGEHTVTSHSSIIHRLPGSDNLYDDPYQPEITPSPL 400 410 420 430 440 450 >>KIAA1264 ( 753 res) hj01058 (753 aa) initn: 479 init1: 159 opt: 343 Z-score: 293.9 bits: 64.4 E(): 3e-11 Smith-Waterman score: 540; 39.224% identity (66.379% similar) in 232 aa overlap (3-234:528-737) 10 20 30 KIAA11 TPEIQAMSQCHHPNIVSYYTSFVVKDELWLVM :. : . :: :.:..:.:..: ::::.:: KIAA12 CIATEKHTGKQVAVKKMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYHHDNVVDMYSSYLVGDELWVVM 500 510 520 530 540 550 40 50 60 70 80 90 KIAA11 KLLSGGSVLDIIKHIVAKGEHKSGVLDESTIATILREVLEGLEYLHKNGQIHRDVKAGNI ..: ::.. ::. : ..: :::. ::..: :::..: ::::.:. .: KIAA12 EFLEGGALTDIVTHTR---------MNEEQIATVCLSVLRALSYLHNQGVIHRDIKSDSI 560 570 580 590 600 100 110 120 130 140 150 KIAA11 LLGEDGSVQIADFGVSAFLATGGDITRNKVRKTFVGTPCWMAPEVMEQVRGYDFKADIWS :: :: ....::: : .. .. . ::..:::: ::::::. .. : ..:::: KIAA12 LLTSDGRIKLSDFGFCAQVSK--EVPK---RKSLVGTPYWMAPEVISRL-PYGTEVDIWS 610 620 630 640 650 660 160 170 180 190 200 210 KIAA11 FGITAIELATGAAPYHKYPPMKVLMLTLQNDPPSLETGVQDKEMLKKYGKSFRKMISLCL .:: .::. : :: . ::.... .. :: :.: :.: .. .: ...: : KIAA12 LGIMVIEMIDGEPPYFNEPPLQAMRRIRDSLPPR----VKD---LHKVSSVLRGFLDLML 670 680 690 700 710 220 230 240 250 260 270 KIAA11 QKDPEKRPTAAELLRHKFFQKAKNKEFLQEKTLQRAPTISERAKKVRRVPGSSGRLHKTE ..: .: :: ::: : :.. : KIAA12 VREPSQRATAQELLGHPFLKLAGPPSCIVPLMRQYRHH 720 730 740 750 >>KIAA1361 ( 1005 res) fj02367 (1005 aa) initn: 462 init1: 184 opt: 339 Z-score: 289.0 bits: 63.9 E(): 5.5e-11 Smith-Waterman score: 514; 31.653% identity (61.905% similar) in 357 aa overlap (3-353:80-408) 10 20 30 KIAA11 TPEIQAMSQCHHPNIVSYYTSFVVKDELWLVM :.. ... .::: . : .. . :::: KIAA13 RDVRTNEVVAIKKMSYSGKQSTEKWQDIIKEVKFLQRIKHPNSIEYKGCYLREHTAWLVM 50 60 70 80 90 100 40 50 60 70 80 90 KIAA11 KLLSGGSVLDIIKHIVAKGEHKSGVLDESTIATILREVLEGLEYLHKNGQIHRDVKAGNI . : :. :... ::. :.: ::.: . .:.:: :::.. .::::.::::: KIAA13 EYCLG-SASDLLE------VHKKP-LQEVEIAAITHGALQGLAYLHSHTMIHRDIKAGNI 110 120 130 140 150 160 100 110 120 130 140 150 KIAA11 LLGEDGSVQIADFGVSAFLATGGDITRNKVRKTFVGTPCWMAPEVMEQV-RG-YDFKADI :: : :.:..:::: :: .:. .. .::::: ::::::. . .: :: :.:. 