# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/pf00402.fasta.huge -Q ../query/KIAA1096.ptfa ./tmplib.24314 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1096, 1919 aa vs ./tmplib.24314 library 1985586 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.2931+/-0.00812; mu= -23.1973+/- 0.539 mean_var=769.0616+/-180.211, 0's: 0 Z-trim: 12 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.046248 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 42, opt: 30, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0515 ( 670 res) hg00183 ( 670) 449 46.4 2.8e-05 KIAA0324 ( 2800 res) ee08846s1 (2800) 434 46.1 0.00014 >>KIAA0515 ( 670 res) hg00183 (670 aa) initn: 772 init1: 157 opt: 449 Z-score: 186.7 bits: 46.4 E(): 2.8e-05 Smith-Waterman score: 868; 30.984% identity (55.407% similar) in 823 aa overlap (958-1758:21-651) 930 940 950 960 970 980 KIAA10 APASASAPAPAPTPVSAPNPAPPAPAQTQAQTHKPVQNPLQTTSQSSKQPPPSIRLPSAQ . .. :: :.. . ::. :: :. . : KIAA05 EGFIEVLTKKQRRLLEEERRKKEQAVQVPVKGRGLSSRIPP---RFAKKQ 10 20 30 40 990 1000 1010 1020 1030 1040 KIAA10 TPNGTDYVASGKSIQTPQSHGTLTAELWDNKVAPPAVLNDISKKLGPISPPQPPSVSAWN . . .. .: : .: .:.:... :. : : : :. ..: KIAA05 N----NLCLEQGDVTVPGS--SLGTEIWESS----------SQAL----PVQAPANDSWR 50 60 70 80 1050 1060 1070 1080 1090 1100 KIAA10 KPLTSFGSAPSS---EGAKNGQ-ESGLEIGTDTIQFGAPASNGNENEVVPVLSEKSADKI : .:.:.:. .. .: :..: .::....... . .: .:. . . : :. . 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