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KIAA13 AHNGPAVEAQEE-EEEQDHGVGRTGTVNSVGSNQSIPSMSISASSQSSSVNSLPDVSDDK 330 340 350 360 370 380 330 340 350 360 370 380 KIAA11 SAHLPQPAGQ--IATQPTQVSLPPTAEPAKTAQALSSGSGSQETKIPISLVLRLRNSKKE : .: . :. . .. . . : : : KIAA13 S-ELDMMEGDHTVMSNSSVIHLKPEEENYREEGDPRTRASDPQSPPQVSRHKSHYRNREH 390 400 410 420 430 440 >>KIAA0213 ( 1626 res) ha04841s1 (1626 aa) initn: 315 init1: 118 opt: 341 Z-score: 288.1 bits: 64.4 E(): 6.3e-11 Smith-Waterman score: 380; 30.417% identity (62.500% similar) in 240 aa overlap (3-238:1408-1626) 10 20 30 KIAA11 TPEIQAMSQCHHPNIVSYYTSFVVKDELWLVM :.. . .:::.: :. . ..:... : KIAA02 CISVDTGELMAMKEIRFQPNDHKTIKETADELKIFEGIKHPNLVRYFGVELHREEMYIFM 1380 1390 1400 1410 1420 1430 40 50 60 70 80 90 KIAA11 KLLSGGSVLDIIKHIVAKGEHKSGVLDESTIATILREVLEGLEYLHKNGQIHRDVKAGNI . . :.. .. . : :.: .: ... ... ::..: .:::.:..:: KIAA02 EYCDEGTLEEV---------SRLG-LQEHVIRLYSKQITIAINVLHEHGIVHRDIKGANI 1440 1450 1460 1470 1480 100 110 120 130 140 150 KIAA11 LLGEDGSVQIADFGVSAFLATGGDITRNKVRKTFVGTPCWMAPEVMEQVRG--YDFKADI .: .: ....::: :. : .... ..: .:. :: .:::::. ...: . ::: KIAA02 FLTSSGLIKLGDFGCSVKLKNNAQTMPGEVNSTL-GTAAYMAPEVITRAKGEGHGRAADI 1490 1500 1510 1520 1530 1540 160 170 180 190 200 KIAA11 WSFGITAIELATGAAPYHKYPPMKVLM--LTLQNDPPSLETGVQDKEMLKKYGKSFRKMI ::.: ..::..:: :.:.: .: . . . :: : :. ::.: . KIAA02 WSLGCVVIEMVTGKRPWHEYEHNFQIMYKVGMGHKPPI-------PERLSPEGKDF---L 1550 1560 1570 1580 1590 210 220 230 240 250 260 KIAA11 SLCLQKDPEKRPTAAELLRHKFFQKAKNKEFLQEKTLQRAPTISERAKKVRRVPGSSGRL : ::..::. : ::..:: :.: . ..: KIAA02 SHCLESDPKMRWTASQLLDHSFVKVCTDEE 1600 1610 1620 >>KIAA1901 ( 1265 res) hh03635 (1265 aa) initn: 242 init1: 129 opt: 317 Z-score: 269.5 bits: 60.6 E(): 6.8e-10 Smith-Waterman score: 362; 30.769% identity (62.753% similar) in 247 aa overlap (3-245:58-278) 10 20 30 KIAA11 TPEIQAMSQCHHPNIVSYYTSFVVKDELWLVM :. .... .:::::.: :: . :..:: KIAA19 VKSTEDGRQYVIKEINISRMSSKEREESRREVAVLANMKHPNIVQYRESFEENGSLYIVM 30 40 50 60 70 80 40 50 60 70 80 90 KIAA11 KLLSGGSVLDIIKHIVAKGEHKSGVL-DESTIATILREVLEGLEYLHKNGQIHRDVKAGN :: :..:.: :. .::: .:. : . .. .:...: .:::.:. : KIAA19 DYCEGG---DLFKRINAQ----KGVLFQEDQILDWFVQICLALKHVHDRKILHRDIKSQN 90 100 110 120 130 140 100 110 120 130 140 150 KIAA11 ILLGEDGSVQIADFGVSAFLATGGDITRNKVRKTFVGTPCWMAPEVMEQVRGYDFKADIW :.: .::.::..:::.. : . ...: : .::: ...::. :. . :. :.::: KIAA19 IFLTKDGTVQLGDFGIARVLNSTVELAR-----TCIGTPYYLSPEICEN-KPYNNKSDIW 150 160 170 180 190 160 170 180 190 200 KIAA11 SFGITAIELATGAAPYHKYPPMKVLMLTLQND--PP-SLETGVQDKEMLKKYGKSFRKMI ..: . :: : .. :: :.: . . :: ::. :. ..:... KIAA19 ALGCVLYELCTLKHAFEA-GSMKNLVLKIISGSFPPVSLH-----------YSYDLRSLV 200 210 220 230 240 210 220 230 240 250 260 KIAA11 SLCLQKDPEKRPTAAELLRHKFFQKAKNKEFLQEKTLQRAPTISERAKKVRRVPGSSGRL : ....:. ::.. .:.. :. : . ..::. . . KIAA19 SQLFKRNPRDRPSVNSILEKGFIAK-RIEKFLSPQLIAEEFCLKTFSKFGSQPIPAKRPA 250 260 270 280 290 300 270 280 290 300 310 320 KIAA11 HKTEDGGWEWSDDEFDEESEEGKAAISQLRSPRVKESISNSELFPTTDPVGTLLQVPEQI KIAA19 SGQNSISVMPAQKITKPAAKYGIPLAYKKYGDKKLHEKKPLQKHKQAHQTPEKRVNTGEE 310 320 330 340 350 360 >>KIAA0537 ( 698 res) hg03925 (698 aa) initn: 270 init1: 149 opt: 312 Z-score: 268.5 bits: 59.6 E(): 7.7e-10 Smith-Waterman score: 321; 28.821% identity (55.459% similar) in 229 aa overlap (3-228:140-340) 10 20 30 KIAA11 TPEIQAMSQCHHPNIVSYYTSFVVKDELWLVM ::. ::. .::.:.: : : ::.. ..: KIAA05 TERFSGRVVAIKSIRKDKIKDEQDMVHIRREIEIMSSLNHPHIISIYEVFENKDKIVIIM 110 120 130 140 150 160 40 50 60 70 80 90 KIAA11 KLLSGGSVLDIIKHIVAKGEHKSGVLDESTIATILREVLEGLEYLHKNGQIHRDVKAGNI . : : . : :. :.. :.: ..:... ...: :::: .:::.: :: KIAA05 EYASKGELYDYIS------ERRR--LSERETRHFFRQIVSAVHYCHKNGVVHRDLKLENI 170 180 190 200 210 220 100 110 120 130 140 KIAA11 LLGEDGSVQIADFGVSAFLATGGDITRNKVRKTFVGTPCWMAPEVMEQVRGYDFKA---D :: .. ...:::::.: . ..: .:: :.: . .::. : : ... : KIAA05 LLDDNCNIKIADFGLSNLYQ------KDKFLQTFCGSPLYASPEI---VNGRPYRGPEVD 230 240 250 260 270 150 160 170 180 190 200 KIAA11 IWSFGITAIELATGAAPYHKYPPMKVLMLTLQNDPPSLETGVQDKEMLKKYGKSFRKMIS :..:. :. :. :. . : :. ... : .: : .: KIAA05 SWALGVLLYTLVYGTMPFDGFD-HKNLIRQISSGEYREPTQPSDA----------RGLIR 280 290 300 310 320 210 220 230 240 250 260 KIAA11 LCLQKDPEKRPTAAELLRHKFFQKAKNKEFLQEKTLQRAPTISERAKKVRRVPGSSGRLH :. .:..: : .. : KIAA05 WMLMVNPDRRATIEDIANHWWVNWGYKSSVCDCDALHDSESPLLARIIDWHHRSTGLQAD 330 340 350 360 370 380 467 residues in 1 query sequences 1987038 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:09:11 2008 done: Thu Dec 18 15:09:11 2008 Total Scan time: 0.430 Total Display time: 0.130 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]